DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment CG4849 and MEE5

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_651605.1 Gene:CG4849 / 43358 FlyBaseID:FBgn0039566 Length:975 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_172112.1 Gene:MEE5 / 837131 AraportID:AT1G06220 Length:987 Species:Arabidopsis thaliana


Alignment Length:983 Identity:592/983 - (60%)
Similarity:755/983 - (76%) Gaps:21/983 - (2%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly     1 MDSDLYDEFGNYIGPDLDSDEEDEQSIYGQPDVQDD--PEDAMDEDE--------VEPQEDEDKE 55
            |:|.||||||||:||:::||.:.:..:..: |:||.  .|:..|.::        :....|.:.|
plant     1 MESSLYDEFGNYVGPEIESDRDSDDEVEDE-DLQDKHLEENGSDGEQGPGGSNGWITTINDVEME 64

  Fly    56 VTAVVLHEDKRYYPSAVEVYGPDVETIVQEEDAQPLDKPLIEPVKKLKFQIKEQDMQETTYDMEF 120
             ..:||.|||:|||:|.||||.||||:|.:||.|||::|:|:||:.::|::..:| |.|....:|
plant    65 -NQIVLPEDKKYYPTAEEVYGEDVETLVMDEDEQPLEQPIIKPVRDIRFEVGVKD-QATYVSTQF 127

  Fly   121 MADLMDTPPLIRNVALVGHLHHGKTTFVDCLIRQTH--PQFETMEERQLRYTDTLFTEQERGCSI 183
            :..||..|.|:|||||||||.||||.|:|.|:.|||  ..|....|:.::||||...||||..||
plant   128 LIGLMSNPALVRNVALVGHLQHGKTVFMDMLVEQTHHMSTFNAKNEKHMKYTDTRVDEQERNISI 192

  Fly   184 KATPVTLVLQDVKQKSYLLNIFDTPGHVNFSDEATAAMRMSDGVVLFIDAAEGVMLNTERLLKHA 248
            ||.|::|||:|.:.||||.||.|||||||||||.||::|::||.||.:|||||||:||||.::||
plant   193 KAVPMSLVLEDSRSKSYLCNIMDTPGHVNFSDEMTASLRLADGAVLIVDAAEGVMVNTERAIRHA 257

  Fly   249 VQERQAITVCINKIDRLILELKLPPQDAYFKLKHIVEEVNGLLSTYGAPDDNL-LVSPILGNVCF 312
            :|:...|.|.|||:||||.||||||:|||:||:|.:|.:|..:|.......:| |:.|..|||||
plant   258 IQDHLPIVVVINKVDRLITELKLPPRDAYYKLRHTIEVINNHISAASTTAGDLPLIDPAAGNVCF 322

  Fly   313 ASSLYGFCFTLKSFAKLYADTYEGVAYLD---FAKRLWGDMYFNSKTRKFSKKQPHNSAQRSFVE 374
            ||...|:.|||:||||:||..: ||| :|   ||.|||||:|::|.||.|.:..|....:|:||:
plant   323 ASGTAGWSFTLQSFAKMYAKLH-GVA-MDVDKFASRLWGDVYYHSDTRVFKRSPPVGGGERAFVQ 385

  Fly   375 FILEPMYKLIAQVVGDVDTTLSDTLAELNVRVSKEEMKSNIRPLLRLVCNRFMGDCSGFVDMCVE 439
            |||||:||:.:||:|:...::..|||||.|.:|....|.|:||||||.|:...|..|||.||.|:
plant   386 FILEPLYKIYSQVIGEHKKSVETTLAELGVTLSNSAYKLNVRPLLRLACSSVFGSASGFTDMLVK 450

  Fly   440 HIKSPLENAKRKVDHIYTGPKEGDIYRDMISCNQYGTLMVHSSKMYPNDDCTFFQVLARIVSGTL 504
            ||.||.|.|.|||||.|||.|:..||..|:.|:..|.|||:.:|:||..|.:.|.|..|:.||.|
plant   451 HIPSPREAAARKVDHSYTGTKDSPIYESMVECDPSGPLMVNVTKLYPKSDTSVFDVFGRVYSGRL 515

  Fly   505 HAGQEVRVLGENYTLQDEEDSRILQVGRLWVFESRYKVELNRVPAGNWVLIEGIDQCIVKTSTIV 569
            ..||.||||||.|:.:||||..|.:|.:||::::||::.::..|.|:||||||:|..|:||:|:.
plant   516 QTGQSVRVLGEGYSPEDEEDMTIKEVTKLWIYQARYRIPVSSAPPGSWVLIEGVDASIMKTATLC 580

  Fly   570 DINVPEDLYIFRPLKFNTQSIIKIAVEPVNPSELPKMLDGLRKVNKSYPLLSTRVEESGEHVILG 634
            :.:..||:||||.|:|||..::|.|.||:||||||||::||||::|||||..|:|||||||.|||
plant   581 NASYDEDVYIFRALQFNTLPVVKTATEPLNPSELPKMVEGLRKISKSYPLAITKVEESGEHTILG 645

  Fly   635 TGELYLDCVMHDLRKMYSEIDIKVADPVVAFCETVVETSSLKCFAETPNKKNKITMISEPLEKGL 699
            |||||||.:|.|||::|||:::|||||||:|||||||:||:||||||||||||||||:|||::||
plant   646 TGELYLDSIMKDLRELYSEVEVKVADPVVSFCETVVESSSMKCFAETPNKKNKITMIAEPLDRGL 710

  Fly   700 AEDIENGTVCINWNKKRIGEFFQVNYDWDLLAARSIWAFGPDSTGPNILVDDTLPSEVDKNLLTA 764
            |||||||.|.|:||:|::|:||:..|||||||||||||||||..|||||:|||||:|||:||:.|
plant   711 AEDIENGVVSIDWNRKQLGDFFRTKYDWDLLAARSIWAFGPDKQGPNILLDDTLPTEVDRNLMMA 775

  Fly   765 VKDSIVQGFQWGTREGPLCEEPIRNVKFKILDGVIANEALHRGGGQIIPTARRVAYSAFLMATPR 829
            ||||||||||||.||||||:||||||||||:|..||.|.||||.||:||||||||||||||||||
plant   776 VKDSIVQGFQWGAREGPLCDEPIRNVKFKIVDARIAPEPLHRGSGQMIPTARRVAYSAFLMATPR 840

  Fly   830 LMEPYLFVEVQAPADCVSAVYTVLARRRGHVTQDAPVSGSPIYTIKAFIPAIDSFGFETDLRTHT 894
            ||||..:||:|.|.|||:|:||||:|||||||.|.|..|:|.|.:|||:|.|:|||||||||.||
plant   841 LMEPVYYVEIQTPIDCVTAIYTVLSRRRGHVTSDVPQPGTPAYIVKAFLPVIESFGFETDLRYHT 905

  Fly   895 QGQAFCLSVFHHWQIVPGDPLDKSIIIRPLEPQQASHLAREFMIKTRRRKGLSEDVSINKFFDDP 959
            ||||||||||.||.|||||||||:|.:|||||....|||||||:|||||||:|||||.|||||:.
plant   906 QGQAFCLSVFDHWAIVPGDPLDKAIQLRPLEPAPIQHLAREFMVKTRRRKGMSEDVSGNKFFDEA 970

  Fly   960 MLLELARQ 967
            |::|||:|
plant   971 MMVELAQQ 978

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
CG4849NP_651605.1 EFTUD2 4..111 CDD:464968 47/116 (41%)
PRK13351 115..957 CDD:481252 533/847 (63%)
MEE5NP_172112.1 EFTUD2 4..118 CDD:464968 47/115 (41%)
PRK13351 131..968 CDD:481252 532/838 (63%)

Return to query results.
Submit another query.