DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment Dhc98D and Dnah12

DIOPT Version :9

Sequence 1:NP_524541.3 Gene:Dhc98D / 43379 FlyBaseID:FBgn0013813 Length:5080 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:XP_006252733.1 Gene:Dnah12 / 252959 RGDID:619990 Length:3960 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:3911 Identity:1276/3911 - (32%)
Similarity:2010/3911 - (51%) Gaps:370/3911 - (9%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly  1358 LEASRNRKAAQMKKLYDSLGPVLVKLESLVLGTFSGRSDRMKTYYEYWEG-------ETFKCI-- 1413
            |...|:|.....:.|.:.|.....|.|..::.|:..:...:.|..|..||       ..:.|:  
  Rat   230 LTGIRDRGPIDCEALRNDLSIQARKAEERIMNTWYPKVINLFTKKEALEGIKPEKVDSFYNCVSI 294

  Fly  1414 ------VDMTYQNLKCYI----NRLLSNKPMFEVNAVLLMSEIVLEPSVQELQNTI---VTATKD 1465
                  .|:.::.::.::    :|.:...|:|::.......::...|:.|:|::.:   :....:
  Rat   295 LMSNQLKDLLWRTVEEFVRLFDSRYILRLPIFKMELTFDDDKMEFYPTFQDLEDVVLGLIERISE 359

  Fly  1466 YISRLRIFTRWMTGTCIACPLVEMGKQFKYNYTYYEDVIQIRSIVDLVINIHDLASRVANEARGF 1530
            .:..::....|::||  ..| |.:..:...:..|:       ::..|.|.:|.....|....:.:
  Rat   360 TLQTVQTVPSWLSGT--TAP-VNLDTELPEHVMYW-------ALSTLRIAVHQNLEGVRAHYKTY 414

  Fly  1531 VSQFRKYFNLWAFE--KSFICQKFLEKQVTLIEIDEKFTFYSSIVETLANTRKFQDIKCVRINLE 1593
            |:.:.     |..:  .:.:.::|..:..|..|..|....:.|:...:....::.....||::.|
  Rat   415 VTNYN-----WLLDGTATKMIERFQSENHTFDEYTEFIERFFSLASEIMLLPQWAHYPMVRLDCE 474

  Fly  1594 PLLASITQHAQDWCTTLGEELL---RHVNDNMRAMRNEVKTLSLNLNKTTRELEDFKLVMTTIGT 1655
            .|...:|..|:.:...|..::.   |..|:::.:....:|..:|.:.:||.|:      |..|..
  Rat   475 DLKTGLTNKAKAFANILLNDIASKHRKENESICSEFETIKEHALRVPETTEEM------MELIAF 533

  Fly  1656 VQSSTLTN----EQKIHEMQ-------ETFTILSE------------HKI--MFPYEDMLMAHHL 1695
            ::.:..|.    .|:|.|.:       :||.:..|            .||  :|...|.|:.:  
  Rat   534 IEKARTTGIQNLAQRIQESKRQMGYFLDTFLLSQEDLNLNASVLLWPSKINPVFDENDELIEN-- 596

  Fly  1696 EKRWKRLFLSALYRYEKLQPIKQKFADMTSVEIDEFCDDLAEFIKDYDENGPGSVGAELERGVRL 1760
            .||.|...|.|  :.|||           .:||::....:.||.:          .|||:|    
  Rat   597 SKRTKENELIA--KREKL-----------ILEIEKESRRMEEFTE----------FAELDR---- 634

  Fly  1761 MDPY-------GQKIAERESRREELANAERLFDMAMVDYHEFARVQTEFEGLQQLYKLYKAQKYA 1818
            |..|       .::|.:.|...:.:...|.||...:..|.|..:::...|..|:.:......:..
  Rat   635 MQQYVADVRHLQKRIQDSEEAVQFINKEEELFKWELTKYPELEKLKVTIEPYQKFFNFVLKWQRT 699

  Fly  1819 REGW---------GKTLWADLDP------NVLTEGVESYLKEFRKFTKAVR-------------- 1854
            .:.|         |:::.||:|.      ..|........||.::..||.|              
  Rat   700 EKRWMDGGFLDLNGESMEADIDEFSREVFKTLKFFQTKQKKELQEKRKAARKRSLMEEKPEEEPK 764

  Fly  1855 ---TLPVGVQLEIHMKQFKGTVPLMVSLKHEALRERHWLQLMEKTGQYFDMSP-ARFTLENMFAM 1915
               |:.:...:...:|.||..:|.:..|.:..:|.|||.|:.|..|  :|::| :..||..:..:
  Rat   765 ESPTITMCATVMEQIKVFKEYIPTVSILCNPGMRARHWKQMSEIVG--YDLTPDSGTTLRKVLKL 827

  Fly  1916 QLHKYQEIAEQILTNAIKELQIERGVQAVIETWASMAFKTFKHFKGSDDRG-WVLGPVDEIMQIL 1979
            .|..|.|..|.|...|.||..:||.:.|:|.||..::|    |.....|.| ::|..||||..||
  Rat   828 NLTPYLESFEVISAGASKEFSLERAMNAMIATWDDISF----HISLYRDTGVYILSSVDEIQAIL 888

  Fly  1980 EDNAMNLQSMGASQFIGPFLETVNKWERTLALISEIIDEWLVVQRKWLYLEGIFIGGDIRTQLPE 2044
            :|..:..|:|..|.||.||...:..||..|..|.|.|||||.||.:|||||.||...||..|:||
  Rat   889 DDQIIKTQTMRGSPFIKPFENEIKAWEDRLIRIQETIDEWLKVQAQWLYLEPIFCSEDIMQQMPE 953

  Fly  2045 EARKFDDIDKSYRRIMVDCAKNPLVVPFCTVPGRLVEIQGLGIGLENCQKSLNEYLDSKRRIFPR 2109
            |.|:|..:|:.::.||..|||:|.|:...::.|.|.::|.....|:...|.||.||:.||..|||
  Rat   954 EGRQFQTVDRHWKDIMKFCAKDPKVLAATSLTGLLEKLQNCNDLLDKIMKGLNAYLEKKRLFFPR 1018

  Fly  2110 FYFISTDELLSILG-SSEPSAVQNHIIKMYDNIKSLRLVKEGSQTIVTGMISSEGEVMEF---RH 2170
            |:|:|.||:|.||. :.:|..||.|:.|.::.|..|..:   :...:..|.|||||.:|.   ..
  Rat  1019 FFFLSNDEMLEILSETKDPLRVQPHLKKCFEGIAKLEFL---TNLDIKAMYSSEGERVELISVIS 1080

  Fly  2171 SARAAGRVEYWMNDVLDEMRRSNRFINKTAIYDFGTDLQISRP-----DWLMNYQGMVGLAASQV 2230
            ::.|.|.||.|:..|.|.|.||        |:|.....:::.|     ||:..:.|.|.|..||:
  Rat  1081 TSAARGAVEKWLIQVEDLMLRS--------IHDVIAASRLAYPESARKDWVREWPGQVVLCVSQM 1137

  Fly  2231 WWTAEVEEAFDQAQNHGNMRAMKDFLGKNNYQIEELVLKVRSNLSRNDRLKFKAQCTVDVHARDI 2295
            :||:|.:|...     |....:|.:..:..||:.::|..||..||:..|:...|..|:||||||:
  Rat  1138 FWTSETQEVIS-----GGNEGLKKYYKELQYQLNDIVELVRGKLSKQTRITLGALVTIDVHARDV 1197

  Fly  2296 IDNFVRDNVLDASEFSWESQLRFYWIKFYDNLHVLQCSGSFDFGYEYMGLNGRLVITPLTDRIYL 2360
            :.:.:...|...::|.|.:|||:||  .|:|..|...:.:..:.|||:|.:.||||||||||.|.
  Rat  1198 VMDMIDMGVSHDTDFQWLAQLRYYW--EYENARVRIVNCNVKYAYEYLGNSPRLVITPLTDRCYR 1260

  Fly  2361 TITQALLMNLGGAPAGPAGTGKTETVKDLAKAMGLLCVVTNCGEGMDYRAVGTILSGLVQCGAWG 2425
            |:..|..:||||||.||||||||||.||||||:.:.|||.||.:|:||.|:|....||...|||.
  Rat  1261 TLIGAFYLNLGGAPEGPAGTGKTETTKDLAKALAVQCVVFNCSDGLDYLAMGKFFKGLASSGAWA 1325

  Fly  2426 CFDEFNRIDISVLSVISTQLQTIRNGLIRKLDRFVFEGVEIHLDPKCGVFVTMNPGYAGRTELPE 2490
            ||||||||::.||||::.|:..|:..:.:||:.|||||.|:.|:|.|.|.:|||||||||:|||:
  Rat  1326 CFDEFNRIELEVLSVVAQQILCIQRAIQQKLEVFVFEGTELRLNPNCFVAITMNPGYAGRSELPD 1390

  Fly  2491 SVKALFRPVTCIKPDLELICLISLFSDGFLTAKVLAKKMTVLYSLAQAQLSKQCHYDWGLRSLNS 2555
            ::|.|||.|..:.|:..||..|||:|.|||.||.|:.|:.:.|.|...|||.|.|||:|:|::.:
  Rat  1391 NLKVLFRTVAMMVPNYALIAEISLYSYGFLNAKPLSVKIVMTYRLCSEQLSSQFHYDYGMRAVKA 1455

  Fly  2556 VLRMAGVMKRQSEDLPEAVVLMRVLRDMNFPKFVFEDVPLFLGLIKDLFPGIDCPRIGYPDFNAA 2620
            ||..||.:|.:..:..|.::|:|.::|:|.|||:..|:|||.|:..||||||..|...|.:|   
  Rat  1456 VLVAAGNLKLKYPNENEDILLLRSIKDVNEPKFLSHDIPLFNGITSDLFPGIKLPEADYQEF--- 1517

  Fly  2621 VRHVLVNDGYILLPDQE--------DKVVQMYETMMTRHSTMLVGPTGGGKTVVINALVKAQTHM 2677
                 :...|.....|.        :|::|.||.|:.||..||||.....||.|::.|....|.|
  Rat  1518 -----LECAYEACETQNLQPVKFFLEKIIQTYEMMIVRHGFMLVGEPFAAKTEVLHILADTLTLM 1577

  Fly  2678 -----GLPTKCL--VLNPKACSVIELYGFLDMETRDWIDGLFSNIFREMNKPIEREERRYACFDG 2735
                 |...|.:  .:|||:.::.:|:|..|..:.:|.||:.:|.|||. ...|..:|::..|||
  Rat  1578 NERNYGDEEKVMYRTVNPKSITMGQLFGQFDPVSHEWTDGIVANTFREF-ALAESPDRKWVVFDG 1641

  Fly  2736 DVDALWIENMNSVMDDNKLLTLANGERIRLENYCALLFEVGNLNYASPATVSRAGMVYVDPKNLR 2800
            .:|.||||:||:|:||||.|.|.:||.|::....:|:||..:|:.||||||||.||:|::|..|.
  Rat  1642 PIDTLWIESMNTVLDDNKKLCLMSGEIIQMSPQMSLIFETMDLSQASPATVSRCGMIYLEPSQLG 1706

  Fly  2801 YSPFWQRWVLTRPEPQRE-----LLNDFFEKIITQSIAFILEGLDGTTQGNPLKLVIMQTDLNMV 2860
            :.|....|:.:..||..|     ||.:.|..::..|:.|         :....|.:|...::|.|
  Rat  1707 WEPIVASWLNSLKEPLNELEHQNLLKELFNWLVQPSLEF---------RRKKCKELIPTGNINAV 1762

  Fly  2861 TQFCNLYDALLPNYVMDSKNYDEPVQQNYNTDSLECCFLQAVYGSMGACLVEKHQPVFDEYMKRI 2925
            .....|.:.||...|     .::|..::... .:...|:.::..|:||......:..||.:::.:
  Rat  1763 VALTRLIEILLCTVV-----ENDPSSKHIRV-WIMATFVFSLIWSVGASCDTDGRLAFDNFLRSL 1821

  Fly  2926 -------SGFPLVQDTPENPASGGQFPQSKPTLYDYFWDVKD-NVWKAWEWVVQPY-THDPQVKF 2981
                   :..|:..:..|.|.      ..|..:|||.::::: ..|..|..:::.. ..|.:.|.
  Rat  1822 VTGKNDKAPMPVFINKWECPF------DEKGLVYDYMYELRNRGRWIHWNDLIKSSDIEDRRTKI 1880

  Fly  2982 SEILVPTVDNTRTNRTLSLMSEIKRPVLLVGEAGTSKTATIMQYLRN-LNPSVNVILNINFSSRT 3045
            .:|:|||:|..|....:.|.....:|:|.||..||.|:..:...|.| |.........:|||:||
  Rat  1881 QDIIVPTMDTIRYTFLMDLCISHAKPLLFVGPTGTGKSVYVKDKLMNHLEKGKYFPFYVNFSART 1945

  Fly  3046 SSLDVQHTLEAAVEKRTKDTYGPPMGKRIACFIDDMNMPQVDDYGTQQPIALLKLFFERGGMYDR 3110
            |:..||:.:.|.::||.|..:||||||:...||||||||.::.||.|.||.||:.||:.|..||.
  Rat  1946 SANQVQNIIMARLDKRRKGVFGPPMGKKCVVFIDDMNMPSLEKYGAQPPIELLRQFFDCGHWYDL 2010

  Fly  3111 DKDLNWKKFKDLTFYAAMGTAGGGRNEVDPRFISMFSTYNIIFPNDESLIQIYSSIFKGHMVFVK 3175
             ||.......|:...||||..|||||.|.||||..|:...|...:||::::|:|||...::....
  Rat  2011 -KDTTKITLVDIELIAAMGPPGGGRNAVTPRFIRHFNICTINSFSDETMVRIFSSIMMFYLRTHD 2074

  Fly  3176 FQPEYMLIADMIVHMTLKLFKMVIVDLPPTPSKFHYIFNLKDLSRIFAGMLLIEPTCFKGLRDLI 3240
            |.|||.::...||..|::::|..:.:|.|||:|.||.|||:|.||:..|.|||:....:....:|
  Rat  2075 FSPEYFVLGHQIVSATMEIYKQSMGNLLPTPAKSHYTFNLRDFSRVIRGCLLIDKEAIESKHTMI 2139

  Fly  3241 RVWRNEYTRIICDRLITDND-------IANVRRNLAVEVAERFPPTFEEEHGFIDAAAAEAEAQA 3298
            |::.:|..|:..||||.|.|       |.||       :.:.|..:.|.....:..         
  Rat  2140 RLFVHEVLRVFYDRLINDEDRNWLFLLIKNV-------IKDHFKESLENVFSHLRR--------- 2188

  Fly  3299 RLLYEPSKADIDGGEEEGEEEEEGEEAPQVILSLKDYVLRDPLLFGDFRNFTNESEPRLYEDLLD 3363
                        |.....||:                 ||: |:|||:.|...|.:.|:|.::|:
  Rat  2189 ------------GNSSINEED-----------------LRN-LMFGDYMNPDLEGDDRVYIEILN 2223

  Fly  3364 YNSVYFLFTEILEEYCE-RKQKMTLVLFEDCLEHLTRVHRTLRMNRGHVLLIGVGGSGKKCITRL 3427
            .:....:..:.|:||.: .|::|.||:|...||||:|:.|.|:.:.|:.||||:||||::.:|.|
  Rat  2224 IHQFNEVVDQCLDEYNQTHKRRMNLVVFRYVLEHLSRICRILKQSGGNALLIGLGGSGRQSLTSL 2288

  Fly  3428 AAFAAECDVFEITISRGYNEAAFREDLKVLYTIAGVKRKKVVFLFTGAQVAEEGFLELINNILTV 3492
            |...|:..:|:..||:.|....:|||:|.|....|||.:|.|||.|..|:.||.|||.|:::|..
  Rat  2289 ATSMAKMQIFQPEISKSYGMNEWREDIKSLLRNVGVKGQKTVFLITDTQIKEEAFLEDIDSVLNT 2353

  Fly  3493 GQVPALFPDEDKDGIVNQVRKFAE---EDGVSASKDAVWGYFLRTCAENLHVVLCMSPAGDALRN 3554
            |:||.:|..::|..::..||..|:   :.| ..|..|::.:|:..|.:|||||:..||.|||.||
  Rat  2354 GEVPNIFAADEKQEVMEGVRPVAQVGNKHG-ELSPLALFAFFVNRCKDNLHVVVAFSPIGDAFRN 2417

  Fly  3555 RCRNFPGLIGSTYIDWVFPWPRQALYAVAKLFLTEHRLIPASHREAIVEHVVHVHTSIQQYSKDY 3619
            |.|.||.||....|||..|||..||..||..||....|......| ||....|.||||...|:.:
  Rat  2418 RLRQFPSLINCCTIDWFQPWPEDALERVAVSFLETVELTEVERHE-IVPICKHFHTSIMNLSERF 2481

  Fly  3620 LAKLRRNNFVTPKHYLDYINTYRGLLEEKAKFITQQRSRLGEGIKKIEEASVQIDELRIIVTEQK 3684
            |.:|.|:|:||...||:.|.::|.||.:|.:.:.:.:.|...|:.::..|..|:.|:::.:.|.:
  Rat  2482 LEELGRHNYVTATSYLELIGSFRQLLTKKRQSVMEAKQRYVNGLDQLAFAESQVGEMKLELVELQ 2546

  Fly  3685 KNVAVASEECEAM--LVTIESSTQKANVKKAEASEKSVEV--EI---KGKQIAIEKDEAEEILAE 3742
            ..:..|..|...|  ::.|||:       :.||..|.|::  ||   |.::....|:|.|..|||
  Rat  2547 PKLEAAKVENARMMQIIEIESA-------QVEAKRKIVKLDEEIASGKAEEAQALKNECESDLAE 2604

  Fly  3743 AMPALEEARLALSQLEKAQITEIRSFATPPAAVQVVCECVAILKGYK--EIN------------W 3793
            |:||||.|..||..|:.|.||.::|...|||.|::|...|.::|..|  :|:            |
  Rat  2605 AIPALEAALSALDTLKPADITIVKSMKNPPAGVKLVMAAVCVMKDIKPEKISDPSGTGGKIFDYW 2669

  Fly  3794 KSAKGMMSDVNFLKSLMEMDCEALTQKQITQCRQHMKTGNLED---MAKISVAGAGLLRFVRAVL 3855
            ..:|.::.|:|||:.|.|.|.|.:....:.:.|....|....|   :||.|.|..||.:::.|:.
  Rat  2670 GPSKKLLGDMNFLRDLREYDKENIPVAVMQKIRSEYLTNPEFDPPKVAKASSAAEGLCKWIMAME 2734

  Fly  3856 GFFDVYKEVKPKKERLDFLVEEQEVQIKLLNHLNGEIQKLEEKLNELNENYATSMKQMRALTEMM 3920
            .:..|.|.|.|||.||....:.....::|||...||:.::|..|..|.:.:....::..||.:.:
  Rat  2735 VYDRVAKVVAPKKARLAEAQKSLAETMELLNQKRGELAQVEHHLENLQKTFQEKTEEKAALEDQV 2799

  Fly  3921 QQAERRLIASDKLISGLTSELIRWSKEMASLGQQLIDSVGGCLISASFLAYTGAFTWEFRKAMVF 3985
            :...::|..:.|||.||..|..|||:....|.....:..|..|:||..:||.||||..||:... 
  Rat  2800 ELCAKKLERATKLIGGLGGEKSRWSQAANDLQATYENLTGDVLVSAGVIAYLGAFTSGFRQECT- 2863

  Fly  3986 DDWLEDIASLGIPIQLPFKIDGYLTTDVEISQWSNEGLPPDELSIQNGILTMRASRFPLCIDPQL 4050
            :||.:.......|....|.:...|...|:|..|:..|||.|..||.||::...:.|:||.||||.
  Rat  2864 EDWSKLCKEKKFPCSEEFSLSKTLGDPVKIRAWNIAGLPTDTFSIDNGVIVNNSRRWPLMIDPQG 2928

  Fly  4051 QALQWIRKREFKNNLKVLSFSDSDFLKQLEMAIMYGTPVLFEDVDDYIDPVIDDILQKNIRIQGG 4115
            ||.:||:..|..|.|.|:..||||:::.||..|..|||||.|:|.:.:||.::.:|.:....|||
  Rat  2929 QANKWIKNSEKDNQLSVIKLSDSDYMRTLENCIQLGTPVLLENVGEDLDPSLEPLLLRQTFKQGG 2993

  Fly  4116 RKFVMLGDKEVDWDPSFRVYLTTKFSNPKFDPAVYAKALVINYTVTQTGLEDQLLSVVVGTERPD 4180
            ...:.||:..:::...|:.|:|||..||.:.|.:..|..::|:.:|..|||||||.:||..|||:
  Rat  2994 IDCIRLGEVIIEYSFDFKFYITTKLRNPHYMPELATKVSLLNFMITPEGLEDQLLGIVVAKERPE 3058

  Fly  4181 LEAQRESLIAQTSENKQLLQQLEDSLLRELSTSTGNMLDNVELIETLENTKTKAGVVMEQLKLAA 4245
            ||.:|.:||.|::.||:.|:.:|..:|..||.|.||:|::...|:.|::.|..:..:.::.::|.
  Rat  3059 LEEERNALILQSAANKKQLKDIETRILETLSCSEGNILEDESAIKVLDSAKMMSNEITKKQQVAE 3123

  Fly  4246 DTAADIEVLRNGYRPAAKRGAVLFFALSDMATVNSMYQYALAAYLDVFVYSLRKAVPDASLNKRL 4310
            .|...|...|.||||.||..:||||:::|:|.::.||||:|..::::::.|:..:.....|.|||
  Rat  3124 KTELKIAESREGYRPIAKHSSVLFFSIADLANIDPMYQYSLTWFVNLYINSIHDSNRSKILEKRL 3188

  Fly  4311 NNIIKTLTENVYCYGCTGIFERHKLLFSFQIATKLAQRDGILLQSELDFFIKGSIALTKSERSNP 4375
            ..:....|.|:||..|..:||:.||||||.:...|......:...||.|.:.|.::|..:|::..
  Rat  3189 RYLNDHFTYNLYCNICRSLFEKDKLLFSFLLCANLLLAKKEIEYQELMFLLTGGVSLKSAEKNPD 3253

  Fly  4376 CKWLSEKSWEDVLKLAFDFPDIFGTLPDHFGRYLTEWKEWFDLENPEEVPCPGDYNIKCNAFQKL 4440
            ..||.:||||::.: |.:.| :|..|.:||..::.||::.::.:.|..:..|...:...|..||:
  Rat  3254 PNWLQDKSWEEICR-ASELP-VFHGLREHFCNHIREWEDIYNSKEPHNMKLPESMDKTLNELQKI 3316

  Fly  4441 MFLRCFRVDRIFRSINQYIVETMDEFYIMPPVVSFSAIYEQTSSTIPVCFVLSAGSDPTNDLIKL 4505
            :.|||.|.|:|..:|..|:.:.:.:.::.||....:..|..::.|||:.||||.|:||...|:|.
  Rat  3317 IILRCLRPDKITPAITNYVTDKLGKKFVEPPPFDLTKSYLDSNCTIPLIFVLSPGADPMASLLKF 3381

  Fly  4506 A-DTIVGMSNFCHISLGQGQEKAALRLLDGAIKQGMWLMLQNGHLLIRFVRELEKHLDRI--ENP 4567
            | |..:..:.|..|||||||...|.:::..||::|.|:.|||.||.:.::..|||..:..  |..
  Rat  3382 ANDKSMSGNKFQAISLGQGQGPVATKMITAAIEEGTWVCLQNCHLAVSWMPTLEKICEDFSPEIC 3446

  Fly  4568 HPDFRLWITTDPTPTFPIGILQKSLKVVTEPPNGLKLNLRSTYFK---VRQERLESC--SHVAFR 4627
            :|.||||:|:.|:|.||:.|||..:|:..|||.||:|||..:|..   ...|....|  ..:|:.
  Rat  3447 NPTFRLWLTSYPSPKFPVTILQNGVKMTNEPPTGLRLNLLQSYLSDPISDPEFFNGCPGKELAWE 3511

  Fly  4628 PLVYVLAFFHAVVQERRKYDKLGWNIAYDFNDTDFDVCTEILRTYLTRCGTGKIPWNSLKYLIGE 4692
            .|::.:.||||:||||:|:..|||||.|.||::|..:....|:.::....|  ||:.::.||.||
  Rat  3512 KLLFGVCFFHALVQERKKFGPLGWNIPYGFNESDLRISIRQLQLFINEYDT--IPFEAISYLTGE 3574

  Fly  4693 VMYGGRVIDDFDRRITNCYMNEYMGDFLFDEFKVFHFYEDDNVDYCLPEEETILKEDYIAHIDKL 4757
            ..|||||.||:|||:....:.::....:.:.   .|:....:.:|..|.:.|.  ::||..|.||
  Rat  3575 CNYGGRVTDDWDRRLLLTMLADFYNSLIIEN---PHYKFSPSGNYFAPPKGTY--DEYIEFIKKL 3634

  Fly  4758 PLVNKPDVFGLHPNAEIGYYTMAARNIWNSLIELQ---PQTGEGTGGISRDDFIDSVAAGILKKL 4819
            |...:|::||||.|.:|.......:.::.||:..|   .|||...   |.|..:..:...||.:|
  Rat  3635 PFTQEPEIFGLHENVDISKDLQQTKLLFESLLLTQGGVKQTGSSG---STDQILLEITEDILTQL 3696

  Fly  4820 PPAFE------TWRIRKQIQMSLSPTGVVLLQELDRFNLLVVRIKKTLELLRKAIAGEIGMDNVL 4878
            |..|:      ::.:|.:..|:     .||:||::|||.|::.|:.||..|:|||.|.:.||:.|
  Rat  3697 PNDFDIEAALRSYPVRYEESMN-----TVLVQEMERFNNLIITIRNTLRDLKKAIKGVVVMDSAL 3756

  Fly  4879 DNIANSLFNGLLPAAWSKLAPATCKQLASWLEHLRLRAVQYKYWTLSGEPLVMWLSGLHIPQSYL 4943
            :.::.||..|.:|..|::.:..:.|.|.|::.....|....:.|...|:|.|.|:||....|::|
  Rat  3757 EALSGSLLIGKVPEMWAQRSYPSLKPLGSYITDFLTRLKFLEDWFTMGKPNVFWISGFFFTQAFL 3821

  Fly  4944 TALVQIACRRNAWPLDRSTLFTYVTKFADPDDVEERPVTGCLVHGLYIEGGRFDLATNQLARSHP 5008
            |..:|...|:...|:|   |..|..:....|:....|..|..:||||::|.|::..:..||..||
  Rat  3822 TGAMQNYARKYTIPID---LLGYEFEVIPSDNATNPPEDGVYIHGLYLDGARWNRTSGLLAEQHP 3883

  Fly  5009 KVLVEELAILAVEPIEAHRLKLQNTYLAPVYTTSLRRNAM-----GVGLVFEANLATSEDLSHWI 5068
            |:|.:.:.|:.::|.....:...:.|:.|:|.||.|:..:     ....|....|.|.....|||
  Rat  3884 KLLFDLMPIIWIKPNVKTEIVKTDAYVCPLYKTSERKGTLSTTGHSTNFVIAMLLRTELPAQHWI 3948

  Fly  5069 LQGVCLTLNTD 5079
            .:||.|....|
  Rat  3949 KRGVALLCQLD 3959

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
Dhc98DNP_524541.3 DHC_N1 523..983 CDD:285571
DHC_N2 1798..2201 CDD:285579 144/440 (33%)
P-loop_NTPase 2338..2565 CDD:304359 126/226 (56%)
P-loop_NTPase 2654..2788 CDD:304359 57/140 (41%)
P-loop_NTPase 2976..3246 CDD:304359 109/270 (40%)
P-loop_NTPase 3378..3645 CDD:304359 114/270 (42%)
MT 3658..3989 CDD:289543 109/354 (31%)
AAA_9 4017..4233 CDD:289547 89/215 (41%)
Dynein_heavy 4374..5068 CDD:281078 232/715 (32%)
Dnah12XP_006252733.1 DHC_N2 679..1110 CDD:285579 146/447 (33%)
P-loop_NTPase 1238..1468 CDD:304359 127/229 (55%)
P-loop_NTPase 1552..1695 CDD:304359 58/143 (41%)
P-loop_NTPase 1875..2145 CDD:304359 109/270 (40%)
P-loop_NTPase 2246..2507 CDD:304359 112/262 (43%)
MT 2519..2864 CDD:289543 108/352 (31%)
AAA_9 2896..3110 CDD:289547 88/213 (41%)
Dynein_heavy 3251..3948 CDD:281078 232/716 (32%)
Blue background indicates that the domain is not in the aligned region.


Information from Original Tools:


Tool Simple Score Weighted Score Original Tool Information
BLAST Result Score Score Type Cluster ID
Compara 00.000 Not matched by this tool.
Domainoid 00.000 Not matched by this tool.
eggNOG 00.000 Not matched by this tool.
Hieranoid 00.000 Not matched by this tool.
Homologene 00.000 Not matched by this tool.
Inparanoid 00.000 Not matched by this tool.
OMA 00.000 Not matched by this tool.
OrthoDB 00.000 Not matched by this tool.
OrthoFinder 00.000 Not matched by this tool.
OrthoInspector 00.000 Not matched by this tool.
orthoMCL 1 0.900 - - OOG6_100025
Panther 00.000 Not matched by this tool.
Phylome 1 0.910 - -
SonicParanoid 00.000 Not matched by this tool.
SwiftOrtho 1 1.000 - -
TreeFam 00.000 Not matched by this tool.
32.810

Return to query results.
Submit another query.