Protein Alignment Dhc98D and Dhc64C

DIOPT Version :9

• Sequence 1: NP_524541.3
• Gene: Dhc98D / 43379
• FlyBaseID: FBgn0013813
• Length: 5080
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: NP_001261432.1
• Gene: Dhc64C / 38580
• FlyBaseID: FBgn0261797
• Length: 4661
• Species: Drosophila melanogaster
• Alignment Length: 5090
• Identity: 1242/5090 - (24%)
• Similarity: 2212/5090 - (43%)
• Gaps: 865/5090 - (16%)

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  Fly  1155 VNLKRDVFDVLFEAQQF-EHLGFTLPAVLRTAIMKKDLLFKDYERMTEVVDRYRSIINNLSMSEV 1218
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  Fly   868 V---RSLETCPYSAATFVEILSKIQHAV-------DDLSLRQYSNLSVWVTR---------LDEE 913

  Fly  1219 IFLRGHIYDTELFIQMGVGRYTWTSFNIGKFCDQINSQLRKLTSIVSQINFIRLDLRSRIDMIKS 1283
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                  |:::         |....:.::....|:|:|              |.|:.    ..:..
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  Fly  1544 EKSFICQKFLEKQVTLIEIDEKFTFYSSIVETLANTRKFQDIKCVRINLEPLLASITQHAQDW-- 1606
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  Fly  1607 ------CTTLGEELLRHVNDNMRAMRNEVKTLSLNLNKTTRELEDFKLVMTTIGTVQSSTLTNEQ 1665
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  Fly  1129 EALGKFGTLLGTE-MTSFHSKVSKSRTDLEMQSIEAASTS----DAVSFITYVQSLKKDMIAWDK 1188

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  Fly  1189 QVEVFREAQRILERQRFQFP-NTWLHVDNIEGEW-----SAFN-----EIIKRKDTAIQTQVASL 1242

  Fly  1727 EIDEFCDDLA------EFIKDYDENGPGSVGAELERGVRLMDPYGQKIAERESRREELANAERLF 1785
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  Fly  1243 QAKIVAEDKAVETRTVDFLNDWEKTKPTGGKIRPDDALQQLQIFESKYSRLKEERDNVVKAKEAL 1307

  Fly  1786 DM--AMVDYHEFARVQTEFEGLQ-------QLYKLYKAQKYAREGWGKTLWADLDPNVLTEGVES 1841
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             :|..:.:..:|:.|...   .::|..|::...:...:..:.:         ..:.:|..|....
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  Fly  3137 CPLVPANPTHRDAVINSCVYVHQTLHQANARLAKRGGRTMAVTPRHYLDFIHHFVKLYNEKRSDL 3201

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            ::..|.:.:|.|....:|||.:.::...||:.|:: ....|.:|.    ..|:.||:.
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            .:....|.||..:.|.:|:...::..:.::..|..|:..|..|..||.....:...|:...:|..
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  Fly  4288 AYLDVF---VYSLRKAVPDASLNKRLNNIIKTLTENVYCYGCTGIFERHKLLFSF---QIATKLA 4346
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            ....  |.:|.:||::....|..:  ..|.:.||.:..|.|.:||...| ||..|.:.. |.:.|
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  Fly  4412 WKEWFDLENPEE-VPCPGDYNIK----CNAFQKLMFLRCFRVDRIFRSINQYIVETMDEFYIMPP 4471
            ...|....:||: ||...|.:..    .::..:|:.::.||.||:..:.:..:...:.|.: ||.
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            .   :.|:::.: |.:...|.......|.|.:..:    |.:....|  ...|::|..:. ..|.
  Fly  4027 AEQELDFTSVVDKQLNCNTPALLCSVPGFDASGRV----DDLAAEQNKQISSIAIGSAEGFNQAE 4087

  Fly  4530 RLLDGAIKQGMWLMLQNGHLLIRFVRELEKHLDRIENPHPDFRLWITTDPTPTFPIGILQKSLKV 4594
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            |.|||.|::.||..|:..|...|:........| |.::||:|||:||||.:|..|||...|:||:
  Fly  4152 VFEPPPGIRANLLRTFSTVPAARMMKTPSERAR-LYFLLAWFHAIVQERLRYVPLGWAKKYEFNE 4215

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  Fly  4277 -------KLFTARSFEADFALVANVDGASGGLRHITMPDGTR--RDHFLKWIENLTDRQTPSWLG 4332

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  Fly  4333 LPNNAEKVLLTTRGTDLVSKLLKMQQLEDDDELAYSVEDQSEQSAVGRGEDGRPSWMKTLHNSAT 4397

  Fly  4814 GILKKLPPAFETWRIRKQIQMSLSPTGVVLLQELDRFNLLVVRIKKTLELLRKAIAGEIGMDNVL 4878
            ..|:.||...:.  :::.::....|......:|:...:.|:..:...|:.:.....||....|..
  Fly  4398 AWLELLPKNLQV--LKRTVENIKDPLYRYFEREVTSGSRLLQTVILDLQDVVLICQGEKKQTNHH 4460

  Fly  4879 DNIANSLFNGLLPAAWSK-LAPATCKQLASWLEHLRLRAVQYKYWT----------LSGEPLVMW 4932
            .::.:.|..|::|..|.: ..||.| .:..|:.....|..|.:..:          |.|.|  :|
  Fly  4461 RSMLSELVRGIIPKGWKRYTVPAGC-TVIQWITDFSNRVQQLQKVSQLVSQAGAKELQGFP--VW 4522

  Fly  4933 LSGLHIPQSYLTALVQIACRRNAWPLDRSTLFTYVTKFADPDDVEE--RPVTGCLVHGLYIEGGR 4995
            |.||..|::|:||..|...:.|:|.|:...|...:|.....:|.::  ..|||..:.|...:...
  Fly  4523 LGGLLNPEAYITATRQCVAQANSWSLEELALDVTITDAGLKNDQKDCCFGVTGLKLQGAQCKNNE 4587

  Fly  4996 FDLATNQLARSHPKVLVEELAILAVEPIEAHRLKLQNTYLAPVYTTSLRRNAMGVGLVFEANLAT 5060
            ..||:. :....|..:::.:.| :.|| ...:|.|      |||..|.|..     |:|..:||.
  Fly  4588 LLLAST-IMMDLPVTILKWIKI-SSEP-RISKLTL------PVYLNSTRTE-----LLFTVDLAV 4638

  Fly  5061 S--EDLSHWILQGVCLTLNT 5078
            :  ::...:..:||.:..:|
  Fly  4639 AAGQESHSFYERGVAVLTST 4658

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
Dhc98D	NP_524541.3	DHC_N1	523..983	CDD:285571	113/539 (21%)
		DHC_N2	1798..2201	CDD:285579	113/414 (27%)
		P-loop_NTPase	2338..2565	CDD:304359	116/232 (50%)
		P-loop_NTPase	2654..2788	CDD:304359	66/136 (49%)
		P-loop_NTPase	2976..3246	CDD:304359	74/280 (26%)
		P-loop_NTPase	3378..3645	CDD:304359	90/286 (31%)
		MT	3658..3989	CDD:289543	87/345 (25%)
		AAA_9	4017..4233	CDD:289547	79/215 (37%)
		Dynein_heavy	4374..5068	CDD:281078	186/761 (24%)
Dhc64C	NP_001261432.1	DHC_N1	240..839	CDD:285571	137/678 (20%)
		DYN1	1022..4338	CDD:227570	962/3576 (27%)
		DHC_N2	1326..1724	CDD:285579	113/410 (28%)
		P-loop_NTPase	1870..2103	CDD:304359	116/232 (50%)
		P-loop_NTPase	2227..2367	CDD:304359	67/139 (48%)
		P-loop_NTPase	2572..2835	CDD:304359	73/274 (27%)
		Cas4_I-A_I-B_I-C_I-D_II-B	2834..>2943	CDD:294426	35/171 (20%)
		P-loop_NTPase	2916..3194	CDD:304359	90/277 (32%)
		MT	3208..3544	CDD:289543	88/347 (25%)
		AAA_9	3569..3784	CDD:289547	79/215 (37%)
		Dynein_heavy	3925..4636	CDD:281078	184/753 (24%)

Information from Original Tools

Tool	Simple Score	Weighted Score	Original Tool Information
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Domainoid	1	1.000	230	1.000	Domainoid score	I503
eggNOG	1	0.900	-	-		E1_COG5245
Homologene	0	0.000	Not matched by this tool.
Inparanoid	0	0.000	Not matched by this tool.
Isobase	0	0.000	Not matched by this tool.
OMA	0	0.000	Not matched by this tool.
OrthoDB	0	0.000	Not matched by this tool.
OrthoFinder	0	0.000	Not matched by this tool.
OrthoInspector	1	1.000	-	-		otm47047
orthoMCL	1	0.900	-	-		OOG6_100025
Panther	1	1.100	-	-	P	PTHR10676
Phylome	1	0.910	-	-
RoundUp	0	0.000	Not matched by this tool.
SonicParanoid	0	0.000	Not matched by this tool.
	7	6.740