DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment Dhc98D and Dnah17

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_524541.3 Gene:Dhc98D / 43379 FlyBaseID:FBgn0013813 Length:5080 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:XP_038943440.1 Gene:Dnah17 / 287845 RGDID:1563805 Length:4459 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:4782 Identity:1415/4782 - (29%)
Similarity:2321/4782 - (48%) Gaps:610/4782 - (12%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly   453 PRITPIQRRLLKEIEEFQSEITWTINHIVWAFSLPSSYILPGQEATEFEDAII----RVPVDPKR 513
            ||:  :...::|::...::|:      .|....:....:||..|.....|..:    |:   |..
  Rat   128 PRV--VSEDIVKQVHRLKNEM------FVMGGKIKGKTLLPIPEHLGSLDGTLESMERI---PSS 181

  Fly   514 LDLVITYTQQQLEEVVDGWIKYLKKTM-KTLTDAKLDDFTPM--AEHRYWHKMEVELYGTLEQL- 574
            ||..:.::   :|.::..|...::..: |....|.||...|:  .|..:|....:.|....||| 
  Rat   182 LDNSLLHS---IETIIIDWSHQIRDVLSKDSAQALLDGLHPLPRVEFEFWDARLMNLQCIHEQLN 243

  Fly   575 --KTEFVVAVLQRLTDDKSPVLDEWQAVVEKTEARFKLAKENSDYLGTIIDYLEKVRSYESFKMV 637
              |...:|.:|::......|.|   |.|........|.|.:...||..:...||::...: |.::
  Rat   244 RPKVNKIVEILEKAKSCYWPAL---QNVYMNVTQGLKEANDIVLYLKPLRILLEEMEQAD-FTVL 304

  Fly   638 VLQIPNIMVGLRHIWTMSSHYCRDPEMQVLLCQISNVFVQKVKSIINFENIFK------------ 690
            ...|..::..:..||..|.||.....:.|:|.:.||..::..::.::.|.:.|            
  Rat   305 PSFIVKVLSTICFIWATSEHYNTPSRVIVILREFSNQIIEMTRTYLSPEEVLKGLQGEIEEVLGG 369

  Fly   691 --------YSATYTYETATNCANLLRCWKQAYKLSRQHIEDSGAGSRWEFDRVALFNEVN-HIHR 746
                    ....:.|:..  |||:...:|....:.            |||.....|:.:| ..||
  Rat   370 ISQSVGVLKELFHAYDFC--CANMKLFFKDRPPVP------------WEFPSSLAFSRMNAFFHR 420

  Fly   747 VAV--DIAYVGRVFVQYE--NLFGHRLKACIADPSIVDNLMRKVYRMLDDLIK---SVDYDMFRP 804
            |..  |:......|::.|  .|.|.|       .:|:.||:.::|..:.:|:|   ...||...|
  Rat   421 VQTIEDLYKTAIEFLKLEKIELGGVR-------GNILGNLVTQIYDEVFELVKVFAECKYDPLDP 478

  Fly   805 GNWENWEYSLELFNKRLDNVENEAKNVIDQSINSLLSSEKGLDLVVNAMNIDTRATLQEFVATKH 869
            |: .:::.....|..::.:::.....:..|:.:.....|....|:.....:..|..:...|..::
  Rat   479 GD-SSFDDDYNDFETKIQDLDRRLATIFCQAFDDCNCIESSAKLLYMCGGLLERPLILVEVVPRY 542

  Fly   870 ENLLRFFVTEINAVERVF-TKLKKS-----PPMAKHQPAKISAIFWARLLGKKLKTSVLAFKRVE 928
            ..:|..|.||::..:.:: .::..|     ||:.|:.|.....:.|:..|.::|:.|:...|.: 
  Rat   543 SVMLEMFNTELDNAKLMYDAQMAASEDGQIPPIHKNMPPVAGQLKWSLELQERLEVSMKYLKHI- 606

  Fly   929 DEPAIKNSFLKRSSFKQYFELMTVMFQFEKVLFENFIQNATYLVNTTNRSNVLRIRICKESTMSY 993
            |.| :.:|...:..:.:|.|::.::..:.:..::.:::.    |:.....|:             
  Rat   607 DHP-VMSSVEAKLVYDKYDEMIGLLKGYREKKYQQWVEG----VDQDCHFNL------------- 653

  Fly   994 ISEAVQTLKAKPRPELQMTSDRRVTPVKSSNLMPVQSEAFSAYSVADSAGTEISSESENEGLLVG 1058
                     .:|.                     :|.:.||:                       
  Rat   654 ---------GQPL---------------------IQRDPFSS----------------------- 665

  Fly  1059 DTSQKKLMCRINRLTVLVAMIMWMVSNTRKANIQLQECTAFIKMVKDKKPKDVTAMDRHCVRTCE 1123
                   :.::|....|||:              |:|    :|.:..::.|::.:...      :
  Rat   666 -------LIQVNFSKALVAV--------------LRE----VKYLNFQQQKEIPSSAE------K 699

  Fly  1124 LLQRAESQYLLPIWRELVGEKTLIEYDMDFVVNLKRDVFDVLFE--AQQFEHLGFTLPAVLRTAI 1186
            |....|      |:|:.||...||   :.:...:|..|.:|.|.  ..:.|.:...|.:...|  
  Rat   700 LFSENE------IFRKFVGNLELI---VGWYNEIKTTVMEVEFPLIKSELEEIDVKLMSAETT-- 753

  Fly  1187 MKKDLLFKDYERMTEVVDRYRSIINNLSMSEVIFLRGHIYDTELFIQMGV--GRYTWTSFNIGKF 1249
                 ||.:.|.:.|.:...|.|::|        |:..|..|:..|: |:  ....|::..:.:.
  Rat   754 -----LFWNGENVMEYIQEMREILHN--------LQNRIQKTKQNIE-GITQAMQEWSANPLFER 804

  Fly  1250 CDQINSQLRKLTSIVSQINFIRLDLRSRIDMIKSFNLFNLDDELKVEDTSRSSGESYLQDRKNPS 1314
            .|.....|..|...|:.:|       .|...:|...:                            
  Rat   805 KDNKKEALLDLDGRVANLN-------KRYAAVKDAGV---------------------------- 834

  Fly  1315 QRFKSVTGETITMFSVEKDVPADEKAEQACGSGIYPCQGYFELLEASRNRKAAQMKKLYDSLGPV 1379
             |.:::..|...:|.      ||..::        |.:.|...::|                   
  Rat   835 -RIQAMVTENAELFK------ADTTSQ--------PWKDYVNYIDA------------------- 865

  Fly  1380 LVKLESLVLGTFSGRSDRMKTYYEYWEGETFKCIVDMTYQNLKCYINRLLSN-------KPMFEV 1437
                  :||..|    ||.                      ::..:|.|:.|       .|:||:
  Rat   866 ------MVLDEF----DRF----------------------IRKSLNYLMDNMTMDENIAPLFEI 898

  Fly  1438 NAVLLMSEIVLEPSVQ-----ELQNTIVTATKDYISRLRIFTRWMTGTCIACPLVEMGKQFKYNY 1497
            ...|....:...|:::     ...:.|.....|..:..|:..|...|..          .:|.:.
  Rat   899 RMELDEDGLTFNPTLEMGDEDSFLSLIEGLINDLYNVARLIPRLAKGRI----------NYKSDL 953

  Fly  1498 TYYEDVIQIR-SIVDLVINIHDLASRVANEARGFVSQFRKYFNLWAFEKSFICQKFL-------- 1553
            ....|:|::| .:..|||.    |.:||.|   :...|.:|..||..:.....:.||        
  Rat   954 EDITDLIEMREELSSLVIG----AMKVAEE---YQDSFERYSYLWVDDLQEFMKNFLIFGHAPTP 1011

  Fly  1554 ------------EKQVTLIEIDEKFTFYSSIVETLA---NTRKFQD-IKCVRINLEPLLASITQH 1602
                        :.|.||.:..::...|..:.|.::   ||:.|.. ::|   :..|...::...
  Rat  1012 EELDTKIDDTIPKTQPTLAQFQQQIDSYEKLYEEVSRCENTKVFHGWLQC---DCRPFKQALLNT 1073

  Fly  1603 AQDWCTTLGEELLRHVNDNMRAMRNEVKTLSLNLNKTTRELEDFKLVMTTIG---TVQSSTLTNE 1664
            .:.|.......|..||.:::..:.:.:......|.|..:| .|:..::..:|   .|:...:..:
  Rat  1074 IKRWSLLFKRYLSDHVINSLADLESFMGVTRTGLKKPLKE-GDYDGLVEVMGHLMKVKERQVATD 1137

  Fly  1665 QKIHEMQETFTILSEHKIMFPYEDMLMAHHLEKRWKRLFLSALYRYEKLQPIKQKFADMTSVEID 1729
            .....:::|..:|..:....|.|..|....|.::|......|:...:.:.|::....::...:..
  Rat  1138 SMFEPLKQTIELLKSYGEEMPEETYLKLQELPEQWTNTKKLAIQVKQNVAPLQANEVNILRRKCQ 1202

  Fly  1730 EFCDDLAEFIKDYDENGPGSVGAELERGVRLMDPY------GQKIAERESRREELANAERLFDMA 1788
            :|.....||.:.:..:.|.:....        |||      .:.|:..|...|.|..:..||::.
  Rat  1203 QFELKQHEFREKFRRDAPFTFSDP--------DPYKSLNKQQKSISAMEGVMEALCKSGSLFEVT 1259

  Fly  1789 MVDYHEFARVQTEFEGLQQLYKLYKAQKYAREGWGKTLWADLDPNVLTEGVESYLKEFRKFTKAV 1853
            :.||.:......|...|::|:.:......:.:.|..|.|.|::...:....:.:.|:.|...|.:
  Rat  1260 VPDYKQLKACHKEVRLLKELWDMIVMVNTSIDDWKTTKWKDINVEQMDIDCKKFAKDVRSLDKEM 1324

  Fly  1854 RTLPVGVQLEIHMKQFKGTVPLMVSLKHEALRERHWLQLMEKTGQYFDMSPARFTLENMFAMQLH 1918
            :.....|.|:..:|....::..:..|::.|:|||||.|||:.|...|:|| ...||.::..:.||
  Rat  1325 KAWDAFVGLDNTVKNMITSLRAVSELQNPAIRERHWQQLMQATQVKFEMS-EETTLADLLQLNLH 1388

  Fly  1919 KYQEIAEQILTNAIKELQIERGVQAVIETWASMAFKTFKHFKGSDDRGWVLGPVDEIM-QILEDN 1982
            ||::....|:..|:||..:|:.::.:..||::|.|:...|.:    .|.:|...||:: :.||||
  Rat  1389 KYEDEVRNIVDKAVKESGMEKVLKTLDSTWSTMEFEHELHPR----TGTMLLKSDELLVETLEDN 1449

  Fly  1983 AMNLQSMGASQFIGPFLETVNKWERTLALISEIIDEWLVVQRKWLYLEGIFIGG-DIRTQLPEEA 2046
            .:.||::..|:::..||:.|..|::.|:....:|..|..|||.|.:||.||||. |||.||||::
  Rat  1450 QVQLQNLMMSKYLSHFLKEVTSWQQKLSTADSVISIWFEVQRTWSHLESIFIGSEDIRAQLPEDS 1514

  Fly  2047 RKFDDIDKSYRRIMVDCAKNPLVVPFCTVPGRLVEIQGLGIGLENCQKSLNEYLDSKRRIFPRFY 2111
            |:||.||:.::.:|.|..|.|.||.....||...:::.|...|..|:|:|.|||::||..|||||
  Rat  1515 RRFDSIDQEFKALMEDAVKTPNVVEATNKPGLYDKLERLKKSLAVCEKALAEYLETKRLAFPRFY 1579

  Fly  2112 FISTDELLSILGS-SEPSAVQNHIIKMYDNIKSL--RLVKEGSQTIV-TGMISSEGEVMEFRHSA 2172
            |:|:.:||.||.: ::|..|..|:.|::|::..|  ||...|:...| .||.|.|.|.|:|....
  Rat  1580 FVSSADLLDILSNGNDPVEVSRHLSKLFDSLCKLKFRLDASGNPIKVGLGMYSKEDEYMDFDKEC 1644

  Fly  2173 RAAGRVEYWMNDVLDEMRRSNRFINKTAIYDFGTDLQISRPDWLMNYQGMVGLAASQVWWTAEVE 2237
            ..:|:||.|:|.|||.|..:.|.....|:..:.   :..|..|:.:|...|.|..:|:|||.||.
  Rat  1645 DLSGQVEVWLNRVLDRMCATLRHEIPEAVVTYE---EKPREQWIFDYPAQVALTCTQIWWTTEVG 1706

  Fly  2238 EAFDQAQNHGNMRAMKDFLGKNNYQIEELVLKVRSNLSRNDRLKFKAQCTVDVHARDIIDNFVRD 2302
            .||.:.: .|...|:||:..|...|:..|:..:..|||..||:|....||:||||||::...:..
  Rat  1707 LAFARLE-EGYENAIKDYNKKQISQLNALITLLIGNLSAGDRMKIMTICTIDVHARDVVAKMITA 1770

  Fly  2303 NVLDASEFSWESQLRFYWIKFYDNLHVLQCSGSFDFGYEYMGLNGRLVITPLTDRIYLTITQALL 2367
            .|..:..|:|:||||..|.:...:.....|.....:.|||:|...||||||||||.|:|:||:|.
  Rat  1771 KVESSQAFTWQSQLRHRWDEEKKHCFANICDAQIQYSYEYLGNTPRLVITPLTDRCYITLTQSLH 1835

  Fly  2368 MNLGGAPAGPAGTGKTETVKDLAKAMGLLCVVTNCGEGMDYRAVGTILSGLVQCGAWGCFDEFNR 2432
            :.:|||||||||||||||.|||.:|:|.:..|.||.|.|||::.|.|..||.|.|||||||||||
  Rat  1836 LIMGGAPAGPAGTGKTETTKDLGRALGTMVYVFNCSEQMDYKSCGNIYKGLAQTGAWGCFDEFNR 1900

  Fly  2433 IDISVLSVISTQLQTIRNGLIRKLDRFVFEGVEIHLDPKCGVFVTMNPGYAGRTELPESVKALFR 2497
            |.:.|||||:.|::.:::.:..|..:|.|.|..|.|.|..|:|:||||||||||||||::|||||
  Rat  1901 ISVEVLSVIAVQVKCVQDAIRAKKKKFNFLGEMISLIPTVGIFITMNPGYAGRTELPENLKALFR 1965

  Fly  2498 PVTCIKPDLELICLISLFSDGFLTAKVLAKKMTVLYSLAQAQLSKQCHYDWGLRSLNSVLRMAGV 2562
            |...:.||.||||.|.|.::|||.|::||:|...||:|.:..||||.|||||||::.|||.:||.
  Rat  1966 PCAMVVPDFELICEIMLVAEGFLEARLLARKFITLYTLCKELLSKQDHYDWGLRAIKSVLVVAGS 2030

  Fly  2563 MKRQSEDLPEAVVLMRVLRDMNFPKFVFEDVPLFLGLIKDLFPGIDCPRIGYPDFNAAVRHVLV- 2626
            :||......|..||||.|||.|.||.|.:|:|:|:|||.||||.:|.||....:|...::..:| 
  Rat  2031 LKRGDPTRAEDQVLMRALRDFNIPKIVTDDLPVFMGLIGDLFPALDVPRKRDLNFEKIIKQSIVE 2095

  Fly  2627 -----NDGYILLPDQEDKVVQMYETMMTRHSTMLVGPTGGGKTVVINALVKAQTHMGLPTKCLVL 2686
                 .|.::|      ||||:.|.:..|||..::|..|.||:.|:.:|.|...:|......:.|
  Rat  2096 LKLQAEDSFVL------KVVQLEELLQVRHSVFVIGNAGSGKSQVLKSLNKTYQNMKRKPVAVDL 2154

  Fly  2687 NPKACSVIELYGFLDMETRDWIDGLFSNIFREMNKPIEREERRYACFDGDVDALWIENMNSVMDD 2751
            :|||.:..||:|.::..||:|.|||||.|.|::.. |..:..::...|||:|.:|||::|:||||
  Rat  2155 DPKAVTCDELFGIINPATREWKDGLFSTIMRDLAN-ITHDGPKWIVLDGDIDPMWIESLNTVMDD 2218

  Fly  2752 NKLLTLANGERIRLENYCALLFEVGNLNYASPATVSRAGMVYVDPKNLRYSPFWQRWVLTRPEPQ 2816
            ||:||||:.|||.|.....|:||:.:|..|:||||||||::|::|.:|.::|....|: .|.:.|
  Rat  2219 NKVLTLASNERIPLNRTMRLVFEISHLRTATPATVSRAGILYINPADLGWNPVVSSWI-ERRKVQ 2282

  Fly  2817 RELLN--DFFEKIITQSIAFILEGLDGTTQGNPL-KLVIMQTDLNMVTQFCNLYDALLPNYVMDS 2878
            .|..|  ..|:|.:...:..:..|....|   |: ::.::||.|.::.  |.|.:...|.     
  Rat  2283 SEKANLIILFDKYLPTCLDKLRFGFKRIT---PVPEITVIQTILYLLE--CLLTEKNAPP----- 2337

  Fly  2879 KNYDEPVQQNYNTDSLECCFLQAVYGSMGACLVEKHQPVFDEYMKRISGFPLVQ-DTPENPASGG 2942
               |.|      .:..|..|:.|.:.:.|..:   .|....:|....|.:.:.: .|.:.|:.| 
  Rat  2338 ---DSP------KELYELYFVFACFWAFGGAM---FQDQLIDYRVEFSKWWINEFKTIKLPSQG- 2389

  Fly  2943 QFPQSKPTLYDYFWDVKDNVWKAWEWVVQPYTHDPQVKFSEILVPTVDNTRTNRTLSLMSEIKRP 3007
                   |::||:.|.:...:..|...|..:..||.:.....||.|.:..|....:.|:.....|
  Rat  2390 -------TIFDYYIDPETKKFLPWTDKVPNFELDPDIPLQASLVHTTETIRIRYFMDLLMAKAWP 2447

  Fly  3008 VLLVGEAGTSKTATIMQYLRNLNPSVNVILNINFSSRTSSLDVQHTLEAAVEKRTKDTYGPPMGK 3072
            |:|||.|||.|:..:...|.||:....::..:.|:..|:|..:|..||..:||::...||||..|
  Rat  2448 VMLVGNAGTGKSVLMGDKLENLSTDDYLVQAVPFNFYTTSAMLQGVLEKPLEKKSGRNYGPPGTK 2512

  Fly  3073 RIACFIDDMNMPQVDDYGTQQPIALLKLFFERGGMYDRDKDLNWKKFKDLTFYAAMGTAGGGRNE 3137
            ::..||||||||:||.|||..|..|::...:....|||.| |..|...:..:.|.|....|... 
  Rat  2513 KLIYFIDDMNMPEVDKYGTVAPHTLIRQHMDHRHWYDRQK-LTLKDVHNCQYVACMNPTSGSFT- 2575

  Fly  3138 VDPRFISMFSTYNIIFPNDESLIQIYSSIFKGHMVFVKFQPEYMLIADMIVHMTLKLFKMVIVDL 3202
            :|||....|..:.:.||..|:||.||::|...|:.:.........:...:|...|.|.:.|....
  Rat  2576 IDPRLQRHFCVFAVSFPGHEALITIYNTILAQHLSYRSAPSVIQRLCSHLVTAALALHQKVAATF 2640

  Fly  3203 PPTPSKFHYIFNLKDLSRIFAGMLLIEPTCFKGLRDLIRVWRNEYTRIICDRLITDNDIANVRRN 3267
            .||..||||||||:|||.||.|:|.......:...|::|:|.:|..|:..|:::.:.|...:|| 
  Rat  2641 LPTAIKFHYIFNLRDLSNIFQGILFSTLEILRTPLDIVRLWLHEAERVYGDKMVDEKDQETLRR- 2704

  Fly  3268 LAVEVAERFPPTFEEEHGFIDAAAAEAEAQARLLYEPSKADIDGGEEEGEEEEEGEEAPQVILSL 3332
            :.:...::|.....|||.|                  :|.:|                       
  Rat  2705 VTMASTKKFFDDLGEEHLF------------------AKPNI----------------------- 2728

  Fly  3333 KDYVLRDPLLFGDFRNFTNESEPRLYEDLLDYNSVYFLFTEILEEYCERKQKMTLVLFEDCLEHL 3397
                         |.:||.......|..:.|...:..|..::|:.|.|....|.||||||.:.|:
  Rat  2729 -------------FCHFTQGIGDPKYFPVTDVAHLNKLLKDVLDSYNEVNAVMNLVLFEDAVAHI 2780

  Fly  3398 TRVHRTLRMNRGHVLLIGVGGSGKKCITRLAAFAAECDVFEITISRGYNEAAFREDLKVLYTIAG 3462
            .|::|.|...||:.||:|||||||:.::||||:.:..|||:||:.:||.....:.||...|..:.
  Rat  2781 CRINRILESPRGNALLVGVGGSGKQSLSRLAAYISALDVFQITLKKGYAIPDLKMDLAAQYIKSA 2845

  Fly  3463 VKRKKVVFLFTGAQVAEEGFLELINNILTVGQVPALFPDEDKDGIVNQVRKFAEEDGVSASKDAV 3527
            ||....|||.|.:|||||.||.|||::|..|::|.||.|:|.:.|::.:|...:..|::.:::|.
  Rat  2846 VKNVPSVFLMTDSQVAEEQFLVLINDLLASGEIPGLFGDDDLENIISSMRPQVKSLGMTDTREAC 2910

  Fly  3528 WGYFLRTCAENLHVVLCMSPAGDALRNRCRNFPGLIGSTYIDWVFPWPRQALYAVAKLFLTEHRL 3592
            |.:|:....:.|.|:||.||.|..||.|.|.||.::..|.|||...||..||.:|:..||.|.:.
  Rat  2911 WKFFIEKVRKQLKVILCFSPVGSVLRVRARKFPAVVNCTAIDWFHEWPEDALVSVSARFLQETQG 2975

  Fly  3593 IPASHREAIVEHVVHVHTSIQQYSKDYLAKLRRNNFVTPKHYLDYINTYRGLLEEKAKFITQQRS 3657
            |....:.:|...:.:|||::.:.||.|||..||.|:.|||.:|:.|..|:.||.:|...:..:..
  Rat  2976 IQPEVKTSISLFMSYVHTTVNEMSKTYLATERRYNYTTPKTFLEQIKLYQNLLAKKRMELVAKIE 3040

  Fly  3658 RLGEGIKKIEEASVQIDELRIIVTEQKKNVAVASEECEAMLVTIESSTQKANVKKAEASEKSVEV 3722
            ||..|:.|::..:.|:|:|:..:..|:..:...:|..:.::..:...|:|.:.:||.|.|:.::|
  Rat  3041 RLENGLMKLQSTASQVDDLKAKLAVQEAELKQKNENADKLIQVVGVETEKVSKEKAIADEEEIKV 3105

  Fly  3723 EIKGKQIAIEKDEAEEILAEAMPALEEARLALSQLEKAQITEIRSFATPPAAVQVVCECVAIL-- 3785
            |:..|.:..::...|..||:|.|||..|:.||..|.|..:||::||.:||.||..|...|.||  
  Rat  3106 EVINKNVTEKQKACETDLAKAEPALLAAQEALDTLNKNNLTELKSFGSPPDAVVNVTAAVMILTA 3170

  Fly  3786 ---KGYKEINWKSAKGMMSDVN-FLKSLMEMDCEALTQKQITQCRQHMK------TGNLEDMAKI 3840
               |..|:.:||:||.||..|: ||.||...|.|.:.:    .|.:..|      |.:.|.:...
  Rat  3171 PGGKIPKDKSWKAAKIMMGKVDTFLDSLKRFDKEHIPE----ACLKAFKPYQGNPTFDPEFIRSK 3231

  Fly  3841 SVAGAGLLRFVRAVLGFFDVYKEVKPKKERLDFL-VEEQEVQIKLLNHLNGEIQKLEEKLNELNE 3904
            |.|.|||..:...::.|::||.:|.||::.|:.. .|..|.|.| |:.:..:|.:|...||.|..
  Rat  3232 STAAAGLCSWCINIVRFYEVYCDVAPKRQALEEANAELAEAQDK-LSRIKNKIAELNANLNNLTS 3295

  Fly  3905 NY--ATSMKQMRALTEMMQQAE--RRLIA-SDKLISGLTSELIRWSKEMASLGQQLIDSVGGCLI 3964
            .:  ||:.|     .:..|:|:  .|:|: :::|:.||.||.:||::.:.:...|.:...|..|:
  Rat  3296 AFEKATAEK-----IKCQQEADATNRVISLANRLVGGLASENVRWAESVENFRSQGVTLCGDVLL 3355

  Fly  3965 SASFLAYTGAFTWEFRKAMVFDDWLEDIASLGIPIQLPFKID--GYLTTDVEISQWSNEGLPPDE 4027
            .::|::|.|.||.::|..::...|:..:.:|.:||.:...:|  ..||.|.:::.|:|:|||.|.
  Rat  3356 ISAFVSYVGYFTKKYRNELMEKFWIPYVNNLKVPIPITEGLDPLTLLTDDADVATWNNQGLPSDR 3420

  Fly  4028 LSIQNGILTMRASRFPLCIDPQLQALQWIRKREFKNNLKVLSFSDSDFLKQLEMAIMYGTPVLFE 4092
            :|.:|..:.....|:||.:|.|||.::|| |.::.:.||.:......:|..:|.||..|..:|.|
  Rat  3421 MSTENATILCNTERWPLIVDAQLQGIKWI-KNKYGSELKAIRLGQKSYLDIIEQAISEGDTLLIE 3484

  Fly  4093 DVDDYIDPVIDDILQKNIRIQGGRKFVMLGDKEVDWDPSFRVYLTTKFSNPKFDPAVYAKALVIN 4157
            ::.:.:|||:|.:|.:| .|:.|| |:.:|||||::.||||:.|.||:.||.:.|.:.|:..:||
  Rat  3485 NIGETVDPVLDPLLGRN-TIKKGR-FIKIGDKEVEYHPSFRLILHTKYFNPHYKPEMQAQCTLIN 3547

  Fly  4158 YTVTQTGLEDQLLSVVVGTERPDLEAQRESLIAQTSENKQLLQQLEDSLLRELSTSTGNMLDNVE 4222
            :.||:.|||||||:.||..||||||..:.:|....:|.|.:|::||||||..||.::||.|.:..
  Rat  3548 FLVTRDGLEDQLLAAVVAKERPDLEQLKANLTKSQNEFKIVLKELEDSLLARLSAASGNFLGDTA 3612

  Fly  4223 LIETLENTKTKAGVVMEQLKLAADTAADIEVLRNGYRPAAKRGAVLFFALSDMATVNSMYQYALA 4287
            |:|.||.||..|..:.|:::.|..|...|...|..|||||.|.::|:|.|:|:..:|.:||::|.
  Rat  3613 LVENLETTKHTANEIEEKVQEAKITETKINEARENYRPAAARASLLYFILNDLNKINPIYQFSLK 3677

  Fly  4288 AYLDVFVYSLRKAVPDASLNKRLNNIIKTLTENVYCYGCTGIFERHKLLFSFQIATKLAQRDGIL 4352
            |:..||..:::|..|...:.:|:.|:...:|.:||.|...|:|||.||:|..|:..::......|
  Rat  3678 AFNVVFEKAIQKTPPAEEVRQRVINLTDEITYSVYMYTARGLFERDKLIFLAQVTFQVLSMKKEL 3742

  Fly  4353 LQSELDFFIKGSIALTKSERSNPCKWLSEKSWEDVLKLAFDFPDIFGTLPDHFGRYLTEWKEWFD 4417
            ...||||.::...   |:...:|..:|..:||..:  .|....|.|..|..........||:..:
  Rat  3743 NPVELDFLLRFPF---KAGVVSPVDFLQHQSWGGI--KALSEMDEFKNLDSDIEGSAKRWKKLVE 3802

  Fly  4418 LENPEEVPCPGDYNIKCNAFQKLMFLRCFRVDRIFRSINQYIVETMDEFYIMPPVVSFSAIYEQT 4482
            .|.||:...|.::..| .|.|||..:||.|.||:..::..::.|.|...::....|.||..||::
  Rat  3803 SEAPEKEIFPKEWKNK-TALQKLCMVRCMRPDRMTYAVKNFVEEKMGSKFVEGRSVEFSKSYEES 3866

  Fly  4483 SSTIPVCFVLSAGSDPTNDLIKLADTI---VGMSNFCHISLGQGQEKAALRLLDGAIKQGMWLML 4544
            |.:.|:.|:||.|.||..|:..|...:   :......::|||||||..|...||.|.::|.|::|
  Rat  3867 SPSTPIFFILSPGVDPLKDVEALGKKLGFTIDNGKLHNVSLGQGQEVVAEDALDVAAEKGHWVIL 3931

  Fly  4545 QNGHLLIRFVRELEKHLDRIEN-PHPDFRLWITTDPTPT-----FPIGILQKSLKVVTEPPNGLK 4603
            ||.||:.|::..|:|.::|..: .|.|:|::|:.:|.|:     .|.|||:.::|:..|||.|:.
  Rat  3932 QNIHLVARWLSILDKKVERYSSGSHEDYRVFISAEPAPSVETHIIPQGILENAIKITNEPPTGMY 3996

  Fly  4604 LNLRSTYFKVRQERLESCS-HVAFRPLVYVLAFFHAVVQERRKYDKLGWNIAYDFNDTDFDVCTE 4667
            .||........|:.||.|: .:.|:.:::.|.:|||||.||||:...|||.:|.||:.|..:...
  Rat  3997 ANLHKALDLFTQDTLEMCTKEIEFKCILFALCYFHAVVAERRKFGAQGWNRSYPFNNGDLTISIN 4061

  Fly  4668 ILRTYLTRCGTGKIPWNSLKYLIGEVMYGGRVIDDFDRRITNCYMNEYM------GDFLFD---- 4722
            :|..||.  ...|:||:.|:||.||:||||.:.||:|||:...|:.|::      |:.|..    
  Rat  4062 VLYNYLE--ANPKVPWDDLRYLFGEIMYGGHITDDWDRRLCRTYLIEFIRVEMLEGEVLLAPGFQ 4124

  Fly  4723 -----EFKVFHFYEDDNVDYCLPEEETILKEDYIAHIDKLPLVNKPDVFGLHPNAEIGYYTMAAR 4782
                 ::|.:|.|.|:|    ||.|                   .|.::|||||||||:.|:.:.
  Rat  4125 IPPNLDYKGYHEYIDEN----LPPE-------------------SPYLYGLHPNAEIGFLTVTSE 4166

  Fly  4783 NIWNSLIELQP-QTGEGTG-GISRDDFIDSVAAGILKKLPPAFETWRIRKQIQMSLSPTGVVLLQ 4845
            .::.:::|:|| :|..|.| |:||::.:.:|...||:|:|..|....|..: ....:|..||..|
  Rat  4167 KLFRTVLEMQPKETDSGAGTGVSREEKVKAVLDDILEKIPETFNMAEIMAK-AAEKTPYVVVAFQ 4230

  Fly  4846 ELDRFNLLVVRIKKTLELLRKAIAGEIGMDNVLDNIANSLFNGLLPAAWSKLAPATCKQLASWLE 4910
            |.:|.|:|...::::|:.|...:.||:.:...:::::.:||...:|..|...|..:...||:|..
  Rat  4231 ECERMNILTNEMRRSLKELNLGLKGELTITTDMEDLSTALFYDTVPETWVARAYPSMMGLAAWYS 4295

  Fly  4911 HLRLRAVQYKYWTLS-GEPLVMWLSGLHIPQSYLTALVQIACRRNAWPLDRSTLFTYVTKFADPD 4974
            .|..|..:.:.||.. ..|..:||:|...|||:|||::|...|:|.||||:..|...||| ...:
  Rat  4296 DLLQRIRELESWTTDFALPTTVWLAGFFNPQSFLTAIMQSMARKNEWPLDKMCLSVEVTK-KTRE 4359

  Fly  4975 DVEERPVTGCLVHGLYIEGGRFDLATNQLARSHPKVLVEELAILAVEPIEAHRLKLQNTYLAPVY 5039
            |:...|..|..|:||::||.|:|..|..:|.:..|.|...:.::.::.|...|::.:|.|..|||
  Rat  4360 DMTAPPREGSYVYGLFMEGARWDTQTGVIAEAKLKDLTPVMPVIFIKAIPVDRMETKNIYECPVY 4424

  Fly  5040 TTSLRRNAMGVGLVFEANLATSEDLSHWILQGVCLTL 5076
            .|.:|    |...|:..||.|.|..:.|||..|.|.|
  Rat  4425 KTRIR----GPTYVWTFNLKTKEKAAKWILAAVALLL 4457

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
Dhc98DNP_524541.3 DHC_N1 523..>968 CDD:462457 93/484 (19%)
DHC_N2 1795..2196 CDD:462462 139/406 (34%)
DYN1 1999..4719 CDD:227570 1002/2770 (36%)
AAA_6 2338..2664 CDD:463697 174/331 (53%)
Dynein_C 4778..5076 CDD:465677 96/300 (32%)
Dnah17XP_038943440.1 DHC_N1 187..764 CDD:462457 125/724 (17%)
DHC_N2 1266..1672 CDD:462462 139/410 (34%)
DYN1 1493..4124 CDD:227570 994/2750 (36%)
AAA_6 1806..2132 CDD:463697 174/331 (53%)
MT 3040..3383 CDD:463699 107/352 (30%)
Dynein_C 4162..4457 CDD:465677 96/300 (32%)

Return to query results.
Submit another query.