DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment rdog and CG7627

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_651678.1 Gene:rdog / 43450 FlyBaseID:FBgn0039644 Length:1374 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_609215.3 Gene:CG7627 / 34148 FlyBaseID:FBgn0032026 Length:1355 Species:Drosophila melanogaster


Alignment Length:1375 Identity:602/1375 - (43%)
Similarity:863/1375 - (62%) Gaps:69/1375 - (5%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly    11 PKNPFTKANFFSQWSFWWMRDLFKRGLQGPLTDEELYQHRKTLDSERVTNKFAELWEDELKRS-- 73
            |:||....||.|...||:....|.:|.:..|..::||:..|...||.:.||....||.||:::  
  Fly    10 PENPREHCNFISAACFWYTMPTFIKGRKRTLDTKDLYRALKEHKSETLGNKLCASWELELEKTKG 74

  Fly    74 NPSVVRMILRAYGKIFVPMGLAFSISETICKSLMPLFLGGLVGYFATNQTDISENTAYLYAMGIV 138
            .|:::|.:||.:|..|..:||...:.|...::|.|:||..|:.|:......|  .:||.||.|::
  Fly    75 KPNLLRALLRVFGWYFALLGLVLFLLELGLRTLQPIFLLKLIAYYTHGSESI--ESAYYYAAGVI 137

  Fly   139 ICMLVPVITFHPFIFYIFQVGTKLRLALSGLIYRKVLQVSKSSSNDGLRGRAINILSNDLGRFDV 203
            :|..:.||..||::.....||.|:|:.:..:||||.|::|||:..|...|..:|::|||:||.|:
  Fly   138 LCSALNVIIMHPYMLGTMHVGLKMRVGMCSMIYRKALRLSKSALGDTTAGHVVNLMSNDVGRLDL 202

  Fly   204 ALCFLHDTWKGPMESILIGFLMYREIGISAVIGVSFMLSFIPLQAWAAKKAAYYRQMTAERTDMR 268
            |..|:|..|.||:|::.|.:||||||||:||.||:|||.||||||:..|:.:..|..||.|||.|
  Fly   203 ATIFVHYLWVGPLETLFITYLMYREIGIAAVFGVAFMLLFIPLQAYLGKRTSVLRLRTALRTDER 267

  Fly   269 VKLMNEIIQGIQVIKMYAWEKSFARVIAEVRLKEVKAIRGTAYIHA-ALGCTSMISPLSVFLALC 332
            |::|||||.|||||||||||..|..::|..|.||:.|||..:||.. .|.....::.:|:||:|.
  Fly   268 VRMMNEIISGIQVIKMYAWELPFEHMVAFARKKEINAIRHVSYIRGILLSFIIFLTRVSIFLSLV 332

  Fly   333 SYVYLGDPLTAQKVYTVSSYFNMLNDSMVTFWPMSITFIAEALVSAKRCKDFLLDGDKAEVPINL 397
            .||.||..||.:..:.:::|:|:|..:|..|:|..|:.:||.|||.||.:.::...:...:.:::
  Fly   333 GYVLLGTFLTPEVAFLITAYYNILRTTMTVFFPQGISQMAETLVSIKRVQKYMQSDETNVMDMSV 397

  Fly   398 EANQQ-TGKNKRKISKKDKQKNVELNGSLLSN--GQVHHNRLRDYDPEATKKCVVLKNVSASWDT 459
            :..:. .|.|:..:.....::..|....||..  ..|:.|      .:.::..:.:..:.|.||.
  Fly   398 DLTEDFQGSNQETVHADGDEERDEAEDKLLGPPIATVNEN------AKLSEAGISISGLMAKWDV 456

  Fly   460 SDGHANCAIEDFSTD-----IKDQTLAAVVGPVGAGKSSFLNVLLGEVGIDKGEAMVHGKISYAS 519
            :.       .|:|.:     ::..|:..:||..|:||||.:..:|||:..:.||..|:|.:||||
  Fly   457 NS-------PDYSLNGVNLRVQPGTMLGIVGRTGSGKSSLIQAILGELPAESGEIKVNGSMSYAS 514

  Fly   520 QESWVFEGTIRDNIVFVEDYNERRYKKVVKVCGLERDMELLPRGDLTVVGERGVSLSGGQKARVS 584
            ||.|:|.||:|.||:|.:..:.|||.||||.|.||||.||||..|.|:|||||.|||||||||:|
  Fly   515 QEPWLFSGTVRQNILFGQPMDRRRYAKVVKKCALERDFELLPFKDKTIVGERGASLSGGQKARIS 579

  Fly   585 LARAVYRKADIYLLDDPLSAVDTHVGKHIFDRCIRDFLSNKIRILVTHQVQYLFDVEHLLLMGSG 649
            |||||||:..|||||||||||||||.:|:|::|:|.:|..:|.||.|||:|:|...:.:::|..|
  Fly   580 LARAVYRETSIYLLDDPLSAVDTHVARHLFEQCMRGYLRERIVILATHQLQFLQHADQIVIMDKG 644

  Fly   650 KIMAQGSYQELQRS-----------RQFQFLEQTQHDESGIDTHSVSSYLSRSDSEKSMEHQHNQ 703
            ::.|.|:|:.|:.|           .:.:..|:.....||..|||.|.  .|.:||:|:      
  Fly   645 RVSAVGTYESLRESGLDFASMLADPERDEQSEERSRSRSGSYTHSHSD--QRRNSEQSL------ 701

  Fly   704 LLRPDEHVEDV------NQEQQTVGSIKMHVYASYIKALDSTFLLGIVISLFVCARIMLTGVDYF 762
            |...|..::|:      |||:|..|.|.:.:|:.|.||....|...:::...|.::.:.:..|||
  Fly   702 LSMADSCMDDLEAEQANNQERQEAGQIGLRLYSKYFKAGGGFFAFFVMMGFCVLSQGLASLGDYF 766

  Fly   763 LSRWVIWEEQIAVNRTTTLLNETDTTIANDTLPINATDPYIAPLLASDIQAGIRQELV--LFYAT 825
            ||.||..:..:|.....           |||......:|.::..| .||...:..|::  ..:..
  Fly   767 LSYWVTKKGNVAYRADN-----------NDTTRSEELEPRLSTWL-RDIGLSVDAEMLDTYIFTV 819

  Fly   826 ILGATLIVYLIRTFGFFKMCLRISLHLHDRLFRGITRASMYFFNTNSSGRILNRFSKDIRTVDTD 890
            |...|::|.:.|:|.||.:.::.|:.||:.:|||||||:|||||||.|||||||||||:..||..
  Fly   820 ITVLTILVTVARSFLFFNLAMKASIRLHNSMFRGITRAAMYFFNTNPSGRILNRFSKDMGQVDEI 884

  Fly   891 LPHTLLDCLAFIIDVSGVVIIVAIANYWLLIPAAIIGVILGMIRYLYVNTSRSVKRLESISRSPV 955
            ||..::|.:...:.::|:||::|:.|...|||..::|:|...:|..|:.|||.|||:|:|:||||
  Fly   885 LPAVMMDVIQIFLALAGIVIVIAVVNPLFLIPTVVLGIIFYQLRTFYLKTSRDVKRMEAITRSPV 949

  Fly   956 FSLTNQTFQGLTTIRALQAQSALEQEFHEYQNTNTSAWFLFLSCTRAFALWSDVLCIVYMTAVTF 1020
            :|....:..||:||||..||..||.||..||:.::||:::|:|.:|||..|.|..|::|:..:|.
  Fly   950 YSHLAASLTGLSTIRAFGAQRVLEAEFDNYQDMHSSAFYMFISTSRAFGYWLDCFCVIYIAIITL 1014

  Fly  1021 SFLLLKDEFDSGDVGLAILHSTTMTGMCQWGMRQTAELENQMTSVERVLEYTEQPSEALLETPEK 1085
            ||.:.... :.|||||||..:..||||.||||||:|||||.||:||||:||.:...|..||.|..
  Fly  1015 SFFIFPPA-NGGDVGLAITQAMGMTGMVQWGMRQSAELENTMTAVERVVEYEDIEPEGALEAPAD 1078

  Fly  1086 FKPKSEWPSKGRIEFINFKLRYS--PKEAPVLKDLNFTIEPREKIGIVGRTGAGKSSIIQSIFRL 1148
            .||...||.:|:|.|....|||:  ||...|||.|:|.|:|:||:||||||||||||:|.::|||
  Fly  1079 KKPPKSWPEQGKIVFDELSLRYTPDPKSENVLKSLSFVIKPKEKVGIVGRTGAGKSSLINALFRL 1143

  Fly  1149 ACNEGMIRIDDVDIEHIGLHDLRSQVSIIPQDPVLFSGTLRYNLDPMDERSDEEMWKALGDVELR 1213
            :.|:|.:.||..|...:|||||||::|||||:|||||||:||||||.||.||:::|::|.:|:|:
  Fly  1144 SYNDGSVLIDKRDTSEMGLHDLRSKISIIPQEPVLFSGTMRYNLDPFDEYSDDKLWRSLEEVKLK 1208

  Fly  1214 SYVSTLIGGLNCRMYDGGSNFSVGQRQLVCLARAILRHNKILIMDEATANVDPETDKLIQQTIRS 1278
            ..|:.|..||..::.:||:||||||||||||||||||.|:||:||||||||||:||.|||.|||:
  Fly  1209 EVVADLPSGLQSKITEGGTNFSVGQRQLVCLARAILRENRILVMDEATANVDPQTDGLIQTTIRN 1273

  Fly  1279 KFAHCTVLTIAHRLHTVMDSDRVLVMDAGEVRELGHPYELLQRTGG-YLRQLVDNTGAATSFALQ 1342
            ||..||||||||||||:||||:|||||||...|.|.|||||..... ....:|..||.||..:|.
  Fly  1274 KFKECTVLTIAHRLHTIMDSDKVLVMDAGRAVEFGTPYELLTLADSKVFHGMVKQTGHATYESLL 1338

  Fly  1343 QAAEQSYSKQ 1352
            :.|::::..:
  Fly  1339 KIAQKAFENR 1348

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
rdogNP_651678.1 MRP_assoc_pro 14..1323 CDD:188098 593/1340 (44%)
CG7627NP_609215.3 PLN03130 13..1348 CDD:215595 600/1370 (44%)

Return to query results.
Submit another query.