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Protein Alignment Dhc98D and dync2h1

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_524541.3 Gene:Dhc98D / 43379 FlyBaseID:FBgn0013813 Length:5080 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_001410228.1 Gene:dync2h1 / 100332402 ZFINID:ZDB-GENE-100217-1 Length:4299 Species:Danio rerio


Alignment Length:4842 Identity:1174/4842 - (24%)
Similarity:2041/4842 - (42%) Gaps:943/4842 - (19%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly   536 LKKTMKTLTDAKLDDFTP--MAEHRYWHKMEVELYGTLEQLKTEFVVAVLQRLTDDK-------- 590
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Zfish    97 LESPISTLYQALRQVYSPVLLQDDKWSQSFDSKLQSLLSDL--EIGLGSVLRHSDTKGSGKRSNS 159

  Fly   591 --------SPVLDEWQAVVEKTEARFKLA-KENSDYLGTIIDYLEK-VRSYESFKMV-VLQ-IPN 643
                    :| |||:....:.:.:..|.: ::.:.:...:...:|| ..:.:||.:| ||. |.|
Zfish   160 EMDVSNIMTP-LDEFSFWADVSRSGQKSSERDRATHFCELFTTIEKDYSNLDSFSLVEVLDLIEN 223

  Fly   644 IMVGLRHIWTMSSHYCRDPEMQVLLCQISNV-------FVQKVKSIINFENIFKYSATYTYETAT 701
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Zfish   224 TREAVDDVWKQNEH---TPYPETRMIRLMDVIGGALGRFVQRKLSD------------------- 266

  Fly   702 NCANLLRCWKQAYKLSRQHIEDSGA-------------GSRWEFDRVALFNEVNHIHRVAVDIAY 753
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Zfish   267 -----LRLWEDPYFTVREGLKGGVAVCEQWVAACEHLTGQVWK--RYAPHQWTGEKHR------- 317

  Fly   754 VGRVFVQYENLFGHRLKACIADPSIVDNLMR------------KVYRMLDDLIKSVDYDMFRPGN 806
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Zfish   318 -----PQGLHSLAQRLEEVVQVRSVCEKLQRLLSGGKQQISAARVYQPFTGL-NPIHYN---PYT 373

  Fly   807 WENWEYSLELFNKRLDNVENEAKN-----VID--QSINSLLS-SEKGLDLVVNAMNIDTRATLQE 863
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Zfish   374 EPLWRAAVSQFDRLIAPAEQEAAGKLKTFIIDAQDSPQQLLQVFQKHRDLI-------KRATISK 431

  Fly   864 FVATKHENLLRFFVTEINAVERVF------TKLKKSPPMA-KHQPAKISAIFWARLLGKKLKTSV 921
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Zfish   432 ELQPERETLLTRLLDYNKGLRADFESRCHGTPGEKTGPLAGRNLPEVVNNIVWVRQL-------- 488

  Fly   922 LAFKRVEDEPAIKNSFLKRSSFKQYFELMTVMFQFEKVL-FENFIQNATYLVNTTNRSNVLRIRI 985
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Zfish   489 --LLKVED------------SLKMADALLSDLSGFQPLLRFSDDLQ------------------- 520

  Fly   986 CKESTMSYISEAVQTLKAKPRPELQMTSDRRVTPVKSSNLMPVQSEAFSAYSVADSAGTEISSES 1050
              |...||                                   :.|.|               |.
Zfish   521 --EQLRSY-----------------------------------EQEQF---------------ED 533

  Fly  1051 ENEGLLVGDTSQKKLMCRINRLTVLVAMIMWMVSNTRKANIQLQECTAFIKMVKDKKPKDVTAMD 1115
            ....||.|                         .:..|:.|.||...                  
Zfish   534 WTRDLLSG-------------------------LSDPKSGISLQASN------------------ 555

  Fly  1116 RHCVRTCELLQRAESQYLLPIWRELVGEKTLIEYDMDFVVNLKRDVFDVLFEAQQFEHLGFTLPA 1180
                |..||              :.:..|..|:|. |.:|:|.|:|       :|...||||:||
Zfish   556 ----RVMEL--------------DHMDGKLKIQYS-DRLVSLLREV-------RQLSALGFTIPA 594

  Fly  1181 VLRTAIMKKDLLFKDYERMTEVVDRYRSIINNLSMSEVIFLRGHIYDTELFIQM----------G 1235
            .::.|....:..::....:.:|...|.:|...:..|:...:.|.....|..|:.          |
Zfish   595 KIQQAANTAEKFYRQAIILKQVAHFYNTIDQQMIPSQRPMMLGCALAFEQVIKQNPRSQSRDEGG 659

  Fly  1236 VGRYTWTS-FNIGKFCDQINSQLRKLTSIVSQINFIRLDLRSRIDMIKSFNLFNLDDELKVEDTS 1299
            ..:.||.: ..:.::..::.|...:|::...::.....|...::..:...:|.            
Zfish   660 KLQMTWENPKELEQYISKLQSAAERLSTENRKLRKWHTDFTDKVVGLMGVDLL------------ 712

  Fly  1300 RSSGESYLQDRKNPSQRFKSVTGETITMFSVEKDVPADEKAEQACGSGIYPCQGYFELLEASRNR 1364
                        ...||:|                  |...:...|......||:          
Zfish   713 ------------RQQQRWK------------------DGLQDLRAGFATLESQGF---------- 737

  Fly  1365 KAAQMKKLYDSLGPVLVKLESLVLGTFSGRSDRMKTYYEYWEGETFKCIVDMTYQNLKCYINRLL 1429
                                        |..| |:.:.::|..:.:|.: :..||   ..:..|.
Zfish   738 ----------------------------GAGD-MRAWRQHWNHQLYKAL-EHQYQ---VGLEALN 769

  Fly  1430 SNKPMFEVNAVLLMSEIVLEPSVQELQNTIVTATKDYISRLRIFTRWMTGTCIACPLVEMGKQFK 1494
            .|.|...::.|.....:...|:.:|::.......|.:||                    :..|||
Zfish   770 KNLPEINIDLVFKQGRLQFRPAFEEVRAKYYREMKRFIS--------------------IPNQFK 814

  Fly  1495 YNYTYYEDVIQIRSIVDLVINIHDLASRVANEARGFVSQFRKYFNLWAFEKSFICQKFLEKQVTL 1559
            ......|:.|..|.|              ...|.||::.|.|..:|:: ..|.:..|| :..|.:
Zfish   815 GVSETGEEPIFTRMI--------------ERNASGFLTIFSKAEHLFS-RLSHLLDKF-KDWVVV 863

  Fly  1560 IEIDEKFTFYSSIVETLAN---------TRKFQDIK----------------CVRINLEPLLASI 1599
            .::|         ||.|..         .|.|:.:|                |:.:|.||:..|:
Zfish   864 GQVD---------VEVLVEKHLHSVQDWERNFKALKAKGKEAERLPSSEKVDCITVNCEPVRVSV 919

  Fly  1600 TQHAQDWCTTLGEELLRHVNDNMRA----MRNEVKTLSLNLNKTTRELEDFKLVMTTIGTVQSST 1660
            ....|.....|...|.|.:..:::.    :...::||||. .::..|:.:.....:.:.|.:...
Zfish   920 DDLIQRLFDALLASLRRSIQGHIQVIDSFVNGAMETLSLR-PESIDEIGEANAKHSQLQTQKPEV 983

  Fly  1661 LTNEQKIHEMQETF---------TILSEHKIMFPYEDMLMAHHLEKRWKRLFLSALYRYEKLQPI 1716
            |...|:..|.....         ||.|.......:|.|:.:|.|..|            |:::.:
Zfish   984 LPQFQQAEEKNRLLRSVAGGGLDTISSLRAKWDKFELMMESHQLMIR------------EQVEVM 1036

  Fly  1717 KQKFADMTSVEIDEFCDDLAEFIKDYDENGPGSVGAE------LERGVRLMDPYGQKIAERESRR 1775
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Zfish  1037 KGNVESRVQV----YQQDLQKFRARWDQLKPGNDIIESGDHEALQRCVQIIRERQAEFSELENTR 1097

  Fly  1776 EELANAERLFDMAMVDYHEFARVQTEFEGLQQLYKLYK-----AQKYAREGW----GKTLWADLD 1831
            .:|......|:::..|....:....:.:...|:::||:     .::.|:..|    .||      
Zfish  1098 TKLMEDCEHFNLSSPDGTLASDTLRDLQDCSQMWELYEEFHSGLEEIAQHDWISFRSKT------ 1156

  Fly  1832 PNVLTEGVESYLKEFRKFTKAVRTLPVGVQLEIHMKQFKGTVPLMVSLKHEALRERHWLQLMEKT 1896
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Zfish  1157 -HVFEEFLFAWHDRLRKLEE---HSSMSVKLQKEVDRYKAVVPVLKYVRGEHLSQEHWLDLFRLI 1217

  Fly  1897 GQYFDMSPARFTLENMFAMQLHKYQEIAEQIL--TNAIKEL----QIERGVQAV---IETWASMA 1952
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Zfish  1218 S-----LPRGSTLE---TLQFRDLLRVADNIIDKTLELKDLNSRAQAEVSIREALRELELWGAGA 1274

  Fly  1953 FKTFKHFKGSDDRGWVLGPV-----DEIMQILEDNAMNLQSMGASQFIGPFLETVNKWERTLALI 2012
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Zfish  1275 SFTLTDY--TDTQGCSL-PVIKDWRDVVNQV-GDNRCLLQSLKDSPYYLRFQDKVSLWETRLADL 1335

  Fly  2013 SEIIDEWLVVQRKWLYLEGIFIGGDIRTQLPEEARKFDDIDKSYRRIMVDCAKNPLVVPFCTVPG 2077
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Zfish  1336 DEYLHNLNTIQRKWVYLQPIFGRG----ALPREQARFQRVDQDFRAIMSDVQRDSRVVSLTTRAG 1396

  Fly  2078 RLVEIQGLGIGLENCQKSLNEYLDSKRRIFPRFYFISTDELLSILG-SSEPSAVQNHIIKMYDNI 2141
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Zfish  1397 IRNSLVTILDQLQRCQKSLNEFLEEKRSAFPRFYFIGDDDLLEILGQATNPTVIHTHLKKLFAGI 1461

  Fly  2142 KSLRLVKEGSQTIVTGMISSEGEVMEFRHSARAAGRVEYWMNDVLDEMRRSNRFI-------NKT 2199
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Zfish  1462 SSVEF--DQSFQSITAMKSLEGETVPLINTICISNDVEVWLSALAAEMKNTLKHLLCECVNAGKK 1524

  Fly  2200 AIYDFGTDLQISRPDWLMNYQGMVGLAASQVWWTAEVEEAFDQAQNHGNMRAMKDFLGKNNYQIE 2264
            ...|         |   ..:...|...|.|:.:||.||.:..|...|               |:|
Zfish  1525 GNVD---------P---TRFPSQVLCLAEQIEFTAAVEISIRQQSLH---------------QLE 1562

  Fly  2265 ELVLKVRSNLSRND------------RLKFKAQCTVDVHARDIIDNFVRDNVLDASEFSWESQLR 2317
            :.:.....|.:..|            ::|.||.....:|...::.:.....:....::.|:.|||
Zfish  1563 QQLTAKLENYTSVDTSTDNTTESRVLQMKLKALILDVIHNISLVQSLREAQINSTDDWVWKKQLR 1627

  Fly  2318 FYWIKFYDNLHVLQCSGSFDFGYEYMGLNGRLVITPLTDRIYLTITQALLMNLGGAPAGPAGTGK 2382
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Zfish  1628 FY-LNADQSCSIQMVDADFRYTYEYQGNAAKLVHTPLTDKCYLTLTQAMKMGLGGNPYGPAGTGK 1691

  Fly  2383 TETVKDLAKAMGLLCVVTNCGEGMDYRAVGTILSGLVQCGAWGCFDEFNRIDISVLSVISTQLQT 2447
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Zfish  1692 TESVKALGGLFGRQVLVFNCDEGIDVKSMGRIFVGLVKCGAWGCFDEFNRLEEAVLSAVSMQIQD 1756

  Fly  2448 IRNGLIRKLDRFVFEGVEIHLDPKCGVFVTMNP---GYAGRTELPESVKALFRPVTCIKPDLELI 2509
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Zfish  1757 IQNSLKNHRSTCQLLNKEVDLDPNSGIFITMNPAGKGYGGRQKLPDNLKQLFRPVAMTSPDNELI 1821

  Fly  2510 CLISLFSDGFLTAKVLAKKMTVLYSLAQAQLSKQCHYDWGLRSLNSVLRMAG----VMKRQSEDL 2570
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Zfish  1822 AEVILYSEGFKEGKALGRKLVAIFNLARELLTPQQHYDWGLRALKTVLRGCGSLLQLQRLNNNPL 1886

  Fly  2571 PEAVVLMRVLRDMNFPKFVFEDVPLFLGLIKDLFPGIDCPRIGYPDFNAAVRHVLVNDGYILLPD 2635
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Zfish  1887 KESGLVVQALRLNTMSKLTFADSSRFDALVRDVFPGVDFKDVEYETLKSALLAVYEEAHLEIIPS 1951

  Fly  2636 QEDKVVQMYETMMTRHSTMLVGPTGGGKTVVINALVKAQTHMGLPTKCLVLNPKACSVIELYGFL 2700
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Zfish  1952 QLKKAVELYEQLRQRMGVVVVGPSGAGKSTLWRMLRAALGKTGRLVKQYTMNPKAMPRQQLLGHI 2016

  Fly  2701 DMETRDWIDGLFSNIFRE-MNKPIEREERRYACFDGDVDALWIENMNSVMDDNKLLTLANGERIR 2764
            ||:||:|.||:.::..|: :.:|  :|...:...|||:|..|||::|||:|||:|||:.:||||:
Zfish  2017 DMDTREWSDGVLTSSARQVVREP--QEVNSWIICDGDIDPEWIESLNSVLDDNRLLTMPSGERIQ 2079

  Fly  2765 LENYCALLFEVGNLNYASPATVSRAGMVYVDPKNLRYSPFWQRWVLTRPEPQR----ELLNDFFE 2825
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Zfish  2080 FGPNVNFLFETHDLSCASPATISRMGMIFLSDEDTDVGSLVKSWLKREDEDCRMNLENWLNDYFH 2144

  Fly  2826 KIITQSIAFILEGLDGTTQGNPLKLVIMQTDLNMVTQFCNLYDALLPNYVMDSKNYDEPVQQNYN 2890
            :                    .|:.|:.|:|.        :.|..|...|::..::...|::...
Zfish  2145 R--------------------ALEWVLKQSDF--------VVDTSLVGTVLNGLSHLSGVRERGE 2181

  Fly  2891 TDSLECCFLQAVYGSMGACLVEKHQPVFDEYMKRISGFPLVQDTPENPASGGQFPQSKP--TLYD 2953
                   |:..:...:|..|..|.:   .::.|.:..:  .:::|.:|        .||  |.||
Zfish  2182 -------FIMGLIRGLGGNLTLKCR---QDFAKEVLSW--ARESPPDP--------RKPLDTYYD 2226

  Fly  2954 Y------FWDVKDNVWKAWEWVVQPYTHDPQVKFSEILVPTVDNTRTNRTLS-----LMSEIKRP 3007
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Zfish  2227 QASGRLCVYELQRG-----EGVCEEELSDPH------NLPVIHTPDTQRSLHSFSPWLSANHRQP 2280

  Fly  3008 VLLVGEAGTSKTATI---MQYLRNLNPSVNVILNINFSSRTSSLDV----QHTLEAAVEKRTKDT 3065
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Zfish  2281 FLLVGPEGCGKGMLLRCAFSQLRSTQVSV-----VHCSAQTSSRHVLQKLQHTC-LLISSNTGRV 2339

  Fly  3066 YGPPMGKRIACFIDDMNMPQVDDYGTQQPIALLKLFFERGGMYDRDKDLNWKKFKDLTFYAAMGT 3130
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Zfish  2340 YRPKDCERLLLYLKDINLPKPDKWGTSNLIAFLQQVLTYQGFY--DENLEWVGLENIQIVASM-S 2401

  Fly  3131 AGG--GRNEVDPRFISMFSTYNIIFPNDESLIQIYSSIFK-------GHMVFVKFQPEYMLIADM 3186
            |||  ||:.:..||.|:.....|.:|:.|.|..:||:..|       |:........:...:|..
Zfish  2402 AGGAVGRHTLTSRFTSIVRICTIDYPDREQLQTVYSAYLKPVLQRTLGNDPTWSSSGKIHQLAGS 2466

  Fly  3187 IVHMTLKLFKMVIVDLPPTPSKFHYIFNLKDLSRIFAGMLLIEPTCFKGLRD-LIRVWRNEYTRI 3250
            :|.:..::.....||     ...||:|....|:.....:|..:.:..|.:.| ::.|...|..|:
Zfish  2467 LVQVYEQVKAKFSVD-----DHSHYLFTPCLLTEWVLNLLRYDLSAGKSVVDSVLEVVVYEARRL 2526

  Fly  3251 ICDRLITDNDI--------ANVRRNLAVEVAERFPPTFEEEHGFIDAAAAEAEAQARLLYEPSKA 3307
            ..||:::..|:        :.:|.:...:..:.....:     |:..||:..             
Zfish  2527 FRDRIVSSKDLNVFDNILSSIIRGDWGTDTLDNMTDVY-----FVTWAASHE------------- 2573

  Fly  3308 DIDGGEEEGEE-EEEGEEAPQVILS-LKDYVLRDPLLFGDFRNFTNESEPRLYEDLLDYNSVYFL 3370
                |...|:. ...|.:..::..| |.:.:.:..:|:|                          
Zfish  2574 ----GRSPGQPLPPHGRKLARLNASDLSEIIHKGIVLYG-------------------------- 2608

  Fly  3371 FTEILEEYCERKQKMTLVLFEDCLEHLTRVHRTLRMNRGHVLLIGVGGSGKKCITRLAAFAAECD 3435
                     ...:::.::||.:.|::::||.|.|....|.:||.|..|.|::..|.:.:......
Zfish  2609 ---------RDNRELDILLFPEVLDYMSRVDRVLTSPGGSLLLAGRSGVGRRTATCVVSHMHGAT 2664

  Fly  3436 VFEITISRGYNEAAFREDLKVLYTIAGVKRKKVVFLFTGAQVAEEGFLELINNILTVGQVPALFP 3500
            :|...|||.|:...|:.|||.:...|.|..::||.|....|.....|||::|::|:.|:||.|:.
Zfish  2665 LFTPKISRSYSLKHFKSDLKTVMHSAAVDGQQVVLLLEDHQFVHPSFLEMVNSLLSSGEVPGLYS 2729

  Fly  3501 DEDKDGIVNQVRKFAEEDGVSASKDAVWGYFLRTCAENLHVVLCMSPAGDALRNRCRNFPGLIGS 3565
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Zfish  2730 TEELEPLLASLKDQASQDGFTG---PVLNYFSHRVQQNLHVVLIMDCTNEHFTINCESNPALYRK 2791

  Fly  3566 TYIDWVFPWPRQALYAVAKLFLT---EHRLIPASHREAIVEHVVH---------VHTSIQQYSKD 3618
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Zfish  2792 CSVQWMESWSDSSMKKIPEMLLSRIEEDEKTEDKQRKKKKSASVHTELYRSFLAIHESCREFG-- 2854

  Fly  3619 YLAKLRRNNFVTPKHYLDYINTYRGLLEEKAKFITQQRSRLGEGIKKIEEASVQIDELRIIVTEQ 3683
                      .||..||:::..|:.:...|.|.:|.::..|..|:.|:.||...:|||:....||
Zfish  2855 ----------ATPSQYLNFLQVYQSIYSSKRKELTHKQQHLQAGVAKLNEAKALVDELKRRAAEQ 2909

  Fly  3684 KKNVAVASEECEAMLVTIESSTQKANVKKAEASEKSVEVEIKGKQIAIEKDEAEEILAEAMPALE 3748
            ...:.....|.:|.|..|.:|.|.|:.:|.|..:....:..:..:|...|.:.:|.|.|..|.::
Zfish  2910 SSLLKTKQAEADAALQEITTSMQNASDQKTEMEKIKERMAHEVSKIEERKKKIDEELREVQPLVD 2974

  Fly  3749 EARLALSQLEKAQITEIRSFATPPAAVQVVCECVAILKGYKEINWKSAKGMMSDVNFLKSLMEMD 3813
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Zfish  2975 EAKQAVGNIKSESLSEIRSLRMPPDVIRDILEGVLRLMGIFDTSWVSMKSFLAKRGVREEIATFD 3039

  Fly  3814 CEALTQKQITQCRQHMKTGNL-----EDMAKISVAGAGLLRFVRAVLGFFDVYKEVKPKKERLDF 3873
            ..::|. :|.|..:.:...|.     ::..:.|.|.|.|..:|:|.:.:..|.::::|.:.....
Zfish  3040 ARSITH-EIRQSVEELLHRNKASFDPKNAKRASAAAAPLAAWVKANVQYSHVLEKIEPLQTEHAG 3103

  Fly  3874 LVEEQEVQIKLLNHLNGEIQKLEEKLNELNENYATSMKQMRALTEMMQQAERRLIASDKLISGLT 3938
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Zfish  3104 LMENLRKTENRKNRLEKELNSVGEKVLELKEKFQCRTTEAAKLESEVSRAQETISAAEKLLQQLD 3168

  Fly  3939 SELIRWSKEMASLGQQLIDSVGGCLISASFLAYTGAFTWEFRKAMVFDDWLEDIASLGIPIQLPF 4003
            .|..||:.::..:.::|........:||:|:.|..|...:.|::.: |.|:   :|.|:.   .|
Zfish  3169 GEHTRWTAQVDEISEELDTLPKRAQLSAAFITYLPAAPEDQRRSSL-DHWM---SSSGLQ---KF 3226

  Fly  4004 KIDGYLTTDVEISQWSNEGLPPDELSIQNGILTMRASRF-------PLCIDPQLQALQWIRKREF 4061
            .:..:|.::.|...|.:||||.|:||::|.::.::.:.|       |..|||..:|.:|::....
Zfish  3227 DLRHFLCSESEQLIWKSEGLPSDDLSMENALVILQINEFRSRSASCPFLIDPSSRATEWLQTHLK 3291

  Fly  4062 KNNLKVLSFSDSDFLKQLEMAIMYGTPVLFEDVDDYIDPVIDDILQKNIRIQGGRKFVMLGDKEV 4126
            .:.|:|::..|::|:..||:|:.:|..::.:::|. ::||:..:|::::..||.|..|.:|||.:
Zfish  3292 AHRLEVINQQDANFMTVLELAVRFGKTLIIQEMDG-VEPVLYPLLRRDLIAQGPRYVVQIGDKVM 3355

  Fly  4127 DWDPSFRVYLTTKFSNPKFDPAVYAKALVINYTVTQTGLEDQLLSVVVGTERPDLEAQRESLIAQ 4191
            |::..||::|.|:..:|...|...:....:|:|.|:.||..|||::.:..|:|:||:|:..|:.|
Zfish  3356 DYNEDFRLFLATRNPSPFIPPDAASVITEVNFTTTRAGLRGQLLALTIQQEKPELESQKTKLLQQ 3420

  Fly  4192 TSENKQLLQQLEDSLLRELSTSTGNMLDNVELIETLENTKTKAGVVMEQLKLAADTAADIEVLRN 4256
            ..|.|..|.|||:|||..|:|:.||:|:|.||||:|..||..:.::.:.|..:......::..|:
Zfish  3421 EEEKKIQLAQLEESLLETLATAQGNILENKELIESLNQTKASSALIQQSLSQSHRLQTSLDQERD 3485

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Zfish  4215 EGCSFD--GNRLSESHHDSPSVSSVPPCHMAWIPQSAMGCYSPDECISL--------PVYSSAER 4269

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                 |.:|....|..:.|...||..|..|.|
Zfish  4270 -----VCVVTNVQLPCAGDHDTWIQSGAALFL 4296

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
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Dynein_C 4003..4296 CDD:465677 78/334 (23%)

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