Protein Alignment Cul5 and cul3

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_651665.2
• Gene: Cul5 / 43434
• FlyBaseID: FBgn0288875
• Length: 852
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: NP_592949.1
• Gene: cul3 / 2542637
• PomBaseID: SPAC24H6.03
• Length: 785
• Species: Schizosaccharomyces pombe
• Alignment Length: 881
• Identity: 189/881 - (21%)
• Similarity: 373/881 - (42%)
• Gaps: 157/881 - (17%)

  Fly     3 RAIGKRDRDIFEEVWPDKRRIVLKLLRQDTVSQREWQDLFFGVHFVCLWDEKGAAKIYDCLQQDI 67
            ||||    |||                |.:.||..:::|:...:.:.|  .|...|:|:.: ||:
pombe    31 RAIG----DIF----------------QKSTSQLSFEELYRNAYILVL--HKYGEKLYNHV-QDV 72

  Fly    68 VEFIVQAQSQVQAQRG-EQALLATYIVEWRKFFTQSNYLPLPFRQLEQSPQVKPSSSGSSSSASV 131
            :...::.::.....:. :.:||...:::.||   ..:|.....|.||.:.:...|...|.....|
pombe    73 IRSRLKEETVPAIYKNYDASLLGNALLDIRK---NDSYSTSWSRSLEAAHRFLSSLVNSWKDHIV 134

  Fly   132 SASGASTSAAAAAAATSCSGQAGKSGASTSAAAGASTSAAAAAASTSASTSSAAAAAAASGSGSS 196
            |....|:.........|
pombe   135 SMQMISSVLKYLDKVYS------------------------------------------------ 151

  Fly   197 SSSTSTSKKNPTEDSPV----RKLMLDSWNKHIFHDIKHRLQESAMKIVHAERNGDAYDAQLVVG 257
                .::.|.|..::.:    ..::|:|:      :|..:..|:.:.:|:.||.|:..:..|:..
pombe   152 ----KSADKVPVNENGIYIFREVVLLNSF------EIGEKCVETILILVYLERKGNTINRPLIND 206

  Fly   258 VRESYVNLSSNAEDKLE-IYRENFEMAYLKATVEFYRLKSAEQQQENGVLAYMKYADSKLREEEV 321
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pombe   207 CLDMLNSLPS--ENKKETLYDVLFAPKFLSYTRNFYEIESSTVIGVFGVVEYLKKAEKRFEEEKE 269

  Fly   322 RAKRYLEPSSFSILTYTLVNVLIVDHLNSIIAECP----ALIRDYETERLNLMFRLMDRVMHGVG 382
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pombe   270 RSKNYLFTKIASPLLSVVEDELLSKHLDDLLENQSTGFFSMIDSSNFEGLQLVYESFSRV--ELG 332

  Fly   383 VEPMMGDLQRHIMSAG------LADMLSASEVITQDSEK------YVERLLELFNKFSDLVRNAF 435
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pombe   333 VKSLKKYLAKYVAHHGKLINETTSQALEGKMAVGRLSSNATMATLWVQKVLALWDRLNTIISTTM 397

  Fly   436 NDDPRFLTARDIAFKTVVNDTSVFKMELPTSIANRGVKYTAPESKCPELLANYCDMLLRRTPLSK 500
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pombe   398 DADRSILNSLSDAFVTFVDG------------------YT----RAPEYISLFIDDNLKKD--AR 438

  Fly   501 RLTSEQIDARLRDVLLVLKYVNNKDVFMRYHKVHLTRRLILGTSADSEKEEDIVEWLR-EVGMPA 564
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pombe   439 KAIEGSIEATLQNSVTLFRFISEKDVFEKYYKTHLAKRLLNNRSISSDAELGMISRLKQEAGNV- 502

  Fly   565 DYVNRLARMFQDIKVSEDLNTQFRTSISRHDA-----INIKILNAGAWA--RCSERVSVSLPIEL 622
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pombe   503 -FTQKLEGMFNDMNLSQELLQEYKHNSALQSAKPALDLNVSILASTFWPIDLSPHKIKCNFPKVL 566

  Fly   623 EDYIPDVEEFYKKKHSGRKLQWYHHMSNGTITFVNNFGRYDLDVTTFQMAVLFAWNQ-RQHDKIS 686
            ...|....:||..||:||||.||..|.:..:.......:|||:|:|....:|..:.. :::..:.
pombe   567 LAQIDQFTDFYLSKHTGRKLLWYPSMGSADVRVNFKDRKYDLNVSTIASVILLLFQDLKENQCLI 631

  Fly   687 YENLRLATELPDPELRRTLWSLVAFPKIKKQILLMEPAAISSPKDFAENTMFYINQEFAIVKNGK 751
            :|.:...|.:...:|:|.|.||..   .|.:|||.:|..    ::......||.|:.|.     .
pombe   632 FEEILEKTNIEVGDLKRNLQSLAC---AKYKILLKDPKG----REVNAGDKFYFNENFV-----S 684

  Fly   752 SQRRGKLNLIGRLQLSTERSQQEDNQSIVQLRILRTQEAIIKIMKVRKRMNNAALQGELIDILKN 816
            :..|.|::.:.:.::..:..::...:.:.:.|..:....|:::||.||...:..|..|:...|..
pombe   685 NLARIKISTVAQTRVEDDSERKRTLEKVDESRKHQADACIVRVMKDRKVCEHNQLMAEVTRQLNP 749

  Fly   817 MFLPSKKMIKEQLEWLIENKYMRRDDDDINMFIYVA 852
            .|.||..|||.::|.|||.:|::|..|:..::.|:|
pombe   750 RFHPSPMMIKRRIEALIEREYLQRQADNGRIYEYLA 785

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
Cul5	NP_651665.2	Cullin	17..744	CDD:459983	155/757 (20%)
		Cullin_Nedd8	779..846	CDD:214883	22/66 (33%)
cul3	NP_592949.1	COG5647	1..785	CDD:227934	188/879 (21%)