DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment Dhc98D and Dnhd1

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_524541.3 Gene:Dhc98D / 43379 FlyBaseID:FBgn0013813 Length:5080 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:XP_008758037.1 Gene:Dnhd1 / 690115 RGDID:1584052 Length:4758 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:5103 Identity:995/5103 - (19%)
Similarity:1817/5103 - (35%) Gaps:1322/5103 - (25%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly   777 SIVDNLMRKVYRMLDDLIKSVDYDMFRPGNWENWEYSLELFNKRLDNVENEAKNVIDQSINSLLS 841
            ::|::..|.:..:|...:||:...:.:.|:.|.|.|.                    .::..||.
  Rat    99 AVVESEQRNMLELLLSELKSLFSAVLQDGSCEAWHYL--------------------HAVLGLLP 143

  Fly   842 SEKGLDLVVNAMNIDTRATLQEFV--ATKHENLLRFFVTEINAVERVFTKLKKSPPMAK--HQPA 902
            ..:.:    .|..::....|::..  |.|.:..|:..:  ::|:::.|      ||.:.  |..:
  Rat   144 PYREM----LAGQLELLPFLEQLYCWAPKVQAWLQLDL--LDAIDKAF------PPDSSLLHSSS 196

  Fly   903 KISAIFWARLLGKKLKTSVLAFKRVE-DEPAIKN--SFLKRSSFKQYFELMTVMFQFEKVLFENF 964
            .:....|.:...:....|...|.:.. |:...|.  ::|:..:..:....:.:      |..|..
  Rat   197 HVDCSPWMKRFHRGPPCSACPFVKARWDQQQKKELATWLRPLTLPELQHCLGI------VGAEVA 255

  Fly   965 IQNATYLVNTTNRSNVLRIRICKESTMSYISEAVQTLKAKP---RPELQMTSDRRVTPVKSSNLM 1026
            ::...:|    :..::|.:.:..:..:.|.|..:...:..|   :|:|...:..:....||....
  Rat   256 LEETPWL----DSLSLLPLALATDIPVQYESSDIGHAEPAPAGRKPQLASEAPEKALKRKSPRTS 316

  Fly  1027 PVQSEAFSAYSVADSAGTEISSESENEGLLVGDTSQKKLMCRINRLTVLVAM------IMWMVSN 1085
            .::|:.                    :.||.||.||||    |:.|.:.||.      ...:|..
  Rat   317 ILRSQV--------------------KSLLKGDWSQKK----IHFLYLNVASDRHFNPYKLVVVP 357

  Fly  1086 TRKANIQLQECTAF----IKMVKDKKPKDVTAMDRHCVRTCELLQRAESQYLLPIWRELVGEKTL 1146
            ..|.|.:....:.|    |..|:..:...:....|......| |||      :|.::..:..|.|
  Rat   358 PNKVNPEHYIFSPFGILHIHPVEGSETMSLATWHRDTALWHE-LQR------IPFFKNCLLRKAL 415

  Fly  1147 IEYDMDFVVNLKRDV-FDVLFEAQQF--EHLGFTLP----------------------------- 1179
            ..:        |::| |..|...|.|  .||...:|                             
  Rat   416 TCW--------KKNVRFRGLHRIQTFLKTHLLLAIPHFGAGMLHINRLLQEFRSVSWLPKEPDKS 472

  Fly  1180 AVLRTAIMKKDLLFKDYERMTEVVDRYRSIINNLSMSEVIFLRGHIYDTELFIQMGVGRYTWTSF 1244
            .|||..   |..:.|:..|...|:..:.    ||..|.:..:....|..:..:|..|..:.....
  Rat   473 YVLRDL---KKAIAKENHRALRVLCHFL----NLCASILQLIHEDTYQMQQGLQERVQNWNRIRK 530

  Fly  1245 NIGK------FCDQINSQLRKLTSIVSQIN-FIRLDLRSRIDMIKSFNLFNLDDELKVEDTSRSS 1302
            :.|.      .|..:..:|::..:.:|::. |.||     ||.:...||.::     :||...|.
  Rat   531 SQGSIYLQRTLCRHLEKKLKQAETWLSKLGMFARL-----IDYMICQNLVSI-----LEDEITSF 585

  Fly  1303 GESYLQ-DRKNP---SQRFKSVTGETITMFSVEKDVPADEKAEQACGSGIYPCQGYFELLEASRN 1363
            ..:.|| .|:||   ||......|:...|..||..:.:..|:.|:..:.........: |..||.
  Rat   586 IANNLQAPRQNPFLVSQLVFDDNGQLSPMPRVESIIQSLIKSLQSIKTSALKVMQSTD-LRTSRE 649

  Fly  1364 RKAAQMKKLYDSLGPVLVKLESLVLGTFSGR-SDRMKTY------YEY-WEGETFKCIVDMTYQN 1420
            ...::..|..||       .....:..|.|: ||.::.:      |.: |:......::::....
  Rat   650 PLYSEDNKDQDS-------NTEFPMPKFHGKSSDAVRLFCGPNVGYVWPWKSHAITNVLEVRGHR 707

  Fly  1421 LK-CYINRLLSNKPMFE-----------VNAVLLMSEIVLEPSVQELQNTIVTATKDYISRLRIF 1473
            |: .|::      |.::           :...|.:.:.:||...||:|                 
  Rat   708 LRGQYLH------PNYDHVQEDLDKNAGIQQALAVQQALLEDMRQEVQ----------------- 749

  Fly  1474 TRWMTGTCIACPLVEMGKQFKYNYTYYEDVIQIRSIVDLVINIHDLASRVANEARG-----FVSQ 1533
                              :|.....:.||:.:.         :....|:...:.||     :|..
  Rat   750 ------------------EFCNKQQWVEDIYEF---------LKAWNSQKLEDLRGSPISDYVKL 787

  Fly  1534 FRKYFNLWAFEKSFICQKFLEKQVTLI----EIDEKFTFYSSIVETLANTRKFQDIKCVRINLEP 1594
            .||..| |....|.:..:.|.|...|:    ::.|:      :...|.|.||             
  Rat   788 VRKLKN-WQERVSNMPVELLTKTKLLLLSGRDVQEE------LESKLNNLRK------------- 832

  Fly  1595 LLASITQHAQDWCTTLGEELLRHVNDNMRAMRNEVKTLSLNLN---KTTRELEDFKLVMTTIGTV 1656
               :|.:..::.|.:..::|::.:.:.:|..    :|::|:::   :.:::|.:           
  Rat   833 ---NILEQVKNECWSRNQQLMKKLTEFLRVF----QTINLDIHAIAQCSQKLNE----------- 879

  Fly  1657 QSSTLTNEQKIH-EMQETFT-----ILSEHKIMFPYEDMLMAHHLEKRWKRLFLSALYRYEKLQP 1715
                 .|||..| |.|..:.     ::..|.::|..|:..:...|...|:      .:::|:.| 
  Rat   880 -----ANEQYCHLEEQVEYVRSLHDLIRNHCVLFISENETLDIALLDLWE------AFQFERSQ- 932

  Fly  1716 IKQKFADMTSVEIDEFCDDLAEFIKDYDENGPGSVGAELERGV---RLMDPYGQKIAERESRREE 1777
                        :.||.......|....:....:..|||| |:   .|..|:.....|:.|..::
  Rat   933 ------------VSEFLLSKRHAIVPKLQQLMAAALAELE-GLLVKALSGPFMDPSQEQRSTEQQ 984

  Fly  1778 LANAERLFDMAMVDYHEFARVQTEFEG----------------LQQ-LYKLYKAQKYAREGWGKT 1825
            |...|..|...:.:::........|.|                ||| :::||:........|...
  Rat   985 LGALENQFLNTLSNFNALCYAYRSFTGHKTTMSPPASGNRPIVLQQRIWRLYRIIHENFSEWKCV 1049

  Fly  1826 LWADLDPNVLTEGVESYLKEFRKFTKAV-RTLPVGVQLEIHMKQFKGTVPLMVSLKHEALRERHW 1889
            .::..:.::..|...::|.|..:...|: :..||..:....:::|:..:||::.|....|::.:.
  Rat  1050 AFSKFNLSMAREKTNAWLTEAARLGTALGQQSPVLQRCMRMLEEFRAYLPLLIKLGSLELQDVNT 1114

  Fly  1890 LQLMEKTG----QYFDMSPARFTLENMFAMQLHKYQEIAEQILTNAIKELQIERGVQAVIETWAS 1950
            ..|:...|    |..|:    .||..:....|.::.:...|:.....:.:..:..:|.:.:.|..
  Rat  1115 QSLLRALGLGGLQSLDL----LTLGRLLNCPLLEFADRINQVWQRDKERIHAQEILQQMQQYWEG 1175

  Fly  1951 MAFK-------------TFKHFK------------GSDDRGWVLGPVDEIMQILEDNAMNLQSMG 1990
            ...:             |.:..|            |.|...::|.....:...::::...|..:.
  Rat  1176 RQLRLLNFILQVPYRPPTSERSKRPALRSPQWELVGKDSGTFLLSDYSSLQDAIQNSLQALFKIL 1240

  Fly  1991 ASQFIGPFLETVNKWERTLALISEIIDEWLVVQRKWLYLEGIFIGGDIRTQLPEEARKFDDIDKS 2055
            |.|..|...:...:|...:..:..:::.|:..|:||::|..:....:|.....|...:|..:|..
  Rat  1241 AIQKSGQLHKIALEWVTIMYDLGALLEVWVSFQQKWIFLNKVLHEMEIEFPAAELNARFKVMDDQ 1305

  Fly  2056 YRRIMVDCAKNPLVVPFCTVPG--RLVEIQG------LGIG---LENCQKSLNEYLDSKRRIFPR 2109
            ||.:|.....:|:|:.. .||.  |....||      |.:|   ||.....|.:.|...|..|||
  Rat  1306 YRTLMRISVADPMVLSL-IVPNTKRSPYFQGQHLQHLLKVGSVELEAIIMGLEDVLYGVRANFPR 1369

  Fly  2110 FYFISTDELLSILGSS-EPSAVQNHIIKMYDNIKSLRL-------------VKEGSQTIVT-GMI 2159
            .:|:|..||:::|.|. :.|..:....:.:..||::..             .|...:|:.| .::
  Rat  1370 LFFLSDSELVALLASPLDTSEAKPWAQRCFPYIKAVNFRSKSTNKENNDKDSKSSIETVETISVL 1434

  Fly  2160 SSEGEVMEFRHSARAAGRVEYWMNDVLDEMRR----------SNRFINKTAIY----------DF 2204
            .:.||.::.:........:..|:..:...:|.          :.|.....::.          ..
  Rat  1435 GACGEEVKLQEPLPLYPDLPKWLASLETCLRLVVVNLLQSCVATRLAQGPSLIKALKAMPQQRQM 1499

  Fly  2205 GTDLQISRPDWL---MNYQGMVGLAASQVWWTAEVEEAFDQAQN------H-GNMRAMKDFL-GK 2258
            .|.|.:..  ||   ..:.....|.|.::.|.||:|||..:::.      | .|:..:..|: .:
  Rat  1500 STQLYVQH--WLDAVQVFPWQCILVAEEIVWRAEMEEALLESKTMRLSSVHVRNLEVLVQFIRSQ 1562

  Fly  2259 NNYQIEELVLKVRSNLSRNDRLKFKAQCTVDVHARDIIDNFVRDNVLDASEFSWESQLRFYWIKF 2323
            .:.|.|:.:..||.. |....|..||     |..|||.....::.|.|.::|.|..|::::....
  Rat  1563 RSSQGEQPLPSVRQT-SLFSSLLVKA-----VTHRDIAQLLEKNQVSDLTDFHWVRQIKYHLGSS 1621

  Fly  2324 YDNL-HVLQC----------------------SGSFDFGYEYMGLNGRLVITPLTDRIYLTITQA 2365
            :.|| ..|||                      ..||.:.|||||..    :.||...::......
  Rat  1622 HLNLKSPLQCLTTTASTEEPSVSPAACWIDVLGRSFLYNYEYMGPK----LGPLPSLMHERQVFI 1682

  Fly  2366 LLMNLG----GAPAGPAGTGKTETVKDLAKAMGLLCVVTNCGEGMDYRAVGTILSGLVQCGAWGC 2426
            ||:.|.    ||..|..|.||.|||..||.|:|...|:..|...:::|.:...|:|.:|||||..
  Rat  1683 LLLALNEVAYGAVLGRDGLGKAETVNSLAWALGRQLVIMPCLPQIEFRCLSNYLNGALQCGAWLL 1747

  Fly  2427 FDEFNRIDISVLSVISTQLQTIRN---GLIRKLDRFV---------------FEGVEIHLDPKCG 2473
            .:..:::...:||.:..:|..:.:   .|.:|..:.:               ||..::.:....|
  Rat  1748 LENVHQLPSGLLSALGQRLDELHHLYAPLYQKASKNISTINPTKHLLLGAGFFEKHQVSVRLGFG 1812

  Fly  2474 VFVT---MNPGYAGRTELPESVKALFRPVTCIKPDLELICLISLFSDGFLTAKVLAKKMTVLYSL 2535
            .|:|   ::|      ::|.::..|.|||....|||:.:..:.|...|...|..:|.:::.|:||
  Rat  1813 CFLTFHSLSP------DVPANLHLLLRPVALAFPDLQRVAELQLLGAGVRDASRMATRLSKLFSL 1871

  Fly  2536 ----------AQAQLSKQCHYDWGLRSLNSVLRMAGVMKRQSEDLP------EAVVLMRVLRDMN 2584
                      ::..|.||.        |.:.:......:......|      |...|:|.|  ::
  Rat  1872 ERELVSGTLPSRLPLLKQV--------LENTIETLNASEENKSQQPHNLAAAEEAALLRAL--LH 1926

  Fly  2585 FPKFVFEDVPLFLGLIKDLFPGIDCPRIGY----PDFNAAVRHVLVND----GYILLPDQEDKVV 2641
            .|.|...| .|.|..:::|..|| .|...:    |..:..::.|:|.:    |.....:....:.
  Rat  1927 SPLFTILD-GLRLQKLQELLCGI-FPNASHVLAEPVCHRLMKSVVVEELQQLGLFPTLNTLTSLE 1989

  Fly  2642 QMYETMMTRHSTMLVGPTGGGKTVVINALVKAQTHMGL----------PTKCLVLNPKACSVIEL 2696
            |:.|.:......:|:|..|.||:....:|.|.|..:..          ..:.:.|.|...:..|.
  Rat  1990 QLSEALSKASGILLLGTAGSGKSTCWKSLFKIQNRLAAMEHTSTKGFQSVETVHLYPSVLTSQEY 2054

  Fly  2697 YGFLDMETRDWIDGLFSNIFREMN--KPIEREER--------RYACFDGDVDALWIENMNSVMDD 2751
            .|:  .|...|..|:|:.:.....  |.:..||:        ::...||..:..|::::..::.|
  Rat  2055 LGW--SEGSSWRYGIFTKLLHAAPYCKTVGSEEKSERFTGIQQWIICDGAPNHAWLDSITCLLAD 2117

  Fly  2752 NKLLTLANGERIRLENYCALLFEVGNLNYASPATVSRAGMVYVDPKNLRYSPFWQRW--VLTRPE 2814
            ...|:|.||::|........|.||......||..:.|..:|:...:..     ||..  ||....
  Rat  2118 PPQLSLPNGQQIARPLGTFFLIEVAEAAGMSPTVLGRCALVWCCGEQT-----WQSMLSVLITSL 2177

  Fly  2815 P-----QRELLNDF--FEKIITQSIAFILEGLDGTTQGNPLKLVIMQTDLNMVTQFCNLYDALL- 2871
            |     |:|.:..|  ..:::..|:...|..:..::|........:...:..||....:..||| 
  Rat  2178 PHEYHLQQETIVQFNHLAEVLVPSVFRFLTRIGASSQLQVHGHQAVCPGVAEVTSLIRILRALLD 2242

  Fly  2872 ----------PNYVMDSKNYDEPVQQNY-------NTDSLE------------CCFLQAVYGSMG 2907
                      |:...|....| .|.||:       .:|.:.            ..||.|:....|
  Rat  2243 PHLHLFEEEKPHTKEDFSGTD-LVTQNFISSKSKAQSDRISVYKKERRHLLAISSFLFAIIWGFG 2306

  Fly  2908 ACLVEKHQPVFDEYM-KRISGFPLVQDTPENPASGGQFPQSKPTLYDYFWDVKDNVWKAWEWVVQ 2971
            |.|..:|.|:||::| |.||..|   :.||.|.|.        .::|...:::|.       .:.
  Rat  2307 AHLSSRHWPLFDDFMRKAISSLP---NYPEPPPSA--------LVFDLHINLEDG-------TLV 2353

  Fly  2972 PYTH---DPQVKFS----------EILVPTVDNTRTNRTLSLMSEIKRPVLLVGEAGTSKTATIM 3023
            |:|.   ...||.|          |.|:..||         |:....:||||.||..|.|:|.:.
  Rat  2354 PFTGQYLSTHVKRSLGSFQPSSQVEQLLYVVD---------LLLSNGQPVLLAGEIATGKSAFVE 2409

  Fly  3024 QYL--------RNLNPSVNVILNINFSSRTSSLDVQHTLEAAVEKRTK--DTYGPPMGKR--IAC 3076
            ..:        |.:||::|            |..:::.|..||..:|:  ...||....:  |..
  Rat  2410 VLVEPNHPTIHRPINPALN------------SAHLRNLLSRAVHGQTQAGSFVGPHQDSKGSILF 2462

  Fly  3077 FIDDMNMPQVDDYGTQQPI-ALLKLFFERGGMYDRDKDLNWKKFKDL----TFYAAMGTAGGGRN 3136
            .::|:::...|...:.||: ..|:...| |.:|..    |..:.:.|    .|.|.....|....
  Rat  2463 LMEDLHLAAFDPEKSCQPVLETLRQAME-GTIYSH----NTLELQTLQPTVNFLATATVPGYSER 2522

  Fly  3137 EVDPRFISMFS-------TYNIIF----PNDESLIQIYSSIFKGHMVFVKFQPEYMLIADMIVHM 3190
            .:.||...:|:       |.:.:.    |:.::.::.:.|:.:.|           .:|..:|..
  Rat  2523 PLCPRLYRLFTVLALNSMTQDTLLSRHVPSIQAWLERFPSVEREH-----------TLARALVRA 2576

  Fly  3191 TLKLFKMVIVDLPPTPSKFHYIFNLKDLSRIFAGMLLIEP------------------------- 3230
            :::.::.|.....|:|...||.|:...:|.|...:.|:..                         
  Rat  2577 SVEAWEAVCNCFMPSPLHPHYRFSPHSVSHILGSLQLLPTRMGSRGFVDSFHHQEHLRRVSGLRG 2641

  Fly  3231 ---TCFKGLRDLIRVWRNEYTRIICDRLITDNDIANVRRNLAVEVAERF---PPTFE------EE 3283
               |....:|.::|:|.:|..|..||||.:|.:.::..: |.:|||:|.   .|..|      ||
  Rat  2642 TRLTIMMSMRVMVRLWLHEAQRTFCDRLDSDRERSHCVK-LLLEVAQRVFCSVPGSESLARVCEE 2705

  Fly  3284 HGFIDAAAAEAEAQARLLYEPSKADIDGGEEEGEE------------EEEG-------------- 3322
            ....:....|.|::..:.:....::.|.|.||.|:            .|.|              
  Rat  2706 EEVEEEKVPEVESEEEIAHWEILSNSDSGSEEEEDPFGLQATTGSFLSESGLAPLPIKSVNKENT 2770

  Fly  3323 -----------------------------EEAPQVILSLKDYVLRDPLLFGDFRN---------- 3348
                                         :.|||..|||.  :|...|||....|          
  Rat  2771 ENVSQVAQQLEDIRNSNSKLQSETHKRKWQRAPQTDLSLP--LLLPVLLFYPQENPSDLVFSLEL 2833

  Fly  3349 --FTNESEPRLYEDLLDYNSVYFLFTEILEEYCERKQKMTLVL---------FEDC---LEHLTR 3399
              .:|...|.||                ||...|..:|.....         |..|   ::|:.|
  Rat  2834 TLGSNFESPNLY----------------LERQWENLEKQLAASAVQLKMNSDFAQCHVMVQHVAR 2882

  Fly  3400 VHRTLRMNRGHVLLIG-VGGSGKKCITRLAAFAAECDVFEITISRGYNEAAFREDLKVLYTIAGV 3463
            :.|.|...|.|.||:. ..|:|:.....||:...:..:|.:...   :|.|..:.|:.....|||
  Rat  2883 LVRVLARPRQHGLLLSEFRGTGRNTAIILASNICQARLFHLPFE---SEEAVFQCLRDASWHAGV 2944

  Fly  3464 KRKKVVFLFTGAQVAEEGFLELINNILTVGQVPALFPDEDKDGIVNQVRKFAEEDGVSASKDAVW 3528
            ..:.|..|... ||....|.:|: .:.|.|..|..:.:.|.|.|...:.|....:..|..||.|.
  Rat  2945 LNQSVALLVPD-QVNVATFCQLL-ALATSGSFPDQYTEADLDNIEEHLPKENLVNKYSIKKDTVL 3007

  Fly  3529 GYFLRTCAENLHVVLCMSPAGDALRNRCRN--FPGLIGSTY--IDWVFPWPRQALYAVAKLFLTE 3589
            ..|.:....|||:...|.  .|.::.:..:  |..|:..|.  :|...||.:.:|..||:..|..
  Rat  3008 NRFYQQVCSNLHMFFLME--DDQVQKQLPSTLFLSLLQLTIASVDRYEPWDQASLVRVAQFRLEN 3070

  Fly  3590 HRLIPASHR-------EAIVEHVVH----VHTSIQQYSKDYLAKLRRNNFVTPKHYLDYINTYRG 3643
            .:.:|....       :.::.:|.:    :|.|...|.:.....|   ..|||:.:.|:::.:  
  Rat  3071 DQSLPLDDGSLKCPDFKILIPNVANIMARIHGSSAYYHQHMCPAL---PLVTPRTFQDFLDMF-- 3130

  Fly  3644 LLEEKAKFITQQRSRLGEGIKKIEEASVQIDELRIIVTEQKKNVAVASEECEAMLVTIESSTQKA 3708
             |:::.:.:.|.|.|    .::|:.|   :..||::|.......        :||..:|      
  Rat  3131 -LQQQQQMVLQMRMR----ARRIQSA---LKTLRLLVERHSTQT--------SMLTDLE------ 3173

  Fly  3709 NVKKAEASEKSV--------EVEIKGKQIAIEKDEAEEILA------EAMPALEEARL------- 3752
              |:.:.|.|:|        :.:|..||...|....|.::.      :|:.|.:||.|       
  Rat  3174 --KQLKGSYKNVGMYQGQLEQCKILYKQKMAECQHLESLIENLTRQHDALKAQQEAFLEQMGKAF 3236

  Fly  3753 --ALSQLEKAQITEIRSFATPPAAVQVVCECVAILKGYKEINWKSAKGMMSDVNFLKSLMEMDCE 3815
              .||||..|...||||:..||.:|..|.:.:..| .:.|..|.|||.::...:|.:.|:....|
  Rat  3237 VGPLSQLRVADFEEIRSYRAPPESVVKVTDALCDL-FHHETGWSSAKQLLCTEDFYQELVFFPKE 3300

  Fly  3816 ALTQKQITQCRQHMKTGNLED--MAKISVAGAGLLRFVRAVLGFFDVYKEVKPK---KERLDFLV 3875
            .|...::.:..|.::...:.|  :..:|:..|.|..::||||.:....:...|.   ..::|..:
  Rat  3301 KLMDSELAKLSQALRAPGMSDASLRSVSIPAANLAVWLRAVLRYGLAQRRGLPTGLLLRQVDATL 3365

  Fly  3876 EEQEVQI--------KLLNHLNGEIQKLEEKLNELNENYATSMKQMRALTEMMQQAERRLIASDK 3932
            ..::.::        .||.......:|||:.  :|:.|:         :.|.:.||:........
  Rat  3366 AREQARLGQFQFQAHDLLQQTQFLTKKLEDA--QLSHNH---------VVETLNQAQCGHFHRWP 3419

  Fly  3933 LISGLTSELIRWSKEMASLGQQLIDSVGGCLISASFLAYTGAFTWEFRKAMVFDDWL-------- 3989
            :.|.|.:.:..|:.::..|.:|.....|..|:.::.:.|.|.|..: |:..:.:.||        
  Rat  3420 MKSALLTPMHMWTTQLQKLQEQAKTVFGDALLCSAAIVYLGPFPPQ-RRQELLEKWLSLCQGFEE 3483

  Fly  3990 ----EDIASL------------GIPIQLPFKIDGYLTTDVEISQWSNEGLPPDELSIQNGILT-- 4036
                :|:|..            .:|.:.||:|...|:...|..||..:..|..:.:...|:|.  
  Rat  3484 ALDPDDVAQALRQKSVRVSKNPLLPTRTPFRILTLLSCGSEQHQWDRDLKPQAKSARLLGLLLRS 3548

  Fly  4037 ---MRASRFPLCIDPQLQALQWIR----------------------------------KREFKNN 4064
               ..:||:||.:||..||:.|:.                                  :.|.:||
  Rat  3549 HIHFSSSRWPLLLDPSNQAIIWLNPLPPKQNKWLEQPPKESRAKYHVTNQDSEDETEDELESENN 3613

  Fly  4065 ----------------------------------------------------------LKVLSFS 4071
                                                                      |.|||.:
  Rat  3614 EDEDEVSEQREEHKTEENESEEENKQEEQETEKENEAESTSSGSSSSPPSETQCLPSYLTVLSGT 3678

  Fly  4072 DSDFLKQLEMAIMYGTPVLFEDVDDYIDPVIDDILQKNIRIQGGRKFVMLGDKEVDW-------- 4128
            |.:...||..|...|.|||..:::                       :.||.:|:.|        
  Rat  3679 DPELGPQLLEAAANGLPVLLTNME-----------------------LSLGCQELQWLLSKKNLI 3720

  Fly  4129 ----DPSFRVYLTTKFSNPKFDPAVYAKAL----VINYTVTQTGLEDQLLSVVVGTERPDLEAQR 4185
                .|.|.::|:|.|.....|..:..:.|    |::..:....||:|:|..::..|||:||.:.
  Rat  3721 PPYVQPGFCLFLSTTFPIHALDRVLGYELLKGLNVLDLGLNMEILEEQMLHEILCRERPELETRW 3785

  Fly  4186 ESLIAQTSENKQLLQQLEDSLLRELSTSTGNMLDNVELIETLENTKTK------AGVVMEQLKLA 4244
            :.|..:.:||.:.::..|:.||..|.............:..:..|:.|      .|..:::.|| 
  Rat  3786 QDLKVRAAENYEAMKADEEQLLVILLRQNKMRQKPSRFLREMVRTQAKICQLNAQGEELDEQKL- 3849

  Fly  4245 ADTAADIEVLRNGYRPAAKRGAVLFFALSDMATVNSMYQYALAAYLDVFVYSLRKAV-------- 4301
                 ::..|...||..|..|..:..|||.:..:...:......:|.|    :|:|:        
  Rat  3850 -----EVAALWAPYRQVAYHGMAMVEALSSLQNLLPFFCMKSENWLAV----IRRAIDSMKSCDS 3905

  Fly  4302 ------PDASLNKRLNNIIKTLTENVYCYGC--TGIFERHKLLFSFQIATKLAQRDGILLQSELD 4358
                  |...|..:::...:.|...|...|.  |.:......|...|:..|..:.:.:.|.    
  Rat  3906 YHGEDLPSHLLRMKIHLARQLLINTVVALGLIQTPLVGAFGALAMLQVTKKTPKLERLALW---- 3966

  Fly  4359 FFIKGSIALTKSER-------SNPCKWLSEKSWED--VLKLAFDFPDIFGTLPDHFGRYLTEWKE 4414
               .|.:|...|..       :.|. |||.::||:  .|:|...|..:..:|..|    ...|::
  Rat  3967 ---PGLLASPSSGHNIQIPGVTRPA-WLSSRAWEECGALELLSPFAGLRASLASH----SDVWQD 4023

  Fly  4415 WFDLENPEEVPCPGDYNIKCNAFQKLMFLRCFRVDRIFRSI----NQYIVETMDEFYIMPPVVSF 4475
            :..|.:....|.||..:...:.||||:..|..|.|.:..::    ...:...:||....|     
  Rat  4024 YLSLSSTVLGPAPGPNSEPLSLFQKLILWRVLRPDCLVGALADLTTSLLGRPLDEDLDAP----- 4083

  Fly  4476 SAIYEQTSSTIPVCFVLSAGSDPTNDL------IKLADTIVGMSNFCHISLGQ---GQEKAALRL 4531
            :.|::....|.|:..:|.....||..|      .|||.:.........|:||.   ......:..
  Rat  4084 TMIFDHIQPTQPILILLPPPGHPTATLHPVTVIRKLAASEKPQKRLHVIALGSEDWDPVSTVVNT 4148

  Fly  4532 LDGAIKQGMWLMLQNGHLLIRFVRELEKHL-------------DRIENP--------HPDFRLWI 4575
            |..|:.||.||:|.|.||:..:.|||.:.|             :.|..|        |.|||||:
  Rat  4149 LSQAMLQGHWLVLDNCHLMPFWPRELLQPLQGLLDGAKVVSDSELIAEPESRTVATVHRDFRLWL 4213

  Fly  4576 --TTDPTPTFPIGILQKSLKVVTEPPNGLKLNLRSTYFKVRQERLESCSHVAFRPLVYVLAFFHA 4638
              :|:.:.:.|..:.|.|:.|...  ..|:|..........|:.|.:.|.....||.    |.:.
  Rat  4214 IASTEASTSLPGVLTQHSMPVFWN--QSLELGRILIDSVDSQQELSTQSFTQTFPLF----FLYG 4272

  Fly  4639 VVQERRKYD-KL-----GWNIAYDFNDTDFDVCTEILRTYLTRCGTGKIPWNSLKYLIGEVMYGG 4697
            ::..|:.|. ||     .|:..         ..|.:|:.......:...|..:|..|...|:|||
  Rat  4273 LLVHRQLYGLKLQAHRGRWSQV---------TLTRVLQIQEQLWASLSNPSAALLELAASVLYGG 4328

  Fly  4698 RVIDDFDRR----ITNCYMNEYMGDFLFDEFKVFHFYEDDNVDYCL------PE-EETILKEDYI 4751
            .:.|..||.    :|...:|.          :..::.:.....|.|      || .|...:.|..
  Rat  4329 PLRDLEDRETLVSLTGACLNP----------RNMNWVQPHTPQYLLATLMPSPELGELDARTDCK 4383

  Fly  4752 AHIDKLPLVNKPDVFGLHPNAEIGYYTMAARNIWNSLIELQPQTGEGTGGISRDDFIDSVAAGIL 4816
            |.:..||..::|...||:...:.......:|.:.::|.:..            ..::.:|..||:
  Rat  4384 AQMHLLPTPSEPRTCGLNEGPQAWLLRRQSRALLSALRQCS------------STWVPTVCGGIV 4436

  Fly  4817 KKLPPAFETWRIRKQIQMS---------------------LSPTGVV-----------LLQELDR 4849
            ::     :..|:|:::..:                     ::|..|:           |..|:..
  Rat  4437 QR-----KERRLRQRLVQAKKRLVALQALLTNNRYRSGQCVTPWAVLGPNARPPLEGFLETEVLE 4496

  Fly  4850 FNLLVVRIKKTLELLRKAIAGEIG-MDNVLDNIANSLFNGLLPAAWSKLAPATCKQLASWLEHLR 4913
            ...||..:.:.|:.|.:.:.|:.. ..:....:|.:|:.|.||..|...|||..:....||..|.
  Rat  4497 LKQLVGMLLRDLDCLLQQLKGKTPCTSSRCAEVAQALWAGRLPQPWRSHAPAGPQLPWLWLRQLS 4561

  Fly  4914 LRA---VQYKYWTLS----GEPLVMWLSGLHIPQSYLTALVQIACRRNA---------------- 4955
            .|.   :||....:|    |...:..||....|:..|.||...|...|:                
  Rat  4562 RRGHLLIQYLDSGISENANGPERIFHLSAFRHPRRLLLALRWEAVLENSGHSPKLPGHQGSGSGN 4626

  Fly  4956 -----WPLDRSTLFTYVTKFADPDDVEERPVTGCLVHGLYIEGGRFDLATNQLARSH-------P 5008
                 ..|:...|..:|....:|    :.|..|.|:.||.::...:|.....|..|.       |
  Rat  4627 LPPRRQELNNHPLHIWVENGPNP----KVPKMGLLLIGLQLQHAAWDQTDGALKDSFSSQPCPLP 4687

  Fly  5009 KVLVEELAILAVEPIEAHRLKLQNTYLAPVYTT 5041
            .|.|...:..|.:...:..|.:   |..|:|.|
  Rat  4688 PVSVSTQSRGAKDASVSAGLGI---YSCPLYMT 4717

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
Dhc98DNP_524541.3 DHC_N1 523..>968 CDD:462457 29/197 (15%)
DHC_N2 1795..2196 CDD:462462 85/483 (18%)
DYN1 1999..4719 CDD:227570 693/3331 (21%)
AAA_6 2338..2664 CDD:463697 87/374 (23%)
Dynein_C 4778..5076 CDD:465677 62/332 (19%)
Dnhd1XP_008758037.1 DHC_N2 1026..1475 CDD:462462 82/453 (18%)
AAA_6 1659..2012 CDD:463697 87/374 (23%)
Dynein_AAA_lid <2230..2356 CDD:465532 34/144 (24%)
AAA_7 2382..2540 CDD:463698 40/183 (22%)
AAA_8 2876..3126 CDD:463701 61/259 (24%)
MT <3198..3475 CDD:463699 64/289 (22%)
AAA_9 <3672..3810 CDD:463702 39/160 (24%)
Dynein_heavy 4092..4227 CDD:460782 36/134 (27%)
Dynein_C <4485..4750 CDD:465677 53/240 (22%)

Return to query results.
Submit another query.