Protein Alignment Klp98A and cos

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_524532.2
• Gene: Klp98A / 43310
• FlyBaseID: FBgn0004387
• Length: 1265
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: NP_477092.1
• Gene: cos / 35653
• FlyBaseID: FBgn0000352
• Length: 1201
• Species: Drosophila melanogaster
• Alignment Length: 1206
• Identity: 251/1206 - (20%)
• Similarity: 430/1206 - (35%)
• Gaps: 367/1206 - (30%)

  Fly    68 PHFATQEQVYSDLGNDVVDCAYEGYNACVFAYGQTGSGKTFTMMGTPNNPGL------IPRIC-E 125
            |..::|||||......::....||::|.|..|||.|.||::|:.|...:|.|      :.::| .
  Fly   143 PSSSSQEQVYHQTVFPLITLFLEGFDASVVTYGQRGQGKSYTLYGNVQDPTLTDSTEGVVQLCVR 207

  Fly   126 ELFARMRVGQESGTGYRTHA---SYLEIYNERVKDLLAAQSTGHGLRVREHRSLGPYVENLSQHA 187
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  Fly   208 DIFSHISLHPE-----RTYAINVGFVEICGGDVCDLL-----GMG--------------NI--HC 246

  Fly   188 VSDFDEIQECIARGNAQRTTASTNMNDTSSRSHAIFTITFVQA-VFMNDMPSETVSKIHLVDLAG 251
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  Fly   247 -TNVDAVFHWLQVGLSAR---------QSLPAHTLFTLTLEQQWVSKEGLLQHRLSTASFSDLCG 301

  Fly   252 SERANATGATGQRLKEGAHINKSLVTLGSVISALAEQTGGGHNSSSSALATTPNGASKRVLYIPY 316
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  Fly   302 TERC------GDQ-PPGRPLDAGLCMLEQVISTLTD----------PGLMYGVNG------NIPY 343

  Fly   317 RDSILTWLLKDSLGGNSKTIMIAALSPADCNYSETLSTLRYANRAKNIINKPTVN--EDTNVKLI 379
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  Fly   344 GQTTLTTLLKDSFGGRAQTLVILCVSPLEEHLPETLGNLQFAFKVQCVRNFVIMNTYSDDNTMIV 408

  Fly   380 R------ELREEINKLKSMLAGDIHSLQPSL--------------------KVLADLQKKEAQEK 418
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  Fly   409 QPAEPVPESNSSAGPLSQAGPGDNFGLQFAASQWSKLVTNAEGLFSKLIDSKLITEVEKEQIEEW 473

  Fly   419 VLTEEWTEKWKVAQSILQEQKSLGLRKSGVGVV-------------------------------- 451
            :..::..|:...:...:::||.|      |.::
  Fly   474 LFLKQECEECLSSTEAMRQQKQL------VPILEAEEPEDVNSEAANSESPNSDNENDTDNESHR 532

  Fly   452 --LDSEMPHLIGIHNDVTTGVTL-----YSLKEGETRIGSEDADV-AQDIELAGD---------- 498
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  Fly   533 PDLDDKIESLMEEFRDKTDALILEKHAEYLSKHPKAVMQSQDREIEAQPPEENGDDRKVSIGSRR 597

  Fly   499 -----GIRAQHCSIFLKGGVVTLHPWPLAQCWVNAHLIDEPKQISQGDIILLGRTNIFRFNNPAE 558
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  Fly   598 RSVQPGASLSTAELAMLNRVASQQPPPP----IDPESVVDPLESSSGEGIRQAALAAAAATAPIE 658

  Fly   559 --AAKLRK---DLSRSQLDMSRLSLITSSKENLLTCSIYSDEDGASPYK---------------R 603
              ..||||   ::...|..:..:......|:|:: ..:..:.|..|..|               :
  Fly   659 QLQKKLRKLVAEIEGKQRQLREIEETIQVKQNII-AELVKNSDTRSHAKQRFHKKRAKLEAECDK 722

  Fly   604 PERQYYPQRPMSRDDPELQ-------------------------------------DENRKILDT 631
            .::|........||..|::                                     .|:||..|.
  Fly   723 AKKQLGKALVQGRDQSEIERWTTIIGHLERRLEDLSSMKHIAGESGQKVKKLQQSVGESRKQADD 787

  Fly   632 IENALKQLNVERVQMHDQYKTKVRKLTE---ELIRLE-QEEMDGLQLL----------------- 675
            ::..|::....|.||..:. .|:|:..|   ||::.: ..|..|.||.
  Fly   788 LQKKLRKECKLRCQMEAEL-AKLRESRETGKELVKAQGSPEQQGRQLKAVQARITHLNHILREKS 851

  Fly   676 -NCREQELIARKDMLLWEKNNEKVQIDIVCRQISAFQTQLDSK-KRDFSEYVAKELQELQDCGKL 738
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  Fly   852 DNLEEQPGPEQQETLRHEIRNLRGTRDLLLEE----RCHLDRKLKRD-KVLTQKEERKLLEC--- 908

  Fly   739 DEMGMKIEEGTPLNDELLLQVSDSLDLFAAQFIKDTVRRNNEE---IRKLDEQIAEKER-ILNAS 799
            ||....|:......:|::.. ..|:|      ..|.::|...|   :.:|:....|:.| :|...
  Fly   909 DEAIEAIDAAIEFKNEMITG-HRSID------TSDRIQREKGEQMLMARLNRLSTEEMRTLLYKY 966

  Fly   800 TTKIAKVDETMLEIQAQLERLRLER----------------AESEAESQAMRAKKQN-MKLQLGN 847
            .||:..:.::..:::.||.:|..||                |..|.|..|:..::|: |||.|..
  Fly   967 FTKVIDLRDSSRKLELQLVQLERERDAWEWKERVLSNAVRQARLEGERNAVLLQRQHEMKLTLML 1031

  Fly   848 KSMSTSTSTNEAD-------------DVSKSDTYETCDTFHTAQSNLS--LVSSPTITEGQQSPL 897
            :.|:..||.:.|.             .|..|..:: .|.|:....|.|  |:.:|       .|:
  Fly  1032 RHMAEETSASSASYGERALAPACVAPPVQASSDFD-YDHFYKGGGNPSKALIKAP-------KPM 1088

  Fly   898 SNCSCDAEDEAEDTRKDDLSGSS-----EETSRTCTAGPSSGSGSGSVGIGGSGSAPSCTPSSQA 957
            ...|  |.|:.:|  |:..||.:     ...:|..:|..:..|||.:
  Fly  1089 PTGS--ALDKYKD--KEQRSGRNIFAKFHVLTRYASAAAAGSSGSTA------------------ 1131

  Fly   958 IMSDSGVCLDSRNQAILQNGHLNNYKQAVRTSDEDTGSCSSCELGRHSDVA----RPYCPLHSLR 1018
              .:|...::|...|           .|..||...||:     :|:..|.|    ||    ..|:
  Fly  1132 --EESTALIESTTTA-----------TATTTSTTTTGA-----VGKVKDKALVSFRP----EQLK 1174

  Fly  1019 RKIAAQKALIMKNLETDLNKAQLDEHIADLQDLQRR 1054
            |.:.|..|          .|....::...:||..||
  Fly  1175 RLMPAPTA----------TKVTRQKNKIIIQDASRR 1200

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
Klp98A	NP_524532.2	KISc_KIF1A_KIF1B	2..371	CDD:276816	85/313 (27%)
		Kinesin_assoc	370..478	CDD:465047	25/174 (14%)
		FHA_KIF16	449..556	CDD:438760	23/161 (14%)
		SMC_N	624..>864	CDD:481474	68/296 (23%)
		PX_KIF16B_SNX23	1131..1259	CDD:132784
cos	NP_477092.1	Kinesin	140..389	CDD:459720	84/304 (28%)
		SMC_N	660..>999	CDD:481474	68/355 (19%)