Protein Alignment Cap-D2 and dpy-28

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_651709.1
• Gene: Cap-D2 / 43491
• FlyBaseID: FBgn0039680
• Length: 1380
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: NP_499379.2
• Gene: dpy-28 / 176509
• WormBaseID: WBGene00001087
• Length: 1499
• Species: Caenorhabditis elegans
• Alignment Length: 1463
• Identity: 282/1463 - (19%)
• Similarity: 578/1463 - (39%)
• Gaps: 332/1463 - (22%)

  Fly   121 KMTLFLQVSTVKKINNSVQQAMR-----DQQLNVQKKRAKPSEGLEQFPNW-EVKRGKFLVQLFN 179
            ::|:.||:...|.|.::.|||.|     .:|:::.          :....| :::|.:.:..|..
 Worm   160 RLTVQLQLYVSKSIASANQQAKRGTGRGGRQVDLD----------DDIVKWKDIQRHRMINCLLE 214

  Fly   180 VLQC-----------PLEKLWSPPVAEEDFINLLCDPCYRTIELLPLRMDNKHVFDTIFQIL--- 230
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 Worm   215 LLELRVDTVAGTKKKAIQYVFAPDVMEKDFL---------------LRF-----LDTVVQLLEDP 259

  Fly   231 GTSIKRFNQAMTFPVRILQILRGTEHAAHSVAAGIL--LLHEEYGISSVFSILIKSIVDALRMDS 293
            ....:...|.::...|||::|.........||..:.  |.|.....::.|. .|:.:|..::.:.
 Worm   260 ENMARSSQQWISHYFRILKVLSADYGMTKDVANCLFTALSHSYLEAANTFP-FIEPLVTLMKENG 323

  Fly   294 SDSS----------------VSKHFSNFLAE------FSNIAPSLIVPHLEKLAED------LLD 330
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 Worm   324 EGSGRIYQPLRNVLQLVICRVGNLYAGERAEKPPPKAFCMMVQSLAINVHDLMLQDITHVYRLLQ 388

  Fly   331 CQSHTLRNCVLQIIGDTVVSELTSEDL-----SEELKEVRNEFLEHLMAHILDISAHVRSKVLSI 390
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 Worm   389 NQHVNVRMSTLHALADMFSSSYLSQSLCDTFASRRLK--REGIFKRLLAHTNDEATNVRSKAVSL 451

  Fly   391 WHHLKTQHAIPLNFLTRVLEEAIG-RLEDKSSLVRRAAMHLIKSALESNPYSS---------KLS 445
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 Worm   452 LRNIMENRRIPEEFESCGLLSIVGSRLNDKSVQVRKSAIQFLTTFLDNNRHGHDFNREMHQLKLN 516

  Fly   446 --IDELRAKHEHEVQAMEKLNEV-------------------------LEEERKQEEKLNDEFSS 483
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 Worm   517 AKCSELRNAEEPQSKAIQGAENAFRQNLFTLTAGVRVEVYDIFRRRYRVEPERSITDILTGLFSP 581

  Fly   484 ----------LAPELLPF------IEENLTEFPDMQFDKEES----DETLMERIIPLMR------ 522
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 Worm   582 GSGNRLVRYYVAQENFPFRDRIPSLRERRSD--DMEDDDDDTVSLEDDDMTSLVSEVVKWVVAQA 644

  Fly   523 EKNYKDVIVLVRKVDFLAGNQNMSSLLKHEEHCVYVLALLKTYHLLAAGFKQSSEEMLQQIKTVQ 587
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 Worm   645 EEDYVTFKVQLTQMD-------DDQLLENEQEA-----------------RDRNNQIMQLRAQVQ 685

  Fly   588 FLKDSIDFAVLMTSAFPKLHEMLMSKTNTDVFEAVDLFTTGYMFGIHGTESGMQRMLQLVW--SS 650
            .|.:.:.....::.........:::....::.|.:...|...:|.|.|.:..::.|..|||  |:
 Worm   686 QLINKMSIEQELSRCVTIALRCVLNGETAEIKEGIRFLTRCKLFEITGADDAIRSMCSLVWRPSA 750

  Fly   651 D--KEKRDAVSDAYKRVLFSTDQTGRAHAIKVVQNLSKFLSEIEYGHYTALESLM-----TEWV- 707
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 Worm   751 DILNELIEAAEDMFISRLDGNEKASERDS-STVENLMKAMNGVTEKDRPSVEEVIYLLAATELVH 814

  Fly   708 LGGD----------IDAAVIQVLFERFTLKLEGTTSNESRL--SLQLLIMASQSKSSIVSANTAI 760
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 Worm   815 VDSDKNKVPRKRRPIEANVINKL---WMIALDMSHGINSRKIDALRILYPISRSERGIAEARSR- 875

  Fly   761 IEDIAVGERVRRDPRIFTSCLQLLVNSIDANNTAKYYKRQNSDAEFVGKITRLFLDFFFHRSLYD 825
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 Worm   876 ---LRVVQKKLMDPELAVDALRII--SILGTPT----KLENEQDAYSRPLFKIHQD--------- 922

  Fly   826 FDALAMSVFE-YFYRMCQAPD--------VIAQQLVTALLKQFNESWLVKEAAA----------- 870
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 Worm   923 -DSLWKSIEKLFFYEIMKADDNPDRDWFGVIRLTITTILSLSMDVNVMLPKLASHFVYRTKRISD 986

  Fly   871 -IVPSPDKADTETVPDSQPLEIPHSQTLTPTQTQADSQSQMQGTLIPVYLVSRLIFCIGYMTIKE 934
             .:...|:.|..|               ..|:.:...:.:....|....::.:|:..||.:.::.
 Worm   987 FFLFYCDQVDDAT---------------DDTRKKMAQRRREYWALTYCRVMEKLMAFIGEVAVQL 1036

  Fly   935 MIFLDMDIYN-NMKYRDELTALEERKNRNQQAGSSHNAARLTLNM-SAMEVRKRLSGVAAEPQQE 997
            ..::.:.|.. :.:|..::  ::..||   .|.......|...:: .::..||.:..|
 Worm  1037 NAYIQVTIPKLHTRYVSKM--VDAEKN---DANIREEPVRFLSDLEKSVAQRKTIFTV------- 1089

  Fly   998 PDDDLVGATAEDNIAEEIHGICE---DMLLYNPDALLSKLAPFII--EICKRPGEFGDPT-LQQA 1056
            |.|...|||:.|     :|.:..   |..|:.|:.|:.:|.|.::  ..||..     || ::.|
 Worm  1090 PQDTTPGATSND-----LHHLVSVMCDKRLFVPNKLMGRLLPIVVYGMRCKIM-----PTRIRHA 1144

  Fly  1057 ATLALARLMTVSSRFCESNMSFLMNILNLTKNIRIKCNTVVGLSDLTFRFPNIIEPWTGHFYAQL 1121
            ||:|..::|.:|:...........:.:..:.:|.::||.|....|..|..|.:.|.:....:...
 Worm  1145 ATVAYGKMMPLSAEISAFAAPSFFSAMTKSSSILLRCNLVAACCDFAFAQPTLFELFAQSLFRMS 1209

  Fly  1122 HESNTELRLTAVKMLSHLILNEMIRVKGQIADMALCIVDGNEEIRNITKQFFKEIANKSNILYNV 1186
            .:.:...|.:.:.:||||:.|:||:.:|.:::.|.||.|....:|::.:.||||:.::::.:..:
 Worm  1210 QDESPLARESTILVLSHLMSNDMIQTRGVLSEAARCICDPTRAVRDVAQSFFKELNSRTDTIIQL 1274

  Fly  1187 LPDIISRLGDINLNLDEDKYRIIMSYILGLIQKDR---QIETLVEKLCLRFPVTRV--ERQWRDI 1246
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 Worm  1275 LPEFLYHLSNGNERMSFKSYKTVFEFLIQLL-KDKPKASADSMIDRVCIKFSNTDMNDSETPKYL 1338

  Fly  1247 AYCLGLLTYNERAVKKLMDNMQHYRDKVQVDEVYQSFKLIISNTNKLAK-PELKAVVTEFENRLN 1310
            ...|.....|:..:.:|.||.:|:...:....|.:.:::::.:.:..:| .|.|:...|..:.:|
 Worm  1339 LVALAKFVQNDGGLHRLQDNWRHWSKFMCHPSVAKEYRMMVEHMHSTSKNDEFKSQCVELIDNIN 1403

  Fly  1311 EC----------------------LQVNPDTAAQGDQESTPEGQGNRTRAAPRTKK------GGR 1347
            :.                      .:.|| |...|...:|.....:|.||.|..:.      ...
 Worm  1404 KIESEGLRKEDVAIGSSITKNKGRAKKNP-TTMSGSSRTTSRAANSRRRAPPPAQSDEDDSDSDD 1467

  Fly  1348 KPAANRNNTVRGRGRRARRDSTSEESFSSSSSD 1380
            .|||.|:    ...|:|::.:.:::   .|.||
 Worm  1468 APAAPRS----AARRKAKKSAVADD---DSDSD 1493

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
Cap-D2	NP_651709.1	COG5098	85..1269	CDD:227429	257/1321 (19%)
dpy-28	NP_499379.2	COG5098	<358..1308	CDD:227429	207/1039 (20%)
		HEAT repeat	380..418	CDD:293787	9/37 (24%)
		HEAT repeat	428..454	CDD:293787	9/25 (36%)
		HEAT repeat	465..496	CDD:293787	11/30 (37%)
		Cnd1	1178..1327	CDD:463677	35/149 (23%)