DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment CG11898 and cft-1

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_651679.2 Gene:CG11898 / 43451 FlyBaseID:FBgn0039645 Length:1320 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_504463.1 Gene:cft-1 / 178939 WormBaseID:WBGene00000477 Length:1247 Species:Caenorhabditis elegans


Alignment Length:1311 Identity:313/1311 - (23%)
Similarity:577/1311 - (44%) Gaps:156/1311 - (11%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly    11 NPVTKANFFSKWFFIWTREILVKGLQRNLDPSDLYETEPSLESTQVSSFLLG--HWEQELKRSKP 73
            |...|::|.||...:...::|.|.....:...||    |.||..|.|:.::.  .|:   ||...
 Worm    22 NEQAKSSFASKLLELPVSKLLQKCRSSTITVDDL----PILEEKQCSNRVMSGFKWK---KRVIF 79

  Fly    74 NVLRMIFKAYGWSFVPASIVYSIMAIAVHTTQPLMLGGLVSFFSESTGKITKHSAYLYAMGVV-- 136
            ::|...:|::..:|     .:.:.||.......|:|..|:.....|.   |..:.::.|:.::  
 Worm    80 SILMKFWKSFAGAF-----AFRMCAIFADYASILLLKYLIDSAEISA---TLFNFFIIAVLILFF 136

  Fly   137 --LCSLISGLFFHPFMKYLFRVG-SRVRLACA--GLVYRKFLRVSVAADNSGVSGYAIS-LMATD 195
              |.||:.|:  |.::     || ..|.:...  .::.:|.|.::  ::|:..:...|| |:.|.
 Worm   137 MQLKSLLLGV--HTYL-----VGEDSVEMVTVLNNIIVKKALHLT--SENTDWNRSKISKLLTTH 192

  Fly   196 LPTFNESFYCFHELWRGPLEGVVFVYIIYQLIGWPAVVGLGTIVAFIPLQAWAARAIAR---YKR 257
            ....:......|......:|..:.::.|::.:|...:     ||..|....:|...|..   ||:
 Worm   193 SEAVSNGLAYVHHSCSALIELTIALFWIWETLGTRTI-----IVVLIVALVYAVFNIIDSYVYKK 252

  Fly   258 S---SADVGDERVKLMNEIIAAMQLIKMYAWEKSFAKLIGKVRKEEMDSIRGSTYIYAGLQCTGM 319
            |   .....||||:....::.:|:.|||::||..|.|.:..:|.:|:...|.:..|.:.:....:
 Worm   253 SLKVQLKCRDERVEFEKTVLNSMETIKMFSWEPHFWKKLKSMRGKELSVFRKTLSINSFMHSLNV 317

  Fly   320 ISKLSL-FLSLVTYVFTGDI--VTSQKVFIVASYYDHLN-------------DSLLHSWPLAINM 368
            .|...: |:|...|....:|  :..:..|::.:.::::.             |..|||       
 Worm   318 TSPFVITFVSFAVYGLQYEISALRFEDAFVLIAIFNYMRRPLHVIIPSLEIVDKALHS------- 375

  Fly   369 WVETFVVANRVKDFLFQHENPADGGVHNFKEAEDNPEHGNFFGRTHKPKAEVKSITVHKLSASWD 433
                   |..:..||...::|.    .|.|.|...|.         :|..::|.:..   :.||:
 Worm   376 -------ATIINQFLIVKQSPK----INTKTAPQPPV---------EPDLDIKILNA---NFSWN 417

  Fly   434 QKKQEKRHRHIEDVSFQAQDQQFVGIVGTVGAGKSTLLQVILGELDIISGSVEVNGVLSYAPQEP 498
            .|...     :.||....:..:....:|....|||:||..|.|||.:..|::.|:..:|:||..|
 Worm   418 GKDDT-----LNDVCVHVKKGEKHAFIGFPLCGKSSLLFSITGELKMTKGNMWVSKGISFAPASP 477

  Fly   499 WLLRGSLRDNILFTEPYDEQRYLEVLRVCHLDRDVEQLPLGDSTRVGEGGASLSGGQKARVSLAR 563
            ::...||::||||...|.:.:|.:|:..|.|.:|:..||..::|.:|:.|..|:..|||::||||
 Worm   478 YIFSQSLKENILFGNDYVKSKYDKVIMACDLKKDIFSLPRCEATVLGDKGYVLTSTQKAQISLAR 542

  Fly   564 AVYRKADIYLLDDPLSAVDSHVSKMLLDRCLNE--FLSKKIRILVTHRVQLLRHVDHLVLLEGGR 626
            .:|..||||.||.....:|...|..:..|.|.|  :|..|..||.|:.::|::....:.:|:.|:
 Worm   543 CLYEDADIYALDKAFGPMDRTTSNKIFTRVLGENGYLRDKTVILATNNIELIKTFTMVHVLKNGK 607

  Fly   627 ISVQGHYDALKKLIRFRMSVANDVEVAKLRAMRTDSVY-EEPEPRKSLSQEEHMDRHEIEQQFKE 690
            |...|.||.:.:.......:.|...:.|:    .:..| :|..|||::..::.:.:...::|..|
 Worm   608 IETSGSYDQILECSEIMSDLLNQSRIDKI----IEEKYSDEKPPRKTVMFDDKVLKKRKKKQSME 668

  Fly   691 QQQIGSVKLQTYKEYFK---VLGHPLVVVLILLMFVVARSSEATMDIFLSKW--ATWEETEPNQH 750
            ...........|..||:   .:.....:||::..||.    :|....:||.|  ..|::.|   .
 Worm   669 DTAPVFENRSVYPFYFRSGSFIFTAFYIVLLICRFVF----QALAFFWLSFWLDPVWKKVE---C 726

  Fly   751 EPIPEYHRTRLRMMILYTF-LILCTLIFYVLRTFGFFMMT-LRISLRIHDQLFQGVIRAFMHFFT 813
            |..|:|  ..::.|..:.. .|:.|::.|.     ||::| ::.|.:::..:...:....|.|.:
 Worm   727 ENCPQY--VFIQTMSFFAISAIISTMLSYT-----FFVLTNVQTSRKLYQHITSAIFAVPMIFLS 784

  Fly   814 LATSGRILNRFSSDVLAIDVNLPQAMMDSIEFAVNALAVLAVVSTANIWLLIPATVVVA---LLY 875
            ......::|..:||:..:|...|.....|.|..::.|.:.|:| ..|:.:.  |..|||   .|.
 Worm   785 PTNKESLMNMITSDLDIVDTQFPLFFKFSFECTLHILMIFAIV-CVNVPVF--AIFVVAFLIFLV 846

  Fly   876 GCRCLYIGASRSLKRIETISRSPIYSHTNATFKGLATIRALNGTKYMERDFHYYQNENTSALYLH 940
            |....::.|...:..:|...|......:...|:....:|....|:..........:..|......
 Worm   847 GLLRYFLPALHKISSLEEQKRDLFLCGSIEDFEARIMVRTFGKTRQTLAKTSVNADILTRCRMAR 911

  Fly   941 VSINRAFAFWTD-----LICVLYILAVTFSFLLFDKHRGYYSGDVGLAITQSMKLVL--MCQAGM 998
            .|..|..:..|:     :||:.:.:|   |..|    :..|.|:...|::.:..|.:  :....:
 Worm   912 YSTLRWISLRTEFISNLMICMCFFIA---SICL----KVDYIGNAQFALSVASILCISELVSTFI 969

  Fly   999 RQTVELENMMTSVERVMEYVNIPSEPAYETEESVNLPKHWPSGGQLDFRDLRLRYSNHGPYILKG 1063
            |.|..||::...|:|:......|.||..   :...:...||..|:::.::|.: ::|...:::|.
 Worm   970 RTTCILESLTPHVQRISNVREYPKEPMI---DKCTIRDSWPDDGKIEIKNLNV-FANKYRHVIKD 1030

  Fly  1064 LTFTIRGEEKIGIVGHTAAGKSSIVHALFRL--AHINGHISIDGFETSQLGLHDLRRRISIIPQD 1126
            ::..|...||:||:|...:|||.:...|..:  |....||.:|..:..::.:..||.||::|||.
 Worm  1031 VSLVIEEREKLGIIGKVGSGKSQLAKTLVMMSSADKESHIVVDDLDIFEMSVKTLRSRITVIPQK 1095

  Fly  1127 PVLFSGSLRFNLDPFEEKTDEELWLALEAVKLKEFVSNLKDGINCRLHDCGANFSMGQRQ--LVC 1189
            ..:||.:||.|:||..:..|.::|||:||.:|:|:|.:|.||    ||...:...|...|  .|.
 Worm  1096 AKIFSDTLRSNIDPCCQFADSDIWLAIEACQLREYVKSLPDG----LHQMVSPEKMSNEQKCQVN 1156

  Fly  1190 LARALLRQNKILIMDEATANVDPETDNLIQEAIHTKFAHCTVLTIAHRLHTVMDNDRVMVVDMGR 1254
            :.||||:..:|.::|::|..:.....:|:.|||.......|.:.|......|...|||:|::.|.
 Worm  1157 VCRALLKGGQIFVIDQSTKMMKEPIKSLVNEAIRNSLKQSTTIWIGEDFSDVEHCDRVVVIENGV 1221

  Fly  1255 VVELGHPHELL 1265
            ::....|..|:
 Worm  1222 ILTTDTPQNLI 1232

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
CG11898NP_651679.2 MRP_assoc_pro 2..1268 CDD:188098 313/1311 (24%)
cft-1NP_504463.1 MRP_assoc_pro 67..1236 CDD:188098 299/1262 (24%)

Return to query results.
Submit another query.