DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment Dhc98D and Dnah6

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_524541.3 Gene:Dhc98D / 43379 FlyBaseID:FBgn0013813 Length:5080 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:XP_038964640.1 Gene:Dnah6 / 117250 RGDID:621797 Length:4156 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:4490 Identity:1382/4490 - (30%)
Similarity:2195/4490 - (48%) Gaps:689/4490 - (15%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly   922 LAFKRVEDEPAIKNSFLKRSSFKQYFELMTVMFQFEKVLFENFIQNATYLVNTTNRSNVLRIRIC 986
            :||:..|:|..:|       |.:...|...|:.:..|:                ....||.....
  Rat    13 MAFQGTENEIDLK-------SMENQEEENPVLTRLNKI----------------RAKGVLNYASL 54

  Fly   987 KESTMSYISEAVQTLKAKPRPELQMTSDRRVTPVKSSNLMPVQSEAFSAYSVADSAGTEISSESE 1051
            ||:     ....|||..:...:.|..:.:|..|||...| ||..                     
  Rat    55 KEN-----EPEPQTLVFRHTTKAQEKTRKRQQPVKLEPL-PVLK--------------------- 92

  Fly  1052 NEGLLVGDTSQKKLMCRINRLTVLVAMIM----WMVSNTRKANIQLQECTAFIKMVKDKKPK-DV 1111
                |..|..|.:.:...||..::...|:    .|:..:...:::.||.   :|..:..:|. ||
  Rat    93 ----LYQDHKQPEYIYEQNRQQLMSTGILKPSPSMIERSSIGSLEAQEA---LKRKQVLRPSADV 150

  Fly  1112 TAMDRHCVRTCELLQRAESQYLLPIWRELVGEKTLI--------EY---DMDFVVNLK-RDVFDV 1164
            .::               |...||  |..:|.:.|.        :|   |.:.||... ||...:
  Rat   151 FSL---------------SPSKLP--RTSIGRRGLFGMRSSTYPKYTFNDREEVVKANIRDPLQI 198

  Fly  1165 LFEAQQFEHLGF--TLPAVLRTAIMKKDLLFKDYERMTEVVDRYRSIINN----LSMSEVIFLRG 1223
            :....:.|||||  .:|||.:::|        :|:.....|..|.:|..|    :|...|.    
  Rat   199 IKIVHENEHLGFLYMIPAVPKSSI--------EYDTYNLKVVSYENINKNDYYTISKDAVT---- 251

  Fly  1224 HIY-------DTELFIQMGVGRY----------------TWTSFNIGK---------FCDQ---- 1252
            |::       :||.:.|    .|                .|.:|::.:         .|.:    
  Rat   252 HVFNDDIEYIETERWEQ----EYLYHRELTKIPIFSLFRKWKAFSVWRKNVRSKKITGCRKALRK 312

  Fly  1253 ----INSQLR----KLTSIVSQINFIRLDLRSRIDMIKSFNLFNLDDELKVEDTSRSSGESYLQD 1309
                :|..||    |:..:..|::|:.|      ..|:.|:.:.| .|.|....           
  Rat   313 NLFIVNPYLRPALLKINDMCYQLSFMGL------CYIEKFHTYTL-QEFKAAQV----------- 359

  Fly  1310 RKNPSQRFKSVTGETITMFSVE-KDVPADEKAEQAC-----GSGIYP--C-----QGYFELLEAS 1361
                 .|.:.|| |.:..|..| |||     ..::|     .:|..|  |     :.||::..||
  Rat   360 -----VRVQEVT-ERLEYFRFEAKDV-----VRKSCRFALRAAGFIPDDCEVETHEDYFKINIAS 413

  Fly  1362 RNRKAAQMKKLYDSLGPVLVKLESLVLGTFSGRSDRMKTYYEYWEGETFKCIVDMTY-------- 1418
                                         |......:.||     ||:.|    |||        
  Rat   414 -----------------------------FIDAPSDLPTY-----GESEK----MTYTEQASKRH 440

  Fly  1419 --QNLKCYINRLLSNKPMFEVNAVLLMSEIVLEPSVQELQNTIVTATKDYIS-RLR------IFT 1474
              ..|.|:|.                :::.:::.::..|.....::..:|:| :|:      :..
  Rat   441 HCMRLTCFIR----------------LNDYLIQNTLHVLTVNTASSLLNYLSDKLKRTPSADVIQ 489

  Fly  1475 RWMT----------GTCIACPLVEMGKQFKYNYTYYEDVIQIRSIVDLVINIHDLASRVANE--- 1526
            :|:|          |    .|::|..::       .|.:|.: .:.:|::.:..|....:.|   
  Rat   490 KWITEDKPEVIEKKG----APMMEKQEE-------DESLIPM-FLTELILTVQSLLFEPSLEDFL 542

  Fly  1527 --ARGFVSQFR------------KYFNLWAFEKSFICQKFLEKQV-------TLIEIDEKF-TFY 1569
              ..|.::.|.            .|||  ||...||.:|..||..       .:.|.|..| |..
  Rat   543 DGISGIINHFENTVLSVPNLVPDSYFN--AFTSPFINKKVEEKTCGPGPSLSAVFEDDRNFLTII 605

  Fly  1570 SSIVETL-----------ANTRKFQ---------DIKCVR-----------------------IN 1591
            ..|.||:           |...|||         |::.::                       :.
  Rat   606 QQIKETIHSAFDSARLYAATFEKFQIFFKENESLDLEALKEEEPDVEFFSSQLEKYHKQHKDSVA 670

  Fly  1592 LEP------LLASITQHAQDWCTTLGEELLRHVNDNMRAMRNEVKTLSLNLNKTTRELED----- 1645
            |:|      ||....|        |.|:|   :...:|.:    :.|:|.|.:.:::..|     
  Rat   671 LKPTRNVGLLLIDTKQ--------LKEKL---IPSPLRCL----EVLNLMLPRLSKKKVDAIISE 720

  Fly  1646 -----FKLVM---TTIGTVQSSTLTNE--QKIHEMQE-------TFTILSEHKIMFPYEDMLMAH 1693
                 :||..   |||..|.|....:|  ::|..::|       .:.::.:::::.|.||..:  
  Rat   721 AQDAEYKLEFVPTTTIEYVNSLVFLDEIQERIETLEEEGNTVVQMYKLIEQYQVLTPPEDFAV-- 783

  Fly  1694 HLEKRWKRLFLSALYRYEKLQP--------IKQKFADMTSVEIDEFCDDLAEFIKDYDE------ 1744
                            :..::|        |.:...|..| .|.:||..|...::|.:.      
  Rat   784 ----------------FATMKPSITAVRNAIDKSVGDRES-SIKQFCLHLGRDLEDLNNEVNEVK 831

  Fly  1745 ---NGPG--SVGAELERGVRLMDPYGQKIAERESRREELANAERLFDMAMVDYHEFARVQTEFEG 1804
               ..|.  .:.|:.|:...::......:.:.:.|..:..:.::.|.:.:..:.....|..|...
  Rat   832 LLAQDPQILDISADPEKIKTMLSDLQSVLDDLQKRAFQYKSYQKNFKVEVSKFDALEEVCAELRL 896

  Fly  1805 LQQLYKLYKAQKYAREGWGKTLWADLDPNVLTEGVESYLKEFRKFTKAVRTLPVGVQLEIHMKQF 1869
            .|.|:.........::.|.|:.:..|||.||...|..|.|...:..|.:....|..||:..:::.
  Rat   897 KQLLWDSLSEWDKLQQEWLKSKFDCLDPEVLNGQVTKYAKFVTQLEKGLPPNSVVPQLKQKVERM 961

  Fly  1870 KGTVPLMVSLKHEALRERHWLQLMEKTGQYFDMSPARFTLENMFAMQLHKYQEIAEQILTNAIKE 1934
            |..:|::..|::..|:.|||..:.:.............|||.:..:.:..:.:..:.|...|..|
  Rat   962 KEKLPVINDLRNPTLKPRHWSAIEQTVDALLVDIEIPLTLERLSELHVFDFAQEIQDISGQASGE 1026

  Fly  1935 LQIERGVQAVIETWASMAFKTFKHFKGSDDRGWVLGPVDEIMQILEDNAMNLQSMGASQFIGPFL 1999
            ..:|..::.|.::|.:..|....|....|  .::||..|:|..:|:|:.:|:.::.:|:::||..
  Rat  1027 AALEIILKKVEDSWKTTEFVILPHRDSKD--VFILGGTDDIQVLLDDSTINVATIASSRYVGPLK 1089

  Fly  2000 ETVNKWERTLALISEIIDEWLVVQRKWLYLEGIFIGGDIRTQLPEEARKFDDIDKSYRRIMVDCA 2064
            ..|:.|::.|:|.::.::|||..||.|||||.||...||:.|||.||:.|..:|||::.||....
  Rat  1090 TRVDDWQKQLSLFNQTLEEWLNCQRNWLYLESIFNAPDIQRQLPAEAKMFLQVDKSWKEIMRKVN 1154

  Fly  2065 KNPLVVPFCTVPGRLVEIQGLGIGLENCQKSLNEYLDSKRRIFPRFYFISTDELLSILGSS-EPS 2128
            :.|..:...|.||.|...|.....|:..||.|..||:|||.|||||||:|.||||.||..: .|.
  Rat  1155 RLPNALRAATQPGLLETFQNNNALLDQIQKCLEAYLESKRVIFPRFYFLSNDELLEILAQTRNPQ 1219

  Fly  2129 AVQNHIIKMYDNIKSLRLV----KEGS--------QTIVT----GMISSEGEVMEFRHSARAAGR 2177
            |||.|:.|.:|:|..|...    .||.        :.:.|    .|:|.|||.:......:|.|.
  Rat  1220 AVQPHLRKCFDSISKLEFALMPPTEGKIPGIDTEPEKVFTNDILAMLSPEGERVGLGKGLKARGN 1284

  Fly  2178 VEYWMNDVLDEMRRSNRFINKTAIYDFGTDLQISRPDWLM-NYQGMVGLAASQVWWTAEVEEAFD 2241
            ||.|:..|.:.|..|.|.:.|.||.|:...|   |.:|:: .:...|.|..||:.|..::.|:.:
  Rat  1285 VEEWLGKVEEAMFSSLRRLCKAAIADYQGKL---RTEWVIAGHPSQVILTISQIMWCRDLTESLE 1346

  Fly  2242 QAQNHGNMRAMKDFLGKNNYQIEELVLKVRSNLSRNDRLKFKAQCTVDVHARDIIDNFVRDNVLD 2306
            ...||  :.|::.|...|..::..|...||.:|.:..|....|..|:|||||||:...|:..|..
  Rat  1347 CEDNH--LEALEKFEQVNFERLNALAAIVRGSLPKLHRNIITALITIDVHARDIVSELVQSKVDS 1409

  Fly  2307 ASEFSWESQLRFYWIKFYDNLHVLQCSGSFDFGYEYMGLNGRLVITPLTDRIYLTITQALLMNLG 2371
            |..|.|:.|||:||....||.........:.:.|||:|...||||||||||.||.:..||.::||
  Rat  1410 AESFDWQRQLRYYWDVDLDNCVARMALSQYTYAYEYLGACPRLVITPLTDRCYLCLMGALQLDLG 1474

  Fly  2372 GAPAGPAGTGKTETVKDLAKAMGLLCVVTNCGEGMDYRAVGTILSGLVQCGAWGCFDEFNRIDIS 2436
            ||||||||||||||.||||||:.:.|||.||.:|:||:.:|...|||.|.|||.||||||||||.
  Rat  1475 GAPAGPAGTGKTETTKDLAKALAIQCVVFNCSDGLDYKMMGRFFSGLAQSGAWCCFDEFNRIDIE 1539

  Fly  2437 VLSVISTQLQTIRNGLIRKLDRFVFEGVEIHLDPKCGVFVTMNPGYAGRTELPESVKALFRPVTC 2501
            |||||:.||.||||....||.||:|||.||.|...|..|:|||||||||||||:::||||||:..
  Rat  1540 VLSVIAQQLITIRNAKAAKLSRFMFEGREIKLVMTCAAFITMNPGYAGRTELPDNLKALFRPMAM 1604

  Fly  2502 IKPDLELICLISLFSDGFLTAKVLAKKMTVLYSLAQAQLSKQCHYDWGLRSLNSVLRMAGVMKRQ 2566
            :.|:..||..:.|:|:||.::|:||:|||.:|.|...|||:|.|||:|:|::.|||.|||.:||:
  Rat  1605 MVPNYALIAEVILYSEGFESSKILARKMTQMYKLCSEQLSQQDHYDFGMRAVKSVLVMAGSLKRE 1669

  Fly  2567 SEDLPEAVVLMRVLRDMNFPKFVFEDVPLFLGLIKDLFPGIDCPRIGYPDFNAAVRHVLVNDGYI 2631
            :.||.|.|||:|.|||.|.|||:.:|..||.|:|.|||||:..|...|...::.:..|:::..  
  Rat  1670 NPDLSEDVVLIRALRDSNLPKFLTDDALLFSGIISDLFPGVQIPEHDYGILHSTIVDVMISQN-- 1732

  Fly  2632 LLPD--QEDKVVQMYETMMTRHSTMLVGPTGGGKTVVINALVKAQTHMGL-----------PTKC 2683
            |.|:  ...||:|:||||:.||..|||||||||||.|...|  |:|...|           |.|.
  Rat  1733 LQPEICMVKKVIQLYETMLVRHGVMLVGPTGGGKTTVYQVL--AETLGNLEKLNTGNPFYQPVKT 1795

  Fly  2684 LVLNPKACSVIELYGFLDMETRDWIDGLFS-NIFREMNKPIEREERRYACFDGDVDALWIENMNS 2747
            .|||||:.::.||||.::..|.:|.|||.: ::...:|.  ..|:.::...||.||||||||||:
  Rat  1796 FVLNPKSITMGELYGEVNNVTLEWKDGLMALSVRAAVND--TSEDHKWIISDGPVDALWIENMNT 1858

  Fly  2748 VMDDNKLLTLANGERIRLENYCALLFEVGNLNYASPATVSRAGMVYVDPKNLRYSPFWQRWVLT- 2811
            |:||||:|.|||.|||:|.....:||||.:|..||||||||.|||:|||:.|::.|:.:.|:.| 
  Rat  1859 VLDDNKMLCLANSERIKLTPQVHMLFEVQDLKVASPATVSRCGMVFVDPEELKWMPYVKTWMSTL 1923

  Fly  2812 ---RPEPQRELLNDFFEKIITQSIAFILEGLDGTTQGNPLKLVIMQTDLNMVTQFCNLYDALLPN 2873
               ..|..||.|.:.|.:.:...:.|:.:   ..||..|      |.|::.||..|.|.::||  
  Rat  1924 SKKLSEEIREYLLNLFNRYVDDGLRFVNK---KCTQAIP------QVDISKVTTLCCLLESLL-- 1977

  Fly  2874 YVMDSKNYDEPVQQNYNT---DSLECCFLQAVYGSMGACLVEKHQPVFDEYMKRISGFPLVQDTP 2935
             :....|.....|...||   .:...|:|    .|:|..|.|.|...||.:::     ....|.|
  Rat  1978 -LSKDGNILSLEQMKLNTVVCQTFVFCYL----WSLGGNLTENHWDSFDTFIR-----TQFDDNP 2032

  Fly  2936 EN--PASGGQFPQSKPTLYDYFWDVKDNVWKAWEWVVQPYTHDPQVKFSEILVPTVDNTRTNRTL 2998
            :.  |:||        .|:....|........||.::..:.:..:|.|.|:||||.|..|....:
  Rat  2033 DARLPSSG--------DLWSIHVDFDTKRLDPWERIIPTFKYSREVPFFEMLVPTADTVRYGYLM 2089

  Fly  2999 SLMSEIKRPVLLVGEAGTSKTATIMQYLRNLNPSVNVI-LNINFSSRTSSLDVQHTLEAAVEKRT 3062
            ..:..::..||..|..|..|:......|..:..|...: :.:|||::|||...|..:|:.:|::.
  Rat  2090 EKLLAVRHSVLFTGTTGVGKSVIAKGLLNRIQESAGYVPVYLNFSAQTSSARTQEIIESKLERKR 2154

  Fly  3063 KDTYGPPMGKRIACFIDDMNMPQVDDYGTQQPIALLKLFFERGGMYDRDKDLNWKKFKDLTFYAA 3127
            |:..|.|..|::..|:||:|||::|.||:|.||.||:.:.:.||.|||:| |.||:.:|:|..:|
  Rat  2155 KNILGAPGNKQVVIFVDDLNMPRLDRYGSQPPIELLRQYQDFGGFYDRNK-LFWKEIQDVTIVSA 2218

  Fly  3128 MGTAGGGRNEVDPRFISMFSTYNIIFPNDESLIQIYSSIFKGHMVFVKFQPEYMLIADMIVHMTL 3192
            ....|||||.|.||||..||...:..|::.||.||:.:|..|.:  ..|.......:..||...:
  Rat  2219 CAPPGGGRNPVTPRFIRHFSMLCLPMPSEHSLKQIFQAILNGFL--ADFTEAVKQTSSNIVEAAV 2281

  Fly  3193 KLFKMVIVDLPPTPSKFHYIFNLKDLSRIFAGMLLIEPTCFKGLRDLIRVWRNEYTRIICDRLIT 3257
            :::..:.|||.|||:|.||:|||:|||:...|:|..:|...:....:.|::.:|..|:..||||.
  Rat  2282 EIYNRMSVDLLPTPAKSHYVFNLRDLSKCVQGILQCDPGTIREEMQIFRLFCHECQRVFHDRLIN 2346

  Fly  3258 DND----------IANVRRNLAVEVAERFPPTFEEEHGFIDAAAAEAEAQARLLYEPSKADIDGG 3312
            :.|          :||....:|:::                                        
  Rat  2347 NEDKHYFHVILTEMANKHFGIAIDL---------------------------------------- 2371

  Fly  3313 EEEGEEEEEGEEAPQVILSLKDYVLRDPLLFGDFRNFTNESEPRLYEDLLDYNSVYFLFTEILEE 3377
                                 :|.|..|::||||..|..:...|:|:||.|...:..:..:.|::
  Rat  2372 ---------------------EYFLSKPIIFGDFIKFGADKADRIYDDLPDIEKIENVLQDYLDD 2415

  Fly  3378 Y-CERKQKMTLVLFEDCLEHLTRVHRTLRMNRGHVLLIGVGGSGKKCITRLAAFAAECDVFEITI 3441
            | ....:::.||.|:|.:||::|:.|.:|..||:.||:||||:||:.:|||||........:|.:
  Rat  2416 YNLTNPKEVKLVFFQDAIEHVSRIARMIRQERGNALLVGVGGTGKQSLTRLAAHICGYKCLQIEL 2480

  Fly  3442 SRGYNEAAFREDLKVLYTIAGVKRKKVVFLFTGAQVAEEGFLELINNILTVGQVPALFPDEDKDG 3506
            |||||..:|.|||:.||.:|||:.|.:|||||..|:..|.|||.|||||..|:||.||..::.:.
  Rat  2481 SRGYNYDSFHEDLRKLYKMAGVEDKNMVFLFTDTQIVVEEFLEDINNILNSGEVPNLFEKDELEQ 2545

  Fly  3507 IVNQVRKFAEEDGVS-ASKDAVWGYFLRTCAENLHVVLCMSPAGDALRNRCRNFPGLIGSTYIDW 3570
            ::...|..|:|.|:| .::|.|:.||:....:.||:||||||.|:|.|:|||.||.|:....|||
  Rat  2546 VLAATRPKAKEVGISEGNRDEVFQYFISRVRQKLHIVLCMSPVGEAFRSRCRMFPSLVNCCTIDW 2610

  Fly  3571 VFPWPRQALYAVAKLFLTEHRLIPASHREAIVEHV----VHVHTSIQQYSKDYLAKLRRNNFVTP 3631
            ...|||:||.:|:|.|.:    :..:..|.:.|.:    |:||.|:...:..|.::|||..:.||
  Rat  2611 FVQWPREALLSVSKSFFS----VVDTGNEELKEKLSLMCVNVHLSVSHMADRYYSELRRRYYTTP 2671

  Fly  3632 KHYLDYINTYRGLLEEKAKFITQQRSRLGEGIKKIEEASVQIDELRIIVTEQKKNVAVASEECEA 3696
            ..||:.||.|..:|.||.|.:...|.|:..|:.|:.|.::.:|::::.::..:..:...|::.||
  Rat  2672 TSYLELINLYLTMLTEKRKQLVSARDRVTNGLTKLLETNILVDKMKLDLSALEPVLFQKSQDVEA 2736

  Fly  3697 ML----VTIESSTQKANVKKAEASEKSVEVEIKGKQIAIEKDEAEEILAEAMPALEEARLALSQL 3757
            ::    |..||:.|..||    ..|.....::|.::.....|:|:..|.||:||||.|..||..|
  Rat  2737 LMEKLVVDQESADQVRNV----VQEDEAIAKVKAEETQAIADDAQRDLEEALPALEAANKALDSL 2797

  Fly  3758 EKAQITEIRSFATPPAAVQVVCECVAILKGYKEINWKSAKGMMSDVNFLKSLMEMDCEALTQKQI 3822
            :||.|:|||.|..||..|..|.|.::||...|. :|.:||.::.|.|||:.|:|.|.|.:..:.:
  Rat  2798 DKADISEIRVFTKPPDLVMTVMEAISILLNAKP-DWPTAKQLLGDSNFLRRLLEYDKENIKPQIL 2861

  Fly  3823 TQCRQHMKTGNL--EDMAKISVAGAGLLRFVRAVLGFFDVYKEVKPKKERLDFLVEEQEVQIKLL 3885
            ::.::::...:.  |.:.|:|.|...:..:|||:..:..|.|||:||:::|.....|.:..|..|
  Rat  2862 SKLQRYINNPDFVPEKVEKVSKACKSMCMWVRAMDLYSRVVKEVEPKRQKLRAAQAELDATITTL 2926

  Fly  3886 NHLNGEIQKLEEKLNELNENYATSMKQMRALTEMMQQAERRLIASDKLISGLTSELIRWSKEMAS 3950
            ......::::||::..|.|.|...:.:..:|.:.|...:.||:.:.||.:.|..|.:||.:.:..
  Rat  2927 KEKQALLKQVEEQIRALQEEYDKGVNEKESLAKTMALTKARLVRAGKLTAALGDEQVRWEESIEK 2991

  Fly  3951 LGQQLIDSVGGCLISASFLAYTGAFTWEFRKAMVFDDWLEDIASLGIPIQLPFKIDGYLTTDVEI 4015
            ..:::.:.||...|:|:.:||.||||.::|:.:: :.|::...:|.|||...|.:...|....||
  Rat  2992 FQEEIANIVGNVFIAAACVAYYGAFTAQYRQLLI-ECWIDSCLALDIPIDPSFSLINTLGDPYEI 3055

  Fly  4016 SQWSNEGLPPDELSIQNGILTMRASRFPLCIDPQLQALQWIRKREFKNNLKVLSFSDSDFLKQLE 4080
            .||:.:|||.|.:|.:||||..:..|:||.||||.||.:|||.:|.|:.|||:..:|::||:.||
  Rat  3056 RQWNADGLPRDLISTENGILVTQGRRWPLMIDPQDQANRWIRNKESKSGLKVIKLTDTNFLRILE 3120

  Fly  4081 MAIMYGTPVLFEDVDDYIDPVIDDILQKNIRIQGGRKFVMLGDKEVDWDPSFRVYLTTKFSNPKF 4145
            .:|..|.|||.|::.:.:||.::.||.|...:.|||..:.|||.::|:|.|||.|:|||..||.:
  Rat  3121 NSIRLGLPVLLEELREVLDPALEPILLKQTFMSGGRLLIRLGDSDIDYDKSFRFYMTTKMPNPHY 3185

  Fly  4146 DPAVYAKALVINYTVTQTGLEDQLLSVVVGTERPDLEAQRESLIAQTSENKQLLQQLEDSLLREL 4210
            .|.|..|..:||:|||::||||||||.||..|:|:||.||..||.:.:.:|..|:.:||.:|:.|
  Rat  3186 LPEVCIKVTIINFTVTKSGLEDQLLSDVVRLEKPELEGQRVQLIVRINSDKNQLKSIEDKILKLL 3250

  Fly  4211 STSTGNMLDNVELIETLENTKTKAGVVMEQLKLAADTAADIEVLRNGYRPAAKRGAVLFFALSDM 4275
            .||.||:|||.|||:||:::|..:|.:..:||.|..|...|.:.|..|||.|.:|:|::|.::.:
  Rat  3251 FTSEGNILDNEELIDTLQDSKITSGAIKTRLKEAESTELMINIARERYRPVATQGSVMYFVIASL 3315

  Fly  4276 ATVNSMYQYALAAYLDVFVYSLRKAVPDASLNKRLNNIIKTLTENVYCYGCTGIFERHKLLFSFQ 4340
            :.::.||||:|..:..:|..::..:....||.:||..:::......|.....|:||:|||::||.
  Rat  3316 SEIDPMYQYSLKYFKQLFNTTIETSEKSDSLQERLAILLQQTLLTAYTNVSRGLFEQHKLIYSFM 3380

  Fly  4341 IATKLAQRDGILLQSELDFFIKGSIALTKSERSNP-CKWLSEKSWEDVLKLAFDFPDIFGTLPDH 4404
            :...:.::...|.::|.:||::||..:.|.....| ..||..:.|.....|...|| ||..|..|
  Rat  3381 LCVDIMRQQEQLTEAEWNFFLRGSAGMEKERPPKPEAPWLPIQMWFSCCDLEEWFP-IFEGLTRH 3444

  Fly  4405 ------------FGRYLT--EWKEWFDLENPEEVPCPGDYNIKCNAFQKLMFLRCFRVDRIFRSI 4455
                        |..|:.  .|:.:....:.||.......|.  ::|.||:.::|.:.:::..::
  Rat  3445 ILLHPISISLGSFETYINPQSWEGYPKQRHEEEKEHVWGSNF--SSFHKLILVKCCKEEKVVFAL 3507

  Fly  4456 NQYIVETMDEFYIMPPVVSFSAIYEQTSSTIPVCFVLSAGSDPTNDLIKLADTIVGMSNFCHISL 4520
            ..:::|.:.:.:|..|.|..:.:|:..||:.|:.|:||.||||.....:.|...........|||
  Rat  3508 TDFVIENLGKQFIETPPVDLATLYQDMSSSTPLVFILSTGSDPMGAFQRFARESGYAERVQSISL 3572

  Fly  4521 GQGQEKAALRLLDGAIKQGMWLMLQNGHLLIRFVRELEKHLDRIENPHPD----FRLWITTDPTP 4581
            ||||...|.:::..|.|.|.|:.|||.||.:.::..:|:.:....:|:..    |||::::.|..
  Rat  3573 GQGQGPIAEKMIKDATKSGNWVFLQNCHLAVSWMLAMEELIKTFTDPNQSIKDTFRLFLSSMPCS 3637

  Fly  4582 TFPIGILQKSLKVVTEPPNGLKLNLRSTYFKVRQERL-ESCSHVAFRPLVYVLAFFHAVVQERRK 4645
            |||:.:||.|:||..|||.||:.|:|..:.::..... |:...:.:|.|::.:.||||::|||:|
  Rat  3638 TFPVTVLQNSVKVTNEPPKGLRANIRRAFTEMTPSFFEENILGMKWRKLIFGICFFHAIIQERKK 3702

  Fly  4646 YDKLGWNIAYDFNDTDFDVCTEILRTYLTRCGTGKIPWNSLKYLIGEVMYGGRVIDDFDRRITNC 4710
            :..|||||.|:|||:|.:.....|..|   |..|||||::|.|:.||:.|||||.|.:|:|....
  Rat  3703 FGPLGWNICYEFNDSDRECALLNLNLY---CHEGKIPWDALIYITGEITYGGRVTDTWDQRCLRT 3764

  Fly  4711 YMNEYMG-DFLFDEFKVFHFYEDDNVDYCLPEEETILKEDYIAHIDKLPLVNKPDVFGLHPNAEI 4774
            .:..:.. :.|.||:.    |.:..: |..|..:::  :::..:|:.|||::.|::||:|.||.:
  Rat  3765 VLKRFFSPETLEDEYT----YSESGI-YFAPLADSL--QEFKDYIEDLPLIDDPEIFGMHENANL 3822

  Fly  4775 GYYTMAARNIWNSLIELQPQTGEGTGGISRDDFIDSVAAGILKKLPP------AFETWRIRKQIQ 4833
            .:.......:..:::|:||::..|..|.|.|:.:..:.|.|..::|.      |.||..: |..|
  Rat  3823 VFQYKETNTLITTILEVQPRSSSGGEGKSNDEIVQELVASIRTRVPESLQMEGASETLFV-KDPQ 3886

  Fly  4834 MSLSPTGVVLLQELDRFNLLVVRIKKTLELLRKAIAGEIGMDNVLDNIANSLFNGLLPAAWSKLA 4898
            ..|:....||.||:||||.|:..|..:||.|.|||||.:.|...::.:..|..|..:|:.||..|
  Rat  3887 GRLNSLTTVLGQEVDRFNNLLKLIHISLETLNKAIAGLVVMSEEMEKVYQSFLNNQVPSLWSNTA 3951

  Fly  4899 PATCKQLASWLEHLRLRAVQYKYWTLSGEPLVMWLSGLHIPQSYLTALVQIACRRNAWPLDR-ST 4962
            ..:.|.|.||::.|.||......|...|:|...|:||...||.:||..:|...|:...|:|. |.
  Rat  3952 YPSLKPLGSWVKDLILRTAFVDLWLKRGQPKSFWISGFFFPQGFLTGTLQNHARKYNLPIDELSF 4016

  Fly  4963 LFTYVTKFAD-----------------PDDVE-ERPVTGCLVHGLYIEGGRFDLATNQLARSHPK 5009
            .:..:..:.|                 |.|.| ..|..|.||||::::..|:|.....:..:.|.
  Rat  4017 KYNMIPVYRDQALVIEAAKDIQFGTELPMDKELPTPEDGVLVHGMFMDASRWDDKDMIIEDALPG 4081

  Fly  5010 VLVEELAILAVEPIEAHRLKLQNTYLAPVYTTSLRRNAM-----GVGLVFEANLATSEDLSHWIL 5069
            .:...|.::..||.:.:. .:|..|.:|:|.|..|...:     ....|....|.:.....:||.
  Rat  4082 QMNPMLPVVHFEPQQNYE-PIQTLYHSPLYKTGARAGTLSTTGHSTNFVVTVLLPSKRPSDYWIA 4145

  Fly  5070 QGVCL 5074
            :|..|
  Rat  4146 KGSAL 4150

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
Dhc98DNP_524541.3 DHC_N1 523..>968 CDD:462457 9/45 (20%)
DHC_N2 1795..2196 CDD:462462 131/417 (31%)
DYN1 1999..4719 CDD:227570 1036/2804 (37%)
AAA_6 2338..2664 CDD:463697 187/327 (57%)
Dynein_C 4778..5076 CDD:465677 91/327 (28%)
Dnah6XP_038964640.1 DHC_N2 887..1307 CDD:462462 132/421 (31%)
DYN1 <1127..3774 CDD:227570 1020/2766 (37%)
AAA_6 1441..1767 CDD:463697 187/327 (57%)
Dynein_C 3827..4152 CDD:465677 91/326 (28%)

Return to query results.
Submit another query.