DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment Dhc98D and Dnah1

DIOPT Version :9

Sequence 1:NP_524541.3 Gene:Dhc98D / 43379 FlyBaseID:FBgn0013813 Length:5080 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_001028827.2 Gene:Dnah1 / 171339 RGDID:621795 Length:4250 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:4302 Identity:1332/4302 - (30%)
Similarity:2168/4302 - (50%) Gaps:546/4302 - (12%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly   970 YLVNTTNRSNVLRIRICKESTMSYISEAVQTLKAKPR--------PELQM---TSDRRV--TPVK 1021
            |||..|::..::|    .|..|..::..| |.:.:|.        |.:|:   ..|.||  ..|.
  Rat   302 YLVQKTDKRGLVR----DEMGMPIVNGGV-TPEGRPPLLDTQYWVPRIQLLFCAEDPRVFTQRVV 361

  Fly  1022 SSNLMPVQSEAFSAYSV-ADSAGTEISSESENEGLLVGDTSQKKLMCRINRLTVLVAMIMWMVSN 1085
            .:|.:...:||...|:: .|...||...       ::.:.|..|:.             .|.:|.
  Rat   362 QANALRKNTEALLLYNLYVDCMPTEGQR-------VINEQSLSKIK-------------QWALST 406

  Fly  1086 TRKANIQLQECTAFIKMVKDKKPKDVTAMDRHCVRTCELLQRAES--QYLLPIWRE--LVGEKTL 1146
            .|                                     :::..|  ::|..:.||  |..|:::
  Rat   407 PR-------------------------------------MRKGPSVLEHLSSLAREVNLDYERSM 434

  Fly  1147 IEYDMDFVVNLKRDVFDVLFEAQQFEHLGFTLPAVLRTAIMKKDLLFKDYERMTEVVDRYRSIIN 1211
            .:.:.|.:|:.|.:.|..:           |||......:..:.|:........|..:.: :.::
  Rat   435 NKINFDQIVSSKPETFSFV-----------TLPEKEEEKVPNQGLVSVPEYPFREQKEDF-TFVS 487

  Fly  1212 NLSMSEVIFLRGHIYDTELFIQMGVGRYTWTSFNIGKFCDQINSQLRKLTSIVSQINFIRLDLRS 1276
            .|:.||||        |.|                    .::.::..|:||:  .:....|...|
  Rat   488 LLTRSEVI--------TAL--------------------SKVRAECNKVTSM--SLFHSNLSKYS 522

  Fly  1277 RIDMIKSFNLFNLDDELKVEDTSRSSGESYLQDRKNPSQRFKSVTGETITMFSVEKDVPADEKAE 1341
            |::..:           :::..:.|..:.:|:|        ..::...:.|.|..:|:       
  Rat   523 RLEEFE-----------QIQSQTFSQVQMFLKD--------SWISTLKVAMRSSLRDM------- 561

  Fly  1342 QACGSGIYPCQGYFELLEA-------SRNRKAAQMKK----------LYDSLG-----------P 1378
                     .:|::.|.|.       |:.||..::.|          :.||||           .
  Rat   562 ---------SKGWYNLYETNWEVYLMSKLRKLMELIKYMLQDTLRFLVQDSLGSFAQFIGDACCS 617

  Fly  1379 VLVKLESLVLGTFSGRSDRMKTYYEYWEGETFKCIVDMTYQNLKCYINRLLSNKPMFEVNAVLLM 1443
            ||..::.:..|     .|.:.:.|:..:...|  |||:...|...:.:..|.   .|||..:.|.
  Rat   618 VLECIDDMDWG-----EDLINSPYKPRKNPLF--IVDLVLDNTGVHYSTPLE---QFEVILLNLF 672

  Fly  1444 SE-IVLEPSVQELQNTIVTATKDYISRLRIFTRWMTGTCIACPLVEMGKQFKYNYTYYEDVIQIR 1507
            .: |:...:|.:|:..::   :|      ||   ::|.    ||:|       :...:|.:::  
  Rat   673 DKGILATHAVPQLEKLVM---ED------IF---ISGD----PLLE-------SVGLHEPLVE-- 712

  Fly  1508 SIVDLVINIHDLASRVANEARGFVSQFRKYFNL-----WAFEKSF--ICQKFLE-KQVTLIEIDE 1564
               :|..||.:...:.....:.:..::|||..|     ..|.|::  .|....| ::|.:..:.|
  Rat   713 ---ELRANITNAMHKAMIPLQAYAKEYRKYLELNNNDISTFLKTYQTQCPSAEEVREVVITHLKE 774

  Fly  1565 KFTFYSSIVETLANTRKFQDIKCVRINLEPLLASITQHAQDWCTTLGEELLRHVNDNMRAMRNEV 1629
            |....:|:..::.       |....||::.:..|:::..:...|::.:.|.:::::.:.::..|.
  Rat   775 KEILDNSLPSSII-------IGPFYINVDNVKQSLSKKRKALATSMLDILAKNLHNEVDSICEEF 832

  Fly  1630 KTLSLNLNKTTRELEDFKLVMTTIGTVQSSTLTNEQKIHEMQETFTILSEHKIMFPYE------- 1687
            :::|..:.:....:|:...:...:..:....:..|::|.::...:.::.|    |.|.       
  Rat   833 RSISRKIYEKPNSIEELAELRDWMKGIPEKLVILEERIVKVMSDYEVMDE----FFYNLTTDDFN 893

  Fly  1688 ----------------DMLMAHHL--EKRWKRLFLSALYRY-EKLQPIKQKFADM-TSVEIDEFC 1732
                            ||:...|:  |::::::.|.....: |||:.::...|.. |.|||    
  Rat   894 DKWAANNWPTKILGQIDMVRQQHVEDEEKFRKIQLMDQNNFQEKLEGLQLVVAGFSTHVEI---- 954

  Fly  1733 DDLAEFIKDYDENGPGSVGAELERGVRLMDPYGQKIAERESRREELA----NAERLFDMAMVDYH 1793
                            :...|:...||       ::.::....::||    |.||:|.:.:.:|.
  Rat   955 ----------------ARAHEIANEVR-------RVKKQLKDCQQLAMLYNNRERIFGLPITNYD 996

  Fly  1794 EFARVQTEFEGLQQLYKLYKAQKYAR--EGWGKTLWADLDPNVLTEGVESYLKEFRKFTKAVRTL 1856
            :.:|:..||:....|:.  .|..:.|  |.|.....:.:|...|.:.|....|...|..|..:.:
  Rat   997 KLSRMVKEFQPYLDLWT--TASDWLRWSESWMNDPLSAIDAEQLEKNVIESFKTMHKCVKQFKDI 1059

  Fly  1857 P----VGVQLEIHMKQFKGTVPLMVSLKHEALRERHWLQLMEKTGQYFDMSP-ARFTLENMFAMQ 1916
            |    |.:.:...:.:||..:||:..|::..:|.|||..|..:..  .::.| |..|......|.
  Rat  1060 PACQDVALDIRARIDEFKPYIPLIQGLRNPGMRNRHWEVLSNEIN--INVRPKANLTFARCLEMN 1122

  Fly  1917 LHKYQEIAEQILTNAIKELQIERGVQAVIETWASMAFKTFKHFKGSDDRGWVLGPVDEIMQILED 1981
            |..|.|...::...|.||..||:.:..:.:.|||:.|.... :|.:|.  ::|...||..|:|:|
  Rat  1123 LQDYIESISKVAEVAGKEYAIEQALDKMEKEWASILFNVLP-YKETDT--YILKSPDEASQLLDD 1184

  Fly  1982 NAMNLQSMGASQFIGPFLETVNKWERTLALISEIIDEWLVVQRKWLYLEGIFIGGDIRTQLPEEA 2046
            :.:..|||..|.:..||.:.:|.||..|.|..|:::|||..||.|||||.||...||..|||.|:
  Rat  1185 HIVMTQSMSFSPYKKPFEQRINSWETKLKLTQEVLEEWLNCQRSWLYLEPIFSSEDITRQLPVES 1249

  Fly  2047 RKFDDIDKSYRRIMVDCAKNPLVVPFCTVPGRLVEIQGLGIGLENCQKSLNEYLDSKRRIFPRFY 2111
            :::..:::.:|:||.:..:|..|:..|:....|..::.....|:..||.|:|||::||..|||||
  Rat  1250 KRYQTMERIWRKIMKNAYENREVINVCSDQRLLDSLRDCNKLLDLVQKGLSEYLETKRTAFPRFY 1314

  Fly  2112 FISTDELLSILG-SSEPSAVQNHIIKMYDNIKSLRLVKEGSQTIVTGMISSEGEVMEFRHSARAA 2175
            |:|.||||.||. :.:|:|||.|:.|.::||..| |.:|..:  :|.|.|:|||.::...|...:
  Rat  1315 FLSDDELLEILSQTKDPTAVQPHLRKCFENIARL-LFQEDLE--ITHMYSAEGEEVKLSFSIYPS 1376

  Fly  2176 GRVEYWMNDVLDEMRRSNRFINKTAIYDFGTDLQISRPDWLMNYQGMVGLAASQVWWTAEVEEAF 2240
            ..||.|:.:|...|:.|...|.:.||..:.|.|   |.:|::::.|.|.:|..|.:||.||.:|.
  Rat  1377 SNVEDWLLEVERSMKASVHDIIEMAIKAYPTML---RTEWVLSWPGQVTIAGCQTYWTLEVAQAL 1438

  Fly  2241 DQAQNHGNMRAMKDFLGKNNYQIEELVLKVRSNLSRNDRLKFKAQCTVDVHARDIIDNFVRDNVL 2305
            :.:....::...   |.|   |:.:||..||..|||..|:...|...::|||:|::...:.:||:
  Rat  1439 EASSISSSLFPQ---LSK---QLSDLVALVRGKLSRMQRMVLSALIVIEVHAKDVVSKLIDENVV 1497

  Fly  2306 DASEFSWESQLRFYWIKFYDNLHVLQCSGSFDFGYEYMGLNGRLVITPLTDRIYLTITQALLMNL 2370
            ...:|.|.||||:||..  ::|::...:..|.:||||:|.:|||||||||||.|||:|.||.:..
  Rat  1498 SVHDFEWISQLRYYWTN--NDLYIRAVNAEFIYGYEYLGNSGRLVITPLTDRCYLTLTGALHLKF 1560

  Fly  2371 GGAPAGPAGTGKTETVKDLAKAMGLLCVVTNCGEGMDYRAVGTILSGLVQCGAWGCFDEFNRIDI 2435
            |||||||||||||||.|||.||:.:..||.||.:.:|:.|:|....||...|||.||||||||||
  Rat  1561 GGAPAGPAGTGKTETTKDLGKALAIQTVVFNCSDQLDFMAMGKFFKGLASAGAWACFDEFNRIDI 1625

  Fly  2436 SVLSVISTQLQTIRNGLIRKLDRFVFEGVEIHLDPKCGVFVTMNPGYAGRTELPESVKALFRPVT 2500
            .||||::.|:.||:....::::||:||||||.|.|.|.||:|||||||||||||:::|||||||.
  Rat  1626 EVLSVVAQQITTIQKAQQQRVERFMFEGVEIPLVPSCAVFITMNPGYAGRTELPDNLKALFRPVA 1690

  Fly  2501 CIKPDLELICLISLFSDGFLTAKVLAKKMTVLYSLAQAQLSKQCHYDWGLRSLNSVLRMAGVMKR 2565
            .:.||..:|..|||:|.||..|.|||||:|..:.|:..|||.|.|||:|:|::.:|:..||.:||
  Rat  1691 MMVPDYAMIAEISLYSFGFNEANVLAKKITTTFKLSSEQLSSQDHYDFGMRAVKTVISAAGNLKR 1755

  Fly  2566 QSEDLPEAVVLMRVLRDMNFPKFVFEDVPLFLGLIKDLFPGIDCPRIGYPDFNAAVRHVLVNDGY 2630
            ::..:.|.::.:|.:||:|.|||:.||:.||.|::.||||........|...:.|:|.....:. 
  Rat  1756 ENPTMNEELICLRAIRDVNVPKFLQEDLKLFSGIVSDLFPTTKEEETDYGILDQAIRKACEKNN- 1819

  Fly  2631 ILLPDQED---KVVQMYETMMTRHSTMLVGPTGGGKTVVINALVKAQTHM-GLPT---------K 2682
              |.|.|.   |.:|:|||.:.||..|||||||.||:.....|..|.|.: |.|:         .
  Rat  1820 --LKDVEGFLIKCIQLYETTVVRHGLMLVGPTGSGKSNCYRILAAAMTSLKGKPSISGGVYEAVN 1882

  Fly  2683 CLVLNPKACSVIELYGFLDMETRDWIDGLFSNIFR------EMNKPIEREERRYACFDGDVDALW 2741
            ..|||||:.::.:|||..|:.|.:|.||:|.::.|      :.||       ::..|||.|||:|
  Rat  1883 YYVLNPKSITMGQLYGEFDLLTHEWTDGIFPSLIRAGAIASDTNK-------KWYMFDGPVDAVW 1940

  Fly  2742 IENMNSVMDDNKLLTLANGERIRLENYCALLFEVGNLNYASPATVSRAGMVYVDPKNLRYSPFWQ 2806
            |||||:|:||||.|.|::||.|:|.....::|||.:|..||||||||.||||::|..|...||.:
  Rat  1941 IENMNTVLDDNKKLCLSSGEIIKLTEAMTMMFEVQDLAVASPATVSRCGMVYLEPSILGLMPFVE 2005

  Fly  2807 RWVLTRP---EPQRELLNDFFEKIITQSIAFILEGLDGTTQGNPLKLVIMQTDLNMVTQFCNLYD 2868
            .|:...|   :|..|.....|.|.:..||||:     .||    :|.|:..|:.|:......|.|
  Rat  2006 CWLKHLPSIIKPYEEQFKTLFVKFLESSIAFV-----RTT----VKEVVASTNSNLTMSLLKLLD 2061

  Fly  2869 ALLPNYVMDSKNYDEPVQQ-NYNTDSLECCFLQAVYGSMGACLVEKHQPVFDEYMKRISGFPLVQ 2932
            .....::........|.:: ::..:.:|..|:.::..|:||......:..|.:::|....|..::
  Rat  2062 CFFKPFLPREGLKKIPSEKLSHIPELIEPWFIFSLVWSVGATGDHSSRLNFSQWLKIKMVFEQIK 2126

  Fly  2933 DTPENPASGGQFPQSKPTLYDYFWD----------------VKDNVWKAWEWVVQPYTHDPQVKF 2981
            ..         ||: :..:|||..|                .|...|..|.....|:|..|...:
  Rat  2127 LA---------FPE-EGLVYDYRLDDAGISSTEDDDEDDEESKQVAWVKWMDYSVPFTMMPDTNY 2181

  Fly  2982 SEILVPTVDNTRTNRTLSLMSEIKRPVLLVGEAGTSKTATIM-QYLRNLNPSVNVILNINFSSRT 3045
            ..|:|||:|..:.:..|.::....:|||.:|..||.||.|:. :.|:|| |...:...:.||:||
  Rat  2182 CNIIVPTMDTMQMSYLLGMLITNHKPVLCIGPTGTGKTLTVSNKLLKNL-PLEYISHFLTFSART 2245

  Fly  3046 SSLDVQHTLEAAVEKRTKDTYGPPMGKRIACFIDDMNMPQVDDYGTQQPIALLKLFFERGGMYDR 3110
            |:...|..:::.::||.|..:|||:|:....||||:|||.::.||.|.||.||:.:.:.||.|||
  Rat  2246 SANQTQDLIDSKLDKRRKGVFGPPLGRNFIFFIDDLNMPALETYGAQPPIELLRQWMDHGGWYDR 2310

  Fly  3111 DKDLNWKKFKDLTFYAAMGTAGGGRNEVDPRFISMFSTYNIIFPNDESLIQIYSSIF-------- 3167
            .....:|...|:.|..|||..|||||.:.||....|:..:.|..::.|..:|:|.|.        
  Rat  2311 KIIGAFKNLVDINFVCAMGPPGGGRNAITPRLTRHFNYLSFIEMDEVSKKRIFSIILGCWMDGLL 2375

  Fly  3168 --KGHMVFVKFQPEYMLIADMIVHMTLKLFKMVIVDLPPTPSKFHYIFNLKDLSRIFAGMLLIEP 3230
              |.:...|...|..:.:.:.:|:.|:.::.::...|.|||:|.||.|||:|||::|.|:|:.||
  Rat  2376 GEKSYREPVPGAPNIVHMTEPLVNATISIYAIITSQLLPTPAKSHYTFNLRDLSKVFQGILMAEP 2440

  Fly  3231 TCFKGLRDLIRVWRNEYTRIICDRLITDNDIANVRRNLAVEVAERFPPTFEEEHGFIDAAAAEAE 3295
            ...:....|:|:|.:|..|:..|||:.                       ||:.|:.|       
  Rat  2441 AKVEDKVQLLRLWYHENCRVFRDRLVN-----------------------EEDRGWFD------- 2475

  Fly  3296 AQARLLYEPSKADIDGGEEEGEEEEEGEEAPQVILSLKDYVLRDPLLFGDFRNFTNESEPRLYED 3360
                            |..|.:.|:.|       ::........|:|:|||  .:..|:.:.||.
  Rat  2476 ----------------GLLEMKMEDLG-------VAFNKVCPFQPILYGDF--MSPGSDVKSYEL 2515

  Fly  3361 LLDYNSVYFLFTEILEEYCE-RKQKMTLVLFEDCLEHLTRVHRTLRMNRGHVLLIGVGGSGKKCI 3424
            :...|.:..:..|.:|:|.: ...|:.||||.|.:.|:.|:.||||...|:.||:||||||:..:
  Rat  2516 ITSENKMMQVIEEYMEDYNQINTAKLKLVLFVDAMSHICRISRTLRQALGNALLLGVGGSGRSSL 2580

  Fly  3425 TRLAAFAAECDVFEITISRGYNEAAFREDLKVLYTIAGVKRKKVVFLFTGAQVAEEGFLELINNI 3489
            ||||:..||.:.|::.:|:.|..:.:|||:|.:...||::...:.|||:..|:..|.|||.||||
  Rat  2581 TRLASHMAEYECFQVELSKNYGMSEWREDVKKILLKAGMQNLPITFLFSDTQIKNESFLEDINNI 2645

  Fly  3490 LTVGQVPALFPDEDKDGIVNQVRKFAEEDGVSASKDAVWGYFLRTCAENLHVVLCMSPAGDALRN 3554
            |..|.:|.|:..:::|.|||.:|.:.:|.|:..:|..:...:......|:|:||||||.|:..|.
  Rat  2646 LNSGDIPNLYSADEQDQIVNTMRPYIQEQGLQPTKANLMAAYTGRVRNNIHMVLCMSPIGEVFRA 2710

  Fly  3555 RCRNFPGLIGSTYIDWVFPWPRQALYAVAKLFLTEHRLIPASHR--EAIVEHVVHVHTSIQQYSK 3617
            |.|.||.|:....|||...||.:||.:||..||.|...:..|..  |.::...|::|.|:.:...
  Rat  2711 RLRQFPSLVNCCTIDWFNEWPAEALQSVATRFLHEIPELECSSEVIEGLIHVCVYIHQSVAKKCV 2775

  Fly  3618 DYLAKLRRNNFVTPKHYLDYINTYRGLLEEKAKFITQQRSRLGEGIKKIEEASVQIDELRIIVTE 3682
            :|||:|.|:|:||||.||:.:|.:..|:.:|...:...:.|:..|:.|:...|            
  Rat  2776 EYLAELARHNYVTPKSYLELLNIFSILIGQKKMELKTAKHRMKSGLDKLLRTS------------ 2828

  Fly  3683 QKKNVAVASEECEAMLVTIESSTQ---------KANVKKAEASEKSVEV-EIKGKQIAIE----K 3733
              ::||...||.|.|...:|.:.:         |.:...||.:.|||:. |||..:.|.:    .
  Rat  2829 --EDVAKMQEELEIMRPLLEEAAKDTLLTMDQIKVDTAIAEETRKSVQAEEIKANEKASKAQAIA 2891

  Fly  3734 DEAEEILAEAMPALEEARLALSQLEKAQITEIRSFATPPAAVQVVCECVAILKGYK--------- 3789
            |:|::.|.||:|||:.|..:|..|.|..:||:|:...||..|::|.|.|.|:||.|         
  Rat  2892 DDAQKDLDEALPALDAALASLRNLNKNDVTEVRAMQRPPPGVKLVIEAVCIMKGIKPKKVPGEKP 2956

  Fly  3790 ----EINWKSAKGMMSDV-NFLKSLMEMDCEALTQKQITQCRQHMKTGNLED--MAKISVAGAGL 3847
                :..|:..||::.|. .||:||.:.|.:.:.:..|...:.::.....:.  :||:|.|...:
  Rat  2957 GSKVDDYWEPGKGLLQDPGRFLESLFKFDKDNIGEAVIKAIQPYIDNEEFQPAAIAKVSKACTSI 3021

  Fly  3848 LRFVRAVLGFFDVYKEVKPKKERLDFLVEEQEVQIKLLNHLNGEIQKLEEKLNELNENYATSMKQ 3912
            .::|||:..:..|.|.|:||::.|....::.||..::|......::::|:.::.|...|...:.:
  Rat  3022 CQWVRAMHKYHFVAKAVEPKRQALREAQDDLEVTQRILEEAKHHLREVEDGISTLQAKYRECVTK 3086

  Fly  3913 MRALTEMMQQAERRLIASDKLISGLTSELIRWSKEMASLGQQLIDSVGGCLISASFLAYTGAFTW 3977
            ...|....:|.|:||..:||||:||..|.:||...:.:|...|.:..|..|::|.|:||.|.||.
  Rat  3087 KEELEMKCEQCEQRLGRADKLINGLADEKVRWQDTVENLENMLDNIFGDVLVAAGFVAYLGPFTG 3151

  Fly  3978 EFRKAMVFDDWLEDIASLGIPIQLPFKIDGYLTTDVEISQWSNEGLPPDELSIQNGILTMRASRF 4042
            ::|.|: ::.|:..:...|:|......:...|...|:|..|...|||.|.||::||::...:.|:
  Rat  3152 QYRAAL-YEYWVNQLTVYGVPHTSKPTLISTLGNPVKIRSWQIAGLPNDTLSVENGVINQFSQRW 3215

  Fly  4043 PLCIDPQLQALQWIRKREFKNNLKVLSFSDSDFLKQLEMAIMYGTPVLFEDVDDYIDPVIDDILQ 4107
            ...||||.||.:||:..|.::.|.|...||.|||:.:|.||.:|.|.|.|:|.:.:||.::.:|.
  Rat  3216 THFIDPQGQANKWIKNMEKESGLDVFKLSDRDFLRSMENAIRFGKPCLLENVGEELDPALEPVLL 3280

  Fly  4108 KNIRIQGGRKFVMLGDKEVDWDPSFRVYLTTKFSNPKFDPAVYAKALVINYTVTQTGLEDQLLSV 4172
            |....|.|...:.|||..:.:...||:|:|||..||.:.|.|..|..:||:|::.:|||||||..
  Rat  3281 KQTYKQQGNTVLKLGDTVIPYHEDFRMYITTKLPNPHYSPEVSTKLTLINFTLSPSGLEDQLLGQ 3345

  Fly  4173 VVGTERPDLEAQRESLIAQTSENKQLLQQLEDSLLRELSTSTGNMLDNVELIETLENTKTKAGVV 4237
            ||..||||||..:..||...::.:|.|:.:||.:|..||:|.||.:|:||||:.||.:|.||..:
  Rat  3346 VVAEERPDLEEAKNQLIISNAKMRQELKDIEDQILYRLSSSEGNPVDDVELIKVLEASKMKAAEI 3410

  Fly  4238 MEQLKLAADTAADIEVLRNGYRPAAKRGAVLFFALSDMATVNSMYQYALAAYLDVFVYSLRKAVP 4302
            ..::::|..|..||::.|..|.|.|.|..:|||.:||:|.|:.||||:|..:|::|:..:..:..
  Rat  3411 QAKVRIAEQTEKDIDLTRMEYIPVAVRTQILFFCVSDLANVDPMYQYSLEWFLNIFLSGIANSER 3475

  Fly  4303 DASLNKRLNNIIKTLTENVYCYGCTGIFERHKLLFSFQIATKLAQRDGILLQSELDFFIKGSIAL 4367
            ..:|.||:.||.:.||.::|...|..:||:|||:|:|.:..::...:|.:.|.|..:.:.|....
  Rat  3476 ADNLKKRIVNINRYLTFSLYSNVCRSLFEKHKLMFAFLLCVRIMMNEGKINQGEWRYLLSGGSIQ 3540

  Fly  4368 TKSERSNPCKWLSEKSWEDVLKLAFDFPDIFGTLPDHFGRYLTEWKEWFDLENPEEVPCPGDYNI 4432
            |.||...| .|||:::|.|:|.|: :.| .|.|....|.::|.:::..||...|...|.||.:|.
  Rat  3541 TMSENPAP-HWLSDRAWRDILALS-NLP-AFSTFSTDFVQHLPKFQAIFDSAEPHREPLPGIWNT 3602

  Fly  4433 KCNAFQKLMFLRCFRVDRIFRSINQYIVETMDEFYIMPPVVSFSAIYEQTSSTIPVCFVLSAGSD 4497
            ..:.||||:.|||.|.|::..::..::...::..:|.|...:.||::::::||.|:.||||.|:|
  Rat  3603 YLDEFQKLLILRCLRGDKVTNAMQDFVANHLEPRFIEPQTANLSAVFKESNSTTPLIFVLSPGTD 3667

  Fly  4498 PTNDLIKLADTIVGMSNFCHISLGQGQEKAALRLLDGAIKQGMWLMLQNGHLLIRFVRELEKHLD 4562
            |..||.|.|:.:........|||||||...|..::..:|::|.|:..||.||...::..||:.::
  Rat  3668 PAADLYKFAEEMKFSKKLSAISLGQGQGPRAEAMMRNSIERGKWVFFQNCHLAPSWMPALERLIE 3732

  Fly  4563 RIENP---HPDFRLWITTDPTPTFPIGILQKSLKVVTEPPNGLKLNLRSTYFKVRQERLESCSHV 4624
            .| ||   |.|||||:|:.|:..||:.|||...|:..|||.|:|.||..:|..:..:.|.||..|
  Rat  3733 HI-NPDKVHRDFRLWLTSLPSNKFPVSILQNGSKMTIEPPRGVKANLLKSYNSLSDDFLHSCQKV 3796

  Fly  4625 A-FRPLVYVLAFFHAVVQERRKYDKLGWNIAYDFNDTDFDVCTEILRTYLTRCGTGKIPWNSLKY 4688
            . |:.|:..|..||....||||:..||:||.|:|.|.|..:|...|:.:|..  ...||:..|||
  Rat  3797 VEFKSLLLSLCLFHGNALERRKFGPLGFNIPYEFTDGDLRICISQLKMFLDE--YEDIPYKVLKY 3859

  Fly  4689 LIGEVMYGGRVIDDFDRRITNCYMNEYMGDF-----LFDEFKVFHFYEDDNVDYCLPEEETILKE 4748
            ..||:.|||||.||:|||   |.|| .:.||     |..|    |.|....:.:.:|  .|....
  Rat  3860 TAGEINYGGRVTDDWDRR---CVMN-ILEDFYNPAVLSPE----HRYSKSGIYHQIP--PTYDLN 3914

  Fly  4749 DYIAHIDKLPLVNKPDVFGLHPNAEIGYYTMAARNIWNSLIELQPQTGEGTGGISRDDFIDSVAA 4813
            .|:::|..|||.:.|::||||.||.|.:.......::.::::|||:: ...||.||::.::.||.
  Rat  3915 GYLSYIKSLPLNDMPEIFGLHDNANITFAQNETFALFGAILQLQPKS-SSMGGQSREELVEDVAE 3978

  Fly  4814 GILKKLPPAFETWR-IRKQIQMSLSPTGVVLLQELDRFNLLVVRIKKTLELLRKAIAGEIGMDNV 4877
            .||.::|...:... :.|...:.......||:||:.|:|.|::.|.:||..:.|||.|.:.|...
  Rat  3979 DILVQVPKPVDLEEVVNKYPVLYEESMNTVLVQEVIRYNKLLMVITQTLSDMLKAIKGLVVMSLE 4043

  Fly  4878 LDNIANSLFNGLLPAAWSKLAPATCKQLASWLEHLRLRAVQYKYWTLSGEPLVMWLSGLHIPQSY 4942
            |:.::.||:|..:|..|...|..:.|.||||:..|..|......|..:|.|.|.|:||...||::
  Rat  4044 LELMSTSLYNNAVPELWKSKAYPSLKPLASWIMDLLQRLNFLHSWIKNGIPSVFWISGFFFPQAF 4108

  Fly  4943 LTALVQIACRRNAWPLDRSTLFTYVTKFADPDDVEERPVTGCLVHGLYIEGGRFDLATNQLARSH 5007
            ||..:|...|:....:|..|....|..:|. .::.|||.|||.::||::||.|:|....|||.|.
  Rat  4109 LTGTLQNFARKFVISIDTITFDFKVLSYAS-SEIAERPSTGCYIYGLFLEGARWDPFDFQLAESR 4172

  Fly  5008 PKVLVEELAILAVEPIEAHRLKLQNTYLAPVYTTSLRRNAM-----GVGLVFEANLATSEDLSHW 5067
            ||.|..|:|::.:.|:...:::.|:.||.|:|.|..|...:     ....|....:.:::...||
  Rat  4173 PKELYTEMAVIWLLPVANRKVQNQDFYLCPIYKTLTRAGTLSTTGHSTNYVIAVEIPSNQPQRHW 4237

  Fly  5068 ILQGVCLTLNTD 5079
            |.:||.|....|
  Rat  4238 IKRGVALICALD 4249

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
Dhc98DNP_524541.3 DHC_N1 523..983 CDD:285571 4/12 (33%)
DHC_N2 1798..2201 CDD:285579 133/410 (32%)
P-loop_NTPase 2338..2565 CDD:304359 133/226 (59%)
P-loop_NTPase 2654..2788 CDD:304359 64/149 (43%)
P-loop_NTPase 2976..3246 CDD:304359 97/280 (35%)
P-loop_NTPase 3378..3645 CDD:304359 106/269 (39%)
MT 3658..3989 CDD:289543 102/360 (28%)
AAA_9 4017..4233 CDD:289547 92/215 (43%)
Dynein_heavy 4374..5068 CDD:281078 244/708 (34%)
Dnah1NP_001028827.2 DHC_N2 998..1401 CDD:400618 134/412 (33%)
DYN1 <1237..3883 CDD:227570 990/2769 (36%)
AAA_6 1528..1854 CDD:403853 173/328 (53%)
Dynein_C 3944..4246 CDD:408026 95/303 (31%)


Information from Original Tools:


Tool Simple Score Weighted Score Original Tool Information
BLAST Result Score Score Type Cluster ID
Compara 00.000 Not matched by this tool.
Domainoid 00.000 Not matched by this tool.
eggNOG 1 0.900 - - E1_COG5245
Hieranoid 00.000 Not matched by this tool.
Homologene 00.000 Not matched by this tool.
Inparanoid 00.000 Not matched by this tool.
OMA 00.000 Not matched by this tool.
OrthoDB 00.000 Not matched by this tool.
OrthoFinder 00.000 Not matched by this tool.
OrthoInspector 00.000 Not matched by this tool.
orthoMCL 1 0.900 - - OOG6_100025
Panther 00.000 Not matched by this tool.
Phylome 1 0.910 - -
SonicParanoid 00.000 Not matched by this tool.
SwiftOrtho 1 1.000 - -
TreeFam 00.000 Not matched by this tool.
43.710

Return to query results.
Submit another query.