DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment Dhc98D and Dnah5

DIOPT Version :9

Sequence 1:NP_524541.3 Gene:Dhc98D / 43379 FlyBaseID:FBgn0013813 Length:5080 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:XP_008759046.2 Gene:Dnah5 / 294854 RGDID:1560828 Length:4621 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:4970 Identity:1455/4970 - (29%)
Similarity:2410/4970 - (48%) Gaps:631/4970 - (12%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly   303 IQFQFREPATADSQQMDSYEGQAGGSGGGGAGGPAGETGEDISSEAKESGPGLLELSKPSEFRLR 367
            :.|.:::...|::       ||.|.|||                    ..|...::.||..|   
  Rat    80 LMFYYQDVEGAEA-------GQFGSSGG--------------------VNPASGKMKKPKVF--- 114

  Fly   368 ALKQQKKMKEKEAAAKKAKAKKTDAEPTEEEEEADAHKVEAHLSSSEEEVEIKVEKLTIGQRWEK 432
                  ..:.|:.|...|....|.|:|::              :.:.|.:..:|...|:......
  Rat   115 ------VTEGKDVALMGACVFFTRADPSK--------------AITAENIHREVSFNTLDTADGG 159

  Fly   433 MLNETK---------AKVEAEHAAEEATPPR-ITPIQRRLLKEIEEFQSEITWTINHIVWAFSLP 487
            :||..:         |...:.|...|....: .:.||:..|..:|.|...::...|      ||.
  Rat   160 LLNSVRRLLSDIFIPALRASSHGWGELEGLQDASSIQQEFLSSLEGFVGILSGAQN------SLK 218

  Fly   488 SSYILPGQEATEFEDAIIRVPVDPKRLDLVITYTQQQLEEV---VDGWIKYLKKTMKTLTDAK-- 547
            ....|...:..|.:.  ::.|:|    .|.:....:.:|:|   :..|||.:::.:......:  
  Rat   219 EKVNLQKCDIVELKS--LKEPMD----YLALASNPETVEKVECCMRVWIKQMEQILAENNQLRKE 277

  Fly   548 LDDFTPMAEHRYWHKMEVELYGTLEQLKTEFVVAVLQRLTDDKSPVLDEWQ-AVVEKTEARFKLA 611
            .||..|.||..:|.|...:....|:|||:..|.|||..|...||.:|..|: |.:..|:|..: |
  Rat   278 ADDVGPRAELEHWKKRLSKFNYLLDQLKSPDVKAVLAMLAAAKSKLLKVWRDADIRVTDAANE-A 341

  Fly   612 KENSDYLGTIIDYLEKVRSYESFKMVVLQIPNIMVGLRHIWTMSSHYCRDPEMQVLLCQISNVFV 676
            |:|..||.|:....:.:.|.:...||. .||.::..::.|:::|.:|.....:..|..:::|..:
  Rat   342 KDNVKYLYTLEKCCDPLYSSDPVTMVD-AIPTLINAIKMIYSISHYYNTSERITSLFVKVTNQMI 405

  Fly   677 QKVKSII---NFENIFKYSATYTYETATNCANLLRCWKQAYKLSRQHIEDSGAGSRWEFDRVALF 738
            ...|:.|   ....|:........:.......|.:.::..::.::|.::.:.:..:::|..:.:|
  Rat   406 SACKAHITNNGTATIWSQPQDIVMQKIAAAIKLKQGYQCCFQETKQKLKQNPSEKQFDFSEMYIF 470

  Fly   739 NEVNHIHRVAVDIAYVGRVFVQYENLFGHRLKACIAD-----PSIVDNLMRKVYRMLDDLIKSVD 798
            .:....|:....|..:...|..|..|...:::. :.|     ..:|..:.:|.|..||.  :.:|
  Rat   471 GKFETFHQRLAKIMDIFTTFKTYSVLQDSKIEG-LEDMVTKYQDVVAGIKKKEYNFLDQ--RKMD 532

  Fly   799 YDMFRPGNWENWEYSLELFNKRLDNVENEAKNVIDQSINSLLSSEKGLDLVVNAMNIDTRATLQE 863
            :|.         :|  :.|.|:.:.:.:|.:..:|.:...:.|:.:.|            :||::
  Rat   533 FDQ---------DY--DEFCKQTNELHSELQRFMDTTFEKIQSTRQAL------------STLKK 574

  Fly   864 F---------VATKHENLLRFFVTEINAVERVFTKLKKSPPMAKHQPAKISAIFWARLLGKKLKT 919
            |         :..|::.:.:.|.|:|:.:.:::||.|..||:|:.||.....|.|||.|..:|:.
  Rat   575 FERLNIPNLGIEAKYQIVFQNFGTDIDMISKLYTKQKYDPPLARDQPPIAGKILWARQLFHRLEQ 639

  Fly   920 SVLAFKR-------VEDEPAIKNSFLKRSSFKQYFELMTVMFQFEKVLFENFIQNATYLVNTTNR 977
            .:..|::       ||.:|.|::          |..:..|:.:|| ||:.               
  Rat   640 PMQLFQQHPFVLRTVEAKPVIRS----------YNRIAKVLLEFE-VLYH--------------- 678

  Fly   978 SNVLRIRICKESTMSYISEAVQTLKAKPRPELQMTSDRRVTPVKSSNLMPVQSEAFSAYSVADSA 1042
                                        |..||...:..|                         
  Rat   679 ----------------------------RAWLQQIEEIHV------------------------- 690

  Fly  1043 GTEISSESENEGLLVGDTSQKKLMCRINRLTVLVAMIMWMVSNTRKANIQLQECTAFIKMVKDKK 1107
            |.|.|       |||                                                |.
  Rat   691 GLEAS-------LLV------------------------------------------------KA 700

  Fly  1108 PKDVTAMDRHCVRTCELLQRAESQYLLPIWRELVGEKTLIEYDMDFVVNLKRDVFDVLF-EAQQF 1171
            |           .|.:|....:.|.|                              :|| |.|..
  Rat   701 P-----------GTGQLFVNFDPQIL------------------------------ILFRETQCM 724

  Fly  1172 EHLGFTLPAVLRTAIMKKDLLFKDYERMTEVVDRYRSIINNLSMSEVI--FLRGHIYDTELFIQM 1234
            ..:|..:.........|:|:..|::..|..::..|:.:  .|.|...|  .:..|:...:..:|.
  Rat   725 SQMGLPVSPFAAALFEKRDMYKKNFSDMKMMLSEYQRV--KLKMPPAIEQLMLPHLARVDEALQP 787

  Fly  1235 GVGRYTWTSFNIGKFCDQINSQLRKLTSIVSQIN-FIRLDLRSRIDMIKSFNLFNL--DDELKVE 1296
            |:...||||.|||.:.:....:::.|..::.:|| .|...:.:.::.:.|..|..|  ||.|..|
  Rat   788 GLAVLTWTSLNIGTYLENAFEKIKDLELLLDRINDLIEFRIHAILEEMSSVALCQLPQDDPLTCE 852

  Fly  1297 DTSRSSGESYLQDRK----NPSQR--FKS-----VTGETITMFSVEKDVPADEKAEQ-------- 1342
            :        :||..|    |.:|:  |||     ...|.|.|. ::.||..:|.:|:        
  Rat   853 E--------FLQMTKDLCVNGAQKLHFKSSLVEEAVNELINML-LDVDVLPEEASEKVRHENASP 908

  Fly  1343 ---ACGSGIYPCQGYFELLEASRNRKAAQMKKLYDSLGPVLVKLESLVLGTFSGRSDRMKTYYE- 1403
               ..|.|    :|..|.|.:|.|...:                 ||.|.|.:.:...|:...| 
  Rat   909 NGDTSGGG----EGCAEALASSFNAGTS-----------------SLPLTTIARKKKEMEVLEEA 952

  Fly  1404 -----YWEGETFKCIVDMTYQNLKCYINRL------------------LSNKPMFEVNAVLLMSE 1445
                 |:..:....::.:|...|:....|:                  .::.|:|..:..|.:..
  Rat   953 RELLSYFNHQNTDALLKVTRNTLEAIRRRIHFSHMINFRDSKGASKVKQNHLPIFRASVTLAIPN 1017

  Fly  1446 IVLEPSVQELQNTIVTATKDYISRLRIFTRW---------------------------------- 1476
            |.:.|:::::|.|:..|.:..||..:...:|                                  
  Rat  1018 ISMTPALEDIQQTLNKAVECIISVPKGVRQWSSELLSKRKMRERKMAAVQSNEDSDSDTEVEESE 1082

  Fly  1477 ------MTGTCIACPLVEMGKQFKYNYTYYEDVIQIRSIVDLVINIHDLASRVANEARGFVSQFR 1535
                  :....:..|:        ....||:::...:.||.||..:..:.|....|....:.:|:
  Rat  1083 LQETLELASVNLPIPV--------QTQNYYKNISDNKEIVKLVSVLSTVISSTKKEVITSMDRFK 1139

  Fly  1536 KYFNLWAFEKSFICQKFLEKQVTLIEIDEKFTFYSSIVETLANTRKFQDIKCVRINLEPLLASIT 1600
            .|.::|..||......|:.:...|.|.:.:..::.|:.:.:....::..:..:.:....|..|:|
  Rat  1140 CYNHIWQKEKEDTIMTFIAQNPLLSEFESRILYFQSLEQEINAEPEYICVGSIALYTADLKFSLT 1204

  Fly  1601 QHAQDWCTTLGEELLRHVNDNMRAMRNEVKTLSLNLNKTTRELEDFKLVMTTIGTVQSSTLTNEQ 1665
            ...:.|...||....|.....|..:...|:.....||:..::|:|.::.|..:..::...::.:.
  Rat  1205 AETKAWMMVLGRHCNRKYRSEMENIFTVVEEFQKKLNRPIKDLDDIRIAMAALKEIREQQISTDF 1269

  Fly  1666 KIHEMQETFTILSEHKIMFPYEDMLMAHHLEKRWKRLFLSALYRYEKLQPIKQKFADMTSVEIDE 1730
            ::..::|::.:|:::.::...|:|.....|...|::|...|.....:|..::..|.......::.
  Rat  1270 QVGPIEESYALLNKYGLLVAKEEMDKVDTLRYAWEKLLARASDVQNELGALQPSFRKELISTVEV 1334

  Fly  1731 FCDDLAEFIKDYDENGPGSVGAELERGVRLMDPYGQKIAERESRREELANAERLFDMAMVDYHEF 1795
            |..|..:|..|||.|||...|.:.:.....:..:..:......:.......|.||.:.:..|.:.
  Rat  1335 FLQDCQQFYLDYDLNGPMVSGLKPQEASDRLIIFQNQFDNIYRKYITYTGGEELFGLPVTQYPQL 1399

  Fly  1796 ARVQTEFEGLQQLYKLYKAQKYAREGWGKTLWADLDPNVLTEGVESYLKEF----RKFTKAVRTL 1856
            ..::.:...||::|.||.........:..|||::::    .|.:.|.|.||    ||..:|::..
  Rat  1400 LEIKKQLNLLQKIYSLYNNVIETVNSYQDTLWSEVN----IEKINSELLEFQNRCRKLPRALKDW 1460

  Fly  1857 PVGVQLEIHMKQFKGTVPLMVSLKHEALRERHWLQLMEKTGQYFDMSPARFTLENMFAMQLHKYQ 1921
            ...:.::..:..|....||:..:...|:.||||.::...||...|:....|.|.|:..:.|.||:
  Rat  1461 QAFLDMKKTIDDFSECCPLLEYMASNAMVERHWQRITTLTGHSLDVGNETFKLRNIMEVPLLKYK 1525

  Fly  1922 EIAEQILTNAIKELQIERGVQAVIETWASMAFKTFKHFKGSDDRGWVL---GPVDEIMQILEDNA 1983
            |..|.|..:|:||..||:.::.||..|.:... ||..||   .||.:|   ....|::..:||:.
  Rat  1526 EEIEDICISAVKERDIEQKLKQVINEWDNKTL-TFSSFK---TRGELLLRGDSTSEVIASMEDSL 1586

  Fly  1984 MNLQSMGASQFIGPFLETVNKWERTLALISEIIDEWLVVQRKWLYLEGIFIGGDIRTQLPEEARK 2048
            |.|.|:.::::..||...:..|.:.|:..::||:.|:.||..|:|||.:|:||||..|||:||::
  Rat  1587 MLLGSLLSNRYNMPFKAQIQNWVQCLSNSTDIIENWMTVQNLWIYLEAVFVGGDIAKQLPKEAKR 1651

  Fly  2049 FDDIDKSYRRIMVDCAKNPLVVPFCT---VPGRLVEIQGLGIGLENCQKSLNEYLDSKRRIFPRF 2110
            |.:||||:.:||....:.|.||..|.   ..|:|  :..|...||.|||||..||:.||..||||
  Rat  1652 FSNIDKSWVKIMTRAHEIPNVVQCCVGDETMGQL--LPHLLDQLEICQKSLTGYLEKKRLCFPRF 1714

  Fly  2111 YFISTDELLSILG-SSEPSAVQNHIIKMYDNIKSLRLVKEGSQTIVTGMISSEGEVMEFRHSARA 2174
            :|:|...||.||| :|:...:|.|::.::||||:::...:....|:: :.|.|||.:|......|
  Rat  1715 FFVSDPALLEILGQASDSHTIQAHLLNVFDNIKTVKFHDKIYDRILS-ISSREGETIELDKPVMA 1778

  Fly  2175 AGRVEYWMNDVLDEMRRSNRFINKTA---IYDFGTDLQISRPDWLMNYQGMVGLAASQVWWTAEV 2236
            .|.||.|:|.:|:|.:.|...:.:.|   |.:.|..|    .::|.::...|||...|:.||.:.
  Rat  1779 EGNVEVWLNSLLEESQSSLHLVIRQAAANIQESGFQL----IEFLSSFPAQVGLLGIQMLWTRDS 1839

  Fly  2237 EEAFDQAQNHGNMRAMKDFLGKNNYQIEE----LVLKVRSNLSRNDRLKFKAQCTVDVHARDIID 2297
            |||..      |.:..|..:.|.|....|    |:.....:||..:|:|::...|:.||.|||.|
  Rat  1840 EEALQ------NAKFDKKIMQKTNQSFLELLNMLIEMTTKDLSSMERVKYETLITIHVHQRDIFD 1898

  Fly  2298 NFVRDNVLDASEFSWESQLRFYWIKFYDNLHVLQCSGSFDFGYEYMGLNGRLVITPLTDRIYLTI 2362
            :....:|...::|.|..|.|||:.:..|...:.....:|.:..|::|...||||||||||.|:|:
  Rat  1899 DLCHMHVKSPTDFEWLKQCRFYFKEDSDKTMIHITDVAFTYQNEFLGCTDRLVITPLTDRCYITL 1963

  Fly  2363 TQALLMNLGGAPAGPAGTGKTETVKDLAKAMGLLCVVTNCGEGMDYRAVGTILSGLVQCGAWGCF 2427
            .|||.|::|||||||||||||||.||:.:.:|...||.||.:.||:|.:|.|..||.|.|:||||
  Rat  1964 AQALGMSMGGAPAGPAGTGKTETTKDMGRCLGKYVVVFNCSDQMDFRGLGRIFKGLAQSGSWGCF 2028

  Fly  2428 DEFNRIDISVLSVISTQLQTIRNGLIRKLDRFVF-EGVEIHLDPKCGVFVTMNPGYAGRTELPES 2491
            |||||||:.||||.:.|:..|..........|:| :|..:.::|:.|:|:|||||||||.||||:
  Rat  2029 DEFNRIDLPVLSVAAQQISIILTCKKEHKKSFIFTDGDNVTMNPEFGLFLTMNPGYAGRQELPEN 2093

  Fly  2492 VKALFRPVTCIKPDLELICLISLFSDGFLTAKVLAKKMTVLYSLAQAQLSKQCHYDWGLRSLNSV 2556
            :|..||.|..:.||.::|..:.|.|.||:...|||:|...||.|.:.|||||.|||:|||::.||
  Rat  2094 LKINFRSVAMMVPDRQIIIRVKLASCGFIDNVVLARKFFTLYQLCEEQLSKQVHYDFGLRNILSV 2158

  Fly  2557 LRMAGVMKRQSEDLPEAVVLMRVLRDMNFPKFVFEDVPLFLGLIKDLFPGIDCPRIGYPDFNAAV 2621
            ||..|..||.|....|:.::||||||||..|.:.||.||||.||:||||.|...:.|||:...|:
  Rat  2159 LRTLGAAKRASHTDTESTIVMRVLRDMNLSKLIDEDEPLFLSLIEDLFPNILLDKAGYPELETAI 2223

  Fly  2622 RHVLVNDGYILLPDQEDKVVQMYETMMTRHSTMLVGPTGGGKTVVINALVKAQTHMGLPTKCLVL 2686
            ...:...|.|..|..:.||:|::||...||..|.:||:|.|||..|:.|:||.|..|.|.:.:.:
  Rat  2224 SKQVEEAGLINHPPWKLKVIQLFETQRVRHGMMTLGPSGSGKTSCIHTLMKAMTDCGKPHREMRM 2288

  Fly  2687 NPKACSVIELYGFLDMETRDWIDGLFSNIFREMNKPIEREERRYACFDGDVDALWIENMNSVMDD 2751
            ||||.:..:::|.||:.|.||.||:||.::|:..| .::.|..:...||.|||:||||:|||:||
  Rat  2289 NPKAITAPQMFGRLDVATNDWTDGIFSTLWRKTLK-AKKGEHIWIVLDGPVDAIWIENLNSVLDD 2352

  Fly  2752 NKLLTLANGERIRLENYCALLFEVGNLNYASPATVSRAGMVYVDPKNLRYSPFWQRWVLTRPEPQ 2816
            ||.||||||:||.:...|.::||..|::.||||||||.|||::....|.:||..:.::..|...:
  Rat  2353 NKTLTLANGDRIPMAPNCKIVFEPHNIDNASPATVSRNGMVFMSSSVLDWSPILEGFLKRRSPQE 2417

  Fly  2817 RELLNDFFEKIITQSIAFILEGLDGTTQGNPLKLVIMQTDLNMVTQFCNLYDALLPNYVMDSKNY 2881
            .|:|...:.:.......|.::.|:       .|:.|::.  .::||..::...|:|.        
  Rat  2418 AEILRQLYAETFPDLYRFSIQNLE-------FKMEILEA--FVITQSTHMLQGLIPT-------- 2465

  Fly  2882 DEPVQQNYNTDSLECCFLQAVYGSMGACLVEKHQPVFDEYMKRISG----FPLVQDTPENPASGG 2942
             :....:.:.:.|...|:.|:..|:||.|..:.:...:.:::...|    .|.:.|..:      
  Rat  2466 -KEQAGDVDPEHLGRLFVFAMMWSVGAVLELEGRRRMELWLRSREGPTLHLPQLTDPGD------ 2523

  Fly  2943 QFPQSKPTLYDYFWDVKDNVWKAWEWVVQPYTHDPQV--KFSEILVPTVDNTRTNRTLSLMSEIK 3005
                   |::||: ...|..|:.|...:..|.:.|..  ::..||||.|||.||:..:..:::..
  Rat  2524 -------TMFDYY-VAPDGTWRHWSMCIPEYVYPPDTTPEYGSILVPNVDNVRTDFLIKTIAKQG 2580

  Fly  3006 RPVLLVGEAGTSKTATIMQYLRNLNPSVNVILNINFSSRTSSLDVQHTLEAAVEKRTKDTYGPPM 3070
            :.|||:||.||:||..|..::...:|..:.:.|:||||.|:.|..|.|:|:.|:||...|||||.
  Rat  2581 KAVLLIGEQGTAKTVIIKGFMSKFDPESHTVKNLNFSSATTPLMFQRTIESYVDKRMGTTYGPPA 2645

  Fly  3071 GKRIACFIDDMNMPQVDDYGTQQPIALLKLFFERGGMYDRDKDLNWKKFKDLTFYAAMGTAGGGR 3135
            ||::|.||||:|||.::::|.|....:::...|:.|.|:.:|...:....|:.|.|||...||||
  Rat  2646 GKKMAVFIDDLNMPVINEWGDQVTNEIVRQLMEQNGFYNLEKPGEFTSIVDIQFLAAMIHPGGGR 2710

  Fly  3136 NEVDPRFISMFSTYNIIFPNDESLIQIYSSIFKGHMVFVK-FQPEYMLIADMIVHMTLKLFKMVI 3199
            |::..|....||.:|...|:|.|:.:|:..|.:|:....: |..|.......:|.:|.:|::|..
  Rat  2711 NDIPQRLKRQFSIFNCTLPSDASMDKIFGVIGEGYYCAQRGFSKEVQDAVIKLVPLTRRLWQMTK 2775

  Fly  3200 VDLPPTPSKFHYIFNLKDLSRIFAGMLLIEPTCFKGLRDLIRVWRNEYTRIICDRLITDNDIANV 3264
            :.:.|||:||||:|||:|||||:.|||.|.....|...:|:|:|::|..|:|.||....:|:.  
  Rat  2776 LKMLPTPAKFHYVFNLRDLSRIWQGMLNITSEVIKDTDELLRLWKHECKRVIADRFSMSSDVT-- 2838

  Fly  3265 RRNLAVEVAERFPPTFEEEHGFIDAAAAEAEAQARLLYEPSKADIDGGEEEGEEEEEGEE-APQV 3328
                                 :.|.|....                      .|||.||| .|.|
  Rat  2839 ---------------------WFDKAVVSL----------------------VEEEFGEEKTPVV 2860

  Fly  3329 ILSLKDY---VLRD-PLLFGDFRNFTNESEPRLYEDLLDYNSVYFLFTEILEEYCE--RKQKMTL 3387
            ...:..|   .||| |...|:....|:...|:|||.:...|.:....:..|:.|.|  |...|.:
  Rat  2861 DCGVDAYFVDFLRDAPEATGETPEETDAEMPKLYEPIASLNHLQERLSVFLQLYNESIRGTGMDM 2925

  Fly  3388 VLFEDCLEHLTRVHRTLRMNRGHVLLIGVGGSGKKCITRLAAFAAECDVFEITISRGYNEAAFRE 3452
            |.|.|.:.||.::.|.:|..||:.||:|||||||:.:||||:|.|....|:||::|.||.:...|
  Rat  2926 VFFRDAMVHLVKISRVIRTPRGNALLVGVGGSGKQSLTRLASFIAGYTSFQITLTRSYNTSNLME 2990

  Fly  3453 DLKVLYTIAGVKRKKVVFLFTGAQVAEEGFLELINNILTVGQVPALFPDEDKDGIVNQVRKFAEE 3517
            ||||||..||.:.|.:.|:||..::.||.|||.:||:|:.|:|..||..::.|.|.:.:....::
  Rat  2991 DLKVLYRTAGQQGKGITFIFTDNEIKEESFLEYMNNVLSSGEVSNLFARDEIDEINSDLTSIMKK 3055

  Fly  3518 DGVS--ASKDAVWGYFLRTCAENLHVVLCMSPAGDALRNRCRNFPGLIGSTYIDWVFPWPRQALY 3580
            :...  .:.|.::.||:.....|||:|||.||.|:..|||...||.||....|||...||:.||.
  Rat  3056 EHPKRPPTNDNLYEYFMSRVRGNLHIVLCFSPVGEKFRNRALKFPALISGCTIDWFSRWPKDALV 3120

  Fly  3581 AVAKLFLTEHRL-IPASHREAIVEHVVHVHTSIQQYSKDYLAKLRRNNFVTPKHYLDYINTYRGL 3644
            ||::.||:.:.: ..|..::.:|:.:......:.:...||..:.||:..||||.||.:|..|:.:
  Rat  3121 AVSEHFLSSYNIDCTAEIKKELVQCMGSFQDGVAEKCADYFQRFRRSTHVTPKSYLSFIQGYKFI 3185

  Fly  3645 LEEKAKFITQQRSRLGEGIKKIEEASVQIDELRIIVTEQKKNVAVASEECEAMLVTIESSTQKAN 3709
            .|||...:....:|:..|::|::|||..:..|...:..::|.:.||:|:.:.:|..:....|.|.
  Rat  3186 YEEKHVEVQSLANRMNTGLEKLKEASESVAALSQELAVKEKELQVANEKADMVLKEVTMKAQAAE 3250

  Fly  3710 VKKAEASEKSVEVEIKGKQI--AIEKDE--AEEILAEAMPALEEARLALSQLEKAQITEIRSFAT 3770
            ..|||..    :|:.|.:.|  :|.||:  |||.|..|.||||||..||..::.:.|..:|:...
  Rat  3251 KVKAEVQ----KVKDKAQAIVDSISKDKAIAEEKLEAAKPALEEAEAALQTIKPSDIATVRTLGR 3311

  Fly  3771 PPAAVQVVCECVAILKGYKEIN--------------WKSAKGMMSDVNFLKSLMEMDCEALTQKQ 3821
            ||..:..:.:||.:| .::.:|              |:.:..:|:..|||::|.:...:.:.::.
  Rat  3312 PPHLIMRIMDCVLLL-FHRRVNAVKIDLDKSCTVPSWQESLKLMTAGNFLQNLQQFPKDTINEEV 3375

  Fly  3822 ITQCRQH--MKTGNLEDMAKISVAGAGLLRFVRAVLGFFDVYKEVKPKKERLDFLVEEQEVQIKL 3884
            |.....:  |...|:|...::....|||..:.:|:..||.:.|||.|.|..|  :|:|....:.:
  Rat  3376 IEFLSPYFEMSDYNIETAKRVCGNVAGLCSWTKAMASFFSINKEVLPLKANL--IVQENRHALAM 3438

  Fly  3885 --LNHLNGEIQKLEEKLNELNENYATSMKQMRALTEMMQQAERRLIASDKLISGLTSELIRWSKE 3947
              |.....|:...:.:|:.:...|..:|.:.:.|.|...:...::..:..|||||..|..||:::
  Rat  3439 QDLQKAQAELDDKQAELDVVQAEYEQAMTEKQTLLEDADRCRHKMQTASTLISGLAGEKERWTEQ 3503

  Fly  3948 MASLGQQLIDSVGGCLISASFLAYTGAFTWEFRKAMVFDDWLEDIASLGIPIQLPFKIDGYLTTD 4012
            ......|:...||..|::.:||:|:|.|..|||. ::.:||.:::.:..||......::..|...
  Rat  3504 SKEFAAQIKRLVGDVLLATAFLSYSGPFNQEFRD-LLLNDWKKEMKARKIPFGNDLNLNEMLIDA 3567

  Fly  4013 VEISQWSNEGLPPDELSIQNGILTMRASRFPLCIDPQLQALQWIRKREFKNNLKVLSFSDSDFLK 4077
            ..||:|:.:|||.|:|||||||:..:|||.||.||||.|...|||.:|.:|.|::.|.:...|..
  Rat  3568 PTISEWNLQGLPNDDLSIQNGIIVTKASRSPLLIDPQTQGKIWIRNKESQNELQITSLNHKYFRN 3632

  Fly  4078 QLEMAIMYGTPVLFEDVDDYIDPVIDDILQKNIRIQGGRKF-VMLGDKEVDWDPSFRVYLTTKFS 4141
            .||.::..|.|:|.|||.:.:||.:|::|:||. |:.|..| |.:||||||....|::|:|||..
  Rat  3633 HLEDSLSLGRPLLIEDVGEELDPALDNVLEKNF-IKTGSTFKVKVGDKEVDVMDGFKLYITTKLP 3696

  Fly  4142 NPKFDPAVYAKALVINYTVTQTGLEDQLLSVVVGTERPDLEAQRESLIAQTSENKQLLQQLEDSL 4206
            ||.:.|.:.|:..:|::|||..|||||||..|:.||:.:||.:|..|:.:.:.||:..::|||:|
  Rat  3697 NPAYTPEISARTAIIDFTVTVKGLEDQLLGRVILTEKQELEKERTHLLEEVTANKRRTKELEDNL 3761

  Fly  4207 LRELSTSTGNMLDNVELIETLENTKTKAGVVMEQLKLAADTAADIEVLRNGYRPAAKRGAVLFFA 4271
            |..|:::.|:::::..||..|.|||..|..|.::|:::.:|...|...|..|||.|.||::|:|.
  Rat  3762 LYRLTSTQGSLVEDESLIVVLSNTKKTAEEVTQKLEISGETEIQINSAREEYRPVATRGSILYFL 3826

  Fly  4272 LSDMATVNSMYQYALAAYLDVFVYSLRKAVPDASLNKRLNNIIKTLTENVYCYGCTGIFERHKLL 4336
            :::|..||.|||.:|..:|.:|..||.::|.....:||:.|||:.:|..|:.|...|::|.||.|
  Rat  3827 ITEMRLVNEMYQTSLRQFLGLFDLSLARSVKSPITSKRIGNIIEHMTYEVFKYAVQGLYEEHKFL 3891

  Fly  4337 FSFQIATKLAQRDGILLQSELDFFIKGSIAL-TKSERSNPCKWLSEKSWEDVLKLA--FDFPDIF 4398
            |:..:..|:..:..::...|....|||..:| .|:....|.||:.:.:|.::::|:  ..|.||.
  Rat  3892 FTLLLTLKIDIQRNLVKHEEFLTLIKGGASLDLKACPHKPSKWILDMTWLNLVELSKLKQFSDIL 3956

  Fly  4399 GTLPDHFGRYLTEWKEWFDLENPEEVPCPGDYNIKCNAFQKLMFLRCFRVDRIFRSINQYIVETM 4463
                |...|....|:.|||.|||||.|.|..|:...:.|::|:.:|.:..||......:||:::|
  Rat  3957 ----DQISRNEKLWRIWFDKENPEEEPLPNAYDKSLDCFRRLLLIRSWCPDRTIAQARKYIMDSM 4017

  Fly  4464 DEFYIMPPVVSFSAIYEQTSSTIPVCFVLSAGSDPTNDLIKLADTIVGMSNFCHISLGQGQEKAA 4528
            .|.|....::.....:|::....|:..:||.|||||:.:|.|...:...:.:  :|:|||||..|
  Rat  4018 GENYAEGVILDLEKTWEESDPRTPLICLLSMGSDPTDSIIALGKRLKIETRY--VSMGQGQEVHA 4080

  Fly  4529 LRLLDGAIKQGMWLMLQNGHLLIRFVRELEKHLDRIENPHPDFRLWITTDPTPTFPIGILQKSLK 4593
            .:||...:..|.|::|||.||.:.|:.||...:...|..|..|||||||:....|||.:||.|:|
  Rat  4081 RKLLHQTMANGGWVLLQNCHLGLDFLDELMDVVTETETVHDTFRLWITTEVHKQFPITLLQMSIK 4145

  Fly  4594 VVTEPPNGLKLNLRSTYFKVRQERLESCSHVAFRPLVYVLAFFHAVVQERRKYDKLGWNIAYDFN 4658
            ...|||.||:..||.||..|.|:.|:......::|::|.:||.|:.||||||:..|||||.|:||
  Rat  4146 FANEPPQGLRAGLRRTYGGVSQDLLDVSVGAQWKPMLYAVAFLHSTVQERRKFGPLGWNIPYEFN 4210

  Fly  4659 DTDFDVCTEILRTYLTRCGTGK-IPWNSLKYLIGEVMYGGRVIDDFDRRITNCYMNEYMGDFLFD 4722
            ..||:...:.::.:|......| :.|.:::|:|||:.|||||.||:|:|:.|.:...:..:.:|.
  Rat  4211 QADFNATVQFIQNHLDDMDIKKGVSWTTVRYMIGEIQYGGRVTDDYDKRLLNTFAKVWFSENMFG 4275

  Fly  4723 EFKVFHFYEDDNVDYCLPEEETILKEDYIAHIDKLPLVNKPDVFGLHPNAEIGYYTMAARNIWNS 4787
              ..|.||:..|:..|    .|:  :.|:.:|..||..:.|:||||||||:|.|.:..|:::.::
  Rat  4276 --PDFTFYQGYNIPKC----STV--DGYLQYIQSLPAYDSPEVFGLHPNADITYQSKLAKDVLDT 4332

  Fly  4788 LIELQPQTGEGTGGISRDDFIDSVAAGILKKLPPAFETWRIRKQIQM--SLSPTGVVLLQELDRF 4850
            ::.:||:...|.|..:|:..:..:|..:|:|||..:..:.:::::|.  ...|..:.|.||:||.
  Rat  4333 ILGIQPKDSSGGGDETREAVVARLADDMLEKLPEDYSPFEVKERLQKMGPFQPMNIFLRQEIDRM 4397

  Fly  4851 NLLVVRIKKTLELLRKAIAGEIGMDNVLDNIANSLFNGLLPAAWSKLAPATCKQLASWLEHLRLR 4915
            ..::..::.||..|:.|:.|.|.|.:.|.:..:.:|:..:||.|.| |......|..|...|..|
  Rat  4398 QRVLSLVRSTLTELKLAVDGTIIMSDNLRDALDCMFDARIPARWKK-ASWVSSTLGFWFTELLER 4461

  Fly  4916 AVQYKYWTLSGEPLVMWLSGLHIPQSYLTALVQIACRRN-AWPLDRSTLFTYVTKFADPDDVEER 4979
            ..|:..|..:|.|...|::|...||.:|||:.|...|.| .|.||...|...||||. .||:...
  Rat  4462 NCQFTSWVSNGRPHCFWMTGFFNPQGFLTAMRQEITRANKGWALDNMVLCNEVTKFM-KDDISAP 4525

  Fly  4980 PVTGCLVHGLYIEGGRFDLATNQLARSHPKVLVEELAILAVEPIEAHRLKLQNTYLAPVYTTSLR 5044
            |..|..|:|||:||..:|....:|..|.||||.|.:.::.:. .|.:..:....|..|:|...:|
  Rat  4526 PTEGVYVYGLYLEGAGWDKRNMKLIESKPKVLFELMPVIRIF-AENNTARDPRLYCCPIYKKPVR 4589

  Fly  5045 RNAMGVGLVFEANLATSEDLSHWILQGVCL 5074
            .:   :..:...:|.|::...||||:||.|
  Rat  4590 TD---LNYIAAVDLKTAQAPEHWILRGVAL 4616

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
Dhc98DNP_524541.3 DHC_N1 523..983 CDD:285571 103/489 (21%)
DHC_N2 1798..2201 CDD:285579 139/416 (33%)
P-loop_NTPase 2338..2565 CDD:304359 119/227 (52%)
P-loop_NTPase 2654..2788 CDD:304359 65/133 (49%)
P-loop_NTPase 2976..3246 CDD:304359 104/272 (38%)
P-loop_NTPase 3378..3645 CDD:304359 105/271 (39%)
MT 3658..3989 CDD:289543 96/352 (27%)
AAA_9 4017..4233 CDD:289547 96/216 (44%)
Dynein_heavy 4374..5068 CDD:281078 234/699 (33%)
Dnah5XP_008759046.2 DHC_N1 250..802 CDD:400611 142/756 (19%)
DHC_N2 1399..1804 CDD:400618 138/415 (33%)
DYN1 <1640..4282 CDD:227570 982/2749 (36%)
AAA_6 1939..2266 CDD:403853 164/326 (50%)
Dynein_C 4326..4618 CDD:408026 90/297 (30%)


Information from Original Tools:


Tool Simple Score Weighted Score Original Tool Information
BLAST Result Score Score Type Cluster ID
Compara 00.000 Not matched by this tool.
Domainoid 00.000 Not matched by this tool.
eggNOG 00.000 Not matched by this tool.
Hieranoid 00.000 Not matched by this tool.
Homologene 00.000 Not matched by this tool.
Inparanoid 00.000 Not matched by this tool.
OMA 00.000 Not matched by this tool.
OrthoDB 1 1.010 - - D11510at33208
OrthoFinder 00.000 Not matched by this tool.
OrthoInspector 00.000 Not matched by this tool.
orthoMCL 1 0.900 - - OOG6_100025
Panther 00.000 Not matched by this tool.
Phylome 1 0.910 - -
SonicParanoid 00.000 Not matched by this tool.
SwiftOrtho 1 1.000 - -
TreeFam 00.000 Not matched by this tool.
43.820

Return to query results.
Submit another query.