DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment Gp93 and hsp-90

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_651601.1 Gene:Gp93 / 43354 FlyBaseID:FBgn0039562 Length:787 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_506626.1 Gene:hsp-90 / 179971 WormBaseID:WBGene00000915 Length:702 Species:Caenorhabditis elegans


Alignment Length:719 Identity:339/719 - (47%)
Similarity:476/719 - (66%) Gaps:31/719 - (4%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly    70 EKAKKFTFQTEVNRMMKLIINSLYRNKEIFLRELISNASDAIDKIRLLALSNSKELETNPELHIR 134
            |.|:.|.||.|:.::|.||||:.|.||||:|||||||||||:||||..||:...||:|..||.|:
 Worm     3 ENAETFAFQAEIAQLMSLIINTFYSNKEIYLRELISNASDALDKIRYQALTEPSELDTGKELFIK 67

  Fly   135 IKADKENKALHIMDSGIGMTHQDLINNLGTIAKSGTADFLAKMQDPSKSEGLDMNDMIGQFGVGF 199
            |..:||.|.|.|||:|||||..||:|||||||||||..|:..:|     .|.|:: |||||||||
 Worm    68 ITPNKEEKTLTIMDTGIGMTKADLVNNLGTIAKSGTKAFMEALQ-----AGADIS-MIGQFGVGF 126

  Fly   200 YSAFLVADRVVVTTKHNDDKQYIWESDA-NSFSIT--EDPRGDTLKRGSVISLYLKEEAQDFLEE 261
            ||||||||:||||:|:|||..|.|||.| .||.:.  .||.   :.||:.|.:::||:..|||||
 Worm   127 YSAFLVADKVVVTSKNNDDDSYQWESSAGGSFVVRPFNDPE---VTRGTKIVMHIKEDQIDFLEE 188

  Fly   262 DTVRELIRKYSQFINFPIRMWSSKTVEEEVPVEE--EAK-PEKSEDDVED--EDAKVEEAEDEKP 321
            ..::|:::|:||||.:||::...|..|:||..||  ||| .||.|.:||:  :||       :|.
 Worm   189 RKIKEIVKKHSQFIGYPIKLVVEKEREKEVEDEEAVEAKDEEKKEGEVENVADDA-------DKK 246

  Fly   322 KTKKVSKTTWDWTLINDSKPIWTRKPAEVTEDEYTSFYKSLTKDSSEPLTQTHFIAEGEVTFKSL 386
            ||||:.:..::...:|.:||||||.|.:::.:||..|||||:.|..:.|...||..||::.|::|
 Worm   247 KTKKIKEKYFEDEELNKTKPIWTRNPDDISNEEYAEFYKSLSNDWEDHLAVKHFSVEGQLEFRAL 311

  Fly   387 LYVPKVQPSESFNRYGTKSDNIKLYVRRVFITDEFNDMMPNYLSFIRGVVDSDDLPLNVSRETLQ 451
            |:||:..|.:.|....:| ::||||||||||.:...::||.||:||:|||||:|||||:|||.||
 Worm   312 LFVPQRAPFDLFENKKSK-NSIKLYVRRVFIMENCEELMPEYLNFIKGVVDSEDLPLNISREMLQ 375

  Fly   452 QHKLIKVIKKKLVRKVLDMLKKI--DKEAYEKFWKEFSTNIKLGVMEDPSNRSRLAKLLRFQTSN 514
            |.|::|||:|.||:|.::::.::  ||:.::||:::|..|:|||:.||.:||.:|:..||:.||.
 Worm   376 QSKILKVIRKNLVKKCMELIDEVAEDKDNFKKFYEQFGKNLKLGIHEDSTNRKKLSDFLRYSTSA 440

  Fly   515 GKGVTSLAEYKERMKAKQEHIYYIAGANRAEVEKSPFVERLLSKGYEVLYLVEAVDEYCISALPE 579
            |...|||.||..|||..|..||||.|.::..|..|.||||:.|:|:||||:.:.:||||:..|.|
 Worm   441 GDEPTSLKEYVSRMKENQTQIYYITGESKDVVAASAFVERVKSRGFEVLYMCDPIDEYCVQQLKE 505

  Fly   580 FDGKKFQNVAKEGFQLNESEKSKKNFESLKSTFEPLVKWLNDVALKDQISKAQVSERLSNSPCAL 644
            :||||..:|.|||.:|.|:|:.||.||..|..:|.|.|.:.|: |:.::.|..||.||.:|||.:
 Worm   506 YDGKKLVSVTKEGLELPETEEEKKKFEEDKVAYENLCKVIKDI-LEKKVEKVGVSNRLVSSPCCI 569

  Fly   645 VAGVFGWTGNMERLAMSNAHQKSDDPQRTYYLNQKKTLEINPRHPLMRELLRRVEADEADDTAKD 709
            |...:||:.||||:..:.|.:   |.....|:..||.|||||.|.:|:.|..|||.|:.|.|.||
 Worm   570 VTSEYGWSANMERIMKAQALR---DSSTMGYMAAKKHLEINPDHAIMKTLRDRVEVDKNDKTVKD 631

  Fly   710 MAVMMFRTATLRSGYMLQETSQFADSIEQMMRQTLGVSQDEQVEFDEEEEDDAEETATGSQESGN 774
            :.|::|.||.|.||:.|:|....|..|.:|::..|.:..||..:........||....|::|..:
 Worm   632 LVVLLFETALLASGFSLEEPQSHASRIYRMIKLGLDIGDDEIEDSAVPSSCTAEAKIEGAEEDAS 696

  Fly   775 ADDE 778
            ..:|
 Worm   697 RMEE 700

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
Gp93NP_651601.1 HATPase_Hsp90-like 82..275 CDD:340404 111/195 (57%)
HSP90 257..748 CDD:459703 224/497 (45%)
hsp-90NP_506626.1 HSP90 6..702 CDD:481033 337/716 (47%)

Return to query results.
Submit another query.