DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment Rpn2 and Rpn2

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_001263057.1 Gene:Rpn2 / 43449 FlyBaseID:FBgn0028692 Length:1029 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:XP_321340.6 Gene:Rpn2 / 1281429 VectorBaseID:AGAMI1_001466 Length:1042 Species:Anopheles gambiae


Alignment Length:1056 Identity:800/1056 - (75%)
Similarity:881/1056 - (83%) Gaps:53/1056 - (5%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly     1 MSLTSAAGIISLLDEPMPDLKVFALKKLDNIVDEFWPEISESIEKIEMLHEDRSFPENKLAGMVA 65
            :::|||||||.|||||:.:||||||.||:.||.||||||||:.|||||||||:||..::||.:||
Mosquito     2 VNITSAAGIICLLDEPVTELKVFALNKLNMIVGEFWPEISEAAEKIEMLHEDKSFSHHELAALVA 66

  Fly    66 SKVFYHLGSFEDALTYALGAGDLFDVNARNEYTETIIAKCIDFYIAQRVEFI---ENPKEASVVD 127
            |||:||||||||:|||||||||||||||||||.:||||||||.|...||..:   ||...|..:|
Mosquito    67 SKVYYHLGSFEDSLTYALGAGDLFDVNARNEYVDTIIAKCIDHYTQLRVALVEAEENNLVAKPID 131

  Fly   128 ERLEGIVNRMIQRCLDDNQFRQALGIALETRRMDTFKDAIMKSDDVRGMLAYAYNVTMSLIQNRG 192
            .|||.||||||||||:|.|::|||||||||||||..:.:|||:|||.||||||:.|||..||||.
Mosquito   132 ARLEAIVNRMIQRCLEDGQYKQALGIALETRRMDIVEASIMKADDVPGMLAYAFQVTMGFIQNRA 196

  Fly   193 FRNEVLRCLVSLYRDLGVPDYVNMCQCLIFLEDPFAVAEMLDNLTRSSVETNNLMAYQIAFDLYE 257
            |||.||||||.|||:.||||||||||||||||||.||||:||.||:.| |::.||||||||||||
Mosquito   197 FRNTVLRCLVELYRNAGVPDYVNMCQCLIFLEDPLAVAEVLDGLTKES-ESSVLMAYQIAFDLYE 260

  Fly   258 SATQEFLGNVLQHLKNTAPIPTALPSTFKPQGTTSEDGAKSEGDKSKSDEDITEETPADDKVERT 322
            ||||::||.|||.||.|||||:||.|.|||||||:.|...:..         ||.|  :.|.|||
Mosquito   261 SATQQYLGQVLQALKATAPIPSALISNFKPQGTTTTDATATTA---------TEAT--EPKAERT 314

  Fly   323 IDSLNEVEKLHQKNIEKLISILSGEVSIDLQLQFLIRSNHADLQVLRGTKEAVRVSICHTATVIA 387
            ::||||.||.||||||||.|||||||:|:|||||||||||||||:||.|||:||:||||||||||
Mosquito   315 LESLNEAEKTHQKNIEKLASILSGEVTIELQLQFLIRSNHADLQILRATKESVRLSICHTATVIA 379

  Fly   388 NAFMHSGTTSDQFLRDNLDWLARATNWAKLTATASLGVIHRGHEKDSLALMQSYLPKEAGPSSGY 452
            |.||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||:||||||
Mosquito   380 NTFMHSGTTSDQFLRDNLEWLARATNWAKLTATASLGVIHRGHETDSLALMQSYLPKESGPSSGY 444

  Fly   453 SEGGALYALGLIHANHGANIIDYLLQQLKDAQNENVRHGGCLGLGLAGMGTHRQDLYEQLKFNLY 517
            ||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||:|||||||||
Mosquito   445 SEGGGLYALGLIHANHGANIIDYLLQQLKDAQNENVRHGGCLGLGLAAMGTHRQDVYEQLKFNLY 509

  Fly   518 QDDAVTGEAAGIAMGMVMLGSKNAQAIEDMVSYAQETQHEKILRGLAVGISLTMFSRLEEADPLV 582
            ||||||||||||||||:|||||:|||||||||||||||||||||||||||||||::||||||.||
Mosquito   510 QDDAVTGEAAGIAMGMLMLGSKHAQAIEDMVSYAQETQHEKILRGLAVGISLTMYARLEEADALV 574

  Fly   583 TSLSSDKDPVLRRSGMYTIAMAYNGTGSNKAIRKLLHVAVSDVNDDVRRAAVTAIGFILFRSPEQ 647
            .|||:||||||||||||||||||.|||:|:|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mosquito   575 ASLSNDKDPVLRRSGMYTIAMAYCGTGNNQAIRKLLHVAVSDVNDDVRRAAVTAIGFILFRSPEQ 639

  Fly   648 CPSVVSLLAESYNPHVRYGAAMALGIACAGTGLREAIALLEPMVKFDPVNFVRQGALIASAMILI 712
            ||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||.|||||||||||||||||||||
Mosquito   640 CPSVVSLLAESYNPHVRYGAAMALGIACAGTGSREAIALLEPMAKFDPVNFVRQGALIASAMILI 704

  Fly   713 QHTDQSCPKSTFFRQLYAEVISNKHEDVMAKYGAILAQGIIDAGGRNATLSLQSRTGHTNLQAVV 777
            |||||:|||.|||||||.:||:|||||||||:|||||||||||||||.|:|||||||||||||||
Mosquito   705 QHTDQTCPKVTFFRQLYTQVITNKHEDVMAKFGAILAQGIIDAGGRNVTVSLQSRTGHTNLQAVV 769

  Fly   778 GMLAFTQYWYWFPLAHTLSLAFTPTCVIGLNSDLKMPKMEYKSAAKPSLYAYPAPLEEKKSEERE 842
            |||.||||||||||:|.|||||||||:|.|||||||||:::||||:||||||||||||||.||||
Mosquito   770 GMLLFTQYWYWFPLSHCLSLAFTPTCIIALNSDLKMPKIDFKSAARPSLYAYPAPLEEKKREERE 834

  Fly   843 KVATAVLSIAARQKRRENADK-------------KEDEKMDVDEDSKEGAAVKKDEEAKADEK-- 892
            ||.|||||||||.||||...|             ||:.||:||||    |:..|||.|||.|:  
Mosquito   835 KVTTAVLSIAARAKRREGDKKKEAKDGGAKDGGAKEETKMEVDED----ASGSKDETAKAKEEAK 895

  Fly   893 ----MVTDEKPKKKDEKEKKKE-------------EDKEKEAAGTSSEKDKDKEKD-KKEKKEPE 939
                ..|...|.|::.|:|.|.             ||....:|..|:..||..:|. .|..||||
Mosquito   896 PTATTTTTTTPVKEESKKKDKSASSGAASPAPASGEDATATSASASTGTDKAADKTASKTPKEPE 960

  Fly   940 PTSEILQNPARVLRQQLKVLSVIDGQSYEPLKDVTIGGIIVFQHTGKAEDQELVEPVAAFGPMND 1004
            |:.|||.|||||:||||||:|:.:|.:|.|||||.|||||:..||...| |.|||||||.||.||
Mosquito   961 PSFEILSNPARVMRQQLKVISIAEGTAYTPLKDVAIGGIIMMNHTAGGE-QVLVEPVAACGPKND 1024

  Fly  1005 EEKEPEPPEPFEYIED 1020
            :.||||.||||||:||
Mosquito  1025 DLKEPEAPEPFEYVED 1040

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
Rpn2NP_001263057.1 RPN2 1..1003 CDD:227446 786/1037 (76%)
HEAT repeat 581..602 CDD:293787 18/20 (90%)
HEAT repeat 616..639 CDD:293787 22/22 (100%)
HEAT repeat 651..676 CDD:293787 24/24 (100%)
Rpn2XP_321340.6 None

Return to query results.
Submit another query.