DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment Dhc98D and Dnah3

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_524541.3 Gene:Dhc98D / 43379 FlyBaseID:FBgn0013813 Length:5080 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_647937.2 Gene:Dnah3 / 38586 FlyBaseID:FBgn0035581 Length:4385 Species:Drosophila melanogaster


Alignment Length:4891 Identity:1389/4891 - (28%)
Similarity:2229/4891 - (45%) Gaps:891/4891 - (18%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly   506 RVPVDPKRLDLVITYTQQQLEEVVDGWIKYLKKTMKTLTDAKLD-DFTPMAEHRYWHKMEVELYG 569
            ::|:||     |..:.|:::..:         :|.|.:.....: ||     |||          
  Fly    59 QLPLDP-----VKEFLQEKISHM---------QTDKIVGHCNREFDF-----HRY---------- 94

  Fly   570 TLEQLKTEFVVAVLQRLTDDKSPVLDEWQAVVEKTEARFKLAKENSDYLGTIIDYLEKVRSYESF 634
            .|:.:|.|:...      ||.|  |.|.|........:|::.::..|:|            |...
  Fly    95 DLDNVKDEYDEC------DDDS--LQELQLEDIIMPEQFEMLRDAKDHL------------YNFD 139

  Fly   635 KMVVLQIPNI---MVGLR----HIWTMSSH----YCRDPEMQVLLCQISNVFVQKVKSIINFENI 688
            .....|.|.|   |.|:|    .|:.|:||    ||.                ::|:       |
  Fly   140 STACNQFPWIDKWMTGVRPSEQEIYEMTSHLLEIYCN----------------RRVR-------I 181

  Fly   689 FKYSATYTYETATNCANLLRCWKQAYKLSRQHIEDSGAGSRWEFDRVALFNEVNHIHRVAVDIAY 753
            |          ...|......|..  :|.|||      ||..|.  :..:...:..|        
  Fly   182 F----------YPGCGTSSSLWTN--QLRRQH------GSPSEL--IGAYRTPSARH-------- 218

  Fly   754 VGRVFVQYENLFGHRLKA--------CIADPSIVDNLMRKVYRMLDDLIKSVDYDMFRPGNWENW 810
                 ::..|:.|...|.        ....|....|.:.:|.:::|:||:.|             
  Fly   219 -----MRVNNMRGPPKKEKFTAGDHYAFRTPQECRNELMRVGKIIDELIEPV------------- 265

  Fly   811 EYSLELFNKRL--------------DNVENEAKNVIDQSINSLLSSEKGLDLVVNAMNIDTR--A 859
               |:....::              ||.     |.|.:|...|:..:|  :..|....|..:  |
  Fly   266 ---LKAAEHKIGHGLTKYPDPPSCKDNT-----NRILRSAGILVGKKK--NCYVGKCRIHRKDFA 320

  Fly   860 TLQEFVATKHENLLRFFVTEINAVERVFTKLKKSPPMAKHQPAKISAIFWARLLGKKLKTSVLAF 924
            |.:||:..    |.|...|..             |.|...||....        .:|:|  :||.
  Fly   321 TNEEFLRC----LKRMEATHF-------------PYMQPLQPVDPD--------DQKIK--MLAK 358

  Fly   925 KRVEDEPAIKNSFLKRSSFKQYFELMTVMFQFEKVLFENFIQNATYLVNTTNRSNVLR---IRIC 986
            .|||...|.|...||..  |:|..|:..|         :.:|.|||      .|:::|   .||.
  Fly   359 YRVELARAEKLFTLKIQ--KRYQCLLKSM---------SIVQLATY------PSHLIRKAFRRIN 406

  Fly   987 KESTMSYISEAVQTLKAKPR------PELQMTSDRRVTPVKSSNLMPVQSEAFSAYSVADSAGTE 1045
            ..|.:  :.:|.|.:..:.|      ||:.:.                                 
  Fly   407 PRSAL--LQDAYQFIVKEKRDWPKLPPEVILM--------------------------------- 436

  Fly  1046 ISSESENEGLLVGDTSQKK------LMCRIN-----RLTVLVAMIMWMV-SNTRKANIQLQECTA 1098
                   :.|.|||...::      ::|.|:     |..|..:.:.::: ||..:..:||     
  Fly   437 -------DYLFVGDRGVRQDLAILIIVCLIDLQEDFRHYVKRSFLNYLLSSNMERRRLQL----- 489

  Fly  1099 FIKMVKDKKPKDVTAMD------------RHCVRTCELLQRAES--QYLLPIWRELVGEKTLIEY 1149
                  :::|.:...:.            |...|..|:|.....  |.|..:|.:|..:..:::.
  Fly   490 ------EREPPEFPILTISPPVSWRSNLLRGKARIGEVLMTTHPTVQALNRLWHDLYEDLVVVDL 548

  Fly  1150 DMDFVVN--LKRDVFDVLFEAQQFEHLGFTLPAVLRTAIMKKDLLFKDYERMTEVVDRYRSIINN 1212
            ....:..  |..|...|..|               ::....:|||..|:      :.|...::|.
  Fly   549 GQLLLAQRPLDADTVQVFIE---------------KSCADVRDLLLNDW------LPRCADLMNE 592

  Fly  1213 LSMSEVIFLRGHIYDTELFIQMGVGRYTWTSF--NIGKF---------CDQINSQL-RKLTSIVS 1265
            :                        |.||...  ..||:         |  |:|.: |.|.|::|
  Fly   593 M------------------------RGTWKDLVPMSGKYGGRAAMLFRC--IHSAMSRHLNSLIS 631

  Fly  1266 Q-INFI-----------RLDLRSRID-MIKSFNLFNL---------DDE-LKVEDTSRSSGESYL 1307
            : ||::           |::..|..| .:|...|..|         |.| :.:....|.:...|:
  Fly   632 KSINYLFKVLCAFKGGNRIEKYSMFDAKLKRIPLMTLIASVVGAHFDHEPINMGPGVRPASNIYV 696

  Fly  1308 --QDRKNPSQRFKSVTGETITMFSVEKDVPADEKAEQACGSG----IYPCQGYFELLEASRNRKA 1366
              :|..:|.|:      ..:..| ||.....|:.|:......    |||   |.:.|.    |..
  Fly   697 YDEDDADPFQQ------PQVNQF-VENVPDIDDVAQFELDHSNKLYIYP---YMQELP----RIF 747

  Fly  1367 AQMKKLYDSLGPVLVKLESLVLGTFSGRSDRMKTYYEYWEG---------ETFKCIVDMTYQNLK 1422
            .:..|...::|..:.:||.::    ||.....|.:..:.:.         |..:.||.:.:|.:.
  Fly   748 TEHFKSILAVGYEIPRLEFVM----SGGEPETKGFLHFIDEDHVDFLELCEKVEQIVKVNWQGVH 808

  Fly  1423 CYINRLLSNKPMFEVNAVLLMSEIVLEPSVQEL--QNTI--VTATKDYISRLRIFTRWMTGTCIA 1483
            .|:      ||:::....|....|:  |.||::  :|.:  :.|.::.:.:|:..:         
  Fly   809 VYL------KPVYKYYFGLFQKLIL--PMVQKVWTENNLPELGAVQELLKKLQAVS--------- 856

  Fly  1484 CPLVEMGKQFKYNYTYYEDVIQIRSIVDLVINIHDLASR--------VANEARGFVSQFRKYFNL 1540
                        :.|||     :|..:.|  |:..|.:|        ...|...|:..|.|..| 
  Fly   857 ------------DTTYY-----LRDFIPL--NLFMLDNRHVKLSLRMYVREIYDFIIDFYKALN- 901

  Fly  1541 WAFEKSFICQKFLEKQVTLIEIDEKFTFYSSIVETLANTRKFQDIKCVRINLEPLLASITQHAQD 1605
            |. |...||::..|..:...|..|:      ..|.:|                            
  Fly   902 WN-ENRAICEELEEMSMKAGERPEE------TPEVVA---------------------------- 931

  Fly  1606 WCTTLGEELLRHVND--NMR--AMRNEVKTLSLNLNKTTRELEDFKLVMTTIGTVQSSTLTNEQK 1666
                    |..::||  .||  |:::|:|.                 |:..:..:.:.|..:..:
  Fly   932 --------LQNYINDCREMRIFAIKDEIKN-----------------VLKRVVFLLTHTYLSSDE 971

  Fly  1667 IHEMQETFTILSEHKIMFPYEDMLMAH--------HLEKRWKRLFLSALYRYEKLQPIKQKFADM 1723
            :|....||.:..|.:.:.   |:..|.        .|..|.:|:      .:|||  :.|:...|
  Fly   972 LHLNSRTFILPGELEEVL---DLSAARLAVVRDNLELALRERRM------EFEKL--LAQEKRTM 1025

  Fly  1724 TSVEIDEFCDDLAEFIKDYDENGPGSVGAELERGVRLMDPYGQKIAERESRREELANAERLFDMA 1788
            ....|.|..|.|..              .||:..|..:|.....| |..||..:..|.|.  .:.
  Fly  1026 DGFRIREIRDVLTL--------------EELKERVDTVDLLFTTI-ENLSREAKAINTEE--TLL 1073

  Fly  1789 MVDYHEFARVQTEFEGLQQLYKLYKAQKYAREG----WGKTLWADLDPNVLTEGVESYLKEFRKF 1849
            .:|...|..:....|.::.:.||:|. .|..|.    |....:..|:.:.:.|.||:..|...|.
  Fly  1074 QIDVSAFPLLAEIIEKMEPIEKLWKT-SYEFEKDYLIWMFERFECLNADGVREQVENMHKIMYKL 1137

  Fly  1850 TKAVRTLPV----GVQLEIHMKQFKGTVPLMVSLKHEALRERHWLQLMEKTGQYFDMSPARF-TL 1909
            ::.:...||    ..|:.:.:::|:..:|::.|:....|.:|||.|:.:..|:  .::|..| ||
  Fly  1138 SRQLAYNPVAKRAAEQMRMKIEKFRVYLPVLDSICRHGLEKRHWDQISKILGR--KVNPKLFPTL 1200

  Fly  1910 ENMFAMQLHKYQEIAEQILTNAIKELQIERGVQAVIETWASMAFKTFKHFKGSDDRGWVLGPVDE 1974
            ::|..:.:.......|:|...|.||..:..|::.:...|..:.|:..: ::.||..  :|..:|:
  Fly  1201 KDMIDVDIMSILPQLEEIANAAGKEYDLNNGLRIMQADWRDVMFEVLQ-YRDSDTH--ILASLDD 1262

  Fly  1975 IMQILEDNAMNLQSMGASQFIGPFLETVNKWERTLALISEIIDEWLVVQRKWLYLEGIFIGGDIR 2039
            |..:|:|:.|..|:|..|.||.......:.||..|.||..|||.|..||..|:|||.||...||.
  Fly  1263 IQTLLDDHIMRTQAMKRSPFITALGSKADDWEARLLLIQNIIDAWTQVQITWMYLEPIFSSEDIM 1327

  Fly  2040 TQLPEEARKFDDIDKSYRRIMVDCAKNPLVVPFCTVPGRLVEIQGLGI-GLENCQKSLNEYLDSK 2103
            .|:|.|.|.|..:||.:|:||....|:..|:.....| .::|:....| .||...|.||.||:.|
  Fly  1328 RQMPLEGRNFKAVDKLWRKIMKHTLKDRHVMAATEYP-EMLEVFTKAIEDLETVTKGLNTYLEQK 1391

  Fly  2104 RRIFPRFYFISTDELLSILG-SSEPSAVQNHIIKMYDNIKSLRLVKEGSQTIVTGMISSEGE--- 2164
            |..|.||:|:|.||||.||. :.:|..||.|:.|.::.|.||..  :.:..||. |:|.|.|   
  Fly  1392 RLFFARFFFLSNDELLEILSETKDPMRVQPHLRKCFEGIGSLTF--DDNMEIVE-MVSDEEERVA 1453

  Fly  2165 VMEFRHSARAAGRVEYWMNDV----LDEMRRSNRFINKTAIYDFGTDLQISRPDWLMNYQGMVGL 2225
            ::...:...|.|.||.|:.:|    ||.::...|    .|..|:.   .:.|..|::::.|.|..
  Fly  1454 LVRKINPQLANGLVEMWLKEVEMVMLDSVKEQMR----EAWEDYA---MVERISWVVSWPGQVVQ 1511

  Fly  2226 AASQVWWTAEVEEAFDQAQNHGNMRAMKDFLGKNNYQIEELVLKVRSNLSRNDRLKFKAQCTVDV 2290
            ..|.:.||.|||||.:       .:.:..:|.|:|.||.:||..||::|....|:..:|...:||
  Fly  1512 GISCMAWTYEVEEAIE-------TKELPAYLEKSNLQIADLVQLVRTDLQAGVRIAVEALIVLDV 1569

  Fly  2291 HARDIIDNFVRDNVLDASEFSWESQLRFYW---IKFYDNLHVLQCSGSFDFGYEYMGLNGRLVIT 2352
            |.||::.......:.:..:|.|.||||:||   .|..|.:.|.......::|.||:|...|||:|
  Fly  1570 HDRDVVKYLTDCRITNIQDFDWISQLRYYWKVNEKNEDWVCVSMVVTDVEYGMEYLGNLPRLVVT 1634

  Fly  2353 PLTDRIYLTITQALLMNLGGAPAGPAGTGKTETVKDLAKAMGLLCVVTNCGEGMDYRAVGTILSG 2417
            |||||.|.|:..||.:.|||||.||||||||||.||||||:...|||.||.:|:||:|:|....|
  Fly  1635 PLTDRCYRTLMGALKLCLGGAPEGPAGTGKTETCKDLAKAVAKKCVVFNCSDGLDYKALGKFFKG 1699

  Fly  2418 LVQCGAWGCFDEFNRIDISVLSVISTQLQTIRNGLIRKLDRFVFEGVEIHLDPKCGVFVTMNPGY 2482
            |.|.|||.||||||||::.||||::.|:.||:..:.||:.:|.||...:.|||.|.:|:||||||
  Fly  1700 LAQSGAWACFDEFNRIELEVLSVVAQQILTIQRAIGRKVVKFFFEDTMLKLDPTCSIFITMNPGY 1764

  Fly  2483 AGRTELPESVKALFRPVTCIKPDLELICLISLFSDGFLTAKVLAKKMTVLYSLAQAQLSKQCHYD 2547
            |||||||:::|.|||.|..:.||..:|..|:|:|:||..|:.|::|:...|.|...|||.|.|||
  Fly  1765 AGRTELPDNLKVLFRTVAMMVPDYAMIGEITLYSNGFDMARNLSQKIVQAYKLCSEQLSSQSHYD 1829

  Fly  2548 WGLRSLNSVLRMAGVMKRQSEDLPEAVVLMRVLRDMNFPKFVFEDVPLFLGLIKDLFPGIDCPR- 2611
            :|:|::.|||..:..::|...||||..:::|.:.|:|.|||:.:|:.||:|:..|||||::.|. 
  Fly  1830 YGMRAVKSVLLASASLRRLYVDLPEPEIVLRAIVDVNLPKFLEQDISLFIGIYMDLFPGVELPMP 1894

  Fly  2612 -----IGYPDFNAAVRHVLVNDGYILLPDQEDKVVQMYETMMTRHSTMLVGPTGGGKTVVINALV 2671
                 :.:...|.|.|::.....|:      :|::|:||.::.||..|:||.:.||||.....|.
  Fly  1895 QRGDILKWLHINLADRNLQATPWYL------EKILQIYEMLLVRHGLMIVGGSMGGKTTAYQVLA 1953

  Fly  2672 KAQTHMG---------LPTKCLVLNPKACSVIELYGFLDMETRDWIDGLFSNIFRE-MNKPIERE 2726
            :...::.         .|....::||||.::.:|||..|..:.:|.||:.:..||| :..|  :.
  Fly  1954 QTLRNVSTDEEATLKEFPVTFRIINPKAITMGQLYGRFDPVSHEWYDGVLAKTFREQVQGP--KG 2016

  Fly  2727 ERRYACFDGDVDALWIENMNSVMDDNKLLTLANGERIRLENYCALLFEVGNLNYASPATVSRAGM 2791
            ||.:..|||.|||:||||:|:|:||||.|.|.:||.:::.....::||..:|..||||||||.||
  Fly  2017 ERAWVMFDGPVDAVWIENLNTVLDDNKKLCLMSGEIMQMTKLMNMMFEPADLEQASPATVSRCGM 2081

  Fly  2792 VYVDPKNLRYSPFWQRW--VLTRPEPQRELLNDFFEKIITQSIAFILEGLDGTTQGNPLKLVIMQ 2854
            :|::|..|.:....:.:  ||.......::....||.:....:...||.|....|         .
  Fly  2082 IYMEPSQLGWRALHKSFINVLVNKVGLGDIYMTLFEDMTEWLVPAALEFLPQCKQ---------M 2137

  Fly  2855 TDLNMVTQFCNLYDALLPNYVMDSKNYDEP-VQQNYNTDSLECCFLQAVYGSMGACLVEKHQPVF 2918
            .:|:.:.|: ..:.....:::...|.:::. .||.:     ..||..| |.|   .|..:.|..|
  Fly  2138 LELSPIYQY-QTFSRFFLHFLEKHKQFNQAWFQQMF-----LFCFAWA-YCS---ALTGQGQKTF 2192

  Fly  2919 DEYMKRI-----SGFPLVQDTPENPASGGQFPQSKPTLYDYFWDVKDNVWKAWEW--------VV 2970
            |..::::     ..||..:....|  .|..||: |....||.:|..:| |  |.|        ..
  Fly  2193 DALLRKVIYGSNENFPKPKYFSLN--RGQMFPE-KLLFLDYRFDEAEN-W--WTWQKSDDSASTT 2251

  Fly  2971 QPYTHDPQVKFSEILVPTVDNTRTNRTLSLMSEIKRPVLLVGEAGTSKTATIMQYLRNLNPSVNV 3035
            ..:..:.|:  ||::|||.:....:............:|:||..||.|:|.|...|..:....|:
  Fly  2252 SNFPENAQI--SELIVPTKETGYISYWQEFCISKSYAMLVVGPTGTGKSAIITSNLLAMPKFANL 2314

  Fly  3036 ILNINFSSRTSSLDVQHTLEAAVEKRTKDTYGPPMGKRIACFIDDMNMPQVDDYGTQQPIALLKL 3100
            :..||||:|||:..||.|:.:.:::|.|..:||.:||:...|.||:.||..|.||:|.|:.||:.
  Fly  2315 VNVINFSARTSAQMVQDTIMSKLDRRRKGVFGPSLGKKCTVFCDDVAMPSKDTYGSQAPLELLRT 2379

  Fly  3101 FFERGGMYDRDKDLNWKKFKDLTFYAAMGTAGGGRNEVDPRFISMFSTYNIIFPNDESLIQIYSS 3165
            :.:.|...|. .|....:..|:|...||||.||. |.:.||.........:....|.::::|:::
  Fly  2380 WLDHGYWSDL-VDTTKIELVDMTLMCAMGTLGGS-NFIFPRLYRHMFVVAVDSFEDSTIVRIFTT 2442

  Fly  3166 IFKGHMVFVKFQPEYM-LIADMIVHMTLKLFKMVIVDLPPTPSKFHYIFNLKDLSRIFAGMLLIE 3229
            |...|  |.|..||.: |::..:....:.:::..|....|||:|.||.|:|:|::|:|.|::::.
  Fly  2443 IGDWH--FSKGYPEKVALLSRGLSEAMVSVYRDAIRSFLPTPAKSHYSFSLRDITRVFQGIVMVP 2505

  Fly  3230 PTCFKGLRDLIRVWRNEYTRIICDRLITDNDIANVRRNLAVEVAE------RFPPTFEEEHGFID 3288
            |........|.|:|.:|..|:..|||:...|    |..|.|...:      |||    .|..|  
  Fly  2506 PKRMPDPEKLGRLWAHETYRVFYDRLVDQQD----RDRLLVMAVDACKSNLRFP----LEQAF-- 2560

  Fly  3289 AAAAEAEAQARLLYEPSKADIDGGEEEGEEEEEGEEAPQVILSLKDYVLRDPLLFGDFRNFTNES 3353
                                       ||..|.||:       |.|..||: |.:|::  ...::
  Fly  2561 ---------------------------GERIEPGEK-------LTDNDLRN-LFYGNY--MEPDA 2588

  Fly  3354 EPRLYEDLLDYNSVYFLFTEILEEYCE-RKQKMTLVLFEDCLEHLTRVHRTLRMNRGHVLLIGVG 3417
            ||:.|::...|..:..|....|.||.. ....|.||:|...:||::||.|.|:|.||::|::|:|
  Fly  2589 EPKFYDEGDTYEKLEKLMKYYLREYNSFSSTPMDLVMFRFAIEHVSRVSRVLQMPRGNILMVGMG 2653

  Fly  3418 GSGKKCITRLAAFAAECDVFEITISRGYNEAAFREDLKVLYTIAGVKRKKVVFLFTGAQVAEEGF 3482
            |||::...||||:.|:|.:..:.:|:.|....:|:|||.:...|.......||||:.||..:||:
  Fly  2654 GSGRRSSARLAAYIADCRLMTVQVSKSYTITDWRDDLKKILMSASFNLNHTVFLFSDAQATDEGY 2718

  Fly  3483 LELINNILTVGQVPALFPDEDKDGIVNQVRKFAEEDG--VSASKDAVWGYFLRTCAENLHVVLCM 3545
            :|.||.||..|.:|.|:..|||..|:..:...|::.|  :......|:.|::....|.||:.|..
  Fly  2719 VEDINGILNTGDLPNLYQLEDKATIMENMANVAKQLGKILDTLPSEVYAYYIDRIREQLHIALAF 2783

  Fly  3546 SPAGDALRNRCRNFPGLIGSTYIDWVFPWPRQALYAVAKLFLT---------EHRLIPASHREA- 3600
            ||.||:.:.|.|.:|.||....|||..|||.:||..|...|::         |....|...::| 
  Fly  2784 SPIGDSFKERIRVYPSLINCCTIDWYMPWPEEALSRVGVYFVSSMNLNRPHGEETQEPVQSKDAA 2848

  Fly  3601 ------------------------IVEHVVHVHTSIQQYSKDYLAKLRRNNFVTPKHYLDYINTY 3641
                                    :|:.|::.|.|:...|:....:|.|.|:|||..||:.:..:
  Fly  2849 DPDEEEVRRETVGVEREQTQLEADLVDCVMYFHQSVVDASEKCYLELNRRNYVTPSAYLELLKAF 2913

  Fly  3642 RGLLEEKAKFITQQRSRLGEGIKKIEEASVQIDELRIIVTEQKKNVAVASEECEAMLVTIESSTQ 3706
            |.....|...||:.|.|...|::|::.|:.|:.|::..:.:.:..:.|.|||.:.::|.||..|.
  Fly  2914 RTFYTRKLDEITRLRDRYTTGLEKLDFAAGQVGEMQTNLYDLQPKLKVLSEETDRIMVNIERETA 2978

  Fly  3707 KANVKK-------AEASEKSVEVEIKGKQIAIEKDEAEEILAEAMPALEEARLALSQLEKAQITE 3764
            :|..||       |.|:|.:...:      || ||:.|..||||:||:|.|..||:.|:.|.|..
  Fly  2979 EAEKKKEVVGADEAAANEAAAAAQ------AI-KDDCETDLAEAIPAMEAALEALNTLKPADIFI 3036

  Fly  3765 IRSFATPPAAVQVVCECVAILKGYK------------EINWKSAKGMMSDVNFLKSLMEMDCEAL 3817
            ::|...||..|::..|.|.:::|.|            |..|..:..|:||:.||.||...|.:.:
  Fly  3037 VKSMKNPPYGVKLTMEAVCVIRGIKPDRKPDPSGHMVEDYWGPSMRMLSDMKFLDSLKTFDKDNI 3101

  Fly  3818 TQKQITQCRQHMKTGN---LEDMAKISVAGAGLLRFVRAVLGFFDVYKE----VKPKKERLDFLV 3875
            ....|.:.|:......   .|.:...|:|..|:.|:|||:    |||.:    |.|||..|....
  Fly  3102 PPPIIKRIREKYIADRDFVPEKIKAASMACEGICRWVRAM----DVYDKVARIVMPKKAALAEAE 3162

  Fly  3876 EEQEVQIKLLNHLNGEIQKLEEKLNELNENYATSMKQMRALTEMMQQAERRLIASDKLISGLTSE 3940
            .|...|::.||....|:|.:.:||.:||:.:|...::.:.|.:.:...|::|..::||:.||..|
  Fly  3163 GELSQQMEKLNAKRAELQVILDKLQKLNDFFAEKSREKKRLEDEIDNCEKKLNRAEKLLGGLGGE 3227

  Fly  3941 LIRWSKEMASLGQQLIDSVGGCLISASFLAYTGAFTWEFRKAMVFDDWLEDIASLGIPIQLPFKI 4005
            ..|||:...:|.:.:.:.||..|::....||.|.||.|:| ..:.|||........||....|.:
  Fly  3228 KTRWSEAAKNLHESISNIVGDVLLAGGCTAYLGYFTTEYR-VNILDDWNALCKRKHIPSSETFSL 3291

  Fly  4006 DGYLTTDVEISQWSNEGLPPDELSIQNGILTMRASRFPLCIDPQLQALQWIRKREFKNNLKVLSF 4070
            ...|...:.|..||..|||.|..|::|||:...:||:.|.||||:||.:||:..|..|||||:..
  Fly  3292 ATTLGHPMTIRAWSLAGLPADNFSVENGIIVTNSSRYSLLIDPQVQANKWIKNMEKNNNLKVIKQ 3356

  Fly  4071 SDSDFLKQLEMAIMYGTPVLFEDVDDYIDPVIDDILQKNIRIQGGRKFVMLGDKEVDWDPSFRVY 4135
            ||:::::.||:||.:|.|||.|:|.:.:|..:..||:||:....|..|:..||:.::::|:||:|
  Fly  3357 SDANYMQVLELAITFGQPVLIENVGEKLDSNLTPILEKNVIKHKGGLFIKSGDQMIEYNPNFRLY 3421

  Fly  4136 LTTKFSNPKFDPAVYAKALVINYTVTQTGLEDQLLSVVVGTERPDLEAQRESLIAQTSENKQLLQ 4200
            :||...||::.|.|.....|:|:.:|:.||.:|||::||..|||||:.::|.||.:::.|:..|.
  Fly  3422 ITTCLRNPRYPPEVMVMVTVLNFMITEQGLREQLLAIVVAHERPDLQEKKEQLIIESARNRDALY 3486

  Fly  4201 QLEDSLLRELSTSTGNMLDNVELIETLENTKTKAGVVMEQLKLAADTAADIEVLRNGYRPAAKRG 4265
            .:|..:|..||||.||:|::...|..|.::|..:..:.|:..:|..|..:|:..|..|.|.:|..
  Fly  3487 TIESKILEVLSTSEGNVLEDENAINILSSSKILSEDIQEKQVIAVATEIEIDAARQQYIPVSKHS 3551

  Fly  4266 AVLFFALSDMATVNSMYQYALAAYLDVFVYSLRKAVPDASLNKRLNNIIKTLTENVYCYGCTGIF 4330
            |:|||.:|::|.|:.||||:|:.:|::||.::.||.....|::||.|:....|:::|...|..:|
  Fly  3552 AILFFCISELANVDPMYQYSLSWFLNLFVNTILKAPKSDQLSERLKNLNDYFTKSIYTNVCRSLF 3616

  Fly  4331 ERHKLLFSFQIATKLAQRDGILLQSELDFFIKGSIALTKSERSNPC-KWLSEKSWEDVLKLAFDF 4394
            |:.||:.|..:...:....|.:.::.|.||:.|.|.. |:...||. .||.:|||..|.|.|   
  Fly  3617 EKDKLVISLVMCLGILVSQGRVEKAALLFFLTGGIGY-KTIPPNPLGAWLPDKSWASVCKAA--- 3677

  Fly  4395 PDIFG--TLPDHFGRYLTEWKEWFDLENPEEVPCPGDYNIKCNAFQKLMFLRCFRVDRIFRSINQ 4457
             |:.|  .||.....|..||..::|..||:::..|..:| ..|....|:.::..|.|::..::..
  Fly  3678 -DLEGLKNLPQMMETYSDEWHNFYDASNPDQLQLPAPHN-TVNDMYFLIVIKSLRPDKLVPAVRA 3740

  Fly  4458 YIVETMDEFYIMPPVVSFSAIYEQTSSTIPVCFVLSAGSDPTNDLIKLADTIVGMSNFCHISLGQ 4522
            :|...:|..::.||....:|.:..:|..||:.|:|||||||...|...|...........|||||
  Fly  3741 FITRNLDRSFVEPPPFDLAASFADSSPKIPLVFLLSAGSDPMASLFMFAKQRNMYDKLKTISLGQ 3805

  Fly  4523 GQEKAALRLLDGAIKQGMWLMLQNGHLLIRFVRELEK---HLDRIENPHPDFRLWITTDPTPTFP 4584
            ||...|.:::..|.:.|.|::|||.|:.|.::.:||:   .....:..:.|:|||.|:.|:..||
  Fly  3806 GQGPRAEKMIMEAARHGQWVVLQNCHVAISWMGDLERICNDTTLTDGANHDYRLWCTSYPSAVFP 3870

  Fly  4585 IGILQKSLKVVTEPPNGLKLNLRSTY---------FKVRQERLESCSHVAFRPLVYVLAFFHAVV 4640
            :.:||.|:|:..|||.||:.|:..::         |..........::..:...|:.|.||||||
  Fly  3871 VSVLQNSVKMTNEPPKGLRANMHRSFTSDPLMRDKFFTNAFLFSDSANKCWLRGVFALVFFHAVV 3935

  Fly  4641 QERRKYDKLGWNIAYDFNDTDFDVCTEILRTYLTRCGTGKIPWNSLKYLIGEVMYGGRVIDDFDR 4705
            ||||::..|||||.|:||::|..:....|:.::.:  :..||:....||.||..|||||.||.||
  Fly  3936 QERREFGPLGWNIPYEFNESDLKISLLQLKMFINQ--SQSIPFRGHVYLTGECNYGGRVTDDKDR 3998

  Fly  4706 RITNCYMNEYMGDFLFDEFKVFHFYEDDNV------DYCLPEEETILKEDYIAHIDKLPLVNKPD 4764
            |:....:|     .:::...:    |:||.      .|.:|...|.|..  |.::...||...|:
  Fly  3999 RLILSLLN-----MIYNPNTI----EEDNYALSQSGTYRVPLSPTRLNS--IEYVSSFPLSPHPE 4052

  Fly  4765 VFGLHPNAEIGYYTMAARNI--WNSLIE--LQPQT-------GEGTGGISRDDFIDSVAAGILKK 4818
            |:|||.||:|.      ||:  .|:||.  |..||       ...:||...|..| ::...:||:
  Fly  4053 VYGLHENADIN------RNVKETNALISGVLLTQTDLMASVKASSSGGAKEDPAI-AICKQVLKQ 4110

  Fly  4819 LPPAFETWRIRKQIQMSLSPT-GVVLLQELDRFNLLVVRIKKTLELLRKAIAGEIGMDNVLDNIA 4882
            ||..|....:.|...:..:.: ..||.|||.|||.|:..|:|:|..:.||:.|:|.|...|:...
  Fly  4111 LPEEFNIDEVSKTYPVIYTNSMNTVLRQELIRFNRLLSYIRKSLVNVGKAVVGQIAMIPELERTH 4175

  Fly  4883 NSLFNGLLPAAWSKLAPATCKQLASWLEHLRLRAVQYKYWTLSGEPLVMWLSGLHIPQSYLTALV 4947
            .|:..|.|||.|.|.:..:.|.|.|::..|..|...::.|..:|||:|.|:||.:..||::|.::
  Fly  4176 ASMVIGKLPADWLKKSYPSLKPLGSYVSDLLARLAFFQEWIDNGEPMVYWISGFYFTQSFITGVL 4240

  Fly  4948 QIACRRNAWPLDRSTLFTYVTKFADPDDVEERPVTGCLVHGLYIEGGRFDLATNQLARSHPKVLV 5012
            |...|:|.:.:|...:...||||  ...|...|..|..:.|::|||.|::..|.::..|..|||.
  Fly  4241 QNYSRKNRFQIDMILIEFAVTKF--EVQVPGTPDIGAYIRGIFIEGARWNRKTKEVDESFSKVLF 4303

  Fly  5013 EELAILAVEPIEAHRLKL-------------QNTYLAPVYTTSLRRNAM-----GVGLVFEANLA 5059
            :.|.::.:.|:    ||.             :..|..|||.||.||..:     ....|....|.
  Fly  4304 DTLPVIYLRPV----LKALEDLPRSTAGGEPETIYDCPVYKTSERRGVLSTTGHSTNFVMYLQLR 4364

  Fly  5060 TSEDLSHWILQG-VCL 5074
            .|....|||.:| .||
  Fly  4365 CSRKPMHWINRGTACL 4380

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
Dhc98DNP_524541.3 DHC_N1 523..>968 CDD:462457 92/480 (19%)
DHC_N2 1795..2196 CDD:462462 129/418 (31%)
DYN1 1999..4719 CDD:227570 956/2848 (34%)
AAA_6 2338..2664 CDD:463697 158/331 (48%)
Dynein_C 4778..5076 CDD:465677 101/328 (31%)
Dnah3NP_647937.2 DHC_N2 1083..1489 CDD:462462 128/419 (31%)
DYN1 <1322..4005 CDD:227570 938/2806 (33%)
AAA_6 1620..1946 CDD:463697 158/331 (48%)
AAA_9 3302..3523 CDD:463702 90/220 (41%)
Dynein_C 4067..4381 CDD:465677 99/321 (31%)

Return to query results.
Submit another query.