DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment CG3339 and Dync2h1

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_001036762.2 Gene:CG3339 / 43295 FlyBaseID:FBgn0039510 Length:4842 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:XP_063122173.1 Gene:Dync2h1 / 65209 RGDID:71042 Length:4313 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:4954 Identity:1212/4954 - (24%)
Similarity:2078/4954 - (41%) Gaps:1092/4954 - (22%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly   244 NRTILSLLVSP-----TIVEEVFAHVSQGHLRPAL----------DPKFRNLLEEMFINWTTQMH 293
            |..:.|:|.||     ..|.:|||        |.|          |||.:|||.|:....     
  Rat    94 NILVSSMLESPINSLYQAVRQVFA--------PMLLKDQEWSRNFDPKLQNLLSELEAGL----- 145

  Fly   294 DIVLERSECQPLGSTTQSAGHQPKYITL-------VSLPAQEIGFWTNRKLNLQNIYEQLRESTH 351
            .:||.:|:.           :.|| :.|       :..|:.|..||.              |..|
  Rat   146 GVVLRKSDT-----------NLPK-LKLKEDDTRGILTPSDEFQFWI--------------EQAH 184

  Fly   352 KTLAQILERIESVYYEPYATAFRKLVAAWLEAQDVSLWLQPLLRQTAAFNSVQFSNGHDLVAPLV 416
            :...||.:...|.:.|.:.|                     :.|:....:|:......|||....
  Rat   185 RGSKQISKERASYFKELFET---------------------IAREFYNLDSLSLLEVVDLVETTR 228

  Fly   417 HIVHLVWSNARY-YRSTQRMSVLLRCI---CNMLVHRAAEDLEL----QLLFQGDADEGLLKINR 473
            .:|..||....: :....||..||..|   ....|.:....|:|    ..|.:.:...|:....:
  Rat   229 DVVDDVWRQTEHDHYPESRMLHLLDVIGGSFGRFVQKKLGSLKLWEDPYYLVKENLKAGISICEQ 293

  Fly   474 TIAVLELFKQRMLDYKERYAGSQVLLPALSEGAAAVASSPSPDDQQQLWRFCHEDVFGQTLDGFS 538
            .:.|......::.   :||.                   |.|      |:  .|..|.:|||...
  Rat   294 WVIVCSHLTGQVW---QRYV-------------------PHP------WK--SEKYFPETLDRLG 328

  Fly   539 LQL---LELRQVFEAAVQFQQLEKLEVGGLRGKILTERVREIFGEFKVLFEQWSNVD-IDLTATV 599
            .:|   |.:|.:.|..:.|....:..:      :...||          ||.::.|: :......
  Rat   329 KRLEEVLAIRTIHEKLLYFLPASEERI------VCLSRV----------FEPFTGVNPVQYNPYT 377

  Fly   600 ASKWKCFRREQTLFFSRMQLLEQKLATVLLQAFEQCH-SWMHLLRLTLMFGSLLQREAVRPELAR 663
            ...||....:.....:.   .|||:|..|.....:.. |...||:..|.:..|::|..:..||  
  Rat   378 EPLWKAAVSQYEKIIAP---AEQKIAGKLKNYISEIQDSPQQLLQAFLKYKELVKRPTISKEL-- 437

  Fly   664 VLPHILFIYDTEMEQLEDSVGEVLLGYE-----IRGLAALPLA-NNFPPIANAMMWLEQHISRCD 722
                 :...:|.:.:|.||..:..|.:|     |.|.|:.||: .|...:.|.::|:.|.     
  Rat   438 -----MLERETLLARLGDSAKDFRLDFENRCRGIPGDASGPLSGKNLSEVVNNIVWVRQL----- 492

  Fly   723 EFGAKELSQLVEQLLKEKSELQTLPIQWNSLLSRRNILTTKLSNLQMKIWISWHECVDKLIIQGL 787
            |....:..::.|.||.:.|..::.......||.:..:...:    |...|       .:.:..||
  Rat   493 ELKVDDTIKIAEALLSDLSGFRSFHRSAEDLLDQFKLYEQE----QFDDW-------SREVQSGL 546

  Fly   788 DES-------VLSRSQDL----SQLHLNFSQVLFTLLKETKYLLALQATGSLSGDLFQLPEPLLT 841
            .:|       ..||..:|    ..|.:::|..|..||:|.:.|.||.         |.:|..:..
  Rat   547 SDSRSGLCIEANSRIMELDPNDGALKVHYSDRLVILLREVRQLSALG---------FVIPAKIQQ 602

  Fly   842 LYGHRDAYWERRIRLIKIGEFYNGIRSG----------ECAAAELQLIRNDLASIDEHVEVACQQ 896
            :......:.::.|.|.::..|||.|...          :.|.|..|:|:|..|.     .....|
  Rat   603 VANVAQKFCKQAIILKQVAHFYNSIDQQMIQSQRPMMLQSALAFEQIIKNSKAG-----SGGKSQ 662

  Fly   897 LTWRNYNDELVAGIFEQSRDLFARLQQSHGNLDAILASMRRWSREPLHQRSLYGRNLLDLRHQQD 961
            :||.|..:  :.|..::.::...||...:..|       |:|                       
  Rat   663 ITWDNPKE--LEGYIQKLQNAAERLATENRRL-------RKW----------------------- 695

  Fly   962 RVRLRLLQCDETKMLLNRLLIANFCLFFNYESQEFQLYSRDLSVQEFIREFPEEQRRQYNKYLAS 1026
                ....|::..:|:|..|:                                   ||..::...
  Rat   696 ----HTTFCEKVVILMNIDLL-----------------------------------RQQQRWKDG 721

  Fly  1027 VDELICREVREAMRISLEYLYKEMTATATATTTPTAPPVDPGCSAGMARLVLQQITTPQATSTAG 1091
            :.||                                                       .|..|.
  Rat   722 LQEL-------------------------------------------------------RTGLAS 731

  Fly  1092 AGASGAPPTANDAPLFEVKLELTETEIRFSPAFDASVENNFQQIVEQLLLDIKQTCDCMPRIVAD 1156
            ..|.|..|:           ::......::.....::|:.:|..:|.|       .:.:|.|..|
  Rat   732 VAAQGFQPS-----------DMRAWRQHWNHQLYKALEHQYQMGLEAL-------NENLPEINVD 778

  Fly  1157 NAPSEDDEDDDTATVDYEQ-ELRWEP--REDRAQELQERKK-----KDLELEQEQGDPKPQAVQF 1213
                          :.|:| .|::.|  .|.||:..:|.|:     ...:...|.||....:|  
  Rat   779 --------------LTYKQGRLQFRPPFEEIRAKYYREMKRFIGIPNQFKGVGEAGDESIFSV-- 827

  Fly  1214 NLLAAAKAYSQKMECTADGLEMLERAIRDALADTVAAASAYAAKFQAYAFLWTQQSSEVLAACMQ 1278
                                 |::|                    .|..||.....:|.|...:.
  Rat   828 ---------------------MIDR--------------------NASGFLTIYSKAEDLFRRLS 851

  Fly  1279 TAREQTHHVSAGGYAIMETFKKEIENYNEVHD----------------AIDQCENRECINGWLAL 1327
            ....|.......|...||...:  :|.:.|||                .:......:|:|    :
  Rat   852 AVLHQHKEWVVIGQVDMEALVE--KNLSTVHDWEKNFKALKIKGKEVERLPSAVKVDCLN----I 910

  Fly  1328 DIKPLKYGLLNLACKWSHMCKKWLLRYVQGTLKELNAFIARGFETLQLHIARQDFATLLRVLAIM 1392
            :..|:|..:.:|..|...:....|.:.:|..:.|::.|:....:.|.  :..|....:.......
  Rat   911 NCSPVKTVIDDLIQKLFDLLVLSLKKSIQTHIHEIDTFVTEAMKVLT--VIPQSVEEIGDTNLQY 973

  Fly  1393 SEIREREPYADNVFKPLKEIMGLLKTYNVEFEPQLLR-----GIE---QLPQQWQQLKHSSTVKQ 1449
            |.:::|.|          ||:.|.:  ..|.:.:|||     |:|   .|..:|.        |.
  Rat   974 SNLQDRRP----------EILPLFQ--EAEDKNRLLRTVAGGGVETVSNLRAKWD--------KF 1018

  Fly  1450 EALQDTRFHQ---QQRVTALIGLHTCHLQHYARQFQKMPFFRVPCPQVYDVCDEVYLRLHRFRRQ 1511
            |.:.::  ||   :.::..:.|.....||.|                        |..|.:|:  
  Rat  1019 ELMMES--HQLMIKDQIEVMKGNVKSRLQIY------------------------YQELDKFK-- 1055

  Fly  1512 QRLYTRWARLLDIQPPD-------------------PATLQFCEVELRRVKQL------------ 1545
                .||.:|   :|.|                   ...::|.::|:.|.|.:            
  Rat  1056 ----ARWDQL---KPGDDIIETGQQNTMDQSAKSIKEKKIEFDDLEVIRKKLVDDCHHFGLEEPN 1113

  Fly  1546 ----WDFVRVIESCIVAWHATPWLLIDTDDMEHECKKFTRDLRTLDKCIREWAPYVHIVGVLREL 1606
                :...:.||||     |..|.|.:         :|.:.|:.:.|  .:|..|...:.:..|.
  Rat  1114 FSLAYSISKDIESC-----AQIWALYE---------EFQQGLQEMAK--EDWITYRTKIYIFEEF 1162

  Fly  1607 VAS----LRAITE-------LQNPA-----------------ITERHWMELMQLTKLSYKCNKST 1643
            :.:    ||.:.|       ||:..                 ::..||::|.:|..|.    :.|
  Rat  1163 LINWHERLRKVEEHSVMTVKLQSEVDRYKIIIPILKYVRGEHLSPDHWLDLFRLLGLP----RGT 1223

  Fly  1644 RLAQLLTLQL-------QHHEEDIKNTVDRAIKEMTVTKVLDE-----IKATWAHLEFELEQHHT 1696
            .|.:||...|       .....|:|:...||..|:|:.:.|.|     :.|.::.:::|..|:.|
  Rat  1224 SLEKLLFGDLLRVADTIVEKASDLKDLNSRAQGEVTIREALRELDLWGVGAVFSLIDYEDSQNRT 1288

  Fly  1697 RPHIQLLKVSEELIETLDDNQMQLQNISTSKHIEYLLDKLTHWQKVLGGIDTLIVNWFEVQRKWI 1761
               |:|:|..::::..:.||:..||::..|.:.:...||::.|::.|..:|..:.|...:||||:
  Rat  1289 ---IKLIKDWKDIVNQVGDNRCLLQSLKDSPYYKGFEDKVSIWERKLAQLDEYLQNLNHIQRKWV 1350

  Fly  1762 YLECIFIGSADIRAQLPADAANFERIDEDFTALLAKV-QEVRVVMQVVLRHDDVLAQLLQLQHRL 1825
            |||.|| |    |..||.:...|.::||||.:::..: ::.||.  .:..|..:...||.:..:|
  Rat  1351 YLEPIF-G----RGALPKEQTRFNKVDEDFRSIMMDIRKDSRVT--TLTTHAGIRNTLLTILDQL 1408

  Fly  1826 AVCEKALNDYLETKRLAFPRFYFISAADLLDILSNGNNPQVIDRHLIKLFDSILRLQYETNTPNA 1890
            ..|:|:||::||.||.||||||||...|||:||....||.||..||.|||..|..:.::..:.:.
  Rat  1409 QRCQKSLNEFLEEKRSAFPRFYFIGDDDLLEILGQSTNPSVIQSHLKKLFAGINSVCFDEESKHI 1473

  Fly  1891 LGMHSKENDEYVPFVSFDPDQPAFIVCGGRVELWLRAIIQQMRSTLHELFRRALRVFGEKPRELW 1955
            ..|.|.|. |.|||.|       .::....||.||..:..:|:.||.:|.:..:.........:.
  Rat  1474 TAMRSLEG-EVVPFKS-------KVLLSNNVEAWLNDLALEMKQTLKQLLKECVTAGRSSQGAID 1530

  Fly  1956 LYDWPAQVALCCSQISWTADVNRSFGCMEEGYEGVMKELHKRQI-----AQLNALINLLLGELSP 2015
            ...:|:|:.....||.:|.||           |..:::....||     |:|....::......|
  Rat  1531 PSLFPSQILCLAEQIKFTEDV-----------EDAIRDHSLHQIEAQLAAKLERYTSVDTSSEDP 1584

  Fly  2016 GDRQ------KIMTICTIDVHSRDVVGKIIASKVDNSLAFQWQSQLRHRWDDDQAGSSSGRASTA 2074
            |:.:      |:..:....:|:.|:|.::..::|..:..:.|:.|:|.....|..          
  Rat  1585 GNSESGILELKLKALILDIIHNIDIVKQLNQAQVHTTDDWAWKKQVRFYMKSDHT---------- 1639

  Fly  2075 ISCGGGDEDCFANICDAEFRYAYEYLGNTSRLVITPLTDRCYITLTQSLRLRLAGATAGPAGTGK 2139
                     |:..:.|:|.:|.|||.||..:||.|||||:||:||||::::.|.|...|||||||
  Rat  1640 ---------CYVQMVDSELQYTYEYQGNAPKLVYTPLTDKCYLTLTQAMKMGLGGNPYGPAGTGK 1695

  Fly  2140 TETTKDLGRALGVMVYVFNCSEQMDYKSCGNIYKGLAQTGAWGCFDEFNRICVEVLSVVAVQVKT 2204
            ||:.|.||..||..|.||||.|.:|.||.|.|:.||.:.|||||||||||:...|||.|::|::|
  Rat  1696 TESVKALGGLLGRQVLVFNCDEGIDVKSMGRIFVGLVKCGAWGCFDEFNRLEEAVLSAVSMQIQT 1760

  Fly  2205 IQEAIKMHKTQFIFMGERISLEPSVGIFITMNP---GYAGRTELPENLKTLFRPCAMIVPDFALI 2266
            ||:|:|.|::....:|:.:.:..:.||||||||   ||.||.:||:|||.||||.||..||..||
  Rat  1761 IQDALKNHRSVCELLGKEVEINANSGIFITMNPAGKGYGGRQKLPDNLKQLFRPVAMSRPDNDLI 1825

  Fly  2267 CEIMLMAEGFQDARLLARKFITLYTLCKELLSKQDHYDWGLRAIKSVLVVAGTL---------KR 2322
            .|::|.:|||:||:.|.||.:.::.|.:|||:.|.||||||||:|:||..:|.|         |:
  Rat  1826 AEVILYSEGFKDAKELGRKLVAIFNLSRELLTPQQHYDWGLRALKTVLRGSGNLLRQLKKSGTKQ 1890

  Fly  2323 DDHSRPEDQVLMRALRDFNIPKIVTEDVPIFMGLIGDLFPALDVPRKRVFEFEKTIRRAVNEIKL 2387
            |.:   |:.::::|||...:.|....|...|..||.|:||.:|.......|....:::...|...
  Rat  1891 DVN---ENHIVVQALRLNTMSKFTFADCTRFDALIKDVFPGIDFKEVEYNELSSALKQVFEEANY 1952

  Fly  2388 QPEEGFLMKVVQLQELLDVRHSVFIVGNAGTGKTKIWQTLRETYRIQKLKPVC--HVLNPKALSN 2450
            :.....:.|.::|.|.|..|..|.|||.:|.||:.:|:.||..  :.|:..|.  :.:||||:..
  Rat  1953 EVIPNQMKKALELYEQLRQRTGVVIVGPSGAGKSTLWRMLRAA--LCKIGKVVKQYTMNPKAMPR 2015

  Fly  2451 DELFGIVNPTTREWKDGLFSSIMREQANMPPGNPKWIVLDGDIDPMWIESLNTLMDDNKILTLAS 2515
            .:|.|.::..||||.||:.::..|:....|.....||:.||||||.||||||:::|||::||:.|
  Rat  2016 HQLLGHIDMDTREWSDGVLTNSARQVVREPQDVSSWIICDGDIDPEWIESLNSVLDDNRLLTMPS 2080

  Fly  2516 NERISLKREMRLLFEVGHLKAATPATVSRAGILYINPQDLGWSPYVSSWLETRVDMIE-RGILNA 2579
            .|||.....:..:||...|..|:|||:||.|:::::.::...:..:.|||  |...:| |..|..
  Rat  2081 GERIQFGPNVNFVFETHDLSCASPATISRMGMIFLSDEETDLNSLIKSWL--RNQPVEYRSNLEN 2143

  Fly  2580 LFEKYFPCLMQ---RQRDFRRITPITDMAMIQMTCHLLECLLDSDEGNADGRGRGSATGGAANPH 2641
            ....||...:|   :|.|:     :.:.:::                       |:...|.::.|
  Rat  2144 WIGDYFSKALQWVLKQNDY-----VVETSLV-----------------------GTVMNGLSHLH 2180

  Fly  2642 SLHHGELSHEAMVMALETIFVYATVWSFGSALSQDVIIDWHREFHKWWIGEFKDIKLPSQGTVFD 2706
            ...:    |:..::.|        :...|..|:....:::.:|...|......|...| ..|.||
  Rat  2181 GCKY----HDQFIINL--------IRGLGGNLNMKSRLEFTKEVFNWARETPPDSHRP-MDTYFD 2232

  Fly  2707 Y---QLNVQTLKFQPWSELAAHQSLEGQIDSETPLQNVLISTAETIR-LAYFLK-LLIDRNLACM 2766
            .   ||....|| :|.| |.|.....|.   ..|    :|.|.:..| |.||.. |..:.....:
  Rat  2233 CDRGQLASYVLK-KPES-LTADDFSSGH---SLP----VIQTPDMQRGLDYFKPWLSSETKQPFI 2288

  Fly  2767 LVGNSGCGKGAIFRQLFGQYANDQELLEVAVSAATAGDSSHQQQSGNPAGAVVVRRKASSSATPL 2831
            |||..|||||.:.|..|.| ....|:..:..||.|                              
  Rat  2289 LVGPEGCGKGMLLRYAFSQ-LRSTEIATIHCSAQT------------------------------ 2322

  Fly  2832 LTTVQATHFNFYTSSEIFQKMLD--RPLEKKSGRCYAPSGPKRRLIYFVNDLNMPEVDAYGTVQP 2894
                        ||..:.||:..  ..:...:||.|.|...: ||:.::.|:|:|::|.:||...
  Rat  2323 ------------TSRHLLQKLSQTCMVISTNTGRVYRPKDCE-RLVLYLKDINLPKLDKWGTSTL 2374

  Fly  2895 HTIMRQFMDYRQWYDRQRLQLKDIRHCQFAACMNPTAGSFTIDPRLQRH-----------FCVFS 2948
            ...::|.:.|:.:|| :.|:...:.:.|..|.|  :||.     ||.||           .|  :
  Rat  2375 VAFLQQVLTYQGFYD-ENLEWVGLENIQIVASM--SAGG-----RLGRHKLTTRFTSIVRLC--A 2429

  Fly  2949 VAPPGEDTLHHIYG----SILSSHLESPS-QGFTKEIRSIGSLLVRVGIALHRRVEYAFLPTALK 3008
            |..|..:.|..|||    ::|..:|::.| .|.:.:|..:...:|:|    :.:|...|......
  Rat  2430 VDYPEREQLQTIYGAYLEAVLHKNLKNHSIWGSSSKIYLLAGSMVQV----YEQVRAKFTVDDYS 2490

  Fly  3009 FHYLFNLRDLT----GIYQGLMNSVGAPASAGGGGASGFGGTICSRPSE-LMRLYVHEAFRVYHD 3068
             ||.|....||    |:::..:.          ||:|       :.|.: ::.:..:||.|::.|
  Rat  2491 -HYFFTPCILTQWVLGLFRYDLE----------GGSS-------NHPLDYVLEIVAYEARRLFRD 2537

  Fly  3069 RLVDPYDIKSFKSSIRDIFKKDF-EDFDEDFVFAEPLIYSHFAQSLVDQKYMP------------ 3120
            ::|...::..|.:.:..:.:.|: .|..::  .|:....:..||.:...|..|            
  Rat  2538 KIVGVKELHLFDNILTSVLQGDWGSDILDN--MADSFYVTWGAQHISGAKIAPGQPLPPHGKPLG 2600

  Fly  3121 -LKSWDSLYQLLIEAQASYNEVVGYMNLVLFEDAMIHVCRINRILESPRGNALLIGVGGSGKQTL 3184
             |.|.| |..::.:....|......::::||::.:.::.||:|:|..|.|:.||.|..|.|::|:
  Rat  2601 KLSSAD-LKDVIKKGLIHYGRDNQNLDILLFQEVLEYMSRIDRVLSFPGGSLLLAGRSGVGRRTV 2664

  Fly  3185 ARLAAFISSLNVSQIQIKRGFGLLDMREEIGNLYMKVGLKNLASVFLISDAQIPDESILMLINDL 3249
            ..|.:.:....:...:|.||:.....|.::.::....|::....|.|:.|.|....:.|.:||.|
  Rat  2665 TSLVSHMHGAVLFSPKISRGYEPKQFRTDLKHVLHLAGIEAQQVVLLLEDYQFVHPTFLEMINSL 2729

  Fly  3250 LASGEIPELFNDDQLDTITNGIRNEVKQSGTLDTKENCWRYFVEKVRRLLKVVLCFSPVGQTLRV 3314
            |:|||:|.|:..::|:.:...::::..|.|......|   ||..::::.|.:||..........:
  Rat  2730 LSSGEVPGLYTLEELEPLLLPLKDQASQDGFFGPVFN---YFTYRIQQNLHIVLIMDSANLNFII 2791

  Fly  3315 RARKFPAIISRTAIDWFHEWPKSALESVSQKFLNEIN---------------GILEPALVPPIGC 3364
            .....||:..:..:.|...|..|:::.:.:...:|.:               ..::|..:..   
  Rat  2792 NCESNPALHKKCQVLWMEGWSDSSMKKIPEMLFSEADIEEKYEKKRKDEKKKSSVDPDFIKS--- 2853

  Fly  3365 FMAYVHGTVNQISRIYLQNEKRYNYTTPKTFLEYIFLYRKLLVDKNGEFAERIARLQSGMSKLAE 3429
             ...:|           ::.|.|. .||..::.::.:|..:...|..|..:|.:.||:|:|||.|
  Rat  2854 -FLLIH-----------ESCKAYG-ATPSRYMTFLRVYSAISSSKRKELLKRQSHLQAGVSKLNE 2905

  Fly  3430 CARQVDTLKHQLAIQEVQLAAKNAAADKLI--VIVS---AESEKVKRERYIASEEEKRVRIIEED 3489
            ....||.|..:...|.:.|..|...||..:  :.||   |..:|.:.||.       :.||.||.
  Rat  2906 AKALVDELNRKAGEQSILLRIKQDEADSALQEITVSMQDASEQKTELERL-------KHRIAEEV 2963

  Fly  3490 VSI---KTKMCEEDLRQAEPALVAAQAALNTLNKNNLTELKSFGSPPKAVVNVCAAVMVLLASNG 3551
            |.|   |:|: :::|::.:|.:..|:.|:..:...:|:|::|...||..:.::...|:.|:..  
  Rat  2964 VKIEERKSKI-DDELKEVQPLVNEAKLAVGNIRPESLSEIRSLRMPPDVIRDILEGVLRLMGI-- 3025

  Fly  3552 KIPRDRSWKASKLMM----VRVDQFLNDLLNYNKDNIHPNIIETLQEYL--KDPEFNPDKVVQKS 3610
               .|.||.:.|..:    ||     .|:..::..||...|.|:::|.|  ....|:|....:.|
  Rat  3026 ---FDTSWVSMKSFLAKRGVR-----EDIATFDARNIPKEIRESVEELLFKNKASFDPKNAKRAS 3082

  Fly  3611 VAAAGLCAWVINLHRYHQVFLIVGPKQQALQDSHQELLEARERLQYLKAKINNLEAKLAEIQAEF 3675
            .|||.|.|||....:|..|...:.|.:.........|.:..:|.:.|:..:|::..|::|::.:|
  Rat  3083 TAAAPLAAWVKANVQYSHVLERIQPLETEQSGLELNLKKTEDRKRKLEDLLNSVGQKVSELKEKF 3147

  Fly  3676 ENAVGEKQRCQREADKTAFTIDLAHRLVNGLANENVRWKESVQSLLAKIGTLPGDILLISSFLSY 3740
            ::...|..:.:.|..|...||..|..|::.|..|:.||...|..:..::.|||....|.::|::|
  Rat  3148 QSRTSEAAKLEAEVSKAQETIKAAEVLISQLDREHRRWNAQVAEIAEELATLPKRAQLAAAFITY 3212

  Fly  3741 VGCFTRRYR----EELQHKMWLPNFRKIDPHIPHTEGVDTLALFSDDAQIAAWNNEGLPMDRMST 3801
            :.......|    ||......|..|             |.......:::...|.:||||.|.:|.
  Rat  3213 LSAAPEGLRKNCLEEWTKAAGLEKF-------------DLRRFLCTESEQLIWKSEGLPSDDLSI 3264

  Fly  3802 ENATIL-------QYSTRWPLMIDPQLQGIKWIKNRF-GTDLVVLRLRQKGFLEALEKSISQGDT 3858
            |||.::       .:|...|.:|||..|..:|:|... .:.|.|:..:...|:.|||.::..|.|
  Rat  3265 ENALVILQIIGLKSWSRVCPFLIDPSSQATEWLKTHLKDSHLEVINQQDSNFITALELAVRFGKT 3329

  Fly  3859 VLIEQIEESMDTVLEPLLSRALIKKG-RY-LRIGDKEIEFHASFRLILHTKMANPHYKPEMQAQT 3921
            ::|::: :.::.||.|||.|.|:.:| || ::||||.|:::..|||.|.|:..||...|:..:..
  Rat  3330 LIIQEM-DGVEPVLYPLLRRDLVAQGPRYVVQIGDKIIDYNEDFRLFLSTRNPNPFIPPDAASIV 3393

  Fly  3922 TLINFTVTPDGLEEQLLAEVVKIERPDLEQMKTEVTVQQNKFKISLKALEDELLARLASSGENVL 3986
            |.:|||.|..||..||||..::.|:||||:.||::..|:...||.|..||:.||..||:|..|:|
  Rat  3394 TEVNFTTTRSGLRGQLLALTIQHEKPDLEEQKTKLLQQEEDKKIQLARLEESLLETLATSQGNIL 3458

  Fly  3987 DDHALVINLENTKRTVDEIEAKVREARVTTLQIDDTRNIYRSAAKRAAILYFVLTDLSRINPIYK 4051
            ::..|:.:|..||.:...|:..::|:....:.:|..|:.|...|:.|:.:||:::|||:||.:|:
  Rat  3459 ENKDLIESLNQTKASSALIQDSLKESYKLQISLDQERDAYLPLAESASKMYFIISDLSKINNMYR 3523

  Fly  4052 FSLKSFMNVFRQAIAMAAESKNYEKRVLHLVESITLQTYRYTLRGLFEADKLTFTSHM------- 4109
            |||.||:.:|::|:....:|::.|:|:..||.|:....|.|..|.||:||:|.|..|.       
  Rat  3524 FSLASFLRLFQRALQNKQDSESTEQRIQCLVNSLKHMVYEYICRCLFKADQLMFALHFVRGMHPE 3588

  Fly  4110 --------TLRILIAAEQVAKDETDFLLRFPHDPTTLSPLDFVGRSAWGGIKSLTLIEHFYGIDK 4166
                    |...::..:.:.|.::...:| ...|:.:..     ..:|.   ..||.....|:.:
  Rat  3589 FFQENEWDTFTGVVVGDMLRKADSQQRIR-DQLPSWIDQ-----ERSWA---VATLKISLPGLYQ 3644

  Fly  4167 DM--ENYTKRWRKFMASDTPEREQFPGEWKHRTPL-QKLCIIRSLRPDRMTYAMRQFVEQTMGRS 4228
            .:  |:.| .||.:......|:| ||.....:..| |::.::::|||||:..||..|..:.:|  
  Rat  3645 TLCFEDGT-LWRTYYHHSMCEQE-FPSILAKKVSLFQQVLVVQALRPDRLQSAMALFACKALG-- 3705

  Fly  4229 YAEIQTPPFG--AIFQELNAATPAFFILSPGVDPIRDVERYGQRQGFHSESDTLVNISLGQGQEL 4291
            ..|:...|..  .:::|.....|...|:|||.||.::::.....:   ..|:....:::||||..
  Rat  3706 LKELSPLPLNLKRLYKETLEIEPILIIISPGADPSQELQELANAE---RSSECYHQVAMGQGQAD 3767

  Fly  4292 LAEQAIIGALESGQQWVILQNIHLVVNWLPTLEKLIERIVLQSESKGESNFRLFISAEPAPDPQY 4356
            ||.|.:.....:| .|:.|:|:||||:|||.|||.:..:      :.:.:|||:::||..|:   
  Rat  3768 LAIQMLKECARNG-DWLCLKNLHLVVSWLPVLEKELNTL------QPKESFRLWLTAEVHPN--- 3822

  Fly  4357 HVIPQGILESSLKVVNEPPSGMAANLHKAWDNFSQDALETCTQEAEFKSILFALCYFHAVAGERR 4421
              ....:|:||||:..|.|.|:..||.:.:::::.:.:.. .........||:|.:|||...|||
  Rat  3823 --FTPILLQSSLKITYESPPGLKKNLMRTYESWTPEQISK-KDNIHRAHALFSLAWFHAACQERR 3884

  Fly  4422 KFGPQGWNKVYPFNIGDLTISSNVLHNYLEGSNRIPWEDLRYLFGEIMYGGHITDDWDRRLCQTY 4486
            .|.||||.|.|.|::.||....:|:....:||..:.||.:..|....:|||.|.:.:|.|:.|:|
  Rat  3885 NFIPQGWTKFYEFSLSDLRAGYHVIDRLFDGSKDVQWEFVHGLLENSIYGGRIDNYFDLRVLQSY 3949

  Fly  4487 LEELLQQDLID-----GDFELCPGFPAPPN----LDFEGYHSYITEMLPE-ESPLLYGLHPNAEI 4541
            |::.....:||     ....:.|...:.||    ||:..    :.|.||| :.|..:||..|   
  Rat  3950 LKQFFNSSIIDVLNQRNKKSIFPYSISLPNSCSILDYRA----VIEKLPEDDKPSFFGLPAN--- 4007

  Fly  4542 GFLTTASEQLL--RTIFELQPRESELSSHCGAPRE----ELVKIMIDDFLDKLQDEFNL--QALL 4598
              :..:|:::.  :.|.:|:.....:::.|...||    ||..::  :...||....||  |.:.
  Rat  4008 --IARSSQRMTSSQVISQLRILGRSVTAGCKFDREIWSNELSPVL--NLWKKLNQNSNLIHQKVS 4068

  Fly  4599 NRVERK-TP---FVVVALQECERMNA--LIREIKRSLRELMLGLRGELTITQEMERLDHAIFYDH 4657
            ...:|: :|   |:::     |:.||  |::.:.:||..|...:||...::.|:::|..|:....
  Rat  4069 PPNDRQGSPILSFIIL-----EQFNAIRLVQSVHQSLAALSKVIRGTTLLSSEVQKLASALLNQK 4128

  Fly  4658 VPAAWAR--------LAY-----PSMLGLQSWFADLLHRIKELAGWLNDFKLPCAIWLGGLFNPQ 4709
            .|..|..        |.|     ...|.:|:| .:...:...||..|:         |..||:|.
  Rat  4129 CPLTWQSKWEGPEDPLQYLRGLVARTLAIQNW-VEKAEKQALLADTLD---------LSELFHPD 4183

  Fly  4710 SFLTAIMQESARKHDLPLDRM-LISCDVTKKQKDDVTLPPMEGAFVHDLYMDGASWD-CQLN--- 4769
            :||.|:.||:||.....:|.: .::....:.|:..:.:.      :..|.::|.|:| .:|:   
  Rat  4184 TFLNALRQETARATGCSVDSLKFVASWKGRLQEAKLQIK------ISGLLLEGCSFDGSRLSENQ 4242

  Fly  4770 ----SIVALRPKEMLCAMPVIYIKSIVQEKQELQRVYEC---PLYKTRSRGNTYVWTFNLKTRER 4827
                |:.::.|    |     |:....|.........||   |:|.:..| :..|...::.....
  Rat  4243 HDSPSVSSVLP----C-----YMGWTPQGSYGPYSPDECISLPVYTSAER-DCVVTNIDVPCGGN 4297

  Fly  4828 PSRWILGGVALLLQ 4841
            ..:||..|.||.|:
  Rat  4298 QDQWIQCGAALFLK 4311

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
CG3339NP_001036762.2 DHC_N1 279..903 CDD:462457 132/670 (20%)
DHC_N2 1532..1943 CDD:462462 129/467 (28%)
DYN1 1759..4514 CDD:227570 828/2898 (29%)
AAA_6 2095..2421 CDD:463697 154/337 (46%)
MT 3419..3759 CDD:463699 94/357 (26%)
Dynein_C 4545..4840 CDD:465677 72/333 (22%)
Dync2h1XP_063122173.1 None

Return to query results.
Submit another query.