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Protein Alignment Dhc98D and dnah5

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_524541.3 Gene:Dhc98D / 43379 FlyBaseID:FBgn0013813 Length:5080 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:XP_031759546.1 Gene:dnah5 / 100492041 XenbaseID:XB-GENE-854543 Length:4688 Species:Xenopus tropicalis


Alignment Length:4794 Identity:1421/4794 - (29%)
Similarity:2343/4794 - (48%) Gaps:634/4794 - (13%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly   516 LVITYTQQQLEEVVDG---WIKYLKKTMKTLTDAK--LDDFTPMAEHRYWHKMEVELYGTLEQLK 575
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 Frog   289 LTVANSSEGLERIEEGMKVWIKQIEQVLAESNQLRKEADDLGPRAELDHWKKRLSKFHYLLDQLK 353

  Fly   576 TEFVVAVLQRLTDDKSPVLDEWQAVVEKTEARFKLAKENSDYLGTIIDYLEKVRSYESFKMVVLQ 640
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 Frog   354 TPEVKAVLGVLTAAKSKLLKIWRLLDTRITDSANEAKDNVKYLYTLEKFCDPLYNSDPVSMID-S 417

  Fly   641 IPNIMVGLRHIWTMSSHYCRDPEMQVLLCQISNVFVQKVKSII---NFENIFKYSATYTYETATN 702
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 Frog   418 IPRLMNAIGMIHNISRYYNTSEKITSLFVKVTNQMITACKSYITNNKTAKIWDQAQDVVVEKLKS 482

  Fly   703 CANLLRCWKQAYKLSRQHIEDSGAGSRWEFDRVALFNEVNHIHRVAVDIAYVGRVFVQYENLFGH 767
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 Frog   483 AIKLNEFYQHAFHKTKETREQIPTERQFDFSEVYIFGKFDTFQRRLEKIIHIFETITTYSSLQNS 547

  Fly   768 RLK----ACIADPSIVDNLMRKVYRMLDDLIKSVDYDMFRPGNWENWEYSLELFNKRLDNVENEA 828
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 Frog   548 KIEGLEMVTTKFQSTVATIKKKQYDFLDQRRTEFDDD-------------YEEFVKQTHDLHTQL 599

  Fly   829 KNVIDQSINSLLSSEKGLDLVVNAMNIDTRATLQEF---------VATKHENLLRFFVTEINAVE 884
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 Frog   600 KTFMDSTFERNYNTERSIIM------------LEKFERLKIPDLGIEEKYQKILQNYGHDIEMVS 652

  Fly   885 RVFTKLKKSPPMAKHQPAKISAIFWARLLGKKLKTSVLAFKR----VEDEPAIKNSFLKRSSFKQ 945
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 Frog   747 ------------------------------KSPE-----------TLELF--------------- 755

  Fly  1141 VGEKTLIEYDMDFVVNLKRDVFDVLFEAQQFEHLGFTLPAVLRTAIMKKDLLFKDYERMTEVVDR 1205
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 Frog   756 --------------VNFDPLILTLIRETECMAKLGLEIPPFAATLQQKQNVYKKNFDNLQFMLME 806

  Fly  1206 YRSIINNLSMSEVIFLRGHIYDTELFIQMGVGRYTWTSFNIGKFCDQINSQLRKLTSIVSQIN-- 1268
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  Fly  1269 ------------------------------FIRL--DLRSR-------------------IDMIK 1282
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  Fly  1340 ---------AEQACGSGIYPCQGYFELLEASRNRKAAQMKKLYDSLGPVLVKLESLVLGTFSGRS 1395
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 Frog   994 KKKDMMEILEEEAC-----------ELLSHFNHRNV-----------DALLKVTRNTLETIRKRI 1036

  Fly  1396 DRMKTYYEYWEGETFKCIVDMTYQNLKCYINRLLSNKPMFEVNAVLLMSEIVLEPSVQELQNTIV 1460
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 Frog  1087 KAVENIVNVSKGVGQWSKERMSKKNILERKITAMRGNSNDSDSEDVIVEAGGRSTHENISEVASI 1151

  Fly  1493 ----FKYNYTYYEDVIQIRSIVDLVINIHDLASRVANEARGFVSQFRKYFNLWAFEKSFICQKFL 1553
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 Frog  1152 STVAFVHNKNYFKNVSENKEIVKLCSVLSTSINSTKKEVLTALERFKSYHHIWQKDRDNVIEKFV 1216

  Fly  1554 EKQVTLIEIDEKFTFYSSIVETLANTRKFQDIKCVRINLEP--------------LLASITQHAQ 1604
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  Fly  1666 KIHEMQETFTILSEHKIMFPYEDMLMAHHLEKRWKRLFLSALYRYEKLQPIKQKFADMTSVEIDE 1730
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 Frog  1329 QVGPIEESYAMLNKYELLVAKEETEKVDTLRYTWEKLLVRGNEVQNELMAIQPNFRGELISTVQT 1393

  Fly  1731 FCDDLAEFIKDYDENGPGSVG-AELERGVRLMDPYGQKIAERESRREELANAERLFDMAMVDYHE 1794
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  Fly  2110 FYFISTDELLSILG-SSEPSAVQNHIIKMYDNIKSLRLVKEGSQTIVTGMISSEGEVMEFRHSAR 2173
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  Fly  3198 VIVDLPPTPSKFHYIFNLKDLSRIFAGMLLIEPTCFKGLRDLIRVWRNEYTRIICDRLITDNDIA 3262
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 Frog  2834 TKSKMLPTPAKFHYIFNLRDLSRIWQGMLNSTSEVIKDTTVLIKLWKHECKRVIADRFTTAEDVD 2898

  Fly  3263 NVRRNLAVEVAERF-----PPTFEEEHGFIDAAAAEAEAQARLLYEPSKADIDGGEEEGEEEEEG 3322
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  Fly  3323 EEAPQVILSLKDYVLRDPLLFGDFRNFTNESEPRLYEDLLDYNSV---YFLFTEILEEYCERKQK 3384
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 Frog  2949 EEPED----------------ADF------DMPKIYEPIESFNQLKDRLNMFLQIFNESI-RGAG 2990

  Fly  3385 MTLVLFEDCLEHLTRVHRTLRMNRGHVLLIGVGGSGKKCITRLAAFAAECDVFEITISRGYNEAA 3449
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  Fly  3886 NHLNGEIQK----LEEKLNELN---ENYATSMKQMRALTEMMQQAERRLIASDKLISGLTSELIR 3943
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 Frog  3502 ATANLDLQKAQAELDAKQAELDVVQAEYEKAMIEKQTLLEDADRCRHKMQTASSLISGLAGEKER 3566

  Fly  3944 W---SKEMASLGQQLIDSVGGCLISASFLAYTGAFTWEFRKAMVFDDWLEDIASLGIPIQLPFKI 4005
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 Frog  3567 WTEQSKEFAAQTKRL---VGDVLLATAFLSYSGPFNQEFRN-FVLTDWRREMKARKIPFGVNLNL 3627

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 Frog  3628 NEMLIDTPTISEWNLQGLPNDDLSIQNGIIVTKAARYPLLIDPQTQGKIWIKNKEIRNELQITSL 3692

  Fly  4071 SDSDFLKQLEMAIMYGTPVLFEDVDDYIDPVIDDILQKNIRIQGGRKFVMLGDKEVDWDPSFRVY 4135
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 Frog  3693 NHKYFRNHLEDSLSLGRPLLIEDVGEELDPALDNVLEKNFIKTGSTYKVKVGDKEVDVMNGFRLY 3757

  Fly  4136 LTTKFSNPKFDPAVYAKALVINYTVTQTGLEDQLLSVVVGTERPDLEAQRESLIAQTSENKQLLQ 4200
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 Frog  3758 ITTKLPNPAYTPEISARTSIIDFTVTMKGLEDQLLGRVILTEKQELEKERTDLIEDVTANKRKMK 3822

  Fly  4201 QLEDSLLRELSTSTGNMLDNVELIETLENTKTKAGVVMEQLKLAADTAADIEVLRNGYRPAAKRG 4265
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Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
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