DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment CG11898 and mrp-3

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_651679.2 Gene:CG11898 / 43451 FlyBaseID:FBgn0039645 Length:1320 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_001359552.1 Gene:mrp-3 / 181677 WormBaseID:WBGene00003409 Length:1505 Species:Caenorhabditis elegans


Alignment Length:1381 Identity:409/1381 - (29%)
Similarity:681/1381 - (49%) Gaps:198/1381 - (14%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly    12 PVTKANFFSKWFFIWTREILVKGLQRNLDPSDLYETEPSLESTQVSSFLLGHWEQE-LKRS---- 71
            |...|||.|:...:|..:|:..|.:|.|...|::|    ::|.....:|...|:.| ||::    
 Worm   194 PEENANFISRQLLLWFTQIISLGYERTLVADDVFE----MDSQMDQEYLKARWKTEWLKQTEKAR 254

  Fly    72 ------------------------------------------KPNVLRMIFKAYGWSFVPASIVY 94
                                                      :|:|:..:::...|..:..|.: 
 Worm   255 EKQVKLDDKRERARTGSEKAPLLGTFNNYGAVNLDDKDRVIVQPSVIVTLWQIMKWEILGGSFI- 318

  Fly    95 SIMAIAVHTTQPLMLGGLVSFFSESTGKITKHSAYLYAMGVVLCSLISGLFFHPFMKYLFRVGSR 159
            ..::..:....|..|..|:.|.......:.  :....|:|:.|...|..||.:.:...:.|||::
 Worm   319 KFLSDLLQFANPTFLNYLILFIETPNAPLI--NGIGLAVGLFLAGQIKSLFMNTYFIAMTRVGAK 381

  Fly   160 VR--LACAGLVYRKFLRVSVAADNSGVSGYAISLMATDLPTFNESFYCFHELWRGPLEGVVFVYI 222
            ::  |:||  ||.|.|.:|..|......|..:::::.|:..|........:.|..|.:.::.:.:
 Worm   382 IQTMLSCA--VYEKSLLLSNTARRERTVGEMVNILSIDVDRFRMITPQIQQYWSSPFQIIICMVL 444

  Fly   223 IYQLIGWPAVVGLGTIVAFIPL--------QAWAARAIARYKRSSADVGDERVKLMNEIIAAMQL 279
            :.|.||.....|:..:::.:|:        :.|..| :.:||       |||::|:||::..:::
 Worm   445 LSQTIGVAVWAGIVVMISIVPINICVSMITKRWQLR-LMKYK-------DERIRLINEVLNGIKV 501

  Fly   280 IKMYAWEKSFAKLIGKVRKEEMDSIRGSTYIYAGLQCTGMISKLSLFLSLVTYVFT----GDIVT 340
            :|:.|||.:..:.|.:||.:|:..|:.|..:.....|..:.:.:.:.||..| ||.    .:::|
 Worm   502 VKLSAWETAMEETIERVRDKELKMIKQSALLKTFADCLNVGAPVFVALSSFT-VFVLIDPKNVLT 565

  Fly   341 SQKVFIVASYYDHLNDSLLHSWPLAINMWVET--FVVAN-RVKDFLFQHENPADGGVHNFKEAED 402
            ....|:..|.::.|...|:    :|..:..:|  .||:| ||:.||.:.|...        .|.|
 Worm   566 PNIAFVSLSLFNLLRGPLM----MAAELVAQTVQLVVSNKRVRTFLCEKEVDT--------AAID 618

  Fly   403 NPEHGNFFGRTHKPKAEVKSITVHKLSASWDQKKQEKRHRHIEDVSFQAQDQQFVGIVGTVGAGK 467
            ....|..:..|         :.:|..|.:||..:.    |.:.|:.|.|..::.|.:||:||:||
 Worm   619 KEIRGELYTNT---------VEIHSGSFAWDSAEA----RILSDIEFLAGSKELVTVVGSVGSGK 670

  Fly   468 STLLQVILGELDIISGSVEVNGVLSYAPQEPWLLRGSLRDNILFTEPYDEQRYLEVLRVCHLDRD 532
            |:||...|||::.:.|.|.|.|.::|..|:||:|..||:.|:|.....::..|.:|:..|.|..|
 Worm   671 SSLLLAALGEMEKVCGYVGVRGSVAYLSQQPWILNQSLKKNVLMQADLNDVLYKKVIESCALKED 735

  Fly   533 VEQLPLGDSTRVGEGGASLSGGQKARVSLARAVYRKADIYLLDDPLSAVDSHVSKMLLDRCL--N 595
            ::|||.||.|.:||.|.:||||||||::||||||:..|:|.|||||||||:||.|.:.|..:  |
 Worm   736 LKQLPDGDDTEIGEKGINLSGGQKARIALARAVYQSKDVYFLDDPLSAVDAHVGKHIFDNVIGPN 800

  Fly   596 EFLSKKIRILVTHRVQLLRHVDHLVLLEGGRISVQGHYDALKKLIRFRM---------------- 644
            ..||...|||||:....|:....:::::.|||...|.|:.|...:..|.                
 Worm   801 GMLSHTTRILVTNCTSFLQESGKIIVMKDGRIKHCGTYNELLTDVEAREYLQEVDNEYAQAQESS 865

  Fly   645 ---------------SVANDVEVAKL-------RAMRTDSVYEEPEPRKSLSQEEHMDRHEIEQQ 687
                           |:|:...:::|       |.....|:.|:.:|...::             
 Worm   866 GEESGGEENSDILPGSIASGSRMSRLSRLSKISRKKSKSSIVEKKKPDALIT------------- 917

  Fly   688 FKEQQQIGSVKLQTYKEYFKVLGHPLVVVLILLMFVVARSSEATMDIFLSKWAT-WEETEPNQHE 751
             ||:..||.|....|..|||.:|    :|..:|.:.:|.....:..:..|.|.| |.:...:.:.
 Worm   918 -KEEAAIGRVNPGVYLLYFKAMG----IVTYVLPYAIAVVLNVSFALGRSLWLTAWSDANIDINH 977

  Fly   752 PIPEYHRTRLRMMILYTFLILCTLIFYVLRTFGFFMMTLRI------SLRIHDQLFQGVIRAFMH 810
            |.......||.   :|....:..:||.      ||.:.|.:      |..:|..|...|:|..:.
 Worm   978 PDTMSVGARLG---VYAGFGITEVIFL------FFSLVLLLIGGVAASKNLHKPLLHNVLRNPLS 1033

  Fly   811 FFTLATSGRILNRFSSDVLAIDVNLPQAMMDSIEFAVNALAVLAVVSTAN---IWLLIPATVV-- 870
            :|.:...|||:||.:.|:..:|:.|..:....:...:|.:..:.:||...   |.::||..::  
 Worm  1034 YFDITPIGRIINRLAKDMEVVDLRLSSSFRFLVMALINMVQTVLIVSYTTPLFIAIIIPVFIIYF 1098

  Fly   871 VALLYGCRCLYIGASRSLKRIETISRSPIYSHTNATFKGLATIRALNGTKYMERDFHYYQNENTS 935
            ..|.|.     |.::|.|:||.:::||||:|:.:.|.:|::|:||...:....|....:.|.:..
 Worm  1099 FVLKYS-----IKSTRQLQRIASLTRSPIFSNFSETLQGISTVRAFQWSDEFVRRNDEHLNTHVK 1158

  Fly   936 ALYLHVSINRAFAFWTDLI--CVLYILAVTFSFLLFDKHRGYYSGDVGLAITQSMKLVLMCQAGM 998
            ..|.....||..:...:|:  .|::..|:   ..:..|..|..:|.:||:::.|:.:..|....:
 Worm  1159 CSYYSQMANRWLSIRLELLGNIVIFSAAI---LAIIGKESGITAGMLGLSVSYSLNITFMLNMFV 1220

  Fly   999 RQTVELENMMTSVERVMEYVNIPSEPAYETEESVNLPKHWPSGGQLDFRDLRLRYSNHGPYILKG 1063
            ||..|:|..:.||||:.||....||..:..:.: |||.:||:||.::..|...||.:....:||.
 Worm  1221 RQINEVETNVVSVERIDEYSKTKSEAEWRLDNN-NLPSNWPTGGAVNIEDYSCRYRDELDLVLKQ 1284

  Fly  1064 LTFTIRGEEKIGIVGHTAAGKSSIVHALFRLAH-INGHISIDGFETSQLGLHDLRRRISIIPQDP 1127
            ::..|...:|:|:.|.|.|||||:..||||:.. .:|:||||...||.:||||||.:::||||:.
 Worm  1285 ISLNILPGQKVGVCGRTGAGKSSLALALFRIVEAADGNISIDQTITSHIGLHDLREKLTIIPQEN 1349

  Fly  1128 VLFSGSLRFNLDPFEEKTDEELWLALEAVKLKEFVSNLKDGINCRLHDCGANFSMGQRQLVCLAR 1192
            |||:.:||||:||..:.||::||||||...||..|..|...:...:.:.|.|||:|||||:||.|
 Worm  1350 VLFANTLRFNIDPKGQFTDQQLWLALENSNLKAHVELLPHKLESPVAEGGENFSVGQRQLLCLTR 1414

  Fly  1193 ALLRQNKILIMDEATANVDPETDNLIQEAIHTKFAHCTVLTIAHRLHTVMDNDRVMVVDMGRVVE 1257
            ||||::|:|::|||||.:|..||.::|..|..|||..|::||||||||::|.||::|:|.||:||
 Worm  1415 ALLRKSKVLVLDEATAGIDNRTDTMVQATIREKFADSTIITIAHRLHTIIDYDRIIVMDAGRIVE 1479

  Fly  1258 LGHPHELLHNRHGYLH 1273
            .|.|.|||.||:...:
 Worm  1480 DGIPGELLKNRNSQFY 1495

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
CG11898NP_651679.2 MRP_assoc_pro 2..1268 CDD:188098 407/1374 (30%)
mrp-3NP_001359552.1 MRP_assoc_pro 25..1501 CDD:188098 409/1381 (30%)

Return to query results.
Submit another query.