DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment Dhc98D and Dnah8

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_524541.3 Gene:Dhc98D / 43379 FlyBaseID:FBgn0013813 Length:5080 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_001414021.1 Gene:Dnah8 / 207117 RGDID:619986 Length:4727 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:5214 Identity:1529/5214 - (29%)
Similarity:2476/5214 - (47%) Gaps:741/5214 - (14%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly    95 EEVPRPPPT----------VPDKKGKGKKKGDARMAGGKSAGKAGASAGAAGKGRKKAGQDAAAP 149
            ||.|.|||:          .|.:.|.....||            |....|.|:..:..|.|.|:.
  Rat    16 EEAPPPPPSEDTAPPAEQAPPPEDGAPPPTGD------------GVEPSAEGEALQAEGIDPASL 68

  Fly   150 AGGDQEAVEEVNTGGETTDAEVEGELEGEEEATV------AGSGKSSARSRP-----------SS 197
            :..:..|:       ..||  ....:..:||.|:      :|.|:..||..|           |.
  Rat    69 SVQEDPAL-------NMTD--YRSLIPSDEEITMPPEDDESGQGRVRARLAPRPVQSVLSDGLSQ 124

  Fly   198 DTENGSKFRKKKATYVPVYVEVKKLVPAYVKTPQVHCHFGRMESCDLDPKIKYIYIVRKNRREIP 262
            .:...|||| :..|.:|...|..|...|..:    ....||  ...:||..|||:.:        
  Rat   125 SSRRSSKFR-RSMTGIPNLQETLKEKQARFR----EAREGR--RMKIDPSYKYIFEI-------- 174

  Fly   263 NFSDVSACFAQMPLYFLLGTVRGSLINSLRDDLNLVYKSAIQFQFREPATADSQQMDSYEG--QA 325
                             ||...|         |:||..        |....|...:|::..  :.
  Rat   175 -----------------LGEKLG---------LDLVSV--------EELILDCPSLDAFSSFFEK 205

  Fly   326 GGS-------GGGGAGGPAGETGEDISSEAKESGPGLLEL----SKPSEFRLRALKQQKKMKE-- 377
            |||       ..|..  |..|.|..|:...|  |..::.|    :.|           :|:||  
  Rat   206 GGSKTLKFLYQEGDV--PGLECGRTITGVPK--GGKMMRLYIDNAAP-----------EKLKELC 255

  Fly   378 ------KEAAAKKAKAKKTDAEPTEEEEEADAHK-----VEAHLSSSEEEVEIKVEKLTIGQRWE 431
                  :...|..:|....|...|    ..||.|     ::..|.:      |.:..:.....| 
  Rat   256 LFFVRCRNDVAINSKTIYEDVLFT----VLDASKGLLKGIKNMLKN------IFLPAILATGNW- 309

  Fly   432 KMLNETKAKVEAEHAAEEATPPRITPIQRRLLKEIEEFQSEITWTINHIVWAFSLPSSYILPGQE 496
            ..||::|.....:|.                          .|.|||.          |:|....
  Rat   310 GALNQSKQGESEKHI--------------------------FTETINR----------YLLFLDG 338

  Fly   497 AT-EFEDAIIRVPVDPKRLDLVITYTQ-----------QQLEEVVDGWIKYLKKTM--KTLTDAK 547
            || ..|..::...||......:.|:.:           .|||:|:..|.|.:::.:  ......:
  Rat   339 ATISIEGTVMLKKVDNIDFSKLHTFEEVTAAASSSEMVHQLEDVLMMWYKQIEQVLIESEQMRKE 403

  Fly   548 LDDFTPMAEHRYWHKMEVELYGTLEQLKTEFVVAVLQRLTDDKSPVLDEWQAVVEKTEARFKLAK 612
            .||..|:.|..:|.:|..:....:||:|.....||:..|....|.:|..|:.:..:.......:|
  Rat   404 ADDSGPLTELEHWKRMSAKFNYIIEQIKGPSCKAVINVLNVAHSKLLKNWRDLDARITDTANESK 468

  Fly   613 ENSDYLGTIIDYLEKVRSYESFKMVVLQIPNIMVGLRHIWTMSSHYCRDPEMQVLLCQISNVFVQ 677
            :|..||.|:....:.:.:|:...| ...|.|::..:|.|.::|.:|.....|..|..:::|..|.
  Rat   469 DNVRYLYTLEKVCQPLYNYDLVSM-AHGIQNLINAIRMIHSVSRYYNTSERMTSLFIKVTNQMVT 532

  Fly   678 KVKSII---NFENIFKYSATYTYETATNCANLLRCWKQAYKLSRQHIEDSGAGSRWEFDRVALFN 739
            ..|:.|   ...:::........:...:|..|.:.::.::..:|:.|.:|.....:|...:.:|.
  Rat   533 ACKAYITDGGTNHVWDQETPAVLKKIQDCIFLFKEYQASFHKTRKQILESSGEKSFEVSEMYIFG 597

  Fly   740 EVNHIHRVAVDIAYVGRVFVQYENLFGHRLKACIADPSIVDNLMRKVYRMLDDLIKSVDYDMFRP 804
            :.....:....|..:..:...|..|....::..    .|:....:.:|:.    ||...||:..|
  Rat   598 KFEAFCKRLEKITEMITIVQTYSALSNSTIEGI----DILGIKFKNIYQG----IKKNQYDILDP 654

  Fly   805 GNWENWEYSLELFNKRLDNVENEAKNVIDQSINSLLSSEKGLDLVVNAMNIDTRATLQEFVATKH 869
            ...| ::.....|..:::.:|.:.:..::.:...:|||::.|.|:.....:: ...||..:....
  Rat   655 RRTE-FDTDFSDFMGKINTLEIQIQAFMNITFGKILSSQQALQLLQRFQKLN-MPCLQLEINHTI 717

  Fly   870 ENLLRFFVTEINAVERVFTKLKKSPPMAKHQPAKISAIFWARLLGKKLKTSVLAFKRVEDEPAIK 934
            |.:|:.:|.|:.|.::::...|..||:|::.|.....|.|.|.|.:::...:..|.:..|   |.
  Rat   718 ERILQCYVAELEATKKLYHSQKDDPPLARNMPPIAGKILWVRQLYRRINEPINYFFKNSD---IL 779

  Fly   935 NSFLKRSSFKQYFELMTVMFQFEKVLFENFIQNATYLVNTTNRSNVLRIRICKESTMSYISEAVQ 999
            :|...::..:||.::..|:.:||.|....:::..                    |.:.|..:|..
  Rat   780 SSIEGKAVIRQYNKISYVLVEFEVVYHTAWVKEI--------------------SQLQYALQATL 824

  Fly  1000 TLKAKPRPELQMTSDRRVTPVKSSNLMPVQSEAFSAYSVADSAGTEISSESENEGLLVGDTSQKK 1064
            .::.....:|.:..|.::..|                                            
  Rat   825 FVRHPETGKLLVNFDPKILEV-------------------------------------------- 845

  Fly  1065 LMCRINRLTVLVAMIMWMVSNTRKANIQLQECTAFIKMVKDKKPKDVTAMDRHCVRTCELLQRAE 1129
                                        ::|....|||..| .|:                   :
  Rat   846 ----------------------------VRETKCMIKMKLD-VPE-------------------Q 862

  Fly  1130 SQYLLPIWRELVGEKTLIEYDMDFVVNLKRDVFDVLFEAQQFEHLGFTLPAV---LRTAIMKKDL 1191
            ::.||.:..:|..:|..::..:.:..:|.::|                 |:|   |.|..|||  
  Rat   863 AKKLLKLESKLKADKLYLQGLLQYYDDLCQEV-----------------PSVFVNLMTPKMKK-- 908

  Fly  1192 LFKDYERMTEVVDRYRSIINNLSMSEVIFLRGHIYDTELFIQMGVGRYTWTSFNIGKFCDQINSQ 1256
                                                .|..::.|:...||:|..:..|..::.|.
  Rat   909 ------------------------------------VESVLRQGLTVLTWSSLMLESFFKEVESV 937

  Fly  1257 LRKLTSIVSQIN-FIRLDLRSRIDMIKSFNLFNLDDE--LKVEDTSRSSGESYLQD----RKNPS 1314
            |.....::.::| ...:.:.:.:..|....|.:|.|.  .:||| ..:..|:|.::    ..:.|
  Rat   938 LDMFNQLLKKVNDLCEMHIDTVLKEIAKTLLISLSDSGATRVED-MLTLNETYTKEWADILNHKS 1001

  Fly  1315 QRFKSVTGETITMFSVEKDV-----PADEKAEQA--CGSGIYPCQGYFELLE---------ASRN 1363
            :..:....|.|.:|....:|     ||....||.  ...|....:|  |.||         ...|
  Rat  1002 RHVEEAVKELILIFEQIYEVKYTGKPAKPVPEQRKHVVFGSEADEG--ESLEYDPDSTARDVDNN 1064

  Fly  1364 RKAAQMKK------------LYDSLGPVL-VKLESLVLGTFSGRSDRMKTYYEYWEGETFKCIVD 1415
            .|..:.||            |.|||.... :.|:::....|.|...|.::               
  Rat  1065 DKEDEFKKECKEVYAFFSHQLLDSLQKATRLSLDTMKKRIFVGNQGRKRS--------------- 1114

  Fly  1416 MTYQNLKCYINRLLSNKPMFEVNAVLLMSEIVLEPSVQELQNTIVTATKDYISRLRIFTRW---- 1476
               :::..:|..        ||:  |.:..:|:.||:.::|..|....:..:...|....|    
  Rat  1115 ---EDVVSFIKT--------EVH--LAIPNVVMVPSLDDIQQAINRMIQLTLEVSRGVAHWGQQQ 1166

  Fly  1477 -------MTGTCIACPLVEMGKQFKYN-------------YTYYEDVIQIRSIVDLVINIHDLAS 1521
                   .|.:..:.....|||..|..             ..:|..|.:.:.|..||:.:....:
  Rat  1167 VRRTKSPQTSSRGSDQPSIMGKALKKEERSFEESIPARKLKNFYPGVAEHKDISKLVLLLSSSVN 1231

  Fly  1522 RVANEARGFVSQFRKYFNLWAFEKSFICQKFLEKQVTLIEIDEKFTFYSSIVETLANTRKFQDIK 1586
            .:...|...:..|:||..||..::....::||....:|.||..:...|::..:.:...:...|:.
  Rat  1232 SLRKAATEALQDFQKYKTLWTEDRDVKVKEFLANNPSLTEIRSEILHYATFEQEIEELKPIIDVG 1296

  Fly  1587 CVRINLEPLLASITQHAQDW----CTTLGEELLRHVNDNMRAMRNEVKTLSLNLNKTTRELEDFK 1647
            .:.::.||:..:::..|:.|    |..|.||..:.::|.:..:...:|.||    :..|:|:|.:
  Rat  1297 ALELHTEPMKLALSIEAKAWKMLLCRYLNEEYKKKMSDMIVFINEYLKKLS----RPIRDLDDVR 1357

  Fly  1648 LVMTTIGTVQSSTLTNEQKIHEMQETFTILSEHKIMFPYEDMLMAHHLEKRWKRLFLSALYRYEK 1712
            ..|..:..::.:.:..:..:..::|.:.||:..::....|:......|...:.:|...|:...::
  Rat  1358 FAMEALSCIRDNEIQMDMTLGPIEEAYGILNRFEVEVTKEESEGVDTLRYSFNKLQSKAVSVQDE 1422

  Fly  1713 LQPIKQKFADMTSVEIDEFCDDLAEFIKDYDENGPGSVGAELERGVRLMDPYGQKIAERE-SRRE 1776
            |..::.||.......:|.|.:|:..|.:.|:..||             |.|   .|..:| |.|.
  Rat  1423 LVQVQPKFKSSLLESVDVFREDVINFTEAYETEGP-------------MVP---NIPPQEASNRL 1471

  Fly  1777 ELANA---------------ERLFDMAMVDYHEFARVQTEFEGLQQLYKLYKAQKYAREGWGKTL 1826
            ::..|               |:||.:.:.||....:.:.|...||:||.||.....:..|:.:.|
  Rat  1472 QIFQANFDDLWRKFVTYSAGEQLFGLPVTDYEVLHKTRKELNLLQKLYGLYDTVMGSISGYYEIL 1536

  Fly  1827 WADLDPNVLTEGVESYLKEF----RKFTKAVRTLPVGVQLEIHMKQFKGTVPLMVSLKHEALRER 1887
            |.|:|    .|.:.:.|.||    ||..|.::.....:.|:..:..|..:.||:..:.::|:::|
  Rat  1537 WGDVD----IEKINAELLEFQNRCRKLPKGLKDWQAYLDLKKRIDDFSESCPLLEMMTNKAMKQR 1597

  Fly  1888 HWLQLMEKTGQYFDMSPARFTLENMFAMQLHKYQEIAEQILTNAIKELQIERGVQAVIETWASMA 1952
            ||.::.|.||..||:....|.|.|:....|.|.::..|.|..:||||..||..:..|||.|.:..
  Rat  1598 HWDRISELTGTPFDVESDTFCLRNIMEAPLLKNKDDIEDICISAIKEKDIEAKMTQVIENWTNQN 1662

  Fly  1953 FKTFKHFKGSDD---RGWVLGPVDEIMQILEDNAMNLQSMGASQFIGPFLETVNKWERTLALISE 2014
            . :|..|||..:   :|...|   ||:.::||:.|.|.|:.::::..||.:|:..|...|:..|:
  Rat  1663 L-SFSAFKGKGELLLKGTESG---EIITLMEDSLMVLGSLLSNRYNTPFKKTIQNWVYKLSTSSD 1723

  Fly  2015 IIDEWLVVQRKWLYLEGIFIGGDIRTQLPEEARKFDDIDKSYRRIMVDCAKNPLVVPFCT---VP 2076
            ||:||||||..|:|||.:|:||||..|||:||::|.:||||:.:||....:||.|:..|.   ..
  Rat  1724 IIEEWLVVQNLWVYLEAVFVGGDIAKQLPQEAKRFQNIDKSWVKIMQRAHENPNVISCCVGDETM 1788

  Fly  2077 GRLVEIQGLGIGLENCQKSLNEYLDSKRRIFPRFYFISTDELLSILG-SSEPSAVQNHIIKMYDN 2140
            |:|  :..|...||.|||||..||:.||.:||||:|:|...||.||| :|:...:|.|:..:.||
  Rat  1789 GQL--LPHLHEQLEVCQKSLTGYLEKKRLLFPRFFFVSDPVLLEILGQASDSHTIQPHLPAVSDN 1851

  Fly  2141 IKSLRLVKEGSQTIVTGMISSEGEVMEFRHSARAAGRVEYWMNDVLDEMRRSNRFINKTAIYDFG 2205
            |..:....:.... :|.:||.|||.:.......|.|.||.|:.|:|.....|...|.::|.|   
  Rat  1852 INEVTFHPKDYDR-MTAVISREGEKIMLDTPVMAKGPVEIWLLDLLKVQMSSLHNIIRSAFY--- 1912

  Fly  2206 TDLQISRPDWLM-----NYQGMVGLAASQVWWTAEVEEAFDQAQN-----HGNMRAMKDFLGKNN 2260
               |||...:|:     ::...|||...|:.||.:.|||.:.|::     |...:...|.|    
  Rat  1913 ---QISDSGFLLLPFLNHFPAQVGLLGIQMLWTHDSEEALNSAKDDRKIMHITNQKFLDIL---- 1970

  Fly  2261 YQIEELVLKVRSNLSRNDRLKFKAQCTVDVHARDIIDNFVRDNVLDASEFSWESQLRFYWIKFYD 2325
               ..|:.:...:|::.||:||:...|:.||.|||.|:.|:.::...::|.|..|.|||:.:..|
  Rat  1971 ---NTLISQTTHDLTKFDRVKFETLITIHVHQRDIFDDLVKMHIKSVTDFEWLKQSRFYFKEDLD 2032

  Fly  2326 NLHVLQCSGSFDFGYEYMGLNGRLVITPLTDRIYLTITQALLMNLGGAPAGPAGTGKTETVKDLA 2390
            ...|......|::..|::|...||||||||||.|:|:.|||.||:|||||||||||||||.||:.
  Rat  2033 QTVVSITDVDFNYQNEFLGCTDRLVITPLTDRCYITLAQALGMNMGGAPAGPAGTGKTETTKDMG 2097

  Fly  2391 KAMGLLCVVTNCGEGMDYRAVGTILSGLVQCGAWGCFDEFNRIDISVLSVISTQLQTIRNGLIRK 2455
            :.:|...||.||.:.||:|.:|.|..||.|.|:||||||||||::.||||.:.|:..:......:
  Rat  2098 RCLGKYVVVFNCSDQMDFRGLGRIFKGLAQSGSWGCFDEFNRIELPVLSVAAQQIYIVLTARKER 2162

  Fly  2456 LDRFVF-EGVEIHLDPKCGVFVTMNPGYAGRTELPESVKALFRPVTCIKPDLELICLISLFSDGF 2519
            ..:|:| :|..:.|:|:.|:|:|||||||||.||||::|..||.|..:.||.::|..:.|.|.||
  Rat  2163 KKQFIFSDGDCVDLNPEFGIFLTMNPGYAGRQELPENLKIQFRTVAMMVPDRQIIMRVKLASCGF 2227

  Fly  2520 LTAKVLAKKMTVLYSLAQAQLSKQCHYDWGLRSLNSVLRMAGVMKRQSEDLPEAVVLMRVLRDMN 2584
            |...:||:|..|||.|.:.||:||.|||:|||::.||||..|..||...:..|...:||.|||||
  Rat  2228 LENVILAQKFYVLYKLCEEQLTKQVHYDFGLRNILSVLRTLGSQKRARPEDSELSTVMRGLRDMN 2292

  Fly  2585 FPKFVFEDVPLFLGLIKDLFPGIDCPRIGYPDFNAAVRHVLVNDGYILLPDQEDKVVQMYETMMT 2649
            ..|.|.||.||||.||.|||||:......|.:..|||.:.:..:|.|..|....|:||:|||.:.
  Rat  2293 LSKLVDEDEPLFLSLINDLFPGLQLDSNTYAELQAAVDNQVNLEGLINHPPWNLKLVQLYETSLV 2357

  Fly  2650 RHSTMLVGPTGGGKTVVINALVKAQTHMGLPTKCLVLNPKACSVIELYGFLDMETRDWIDGLFSN 2714
            ||..|.:||:|.|||.||..|:|:.|..|.|.:.:.:||||.:..:::|.||..|.||.||:||.
  Rat  2358 RHGLMTLGPSGSGKTTVITILMKSLTECGRPHREMRMNPKAITAPQMFGRLDTATNDWTDGIFST 2422

  Fly  2715 IFREMNKPIEREERRYACFDGDVDALWIENMNSVMDDNKLLTLANGERIRLENYCALLFEVGNLN 2779
            ::|:..| .::.|..:...||.|||:||||:|||:||||.||||||:||.:...|.|||||.|:.
  Rat  2423 LWRKTLK-AKKGENIFLILDGPVDAIWIENLNSVLDDNKTLTLANGDRIPMAPTCKLLFEVHNIE 2486

  Fly  2780 YASPATVSRAGMVYVDPKNLRYSPFWQRWVLTRPEPQRELLNDFFEKIITQSIAFILEGLDGTTQ 2844
            .||||||||.||||:....|.:.|..|.|:..|.:.:.......::|:...:..::         
  Rat  2487 NASPATVSRMGMVYISSSALSWRPILQAWLKRRTQQEATAFLSLYDKVFEDAYTYM--------- 2542

  Fly  2845 GNPLKLV--IMQTDLNMVTQFCNLYDALLPNYVMDSKNYDEPVQQNYNTDSLECCFLQAVYGSMG 2907
              .|.|:  :...:.|.:||..||.:.|:|:......:         :.|.|...|:..:..|:|
  Rat  2543 --KLNLIPKMQLLECNYITQSLNLLEGLIPSKEEGGVS---------SVDHLHKLFVFGLMWSLG 2596

  Fly  2908 ACLVEKHQPVFDEYMKRISGFPLVQDTPENPASGGQFPQSKPTLYD-YFWDVKDNVWKAWEWVVQ 2971
            |.|..:.:...:.:::   |.....:.||..      ..|..|:|: |..|..|  |:.|...:|
  Rat  2597 ALLELESREKLEVFLR---GHESKLNLPEIA------KDSHHTMYEFYVTDYGD--WEHWNKRLQ 2650

  Fly  2972 PYTH--DPQVKFSEILVPTVDNTRTNRTLSLMSEIKRPVLLVGEAGTSKTATIMQYLRNLNPSVN 3034
            ||.:  |...::|.||||.|||.|||..:..:::..:.|||.||.||:||..:..||:..:|.|.
  Rat  2651 PYFYPTDSIPEYSSILVPNVDNIRTNFLIDTIAKQHKAVLLTGEQGTAKTVMVKAYLKKYDPEVQ 2715

  Fly  3035 VILNINFSSRTSSLDVQHTLEAAVEKRTKDTYGPPMGKRIACFIDDMNMPQVDDYGTQQPIALLK 3099
            :..::||||.|..:..|.|:|:.|:||...|||||.|:::..||||:|||.::::|.|....:::
  Rat  2716 LSKSLNFSSATEPMMFQRTIESYVDKRMGSTYGPPGGRKMTVFIDDINMPVINEWGDQITNEIVR 2780

  Fly  3100 LFFERGGMYDRDKDLNWKKFKDLTFYAAMGTAGGGRNEVDPRFISMFSTYNIIFPNDESLIQIYS 3164
            ...|..|||..||..::....|:...|||...|||||::..|....|:.:|...|::.|:.:|:.
  Rat  2781 QMMEMEGMYSLDKPGDFTTIVDVQLIAAMIHPGGGRNDIPQRLKRQFTVFNCTLPSNTSIDKIFG 2845

  Fly  3165 SIFKGHM-VFVKFQPEYMLIADMI---VHMTLKLFKMVIVDLPPTPSKFHYIFNLKDLSRIFAGM 3225
            .|..|:. ...||:||   |.|||   |.:...|::...|.:.||||||||||||:|||||:.||
  Rat  2846 IIGCGYFDPCRKFRPE---ICDMIGNLVSVGRVLWQWTKVKMLPTPSKFHYIFNLRDLSRIWQGM 2907

  Fly  3226 LLIEPTCFKGLRDLIRVWRNEYTRIICDRLITDND--------IANVRRNLAVEVAERFPPTFEE 3282
            |.|:....|.:..|:.::::|..|:|.||.||.:|        |..|..|::.|||....|    
  Rat  2908 LTIKAEECKTIPILMALFKHECNRVIADRFITPDDEQWFNTQLIRAVEENISPEVAASINP---- 2968

  Fly  3283 EHGFIDAAAAEAEAQARLLYEPSKADIDGGEEEGEEEEEGE-EAPQVILSLKDYVLRDPLLFGDF 3346
            |..|:|.        .|.:.||:          |:|.|:.. |.|::      |.|.....|   
  Rat  2969 EPYFVDF--------LRDMPEPT----------GDEPEDTMFEVPKI------YELVPSFEF--- 3006

  Fly  3347 RNFTNESEPRLYEDLLDYNSVYFLFTEILEEYCERKQKMTLVLFEDCLEHLTRVHRTLRMNRGHV 3411
                      |.|.|..|..   .|.||:     |...:.||.|:|.:.||.::.|.:|.:.|:.
  Rat  3007 ----------LCEKLQFYQK---QFNEII-----RGTSLDLVFFKDAMTHLIKISRIIRTSCGNA 3053

  Fly  3412 LLIGVGGSGKKCITRLAAFAAECDVFEITISRGYNEAAFREDLKVLYTIAGVKRKKVVFLFTGAQ 3476
            ||:|||||||:.::|||:|.|...:|:||::|.||.:...:|||.||.:||...|.:.|:||..:
  Rat  3054 LLVGVGGSGKQSLSRLASFIAGYQIFQITLTRSYNVSNLIDDLKNLYKVAGADGKGITFIFTDNE 3118

  Fly  3477 VAEEGFLELINNILTVGQVPALFP----DEDKDGIVNQVRKFAEEDGVSASKDAVWGYFLRTCAE 3537
            :.:|.|||.:||:|:.|::..||.    ||...|:::.:::  |......:.|.::.||:.....
  Rat  3119 IKDEAFLEYLNNLLSSGEISNLFARDELDEITQGLISVMKR--ELPRHPPTFDNLYEYFISRSRR 3181

  Fly  3538 NLHVVLCMSPAGDALRNRCRNFPGLIGSTYIDWVFPWPRQALYAVAKLFLTEHRLIPASHREAIV 3602
            |||||||.||.|:..|.|...|||||....:||...||::||.|||..||:::.::.:..   |.
  Rat  3182 NLHVVLCFSPVGEKFRARSLKFPGLISGCTMDWFSRWPKEALIAVASYFLSDYNIVCSME---IK 3243

  Fly  3603 EHVVHV----HTSIQQYSKDYLAKLRRNNFVTPKHYLDYINTYRGLLEEKAKFITQQRSRLGEGI 3663
            .|||..    |..:.:..::|..:.||...||||.||.:||.|:.:..||.|:|.:|..|:..|:
  Rat  3244 RHVVEAMGLFHDMVSESCENYFQRYRRRAHVTPKSYLSFINGYKNIYTEKVKYINEQAERMNIGL 3308

  Fly  3664 KKIEEASVQIDELRIIVTEQKKNVAVASEECEAMLVTIESSTQKANVKKAEASEKSVEVEIKGK- 3727
            .|:.|||..:.:|...:..::|.:||||.:.:.:|..:..|.|      |.|..|:...|:|.| 
  Rat  3309 DKLMEASESVAKLSQDLAVKEKELAVASVKADEVLAEVTVSAQ------ASAKVKNEVQEVKDKA 3367

  Fly  3728 -----QIAIEKDEAEEILAEAMPALEEARLALSQLEKAQITEIRSFATPPAAVQVVCECVAIL-- 3785
                 :|..||.:||..|..|.||||||..||:.::...|..:|..|.||..:..:.:||.:|  
  Rat  3368 QKIVDEIDSEKVKAESKLEAAKPALEEAEAALNTIKPNDIATVRKLAKPPHLIMRIMDCVLLLFQ 3432

  Fly  3786 -----------KGYKEINWKSAKGMMSDVNFLKSLMEMDCEALTQK--QITQCRQHMKTGNLEDM 3837
                       |...:.:|..:..:||...||.||.:...:.:.::  ::.|...:|.....|..
  Rat  3433 KKIDPVTMDPEKPCCKPSWGESLKLMSATGFLFSLQQFPKDTINEETVELLQPYFNMDDYTYESA 3497

  Fly  3838 AKISVAGAGLLRFVRAVLGFFDVYKEVKPKKERLDFLVEEQEVQIKLLNHLNGEIQK-LEEKLNE 3901
            .|:....||||.:..|:..|:.:.:||.|.|..|    .:||.::.:.|...|:.|. |:||..|
  Rat  3498 KKVCGNVAGLLSWTLAMAIFYGINREVLPLKANL----AKQEGRLAVANAELGKAQALLDEKQAE 3558

  Fly  3902 LNENYATSMKQMRALTEMMQQAE---RRLIASDKLISGLTSELIRWSKEMASLGQQLIDSVGGCL 3963
            |::..|.....|....:::..|:   :::.|:..||.||:.|.:||:::......|:...||..|
  Rat  3559 LDKVQAKFDAAMNEKMDLLNDADMCRKKMQAASTLIDGLSGEKVRWTQQSKEFKAQINRLVGDVL 3623

  Fly  3964 ISASFLAYTGAFTWEFRKAMVFDDWLEDIASLGIPIQLPFKIDGYLTTDVEISQWSNEGLPPDEL 4028
            :...||:|.|.|...||..::.|.|..::.:..||......:...|.....|.:|..:|||.|:|
  Rat  3624 LCTGFLSYLGPFNQIFRNYLLKDQWELEMKARKIPFTENLNLIAMLVDPPTIGEWGLQGLPGDDL 3688

  Fly  4029 SIQNGILTMRASRFPLCIDPQLQALQWIRKREFKNNLKVLSFSDSDFLKQLEMAIMYGTPVLFED 4093
            ||||||:..:|:|:||.||||.|...||:.:|.:|:|:|.|.:...|...||.::..|.|:|.||
  Rat  3689 SIQNGIIVTKATRYPLLIDPQTQGKTWIKSKEKENDLQVTSLNHKYFRTHLEDSLSLGRPLLIED 3753

  Fly  4094 VDDYIDPVIDDILQKNIRIQGGRKF-VMLGDKEVDWDPSFRVYLTTKFSNPKFDPAVYAKALVIN 4157
            :.:.:||.:|::|:||. |:.|..| |.:||||.|...:|::|:|||..||.|.|.:.||..||:
  Rat  3754 IREELDPALDNVLEKNF-IKSGTAFKVKVGDKECDIMDTFKLYITTKLPNPAFTPEINAKTSVID 3817

  Fly  4158 YTVTQTGLEDQLLSVVVGTERPDLEAQRESLIAQTSENKQLLQQLEDSLLRELSTSTGNMLDNVE 4222
            :|||..|||:|||..|:.||:.:||::|..|:...:.||:.:::|||:||.:|||:.|:::|:..
  Rat  3818 FTVTMKGLENQLLRRVILTEKQELESERVKLLEDVTFNKRKMKELEDNLLYKLSTTQGSLVDDES 3882

  Fly  4223 LIETLENTKTKAGVVMEQLKLAADTAADIEVLRNGYRPAAKRGAVLFFALSDMATVNSMYQYALA 4287
            ||..|..||..|..|.|:|.:||:|...|...:..:||||.||::|:|.:::|:.||.|||.:||
  Rat  3883 LIGVLRITKQTAAEVSEKLHVAAETEIKINTAQEEFRPAATRGSILYFLITEMSMVNIMYQTSLA 3947

  Fly  4288 AYLDVFVYSLRKAVPDASLNKRLNNIIKTLTENVYCYGCTGIFERHKLLFSFQIATKLAQRDGIL 4352
            .:|.:|..|:.::.......||:.|||:.||..|:.|...|::|.||.||:..:..|:..:.|.:
  Rat  3948 QFLKLFDQSMARSEKSPLPQKRITNIIEYLTYEVFTYSVRGLYENHKFLFALLMTLKIDLQRGTV 4012

  Fly  4353 LQSELDFFIKGSIAL-TKSERSNPCKWLSEKSWEDVLKLAFDFPDIFGTLPDHFGRYLTEWKEWF 4416
            ...|....|||..|| .|:....|.:|:.:.:|.::::|: ..|. |..:.:...|....||.||
  Rat  4013 KHKEFQALIKGGAALDLKACPPKPFRWILDMTWLNLVELS-KLPQ-FAEIMNQISRNEKGWKNWF 4075

  Fly  4417 DLENPEEVPCPGDYNIKCNAFQKLMFLRCFRVDRIFRSINQYIVETMDEFYIMPPVVSFSAIYEQ 4481
            |.:.|||...|..||...:..:||:.:|.:..||......:||.::::|.|..|.:::....:|:
  Rat  4076 DKDAPEEEIIPDGYNDSLDTCRKLLLIRSWCPDRTVFQARKYIADSLEEKYTEPVILNLEKTWEE 4140

  Fly  4482 TSSTIP-VCFVLSAGSDPTNDLIKLADTIVGMSNFCH-ISLGQGQEKAALRLLDGAIKQGMWLML 4544
            :.:..| :|| ||.|||||..:..||..   :...|. ||:|||||..|.:|:..:::||.|::|
  Rat  4141 SDTHTPLICF-LSMGSDPTIQIDALAKK---LKLECRTISMGQGQEVHARKLVQLSMQQGGWVLL 4201

  Fly  4545 QNGHLLIRFVRELEKHLDRIENPHPDFRLWITTDPTPTFPIGILQKSLKVVTEPPNGLKLNLRST 4609
            ||.||.:.|:.||.:.|...|.....||:||||:|...|||.:||.|||...|||.|::..|:.|
  Rat  4202 QNCHLGLEFMEELLETLMVTETTEDSFRVWITTEPHDRFPITLLQTSLKFTNEPPQGVRAGLKRT 4266

  Fly  4610 YFKVRQERLESCSHVAFRPLVYVLAFFHAVVQERRKYDKLGWNIAYDFNDTDFDVCTEILRTYLT 4674
            :..:.|:.|:..:...::|::|.:||.|:.||||||:..|||||.|:||..||....:.::.:|.
  Rat  4267 FAGINQDLLDISNLPMWKPMLYTVAFLHSTVQERRKFGPLGWNIPYEFNSADFSASVQFIQNHLD 4331

  Fly  4675 RCGTGK-IPWNSLKYLIGEVMYGGRVIDDFDRRITNCYMNEYMGDFLFDEFKVFHFYEDDNVDYC 4738
            .|...| :.|::::|:||||.|||||.||||:|:.||:...:..:.:|:  ..|.||    ..|.
  Rat  4332 ECDIKKGVSWSTVRYMIGEVQYGGRVTDDFDKRLLNCFARVWFSEKMFE--PSFCFY----TGYK 4390

  Fly  4739 LPEEETILKEDYIAHIDKLPLVNKPDVFGLHPNAEIGYYTMAARNIWNSLIELQPQTGEGTGGIS 4803
            :|..:|:  :.|..:|..||.::.|:||||||||:|.|.:..|.::..::..:||:...|..|.:
  Rat  4391 IPVCKTL--DQYFEYIQSLPSLDNPEVFGLHPNADITYQSNTASDVLETITNIQPKESGGGMGET 4453

  Fly  4804 RDDFIDSVAAGILKKLPPAFETWRIRKQIQM--SLSPTGVVLLQELDRFNLLVVRIKKTLELLRK 4866
            |:..:..::..:|.||||.:....::.::..  .|:...:.|.||:||...::..::.:|..|:.
  Rat  4454 REAIVYRLSEDMLSKLPPNYVAHEVKARLMKMGHLNSMNIFLRQEIDRMQRVISLLRNSLNDLKL 4518

  Fly  4867 AIAGEIGMDNVLDNIANSLFNGLLPAAWSKLAPATCKQLASWLEHLRLRAVQYKYWTLSGEPLVM 4931
            ||.|.|.|...|.:..:::::..:|..|.::: .....|..|...|..|..|:..|...|.|.|.
  Rat  4519 AIEGTIIMSENLRDALDNMYDARIPQLWKRVS-WDSSTLGFWFTELLERNAQFSTWIFEGRPNVF 4582

  Fly  4932 WLSGLHIPQSYLTALVQIACR-RNAWPLDRSTLFTYVTKFADPDDVEERPVTGCLVHGLYIEGGR 4995
            |::|...||.:|||:.|...| ...|.||..|:...|.: ...:::...||.|..::|||::|..
  Rat  4583 WMTGFFNPQGFLTAMRQEVTRAHKGWALDSVTIHNEVLR-QTKEEIITPPVEGVYIYGLYMDGAS 4646

  Fly  4996 FDLATNQLARSHPKVLVEELAILAVEPIEAHRLKLQNTYLAPVYTTSLRRNAMGVGLVFEANLAT 5060
            :|....:|..|.||||..:|.:|.:..|.:...|....|:.|:|....|.:...:.:|:   |.|
  Rat  4647 WDRRNGKLTESTPKVLFMQLPVLHIYAINSTAPKDPKLYVCPIYKKPRRTDLTFITVVY---LRT 4708

  Fly  5061 SEDLSHWILQGVCL 5074
            .....||||:||.|
  Rat  4709 VLSPDHWILRGVAL 4722

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
Dhc98DNP_524541.3 DHC_N1 523..>968 CDD:462457 91/449 (20%)
DHC_N2 1795..2196 CDD:462462 146/411 (36%)
DYN1 1999..4719 CDD:227570 1028/2790 (37%)
AAA_6 2338..2664 CDD:463697 164/326 (50%)
Dynein_C 4778..5076 CDD:465677 82/300 (27%)
Dnah8NP_001414021.1 None

Return to query results.
Submit another query.