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Protein Alignment Dhc98D and dnah6

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_524541.3 Gene:Dhc98D / 43379 FlyBaseID:FBgn0013813 Length:5080 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:XP_073806886.1 Gene:dnah6 / 100148193 ZFINID:ZDB-GENE-030616-623 Length:4163 Species:Danio rerio


Alignment Length:4479 Identity:1380/4479 - (30%)
Similarity:2201/4479 - (49%) Gaps:601/4479 - (13%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly   849 VVNAMNIDTRATLQEFVATKHENLLRFFVTEINAVERVFTKLKKSPPMAKHQPAKISAIFWARLL 913
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Zfish    27 MAKSLPVDT--TVPPSLAPVDVEMLR---------SRLISAVPRHP-----QPNADALVFPHRTR 75

  Fly   914 GKKLKTSVLAFKRVEDEPAIKNSFLKRSSFKQYF--ELMT--VMFQFEKVLFENFIQNATYLVNT 974
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Zfish    76 AQERQWATQKPAQVEMLPVLK----RRSGYMKPYNNQKLTPKMPFQFDEV---------QSIDSS 127

  Fly   975 TNRS-NVLRIRICKESTMSYISE-AVQTLKAK---PRPELQMTSDRRVTPVKSSNLMPVQSEAFS 1034
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Zfish   128 TERGPSVLQL----PKIPHYIKDRQVQLTQGSLRIPSPPKRVKSSSKSCPVPSLSYTP--SPPLS 186

  Fly  1035 AYSVADSAGTEISSESENEGLLVGDTSQKKLMCRINRLTVLVAMI--------MWMVSNTRKANI 1091
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Zfish   187 -------------------GSLLFDSVDELIRAKICSPPHIVQAIRTNPHLGFFYLTSSVPKSSI 232

  Fly  1092 QLQECTAFIKMVKDKKPKDVTAMDRHCVR-------TCELLQRAESQYLLPIWRELVGEKTLIEY 1149
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Zfish   233 NFDTYNLKIATFGNINKSDYYTVSTHAVTHYCGSEVDCLPLERWEQEY----------------- 280

  Fly  1150 DMDFVVNLKRDVFDVLFEAQQFEHLGFTLPAVLRTAIMKKDLLFKDY---ERMTEVVDRYRSIIN 1211
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Zfish   281 --------------------QFHRKLLRIPVF---ALFRKWKAFRVWCANVRYKKISKCRRSLQE 322

  Fly  1212 NL---------SMSEVIFLRGHIYDTELFIQMGVGRYTWTSFNIGKF--CDQINSQLRKLTSIVS 1265
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Zfish   323 NLFVLNESLRPALIDIREMCYHISDMPLCRLEKDHTFTLKEFQRAQYTQLEEVSSRLEKFRELVM 387

  Fly  1266 QI--NFIRLDLRSRIDMIKSFNLFNLDDELKVEDTSRSSGESYLQDRKNPSQRFKSV---TGETI 1325
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Zfish   388 EVARNACR-------NALKEFG--HTPDYGEVE----TDGNEEL-----ASPAFKLVFEDTPEKI 434

  Fly  1326 TMFSVEKDVPADEKAEQACGSGIYPCQGYFELLEASRNRKAAQMKKLYDSLGPVLVKLESLVLGT 1390
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Zfish   435 TY------------TQQANKS--YHC------------KRLTCFIRLADYL--IVNTTHMLVVNS 471

  Fly  1391 FSGRSDRMKTYYEY------------WEGETFKCIVDM---TYQNLKCYINRLLSNKPMFEVNAV 1440
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Zfish   472 V---SKLLRVFQEHITHTPSPALIQSWTGNEISHDTDIKVTAEQNISAY------HQPMFITELM 527

  Fly  1441 LLMSEIVLEPSVQELQNTIVTATKDYISRLRIFTRWMTGTCIACPLVEMGKQFKYNYTYYEDVIQ 1505
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Zfish   528 LDTHSLSYQPSNEDFQE-----------------------CVA----EIIGQFE----------- 554

  Fly  1506 IRSIVDLVINIHDLASRVANEARGFVSQFRKYFNLWAFEKSFICQKFLEK----QVTLIEIDEKF 1566
             ::::.|...:.|                 .||:  ||.:..|.||..||    ..::.||.|:.
Zfish   555 -KTVLSLDTLVQD-----------------TYFD--AFTQPIINQKVEEKICGDGPSVEEILEED 599

  Fly  1567 TFYSSIVETL----------AN--TRKFQDIKCVRINLEPLLASITQHAQDWCTTLGEELLRHVN 1619
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Zfish   600 AYLQNIILNIKQSIQTAFVTANVYARTFEPFRLFYKENEDLDLEALKEQEHEVAFFENSLDKYHQ 664

  Fly  1620 DNMRAMR-NEVKTLSLNLNKTTR---------------------------------ELEDFKLVM 1650
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Zfish   665 EHKEALAIQQKRPLGILLVDTTKLKHRLIPSPLRCIEAINDILPRLAKKKMDDIIAEAQDAQFKL 729

  Fly  1651 TTIGTVQSSTLTNEQKIHEMQ--------ETFTILSEHKIM------FPYEDMLMAHHLEKRWKR 1701
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Zfish   730 DFVPTVTTEYVDSLNFLDEIQKRIEVLEKETVTVSEMYKLIECYSVPTPPEDIAV---------- 784

  Fly  1702 LFLSALYRYEKLQP--------IKQKFADMTSVEIDEFCDDLAEFIKDYDENGPGSVGAELERGV 1758
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Zfish   785 --------YATLPPCITAVRNTIDKAVGERDSY-VDKFCQHLQQDIGQLN-NTVQEVKAEAENHQ 839

  Fly  1759 ------------RLMDPYGQKIAERESRREELANAERLFDMAMVDYHEFARVQTEFEGLQQLYKL 1811
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Zfish   840 LLDIDADRSHIRRLLGDIQISIDELQSQAFKYKTYQKNFKVEVTKYDTLEELTAEVKLKQLLWDS 904

  Fly  1812 YKAQKYAREGWGKTLWADLDPNVLTEGVESYLKEFRKFTKAVRTLPVGVQLEIHMKQFKGTVPLM 1876
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Zfish   905 LEEWESLENGWLQDKFDELDPELLSKQVNRFVKYVSQLEKGLPPNNVVPFLKAKVESMREKLPVI 969

  Fly  1877 VSLKHEALRERHWLQLMEK--TGQYFDMSPARFTLENM----FAMQLHKYQEIAEQILTNAIKEL 1935
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Zfish   970 TDLRNPCLKARHW-EMLEAIVDSKLLEEAQTLATLQNIDIFRFGLQI---QEVSGQ----ASGEA 1026

  Fly  1936 QIERGVQAVIETWASMAFKTFKHFKGSDDRGWVLGPVDEIMQILEDNAMNLQSMGASQFIGPFLE 2000
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Zfish  1027 SLENILRKIEDSWKTTEFIVLPHRDTKD--VFILGGTDDIQVLLDDSIVNVATVASSRYAGPIKA 1089

  Fly  2001 TVNKWERTLALISEIIDEWLVVQRKWLYLEGIFIGGDIRTQLPEEARKFDDIDKSYRRIMVDCAK 2065
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Zfish  1090 RVDKWQRQLLLFNQTLDEWLLCQRSWLYLESIFSAPDIQRQLPAEAKMFLQVDKSWKEIMRKVNR 1154

  Fly  2066 NPLVVPFCTVPGRLVEIQGLGIGLENCQKSLNEYLDSKRRIFPRFYFISTDELLSILGSS-EPSA 2129
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Zfish  1155 MPNALRAATQTGILDVFQNNNALLERIQKCLEAYLESKRVIFPRFYFLSNDELLEILAQTRNPQA 1219

  Fly  2130 VQNHIIKMYDNIKSLRL------VKEGSQTI--------VTGMISSEGEVMEFRHSARAAGRVEY 2180
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Zfish  1220 VQPHLRKCFDAISQLEFATLTPTTPEGDDTVEKIQYTNDILSMVSPEGEKVVLGKGLKARGNVED 1284

  Fly  2181 WMNDVLDEMRRSNRFINKTAIYDFGTDLQISRPDWLM-NYQGMVGLAASQVWWTAEVEEAFDQAQ 2244
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Zfish  1285 WLGKVEEAMFSSLRRLSKAAIADYQSK---PRVEWVVAGHPSQVVLTISQLMWCRDMDNCLE--G 1344

  Fly  2245 NHGNMRAMKDFLGKNNYQIEELVLKVRSNLSRNDRLKFKAQCTVDVHARDIIDNFVRDNVLDASE 2309
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Zfish  1345 EHDHFQALQEFEITNFERLNALAALVRGNLPSLHRNIITALITIDVHARDIVTDLVKEQVDSSDN 1409

  Fly  2310 FSWESQLRFYWIKFYDNLHVLQCSGSFDFGYEYMGLNGRLVITPLTDRIYLTITQALLMNLGGAP 2374
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Zfish  1410 FEWQRQLRYYWDVDLDDCVARMALSQYIYGYEYLGACPRLVITPLTDRCYLCLMGALQLDLGGAP 1474

  Fly  2375 AGPAGTGKTETVKDLAKAMGLLCVVTNCGEGMDYRAVGTILSGLVQCGAWGCFDEFNRIDISVLS 2439
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Zfish  1475 AGPAGTGKTETTKDLAKALAIQCVVFNCSDGLDYKMMGTFFSGLAQSGAWCCFDEFNRINIEVLS 1539

  Fly  2440 VISTQLQTIRNGLIRKLDRFVFEGVEIHLDPKCGVFVTMNPGYAGRTELPESVKALFRPVTCIKP 2504
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Zfish  1540 VIAQQLITIRNAKAAKLSRFMFEGREIKLVMTCAAFITMNPGYAGRTELPDNLKALFRPIAMMVP 1604

  Fly  2505 DLELICLISLFSDGFLTAKVLAKKMTVLYSLAQAQLSKQCHYDWGLRSLNSVLRMAGVMKRQSED 2569
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Zfish  1605 NYALIAEVILYSEGFESSKTLARKMTQMYKLCSEQLSQQDHYDFGMRAVKSVLVMAGSLKRENPN 1669

  Fly  2570 LPEAVVLMRVLRDMNFPKFVFEDVPLFLGLIKDLFPGIDCPRIGYPDFNAAVRHVLVNDGYILLP 2634
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Zfish  1670 LSEDVVLIRALRDSNLPKFLKDDAALFSGILSDLFPGVTIPEHDYGVLQSTIHSSLCQRSLQPLP 1734

  Fly  2635 DQEDKVVQMYETMMTRHSTMLVGPTGGGKTVVINALVKAQT-----HMG------LPTKCLVLNP 2688
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Zfish  1735 SIISKVIQLYETMLVRHGVMLVGPTGSGKTTVYRVL--ADTLDTLHHAGHPNPFFRPVKTYVLNP 1797

  Fly  2689 KACSVIELYGFLDMETRDWIDGLFSNIFREMNKPIEREERRYACFDGDVDALWIENMNSVMDDNK 2753
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Zfish  1798 KSVSMGELYGEVNPLTLEWRDGLMALCVRAAVQDFS-DDHKWVISDGPVDALWIENMNTVLDDNK 1861

  Fly  2754 LLTLANGERIRLENYCALLFEVGNLNYASPATVSRAGMVYVDPKNLRYSPFWQRWVLTRPE---- 2814
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Zfish  1862 MLCLANSERIKLTPSIHMMFEVQDLAVASPATVSRCGMVYIDPEELKWMPYVQTWLTGFAEKISD 1926

  Fly  2815 PQRELLNDFFEKIITQSIAFILEGLDGTTQGNPLKLVIMQTDLNMVTQFCNLYDALL-----PNY 2874
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Zfish  1927 PVRGYLMELFEQYVEKGLQF---------ASKHCVQAVAQVDISKVTTLCCLLEALLFSDGAPSL 1982

  Fly  2875 VMDSKNYDEPVQQNYNTDSLECCFLQAVYGSMGACLVEKHQPVFDEYMKRISGFPLVQDTPENPA 2939
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Zfish  1983 KMESSKLNNVLCQTF-----VFCYLWAVGGN----LIESHWDTFDTFVRQ----QFEDNTDAKLS 2034

  Fly  2940 SGGQFPQSKPTLYDYFWDVKDNVWKAWEWVVQPYTHDPQVKFSEILVPTVDNTRTNRTLSLMSEI 3004
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Zfish  2035 SVGD-------LWSVYMNFDIKCLEPWERIIPVFSYNSEIPFFEMLVPTTDTVRYGYLMEKLLSV 2092

  Fly  3005 KRPVLLVGEAGTSKTATIMQYLRNLNPSVNVI-LNINFSSRTSSLDVQHTLEAAVEKRTKDTYGP 3068
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Zfish  2093 NHSVLFTGITGVGKSVVARALLNSVQEKAGYVPVYINFSAQTSSARTQEIIESKLEKKRKNILGA 2157

  Fly  3069 PMGKRIACFIDDMNMPQVDDYGTQQPIALLKLFFERGGMYDRDKDLNWKKFKDLTFYAAMGTAGG 3133
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Zfish  2158 PANKKIVVFVDDLNMPKLDSYGSQPPIELLRQFQDFHGFYDREK-FFWKEIHDMTIAAACAPPGG 2221

  Fly  3134 GRNEVDPRFISMFSTYNIIFPNDESLIQIYSSIFKGHMVFVKFQPEYMLIADMIVHMTLKLFKMV 3198
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Zfish  2222 GRNPVTPRFIRHFSMLCLPTPSESSLKQIFKAILGGFL--TEFSTAVKQAADSIVDAAVEIYHRM 2284

  Fly  3199 IVDLPPTPSKFHYIFNLKDLSRIFAGMLLIEPTCFKGLRDLIRVWRNEYTRIICDRLITDNDIAN 3263
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Zfish  2285 SVDLLPTPAKSHYVFNLRDLSKCVQGMLQCEPTTVRDQTHIFRLFCHECQRVFHDRLINNED-KS 2348

  Fly  3264 VRRNLAVEVAERFPPTFEEEHGFIDAAAAEAEAQARLLYEPSKADIDGGEEEGEEEEEGEEAPQV 3328
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Zfish  2349 YFNTMISEMASKY---------------------FSINIEPA----------------------- 2369

  Fly  3329 ILSLKDYVLRDPLLFGDFRNFTNESEPRLYEDLLDYNSVYFLFTEILEEYCERKQKMT-LVLFED 3392
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Zfish  2370 ------YFVNQPIIFGDFIKVGADKADRVYEDLTDMDKIRQVLQDYLDDYNTTFAKETKLVFFQD 2428

  Fly  3393 CLEHLTRVHRTLRMNRGHVLLIGVGGSGKKCITRLAAFAAECDVFEITISRGYNEAAFREDLKVL 3457
            .:||::|:.|.:|..||:.||:||||:||:.:|||||.......|:|.:|||||..:|.|||:.|
Zfish  2429 AIEHVSRIARMIRQERGNALLVGVGGTGKQSLTRLAAHMCGYRCFQIELSRGYNYDSFHEDLRKL 2493

  Fly  3458 YTIAGVKRKKVVFLFTGAQVAEEGFLELINNILTVGQVPALFPDEDKDGIVNQVRKFAEEDGVS- 3521
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Zfish  2494 YRMAGVEGQDMVFLFTDTQIVVEEFLEDINNMLNSGEVPNLFEKDELKQVLAAISPKAKEAGISE 2558

  Fly  3522 ASKDAVWGYFLRTCAENLHVVLCMSPAGDALRNRCRNFPGLIGSTYIDWVFPWPRQALYAVAKLF 3586
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Zfish  2559 GNRDEVYQFFITRVREKLHIVLCMSPVGDSFRSRCRMFPSLVNCCTIDWFVQWPREALLSVSQTF 2623

  Fly  3587 LTEHRLIPASHREAIVEHVVHVHTSIQQYSKDYLAKLRRNNFVTPKHYLDYINTYRGLLEEKAKF 3651
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Zfish  2624 FQNVEFGSEEMKQCFSEMCVEIHVSVTDMAERFYSELRRHYYTTPTSYLELINLYLGMLGEKRQQ 2688

  Fly  3652 ITQQRSRLGEGIKKIEEASVQIDELRIIVTEQKKNVAVASEECEAMLVTIESSTQKANVKKAEAS 3716
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Zfish  2689 LQAARDRIKNGLTKLLETNELVDKMKQDLSALEPVLAQKSIDVSALMEKLAVDQENADQVRRVVK 2753

  Fly  3717 EKSVEVEIKGKQIAIEKDEAEEILAEAMPALEEARLALSQLEKAQITEIRSFATPPAAVQVVCEC 3781
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Zfish  2754 EDEALAKVKAEETQAIADDAQRDLDEALPALDSANKALNALDKADISEMRVFTKPPDLVMTVMEA 2818

  Fly  3782 VAILKGYKEINWKSAKGMMSDVNFLKSLMEMDCEALTQKQITQCRQHMKTGNL--EDMAKISVAG 3844
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Zfish  2819 VCILLSNK-TDWASAKQLLGDGNFLKKLMDYDKDNIKPQILQKLHKYISNPDFVPEKVEKVSKAC 2882

  Fly  3845 AGLLRFVRAVLGFFDVYKEVKPKKERLDFLVEEQEVQIKLLNHLNGEIQKLEEKLNELNENYATS 3909
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Zfish  2883 KSMCMWVRAMDLYSRVLKEVGPKREKLAAAQVELDATMSTLKEKQNKLQEVENQIKVLQDQFESS 2947

  Fly  3910 MKQMRALTEMMQQAERRLIASDKLISGLTSELIRWSKEMASLGQQLIDSVGGCLISASFLAYTGA 3974
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Zfish  2948 MAEKETLAKTMALTEARLGRSGKLTSALGDEQVRWQESITLFEQEIHNVIGNVFIAAACVAYYGA 3012

  Fly  3975 FTWEFRKAMVFDDWLEDIASLGIPIQLPFKIDGYLTTDVEISQWSNEGLPPDELSIQNGILTMRA 4039
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Zfish  3013 FTSHYRQLLI-DHWITRCQSLGIPISDNFSLIGILGDPYEIRQWNAEGLPRDNVSTENGILVMRG 3076

  Fly  4040 SRFPLCIDPQLQALQWIRKREFKNNLKVLSFSDSDFLKQLEMAIMYGTPVLFEDVDDYIDPVIDD 4104
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Zfish  3077 RRWPLMIDPQDQANRWIRSKETKNGLKVIKLTDAGFLRTLENAIRLGMPVLLEELKETLDPALEP 3141

  Fly  4105 ILQKNIRIQGGRKFVMLGDKEVDWDPSFRVYLTTKFSNPKFDPAVYAKALVINYTVTQTGLEDQL 4169
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Zfish  3142 ILLKQTFVSGGRTLIRLGDSDIDYDKNFRFYMTTKMANPHYLPEVCIKVTIINFTVTKSGLEDQI 3206

  Fly  4170 LSVVVGTERPDLEAQRESLIAQTSENKQLLQQLEDSLLRELSTSTGNMLDNVELIETLENTKTKA 4234
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Zfish  3207 LSDVVRLERPDLEEQRSQLIVRINADRNQLKAIEDRILKLLFTSEGNILDNEELVQTLQESKVTS 3271

  Fly  4235 GVVMEQLKLAADTAADIEVLRNGYRPAAKRGAVLFFALSDMATVNSMYQYALAAYLDVFVYSLRK 4299
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Zfish  3272 QAIKSRLVEAETTEEMINRAREKYRPVATRGSIMYFVIASLSEIDPMYQFSLKYFKQLFNNTIES 3336

  Fly  4300 AVPDASLNKRLNNIIKTLTENVYCYGCTGIFERHKLLFSFQIATKLAQRDGILLQSELDFFIKGS 4364
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Zfish  3337 AEKHKDLSLRLQILLDQTLLSAYTNVSRGLFEQHKAIYSFMLCVEIMMQRGEISQQEWLYFLRGA 3401

  Fly  4365 IALTKSERSNP-CKWLSEKSWEDVLKLAFDFP-------DIFGT-------------LPDHFGRY 4408
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Zfish  3402 GGIRKELPEKPEVPWLSDFAWETCCNLEDRLPCFNGIKKEIISTPISVKLGQLEVTVNPEHWDGY 3466

  Fly  4409 LTEWKEWFDLENPEEVPCP------GDYNIKCNAFQKLMFLRCFRVDRIFRSINQYIVETMDEFY 4467
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Zfish  3467 VTDLPPF-----SEEIPSEKQPQVRGHWNQQLGAFQKLILIKSFMEEKVVSAVTEFVITGLGQQF 3526

  Fly  4468 IMPPVVSFSAIYEQTSSTIPVCFVLSAGSDPTNDLIKLADTIVGMSNFCHISLGQGQEKAALRLL 4532
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Zfish  3527 VENPLVDLATLYADMSPSIPLVFILSTGSDPMGAFQRFANEKGYQDRVKSISLGQGQGPIAERMI 3591

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Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

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