DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment Dhc98D and Dnah9

DIOPT Version :9

Sequence 1:NP_524541.3 Gene:Dhc98D / 43379 FlyBaseID:FBgn0013813 Length:5080 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:XP_002727768.2 Gene:Dnah9 / 117251 RGDID:621799 Length:4484 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:4914 Identity:1459/4914 - (29%)
Similarity:2403/4914 - (48%) Gaps:691/4914 - (14%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly   350 ESGPGLLELSKPSEFRLRALKQQKKMKEKEAAAKKAKAKKTDAEPTEEEE--------EADAHKV 406
            :||||.| :.:|.        .....:..:|.||.....:|.:||.....        :..|..:
  Rat    73 QSGPGGL-VVRPG--------LDAGPEPNQARAKGLFFLRTRSEPPGNHSLRGTVLCGDLPAVPL 128

  Fly   407 EAHLSSSEEEVEIKVEKLTIGQRWEKMLNETKAKVEAEHAAEEATPPRITPIQRRLLKEIEEFQS 471
            | ||:....||.|.|            |:..|..::..|.           :.:.:.......||
  Rat   129 E-HLAPLLSEVIIPV------------LDNEKNHLDWPHM-----------VCQDIRHHAHSLQS 169

  Fly   472 EITWTINHIVWAFSLPSSYILP-GQEATEFEDAIIRVPVDPKRLDLVITYTQQQLEEVVDGWIKY 535
            ::...:.|:.....||    || |.|..||.|.... ||    ||.:...|...:|..|..|...
  Rat   170 DLLVILEHMKGRTLLP----LPVGSEKVEFVDGQSE-PV----LDSIDKSTVYAMESAVIKWSHQ 225

  Fly   536 LKKTMKTLTDAKL---DDFTPMAEHRYWHKMEVE----LYGTLEQLKTEFVVAVLQRLTDDKSPV 593
            ::..:|..:...|   :..||..|..:| |...|    :|..|..:|...:..:|.:|   :|..
  Rat   226 VQVVLKRESSQPLIQGEKPTPKVELEFW-KSRCEDLEHIYNQLMTIKVRGMAGLLDKL---QSSY 286

  Fly   594 LDEWQAVVEKTEARFKLAKENSDYLGTIIDYLEKVRSYESFKMVVLQIPNIMVGLR---H----I 651
            |..::|:.:..||....|::...:|..:..:|:.:.:        ::.|.:...||   |    |
  Rat   287 LPAFKAMFQDVEAALTEAQDIRVHLLPLQQHLDILEN--------MEFPEVKGRLRPLLHVVCLI 343

  Fly   652 WTMSSHYCRDPEMQVLLCQISNVFVQKVKSIINFENIFKYSATYTYETATNCANLLRCWKQAYKL 716
            |.....|.....:.|||.:|.|:.:|:..:.::.|::.:.....:.......::.|..:|||::.
  Rat   344 WANCKWYRSPGRLTVLLQEICNLLIQQASNYLSPEDLLRSEVEESQRKLQIVSDTLSFFKQAFQD 408

  Fly   717 SRQHI-----EDSGAGSRWEFDRVALFNEVNHI---HRVAVDIAYVGRVFVQYENLFGHRLKACI 773
            .|:|:     |||...: |:|....:|..::..   .|:..|:......|.:.|.|....|:.  
  Rat   409 RREHLHTYFKEDSEVRA-WDFQASLVFVRLDGFLGRLRMVEDLLKTALDFNKLEKLEFSGLRG-- 470

  Fly   774 ADPSIVDNLMRKVYRM---LDDLIK---SVDYDMFRPGNWENWEYSLEL--FNKRLDNVENEAKN 830
                  ::|.:||.:|   .:::.|   ...||...|   |:.|:..::  ||||:::::.....
  Rat   471 ------NSLSQKVQQMHEEFEEMYKVFLDCSYDCLNP---ESMEFENDVCGFNKRVEDLDRRLGT 526

  Fly   831 VIDQSINSLLSSEKGLDLVVNAMNIDTRATLQEFVATKHENLLRFFVTEINAVERVFTKLKKS-- 893
            ::.|:.:.:...|....|:.....:..|..:.:.|:.|:..|:|.|.||::||..::::..:.  
  Rat   527 ILIQAFDDVPEVEHAFKLLDITGTLVERPLVAQDVSHKYLALIRMFNTELDAVRIIYSQHIREEV 591

  Fly   894 ----PPMAKHQPAKISAIFWARLLGKKLKTSVLAFKRVEDEP--AIKNSFLKRSSFKQYFELMTV 952
                .|:.|:.|.....|.||:.|.:::|.....||.:   |  .::::..|| ..::|.:|:|:
  Rat   592 EHGFSPVHKNMPTMAGGIRWAQELRQRIKGPFSNFKNI---PHWCLQSAEGKR-MIQKYEDLLTL 652

  Fly   953 MFQFEKVLFENFIQNATYLVNTTNRSNVL-----RIRICKESTMSYISEAVQTLKAKPRPELQMT 1012
            :.::|:.|:|::.|.    |:..::.|:.     |..|.|:.::::.|:.:..||     |:...
  Rat   653 LEEYERRLYEDWCQT----VSEKSQRNLSLPLLHRDPITKQLSVNFNSQLISVLK-----EMNYL 708

  Fly  1013 SDRRVTPVKSSNLMPVQSEAFSAYSVADSAGTEISSESENEGLLVGDTSQKKLMCRINRLTVLVA 1077
            ....|.|:..:......|..|....||:                                  |..
  Rat   709 QPTEVKPIPETAAAMFSSREFYRQLVAN----------------------------------LEL 739

  Fly  1078 MIMWMVSNTRKANIQLQECTAFIKMVKDKKPKDVTAMDRHCVRTCELLQRAESQYLLPIWRELVG 1142
            |..|                 :.|::                                       
  Rat   740 MANW-----------------YNKVI--------------------------------------- 748

  Fly  1143 EKTLIEYDMDFVVNLKRDVFDVLFEAQQFEHLGFTLPAVLRTAIMKKDLLFKDYERMTEVVDRYR 1207
             .||:|.:...|             .::.:::...|.|...|...|           ||.:..|.
  Rat   749 -TTLLEVEFPLV-------------EEELQNIDLRLRAAEETLSWK-----------TEGIWDYA 788

  Fly  1208 SIINNLSMSEVIFLRGHIYDTELFIQMGVGRYTWTSFNIGKFCDQINSQLRKLTSIVSQINFIRL 1272
            ..|.|           .|:|.|..||.       |..|:    ::|.:.::...|.:    |.|.
  Rat   789 MQITN-----------SIHDLERRIQK-------TKDNV----EEIQTIMKTWVSPI----FKRK 827

  Fly  1273 DLRSRIDMIKSFNLFNLDDELKVEDTSRSSGESYLQDRKNPSQRFKSVTGETITMFSVEKDVPAD 1337
            |.:....:       :|||:               ||                   .:||     
  Rat   828 DGKKECPL-------SLDDQ---------------QD-------------------LLEK----- 846

  Fly  1338 EKAEQACGSGIYPCQGYFELLEASRNRKAAQMKKLYDSLGPVLVKLESLVLGTFSGRSDRMKTYY 1402
                            |:.|:..|..:..|.::             |:|||......|...|:|.
  Rat   847 ----------------YYSLIRESGLKIHALVQ-------------ENLVLFAADPASSTWKSYV 882

  Fly  1403 EYWEGETFKCIVDMTYQNLKCYINRLLSN-------KPMFEVNAVLLMSEIVLEPSVQ------- 1453
                |.....::|..:..::|.:..||.|       .|:||....|:..|:|..||:.       
  Rat   883 ----GHIDSMLLDGFFLAIECSLKYLLENTECKPGLTPIFEAQLNLVTPELVFYPSLDSGVKGGL 943

  Fly  1454 -ELQNTIVT---ATKDYISRLR------------------------IFTRWMTGTCIACPLVEMG 1490
             ::..::||   |....:.||.                        :..|..|...:.|......
  Rat   944 YDIVQSLVTSIFAVPSLVPRLSPHSGSPHYQGDLEEMADLASLRSLLLERVQTMMTLCCSYRNTL 1008

  Fly  1491 KQFKYNYTYYEDVIQIRSIVDLVINIHDLASRVANEARGFVSQFRKYFNLWAFEKSFICQKFLEK 1555
            .|  |:|.|.||                     ..||.|   ||..|.::...|:       :|.
  Rat  1009 SQ--YSYLYVED---------------------RKEALG---QFLLYGHVLTPEE-------IEA 1040

  Fly  1556 QV--------TLI-----EIDEKFTFYSSIVETLANTRKFQDIKCVRINLEPLLASITQHAQDWC 1607
            .|        .|:     :||.....|..:| :|..::.|..  .:|:::.|..||:....:.|.
  Rat  1041 HVEDGIPESPPLLHHFKDQIDSYEKLYEDVV-SLEPSKVFDG--WMRVDVRPFKASLLNTIKKWS 1102

  Fly  1608 TTLGEELLRHVNDNMRAMRNEVKTLSLNLNKTTRELEDFKLVMTTIGTV------QSSTLTNEQK 1666
            ....:.|:..|.:::..:.:.:|:....|.|.. |..||:.::..:|.:      ||||   :..
  Rat  1103 LMFKQHLVDFVTNSLADLDSFIKSTECGLLKRV-EKGDFQGLVEIMGHLVTLKERQSST---DDM 1163

  Fly  1667 IHEMQETFTILSEHKIMFPYEDMLMAHHLEKRWKRLFLSALYRYEKLQPIKQKFADMTSVEIDEF 1731
            ...:::|..:|..::...|.........|.::||.:...|:...:::.|::.....:.......|
  Rat  1164 FEPLKQTIELLKSYEQELPETVFKQLEELPEKWKNVKKMAITVRQQVAPLQANEVALLRQRCSAF 1228

  Fly  1732 CDDLAEFIKDYDENGP---GSVGAELERGVRLMDPYGQKIAERESRREELANAERLFDMAMVDYH 1793
            .|:..:|.:.:.:..|   .|:...     :::|.:..:|...||....::.:..||::.:.||.
  Rat  1229 DDEQQQFQERFHKEAPFRFDSINPH-----QMLDVWHMEIQHMESTMATISKSADLFEVNVPDYK 1288

  Fly  1794 EFARVQTEFEGLQQLYKLYKAQKYAREGWGKTLWADLDPNVLTEGVESYLKEFRKFTKAVRTLPV 1858
            :..:.:.|...|::|:........:.:.|..|.|.::....:....:.:.::.|...|..||...
  Rat  1289 QLRQCRKEACQLKELWDTIGMVTSSIQAWEATSWRNISVEAMDSECKQFARQIRNLDKEFRTWDA 1353

  Fly  1859 GVQLEIHMKQFKGTVPLMVSLKHEALRERHWLQLMEKTGQYFDMSPARFTLENMFAMQLHKYQEI 1923
            ...||..:.....::..:..|::.|:|||||.|||:.||..|.|. ...||.::..:|||.:::.
  Rat  1354 FTGLESTVLNTLTSLRAVAELQNPAIRERHWRQLMQATGVNFTMD-RDTTLAHLLQLQLHHFEDE 1417

  Fly  1924 AEQILTNAIKELQIERGVQAVIETWASMAFKTFKHFK------GSDDRGWVLGPVDEIMQILEDN 1982
            ...|:..|:||:.:|:.::.:..|||||.|:...|.:      .||         ::::::||||
  Rat  1418 VRDIVDRAVKEMSMEKTLKELQTTWASMEFQYETHARTHIPLLQSD---------EDLIEVLEDN 1473

  Fly  1983 AMNLQSMGASQFIGPFLETVNKWERTLALISEIIDEWLVVQRKWLYLEGIFIGG-DIRTQLPEEA 2046
            .:.||::..|:::..|||.|:.|::.|:....:|..|..|||.|.:||.||||. |||.|||::|
  Rat  1474 QVQLQNLMMSKYVAFFLEEVSSWQKKLSTADSVISIWFEVQRTWSHLESIFIGSEDIRAQLPQDA 1538

  Fly  2047 RKFDDIDKSYRRIMVDCAKNPLVVPFCTVPGRLVEIQGLGIGLENCQKSLNEYLDSKRRIFPRFY 2111
            ::|:.||..:|.::.|..|.|.||......|...:::.:...|..|:|:|.||||:||..|||||
  Rat  1539 KRFESIDSDFRELVYDAQKTPNVVEATNKSGLYEKLEDIQSRLCLCEKALAEYLDTKRLAFPRFY 1603

  Fly  2112 FISTDELLSILGS-SEPSAVQNHIIKMYDNIKSLRLVKEGSQT---IVTGMISSEGEVMEFRHSA 2172
            |:|:.:||.||.: :.|..||.|:.|::||:..::...:.||.   ...||.|.|.|.:.|....
  Rat  1604 FLSSSDLLDILSNGTAPQQVQRHLSKLFDNMAKMQFQLDASQNPTKTSLGMYSKEEEYVAFSEPC 1668

  Fly  2173 RAAGRVEYWMNDVLDEMRRSNRFINKTAI--YDFGTDLQISRPDWLMNYQGMVGLAASQVWWTAE 2235
            ..:|:||.|:|.||..|:.:.|.....|:  |:     :..|..||.:|...|.|..:|:|||.|
  Rat  1669 DCSGQVEIWLNRVLRHMKATVRHEMTEAVTAYE-----EKPRDQWLFDYPAQVALTCTQIWWTTE 1728

  Fly  2236 VEEAFDQAQNHGNMRAMKDFLGKNNYQIEELVLKVRSNLSRNDRLKFKAQCTVDVHARDIIDNFV 2300
            |..||.:.: .|...||||:..|...|::.|:..:...||:.||.|....||:||||||::...:
  Rat  1729 VGIAFARLE-EGYENAMKDYYKKQVAQLKTLITMLIGQLSKGDRQKIMTICTIDVHARDVVAKMI 1792

  Fly  2301 RDNVLDASEFSWESQLRFYWIKFYDNLHVLQCSGSFDFGYEYMGLNGRLVITPLTDRIYLTITQA 2365
            ...|.:|..|.|.||||..|.....:.....|...|.:.|||:|...||||||||||.|:|:||:
  Rat  1793 AQKVDNAQAFLWLSQLRHRWDDEAKHCFANICDAQFLYSYEYLGNTPRLVITPLTDRCYITLTQS 1857

  Fly  2366 LLMNLGGAPAGPAGTGKTETVKDLAKAMGLLCVVTNCGEGMDYRAVGTILSGLVQCGAWGCFDEF 2430
            |.:.:.||||||||||||||.|||.:|:|::..|.||.|.|||::.|.|..||.|.|||||||||
  Rat  1858 LHLTMSGAPAGPAGTGKTETTKDLGRALGIMVYVFNCSEQMDYKSCGNIYKGLAQTGAWGCFDEF 1922

  Fly  2431 NRIDISVLSVISTQLQTIRNGLIRKLDRFVFEGVEIHLDPKCGVFVTMNPGYAGRTELPESVKAL 2495
            |||.:.||||::.|:::|::.:..|..||.|.|.||.|||..|:|:||||||||||||||::|||
  Rat  1923 NRISVEVLSVVAVQVKSIQDAIRDKKQRFSFLGEEISLDPSVGIFITMNPGYAGRTELPENLKAL 1987

  Fly  2496 FRPVTCIKPDLELICLISLFSDGFLTAKVLAKKMTVLYSLAQAQLSKQCHYDWGLRSLNSVLRMA 2560
            |||...:.||.||||.|.|.::||:.|::||:|...||.|.:..||||.|||||||::.|||.:|
  Rat  1988 FRPCAMVVPDFELICEIMLVAEGFIEARLLARKFITLYRLCKELLSKQDHYDWGLRAIKSVLVVA 2052

  Fly  2561 GVMKRQSEDLPEAVVLMRVLRDMNFPKFVFEDVPLFLGLIKDLFPGIDCPRIGYPDFNAAVRHVL 2625
            |.:||...|.||..||||.|||.|.||.|.:|:|:|:|||.||||.:|.||....||.|.||..:
  Rat  2053 GSLKRGDPDRPEDQVLMRSLRDFNIPKIVTDDMPVFMGLISDLFPALDVPRKRDLDFEAVVRKAI 2117

  Fly  2626 VN------DGYILLPDQEDKVVQMYETMMTRHSTMLVGPTGGGKTVVINALVKAQTHMGLPTKCL 2684
            |:      |.::|      ||||:.|.:..|||..:||..|.||:.|:.:|.|....|.......
  Rat  2118 VDLKLQAEDNFVL------KVVQLEELLAVRHSVFIVGGAGTGKSQVLKSLHKTYQIMRCRPVWT 2176

  Fly  2685 VLNPKACSVIELYGFLDMETRDWIDGLFSNIFREMNKPIEREERRYACFDGDVDALWIENMNSVM 2749
            .|||||.:..||:|.::..||:|.|||||:|.||:.. |..:..::...|||:|.:|||::|:||
  Rat  2177 DLNPKAVTNDELFGIINPATREWKDGLFSSIMRELAN-ISHDGPKWILLDGDIDPMWIESLNTVM 2240

  Fly  2750 DDNKLLTLANGERIRLENYCALLFEVGNLNYASPATVSRAGMVYVDPKNLRYSPFWQRWVLTRP- 2813
            ||||:||||:.|||.|.....||||:.:|..|:||||||||::|::|.:|.::|....|:..|. 
  Rat  2241 DDNKVLTLASNERIPLNPTMRLLFEISHLRTATPATVSRAGILYINPADLGWNPPVNSWIDQREV 2305

  Fly  2814 EPQRELLNDFFEKIITQSIAFILEGLDGTTQGNPLKLVIMQTDLNMVTQFCNLYDALLPNYVMDS 2878
            :.:|..|...|:|.:...:         .|.....|.:|...:.:|:...|.|.:.||..     
  Rat  2306 QTERANLTILFDKYLPTCL---------DTLRTRFKKIIPVPEQSMIQMLCYLLECLLTK----- 2356

  Fly  2879 KNYDEPVQQNYNTDSLECCFLQAVYGSMGACLVEKHQPVFDEYMKRISGFPLVQ-DTPENPASGG 2942
                |.|..:...:..|..|:.|...:.|:.:|   |....:|....|.:.|.: .|.:.|:.| 
  Rat  2357 ----EAVPADCPKEIYELYFVFAAIWAFGSSMV---QDQLVDYRAEFSKWWLTEFKTVKFPSQG- 2413

  Fly  2943 QFPQSKPTLYDYFWDVKDNVWKAWEWVVQPYTHDPQVKFSEILVPTVDNTRTNRTLSLMSEIKRP 3007
                   |::||:.|.:...::.|..::..:..||::.....||.|.:..|....:..:.|.:||
  Rat  2414 -------TVFDYYIDQETKKFEPWGKLIPQFEFDPEMPLQACLVHTSETIRVCYFMERLMERRRP 2471

  Fly  3008 VLLVGEAGTSKTATIMQYLRNLNPSVNVILNINFSSRTSSLDVQHTLEAAVEKRTKDTYGPPMGK 3072
            |:|||.||:.|:..:...|.:|||...::.|:.|:..|:|..:|..||..:||:....||||..:
  Rat  2472 VMLVGSAGSGKSVLVGAKLSSLNPEEYMVKNVPFNYYTTSAMLQAVLEKPLEKKAGRNYGPPGNR 2536

  Fly  3073 RIACFIDDMNMPQVDDYGTQQPIALLKLFFERGGMYDRDKDLNWKKFKDLTFYAAMGTAGGGRNE 3137
            ::..||||||||:||.|||.||..:::...:.|..|||:| |:.|:..::.:.:.|....|... 
  Rat  2537 KLIYFIDDMNMPEVDAYGTVQPHTVIRQHLDYGHWYDRNK-LSLKEIMNVQYISCMNPTAGSFT- 2599

  Fly  3138 VDPRFISMFSTYNIIFPNDESLIQIYSSIFKGHMVFVKFQPEYMLIADMIVHMTLKLFKMVIVDL 3202
            ::||....||.:.:.||..::|..|||:|...|:....|..........::::.:...:.:....
  Rat  2600 INPRLQRHFSVFALCFPGADALSSIYSTILTHHLKLGNFPTTLQKSIPSLINLAVTFHQKIATTF 2664

  Fly  3203 PPTPSKFHYIFNLKDLSRIFAGMLLIEPTCFKGLRDLIRVWRNEYTRIICDRLITDNDIANVRRN 3267
            .||..||||||||:|.:.||.|:|.....|.|..:||::::.:|..|:..|:::.:.|. |:...
  Rat  2665 LPTAIKFHYIFNLRDFANIFQGILFSSTECVKSTQDLVKLYLHESDRVYRDKMVEEKDF-NLFDK 2728

  Fly  3268 LAVEVAERFPPTFEEEHGFIDAAAAEAEAQARLLYEPSKADIDGGEEEGEEEEEGEEAPQVILSL 3332
            |..|..::   .|::..|.::      :.|...:|                              
  Rat  2729 LQTEFLKK---NFDDSKGMLE------QTQNLNMY------------------------------ 2754

  Fly  3333 KDYVLRDPLLFGDFRNFTNE-SEPRLYEDLLDYNSVYFLFTEILEEYCERKQKMTLVLFEDCLEH 3396
                          .:|.|. .||: |..:..::.:.....|.||.:.|....|.||||||.:.|
  Rat  2755 --------------CHFANGIGEPK-YMPVQSWDLLSQTLVEALESHNEVNAVMDLVLFEDAIHH 2804

  Fly  3397 LTRVHRTLRMNRGHVLLIGVGGSGKKCITRLAAFAAECDVFEITISRGYNEAAFREDLKVLYTIA 3461
            :..::|.|...||:.||:|||||||:.:||||||.:..|||:||:.:||....|:.||..|...|
  Rat  2805 ICHINRILESPRGNALLVGVGGSGKQSLTRLAAFISSMDVFQITLRKGYQIPDFKVDLASLCLKA 2869

  Fly  3462 GVKRKKVVFLFTGAQVAEEGFLELINNILTVGQVPALFPDEDKDGIVNQVRKFAEEDGVSASKDA 3526
            |||....|||.|.|.||:|.||.|||::|..|::|.|:.:|:::.|:|.||...:..|:..|::.
  Rat  2870 GVKNLSTVFLMTDAHVADERFLVLINDLLASGEIPDLYSEEEEENIINNVRNEVKSQGLIDSREN 2934

  Fly  3527 VWGYFLRTCAENLHVVLCMSPAGDALRNRCRNFPGLIGSTYIDWVFPWPRQALYAVAKLFLTEHR 3591
            .|.:|:......|.|.||.||.|:.||.|.|.||.::..|.|:|...||::||.:|:..||...:
  Rat  2935 CWKFFIERVRRQLKVTLCFSPVGNKLRIRSRKFPAIVNCTAINWFHEWPQEALESVSLRFLQNTK 2999

  Fly  3592 LIPASHREAIVEHVVHVHTSIQQYSKDYLAKLRRNNFVTPKHYLDYINTYRGLLEEKAKFITQQR 3656
            .|..:.:::|.:.:..||.|:.:.|:.||...:|.|:.|||.:|::|..|:.|||...|.:..:.
  Rat  3000 NIEPAVKQSISKFMAFVHISVNKISQSYLINEQRYNYTTPKSFLEFIRLYQSLLERNGKELQSKV 3064

  Fly  3657 SRLGEGIKKIEEASVQIDELRIIVTEQKKNVAVASEECEAMLVTIESSTQKANVKKAEASEKSVE 3721
            .||..|:.|:...|.|:|:|:..:..|:..:...:|:.:.::..:...|.|.:.:||.|.|:..:
  Rat  3065 ERLENGLLKLHSTSAQVDDLKAKLATQEVELRQKNEDTDKLIQVVGVETSKVSREKAIADEEEQK 3129

  Fly  3722 VEIKGKQIAIEKDEAEEILAEAMPALEEARLALSQLEKAQITEIRSFATPPAAVQVVCECVAIL- 3785
            |.:...::..::.:.||.||:|.|||..|:.||:.|.|..:||::||.:||.||..|...|.:| 
  Rat  3130 VALIMLEVQQKQKDCEEDLAKAEPALTAAQAALNTLNKTNLTELKSFGSPPLAVSNVSAAVMVLM 3194

  Fly  3786 ----KGYKEINWKSAKGMMSDV-NFLKSLMEMDCEALTQKQITQCRQHMK--TGNLEDMAKISVA 3843
                |..|:.:||:||..|:.| :||.||:..|.|.:.:..:...|.:::  ..|.|.:|..|.|
  Rat  3195 APGGKVPKDRSWKAAKITMTKVDSFLDSLIHFDKENIHENCLKAIRPYLQDPAFNPEFVATKSYA 3259

  Fly  3844 GAGLLRFVRAVLGFFDVYKEVKPKKERLDFLVEEQEVQIKLLNHLNGEIQKL---EEKLNELNEN 3905
            .|||..:|..::.|::|:.:|:||::.|:          |..:.|....:||   :.|:..||||
  Rat  3260 AAGLCSWVINIVRFYEVFCDVEPKRQALN----------KATSDLTAAQEKLAAIKAKITHLNEN 3314

  Fly  3906 YA-TSMKQMRALTEMMQ-QAERRLIA-----SDKLISGLTSELIRWSKEMASLGQQLIDSVGGCL 3963
            .| .:.|..:|..|.:: |.|..:.|     :::|:.||.||.:||::.:.:..||.....|..|
  Rat  3315 LAKLTTKFEKATAEKLKCQQEAEVTAGTISLANRLVGGLASENVRWAEAVQNFRQQERTLCGDIL 3379

  Fly  3964 ISASFLAYTGAFTWEFRKAMVFDDWLEDIASLGIPIQL-----PFKIDGYLTTDVEISQWSNEGL 4023
            ::.:|::|.|.||.::||:::...|...::.|.:||..     |.|:   ||.|.:::.|.||||
  Rat  3380 LTTAFISYLGFFTKKYRKSLMDGTWKPYLSQLKVPIPTTPTLDPLKM---LTDDADVATWQNEGL 3441

  Fly  4024 PPDELSIQNGILTMRASRFPLCIDPQLQALQWIRKREFKNNLKVLSFSDSDFLKQLEMAIMYGTP 4088
            |.|.:|::|..:.:...|:||.:|||||.::|| |.::...|:|........|:.:|.|:..|..
  Rat  3442 PADRMSMENATILINCERWPLMVDPQLQGIKWI-KNKYGEELRVTQIGQKGCLQTIERALEAGDV 3505

  Fly  4089 VLFEDVDDYIDPVIDDILQKNIRIQGGRKFVMLGDKEVDWDPSFRVYLTTKFSNPKFDPAVYAKA 4153
            ||.|::::.||||:..:|.:.: |:.|| |:.:||||.:::|.||:.|.||.:||.:.|.:.|:|
  Rat  3506 VLIENLEESIDPVLGPLLGREV-IKKGR-FIKIGDKECEFNPKFRLILHTKLANPHYQPELQAQA 3568

  Fly  4154 LVINYTVTQTGLEDQLLSVVVGTERPDLEAQRESLIAQTSENKQLLQQLEDSLLRELSTSTGNML 4218
            .:||:|||:.|||||||:.||..|.||||..:..|..|.:..|..|:.|||:||..||:::||.|
  Rat  3569 TLINFTVTRDGLEDQLLAAVVSMEIPDLEHLKSDLTKQQNGFKITLKTLEDNLLSRLSSASGNFL 3633

  Fly  4219 DNVELIETLENTKTKAGVVMEQLKLAADTAADIEVLRNGYRPAAKRGAVLFFALSDMATVNSMYQ 4283
            ....|:|.||.||..|..|.|:::.|..|...|...|..|||||.|.::|:|.::|::.::.|||
  Rat  3634 GETALVENLEVTKQTAAEVQEKVQEAKLTEVKINEAREHYRPAAARASLLYFIMNDLSKIHPMYQ 3698

  Fly  4284 YALAAYLDVFVYSLRKAVPDASLNKRLNNIIKTLTENVYCYGCTGIFERHKLLFSFQIATKLAQR 4348
            ::|.|:..||..::.||.|...:.:|:.|:|.::|.:||.|...|:||..||.:..|:..::...
  Rat  3699 FSLKAFSIVFQKAVEKAAPSEDVKERVTNLIDSITFSVYQYTTRGLFECDKLTYLAQLTFQILLV 3763

  Fly  4349 DGILLQSELDFFIKGSIALTKSERSNPCKWLSEKSWEDVLKLAF--DF----PDIFGTLPDHFGR 4407
            :..:..:||||.::..:   ::...:|.::||.::|..:..|:.  :|    .||.|:       
  Rat  3764 NQEVNAAELDFLLRAPV---QAGTPSPMEFLSHQAWGSIKALSSMEEFCNLDRDIEGS------- 3818

  Fly  4408 YLTEWKEWFDLENPEEVPCPGDYNIKCNAFQKLMFLRCFRVDRIFRSINQYIVETMDEFYIMPPV 4472
             ...||::.:.|.||:...|.|:..| ...|:|..:|..|.||:..::..::.|.:...|:|...
  Rat  3819 -AKSWKKFVESECPEKEKFPQDWKNK-TGLQRLCMMRAMRPDRMTYAMRDFVEEKLGSKYVMGRP 3881

  Fly  4473 VSFSAIYEQTSSTIPVCFVLSAGSDPTNDL----IKLADTIVGMSNFCHISLGQGQEKAALRLLD 4533
            :.|.:.:|::....|:.|:||.|.||..|:    .||..|. ...||.::|||||||..|...||
  Rat  3882 LDFVSSFEESGPATPMFFILSPGVDPLKDVENQGKKLGYTF-NNRNFHNVSLGQGQEVVAEAALD 3945

  Fly  4534 GAIKQGMWLMLQNGHLLIRFVRELEKHLDRI-ENPHPDFRLWITTDPTPT-----FPIGILQKSL 4592
            .|.|:|.|::|||.||:.:::..|||.|:.: |..|||||::|:.:|.|:     .|.|||:.|:
  Rat  3946 LAAKKGHWVILQNIHLVAKWLSTLEKKLEELSEESHPDFRVFISAEPAPSPEGHIIPQGILENSI 4010

  Fly  4593 KVVTEPPNGLKLNLRSTYFKVRQERLESCS-HVAFRPLVYVLAFFHAVVQERRKYDKLGWNIAYD 4656
            |:..|||.|:..||........|:.||.|| ...|:.:::.|.:|||||.||||:...|||.:|.
  Rat  4011 KITNEPPTGMHANLHKALDNFTQDTLEMCSRETEFKTILFALCYFHAVVAERRKFGPQGWNRSYP 4075

  Fly  4657 FNDTDFDVCTEILRTYLTRCGTGKIPWNSLKYLIGEVMYGGRVIDDFDRRITNCYMNEYM-GDFL 4720
            ||..|..:...:|..:|.  ...|:|::.|:||.||:||||.:.||:|||:...|:.|:: .:.|
  Rat  4076 FNTGDLTISVNVLYNFLE--ANTKVPYDDLRYLFGEIMYGGHITDDWDRRLCRTYLEEFIRPEML 4138

  Fly  4721 FDEFKVF-HFYEDDNVDYCLPEEETILKEDYIAHID-KLPLVNKPDVFGLHPNAEIGYYTMAARN 4783
            ..|..:. .|....|:||          ..|..:|| :|| ...|.::|||||||||:.|..:..
  Rat  4139 EGELSLAPGFPLPGNMDY----------SGYHQYIDAELP-PESPYLYGLHPNAEIGFLTQTSEK 4192

  Fly  4784 IWNSLIELQP---QTGEGTGGISRDDFIDSVAAGILKKLPPAFETWRIRKQIQMSLSPTGVVLLQ 4845
            ::.:::|:||   |.|:|.|. :|::.:.:....||.::...|....:..::: ..:|..||.||
  Rat  4193 LFRTVLEMQPRDSQAGDGAGS-TREEKVKAFLEEILDRVTDEFNIPELMAKVE-ERTPYIVVALQ 4255

  Fly  4846 ELDRFNLLVVRIKKTLELLRKAIAGEIGMDNVLDNIANSLFNGLLPAAWSKLAPATCKQLASWLE 4910
            |.:|.|:|...|:::|..|...:.||:.|.:.::|:.|:|:..::|..|::.|..:...||:|..
  Rat  4256 ECERMNILTREIQRSLRELHLGLQGELTMTSEMENLQNALYLDVVPEPWARRAYPSTAGLAAWFL 4320

  Fly  4911 HLRLRAVQYKYWTLSGE---PLVMWLSGLHIPQSYLTALVQIACRRNAWPLDRSTLFTYVTKFAD 4972
            .|..|..:.:.||  |:   |..:||:|...|||:|||::|...|:|.||||:..|...||| .:
  Rat  4321 DLLNRIKELETWT--GDFVMPSTVWLTGFFNPQSFLTAIMQSMARKNEWPLDQMALQCDVTK-KN 4382

  Fly  4973 PDDVEERPVTGCLVHGLYIEGGRFDLATNQLARSHPKVLVEELAILAVEPIEAHRLKLQNTYLAP 5037
            .::....|..|..::||::||..:|.....:|.:..|.|...:.::.::.|.|.:...::.|..|
  Rat  4383 REEFRSPPREGAYIYGLFMEGACWDTQAGIIAEAKLKDLTPPMPVMFLKAIPAEKQDCRSIYACP 4447

  Fly  5038 VYTTSLRRNAMGVGLVFEANLATSEDLSHWILQGVCLTL 5076
            ||.|..|    |...|:..||.|.|:.|.|:|.||.|.|
  Rat  4448 VYKTCQR----GPTYVWTFNLKTKENPSKWVLAGVALLL 4482

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
Dhc98DNP_524541.3 DHC_N1 523..983 CDD:285571 105/502 (21%)
DHC_N2 1798..2201 CDD:285579 132/413 (32%)
P-loop_NTPase 2338..2565 CDD:304359 133/226 (59%)
P-loop_NTPase 2654..2788 CDD:304359 61/133 (46%)
P-loop_NTPase 2976..3246 CDD:304359 89/269 (33%)
P-loop_NTPase 3378..3645 CDD:304359 108/266 (41%)
MT 3658..3989 CDD:289543 105/348 (30%)
AAA_9 4017..4233 CDD:289547 92/215 (43%)
Dynein_heavy 4374..5068 CDD:281078 236/719 (33%)
Dnah9XP_002727768.2 DHC_N1 210..787 CDD:285571 133/728 (18%)
DHC_N2 1293..1697 CDD:285579 132/413 (32%)
P-loop_NTPase 1830..2060 CDD:304359 135/229 (59%)
P-loop_NTPase 2144..2279 CDD:304359 62/135 (46%)
P-loop_NTPase 2437..2708 CDD:304359 89/272 (33%)
P-loop_NTPase 2786..3053 CDD:304359 108/266 (41%)
MT 3065..3408 CDD:289543 106/352 (30%)
AAA_9 3435..3648 CDD:289547 92/215 (43%)
Dynein_heavy 3785..4474 CDD:281078 236/720 (33%)


Information from Original Tools:


Tool Simple Score Weighted Score Original Tool Information
BLAST Result Score Score Type Cluster ID
Compara 00.000 Not matched by this tool.
Domainoid 00.000 Not matched by this tool.
eggNOG 1 0.900 - - E1_COG5245
Hieranoid 00.000 Not matched by this tool.
Homologene 00.000 Not matched by this tool.
Inparanoid 00.000 Not matched by this tool.
OMA 00.000 Not matched by this tool.
OrthoDB 1 1.010 - - D1492at2759
OrthoFinder 1 1.000 - - FOG0000396
OrthoInspector 00.000 Not matched by this tool.
orthoMCL 1 0.900 - - OOG6_100025
Panther 00.000 Not matched by this tool.
Phylome 1 0.910 - -
SonicParanoid 00.000 Not matched by this tool.
SwiftOrtho 1 1.000 - -
TreeFam 00.000 Not matched by this tool.
65.720

Return to query results.
Submit another query.