DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment spg and Dock4

DIOPT Version :9

Sequence 1:NP_733258.4 Gene:spg / 43404 FlyBaseID:FBgn0264324 Length:2187 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:XP_038934052.1 Gene:Dock4 / 366608 RGDID:1561724 Length:1978 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:2236 Identity:776/2236 - (34%)
Similarity:1163/2236 - (52%) Gaps:369/2236 - (16%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly     1 MWIPS-NNKYGVAIHNWHGDVRFGLALDVGDSVDIVEECKHWYRGSCPRKSRAVGLFPKTYIHIK 64
            ||||: :.||||.|.::.|.|.:||:|::||:|.|:|:|..||||...:.....|:||.:|:|:|
  Rat     1 MWIPTEHEKYGVVIASFRGTVPYGLSLEIGDTVQILEKCDGWYRGFALKNPNIKGIFPSSYVHLK 65

  Fly    65 D------------LSKIDPVVAECTQVLREWSEIWKRLYVDREAYKFQTLRKVMFSILESRRELL 117
            :            :...|.|:.|.|..||:|..:||:|||..|...|..|..:|..||:.||::|
  Rat    66 NACVKNKGQFEMVIPTEDSVITEMTSTLRDWGSMWKQLYVRNEGDLFHRLWHIMNEILDLRRQVL 130

  Fly   118 SATMTQDQTLELQMVVVSKIDWGNRKLGLDLVPREGPLAVDPHGIGIVKLYNV----HVSSADNA 178
            ...:|.|:..:::..:.:::||||.:||||||||:....|||..|.|.:||.:    |.......
  Rat   131 VGHLTHDRMKDVKRHITARLDWGNEQLGLDLVPRKEYAMVDPEDISITELYRLMEHRHRKKDTPV 195

  Fly   179 KASSSRGTLRRKTQRKILTHHLYFCMRDFGHRIGGDDAEVYFFLYDGSHMRPLSERFLVKISKDG 243
            :|||               |||:..|:.......|::.||.|.|:|....||:||||.::::::|
  Rat   196 QASS---------------HHLFVQMKSLMCSNLGEELEVIFSLFDSKENRPISERFFLRLNRNG 245

  Fly   244 FSNYIERLHSNCTVFTDLGAADLNEELHLVAVVMRVGKIIQSDSIKKIEKSGTLGHGP------- 301
            .....::...:|::|.|||:::|.:::::...::|:|:               :|.|.       
  Rat   246 LPKAPDKPERHCSLFVDLGSSELRKDIYITVHIIRIGR---------------MGAGEKKNACSV 295

  Fly   302 TFRRPFGVGVLSLGDIAHFDSSLEQSSDEREYNFKLFQCE-EKDFHLLPELIIKKSSGKYSPIQA 365
            .:|||||..|||:.|       |.....:.:...|::.|. |.:::.:.|.||||.:.:|:   .
  Rat   296 QYRRPFGCAVLSIAD-------LLTGETKDDLVLKVYMCNTESEWYQIHENIIKKLNARYN---L 350

  Fly   366 SQGTQGIVVSLKLLHGGLGQARQEQPMLF-QGSTITRKMGFPDVIMPGDVRNDLFLNLERGEFER 429
            :....|:.|||:||||.:.|.|:|...:| .|.:||||:||.|:||||::||||::.:||||||:
  Rat   351 TGSNAGLAVSLQLLHGDIEQIRREYSSVFSHGVSITRKLGFSDIIMPGEMRNDLYITVERGEFEK 415

  Fly   430 GGKNTGKNILVTVVVLDVAGNVLTDCLWGASGMESQPQYRSMILYHQNAPSWNEMLRLSVPIDKF 494
            |||:..:|:.||:.::|..|..|.|.:...||.....:|.|.:|||.|:|.|:|:|:|.:|:|||
  Rat   416 GGKSVARNVEVTMFIVDSNGQPLKDFISFGSGEPLASEYHSFVLYHNNSPRWSELLKLPIPVDKF 480

  Fly   495 STAHVRFEFRHCSTRDKTEPKLFAFSFARLMDTGGATLGDGLHELYVYKCEDPAKLQ-VANYLRL 558
            ..:|:|||||||||::|.|.|||.|||..||...|.||.||.|||.|:|||:...|| ...||:.
  Rat   481 RGSHIRFEFRHCSTKEKGEKKLFGFSFVPLMQEDGRTLPDGTHELIVHKCEENTNLQDTTRYLKF 545

  Fly   559 QCRPRDAQAKMDCGGCFSRSSKEVFVLRSLLCSTKLTQNADLLSLLQWRTYPETIQDSLTGVLRL 623
               |......:.......:::||.|.:.|.|||||||||.|:|.||:|||:|:.|...|:.:..:
  Rat   546 ---PFSKVIFLGNNNQTMKATKESFWITSFLCSTKLTQNGDMLDLLKWRTHPDKITGCLSKLKEI 607

  Fly   624 NDEELVKFLQDVLDALFAMFSNEEGNSTQHSGLVFHVLVSIFSLLQSNKFQHFRPVMNEYIENHF 688
            :..|:||||||.||.||.:.   :.||.::...||..||.|.:|||.:||.||:|||:.|||:||
  Rat   608 DGSEIVKFLQDTLDTLFGIL---DENSQKYGSKVFDSLVHIINLLQDSKFHHFKPVMDTYIESHF 669

  Fly   689 AAALVYKGLITSVEHMAVFMTKAEHPDPFQKCFGSLEYIFKLLIQSRKLFARATGGQYEDSFKRD 753
            |.||.|:.||..::.....:|:||..:..|:...:.|||||.::|||:||:.|||||.|:.|:..
  Rat   670 AGALAYRDLIKVLKWYVDRITEAERQEHIQEVLKAQEYIFKYIVQSRRLFSLATGGQNEEEFRCC 734

  Fly   754 LHSLFTALNGMLAVPS--YDVIIPTQEALLNSTGVVLEQLKDTLPAPELGMLARNMLDAIPRGAP 816
            :..|..::...|:..|  ...:..:|...|:|...|..:|.......|:..|.::.|.::|   .
  Rat   735 IQELLMSVRFFLSQESKGTGALSQSQAVFLSSFPAVYSELLKLFDVREVANLVQDTLGSLP---T 796

  Fly   817 IRLIQAKLHAVK-----DLVSGELFHEDDSRTVVLSVACKHLRMHLSRRDELRLCAEILSEILSQ 876
            |..:...|.|:|     ..|..:|:...|||.::|.|...||.:||..:.:|.:||.|||.:...
  Rat   797 IMHVDDSLQAIKLQCIGKTVESQLYTNPDSRYILLPVVLHHLHIHLQEQKDLIMCARILSNVFCL 861

  Fly   877 LYDLQKEQREKVTNTLQHDLDSLCKNILGILIRTISIIMEGSNA-----------VLPQLVSCLL 930
               ::|...||   ::..::|.:..::|.||:|||..|.....|           |..:.|:|||
  Rat   862 ---IKKNSSEK---SVLEEIDVIVASLLDILLRTILEITSRPQASSSAMRLQFQDVTGEFVACLL 920

  Fly   931 GLLQLLDETHYKRYWDELSPNKDPRDLKEFLSKSLLVYEELLTQDWHVFPNDWLVMKLAANDVLR 995
            .||:.:.:.||::..:..:..:   :|::||.:...|:..|:..:  :||.||.||:|.||:|:.
  Rat   921 SLLRQMTDRHYQQLLNSFNTKE---ELRDFLLQIFTVFRILIRPE--MFPKDWTVMRLVANNVII 980

  Fly   996 MSLEEFAKPLVYRFLGPQAFDSQLWWSYFSLAVAFLTQPSLQLEQYREPKRLKILHSHGDMRVLM 1060
            .::...:..|...||. :.||.::|.|||.|||.|:.|..||||.:...|:.|:|..:|||||.|
  Rat   981 TTVLYLSDALRKNFLN-ENFDYKIWDSYFYLAVIFINQLCLQLEMFTPSKKKKVLEKYGDMRVTM 1044

  Fly  1061 GFQILSMWSQLGEQKLHFIPSMVGPFLEVTLVPEPALRKATLSVFYDMMQCEQAARGSFRLVESE 1125
            |.:|.|||..|||.||||||:::||||||||:|:|.||...:.:|:|||..||...|:|:.||::
  Rat  1045 GCEIFSMWQNLGEHKLHFIPALIGPFLEVTLIPQPDLRNVMIPIFHDMMDWEQRRSGNFKQVEAK 1109

  Fly  1126 LIDKLDLLISENKGDDEYRELFSTI---------LLEKVQVENPNWKEAGIAFIASVTRLLERLL 1181
            ||||||.|:||.|||:.|||||::|         ||:|  :|...|:|:|::.||:||||:||||
  Rat  1110 LIDKLDSLMSEGKGDETYRELFNSIIPLFGPYPSLLKK--IERETWRESGVSLIATVTRLMERLL 1172

  Fly  1182 DYRSVMQGEENRDKRMTCTVNLLNFYKNEINRKEMYLRYIYKLHNLHLQAENYTEAGFTLKLYAS 1246
            |||..|:..|...|::.|||:||||||.|:|::|||:|||:||::|||:|:|:|||.:||.||..
  Rat  1173 DYRDCMKIGEVDGKKIGCTVSLLNFYKTELNKEEMYIRYIHKLYDLHLKAQNFTEAAYTLLLYDE 1237

  Fly  1247 MLSW-DRETQSFAPFDNSGQPEWQRKERLYHEILKYFDKGKCWEKGIPLCKELAHLYETRRFDYN 1310
            :|.| ||..:.|..:..  |.||||||.|:..|::.||:|||||.||.||:::|..||: .:||.
  Rat  1238 LLEWSDRPLREFLTYPM--QTEWQRKEHLHLTIIQNFDRGKCWENGIILCRKIAEQYES-YYDYR 1299

  Fly  1311 KLSEILIQEAKFFQNILTQLRPEPEYFRVGFYGMGLPLFVRNKQFVYRGLEYERIGAFTQRLQTE 1375
            .||::.:.||..:..|:.|.|.|||:|||||||...|.|:|||:||.||.:|||:.||.||:..|
  Rat  1300 NLSKMRMMEASLYDKIMDQQRLEPEFFRVGFYGKKFPFFLRNKEFVCRGHDYERLEAFQQRMLNE 1364

  Fly  1376 FPSAQILGNNSPPDNAILNAPDQYIQISNVRPVGDAQALKTAMVPVPEKIARFYEVNDVTRFIYD 1440
            ||.|..:.:.:.||..|..|..||:||..|.|:.::|.: .....||:.|..||:||.:.:|.||
  Rat  1365 FPHAIAMQHANQPDETIFQAEAQYLQIYAVTPIPESQEV-LQREGVPDNIKSFYKVNHIWKFRYD 1428

  Fly  1441 RPMYKGTVDKDNEFKSLWIERTILEIASPLPGILRWYEVKQKTMQELTPVEYACEIISNAGKELS 1505
            ||.:|||.||:|||||||:|||.|.:...||||.||:||:::.:.|::|:|.|.|::.|..::|.
  Rat  1429 RPFHKGTKDKENEFKSLWVERTSLYLVQSLPGISRWFEVEKREVVEMSPLENAIEVLENKNQQLK 1493

  Fly  1506 ELIVQYKRDPKRNINPFSMRLQGTIDANVMGGISKYQEAFFSEQFLKSPQGAGQQANVQRLKVLI 1570
            .||.|.:....:||||.:|.|.|.|||.|.||:|:||||||.:.::.|....|::  :.||:.|:
  Rat  1494 TLISQCQSRQMQNINPLTMCLNGVIDAAVNGGVSRYQEAFFVKDYILSHPEDGEK--IARLRELM 1556

  Fly  1571 LEQIQILEQALELHGQLAPSGVQPLHNRLLERFSQLKQSL-----------------SGMGRLKR 1618
            |||.||||..|.:|.:..|..::|||.:|:::|..:|.|.                 :|..|:.|
  Rat  1557 LEQAQILEFGLAVHEKFVPQDMRPLHKKLVDQFFVMKSSFGIQEFPACIQASPVHFPNGSPRVCR 1621

  Fly  1619 QHSESIVNTPLPPLPTEQRVAPAT-----------ASSSLNANAHSNYVYDLDEI--YTRPGDTV 1670
            .      :.|....|...||.|..           :||||::.|.:    ::..|  .:...|.|
  Rat  1622 N------SAPASMSPDGTRVIPRRSPLSYPAVNRYSSSSLSSQASA----EVSNITGQSESSDEV 1676

  Fly  1671 RPVDPLSSYQTLSKESLSIPLEDTAAPPVPNRPRSQNFIGNGSMDSPEVPPK----RQPTLNSPN 1731
            ..:.|..|..:||....:.|...::||             :.:..||.:..|    |:.:..||.
  Rat  1677 FNMQPSPSTSSLSSTHSASPNVTSSAP-------------SSARASPLLSDKHKHSRENSCLSPR 1728

  Fly  1732 APP---LPPRGITPDKRASNPLIFNDFGSGDAVGRRHSQQQQQHGQKYSVVDISYDDPEADQQPH 1793
            ..|   :.|..:.|.:|    ::||..|.| |:.|                    .||.......
  Rat  1729 DRPCSAIYPTPVEPSQR----MLFNHIGDG-ALPR--------------------SDPNLSAPEK 1768

  Fly  1794 SLPPNFQDGSGGHLSVCFAPNDFRDSGISTTSSRELNHMNLNNLSEDSSSISTITVQHREHCRIS 1858
            ::.|.                   .|..|..|.:|     ..|:|:....||.            
  Rat  1769 AVNPT-------------------PSSWSLDSGKE-----AKNMSDSGKLISP------------ 1797

  Fly  1859 SNGSLDYNAAASMNITQRESSTSSFDVEDFPVPPPPIPPKSLAVSSNGVNFSLDEAHSPHPSTQA 1923
                                          ||||.|....|.|..:..|        ||.|:   
  Rat  1798 ------------------------------PVPPRPTQTASPARHTTSV--------SPSPA--- 1821

  Fly  1924 NTTQLNHIQNPNQNHSTNSHHHLQQQQNGDGDGYSTLQHPMNGLGLPTLPPPPSAVESPMPASAI 1988
                                            |.|.|:..:...       .||.||...|..:.
  Rat  1822 --------------------------------GRSPLKSSVQSF-------TPSPVEYNSPGLSS 1847

  Fly  1989 ASSTSSHQHDGGTFXVTICRCHHPPDQPHQPHKPSSSTSTSDSTATDTASESTESSSSTHSMTPP 2053
            .|...|..:..|.. ::.|                       ||:..:..|:..:..|.....|.
  Rat  1848 NSPVLSGSYSSGISSLSRC-----------------------STSETSGFENQANEQSVPVPVPV 1889

  Fly  2054 PPPPPPPSSFTHLHHQMAATTHYCQDCLSSPSPPPTIITEQAQVHPTPGSTSAQPHIEHCSCGLS 2118
            |.|.|.| ||:.....:..         .|.:|||..:.|:....|.|     .||      .||
  Rat  1890 PVPMPVP-SFSGSEEPVRK---------ESKTPPPYSVYERTLRRPVP-----LPH------SLS 1933

  Fly  2119 FSVVQDQQEQFPRLLSTRFSTLERQT 2144
            ..|..:.....|:.|:.|.|.||..|
  Rat  1934 IPVTSEPPALPPKPLAARSSHLENGT 1959

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
spgNP_733258.4 SH3_DOCK_AB 9..64 CDD:212805 24/54 (44%)
DOCK_N 67..406 CDD:292790 110/351 (31%)
C2_Dock-B 414..600 CDD:176077 87/186 (47%)
DHR2_DOCK 1215..1610 CDD:297424 185/395 (47%)
Dock4XP_038934052.1 SH3_DOCK4_B 10..65 CDD:212982 24/54 (44%)
DOCK_N 69..392 CDD:406558 110/362 (30%)
C2_Dock-B 400..584 CDD:176077 87/186 (47%)
DHR2_DOCK4 1206..1596 CDD:212578 185/395 (47%)


Information from Original Tools:


Tool Simple Score Weighted Score Original Tool Information
BLAST Result Score Score Type Cluster ID
Compara 00.000 Not matched by this tool.
Domainoid 1 1.000 492 1.000 Domainoid score I354
eggNOG 00.000 Not matched by this tool.
Hieranoid 00.000 Not matched by this tool.
Homologene 00.000 Not matched by this tool.
Inparanoid 1 1.050 1341 1.000 Inparanoid score I131
OMA 1 1.010 - - QHG54452
OrthoDB 1 1.010 - - D102580at2759
OrthoFinder 1 1.000 - - FOG0000433
OrthoInspector 1 1.000 - - otm44464
orthoMCL 1 0.900 - - OOG6_100636
Panther 1 1.100 - - O PTHR45653
Phylome 1 0.910 - -
SonicParanoid 1 1.000 - - X372
SwiftOrtho 1 1.000 - -
TreeFam 00.000 Not matched by this tool.
1110.980

Return to query results.
Submit another query.