Protein Alignment Cul5 and cul2

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_651665.2
• Gene: Cul5 / 43434
• FlyBaseID: FBgn0288875
• Length: 852
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: XP_002666627.1
• Gene: cul2 / 336088
• ZFINID: ZDB-GENE-030131-8032
• Length: 745
• Species: Danio rerio
• Alignment Length: 858
• Identity: 226/858 - (26%)
• Similarity: 395/858 - (46%)
• Gaps: 140/858 - (16%)

  Fly    13 FEEVWPDKRRIVLKLLRQDTVSQREWQDLFFGVHFVCL-WDEKGAAKIYDCLQQDIVEFIVQAQS 76
            |:|.|......:..::..|.|.:..|.|.|..::.:|: :.|....|:|...:..:...:.|...
Zfish    10 FDETWNKLLTTIRAVVMLDYVERATWNDRFSDIYALCVAYPEPLGEKLYTETKVFLENHVRQLFK 74

  Fly    77 QVQAQRGEQALLATYIVEWRKFFTQSNYLPLPFRQLEQSPQVKPSSSGSSSSASVSASGASTSAA 141
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Zfish    75 RV--LESEEKVLVMYHRYWEEYSKGAEYMDCLYRYL------------------------NTQFI 113

  Fly   142 AAAAATSCSGQAGKSGASTSAAAGASTSAAAAAASTSASTSSAAAAAAASGSGSSSSSTSTSKKN 206
            .....|....|.|..|...:                                            .
Zfish   114 KKNKLTEADLQYGYGGVDMN--------------------------------------------E 134

  Fly   207 PTEDSPVRKLMLDSWNKHIFHDIKHRLQESAMKIVHAERNGDAYDAQLVVGVRESYVNLSS-NAE 270
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Zfish   135 PLME--IGELALDMWRKLMIEPLQPMLIGKLLKEIKNDRCGEDPNQKVIHGVINSFVHVEQYKKK 197

  Fly   271 DKLEIYRENFEMAYLKATVEFYRLKSAEQQQENGVLAYMKYADSKLREEEVRAKRYLEPSSFSIL 335
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Zfish   198 FPLKFYQEIFEGPFLTKTGEYYKQEASNLLQESNCSQYMEKVLGRLKDEEVRCRKYLHPSSYSKV 262

  Fly   336 TYTLVNVLIVDHLNSIIAECPALIRDYETERLNLMFRLMDRVMHGVGVEPMMGDLQRHIMSAGLA 400
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Zfish   263 IHECQQRMVADHLQFLHGECQNIIRQEKRDDMANMYTLLRAV--SSGLPHMIQELQVHIHDEGIR 325

  Fly   401 DMLSASEVITQDSEKYVERLLELFNKFSDLVRNAFNDDPRFLTARDIAFKTVVNDTSVFKMELPT 465
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Zfish   326 ATINLSQ--ENMPTLFVESVLEVHSKFVQLINTVLNGDQHFMSALDKALTSVVN----------- 377

  Fly   466 SIANRGVKYTAPESKC--PELLANYCDMLLRRTPLSKRLTSEQIDARLRDVLLVLKYVNNKDVFM 528
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Zfish   378 --------YREPKSICKAPELLAKYCDNLLKKS--AKGMTENEVEDKLTSFITVFKYIDDKDVFQ 432

  Fly   529 RYHKVHLTRRLILGTSADSEKEEDIVEWLREVGMPADYVNRLARMFQDIKVSEDLNTQFRTSISR 593
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Zfish   433 KIYARMLAKRLIHGLSLSMDSEEAMINKLKQ-ACGYEFTSKLHRMYTDMSVSTDLNNKFNNFIKT 496

  Fly   594 HDAI-------NIKILNAGAWARCSERVSV-SLPIELEDYIPDVEEFYKKKHSGRKLQWYHHMSN 650
            .:.:       .|.:|.||||.......|. ::|.|||..:...|.||.:..|||||.|.|::..
Zfish   497 QETVVDLGISFQIYVLQAGAWPLTHVPSSTFAIPQELEKSVQMFELFYNQHFSGRKLTWLHYLCT 561

  Fly   651 GTITFVNNFGR-YDLDVTTFQMAVLFAWNQRQHDKISYENLRLATELPDPELRRTLWSLVAFPKI 714
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Zfish   562 GEVK-MNYLSKPYVAVVTTYQMAVLLAFN--NSETVSYKELQDSTQMNEKELQKTIKSLLDVKMI 623

  Fly   715 -----KKQILLMEPAAISSPKDFAENTMFYINQEFAIVKNGKSQRRGKLNLIGRLQLSTERSQQE 774
                 |::|   ||          |:|       |:::.:..| :|.|..:...:|..|.:..::
Zfish   624 SHDLQKEEI---EP----------EST-------FSLIMSFTS-KRTKFKITTSMQKDTPQELEQ 667

  Fly   775 DNQSIVQLRILRTQEAIIKIMKVRKRMNNAALQGELIDILKNMFLPSKKMIKEQLEWLIENKYMR 839
            ...::.:.|.:..|.||::|||.||.:.:.||..|:|:..|..|.||..|||:.:|.||:.:|:.
Zfish   668 TRSAVDEDRKMYLQAAIVRIMKARKVLRHNALIQEVINQSKARFNPSISMIKKCIEVLIDKQYIE 732

  Fly   840 RDDDDINMFIYVA 852
            |.....:.:.|||
Zfish   733 RSQSSADEYSYVA 745

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
Cul5	NP_651665.2	Cullin	17..744	CDD:459983	190/744 (26%)
		Cullin_Nedd8	779..846	CDD:214883	25/66 (38%)
cul2	XP_002666627.1	Cullin	14..644	CDD:459983	191/750 (25%)
		Cullin_Nedd8	675..737	CDD:463146	25/61 (41%)