Protein Alignment rdog and cftr

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_651678.1
• Gene: rdog / 43450
• FlyBaseID: FBgn0039644
• Length: 1374
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: XP_031754831.1
• Gene: cftr / 100486085
• XenbaseID: XB-GENE-853972
• Length: 1485
• Species: Xenopus tropicalis
• Alignment Length: 1538
• Identity: 401/1538 - (26%)
• Similarity: 711/1538 - (46%)
• Gaps: 289/1538 - (18%)

  Fly    12 KNPFTKANFFSQWSFWWMRDLFKRGLQGPLTDEELYQHRKTLDSERVTNKFAELWEDEL--KRSN 74
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 Frog     3 RSPLEKASIFSQIFFSWTKPILWKGYRQRLELSDIYQIHPGDSADNLSERLEREWDREVATSKKN 67

  Fly    75 PSVVRMILRAYGKIFVPMGLAFSISETICKSLMPLFLGGLV-GYFATNQTDISENTAYLYAMGIV 138
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 Frog    68 PKLINALKRCFFWKFLFYGILLYLGE-VTKAVQPLLLGRIIASYDRDNEHE--RSIAYYLAIGLC 129

  Fly   139 ICMLVPVITFHPFIFYIFQVGTKLRLALSGLIYRKVLQVSKSSSNDGLRGRAINILSNDLGRFDV 203
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 Frog   130 LLFVVRMLLLHPAIFGLHHIGMQMRIAMFSLIYKKTLKLSSRVLDKISTGQLVSLLSNNLNKFDE 194

  Fly   204 ALCFLHDTWKGPMESILIGFLMYREIGISAVIGVSFMLSFIPLQAWAAKKAAYYRQMTAERTDMR 268
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 Frog   195 GLALAHFVWIAPLQVLLLMGLLWDLLQASAFCGLGFLIILALFQAWLGRMMMKYRDKRAGKINER 259

  Fly   269 VKLMNEIIQGIQVIKMYAWEKSFARVIAEVRLKEVKAIRGTAYIHAALGCTSMISP-LSVFLALC 332
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 Frog   260 LVITSEIIENIQSVKAYCWESAMEKIIETIRETELKLTRKAAYVRYFNSSAFFFSGFFVVFLCIV 324

  Fly   333 SYVYLGDPLTAQKVYTVSSYFNMLNDSMVTFWPMSITFIAEALVSAKRCKDFLLDGDKAEVPINL 397
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 Frog   325 PHLLL-DGISLRKIFTTISFSIVLRMAVTRQFPWAVQTWYDSLGVINKIQEFL------------ 376

  Fly   398 EANQQTGKNKRKISKKDKQKNVELNGSLLSNGQVHHNRLRDYDPEATKKCVVLKNVSASWDTSDG 462
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 Frog   377 --------------QKEEYKSLEYN--------------------LTTTEVAMENVSASWDEGIG 407

  Fly   463 -----------------------------HANCAIEDFSTDIKDQTLAAVVGPVGAGKSSFLNVL 498
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 Frog   408 EFFEKAKQEVNGGNISNEDPSPFFSNFSLHVAPVLRNINFKIEKGQLLAIAGSTGAGKTSLLMMI 472

  Fly   499 LGEVGIDKGEAMVHGKISYASQESWVFEGTIRDNIVFVEDYNERRYKKVVKVCGLERDMELLPRG 563
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 Frog   473 MGELEPSAGKIKHSGRISFSPQVSWIMPGTIKENIIFGVSYDQYRYLSVIKACQLEEDISKFPEK 537

  Fly   564 DLTVVGERGVSLSGGQKARVSLARAVYRKADIYLLDDPLSAVDTHVGKHIFDRCIRDFLSNKIRI 628
            |.||:||.|::|||||:||:|||||||:.||:||:|.|.|.:|....|.||:.|:...::||.||
 Frog   538 DNTVLGEGGITLSGGQRARISLARAVYKDADLYLMDSPFSYLDLFTEKEIFESCVCKLMANKTRI 602

  Fly   629 LVTHQVQYLFDVEHLLLMGSGKIMAQGSYQELQ-------------------------------- 661
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 Frog   603 LVTSKVEQLKKADKVLILHEGSCYFYGTFSELQDQRPEFSSHLTGFDHFNAERRNSIITETLRRC 667

  Fly   662 -------------------------------------RSRQFQFLEQTQHDESGIDTHSV----- 684
                                                 .||:|..::::|...|||:...:
 Frog   668 SIDSDPTAVRNEVKNKSFKQVADFSEKRKNSVINPRKSSRKFSIMQKSQPQMSGIEEEDIPPNQG 732

  Fly   685 --------------------------------------------------SSYLSRSDSEKSME- 698
                                                              :::.:|:.|.:.|.
 Frog   733 ERKLSLVPESEQGEASLPRSNVLNTGPTFQGRRRQSVLNLMTRTSVSQGSNAFATRNTSVRKMSV 797

  Fly   699 ----------HQHNQLLRPD---EHVEDVNQE-------QQTVGSIKMHVYASYIKALDS----T 739
                      ..:|:.|..|   |..|::|:|       ..|........:.:||:.|.:    .
 Frog   798 GSFSNSSFEVDIYNRRLSQDSILEVSEEINEEDLKECFLDDTDSPSPTTTWNTYIRFLTAHKNFI 862

  Fly   740 FLLGIVISLFVCARIMLTGVDYFLSRWVIWEEQIAVNRTTTLLNETDTTIANDTLPINATDP--- 801
            |:|...|.:|: |.::.:..    ..|:|.......|.|:   || :.:.|:|.|.:..|..
 Frog   863 FILVFCIVIFL-AEVIASSA----GLWIIKRNAPVSNMTS---NE-NISEASDILSVIVTHTSFY 918

  Fly   802 YIAPLLASDIQAGIRQELVLFYATILGATLIVYLIRTFGFFKMCLRISLHLHDRLFRGITRASMY 866
            |:                ...|..:..:.|.:.:.|........:.:|..||.::...|..|.|.
 Frog   919 YV----------------FYIYVGVADSLLALGIFRGLPLVHSLISVSRVLHKKMLHSILHAPMS 967

  Fly   867 FFNTNSSGRILNRFSKDIRTVDTDLPHTLLDCLAFIIDVSGVVIIVAIAN-YWLLIPAAIIGVIL 930
            .|||..:||||||||||...:|..||.::.|....::.|.|.:.:|::.. |..|....:|...:
 Frog   968 TFNTMRAGRILNRFSKDTAILDDILPLSIFDFTQLVLIVIGAITVVSLLEPYIFLATVPVIAAFI 1032

  Fly   931 GMIRYLYVNTSRSVKRLESISRSPVFSLTNQTFQGLTTIRALQAQSALEQEFHEYQNTNTSAWFL 995
             ::|..:::||:.:|:|||.:|||:|:....:.:||.|:||...|...|..||:..|.:|:.|||
 Frog  1033 -LLRSYFLHTSQQLKQLESEARSPIFAHLITSLKGLWTLRAFGRQPYFETLFHKALNLHTANWFL 1096

  Fly   996 FLSCTRAFALWSDVLCIVYMTAVTFSFLLLKDEFDSGD--VGLAILHSTTMTGMCQWGMRQTAEL 1058
            :||..|.|.:..:::.:::..||:|..:...   .:|:  ||:.:..:..:....||.:..:.::
 Frog  1097 YLSTLRWFQMTIEMIFVIFFIAVSFISIATS---GAGEEKVGIVLTLAMNIMNTLQWAVNASIDV 1158

  Fly  1059 ENQMTSVERVLEYTEQP---------------SEALLETPEKFKPKSEWPSKGRIEFINFKLRYS 1108
            ::.|.||.|:..:.:.|               ||.|:...:..|....|||.|::...|...:|.
 Frog  1159 DSLMRSVSRIFRFIDMPREELIHDNNHKDDQLSEVLIYENDYIKKNQVWPSGGQMTVKNLSAKYK 1223

  Fly  1109 PKEAPVLKDLNFTIEPREKIGIVGRTGAGKSSIIQSIFRLACNEGMIRIDDVDIEHIGLHDLRSQ 1173
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 Frog  1224 DGGHTVLENISFSLNPGQRVGLLGRTGSGKSTLLSAFLRLLSTQGDIQIDGVSWQTIPLQKWRKA 1288

  Fly  1174 VSIIPQDPVLFSGTLRYNLDPMDERSDEEMWKALGDVELRSYVSTLIGGLNCRMYDGGSNFSVGQ 1238
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 Frog  1289 FGVVPQKVFIFSGTIRKNLDPYGKWSDEELLKVTEEVGLKSIIDQFPGQLDFVLLDGGCVLSHGH 1353

  Fly  1239 RQLVCLARAILRHNKILIMDEATANVDPETDKLIQQTIRSKFAHCTVLTIAHRLHTVMDSDRVLV 1303
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 Frog  1354 KQLVCLARSVLSKAKILLLDEPSAHLDPITFQIIRKTLKHAFANCTVILSEHRLEAMLECQHFLV 1418

  Fly  1304 MDAGEVRELGHPYELLQR---TGGYLRQLVDNTGAATSFALQQ 1343
            ::...||:    |:.:|:   ...:.:|.:..:.....|.|.:
 Frog  1419 IEDNTVRQ----YDSIQKLMNEKSFFKQAISQSDRLKLFPLHR 1457

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
rdog	NP_651678.1	MRP_assoc_pro	14..1323	CDD:188098	398/1514 (26%)
cftr	XP_031754831.1	CFTR_protein	1..1472	CDD:273530	401/1538 (26%)