DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment Dhc98D and Dnah11

DIOPT Version :9

Sequence 1:NP_524541.3 Gene:Dhc98D / 43379 FlyBaseID:FBgn0013813 Length:5080 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:XP_038934019.1 Gene:Dnah11 / 117253 RGDID:621088 Length:4514 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:4968 Identity:1404/4968 - (28%)
Similarity:2336/4968 - (47%) Gaps:697/4968 - (14%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly   348 AKESGPGLLELSKPSEFRLRALKQQKKMKEKEAAAKKAKAKKTDAE--------------PTE-- 396
            |:|.|. :|.|| |||       |:.:..|:..||::|:....|..              |.|  
  Rat     3 AQEEGT-VLRLS-PSE-------QEDEEDEEAEAARRAQRFAVDPRVRFLGGRLQQALGFPEETW 58

  Fly   397 -EEEEADAHK------------------VEAHLSSSEEEV--EIK------VEKLTIGQRWEKML 434
             |..|::.|:                  |...|.|:..|:  ::|      .:|:| |...|...
  Rat    59 GEYLESEDHRQVLGDFLESSGPASLVFSVAPGLLSASPEIPRDVKHKLVYFAKKMT-GSTGESDF 122

  Fly   435 NETKAKVEAEHAAEEATPPRITPIQRRLLKEIEEFQSEITWTI-----NHIVWAFSLPSS----- 489
            ::|....|               |.|.|...:..|..||...|     ||..|:..:...     
  Rat   123 SQTVLFGE---------------IPRSLFTHVTAFLDEILVPILSNKNNHESWSCFISQDVEHHT 172

  Fly   490 -------YILPGQEATEFEDAIIRVPVDPKRLDLVITY--TQQQ---------LEEVVDGWIKYL 536
                   :|..|:.:....   :.:|...:.:||...|  |:.|         :|.||..|...:
  Rat   173 EIMKNKMHIFRGKMSRRTH---LPIPTIAENIDLDQHYSVTRPQSDERRILHAIESVVIKWSHQI 234

  Fly   537 KKTM-KTLTDAKLDDF--TPMAEHRYWHKMEVELYGTLEQLKTEFVVAVLQRLTDDKSPVLDEWQ 598
            ::.: |......|...  ||..|..:|......|.....||:...|:.:::.|...:|..|...:
  Rat   235 QEIIEKDSAQPLLSGLHPTPETELDFWTMRHDNLKCIYHQLQAPIVLKMVKILRTRQSSYLPALK 299

  Fly   599 AVVEKTEARFKLAKENSDYLGTIIDYLEKVRSYESFKMVVLQIPNIMVGLRHIWTMSSHYCRDPE 663
            .:....|.....|::...:|..:..:::.::..: |....:.|..::..:..||:.|..|.....
  Rat   300 GIFTTVENALLEARDVELHLRPLRKHIQGLQEAD-FPQTGILIAPLIHTICLIWSHSKFYNSPAR 363

  Fly   664 MQVLLCQISNVFVQKVKSIINFENIFKYSATYTYETATNCANLLRCWKQAYKLSRQHIEDSGAGS 728
            :.|||.:..|:|:.:.::.::.|::.|.......|.......:||.::.::...|:.:.....|.
  Rat   364 VIVLLQEFCNLFIDQARAYLSPEDLLKGEIEDALEKVQVAIGVLRMFQNSFFKYRRGLTSYFTGD 428

  Fly   729 R----WEFDRVALFNEVNHIHRVAVDIAYVGRVFVQYENL----FGHRLKACIADPSIVDNLMRK 785
            .    |:|....:|:..|......|.|..:....:::|.|    ||....|.         |..:
  Rat   429 TEQRPWDFQSHLVFSRFNKFLDRLVKIEDMFVTILEFEKLERLEFGGSKGAV---------LNAQ 484

  Fly   786 VYRMLDDLIKSVD---YDMFRPGNWENWEYSLELF---NKRLDNVENEAKNVIDQSINSL----L 840
            ::.|.::.|:..:   ..::.|.:.::.|:..:.|   :|.||         .|:.:.:|    |
  Rat   485 IHSMKEEFIECCNVFRQSIYDPSDCDSMEFESDYFQFKSKTLD---------FDRRLGTLLCEGL 540

  Fly   841 SSEKGLDLVVNAM----NIDTRATLQEFVATKHENLLRFFVTEINAVERVFTKLKKS-----PPM 896
            |:..||:.....:    |...:..:.|..:..:..||..|..|::..:|::.:..|.     ..:
  Rat   541 SNCSGLESAFKLLTIFGNFLEKPVVMEIFSPHYSTLLNMFNAELDMCKRLYDEHMKQIEHGHEIL 605

  Fly   897 AKHQPAKISAIFWARLLGKKLK------TSV-LAFKRVEDEPAIKNSFLKRSSFKQYFELMTVMF 954
            .|:.|.....|.|||:|.::|:      ||: ..|....||.|:         .::|.|:.|::.
  Rat   606 NKNMPFTSGNIKWARMLLERLQMFWSNFTSLHYLFPDSPDEAAV---------CQKYAEMTTLLD 661

  Fly   955 QFEKVLFENFIQNATYLVNTTNRSNVLRIRICKESTMSYISEAVQTLKAKPRPELQMTSDRRVTP 1019
            |||..::..:.:|    |:.|...| |...:.|.|.::    .:.::...|:....:...:.:..
  Rat   662 QFESRIYSEWRRN----VDKTCEFN-LNQPLVKFSPIN----GLLSVNFDPKLVAVLREVKYLLM 717

  Fly  1020 VKSSNLMPVQSEAFSAYSVADSAGTEISSESENEGLLVGDTSQKKLMCRI-------------NR 1071
            :|.||:..      ||..:.......:......|.|:.|....|:.:..:             .:
  Rat   718 LKKSNIPD------SALGIFQKKNIILKHIGNLELLVQGYNKLKQTLLEVEYPLIEKELGAIDEQ 776

  Fly  1072 LTVLVAMIMWMVSNTRKANIQLQECTAFIKMVKDKKPKDVTAMDRHCVRTCELLQRAES------ 1130
            |.|....:.|.           .:...:::.|:              |.|.||.:|...      
  Rat   777 LRVAATWLTWQ-----------DDFWVYMEKVQ--------------VATAELERRVSQTQSNVQ 816

  Fly  1131 --QYLLPIWRELVGEKTLIEYDMDFVVNLKRDVFDVLFEAQQFEHLGFTLPAVLRTAIMKKDLLF 1193
              |..:..|.|                      :.:|...:.......||..       |.||..
  Rat   817 TIQQTMQAWAE----------------------WPLLPRRETRREAALTLDD-------KGDLFA 852

  Fly  1194 KDYERMTEVVDRYRSIINNLSMSEVIFLRGHIYDTELFIQMGVGRYTWTSFNIGKFCDQINSQLR 1258
            |.|:.:.|  |.|:  |:||           :.:.....:......:|..:  .:|.|.|     
  Rat   853 KKYKLIRE--DGYK--IHNL-----------VEENRKLFRADPSLDSWKIY--VEFIDDI----- 895

  Fly  1259 KLTSIVSQINFIRLDLRSRIDMIKSFNLFNLDDELKVEDTSRSSGESYLQDRKNPSQRFKSVTGE 1323
                :|.  .|.:..|.   |:  .|.|.|.:.:||                  |:..|::    
  Rat   896 ----VVE--GFFQTILH---DL--DFFLRNTEKQLK------------------PAPFFQA---- 927

  Fly  1324 TITMFSVEKDVPADEKAEQACGSGIYPCQGYFELLEASRNRKAAQMKKLYDSLGPVLVKLESLVL 1388
              .|..:..::......|:..|.|.|      .|:||                         ::.
  Rat   928 --QMLLMPPEIVFKPPLEREAGDGFY------NLVEA-------------------------MLC 959

  Fly  1389 GTF--SGRSDRMKTYYEYWEGETFKCIVDMTYQNLKCYINRLLSNKPMFEVNAVLLMSEIVLEPS 1451
            |:|  |.:..|:..:.:         |.|  |||               :::.:|.::|:     
  Rat   960 GSFKVSAQMGRVAAHLD---------IPD--YQN---------------DMDNMLGLAEV----- 993

  Fly  1452 VQELQNTIVTATKDYISRLRIFTRWMTGTCIACPLVEMGKQFKYNYTYYEDVIQIRSIVDLVINI 1516
            .||:.|.:.    |.|.::..|...:.               .|:|.:.:|.::|  :...::..
  Rat   994 RQEIMNRVA----DVIDKVLEFRSSLE---------------TYSYLWVDDRVEI--LRQFLLYG 1037

  Fly  1517 HDLASRVANEARGFVSQFRKYFNLWAFEKSFICQKFLEKQVTLIEIDEKFTFYSSIVETLANTRK 1581
            |.:.|...:...|                    :..|:.. ||.:..|:...|.::...::   |
  Rat  1038 HAVPSEEIDAPAG--------------------EDILQSP-TLEQFKEQIDIYEALYVQMS---K 1078

  Fly  1582 FQDIKC----VRINLEPLLASITQHAQDWCTTLGEELLRHVNDNMRAMRNEVKTLSLNLNKTTRE 1642
            |.|.:.    .:|::.|...|:....:.|.....|.|||.|.|::..::..:|..:..|.:...|
  Rat  1079 FDDFRVFNSWFKIDMRPFKLSMLNVIKKWSWMFQEHLLRFVVDSLSELQGFIKQTNAGLQRQPHE 1143

  Fly  1643 LEDFKLV--MTTIGTVQSSTLTNEQKIHEMQETFTILSEHKIMFPYEDMLMAHHLEKRWKRL-FL 1704
            .:...||  |..:..|:|.....::....::||..:|..:....|.:.......|.:||:.. .:
  Rat  1144 GDHDGLVDIMGHLLAVRSRQRATDELFEPLKETIMLLESYGQKMPEQVYAQLEELPERWETTKKI 1208

  Fly  1705 SALYRYEKLQPIKQKFADMTSVEIDEFCDDLAEFIKDYDENGPGSVGAELERGVRLMDPYGQKIA 1769
            :|:.|:| :.|::.....:...:...|.:..|||.:.:....|  :|.:.|....::|...|::.
  Rat  1209 AAVVRHE-VSPLQNAEVTLLRKKCILFDEKQAEFRERFRSYAP--LGFKAENPYSVLDKANQELE 1270

  Fly  1770 ERESRREELANAERLFDMAMVDYHEFARVQTEFEGLQQLYKLYKAQKYAREGWGKTLWADLDPNV 1834
            ..|....::.|..|||::.:.:|.:..:.:.|...|::|:.:....:.:.:.|.:|.|..::...
  Rat  1271 ALEEEVVQMQNCARLFEVVLPEYKQMKQCRREVRLLKELWDIIVYVRRSIDNWTETRWRQVNMEQ 1335

  Fly  1835 LTEGVESYLKEFRKFTKAVRTLPVGVQLEIHMKQFKGTVPLMVSLKHEALRERHWLQLMEKTGQY 1899
            :...:..:.||.....||||.......||..:|....::..:..|::.|||:|||.||....|..
  Rat  1336 MDLELRRFAKEIWSLDKAVRVWDAYSGLEGTVKDMTTSLRAVAELQNPALRDRHWQQLTNAIGVR 1400

  Fly  1900 FDMSPARFTLENMFAMQLHKYQEIAEQILTNAIKELQIERGVQAVIETWASMAFKTFKHFKGSDD 1964
            |.::.:. ||.::.|:|||:.:|....|:..|:|||..|:.:..|..||.::.|....|.:....
  Rat  1401 FSINDST-TLADLLAVQLHQVEEDVRDIVDKAVKELGTEKVITDVSHTWEALEFSYEVHHRTGTP 1464

  Fly  1965 RGWVLGPVDEIMQILEDN---------------------------AMNLQSMGASQFIGPFLETV 2002
               :|...:::.:.||.|                           .:.||::..|:::..|::.|
  Rat  1465 ---LLKSDEQLFETLEHNQSFLLGLGTSWLATEPLGSAYSHAGILQVQLQTLLQSKYVEYFIDQV 1526

  Fly  2003 NKWERTLALISEIIDEWLVVQRKWLYLEGIFI-GGDIRTQLPEEARKFDDIDKSYRRIMVDCAKN 2066
            ..|:..|.:...:|..|:.|||.|.:||.||: ..|||.||.|:|::||::|..::.:|...||.
  Rat  1527 LSWQNKLNVADAVIFTWMQVQRTWSHLESIFVCSEDIRIQLVEDAQRFDEVDAEFKELMFKTAKI 1591

  Fly  2067 PLVVPFCTVPGRLVEIQGLGIGLENCQKSLNEYLDSKRRIFPRFYFISTDELLSILG-SSEPSAV 2130
            ..|:.....|....:::.....|..|:|:|.|||::||..|.||||||:.:||.:|. .::|..|
  Rat  1592 KNVLEATCRPHLYEKLKDFQHRLSLCEKALAEYLETKRVTFSRFYFISSADLLDLLSKGAQPKQV 1656

  Fly  2131 QNHIIKMYDNIKSLRLV--KEGSQTIVTGMISSEGEVMEFRHSARAAGRVEYWMNDVLDEMRRSN 2193
            ..|::|::|:|..|:..  .|.|.....||.|.|.|.:.|:......|.||.|:..:...|:.:.
  Rat  1657 TRHLVKLFDSISDLQFEDNPEVSTCKAVGMFSKEKEYVSFQAGCECIGHVESWLLQLEQTMKETV 1721

  Fly  2194 RFINKTAI--YDFGTDLQISRPDWLMNYQGMVGLAASQVWWTAEVEEAFDQAQNHGNMRAMKDFL 2256
            |.....||  |:     :..|..|:.::...|.|..||:|||.:|..||.:.: .|...|:|||.
  Rat  1722 RLAIAEAIAAYE-----EKPRELWIFDFPAQVALTGSQIWWTTDVGIAFSRLE-EGYETALKDFH 1780

  Fly  2257 GKNNYQIEELVLKVRSNLSRNDRLKFKAQCTVDVHARDIIDNFVRDNVLDASEFSWESQLRFYWI 2321
            .|...|:..|:..:...||..||.|....||:||||||::...:...|:....|:|.||||..|.
  Rat  1781 KKQISQLNTLITLLLGELSPGDRQKVMTICTIDVHARDVVAKLISQKVVSPRAFTWLSQLRHEWE 1845

  Fly  2322 KFYDNLHVLQCSGSFDFGYEYMGLNGRLVITPLTDRIYLTITQALLMNLGGAPAGPAGTGKTETV 2386
            :...:..|..|...|.:.|||:|.:.||||||||||.|:|:||:|.:.:.||||||||||||||.
  Rat  1846 ESRKHCIVNICDAHFQYCYEYLGNSPRLVITPLTDRCYITLTQSLHLTMSGAPAGPAGTGKTETT 1910

  Fly  2387 KDLAKAMGLLCVVTNCGEGMDYRAVGTILSGLVQCGAWGCFDEFNRIDISVLSVISTQLQTIRNG 2451
            |||.:|:|::..|.||.|.||||::|.|..||||.||||||||||||.:.||||::.|::.|.:.
  Rat  1911 KDLGRALGMMVYVFNCSEQMDYRSIGNIYKGLVQTGAWGCFDEFNRIAVEVLSVVAVQVKMIHDA 1975

  Fly  2452 LIRKLDRFVFEGVEIHLDPKCGVFVTMNPGYAGRTELPESVKALFRPVTCIKPDLELICLISLFS 2516
            :..:..||||.|..|.|.|..|:|:|:||||||||||||::||||||...:.||.||||.|.|.:
  Rat  1976 IRSRRRRFVFLGETIPLKPSVGIFITLNPGYAGRTELPENLKALFRPCAMVAPDTELICEIMLVA 2040

  Fly  2517 DGFLTAKVLAKKMTVLYSLAQAQLSKQCHYDWGLRSLNSVLRMAGVMKRQSEDLPEAVVLMRVLR 2581
            :||:.|:.||:|...||:|....||||.|||||||::.|||.:||.:||..::.||..||||.||
  Rat  2041 EGFVDARSLARKFISLYTLCDELLSKQDHYDWGLRAIKSVLVVAGSLKRGDKNRPEDQVLMRALR 2105

  Fly  2582 DMNFPKFVFEDVPLFLGLIKDLFPGIDCPRIGYPDFNAAVRHVLV------NDGYILLPDQEDKV 2640
            |.|.||.|.:|||:||||:.||||.:|.||...|.|...|:...:      .:.:||      ||
  Rat  2106 DFNMPKIVTDDVPVFLGLVSDLFPALDVPRQRKPHFEQMVKQSTLELRLQPEESFIL------KV 2164

  Fly  2641 VQMYETMMTRHSTMLVGPTGGGKTVVINALVKAQTHMGLPTKCLVLNPKACSVIELYGFLDMETR 2705
            ||:.|.:..|||..:||..|.||:.::..|.:...:|........|||||.:..||:||:...||
  Rat  2165 VQLEELLAVRHSIFVVGNAGTGKSKILRTLNRTYVNMKQKPVWNDLNPKAVTTDELFGFIHHATR 2229

  Fly  2706 DWIDGLFSNIFREMNKPIEREERRYACFDGDVDALWIENMNSVMDDNKLLTLANGERIRLENYCA 2770
            :|.|||.|:|.||... :..:...:...|||:|.||||::|:||||||:||||:.||:.|.....
  Rat  2230 EWKDGLLSSILREQAN-LTHDGPTWIVLDGDIDPLWIESLNTVMDDNKVLTLASNERVALTPSMR 2293

  Fly  2771 LLFEVGNLNYASPATVSRAGMVYVDPKNLRYSPFWQRWV-LTRPEPQRELLNDFFEKIITQSIAF 2834
            ||||..:|..|:||||||||::||:|::|.::|:...|: ..|.:.::..|...|:|.    |..
  Rat  2294 LLFETHHLQTATPATVSRAGILYVNPQDLGWNPYVASWIDRRRHQSEKANLTILFDKY----IPV 2354

  Fly  2835 ILEGLDGTTQGNPLKLVIMQTDLNMVTQFCNLYDALLPNYVMDSKNYDEPVQQNYNTDSLECCFL 2899
            .||.|     ....|.:....:.::|...|.|.:.||.         .|.:..:...::.|..|:
  Rat  2355 CLEKL-----RTSFKAITSVPESSLVQTICTLLECLLT---------PENIPSDSPKETYEVYFV 2405

  Fly  2900 QAVYGSMGACL----VEKHQPVFDEY----MKRISGFPLVQDTPENPASGGQFPQSKPTLYDYFW 2956
            .|...:.|..|    :..:|..|..:    ||.:                 :|| |:.|::||:.
  Rat  2406 FACVWTFGGTLLRDQLSDYQADFSRWWHKEMKAV-----------------KFP-SQGTIFDYYL 2452

  Fly  2957 DVKDNVWKAWEWVVQPYTHDPQVKFSEILVPTVDNTRTNRTLSLMSEIKRPVLLVGEAGTSKTAT 3021
            |.|...:..|...|..:|.|.......:||.|.:.||......|:....:|::|||.||..||..
  Rat  2453 DHKTKKFLPWTDKVPQFTMDADAPLKTVLVHTPETTRLRYFTELLLNKGKPLMLVGNAGVGKTVF 2517

  Fly  3022 IMQYLRNLNPSVNVILNINFSSRTSSLDVQHTLEAAVEKRTKDTYGPPMGKRIACFIDDMNMPQV 3086
            :...|.:::... ::..:.|:..|:|.|:|..||..:||:....|||...|::..||||:|||:|
  Rat  2518 LSDTLASISEDY-IVSRVPFNYYTTSADLQRILEKPLEKKAGRNYGPRGNKKLVYFIDDLNMPEV 2581

  Fly  3087 DDYGTQQPIALLKLFFERGGMYDRDKDLNWKKFKDLTFYAAMGTAGGGRNEVDPRFISMFSTYNI 3151
            |.|||.||.|||:...:.|..|||.| :..|:.::..:.|.|....|... ||||....|:....
  Rat  2582 DLYGTVQPHALLRQHIDYGHWYDRHK-VMLKEIRNCQYVACMNPMAGSFT-VDPRLKRHFTVLAF 2644

  Fly  3152 IFPNDESLIQIYSSIFKGHMVFVKFQPEYMLIADMIVHMTLKLFKMVIVDLPPTPSKFHYIFNLK 3216
            .||:.::|..||..||..::....|.|..:.....::..|:...:.:..:..||..||||.|||:
  Rat  2645 NFPSLDTLTTIYGQIFSFYLQQQAFCPSVLRTGPSLIQATIAFHQTMAENFVPTAIKFHYNFNLR 2709

  Fly  3217 DLSRIFAGMLLIEPTCFKGLRDLIRVWRNEYTRIICDRLITDNDIANVRRNLAVEVAERFPPTFE 3281
            |||.||.|:|...|.|.|...||.|:|.:|.:|:..|||:..||....:|.:           .|
  Rat  2710 DLSNIFQGILFASPECLKCPEDLARLWLHETSRVYGDRLVDANDSDLFQRKM-----------LE 2763

  Fly  3282 EEHGFIDAAAAEAEAQARLLYEPSKADIDGGEEEGEEEEEGEEAPQVILSLKDYVLRDPLLFGDF 3346
            ..|.:...|.|....|..|:|                                            
  Rat  2764 AAHKYFKGADANTLQQQPLVY-------------------------------------------- 2784

  Fly  3347 RNFTNESEPRLYEDLLDYNSVYFLFTEILEEYCERKQKMTLVLFEDCLEHLTRVHRTLRMNRGHV 3411
            .:|.:..|...||.:.|:..:..:.||::..|.|...:|.||||||.::|:.|:.|.||..:||.
  Rat  2785 CHFASGREDPCYEPVKDWEGLKAVLTEMMGNYNELHSEMHLVLFEDAMQHVCRISRILRTPQGHA 2849

  Fly  3412 LLIGVGGSGKKCITRLAAFAAECDVFEITISRGYNEAAFREDLKVLYTIAGVKRKKVVFLFTGAQ 3476
            ||:|||||||:.::||||:....:||:||::.||.....|.||..||...|.|....|||.|.|.
  Rat  2850 LLVGVGGSGKQSLSRLAAYICSLEVFQITLTEGYGTQDLRVDLANLYVRTGAKNMPTVFLLTDAH 2914

  Fly  3477 VAEEGFLELINNILTVGQVPALFPDEDKDGIVNQVRKFAEEDGVSASKDAVWGYFLRTCAENLHV 3541
            |.:|.||.|||::|..|.:|.||.|||.|.|::.:|......|::.|::..|.:||......|.:
  Rat  2915 VLDESFLVLINDLLASGDIPGLFSDEDTDKIISGIRNEVRGLGITDSRENCWAFFLARVRLQLKM 2979

  Fly  3542 VLCMSPAGDALRNRCRNFPGLIGSTYIDWVFPWPRQALYAVAKLFLTEHRLIPASHREAIVEHVV 3606
            |.|.||.|..||.|.|.||.|:..|.|||...||::||.:|::.|:.|...|...|:::|...:.
  Rat  2980 VFCFSPVGHTLRVRARKFPALVNCTAIDWFHAWPQEALVSVSRRFIEEIEGIEPQHKDSISLFMA 3044

  Fly  3607 HVHTSIQQYSKDYLAKLRRNNFVTPKHYLDYINTYRGLLEEKAKFITQQRSRLGEGIKKIEEASV 3671
            :||||:::.|..|....||.|:.||:.:|:.|:.::.||::|...:.:::..||.||:|::..:.
  Rat  3045 YVHTSVKEVSAWYYQNERRYNYTTPRSFLEQISLFKSLLKKKRGEVQRKKEHLGNGIQKLQTTAS 3109

  Fly  3672 QIDELRIIVTEQKKNVAVASEECEAMLVTIESSTQKANVKK--AEASEK---SVEVEIKGKQIAI 3731
            |:..|:..:..|:..:.:.:::.||::..|...|:|.:.:|  |:|.|:   :::.|...||...
  Rat  3110 QVGNLKARLASQEAELQLRNQDAEALITKIGLQTEKVSREKAIADAEERKVAAIQTEASQKQREC 3174

  Fly  3732 EKDEAEEILAEAMPALEEARLALSQLEKAQITEIRSFATPPAAVQVVCECVAIL---KGY--KEI 3791
            |.|     |.:|.|||..|..||:.|.:..:||:::|..||.||..|...|.:|   :|.  |:.
  Rat  3175 EAD-----LLKAEPALVAATAALNTLNRVNLTELKTFPNPPNAVTNVTAAVMVLLAPRGRVPKDR 3234

  Fly  3792 NWKSAKGMMSDV-NFLKSLMEMDCEALTQKQITQCRQHMKTGNLED-------MAKISVAGAGLL 3848
            :||:|:..|..| :||::|:..|.|.:.:    .|.:.:....|:|       :...|.|.|||.
  Rat  3235 SWKAARIFMGKVDDFLQALINYDKEHIPE----NCLKVVNEQYLKDPEFNPNLIRTKSFAAAGLC 3295

  Fly  3849 RFVRAVLGFFDVYKEVKPKKERLDFLVEEQEVQIKLLNHLNGEIQKLEEKLNELNENYATSMKQM 3913
            .:|..::.|::||.:|:||::.|.....:.....:.|..:..::..|:..|..|..::..:..:.
  Rat  3296 AWVINIIKFYEVYCDVEPKRQALAQTNLDLAAATEKLEAVRRKLVDLDHNLRRLTASFEKATAEK 3360

  Fly  3914 RALTEMMQQAERRLIASDKLISGLTSELIRWSKEMASLGQQLIDSVGGCLISASFLAYTGAFTWE 3978
            ....|.:.|..:.:..:::|:|.|.||.|||.:.:.|...|.....|..|::|:|::|.|:||.:
  Rat  3361 VRCQEEVNQTNKTIDLANRLVSELESEKIRWGQSIKSFETQEKTLCGDVLLTAAFVSYIGSFTRQ 3425

  Fly  3979 FRKAMVFDDWLEDI-ASLGIPIQLPFKIDGYLTTDVEISQWSNEGLPPDELSIQNGILTMRASRF 4042
            :|:.:|...|:..: ..:.|||.....:...||.|..|:.|:|:|||.|.:|.:|..:.....|:
  Rat  3426 YRQELVDCKWIPFLQQKVSIPIAEGLDMIATLTDDATIATWNNQGLPSDRMSTENATILTHCKRW 3490

  Fly  4043 PLCIDPQLQALQWIRKREFKNNLKVLSFSDSDFLKQLEMAIMYGTPVLFEDVDDYIDPVIDDILQ 4107
            ||.||||.|.::|| |.::..:|||.......||..:|||:.:|..:|.|::.:.:|||:..:|.
  Rat  3491 PLMIDPQQQGIKWI-KNKYGPDLKVTHLGQKGFLNAIEMALAFGDVILIENLKETVDPVLGPLLG 3554

  Fly  4108 KNIRIQGGRKFVMLGDKEVDWDPSFRVYLTTKFSNPKFDPAVYAKALVINYTVTQTGLEDQLLSV 4172
            :|...:|  |::.:||||.:::.:||:.|.||.:||.:.|.:.|:..::|:|||:.|||.|||:.
  Rat  3555 RNTIKKG--KYIRIGDKECEFNKNFRLILHTKLANPHYKPELQAQTTLLNFTVTEDGLEGQLLAE 3617

  Fly  4173 VVGTERPDLEAQRESLIAQTSENKQLLQQLEDSLLRELSTSTGNMLDNVELIETLENTKTKAGVV 4237
            ||..||||||..:..|....::.|..|:.||:.||..||.:.|:.||:.:|:|.||.||..|..:
  Rat  3618 VVSVERPDLERLKLVLTKHQNDFKIELRHLEEDLLLRLSAAEGSFLDDTDLVERLETTKATAAEI 3682

  Fly  4238 MEQLKLAADTAADIEVLRNGYRPAAKRGAVLFFALSDMATVNSMYQYALAAYLDVFVYSLRKAVP 4302
            ..::..|.:....|...|..|||.|.|.::::|.:||:..:|.:||::|.|:..:|..::.:|..
  Rat  3683 EHKVIEARENERKINETRECYRPVAARASLMYFVISDLRKINPVYQFSLKAFKTLFHRAIEQADK 3747

  Fly  4303 DASLNKRLNNIIKTLTENVYCYGCTGIFERHKLLFSFQIATKLAQRDGILLQSELDFFIKGSIAL 4367
            .....:|:..:::::|...:.:....:||:.||.|..|:|.::..|...:...||||.::.::..
  Rat  3748 VEDTQERICALMESVTYATFLHASQALFEKDKLTFLSQMAFQILLRRNEIHPLELDFLLRFTVEH 3812

  Fly  4368 TKSERSNPCKWLSEKSWEDVLKLAF--DF----PDIFGTLPDHFGRYLTEWKEWFDLENPEEVPC 4426
            |   .|:|..:|:.:||..|..:|.  :|    .|:.|:        ..:|::|.:.|.||:...
  Rat  3813 T---YSSPVDFLTAQSWSAVKAVALMEEFRGLDRDVEGS--------AKQWRKWVESECPEKEKL 3866

  Fly  4427 PGDYNIKCNAFQKLMFLRCFRVDRIFRSINQYIVETMDEFYIMPPVVSFSAIYEQTSSTIPVCFV 4491
            |.::. |.:..|||:.||..|.||:..::..::.|.:...|:....:.....:.::|...||.|:
  Rat  3867 PQEWK-KKSLIQKLIILRAVRPDRMTYALRNFVEEKLGTKYVERTRLDLGKAFGESSPGTPVFFI 3930

  Fly  4492 LSAGSDPTNDLIKLADTI---VGMSNFCHISLGQGQEKAALRLLDGAIKQGMWLMLQNGHLLIRF 4553
            ||.|.|...||..|...:   :....|.::|||||||..|...|:.|...|.|:.|||.||:.::
  Rat  3931 LSPGVDALKDLEVLGKRLGFTIDSGKFHNVSLGQGQELVAEMALEKAAIGGHWVFLQNVHLVAKW 3995

  Fly  4554 VRELEKHLDRI-ENPHPDFRLWITTDPTPT-----FPIGILQKSLKVVTEPPNGLKLNLRSTYFK 4612
            :..|||.|::. :..|.|:|::::.:..|:     .|.|:|:.|:|:..|||.|:..||.:..:.
  Rat  3996 LGTLEKLLEKFSQGSHRDYRVFLSAEAAPSQHEPVIPQGLLENSIKITNEPPTGMLANLHAALYN 4060

  Fly  4613 VRQERLESCS-HVAFRPLVYVLAFFHAVVQERRKYDKLGWNIAYDFNDTDFDVCTEILRTYLTRC 4676
            ..|:.||.|| ...|:.:::.|.:||..|..|.::...||:.:|.|:..|..:||.||..:|.  
  Rat  4061 FDQDTLEMCSKDQEFKSILFSLCYFHGCVAGRLRFGPQGWSRSYPFSPGDLTICTNILYNHLE-- 4123

  Fly  4677 GTGKIPWNSLKYLIGEVMYGGRVIDDFDRRITNCYMNEYMGDFL---------------FDEFKV 4726
            ....:||..|:||.||::|||.:.|.:||::...|:.|:|...|               :.::..
  Rat  4124 ANPHVPWEDLRYLFGEIIYGGHITDAWDRKLCRVYLEEFMNPSLIEDELMLAPGFAAPPYSDYSG 4188

  Fly  4727 FHFYEDDNVDYCLPEEETILKEDYIAHIDKLPLVNKPDVFGLHPNAEIGYYTMAARNIWNSLIEL 4791
            :|.|.:|    .||.|                   .|.::||||||||...|:.:..::.:|:|:
  Rat  4189 YHQYIED----MLPPE-------------------SPALYGLHPNAEIELLTVTSNMLFRTLLEM 4230

  Fly  4792 QPQTGEGT--GGISRDDFIDSVAAGILKKLPPAFETWRIRKQIQMSLSPTGVVLLQELDRFNLLV 4854
            ||:.....  .|.|.:|.:.::...||::||..|....| .|...:.||..:|..||.:|.|:|:
  Rat  4231 QPRNAVSNEEQGQSTEDKVKNILDDILERLPEEFNMAEI-MQKNPNRSPYILVCFQECERMNVLL 4294

  Fly  4855 VRIKKTLELLRKAIAGEIGMDNVLDNIANSLFNGLLPAAWSKLAPATCKQLASWLEHLRLRAVQY 4919
            ..|:.:|:.|...:.||:.:...::...::|....:|..|:|||..:...||.|...|.||..:.
  Rat  4295 REIRVSLQHLDLGLKGELTLSPDVETQLSALSYDRVPDTWNKLAYPSTYGLAQWFNDLLLRCREL 4359

  Fly  4920 KYWTLS-GEPLVMWLSGLHIPQSYLTALVQIACRRNAWPLDRSTLFTYVTKFADPDDVEERPVTG 4983
            ..||.. ..|.|:|||||..|||:|||::|...|:|.|||||..|...||| ...:|....|..|
  Rat  4360 DTWTQDLTLPAVVWLSGLFNPQSFLTAIMQTMARKNEWPLDRMCLTIDVTK-KTKEDYGHPPREG 4423

  Fly  4984 CLVHGLYIEGGRFDLATNQLARSHPKVLVEELAILAVEPIEAHRLKLQNTYLAPVYTTSLRRNAM 5048
            ..:|||::||.|:|:.:..|..:..|.|...:.::..:.|.|.|.::::.|..|||.|..|    
  Rat  4424 AYLHGLHLEGARWDIQSGALVDARLKELTSTMPVIFAKAIPADRQEVKHAYECPVYKTKAR---- 4484

  Fly  5049 GVGLVFEANLATSEDLSHWILQGVCLTL 5076
            |:..|:...|.:.:.::.|:|.||.|.|
  Rat  4485 GLTYVWTFRLRSKDRIAKWVLAGVALLL 4512

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
Dhc98DNP_524541.3 DHC_N1 523..983 CDD:285571 98/505 (19%)
DHC_N2 1798..2201 CDD:285579 120/433 (28%)
P-loop_NTPase 2338..2565 CDD:304359 132/226 (58%)
P-loop_NTPase 2654..2788 CDD:304359 58/133 (44%)
P-loop_NTPase 2976..3246 CDD:304359 93/269 (35%)
P-loop_NTPase 3378..3645 CDD:304359 110/266 (41%)
MT 3658..3989 CDD:289543 95/348 (27%)
AAA_9 4017..4233 CDD:289547 86/215 (40%)
Dynein_heavy 4374..5068 CDD:281078 219/727 (30%)
Dnah11XP_038934019.1 DHC_N1 220..789 CDD:400611 112/622 (18%)
DHC_N2 1296..1722 CDD:400618 119/429 (28%)
DYN1 1550..4164 CDD:227570 946/2746 (34%)
AAA_6 1862..2188 CDD:403853 178/331 (54%)
MT 3095..3439 CDD:289543 96/352 (27%)
Dynein_C 4217..4512 CDD:408026 97/300 (32%)


Information from Original Tools:


Tool Simple Score Weighted Score Original Tool Information
BLAST Result Score Score Type Cluster ID
Compara 00.000 Not matched by this tool.
Domainoid 00.000 Not matched by this tool.
eggNOG 00.000 Not matched by this tool.
Hieranoid 00.000 Not matched by this tool.
Homologene 00.000 Not matched by this tool.
Inparanoid 00.000 Not matched by this tool.
OMA 00.000 Not matched by this tool.
OrthoDB 1 1.010 - - D1492at2759
OrthoFinder 1 1.000 - - FOG0000396
OrthoInspector 00.000 Not matched by this tool.
orthoMCL 1 0.900 - - OOG6_100025
Panther 00.000 Not matched by this tool.
Phylome 1 0.910 - -
SonicParanoid 00.000 Not matched by this tool.
SwiftOrtho 00.000 Not matched by this tool.
TreeFam 00.000 Not matched by this tool.
43.820

Return to query results.
Submit another query.