Protein Alignment Cul5 and Cul2

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_651665.2
• Gene: Cul5 / 43434
• FlyBaseID: FBgn0288875
• Length: 852
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: NP_610117.1
• Gene: Cul2 / 35420
• FlyBaseID: FBgn0032956
• Length: 753
• Species: Drosophila melanogaster
• Alignment Length: 866
• Identity: 215/866 - (24%)
• Similarity: 376/866 - (43%)
• Gaps: 148/866 - (17%)

  Fly    13 FEEVWPDKRRIVLKLLRQDTVSQREWQDLFFGVHFVCL-WDEKGAAKIY----DCLQQDIVEFI- 71
            |.:|||..|.|...::....|.:..|...|..|:.:|: ..|..|.::|    ..|:|.:.|.:
  Fly    10 FVDVWPRLRCIAESVITLTKVERSVWNTSFSDVYTLCVAQPEPMADRLYGETKHFLEQHVQEMLA 74

  Fly    72 --VQAQSQVQAQRGEQALLATYIVEWRKFFTQSNYLPLPFRQLEQSPQVKPSSSGSSSSASVSAS 134
              |..:.:.....|...||..|.:.|.::.....||...:..|.|....|...:
  Fly    75 KKVLIEGECSHSNGGPDLLQRYYITWMEYSQGIKYLHQLYIYLNQQHIKKQKIT----------- 128

  Fly   135 GASTSAAAAAAATSCSGQAGKSGASTSAAAGASTSAAAAAASTSASTSSAAAAAAASGSGSSSSS 199
                                    .|.:..|..:|.||
  Fly   129 ------------------------DTESFYGNLSSDAA--------------------------- 142

  Fly   200 TSTSKKNPTEDSPVRKLMLDSWNKHIFHDIKHRLQESAMKIVHAER--NG--DAYDAQLVVGVRE 260
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  Fly   143 ---------EQMEIGELGLDIWRLYMIEYLSSELVRHILEGIAADRASNGTLDHHRVQIINGVIH 198

  Fly   261 SYVNLSS-NAEDKLEIYRENFEMAYLKATVEFYRLKSAEQQQENGVLAYMKYADSKLREEEVRAK 324
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  Fly   199 SFVEVQDYKKTGSLKLYQELFEGPMLEASGAYYTDEANKLLHRCSVSEYMQEVIRILEYESRRAQ 263

  Fly   325 RYLEPSSFSILTYTLVNVLIVDHLNSIIAECPALIRDYETERLNLMFRLMDRVMHGVGVEPMMGD 389
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  Fly   264 KFLHVSSLPKLRKECEEKFINDRLGFIYSECREMVSEERRQDLRNMY---------VVLKPIPDN 319

  Fly   390 LQRHIMSAGLADMLSASEVITQDSEK-------YVERLLELFNKFSDLVRNAFNDDPRFLTARDI 447
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  Fly   320 LKSELITTFL-DHIKSEGLQTVSALKGENIHIAFVENMLKVHHKYQELIADVFENDSLFLSALDK 383

  Fly   448 AFKTVVNDTSVFKMELPTSIANRGVKYTAPESKCPELLANYCDMLLRRTPLSKRLTSEQIDARLR 512
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  Fly   384 ACASVIN-------RRPTE---------RQPCRSAEYVAKYCDTLLKK---SKTCEAE-IDQKLT 428

  Fly   513 DVLLVLKYVNNKDVFMRYHKVHLTRRLILGTSADSEKEEDIVEWLREVGMPADYVNRLARMFQDI 577
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  Fly   429 NNITIFKYIEDKDVYQKFYSRLLAKRLIHEQSQSMDAEEGMINRLKQ-ACGYEFTNKLHRMFTDI 492

  Fly   578 KVSEDLNTQFRTSISRHD---AIN--IKILNAGAWARCSERV-SVSLPIELEDYIPDVEEFYKKK 636
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  Fly   493 SVSVDLNNKFNTHLKDSNVDLGINLAIKVLQAGAWPLGSTQVIPFAVPQEFEKSIKMFEDYYHKL 557

  Fly   637 HSGRKLQWYHHMSNGTITFVNNFGRYDLDVTTFQMAVLFAWNQRQHDKISYENLRLATELPDPEL 701
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  Fly   558 FSGRKLTWLHHMCHGELKLSHLKKSYIVTMQTYQMAIILLF--ETCDSLSCREIQNTLQLNDETF 620

  Fly   702 RRTLWSLVAFPKIKKQILLMEPAAISSPKDFAENTMFYINQEFAIVKNGKSQRRGKLNLIGRLQL 766
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  Fly   621 QKHMQ-----PIIESKLL------NASSENLAGETRIELNLDY-------TNKRTKFKISSALQK 667

  Fly   767 STERSQQEDNQSIVQLRILRTQEAIIKIMKVRKRMNNAALQGELIDILKNMFLPSKKMIKEQLEW 831
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  Fly   668 ETPQEVEHTINSVDEDRKLFLQAAIVRIMKARKVLKHNALIQEVLSLSKVSFTPNIAMIKKCVES 732

  Fly   832 LIENKYMRRDDDDINMFIYVA 852
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  Fly   733 LIDKQYIERTANSGDEYSYMA 753

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
Cul5	NP_651665.2	Cullin	17..744	CDD:459983	181/752 (24%)
		Cullin_Nedd8	779..846	CDD:214883	24/66 (36%)
Cul2	NP_610117.1	Cullin	14..652	CDD:459983	181/752 (24%)
		Cullin_Nedd8	683..745	CDD:463146	24/61 (39%)