DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment Dhc98D and Dnah12

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_524541.3 Gene:Dhc98D / 43379 FlyBaseID:FBgn0013813 Length:5080 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:XP_063131137.1 Gene:Dnah12 / 252959 RGDID:619990 Length:3962 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:3910 Identity:1277/3910 - (32%)
Similarity:2012/3910 - (51%) Gaps:366/3910 - (9%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly  1358 LEASRNRKAAQMKKLYDSLGPVLVKLESLVLGTFSGRSDRMKTYYEYWEG-------ETFKCI-- 1413
            |...|:|.....:.|.:.|.....|.|..::.|:..:...:.|..|..||       ..:.|:  
  Rat   230 LTGIRDRGPIDCEALRNDLSIQARKAEERIMNTWYPKVINLFTKKEALEGIKPEKVDSFYNCVSI 294

  Fly  1414 ------VDMTYQNLKCYI----NRLLSNKPMFEVNAVLLMSEIVLEPSVQELQNTI---VTATKD 1465
                  .|:.::.::.::    :|.:...|:|::.......::...|:.|:|::.:   :....:
  Rat   295 LMSNQLKDLLWRTVEEFVRLFDSRYILRLPIFKMELTFDDDKMEFYPTFQDLEDVVLGLIERISE 359

  Fly  1466 YISRLRIFTRWMTGTCIACPLVEMGKQFKYNYTYYEDVIQIRSIVDLVINIHDLASRVANEARGF 1530
            .:..::....|::||  ..| |.:..:...:..|:       ::..|.|.:|.....|....:.:
  Rat   360 TLQTVQTVPSWLSGT--TAP-VNLDTELPEHVMYW-------ALSTLRIAVHQNLEGVRAHYKTY 414

  Fly  1531 VSQFRKYFNLWAFE--KSFICQKFLEKQVTLIEIDEKFTFYSSIVETLANTRKFQDIKCVRINLE 1593
            |:.:.     |..:  .:.:.::|..:..|..|..|....:.|:...:....::.....||::.|
  Rat   415 VTNYN-----WLLDGTATKMIERFQSENHTFDEYTEFIERFFSLASEIMLLPQWAHYPMVRLDCE 474

  Fly  1594 PLLASITQHAQDWCTTLGEELL---RHVNDNMRAMRNEVKTLSLNLNKTTRELEDFKLVMTTIGT 1655
            .|...:|..|:.:...|..::.   |..|:::.:....:|..:|.:.:||.|:      |..|..
  Rat   475 DLKTGLTNKAKAFANILLNDIASKHRKENESICSEFETIKEHALRVPETTEEM------MELIAF 533

  Fly  1656 VQSSTLTN----EQKIHEMQ-------ETFTILSE------------HKI--MFPYEDMLMAHHL 1695
            ::.:..|.    .|:|.|.:       :||.:..|            .||  :|...|.|:.:  
  Rat   534 IEKARTTGIQNLAQRIQESKRQMGYFLDTFLLSQEDLNLNASVLLWPSKINPVFDENDELIEN-- 596

  Fly  1696 EKRWKRLFLSALYRYEKLQPIKQKFADMTSVEIDEFCDDLAEFIKDYDENGPGSVGAELERGVRL 1760
            .||.|...|.|  :.|||           .:||::....:.||.:          .|||:|    
  Rat   597 SKRTKENELIA--KREKL-----------ILEIEKESRRMEEFTE----------FAELDR---- 634

  Fly  1761 MDPY-------GQKIAERESRREELANAERLFDMAMVDYHEFARVQTEFEGLQQLYKLYKAQKYA 1818
            |..|       .::|.:.|...:.:...|.||...:..|.|..:::...|..|:.:......:..
  Rat   635 MQQYVADVRHLQKRIQDSEEAVQFINKEEELFKWELTKYPELEKLKVTIEPYQKFFNFVLKWQRT 699

  Fly  1819 REGW---------GKTLWADLDP------NVLTEGVESYLKEFRKFTKAVR-------------- 1854
            .:.|         |:::.||:|.      ..|........||.::..||.|              
  Rat   700 EKRWMDGGFLDLNGESMEADIDEFSREVFKTLKFFQTKQKKELQEKRKAARKRSLMEEKPEEEPK 764

  Fly  1855 ---TLPVGVQLEIHMKQFKGTVPLMVSLKHEALRERHWLQLMEKTGQYFDMSP-ARFTLENMFAM 1915
               |:.:...:...:|.||..:|.:..|.:..:|.|||.|:.|..|  :|::| :..||..:..:
  Rat   765 ESPTITMCATVMEQIKVFKEYIPTVSILCNPGMRARHWKQMSEIVG--YDLTPDSGTTLRKVLKL 827

  Fly  1916 QLHKYQEIAEQILTNAIKELQIERGVQAVIETWASMAFKTFKHFKGSDDRG-WVLGPVDEIMQIL 1979
            .|..|.|..|.|...|.||..:||.:.|:|.||..::|    |.....|.| ::|..||||..||
  Rat   828 NLTPYLESFEVISAGASKEFSLERAMNAMIATWDDISF----HISLYRDTGVYILSSVDEIQAIL 888

  Fly  1980 EDNAMNLQSMGASQFIGPFLETVNKWERTLALISEIIDEWLVVQRKWLYLEGIFIGGDIRTQLPE 2044
            :|..:..|:|..|.||.||...:..||..|..|.|.|||||.||.:|||||.||...||..|:||
  Rat   889 DDQIIKTQTMRGSPFIKPFENEIKAWEDRLIRIQETIDEWLKVQAQWLYLEPIFCSEDIMQQMPE 953

  Fly  2045 EARKFDDIDKSYRRIMVDCAKNPLVVPFCTVPGRLVEIQGLGIGLENCQKSLNEYLDSKRRIFPR 2109
            |.|:|..:|:.::.||..|||:|.|:...::.|.|.::|.....|:...|.||.||:.||..|||
  Rat   954 EGRQFQTVDRHWKDIMKFCAKDPKVLAATSLTGLLEKLQNCNDLLDKIMKGLNAYLEKKRLFFPR 1018

  Fly  2110 FYFISTDELLSILG-SSEPSAVQNHIIKMYDNIKSLRLVKEGSQTIVTGMISSEGEVMEF---RH 2170
            |:|:|.||:|.||. :.:|..||.|:.|.::.|..|..:   :...:..|.|||||.:|.   ..
  Rat  1019 FFFLSNDEMLEILSETKDPLRVQPHLKKCFEGIAKLEFL---TNLDIKAMYSSEGERVELISVIS 1080

  Fly  2171 SARAAGRVEYWMNDVLDEMRRSNRFINKTAIYDFGTDLQISRP-----DWLMNYQGMVGLAASQV 2230
            ::.|.|.||.|:..|.|.|.||        |:|.....:::.|     ||:..:.|.|.|..||:
  Rat  1081 TSAARGAVEKWLIQVEDLMLRS--------IHDVIAASRLAYPESARKDWVREWPGQVVLCVSQM 1137

  Fly  2231 WWTAEVEEAFDQAQNHGNMRAMKDFLGKNNYQIEELVLKVRSNLSRNDRLKFKAQCTVDVHARDI 2295
            :||:|.:|...     |....:|.:..:..||:.::|..||..||:..|:...|..|:||||||:
  Rat  1138 FWTSETQEVIS-----GGNEGLKKYYKELQYQLNDIVELVRGKLSKQTRITLGALVTIDVHARDV 1197

  Fly  2296 IDNFVRDNVLDASEFSWESQLRFYWIKFYDNLHVLQCSGSFDFGYEYMGLNGRLVITPLTDRIYL 2360
            :.:.:...|...::|.|.:|||:||  .|:|..|...:.:..:.|||:|.:.||||||||||.|.
  Rat  1198 VMDMIDMGVSHDTDFQWLAQLRYYW--EYENARVRIVNCNVKYAYEYLGNSPRLVITPLTDRCYR 1260

  Fly  2361 TITQALLMNLGGAPAGPAGTGKTETVKDLAKAMGLLCVVTNCGEGMDYRAVGTILSGLVQCGAWG 2425
            |:..|..:||||||.||||||||||.||||||:.:.|||.||.:|:||.|:|....||...|||.
  Rat  1261 TLIGAFYLNLGGAPEGPAGTGKTETTKDLAKALAVQCVVFNCSDGLDYLAMGKFFKGLASSGAWA 1325

  Fly  2426 CFDEFNRIDISVLSVISTQLQTIRNGLIRKLDRFVFEGVEIHLDPKCGVFVTMNPGYAGRTELPE 2490
            ||||||||::.||||::.|:..|:..:.:||:.|||||.|:.|:|.|.|.:|||||||||:|||:
  Rat  1326 CFDEFNRIELEVLSVVAQQILCIQRAIQQKLEVFVFEGTELRLNPNCFVAITMNPGYAGRSELPD 1390

  Fly  2491 SVKALFRPVTCIKPDLELICLISLFSDGFLTAKVLAKKMTVLYSLAQAQLSKQCHYDWGLRSLNS 2555
            ::|.|||.|..:.|:..||..|||:|.|||.||.|:.|:.:.|.|...|||.|.|||:|:|::.:
  Rat  1391 NLKVLFRTVAMMVPNYALIAEISLYSYGFLNAKPLSVKIVMTYRLCSEQLSSQFHYDYGMRAVKA 1455

  Fly  2556 VLRMAGVMKRQSEDLPEAVVLMRVLRDMNFPKFVFEDVPLFLGLIKDLFPGIDCPRIGYPDF--- 2617
            ||..||.:|.:..:..|.::|:|.::|:|.|||:..|:|||.|:..||||||..|...|.:|   
  Rat  1456 VLVAAGNLKLKYPNENEDILLLRSIKDVNEPKFLSHDIPLFNGITSDLFPGIKLPEADYQEFLEC 1520

  Fly  2618 --NAAVRHVLVNDGYILLPDQEDKVVQMYETMMTRHSTMLVGPTGGGKTVVINALVKAQTHM--- 2677
              .|.....|....:.|     :|::|.||.|:.||..||||.....||.|::.|....|.|   
  Rat  1521 AYEACETQNLQPVKFFL-----EKIIQTYEMMIVRHGFMLVGEPFAAKTEVLHILADTLTLMNER 1580

  Fly  2678 --GLPTKCL--VLNPKACSVIELYGFLDMETRDWIDGLFSNIFREMNKPIEREERRYACFDGDVD 2738
              |...|.:  .:|||:.::.:|:|..|..:.:|.||:.:|.|||. ...|..:|::..|||.:|
  Rat  1581 NYGDEEKVMYRTVNPKSITMGQLFGQFDPVSHEWTDGIVANTFREF-ALAESPDRKWVVFDGPID 1644

  Fly  2739 ALWIENMNSVMDDNKLLTLANGERIRLENYCALLFEVGNLNYASPATVSRAGMVYVDPKNLRYSP 2803
            .||||:||:|:||||.|.|.:||.|::....:|:||..:|:.||||||||.||:|::|..|.:.|
  Rat  1645 TLWIESMNTVLDDNKKLCLMSGEIIQMSPQMSLIFETMDLSQASPATVSRCGMIYLEPSQLGWEP 1709

  Fly  2804 FWQRWVLTRPEPQRE-----LLNDFFEKIITQSIAFILEGLDGTTQGNPLKLVIMQTDLNMVTQF 2863
            ....|:.:..||..|     ||.:.|..::..|:.|         :....|.:|...::|.|...
  Rat  1710 IVASWLNSLKEPLNELEHQNLLKELFNWLVQPSLEF---------RRKKCKELIPTGNINAVVAL 1765

  Fly  2864 CNLYDALLPNYVMDSKNYDEPVQQNYNTDSLECCFLQAVYGSMGACLVEKHQPVFDEYMKRI--- 2925
            ..|.:.||...|     .::|..::... .:...|:.::..|:||......:..||.:::.:   
  Rat  1766 TRLIEILLCTVV-----ENDPSSKHIRV-WIMATFVFSLIWSVGASCDTDGRLAFDNFLRSLVTG 1824

  Fly  2926 ----SGFPLVQDTPENPASGGQFPQSKPTLYDYFWDVKD-NVWKAWEWVVQPY-THDPQVKFSEI 2984
                :..|:..:..|.|.      ..|..:|||.::::: ..|..|..:::.. ..|.:.|..:|
  Rat  1825 KNDKAPMPVFINKWECPF------DEKGLVYDYMYELRNRGRWIHWNDLIKSSDIEDRRTKIQDI 1883

  Fly  2985 LVPTVDNTRTNRTLSLMSEIKRPVLLVGEAGTSKTATIMQYLRN-LNPSVNVILNINFSSRTSSL 3048
            :|||:|..|....:.|.....:|:|.||..||.|:..:...|.| |.........:|||:|||:.
  Rat  1884 IVPTMDTIRYTFLMDLCISHAKPLLFVGPTGTGKSVYVKDKLMNHLEKGKYFPFYVNFSARTSAN 1948

  Fly  3049 DVQHTLEAAVEKRTKDTYGPPMGKRIACFIDDMNMPQVDDYGTQQPIALLKLFFERGGMYDRDKD 3113
            .||:.:.|.::||.|..:||||||:...||||||||.::.||.|.||.||:.||:.|..||. ||
  Rat  1949 QVQNIIMARLDKRRKGVFGPPMGKKCVVFIDDMNMPSLEKYGAQPPIELLRQFFDCGHWYDL-KD 2012

  Fly  3114 LNWKKFKDLTFYAAMGTAGGGRNEVDPRFISMFSTYNIIFPNDESLIQIYSSIFKGHMVFVKFQP 3178
            .......|:...||||..|||||.|.||||..|:...|...:||::::|:|||...::....|.|
  Rat  2013 TTKITLVDIELIAAMGPPGGGRNAVTPRFIRHFNICTINSFSDETMVRIFSSIMMFYLRTHDFSP 2077

  Fly  3179 EYMLIADMIVHMTLKLFKMVIVDLPPTPSKFHYIFNLKDLSRIFAGMLLIEPTCFKGLRDLIRVW 3243
            ||.::...||..|::::|..:.:|.|||:|.||.|||:|.||:..|.|||:....:....:||::
  Rat  2078 EYFVLGHQIVSATMEIYKQSMGNLLPTPAKSHYTFNLRDFSRVIRGCLLIDKEAIESKHTMIRLF 2142

  Fly  3244 RNEYTRIICDRLITDND-------IANVRRNLAVEVAERFPPTFEEEHGFIDAAAAEAEAQARLL 3301
            .:|..|:..||||.|.|       |.||       :.:.|..:.|.....:..            
  Rat  2143 VHEVLRVFYDRLINDEDRNWLFLLIKNV-------IKDHFKESLENVFSHLRR------------ 2188

  Fly  3302 YEPSKADIDGGEEEGEEEEEGEEAPQVILSLKDYVLRDPLLFGDFRNFTNESEPRLYEDLLDYNS 3366
                     |.....||:                 ||: |:|||:.|...|.:.|:|.::|:.:.
  Rat  2189 ---------GNSSINEED-----------------LRN-LMFGDYMNPDLEGDDRVYIEILNIHQ 2226

  Fly  3367 VYFLFTEILEEYCE-RKQKMTLVLFEDCLEHLTRVHRTLRMNRGHVLLIGVGGSGKKCITRLAAF 3430
            ...:..:.|:||.: .|::|.||:|...||||:|:.|.|:.:.|:.||||:||||::.:|.||..
  Rat  2227 FNEVVDQCLDEYNQTHKRRMNLVVFRYVLEHLSRICRILKQSGGNALLIGLGGSGRQSLTSLATS 2291

  Fly  3431 AAECDVFEITISRGYNEAAFREDLKVLYTIAGVKRKKVVFLFTGAQVAEEGFLELINNILTVGQV 3495
            .|:..:|:..||:.|....:|||:|.|....|||.:|.|||.|..|:.||.|||.|:::|..|:|
  Rat  2292 MAKMQIFQPEISKSYGMNEWREDIKSLLRNVGVKGQKTVFLITDTQIKEEAFLEDIDSVLNTGEV 2356

  Fly  3496 PALFPDEDKDGIVNQVRKFAE---EDGVSASKDAVWGYFLRTCAENLHVVLCMSPAGDALRNRCR 3557
            |.:|..::|..::..||..|:   :.| ..|..|::.:|:..|.:|||||:..||.|||.|||.|
  Rat  2357 PNIFAADEKQEVMEGVRPVAQVGNKHG-ELSPLALFAFFVNRCKDNLHVVVAFSPIGDAFRNRLR 2420

  Fly  3558 NFPGLIGSTYIDWVFPWPRQALYAVAKLFLTEHRLIPASHREAIVEHVVHVHTSIQQYSKDYLAK 3622
            .||.||....|||..|||..||..||..||....|......| ||....|.||||...|:.:|.:
  Rat  2421 QFPSLINCCTIDWFQPWPEDALERVAVSFLETVELTEVERHE-IVPICKHFHTSIMNLSERFLEE 2484

  Fly  3623 LRRNNFVTPKHYLDYINTYRGLLEEKAKFITQQRSRLGEGIKKIEEASVQIDELRIIVTEQKKNV 3687
            |.|:|:||...||:.|.::|.||.:|.:.:.:.:.|...|:.::..|..|:.|:::.:.|.:..:
  Rat  2485 LGRHNYVTATSYLELIGSFRQLLTKKRQSVMEAKQRYVNGLDQLAFAESQVGEMKLELVELQPKL 2549

  Fly  3688 AVASEECEAM--LVTIESSTQKANVKKAEASEKSVEV--EI---KGKQIAIEKDEAEEILAEAMP 3745
            ..|..|...|  ::.|||:       :.||..|.|::  ||   |.::....|:|.|..||||:|
  Rat  2550 EAAKVENARMMQIIEIESA-------QVEAKRKIVKLDEEIASGKAEEAQALKNECESDLAEAIP 2607

  Fly  3746 ALEEARLALSQLEK--AQITEIRSFATPPAAVQVVCECVAILKGYK--EIN------------WK 3794
            |||.|..||..|::  |.||.::|...|||.|::|...|.::|..|  :|:            |.
  Rat  2608 ALEAALSALDTLKESPADITIVKSMKNPPAGVKLVMAAVCVMKDIKPEKISDPSGTGGKIFDYWG 2672

  Fly  3795 SAKGMMSDVNFLKSLMEMDCEALTQKQITQCRQHMKTGNLED---MAKISVAGAGLLRFVRAVLG 3856
            .:|.::.|:|||:.|.|.|.|.:....:.:.|....|....|   :||.|.|..||.:::.|:..
  Rat  2673 PSKKLLGDMNFLRDLREYDKENIPVAVMQKIRSEYLTNPEFDPPKVAKASSAAEGLCKWIMAMEV 2737

  Fly  3857 FFDVYKEVKPKKERLDFLVEEQEVQIKLLNHLNGEIQKLEEKLNELNENYATSMKQMRALTEMMQ 3921
            :..|.|.|.|||.||....:.....::|||...||:.::|..|..|.:.:....::..||.:.::
  Rat  2738 YDRVAKVVAPKKARLAEAQKSLAETMELLNQKRGELAQVEHHLENLQKTFQEKTEEKAALEDQVE 2802

  Fly  3922 QAERRLIASDKLISGLTSELIRWSKEMASLGQQLIDSVGGCLISASFLAYTGAFTWEFRKAMVFD 3986
            ...::|..:.|||.||..|..|||:....|.....:..|..|:||..:||.||||..||:... :
  Rat  2803 LCAKKLERATKLIGGLGGEKSRWSQAANDLQATYENLTGDVLVSAGVIAYLGAFTSGFRQECT-E 2866

  Fly  3987 DWLEDIASLGIPIQLPFKIDGYLTTDVEISQWSNEGLPPDELSIQNGILTMRASRFPLCIDPQLQ 4051
            ||.:.......|....|.:...|...|:|..|:..|||.|..||.||::...:.|:||.||||.|
  Rat  2867 DWSKLCKEKKFPCSEEFSLSKTLGDPVKIRAWNIAGLPTDTFSIDNGVIVNNSRRWPLMIDPQGQ 2931

  Fly  4052 ALQWIRKREFKNNLKVLSFSDSDFLKQLEMAIMYGTPVLFEDVDDYIDPVIDDILQKNIRIQGGR 4116
            |.:||:..|..|.|.|:..||||:::.||..|..|||||.|:|.:.:||.::.:|.:....|||.
  Rat  2932 ANKWIKNSEKDNQLSVIKLSDSDYMRTLENCIQLGTPVLLENVGEDLDPSLEPLLLRQTFKQGGI 2996

  Fly  4117 KFVMLGDKEVDWDPSFRVYLTTKFSNPKFDPAVYAKALVINYTVTQTGLEDQLLSVVVGTERPDL 4181
            ..:.||:..:::...|:.|:|||..||.:.|.:..|..::|:.:|..|||||||.:||..|||:|
  Rat  2997 DCIRLGEVIIEYSFDFKFYITTKLRNPHYMPELATKVSLLNFMITPEGLEDQLLGIVVAKERPEL 3061

  Fly  4182 EAQRESLIAQTSENKQLLQQLEDSLLRELSTSTGNMLDNVELIETLENTKTKAGVVMEQLKLAAD 4246
            |.:|.:||.|::.||:.|:.:|..:|..||.|.||:|::...|:.|::.|..:..:.::.::|..
  Rat  3062 EEERNALILQSAANKKQLKDIETRILETLSCSEGNILEDESAIKVLDSAKMMSNEITKKQQVAEK 3126

  Fly  4247 TAADIEVLRNGYRPAAKRGAVLFFALSDMATVNSMYQYALAAYLDVFVYSLRKAVPDASLNKRLN 4311
            |...|...|.||||.||..:||||:::|:|.::.||||:|..::::::.|:..:.....|.|||.
  Rat  3127 TELKIAESREGYRPIAKHSSVLFFSIADLANIDPMYQYSLTWFVNLYINSIHDSNRSKILEKRLR 3191

  Fly  4312 NIIKTLTENVYCYGCTGIFERHKLLFSFQIATKLAQRDGILLQSELDFFIKGSIALTKSERSNPC 4376
            .:....|.|:||..|..:||:.||||||.:...|......:...||.|.:.|.::|..:|::...
  Rat  3192 YLNDHFTYNLYCNICRSLFEKDKLLFSFLLCANLLLAKKEIEYQELMFLLTGGVSLKSAEKNPDP 3256

  Fly  4377 KWLSEKSWEDVLKLAFDFPDIFGTLPDHFGRYLTEWKEWFDLENPEEVPCPGDYNIKCNAFQKLM 4441
            .||.:||||::.: |.:.| :|..|.:||..::.||::.::.:.|..:..|...:...|..||::
  Rat  3257 NWLQDKSWEEICR-ASELP-VFHGLREHFCNHIREWEDIYNSKEPHNMKLPESMDKTLNELQKII 3319

  Fly  4442 FLRCFRVDRIFRSINQYIVETMDEFYIMPPVVSFSAIYEQTSSTIPVCFVLSAGSDPTNDLIKLA 4506
            .|||.|.|:|..:|..|:.:.:.:.::.||....:..|..::.|||:.||||.|:||...|:|.|
  Rat  3320 ILRCLRPDKITPAITNYVTDKLGKKFVEPPPFDLTKSYLDSNCTIPLIFVLSPGADPMASLLKFA 3384

  Fly  4507 -DTIVGMSNFCHISLGQGQEKAALRLLDGAIKQGMWLMLQNGHLLIRFVRELEKHLDRI--ENPH 4568
             |..:..:.|..|||||||...|.:::..||::|.|:.|||.||.:.::..|||..:..  |..:
  Rat  3385 NDKSMSGNKFQAISLGQGQGPVATKMITAAIEEGTWVCLQNCHLAVSWMPTLEKICEDFSPEICN 3449

  Fly  4569 PDFRLWITTDPTPTFPIGILQKSLKVVTEPPNGLKLNLRSTYFK---VRQERLESC--SHVAFRP 4628
            |.||||:|:.|:|.||:.|||..:|:..|||.||:|||..:|..   ...|....|  ..:|:..
  Rat  3450 PTFRLWLTSYPSPKFPVTILQNGVKMTNEPPTGLRLNLLQSYLSDPISDPEFFNGCPGKELAWEK 3514

  Fly  4629 LVYVLAFFHAVVQERRKYDKLGWNIAYDFNDTDFDVCTEILRTYLTRCGTGKIPWNSLKYLIGEV 4693
            |::.:.||||:||||:|:..|||||.|.||::|..:....|:.::....|  ||:.::.||.||.
  Rat  3515 LLFGVCFFHALVQERKKFGPLGWNIPYGFNESDLRISIRQLQLFINEYDT--IPFEAISYLTGEC 3577

  Fly  4694 MYGGRVIDDFDRRITNCYMNEYMGDFLFDEFKVFHFYEDDNVDYCLPEEETILKEDYIAHIDKLP 4758
            .|||||.||:|||:....:.::....:.:.   .|:....:.:|..|.:.|.  ::||..|.|||
  Rat  3578 NYGGRVTDDWDRRLLLTMLADFYNSLIIEN---PHYKFSPSGNYFAPPKGTY--DEYIEFIKKLP 3637

  Fly  4759 LVNKPDVFGLHPNAEIGYYTMAARNIWNSLIELQ---PQTGEGTGGISRDDFIDSVAAGILKKLP 4820
            ...:|::||||.|.:|.......:.::.||:..|   .|||...   |.|..:..:...||.:||
  Rat  3638 FTQEPEIFGLHENVDISKDLQQTKLLFESLLLTQGGVKQTGSSG---STDQILLEITEDILTQLP 3699

  Fly  4821 PAFE------TWRIRKQIQMSLSPTGVVLLQELDRFNLLVVRIKKTLELLRKAIAGEIGMDNVLD 4879
            ..|:      ::.:|.:..|:     .||:||::|||.|::.|:.||..|:|||.|.:.||:.|:
  Rat  3700 NDFDIEAALRSYPVRYEESMN-----TVLVQEMERFNNLIITIRNTLRDLKKAIKGVVVMDSALE 3759

  Fly  4880 NIANSLFNGLLPAAWSKLAPATCKQLASWLEHLRLRAVQYKYWTLSGEPLVMWLSGLHIPQSYLT 4944
            .::.||..|.:|..|::.:..:.|.|.|::.....|....:.|...|:|.|.|:||....|::||
  Rat  3760 ALSGSLLIGKVPEMWAQRSYPSLKPLGSYITDFLTRLKFLEDWFTMGKPNVFWISGFFFTQAFLT 3824

  Fly  4945 ALVQIACRRNAWPLDRSTLFTYVTKFADPDDVEERPVTGCLVHGLYIEGGRFDLATNQLARSHPK 5009
            ..:|...|:...|:|   |..|..:....|:....|..|..:||||::|.|::..:..||..|||
  Rat  3825 GAMQNYARKYTIPID---LLGYEFEVIPSDNATNPPEDGVYIHGLYLDGARWNRTSGLLAEQHPK 3886

  Fly  5010 VLVEELAILAVEPIEAHRLKLQNTYLAPVYTTSLRRNAM-----GVGLVFEANLATSEDLSHWIL 5069
            :|.:.:.|:.::|.....:...:.|:.|:|.||.|:..:     ....|....|.|.....|||.
  Rat  3887 LLFDLMPIIWIKPNVKTEIVKTDAYVCPLYKTSERKGTLSTTGHSTNFVIAMLLRTELPAQHWIK 3951

  Fly  5070 QGVCLTLNTD 5079
            :||.|....|
  Rat  3952 RGVALLCQLD 3961

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
Dhc98DNP_524541.3 DHC_N1 523..>968 CDD:462457
DHC_N2 1795..2196 CDD:462462 144/438 (33%)
DYN1 1999..4719 CDD:227570 1015/2800 (36%)
AAA_6 2338..2664 CDD:463697 163/330 (49%)
Dynein_C 4778..5076 CDD:465677 91/311 (29%)
Dnah12XP_063131137.1 None
Blue background indicates that the domain is not in the aligned region.

Return to query results.
Submit another query.