DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment Dhc98D and Dnah11

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_524541.3 Gene:Dhc98D / 43379 FlyBaseID:FBgn0013813 Length:5080 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:XP_038934019.1 Gene:Dnah11 / 117253 RGDID:621088 Length:4514 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:4968 Identity:1404/4968 - (28%)
Similarity:2336/4968 - (47%) Gaps:697/4968 - (14%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly   348 AKESGPGLLELSKPSEFRLRALKQQKKMKEKEAAAKKAKAKKTDAE--------------PTE-- 396
            |:|.|. :|.|| |||       |:.:..|:..||::|:....|..              |.|  
  Rat     3 AQEEGT-VLRLS-PSE-------QEDEEDEEAEAARRAQRFAVDPRVRFLGGRLQQALGFPEETW 58

  Fly   397 -EEEEADAHK------------------VEAHLSSSEEEV--EIK------VEKLTIGQRWEKML 434
             |..|::.|:                  |...|.|:..|:  ::|      .:|:| |...|...
  Rat    59 GEYLESEDHRQVLGDFLESSGPASLVFSVAPGLLSASPEIPRDVKHKLVYFAKKMT-GSTGESDF 122

  Fly   435 NETKAKVEAEHAAEEATPPRITPIQRRLLKEIEEFQSEITWTI-----NHIVWAFSLPSS----- 489
            ::|....|               |.|.|...:..|..||...|     ||..|:..:...     
  Rat   123 SQTVLFGE---------------IPRSLFTHVTAFLDEILVPILSNKNNHESWSCFISQDVEHHT 172

  Fly   490 -------YILPGQEATEFEDAIIRVPVDPKRLDLVITY--TQQQ---------LEEVVDGWIKYL 536
                   :|..|:.:....   :.:|...:.:||...|  |:.|         :|.||..|...:
  Rat   173 EIMKNKMHIFRGKMSRRTH---LPIPTIAENIDLDQHYSVTRPQSDERRILHAIESVVIKWSHQI 234

  Fly   537 KKTM-KTLTDAKLDDF--TPMAEHRYWHKMEVELYGTLEQLKTEFVVAVLQRLTDDKSPVLDEWQ 598
            ::.: |......|...  ||..|..:|......|.....||:...|:.:::.|...:|..|...:
  Rat   235 QEIIEKDSAQPLLSGLHPTPETELDFWTMRHDNLKCIYHQLQAPIVLKMVKILRTRQSSYLPALK 299

  Fly   599 AVVEKTEARFKLAKENSDYLGTIIDYLEKVRSYESFKMVVLQIPNIMVGLRHIWTMSSHYCRDPE 663
            .:....|.....|::...:|..:..:::.::..: |....:.|..::..:..||:.|..|.....
  Rat   300 GIFTTVENALLEARDVELHLRPLRKHIQGLQEAD-FPQTGILIAPLIHTICLIWSHSKFYNSPAR 363

  Fly   664 MQVLLCQISNVFVQKVKSIINFENIFKYSATYTYETATNCANLLRCWKQAYKLSRQHIEDSGAGS 728
            :.|||.:..|:|:.:.::.::.|::.|.......|.......:||.::.::...|:.:.....|.
  Rat   364 VIVLLQEFCNLFIDQARAYLSPEDLLKGEIEDALEKVQVAIGVLRMFQNSFFKYRRGLTSYFTGD 428

  Fly   729 R----WEFDRVALFNEVNHIHRVAVDIAYVGRVFVQYENL----FGHRLKACIADPSIVDNLMRK 785
            .    |:|....:|:..|......|.|..:....:::|.|    ||....|.         |..:
  Rat   429 TEQRPWDFQSHLVFSRFNKFLDRLVKIEDMFVTILEFEKLERLEFGGSKGAV---------LNAQ 484

  Fly   786 VYRMLDDLIKSVD---YDMFRPGNWENWEYSLELF---NKRLDNVENEAKNVIDQSINSL----L 840
            ::.|.::.|:..:   ..::.|.:.::.|:..:.|   :|.||         .|:.:.:|    |
  Rat   485 IHSMKEEFIECCNVFRQSIYDPSDCDSMEFESDYFQFKSKTLD---------FDRRLGTLLCEGL 540

  Fly   841 SSEKGLDLVVNAM----NIDTRATLQEFVATKHENLLRFFVTEINAVERVFTKLKKS-----PPM 896
            |:..||:.....:    |...:..:.|..:..:..||..|..|::..:|::.:..|.     ..:
  Rat   541 SNCSGLESAFKLLTIFGNFLEKPVVMEIFSPHYSTLLNMFNAELDMCKRLYDEHMKQIEHGHEIL 605

  Fly   897 AKHQPAKISAIFWARLLGKKLK------TSV-LAFKRVEDEPAIKNSFLKRSSFKQYFELMTVMF 954
            .|:.|.....|.|||:|.::|:      ||: ..|....||.|:         .::|.|:.|::.
  Rat   606 NKNMPFTSGNIKWARMLLERLQMFWSNFTSLHYLFPDSPDEAAV---------CQKYAEMTTLLD 661

  Fly   955 QFEKVLFENFIQNATYLVNTTNRSNVLRIRICKESTMSYISEAVQTLKAKPRPELQMTSDRRVTP 1019
            |||..::..:.:|    |:.|...| |...:.|.|.::    .:.::...|:....:...:.:..
  Rat   662 QFESRIYSEWRRN----VDKTCEFN-LNQPLVKFSPIN----GLLSVNFDPKLVAVLREVKYLLM 717

  Fly  1020 VKSSNLMPVQSEAFSAYSVADSAGTEISSESENEGLLVGDTSQKKLMCRI-------------NR 1071
            :|.||:..      ||..:.......:......|.|:.|....|:.:..:             .:
  Rat   718 LKKSNIPD------SALGIFQKKNIILKHIGNLELLVQGYNKLKQTLLEVEYPLIEKELGAIDEQ 776

  Fly  1072 LTVLVAMIMWMVSNTRKANIQLQECTAFIKMVKDKKPKDVTAMDRHCVRTCELLQRAES------ 1130
            |.|....:.|.           .:...:::.|:              |.|.||.:|...      
  Rat   777 LRVAATWLTWQ-----------DDFWVYMEKVQ--------------VATAELERRVSQTQSNVQ 816

  Fly  1131 --QYLLPIWRELVGEKTLIEYDMDFVVNLKRDVFDVLFEAQQFEHLGFTLPAVLRTAIMKKDLLF 1193
              |..:..|.|                      :.:|...:.......||..       |.||..
  Rat   817 TIQQTMQAWAE----------------------WPLLPRRETRREAALTLDD-------KGDLFA 852

  Fly  1194 KDYERMTEVVDRYRSIINNLSMSEVIFLRGHIYDTELFIQMGVGRYTWTSFNIGKFCDQINSQLR 1258
            |.|:.:.|  |.|:  |:||           :.:.....:......:|..:  .:|.|.|     
  Rat   853 KKYKLIRE--DGYK--IHNL-----------VEENRKLFRADPSLDSWKIY--VEFIDDI----- 895

  Fly  1259 KLTSIVSQINFIRLDLRSRIDMIKSFNLFNLDDELKVEDTSRSSGESYLQDRKNPSQRFKSVTGE 1323
                :|.  .|.:..|.   |:  .|.|.|.:.:||                  |:..|::    
  Rat   896 ----VVE--GFFQTILH---DL--DFFLRNTEKQLK------------------PAPFFQA---- 927

  Fly  1324 TITMFSVEKDVPADEKAEQACGSGIYPCQGYFELLEASRNRKAAQMKKLYDSLGPVLVKLESLVL 1388
              .|..:..::......|:..|.|.|      .|:||                         ::.
  Rat   928 --QMLLMPPEIVFKPPLEREAGDGFY------NLVEA-------------------------MLC 959

  Fly  1389 GTF--SGRSDRMKTYYEYWEGETFKCIVDMTYQNLKCYINRLLSNKPMFEVNAVLLMSEIVLEPS 1451
            |:|  |.:..|:..:.:         |.|  |||               :::.:|.::|:     
  Rat   960 GSFKVSAQMGRVAAHLD---------IPD--YQN---------------DMDNMLGLAEV----- 993

  Fly  1452 VQELQNTIVTATKDYISRLRIFTRWMTGTCIACPLVEMGKQFKYNYTYYEDVIQIRSIVDLVINI 1516
            .||:.|.:.    |.|.::..|...:.               .|:|.:.:|.::|  :...::..
  Rat   994 RQEIMNRVA----DVIDKVLEFRSSLE---------------TYSYLWVDDRVEI--LRQFLLYG 1037

  Fly  1517 HDLASRVANEARGFVSQFRKYFNLWAFEKSFICQKFLEKQVTLIEIDEKFTFYSSIVETLANTRK 1581
            |.:.|...:...|                    :..|:.. ||.:..|:...|.::...::   |
  Rat  1038 HAVPSEEIDAPAG--------------------EDILQSP-TLEQFKEQIDIYEALYVQMS---K 1078

  Fly  1582 FQDIKC----VRINLEPLLASITQHAQDWCTTLGEELLRHVNDNMRAMRNEVKTLSLNLNKTTRE 1642
            |.|.:.    .:|::.|...|:....:.|.....|.|||.|.|::..::..:|..:..|.:...|
  Rat  1079 FDDFRVFNSWFKIDMRPFKLSMLNVIKKWSWMFQEHLLRFVVDSLSELQGFIKQTNAGLQRQPHE 1143

  Fly  1643 LEDFKLV--MTTIGTVQSSTLTNEQKIHEMQETFTILSEHKIMFPYEDMLMAHHLEKRWKRL-FL 1704
            .:...||  |..:..|:|.....::....::||..:|..:....|.:.......|.:||:.. .:
  Rat  1144 GDHDGLVDIMGHLLAVRSRQRATDELFEPLKETIMLLESYGQKMPEQVYAQLEELPERWETTKKI 1208

  Fly  1705 SALYRYEKLQPIKQKFADMTSVEIDEFCDDLAEFIKDYDENGPGSVGAELERGVRLMDPYGQKIA 1769
            :|:.|:| :.|::.....:...:...|.:..|||.:.:....|  :|.:.|....::|...|::.
  Rat  1209 AAVVRHE-VSPLQNAEVTLLRKKCILFDEKQAEFRERFRSYAP--LGFKAENPYSVLDKANQELE 1270

  Fly  1770 ERESRREELANAERLFDMAMVDYHEFARVQTEFEGLQQLYKLYKAQKYAREGWGKTLWADLDPNV 1834
            ..|....::.|..|||::.:.:|.:..:.:.|...|::|:.:....:.:.:.|.:|.|..::...
  Rat  1271 ALEEEVVQMQNCARLFEVVLPEYKQMKQCRREVRLLKELWDIIVYVRRSIDNWTETRWRQVNMEQ 1335

  Fly  1835 LTEGVESYLKEFRKFTKAVRTLPVGVQLEIHMKQFKGTVPLMVSLKHEALRERHWLQLMEKTGQY 1899
            :...:..:.||.....||||.......||..:|....::..:..|::.|||:|||.||....|..
  Rat  1336 MDLELRRFAKEIWSLDKAVRVWDAYSGLEGTVKDMTTSLRAVAELQNPALRDRHWQQLTNAIGVR 1400

  Fly  1900 FDMSPARFTLENMFAMQLHKYQEIAEQILTNAIKELQIERGVQAVIETWASMAFKTFKHFKGSDD 1964
            |.::.:. ||.::.|:|||:.:|....|:..|:|||..|:.:..|..||.::.|....|.:....
  Rat  1401 FSINDST-TLADLLAVQLHQVEEDVRDIVDKAVKELGTEKVITDVSHTWEALEFSYEVHHRTGTP 1464

  Fly  1965 RGWVLGPVDEIMQILEDN---------------------------AMNLQSMGASQFIGPFLETV 2002
               :|...:::.:.||.|                           .:.||::..|:::..|::.|
  Rat  1465 ---LLKSDEQLFETLEHNQSFLLGLGTSWLATEPLGSAYSHAGILQVQLQTLLQSKYVEYFIDQV 1526

  Fly  2003 NKWERTLALISEIIDEWLVVQRKWLYLEGIFI-GGDIRTQLPEEARKFDDIDKSYRRIMVDCAKN 2066
            ..|:..|.:...:|..|:.|||.|.:||.||: ..|||.||.|:|::||::|..::.:|...||.
  Rat  1527 LSWQNKLNVADAVIFTWMQVQRTWSHLESIFVCSEDIRIQLVEDAQRFDEVDAEFKELMFKTAKI 1591

  Fly  2067 PLVVPFCTVPGRLVEIQGLGIGLENCQKSLNEYLDSKRRIFPRFYFISTDELLSILG-SSEPSAV 2130
            ..|:.....|....:::.....|..|:|:|.|||::||..|.||||||:.:||.:|. .::|..|
  Rat  1592 KNVLEATCRPHLYEKLKDFQHRLSLCEKALAEYLETKRVTFSRFYFISSADLLDLLSKGAQPKQV 1656

  Fly  2131 QNHIIKMYDNIKSLRLV--KEGSQTIVTGMISSEGEVMEFRHSARAAGRVEYWMNDVLDEMRRSN 2193
            ..|::|::|:|..|:..  .|.|.....||.|.|.|.:.|:......|.||.|:..:...|:.:.
  Rat  1657 TRHLVKLFDSISDLQFEDNPEVSTCKAVGMFSKEKEYVSFQAGCECIGHVESWLLQLEQTMKETV 1721

  Fly  2194 RFINKTAI--YDFGTDLQISRPDWLMNYQGMVGLAASQVWWTAEVEEAFDQAQNHGNMRAMKDFL 2256
            |.....||  |:     :..|..|:.::...|.|..||:|||.:|..||.:.: .|...|:|||.
  Rat  1722 RLAIAEAIAAYE-----EKPRELWIFDFPAQVALTGSQIWWTTDVGIAFSRLE-EGYETALKDFH 1780

  Fly  2257 GKNNYQIEELVLKVRSNLSRNDRLKFKAQCTVDVHARDIIDNFVRDNVLDASEFSWESQLRFYWI 2321
            .|...|:..|:..:...||..||.|....||:||||||::...:...|:....|:|.||||..|.
  Rat  1781 KKQISQLNTLITLLLGELSPGDRQKVMTICTIDVHARDVVAKLISQKVVSPRAFTWLSQLRHEWE 1845

  Fly  2322 KFYDNLHVLQCSGSFDFGYEYMGLNGRLVITPLTDRIYLTITQALLMNLGGAPAGPAGTGKTETV 2386
            :...:..|..|...|.:.|||:|.:.||||||||||.|:|:||:|.:.:.||||||||||||||.
  Rat  1846 ESRKHCIVNICDAHFQYCYEYLGNSPRLVITPLTDRCYITLTQSLHLTMSGAPAGPAGTGKTETT 1910

  Fly  2387 KDLAKAMGLLCVVTNCGEGMDYRAVGTILSGLVQCGAWGCFDEFNRIDISVLSVISTQLQTIRNG 2451
            |||.:|:|::..|.||.|.||||::|.|..||||.||||||||||||.:.||||::.|::.|.:.
  Rat  1911 KDLGRALGMMVYVFNCSEQMDYRSIGNIYKGLVQTGAWGCFDEFNRIAVEVLSVVAVQVKMIHDA 1975

  Fly  2452 LIRKLDRFVFEGVEIHLDPKCGVFVTMNPGYAGRTELPESVKALFRPVTCIKPDLELICLISLFS 2516
            :..:..||||.|..|.|.|..|:|:|:||||||||||||::||||||...:.||.||||.|.|.:
  Rat  1976 IRSRRRRFVFLGETIPLKPSVGIFITLNPGYAGRTELPENLKALFRPCAMVAPDTELICEIMLVA 2040

  Fly  2517 DGFLTAKVLAKKMTVLYSLAQAQLSKQCHYDWGLRSLNSVLRMAGVMKRQSEDLPEAVVLMRVLR 2581
            :||:.|:.||:|...||:|....||||.|||||||::.|||.:||.:||..::.||..||||.||
  Rat  2041 EGFVDARSLARKFISLYTLCDELLSKQDHYDWGLRAIKSVLVVAGSLKRGDKNRPEDQVLMRALR 2105

  Fly  2582 DMNFPKFVFEDVPLFLGLIKDLFPGIDCPRIGYPDFNAAVRHVLV------NDGYILLPDQEDKV 2640
            |.|.||.|.:|||:||||:.||||.:|.||...|.|...|:...:      .:.:||      ||
  Rat  2106 DFNMPKIVTDDVPVFLGLVSDLFPALDVPRQRKPHFEQMVKQSTLELRLQPEESFIL------KV 2164

  Fly  2641 VQMYETMMTRHSTMLVGPTGGGKTVVINALVKAQTHMGLPTKCLVLNPKACSVIELYGFLDMETR 2705
            ||:.|.:..|||..:||..|.||:.::..|.:...:|........|||||.:..||:||:...||
  Rat  2165 VQLEELLAVRHSIFVVGNAGTGKSKILRTLNRTYVNMKQKPVWNDLNPKAVTTDELFGFIHHATR 2229

  Fly  2706 DWIDGLFSNIFREMNKPIEREERRYACFDGDVDALWIENMNSVMDDNKLLTLANGERIRLENYCA 2770
            :|.|||.|:|.||... :..:...:...|||:|.||||::|:||||||:||||:.||:.|.....
  Rat  2230 EWKDGLLSSILREQAN-LTHDGPTWIVLDGDIDPLWIESLNTVMDDNKVLTLASNERVALTPSMR 2293

  Fly  2771 LLFEVGNLNYASPATVSRAGMVYVDPKNLRYSPFWQRWV-LTRPEPQRELLNDFFEKIITQSIAF 2834
            ||||..:|..|:||||||||::||:|::|.::|:...|: ..|.:.::..|...|:|.    |..
  Rat  2294 LLFETHHLQTATPATVSRAGILYVNPQDLGWNPYVASWIDRRRHQSEKANLTILFDKY----IPV 2354

  Fly  2835 ILEGLDGTTQGNPLKLVIMQTDLNMVTQFCNLYDALLPNYVMDSKNYDEPVQQNYNTDSLECCFL 2899
            .||.|     ....|.:....:.::|...|.|.:.||.         .|.:..:...::.|..|:
  Rat  2355 CLEKL-----RTSFKAITSVPESSLVQTICTLLECLLT---------PENIPSDSPKETYEVYFV 2405

  Fly  2900 QAVYGSMGACL----VEKHQPVFDEY----MKRISGFPLVQDTPENPASGGQFPQSKPTLYDYFW 2956
            .|...:.|..|    :..:|..|..:    ||.:                 :|| |:.|::||:.
  Rat  2406 FACVWTFGGTLLRDQLSDYQADFSRWWHKEMKAV-----------------KFP-SQGTIFDYYL 2452

  Fly  2957 DVKDNVWKAWEWVVQPYTHDPQVKFSEILVPTVDNTRTNRTLSLMSEIKRPVLLVGEAGTSKTAT 3021
            |.|...:..|...|..:|.|.......:||.|.:.||......|:....:|::|||.||..||..
  Rat  2453 DHKTKKFLPWTDKVPQFTMDADAPLKTVLVHTPETTRLRYFTELLLNKGKPLMLVGNAGVGKTVF 2517

  Fly  3022 IMQYLRNLNPSVNVILNINFSSRTSSLDVQHTLEAAVEKRTKDTYGPPMGKRIACFIDDMNMPQV 3086
            :...|.:::... ::..:.|:..|:|.|:|..||..:||:....|||...|::..||||:|||:|
  Rat  2518 LSDTLASISEDY-IVSRVPFNYYTTSADLQRILEKPLEKKAGRNYGPRGNKKLVYFIDDLNMPEV 2581

  Fly  3087 DDYGTQQPIALLKLFFERGGMYDRDKDLNWKKFKDLTFYAAMGTAGGGRNEVDPRFISMFSTYNI 3151
            |.|||.||.|||:...:.|..|||.| :..|:.::..:.|.|....|... ||||....|:....
  Rat  2582 DLYGTVQPHALLRQHIDYGHWYDRHK-VMLKEIRNCQYVACMNPMAGSFT-VDPRLKRHFTVLAF 2644

  Fly  3152 IFPNDESLIQIYSSIFKGHMVFVKFQPEYMLIADMIVHMTLKLFKMVIVDLPPTPSKFHYIFNLK 3216
            .||:.::|..||..||..::....|.|..:.....::..|:...:.:..:..||..||||.|||:
  Rat  2645 NFPSLDTLTTIYGQIFSFYLQQQAFCPSVLRTGPSLIQATIAFHQTMAENFVPTAIKFHYNFNLR 2709

  Fly  3217 DLSRIFAGMLLIEPTCFKGLRDLIRVWRNEYTRIICDRLITDNDIANVRRNLAVEVAERFPPTFE 3281
            |||.||.|:|...|.|.|...||.|:|.:|.:|:..|||:..||....:|.:           .|
  Rat  2710 DLSNIFQGILFASPECLKCPEDLARLWLHETSRVYGDRLVDANDSDLFQRKM-----------LE 2763

  Fly  3282 EEHGFIDAAAAEAEAQARLLYEPSKADIDGGEEEGEEEEEGEEAPQVILSLKDYVLRDPLLFGDF 3346
            ..|.:...|.|....|..|:|                                            
  Rat  2764 AAHKYFKGADANTLQQQPLVY-------------------------------------------- 2784

  Fly  3347 RNFTNESEPRLYEDLLDYNSVYFLFTEILEEYCERKQKMTLVLFEDCLEHLTRVHRTLRMNRGHV 3411
            .:|.:..|...||.:.|:..:..:.||::..|.|...:|.||||||.::|:.|:.|.||..:||.
  Rat  2785 CHFASGREDPCYEPVKDWEGLKAVLTEMMGNYNELHSEMHLVLFEDAMQHVCRISRILRTPQGHA 2849

  Fly  3412 LLIGVGGSGKKCITRLAAFAAECDVFEITISRGYNEAAFREDLKVLYTIAGVKRKKVVFLFTGAQ 3476
            ||:|||||||:.::||||:....:||:||::.||.....|.||..||...|.|....|||.|.|.
  Rat  2850 LLVGVGGSGKQSLSRLAAYICSLEVFQITLTEGYGTQDLRVDLANLYVRTGAKNMPTVFLLTDAH 2914

  Fly  3477 VAEEGFLELINNILTVGQVPALFPDEDKDGIVNQVRKFAEEDGVSASKDAVWGYFLRTCAENLHV 3541
            |.:|.||.|||::|..|.:|.||.|||.|.|::.:|......|::.|::..|.:||......|.:
  Rat  2915 VLDESFLVLINDLLASGDIPGLFSDEDTDKIISGIRNEVRGLGITDSRENCWAFFLARVRLQLKM 2979

  Fly  3542 VLCMSPAGDALRNRCRNFPGLIGSTYIDWVFPWPRQALYAVAKLFLTEHRLIPASHREAIVEHVV 3606
            |.|.||.|..||.|.|.||.|:..|.|||...||::||.:|::.|:.|...|...|:::|...:.
  Rat  2980 VFCFSPVGHTLRVRARKFPALVNCTAIDWFHAWPQEALVSVSRRFIEEIEGIEPQHKDSISLFMA 3044

  Fly  3607 HVHTSIQQYSKDYLAKLRRNNFVTPKHYLDYINTYRGLLEEKAKFITQQRSRLGEGIKKIEEASV 3671
            :||||:::.|..|....||.|:.||:.:|:.|:.::.||::|...:.:::..||.||:|::..:.
  Rat  3045 YVHTSVKEVSAWYYQNERRYNYTTPRSFLEQISLFKSLLKKKRGEVQRKKEHLGNGIQKLQTTAS 3109

  Fly  3672 QIDELRIIVTEQKKNVAVASEECEAMLVTIESSTQKANVKK--AEASEK---SVEVEIKGKQIAI 3731
            |:..|:..:..|:..:.:.:::.||::..|...|:|.:.:|  |:|.|:   :::.|...||...
  Rat  3110 QVGNLKARLASQEAELQLRNQDAEALITKIGLQTEKVSREKAIADAEERKVAAIQTEASQKQREC 3174

  Fly  3732 EKDEAEEILAEAMPALEEARLALSQLEKAQITEIRSFATPPAAVQVVCECVAIL---KGY--KEI 3791
            |.|     |.:|.|||..|..||:.|.:..:||:::|..||.||..|...|.:|   :|.  |:.
  Rat  3175 EAD-----LLKAEPALVAATAALNTLNRVNLTELKTFPNPPNAVTNVTAAVMVLLAPRGRVPKDR 3234

  Fly  3792 NWKSAKGMMSDV-NFLKSLMEMDCEALTQKQITQCRQHMKTGNLED-------MAKISVAGAGLL 3848
            :||:|:..|..| :||::|:..|.|.:.:    .|.:.:....|:|       :...|.|.|||.
  Rat  3235 SWKAARIFMGKVDDFLQALINYDKEHIPE----NCLKVVNEQYLKDPEFNPNLIRTKSFAAAGLC 3295

  Fly  3849 RFVRAVLGFFDVYKEVKPKKERLDFLVEEQEVQIKLLNHLNGEIQKLEEKLNELNENYATSMKQM 3913
            .:|..::.|::||.:|:||::.|.....:.....:.|..:..::..|:..|..|..::..:..:.
  Rat  3296 AWVINIIKFYEVYCDVEPKRQALAQTNLDLAAATEKLEAVRRKLVDLDHNLRRLTASFEKATAEK 3360

  Fly  3914 RALTEMMQQAERRLIASDKLISGLTSELIRWSKEMASLGQQLIDSVGGCLISASFLAYTGAFTWE 3978
            ....|.:.|..:.:..:::|:|.|.||.|||.:.:.|...|.....|..|::|:|::|.|:||.:
  Rat  3361 VRCQEEVNQTNKTIDLANRLVSELESEKIRWGQSIKSFETQEKTLCGDVLLTAAFVSYIGSFTRQ 3425

  Fly  3979 FRKAMVFDDWLEDI-ASLGIPIQLPFKIDGYLTTDVEISQWSNEGLPPDELSIQNGILTMRASRF 4042
            :|:.:|...|:..: ..:.|||.....:...||.|..|:.|:|:|||.|.:|.:|..:.....|:
  Rat  3426 YRQELVDCKWIPFLQQKVSIPIAEGLDMIATLTDDATIATWNNQGLPSDRMSTENATILTHCKRW 3490

  Fly  4043 PLCIDPQLQALQWIRKREFKNNLKVLSFSDSDFLKQLEMAIMYGTPVLFEDVDDYIDPVIDDILQ 4107
            ||.||||.|.::|| |.::..:|||.......||..:|||:.:|..:|.|::.:.:|||:..:|.
  Rat  3491 PLMIDPQQQGIKWI-KNKYGPDLKVTHLGQKGFLNAIEMALAFGDVILIENLKETVDPVLGPLLG 3554

  Fly  4108 KNIRIQGGRKFVMLGDKEVDWDPSFRVYLTTKFSNPKFDPAVYAKALVINYTVTQTGLEDQLLSV 4172
            :|...:|  |::.:||||.:::.:||:.|.||.:||.:.|.:.|:..::|:|||:.|||.|||:.
  Rat  3555 RNTIKKG--KYIRIGDKECEFNKNFRLILHTKLANPHYKPELQAQTTLLNFTVTEDGLEGQLLAE 3617

  Fly  4173 VVGTERPDLEAQRESLIAQTSENKQLLQQLEDSLLRELSTSTGNMLDNVELIETLENTKTKAGVV 4237
            ||..||||||..:..|....::.|..|:.||:.||..||.:.|:.||:.:|:|.||.||..|..:
  Rat  3618 VVSVERPDLERLKLVLTKHQNDFKIELRHLEEDLLLRLSAAEGSFLDDTDLVERLETTKATAAEI 3682

  Fly  4238 MEQLKLAADTAADIEVLRNGYRPAAKRGAVLFFALSDMATVNSMYQYALAAYLDVFVYSLRKAVP 4302
            ..::..|.:....|...|..|||.|.|.::::|.:||:..:|.:||::|.|:..:|..::.:|..
  Rat  3683 EHKVIEARENERKINETRECYRPVAARASLMYFVISDLRKINPVYQFSLKAFKTLFHRAIEQADK 3747

  Fly  4303 DASLNKRLNNIIKTLTENVYCYGCTGIFERHKLLFSFQIATKLAQRDGILLQSELDFFIKGSIAL 4367
            .....:|:..:::::|...:.:....:||:.||.|..|:|.::..|...:...||||.::.::..
  Rat  3748 VEDTQERICALMESVTYATFLHASQALFEKDKLTFLSQMAFQILLRRNEIHPLELDFLLRFTVEH 3812

  Fly  4368 TKSERSNPCKWLSEKSWEDVLKLAF--DF----PDIFGTLPDHFGRYLTEWKEWFDLENPEEVPC 4426
            |   .|:|..:|:.:||..|..:|.  :|    .|:.|:        ..:|::|.:.|.||:...
  Rat  3813 T---YSSPVDFLTAQSWSAVKAVALMEEFRGLDRDVEGS--------AKQWRKWVESECPEKEKL 3866

  Fly  4427 PGDYNIKCNAFQKLMFLRCFRVDRIFRSINQYIVETMDEFYIMPPVVSFSAIYEQTSSTIPVCFV 4491
            |.::. |.:..|||:.||..|.||:..::..::.|.:...|:....:.....:.::|...||.|:
  Rat  3867 PQEWK-KKSLIQKLIILRAVRPDRMTYALRNFVEEKLGTKYVERTRLDLGKAFGESSPGTPVFFI 3930

  Fly  4492 LSAGSDPTNDLIKLADTI---VGMSNFCHISLGQGQEKAALRLLDGAIKQGMWLMLQNGHLLIRF 4553
            ||.|.|...||..|...:   :....|.::|||||||..|...|:.|...|.|:.|||.||:.::
  Rat  3931 LSPGVDALKDLEVLGKRLGFTIDSGKFHNVSLGQGQELVAEMALEKAAIGGHWVFLQNVHLVAKW 3995

  Fly  4554 VRELEKHLDRI-ENPHPDFRLWITTDPTPT-----FPIGILQKSLKVVTEPPNGLKLNLRSTYFK 4612
            :..|||.|::. :..|.|:|::::.:..|:     .|.|:|:.|:|:..|||.|:..||.:..:.
  Rat  3996 LGTLEKLLEKFSQGSHRDYRVFLSAEAAPSQHEPVIPQGLLENSIKITNEPPTGMLANLHAALYN 4060

  Fly  4613 VRQERLESCS-HVAFRPLVYVLAFFHAVVQERRKYDKLGWNIAYDFNDTDFDVCTEILRTYLTRC 4676
            ..|:.||.|| ...|:.:::.|.:||..|..|.::...||:.:|.|:..|..:||.||..:|.  
  Rat  4061 FDQDTLEMCSKDQEFKSILFSLCYFHGCVAGRLRFGPQGWSRSYPFSPGDLTICTNILYNHLE-- 4123

  Fly  4677 GTGKIPWNSLKYLIGEVMYGGRVIDDFDRRITNCYMNEYMGDFL---------------FDEFKV 4726
            ....:||..|:||.||::|||.:.|.:||::...|:.|:|...|               :.::..
  Rat  4124 ANPHVPWEDLRYLFGEIIYGGHITDAWDRKLCRVYLEEFMNPSLIEDELMLAPGFAAPPYSDYSG 4188

  Fly  4727 FHFYEDDNVDYCLPEEETILKEDYIAHIDKLPLVNKPDVFGLHPNAEIGYYTMAARNIWNSLIEL 4791
            :|.|.:|    .||.|                   .|.::||||||||...|:.:..::.:|:|:
  Rat  4189 YHQYIED----MLPPE-------------------SPALYGLHPNAEIELLTVTSNMLFRTLLEM 4230

  Fly  4792 QPQTGEGT--GGISRDDFIDSVAAGILKKLPPAFETWRIRKQIQMSLSPTGVVLLQELDRFNLLV 4854
            ||:.....  .|.|.:|.:.::...||::||..|....| .|...:.||..:|..||.:|.|:|:
  Rat  4231 QPRNAVSNEEQGQSTEDKVKNILDDILERLPEEFNMAEI-MQKNPNRSPYILVCFQECERMNVLL 4294

  Fly  4855 VRIKKTLELLRKAIAGEIGMDNVLDNIANSLFNGLLPAAWSKLAPATCKQLASWLEHLRLRAVQY 4919
            ..|:.:|:.|...:.||:.:...::...::|....:|..|:|||..:...||.|...|.||..:.
  Rat  4295 REIRVSLQHLDLGLKGELTLSPDVETQLSALSYDRVPDTWNKLAYPSTYGLAQWFNDLLLRCREL 4359

  Fly  4920 KYWTLS-GEPLVMWLSGLHIPQSYLTALVQIACRRNAWPLDRSTLFTYVTKFADPDDVEERPVTG 4983
            ..||.. ..|.|:|||||..|||:|||::|...|:|.|||||..|...||| ...:|....|..|
  Rat  4360 DTWTQDLTLPAVVWLSGLFNPQSFLTAIMQTMARKNEWPLDRMCLTIDVTK-KTKEDYGHPPREG 4423

  Fly  4984 CLVHGLYIEGGRFDLATNQLARSHPKVLVEELAILAVEPIEAHRLKLQNTYLAPVYTTSLRRNAM 5048
            ..:|||::||.|:|:.:..|..:..|.|...:.::..:.|.|.|.::::.|..|||.|..|    
  Rat  4424 AYLHGLHLEGARWDIQSGALVDARLKELTSTMPVIFAKAIPADRQEVKHAYECPVYKTKAR---- 4484

  Fly  5049 GVGLVFEANLATSEDLSHWILQGVCLTL 5076
            |:..|:...|.:.:.::.|:|.||.|.|
  Rat  4485 GLTYVWTFRLRSKDRIAKWVLAGVALLL 4512

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
Dhc98DNP_524541.3 DHC_N1 523..>968 CDD:462457 93/490 (19%)
DHC_N2 1795..2196 CDD:462462 120/431 (28%)
DYN1 1999..4719 CDD:227570 955/2775 (34%)
AAA_6 2338..2664 CDD:463697 178/331 (54%)
Dynein_C 4778..5076 CDD:465677 97/300 (32%)
Dnah11XP_038934019.1 DHC_N1 220..791 CDD:462457 112/624 (18%)
DHC_N2 1296..1722 CDD:462462 119/429 (28%)
DYN1 1550..4164 CDD:227570 946/2746 (34%)
AAA_6 1862..2188 CDD:463697 178/331 (54%)
MT 3095..3439 CDD:463699 96/352 (27%)
Dynein_C 4217..4512 CDD:465677 97/300 (32%)

Return to query results.
Submit another query.