DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment CG4849 and eftud2

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_651605.1 Gene:CG4849 / 43358 FlyBaseID:FBgn0039566 Length:975 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_956802.2 Gene:eftud2 / 393480 ZFINID:ZDB-GENE-040426-1569 Length:973 Species:Danio rerio


Alignment Length:975 Identity:726/975 - (74%)
Similarity:837/975 - (85%) Gaps:2/975 - (0%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly     1 MDSDLYDEFGNYIGPDLDSDEEDEQSIYGQPDVQDDPEDAMDEDEVEPQEDEDKEVTAVVLHEDK 65
            |::||||||||||||:|||||::|.....: |..:..|:..|:|:.|..||.......|||||||
Zfish     1 METDLYDEFGNYIGPELDSDEDEELDAEDR-DADEADEEGDDDDQAEADEDGGGGGMEVVLHEDK 64

  Fly    66 RYYPSAVEVYGPDVETIVQEEDAQPLDKPLIEPVKKLKFQIKEQDMQETTYDMEFMADLMDTPPL 130
            :|||:|.|||||:|||||||||.|||.:|:|:||:..:|.:.||::..|.|||||:|||||:..|
Zfish    65 KYYPTAEEVYGPEVETIVQEEDTQPLTEPIIKPVRMKQFTLMEQELPATVYDMEFLADLMDSSEL 129

  Fly   131 IRNVALVGHLHHGKTTFVDCLIRQTHPQFETMEERQLRYTDTLFTEQERGCSIKATPVTLVLQDV 195
            ||||.|.||||||||.||||||.||||:....::..|||||.||||||||..||:||||:||.|.
Zfish   130 IRNVTLCGHLHHGKTCFVDCLIEQTHPEIRKRDDEDLRYTDILFTEQERGVGIKSTPVTMVLPDS 194

  Fly   196 KQKSYLLNIFDTPGHVNFSDEATAAMRMSDGVVLFIDAAEGVMLNTERLLKHAVQERQAITVCIN 260
            :.||||.||.|||||||||||.|:|:|:|||:|||||||||||||||||:|||||||.|||:|||
Zfish   195 RGKSYLFNIMDTPGHVNFSDEVTSAVRLSDGIVLFIDAAEGVMLNTERLIKHAVQERLAITICIN 259

  Fly   261 KIDRLILELKLPPQDAYFKLKHIVEEVNGLLSTYGAPDDNLLVSPILGNVCFASSLYGFCFTLKS 325
            ||||||:||||||.|||:||:|||:||||||||| :.|::|:|||:|||||||||.|..||||.|
Zfish   260 KIDRLIVELKLPPTDAYYKLRHIVDEVNGLLSTY-STDESLIVSPLLGNVCFASSQYCICFTLGS 323

  Fly   326 FAKLYADTYEGVAYLDFAKRLWGDMYFNSKTRKFSKKQPHNSAQRSFVEFILEPMYKLIAQVVGD 390
            |||:|:|||..::|::||||||||:|||.|||||:||.|::::|||||||:|||:||:::|||||
Zfish   324 FAKIYSDTYGDISYMEFAKRLWGDIYFNPKTRKFTKKAPNSNSQRSFVEFVLEPLYKILSQVVGD 388

  Fly   391 VDTTLSDTLAELNVRVSKEEMKSNIRPLLRLVCNRFMGDCSGFVDMCVEHIKSPLENAKRKVDHI 455
            |||:|...|.||.:.::|||:|.||:||||||||||.|:.:|.|||||:||.||...|:.|::|.
Zfish   389 VDTSLPRVLDELGIHLTKEELKLNIKPLLRLVCNRFFGEFTGLVDMCVQHIPSPQGGARAKIEHT 453

  Fly   456 YTGPKEGDIYRDMISCNQYGTLMVHSSKMYPNDDCTFFQVLARIVSGTLHAGQEVRVLGENYTLQ 520
            |||..:.|:...|..|:..|.||.|::|||..||...|....|::||||.|||.|:||||||:|:
Zfish   454 YTGGLDSDLGETMSECDPDGPLMCHTTKMYSTDDGVQFHAFGRVLSGTLQAGQPVKVLGENYSLE 518

  Fly   521 DEEDSRILQVGRLWVFESRYKVELNRVPAGNWVLIEGIDQCIVKTSTIVDINVPEDLYIFRPLKF 585
            |||||:|..|||||:..:||::|:|||||||||||||.||.||||:||.:....|:..|||||||
Zfish   519 DEEDSQICTVGRLWISVARYQIEVNRVPAGNWVLIEGCDQPIVKTATITEPRGNEEAQIFRPLKF 583

  Fly   586 NTQSIIKIAVEPVNPSELPKMLDGLRKVNKSYPLLSTRVEESGEHVILGTGELYLDCVMHDLRKM 650
            ||.|:||||||||||||||||||||||||||||.|:|:|||||||||||.|||||||||||||||
Zfish   584 NTASVIKIAVEPVNPSELPKMLDGLRKVNKSYPSLTTKVEESGEHVILGIGELYLDCVMHDLRKM 648

  Fly   651 YSEIDIKVADPVVAFCETVVETSSLKCFAETPNKKNKITMISEPLEKGLAEDIENGTVCINWNKK 715
            |||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||..|.|.||:|
Zfish   649 YSEIDIKVADPVVTFCETVVETSSLKCFAETPNKKNKITMIAEPLEKGLAEDIENEVVQITWNRK 713

  Fly   716 RIGEFFQVNYDWDLLAARSIWAFGPDSTGPNILVDDTLPSEVDKNLLTAVKDSIVQGFQWGTREG 780
            ::|||||..|||||||||||||||||:|||||||||||||||||.||.:||||||||||||||||
Zfish   714 KLGEFFQTKYDWDLLAARSIWAFGPDTTGPNILVDDTLPSEVDKALLGSVKDSIVQGFQWGTREG 778

  Fly   781 PLCEEPIRNVKFKILDGVIANEALHRGGGQIIPTARRVAYSAFLMATPRLMEPYLFVEVQAPADC 845
            |||:||||||||||||.|||.|.|||||||:|||||||.|||||||||||||||.||||||||||
Zfish   779 PLCDEPIRNVKFKILDAVIAQEPLHRGGGQVIPTARRVVYSAFLMATPRLMEPYYFVEVQAPADC 843

  Fly   846 VSAVYTVLARRRGHVTQDAPVSGSPIYTIKAFIPAIDSFGFETDLRTHTQGQAFCLSVFHHWQIV 910
            ||||||||||||||||||||:.|||:||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Zfish   844 VSAVYTVLARRRGHVTQDAPIPGSPLYTIKAFIPAIDSFGFETDLRTHTQGQAFALSVFHHWQIV 908

  Fly   911 PGDPLDKSIIIRPLEPQQASHLAREFMIKTRRRKGLSEDVSINKFFDDPMLLELARQDVLINYPL 975
            |||||||||:|||||||.|.||||||||||||||||||||||:||||||||||||:|||::|||:
Zfish   909 PGDPLDKSIVIRPLEPQPAPHLAREFMIKTRRRKGLSEDVSISKFFDDPMLLELAKQDVMLNYPM 973

  Fly   976  975
            Zfish   974  973

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
CG4849NP_651605.1 EFTUD2 4..111 CDD:464968 60/106 (57%)
PRK13351 115..957 CDD:481252 648/841 (77%)
eftud2NP_956802.2 EFTUD2 4..111 CDD:464968 60/107 (56%)
PRK13351 123..955 CDD:481252 641/832 (77%)

Return to query results.
Submit another query.