DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment CG11898 and Abcc2

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_651679.2 Gene:CG11898 / 43451 FlyBaseID:FBgn0039645 Length:1320 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_036965.1 Gene:Abcc2 / 25303 RGDID:2366 Length:1541 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:1417 Identity:425/1417 - (29%)
Similarity:701/1417 - (49%) Gaps:213/1417 - (15%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly    12 PVTKANFFSKWFFIWTREILVKGLQRNLDPSDLYETEPSLESTQVSSFLLGHWEQELKRS----- 71
            |...|:|.|...|.|....::||.:..|...|:::.:...::..|:|.......::|:::     
  Rat   193 PSVTASFLSSITFSWYDRTVLKGYKHPLTLEDVWDIDEGFKTRSVTSKFEAAMTKDLQKARQAFQ 257

  Fly    72 --------KPN-------------------------------------VLRMIFKAYGWSFVPAS 91
                    ||.                                     :::.:||.:....:.:.
  Rat   258 RRLQKSQRKPEATLHGLNKKQSQSQDVLVLEEAKKKSEKTTKDYPKSWLIKSLFKTFHVVILKSF 322

  Fly    92 IVYSIMAIAVHTTQPLMLGGLVSFFSESTGKITKHSAYLYAMGVVLCSLISGLFFHPFMKYLFRV 156
            |:..|..:.|. ..|.:|..|:.|...|...:  ...|:.|:.:...:||.......:.::.|.:
  Rat   323 ILKLIHDLLVF-LNPQLLKLLIGFVKSSNSYV--WFGYICAILMFAVTLIQSFCLQSYFQHCFVL 384

  Fly   157 GSRVRLACAGLVYRKFLRVSVAADNSGVSGYAISLMATDLPTFNESFYCFHELWRGPLEGVVFVY 221
            |..||......:|:|.|.:|..|......|..::||:.|.....::......:|...::..:.::
  Rat   385 GMCVRTTVMSSIYKKALTLSNLARKQYTIGETVNLMSVDSQKLMDATNYMQLVWSSVIQITLSIF 449

  Fly   222 IIYQLIGWPAVVGLGTIVAFIPLQAWAARAIARYKRSSADVGDERVKLMNEIIAAMQLIKMYAWE 286
            .:::.:|...:.|:|.:|..||:....|..|...:..:....|:|:|:||||::.::::|.:|||
  Rat   450 FLWRELGPSILAGVGVMVLLIPVNGVLATKIRNIQVQNMKNKDKRLKIMNEILSGIKILKYFAWE 514

  Fly   287 KSFAKLIGKVRKEEMDSIRGSTYIYAGLQCTGMISKLSLFL--------SLVTY-----VFTGDI 338
            .||.:.:..:||:|:.:          |...|.:..|.:|:        |:||:     |.:.::
  Rat   515 PSFQEQVQGIRKKELKN----------LLRFGQLQSLLIFILQITPILVSVVTFSVYVLVDSANV 569

  Fly   339 VTSQKVFIVASYYDHLNDSLLHSWPLAINMWVETFVVANRVKDFLFQHENPADGG---------- 393
            :.::|.|...:.::.|... |...|:..:..::..|..:|::.:|        ||          
  Rat   570 LNAEKAFTSITLFNILRFP-LSMLPMVTSSILQASVSVDRLERYL--------GGDDLDTSAIRR 625

  Fly   394 VHNFKEAEDNPEHGNFFGRTHKPKAEVKSITVHKLSASWDQKKQEKRHRHIEDVSFQAQDQQFVG 458
            |.||.                      |::...:.|.:||...:..    |:||:...:..|.|.
  Rat   626 VSNFD----------------------KAVKFSEASFTWDPDLEAT----IQDVNLDIKPGQLVA 664

  Fly   459 IVGTVGAGKSTLLQVILGELDIISGSVEVNGVLSYAPQEPWLLRGSLRDNILFTEPYDEQRYLEV 523
            :|||||:|||:|:..:|||::.:.|.:.:.|..:|.||:.|:..|:::|||||...|:|::|.:|
  Rat   665 VVGTVGSGKSSLVSAMLGEMENVHGHITIQGSTAYVPQQSWIQNGTIKDNILFGSEYNEKKYQQV 729

  Fly   524 LRVCHLDRDVEQLPLGDSTRVGEGGASLSGGQKARVSLARAVYRKADIYLLDDPLSAVDSHVSKM 588
            |:.|.|..|:|.||.||...:||.|.:||||||.|||||||.|:.||||:|||||||||:||.|.
  Rat   730 LKACALLPDLEILPGGDMAEIGEKGINLSGGQKQRVSLARAAYQDADIYILDDPLSAVDAHVGKH 794

  Fly   589 LLDRCL--NEFLSKKIRILVTHRVQLLRHVDHLVLLEGGRISVQGHY-DALKKLIRF-------- 642
            :.::.:  |..|:.|.||.|||.:..|..||.:|:|..|.|..:|.| |.|.|...|        
  Rat   795 IFNKVVGPNGLLAGKTRIFVTHGIHFLPQVDEIVVLGKGTILEKGSYRDLLDKKGVFARNWKTFM 859

  Fly   643 -------RMSVANDVE------------------VAKLRAMRTDSVYEEPEPRKSLSQEEHMD-- 680
                   ..:|.||.|                  .|.|...|.:|:      |::||:.....  
  Rat   860 KHSGPEGEATVNNDSEAEDDDDGLIPTMEEIPEDAASLAMRRENSL------RRTLSRSSRSSSR 918

  Fly   681 --------------------RHEIEQQ---FKEQQQIGSVKLQTYKEYFKVLGHPLVVVLILLMF 722
                                ..|:|.|   .||..:.|.||...|.:|.:.:|. ..::.|:|.:
  Rat   919 RGKSLKNSLKIKNVNVLKEKEKEVEGQKLIKKEFVETGKVKFSIYLKYLQAVGW-WSILFIILFY 982

  Fly   723 VVARSSEATMDIFLSKWATWEETEPNQHEPIPEYHRTRLRMMILYTFLILCTLIFYVLRTFGFFM 787
            .:...:....:::||.| |.:....|.......:...|:.   ::..|.|...|..::.|.....
  Rat   983 GLNNVAFIGSNLWLSAW-TSDSDNLNGTNNSSSHRDMRIG---VFGALGLAQGICLLISTLWSIY 1043

  Fly   788 MTLRISLRIHDQLFQGVIRAFMHFFTLATSGRILNRFSSDVLAIDVNLPQAMMDSIE--FAVNAL 850
            .....|..:|.||...::||.|.||....:|||:||||.|:..:|..|||.:...:.  |.:...
  Rat  1044 ACRNASKALHGQLLTNILRAPMRFFDTTPTGRIVNRFSGDISTVDDLLPQTLRSWMMCFFGIAGT 1108

  Fly   851 AVLAVVSTANIWLLIPATVVVALLY-GCRCLYIGASRSLKRIETISRSPIYSHTNATFKGLATIR 914
            .|:..::|....::|   :.:::|| ..:..|:..||.|:|::::::||||||.:.|..||..||
  Rat  1109 LVMICMATPVFAIII---IPLSILYISVQVFYVATSRQLRRLDSVTKSPIYSHFSETVTGLPIIR 1170

  Fly   915 ALNGTKYMERDFHYYQNE---NTSALYLHVSINRAFAFWTDLICVLYILAVTFSFLLFDKHRGYY 976
            |.   ::.:|...:.:.:   |...::..::.||..|...:|:..|.:..   |.||...:|...
  Rat  1171 AF---EHQQRFLAWNEKQIDINQKCVFSWITSNRWLAIRLELVGNLVVFC---SALLLVIYRKTL 1229

  Fly   977 SGD-VGLAITQSMKLVLMCQAGMRQTVELENMMTSVERVMEYVNIPSEPAYETEESVNLPKHWPS 1040
            :|| ||..::.::.:.......:|.|.|.|..:.:|||:.||:|:.:|..:.|::  ..|..||.
  Rat  1230 TGDVVGFVLSNALNITQTLNWLVRMTSEAETNIVAVERISEYINVENEAPWVTDK--RPPADWPR 1292

  Fly  1041 GGQLDFRDLRLRYSNHGPYILKGLTFTIRGEEKIGIVGHTAAGKSSIVHALFR-LAHINGHISID 1104
            .|::.|.:.::||......:|||:|..|:..||:|:||.|.|||||:.:.||| |....|.|.||
  Rat  1293 HGEIQFNNYQVRYRPELDLVLKGITCNIKSGEKVGVVGRTGAGKSSLTNCLFRILESAGGQIIID 1357

  Fly  1105 GFETSQLGLHDLRRRISIIPQDPVLFSGSLRFNLDPFEEKTDEELWLALEAVKLKEFVSNLKDGI 1169
            |.:.:.:||||||.|::||||||:|||||||.|||||.:.:|||:|.|||...|:.|||.|:.|:
  Rat  1358 GIDVASIGLHDLRERLTIIPQDPILFSGSLRMNLDPFNKYSDEEVWRALELAHLRSFVSGLQLGL 1422

  Fly  1170 NCRLHDCGANFSMGQRQLVCLARALLRQNKILIMDEATANVDPETDNLIQEAIHTKFAHCTVLTI 1234
            ...:.:.|.|.|:|||||:||.||:||::|||::|||||.||.|||:|||..|..:|:.|||:||
  Rat  1423 LSEVTEGGDNLSIGQRQLLCLGRAVLRKSKILVLDEATAAVDLETDSLIQTTIRKEFSQCTVITI 1487

  Fly  1235 AHRLHTVMDNDRVMVVDMGRVVELGHPHELLHNRHGYLHRFVEKTGVGTAQH 1286
            ||||||:||:|::||:|.|::||.|.|.|||.|| |..:...::.|:....|
  Rat  1488 AHRLHTIMDSDKIMVLDNGKIVEYGSPEELLSNR-GSFYLMAKEAGIENVNH 1538

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
CG11898NP_651679.2 MRP_assoc_pro 2..1268 CDD:188098 420/1397 (30%)
Abcc2NP_036965.1 MRP_assoc_pro 7..1533 CDD:188098 423/1410 (30%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 862..881 4/18 (22%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 901..923 5/27 (19%)

Return to query results.
Submit another query.