Protein Alignment rdog and Mdr50

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_651678.1
• Gene: rdog / 43450
• FlyBaseID: FBgn0039644
• Length: 1374
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: NP_523740.3
• Gene: Mdr50 / 36582
• FlyBaseID: FBgn0010241
• Length: 1313
• Species: Drosophila melanogaster
• Alignment Length: 1428
• Identity: 326/1428 - (22%)
• Similarity: 575/1428 - (40%)
• Gaps: 298/1428 - (20%)

  Fly    43 DEELYQHRKTLDSERVTNKFAELWEDELKRSNPSVVRMILRAYGKIFVPMGLAFSISETICKSLM 107
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  Fly    58 EEDGSQYHE--DVKQVS--YFQLFRYATKKDRALYVIGLLSA-----VATGLTTPANSLIFGNLA 113

  Fly   108 --PLFLGGLVGYFATNQTDISENTAYL-----------YAMGIV--ICMLVPVITFHPFIFYIFQ 157
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  Fly   114 NDMIDLGGLLESGKSYRADDAISTLLLDKVRQFSLQNTY-IGIIMLVCSYLSITCFN------YA 171

  Fly   158 VGTKLRLALSGLIYRKVLQVSKSSSNDGLRGRAINILSNDLGRFDVALC-----FLH--DTWKGP 215
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  Fly   172 AHSQI-LTIRSKFFRSILHQDMKWYDFNQSGEVASRMNEDLSKMEDGLAEKVVMFVHYLVAFVG- 234

  Fly   216 MESILIGFLMYREIGISAVIGVSFMLSFIPLQAWAAKKAAYYRQMTAERTDMRVKLMNEIIQGIQ 280
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  Fly   235 --SLVLAFV--KGWQLSLVCLTSLPLTFIAM------------GLVAVATSRLAK---------K 274

  Fly   281 VIKMYAWEKSFARVIAEVRL---KEVKAIRG-----TAYIHAALGC------TSMISPLSVFLAL 331
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  Fly   275 EVTMYAG----AAVVAEGALSGIRTVKAFEGEAKEVAAYKERVVAAKILNIKRNMFSGIG-FGLL 334

  Fly   332 CSYVYLGDPLT-------AQKVYTVSSYFNMLNDSMVTFW------PMSITFIA---EALVSAK- 379
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  Fly   335 WFFIYASYALAFWYGVGLVIKGYHEPAYENYDAGTMITVFFSVMMGSMNIGMAAPYIEAFGIAKG 399

  Fly   380 RC-KDF-LLDGDKAEVPINLEANQQTGKNKRKISKKDKQKNVELNGSLLSNGQVHHNRLRDYDPE 442
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  Fly   400 ACAKVFHIIE----QIP---EINPIDGEGKK------------LN-----------------EPL 428

  Fly   443 ATKKCVVLKNVSASWDTSD-----GHANCAIEDFSTDIKDQTLAAVVGPVGAGKSSFLNVLLGEV 502
            .|   :..|.|...:.|..     ...|..|.      :.||: |:|||.|.|||:.:.::....
  Fly   429 TT---IEFKEVEFQYPTRPEVSILNKLNLKIH------RGQTV-ALVGPSGCGKSTCIQLVQRFY 483

  Fly   503 GIDKGEAMVHG-------------KISYASQESWVFEGTIRDNIVF-VEDYNERRYKKVVKVCGL 553
            ....|..:.:|             :|....||..:|..:|.:||.: .||......:........
  Fly   484 DPQAGNLLFNGTNLKDLDINWLRSRIGVVGQEPILFATSIYENIRYGREDATREEIEAAAAAANA 548

  Fly   554 ERDMELLPRGDLTVVGERGVSLSGGQKARVSLARAVYRKADIYLLDDPLSAVDTHVGKHIFDRCI 618
            ...::.||:|..|:|||||..||||||.|:::|||:.|..:|.|||:..||:|| ..:......:
  Fly   549 AIFIKKLPKGYDTLVGERGAQLSGGQKQRIAIARALIRDPEILLLDEATSALDT-ASEAKVQAAL 612

  Fly   619 RDFLSNKIRILVTHQVQYLFDVEHLLLMGSGKIMAQGSYQELQRSRQFQF-LEQTQHDESGIDTH 682
            ....:.:..|:|.|::..:...:.::::..|:::..|::|||...:...| |..||   .|.|..
  Fly   613 EKVSAGRTTIIVAHRLSTVRRADRIVVINKGEVVESGTHQELMELKDHYFNLVTTQ---LGEDDG 674

  Fly   683 SVSS--------------------YLSRSDSEKSMEHQHNQLLRPDEHVEDVNQEQQTVGSIKMH 727
            ||.|                    .||..:.|..|........:..:.|:|.|:.:..:..:||:
  Fly   675 SVLSPTGDIYKNFDIKDEDEEEIKVLSEDEDEDVMVTDEKNKKKKKKKVKDPNEVKPMLEVMKMN 739

  Fly   728 --VYASYIKALDSTFLLGIVISLFVCARIMLTGVDYFLSRWVIWEEQIAVNRTTTLLNETDTTIA 790
              .:........|:.::|..:.:|.                      :.......:|:..|
  Fly   740 KPEWLQIAVGCISSVIMGCAMPIFA----------------------VLFGSILQILSVKD---- 778

  Fly   791 NDTLPINATDPYIAPLLASDIQAGIRQELVLFYATILGATLIVYLIRTFGFFKMCLRISLHLHDR 855
            ||......::.|....|.:.|..||...|.:::..|.|.                 |::..|...
  Fly   779 NDQYVRENSNQYSLYFLIAGIVVGIATFLQIYFFGIAGE-----------------RLTERLRGL 826

  Fly   856 LFRGITRASMYFFN--TNSSGRILNRFSKDIRTVDTDLPHTLLDCLAFIIDVSGVVIIVAIANY- 917
            :|..:.|..:.:|:  .|.:|.:..|.|.|...|.......:   ...:..:|.:.:.:|::.|
  Fly   827 MFEAMLRQEVAWFDDKANGTGSLCARLSGDAAAVQGATGQRI---GTIVQSISTLALGIALSMYY 888

  Fly   918 -WLLIPAAI-----IGVILGMIRYLYVNTSR-SVKRLESISRSPVFSLTNQTFQGLTTIRALQAQ 975
             |.|...|:     |.:...|.|.|....:. |.|.:|:.::..|..::|     :.|:.:|
  Fly   889 EWSLGLVALAFTPFILIAFYMQRTLMAKENMGSAKTMENCTKLAVEVVSN-----IRTVASL--- 945

  Fly   976 SALEQEFH-----------EYQNTNTSAWFLFLSCTRAFALWSDVLCIVYMT-AVTFSFLLLKDE 1028
             ..|:.||           |....||....|.....|:...::...|:.|.| .|....:|..|.
  Fly   946 -GREEMFHQNYIGMLIPAVEISKRNTHFRGLVYGLARSLMFFAYAACMYYGTWCVIHRGILFGDV 1009

  Fly  1029 FDSGDVGLAILHSTTMTGMCQWGMRQTAELENQMTSVERVLEY-TEQPSEALLETPEKFKPKSEW 1092
            |   .|..|::..|.....   .:.....::..:::.:.:..: ..|||  :::.|.  ..:..|
  Fly  1010 F---KVSQALIMGTASIAN---ALAFAPNMQKGVSAAKTIFTFLRRQPS--IVDRPG--VSRDPW 1064

  Fly  1093 PSKGRIEFINFKLRYSPK-EAPVLKDLNFTIEPREKIGIVGRTGAGKSSIIQSIFRL-ACNEGMI 1155
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  Fly  1065 HSEGYVRFDKVKFSYPTRSEIQVLKGLELAVSKGQKIALVGPSGCGKSTCIQLIQRFYDVDEGAT 1129

  Fly  1156 RIDDVDIEHIGLHDLRSQVSIIPQDPVLFSGTLRYNLDPMDER---SDEEMWKALGDVELRSYVS 1217
            .||:.|:.::.:.:||:|:.|:.|:|:||..|:|.|:...|..   :|:|:..|.....:..:::
  Fly  1130 LIDECDVRNVSMTNLRNQLGIVSQEPILFDRTIRENISYGDNARNVTDQEIISACKKSNIHEFIA 1194

  Fly  1218 TLIGGLNCRMYDGGSNFSVGQRQLVCLARAILRHNKILIMDEATANVDPETDKLIQQTIRSKFAH 1282
            .|..|.:.||.:.|:..|.||:|.:.:|||::|:.||:::||||:.:|.|::|::|..:.:....
  Fly  1195 NLPLGYDTRMGEKGAQLSGGQKQRIAIARALIRNPKIMLLDEATSALDAESEKVVQDALDAASEG 1259

  Fly  1283 CTVLTIAHRLHTVMDSDRVLVMDAGEVRELGHPYELLQRTGGYLRQLVDNTGAATSFALQQAA 1345
            .|.::|||||.||:.||.:.|.:.|.|.|.|...:||...|.|.          |.:.||..|
  Fly  1260 RTTISIAHRLSTVVHSDVIFVFENGLVCEAGDHKQLLANRGLYY----------TLYKLQSGA 1312

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
rdog	NP_651678.1	MRP_assoc_pro	14..1323	CDD:188098	320/1404 (23%)
Mdr50	NP_523740.3	PTZ00265	69..1308	CDD:240339	320/1409 (23%)