Protein Alignment CG3339 and Dhc64C

DIOPT Version :9

• Sequence 1: NP_001036762.2
• Gene: CG3339 / 43295
• FlyBaseID: FBgn0039510
• Length: 4842
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: NP_001261432.1
• Gene: Dhc64C / 38580
• FlyBaseID: FBgn0261797
• Length: 4661
• Species: Drosophila melanogaster
• Alignment Length: 5161
• Identity: 1242/5161 - (24%)
• Similarity: 2218/5161 - (42%)
• Gaps: 987/5161 - (19%)

  Fly    75 RVLVMTLSPGGDLVPRSCLSDLYLPYSVQSARGSIPSAML-----------------PAE-DEAM 121
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  Fly   703 NFPPIANAMMWLEQ-------HISRCDEFGAKELSQLVE-QLLK-------EKSELQTLPIQWNS 752
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  Fly   815 ETKYLLALQATGSLSGDLFQLPEPLLTLYGHRDAYWERRIRLIKIGEFYNGIRSGECAAAEL--- 876
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  Fly   743 EVRNIKNLG---------FRVPLTIVNKAHQANQIYPYAISLIE------SVRTYERTLEKLNNR 792

  Fly   877 QLIRNDLASIDEHVEVACQQLTWRNYNDELVAGIFEQSRDLFARLQQSHGNLDAILASMRRWSRE 941
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  Fly   793 SLAQNSVFKIEDRASIV-----------PLVAGLRKDVLNLVSE--------------------- 825

  Fly   942 PLHQRSLYGRNLLDLRHQQDRVRLRLLQC-DETKMLLNRLLIANFCLFFNYESQEFQLYSRDL-- 1003
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  Fly   826 --------GIGLIWESYKLDPYVIRLSECVTQFQEKVDDLLVVEEQLDVDVRSLETCPYSAATFV 882

  Fly  1004 ----SVQEFIREFPEEQRRQYNKYLASVDELICREVREAMRISLEYLYKEMTATATA------TT 1058
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  Fly   883 EILSKIQHAVDDLSLRQYSNLSVWVTRLDE----EVEKKLALRLQAGIQAWTEALTGNKKEVDTS 943

  Fly  1059 TPTAPPVDPGCSAG--------------------------MARL-VLQQITTPQATSTAGAGASG 1096
            ..|..|..|....|                          .||. ::||....||..|:
  Fly   944 MDTDAPAQPTHKLGGDPQIQNAVHEIRITNQQMYLYPSIEEARFQIMQQFFAWQAIVTS------ 1002

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  Fly  1003 -----------QVRLQSTR--------YQVGLEKHVSQTYRNLLTKLPE------GKILENAYGA 1042

  Fly  1162 DDEDDDTATVDYEQELRWEPRED-RAQELQERKKKDLELEQE-QGDPKPQAVQFNLLAAAKAYS- 1223
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  Fly  1224 -----QKMEC------------------TADGLEM------LERAIRDALADTVAAAS-AYAAKF 1258
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  Fly  1108 IIIDYAKVQAKVTLKYDSWHKEALGKFGTLLGTEMTSFHSKVSKSRTDLEMQSIEAASTSDAVSF 1172

  Fly  1259 QAYAFLWTQQSSEVLAACMQTAREQTHHVSAGGYAIMETFKKEIENYNEVHDAIDQCENRECING 1323
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  Fly  1173 ITY---------------VQSLKKD-----------MIAWDKQVEVFREAQRILER-QRFQFPNT 1210

  Fly  1324 WLALDIKPLKYGLLNLACKWSHMCKKWLLRYVQGTLKELNAFIARGFETLQLHIARQDFATLLRV 1388
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  Fly  1211 WLHVD---------NIEGEWSAF---------NEIIKRKDTAIQTQVASLQAKIVAEDKAVETRT 1257

  Fly  1389 LAIMSEIREREPYADNVFKPLKEIMGLLKTYNVEFEPQLLRGIEQLPQQWQQLK--HSSTVK-QE 1450
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  Fly  1258 VDFLNDWEKTKPTGGKI-RP----------------DDALQQLQIFESKYSRLKEERDNVVKAKE 1305

  Fly  1451 ALQDTRFHQQQRVTALIGLHTCHLQHYARQFQKMPFFRVPCPQVYDVCDEVYLRLHRFRRQQRLY 1515
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  Fly  1581 RDLRTLDKCIREWAPYVHIVGVLRELVASLRAITELQNPAITERHWMELMQLTKLSYKCNKSTRL 1645
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  Fly  1711 ETLDDNQMQLQNISTSKHIEYLLDKLTHWQKVLGGIDTLIVNWFEVQRKWIYLECIFIGSADIRA 1775
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  Fly  1961 AQVALCCSQISWTADVNRSFGCMEEGYEGVMKELHKRQIAQLNALINLL----LGELSPGDRQKI 2021
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  Fly  2187 EDYLVCGEGDEQGAAWMEKGLGSTWVDKVLQLYQISNLNHGLMMVGPSGSGKSTAWKTLLKALER 2251

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  Fly  2614 SAL--RALPDMEVVGLNFSSAT---------------------------TPELLLKTFDHYCEYR 2649

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  Fly  2702 ASDQAWVSLERIQFVGACNPPTDPGRKPLSHRFLRHVPIIYVDYPGETSLKQIYGTFSRAMLRLM 2766

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  Fly  3230 FLISDAQIPDESILMLINDLLASGEIPELFNDDQLDTITNGIRNEVKQSG-TLDTKENCWRYFVE 3293
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  Fly  2999 FILDESNVLDSGFLERMNTLLANGEVPGLFEGDEYTTLMTQCKEGAQREGLMLDSSDELYKWFTQ 3063

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  Fly  3356 -------PALVPPI------------GCFMAYVHGTVNQISRIYLQNEKRYNYTTPKTFLEYIFL 3401
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  Fly  3127 WHAPDFFPSVCPLVPANPTHRDAVINSC--VYVHQTLHQANARLAKRGGRTMAVTPRHYLDFIHH 3189

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            ...:.|::.::.|.:|||||...|:.|.|.:|:|.||||:::.::::...|.:|::.|:.||..|
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            |:..|....|...:|..:   ||.:......:.::||..|||.....||.|....|:.....|
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  Fly  4274 HSESDTLVNISLGQGQEL-LAEQAIIGALESGQQWVILQNIHLVVNWLPTLEKLIERIVLQSESK 4337
               :..:.:|::|..:.. .||:||..|.::| :||:|:|:||...||..|||.:..:      :
  Fly  4069 ---NKQISSIAIGSAEGFNQAERAINMACKTG-RWVLLKNVHLAPQWLVQLEKKMHSL------Q 4123

  Fly  4338 GESNFRLFISAEPAPDPQYHVIPQGILESSLKVVNEPPSGMAANLHKAWDNF-SQDALETCTQEA 4401
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  Fly  4124 PHSGFRLFLTMEINPK-----VPVNLLRAGRIFVFEPPPGIRANLLRTFSTVPAARMMKTPSERA 4183

  Fly  4402 EFKSILFALCYFHAVAGERRKFGPQGWNKVYPFNIGDLTISSNVLHNYLEGS---------NRIP 4457
            .   :.|.|.:|||:..||.::.|.||.|.|.||..||.::.:.|..:::.:         .::|
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  Fly  4246 WDALVTLLSQSIYGGKIDNDFDQRLLTSFLKKLFTARSFEADFALVANVDGASGGLRHITMPDGT 4310

  Fly  4513 DFEGYHSYITEMLPEESPLLYGLHPNAEIGFLTTASEQLLRTIFELQPRESELSSHCGAPREELV 4577
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  Fly  4311 RRDHFLKWIENLTDRQTPSWLGLPNNAEKVLLTTRGTDLVSKLLKMQQLEDD---------DELA 4366

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  Fly  4367 YSVEDQSEQSAVGRGEDGRPSWMKTLHNSATAWLELLPK--NLQVLKRTVENIKDPLYRYFEREV 4429

  Fly  4616 ERMNALIREIKRSLRELMLGLRGELTITQEMERLDHAIFYDHVPAAWARLAYPSMLGLQSWFADL 4680
            ...:.|::.:...|::::|..:||...|.....:...:....:|..|.|...|:...:..|..|.
  Fly  4430 TSGSRLLQTVILDLQDVVLICQGEKKQTNHHRSMLSELVRGIIPKGWKRYTVPAGCTVIQWITDF 4494

  Fly  4681 LHRI---------------KELAGWLNDFKLPCAIWLGGLFNPQSFLTAIMQESARKHDLPLDRM 4730
            .:|:               |||.|:        .:|||||.||::::||..|..|:.:...|:.:
  Fly  4495 SNRVQQLQKVSQLVSQAGAKELQGF--------PVWLGGLLNPEAYITATRQCVAQANSWSLEEL 4551

  Fly  4731 LISCDVT-----KKQKD---DVTLPPMEGAFVHDLYMDGASWDCQLNSIVALRPKEMLCAMPVIY 4787
            .:...:|     ..|||   .||...::||            .|:.|.:  |....::..:||..
  Fly  4552 ALDVTITDAGLKNDQKDCCFGVTGLKLQGA------------QCKNNEL--LLASTIMMDLPVTI 4602

  Fly  4788 IKSI-VQEKQELQRVYECPLYKTRSR 4812
            :|.| :..:..:.:: ..|:|...:|
  Fly  4603 LKWIKISSEPRISKL-TLPVYLNSTR 4627

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
CG3339	NP_001036762.2	DHC_N1	276..903	CDD:285571	128/686 (19%)
		DHC_N2	1535..1944	CDD:285579	112/410 (27%)
		P-loop_NTPase	2095..2324	CDD:304359	129/256 (50%)
		P-loop_NTPase	2409..2544	CDD:304359	63/138 (46%)
		P-loop_NTPase	2731..3061	CDD:304359	68/335 (20%)
		P-loop_NTPase	3138..3406	CDD:304359	87/290 (30%)
		MT	3419..3759	CDD:289543	95/348 (27%)
		AAA_9	3789..4001	CDD:289547	68/214 (32%)
		Dynein_heavy	4142..4832	CDD:281078	181/761 (24%)
Dhc64C	NP_001261432.1	DHC_N1	240..839	CDD:285571	136/746 (18%)
		DYN1	1022..4338	CDD:227570	961/3628 (26%)
		DHC_N2	1326..1724	CDD:285579	113/440 (26%)
		P-loop_NTPase	1870..2103	CDD:304359	126/232 (54%)
		P-loop_NTPase	2227..2367	CDD:304359	64/139 (46%)
		P-loop_NTPase	2572..2835	CDD:304359	68/327 (21%)
		Cas4_I-A_I-B_I-C_I-D_II-B	2834..>2943	CDD:294426	33/113 (29%)
		P-loop_NTPase	2916..3194	CDD:304359	85/281 (30%)
		MT	3208..3544	CDD:289543	95/349 (27%)
		AAA_9	3569..3784	CDD:289547	68/215 (32%)
		Dynein_heavy	3925..4636	CDD:281078	182/764 (24%)

Information from Original Tools

Tool	Simple Score	Weighted Score	Original Tool Information
			BLAST Result	Score	Score Type	Cluster ID
Compara	1	0.930	-	-		C45450566
Domainoid	1	1.000	230	1.000	Domainoid score	I503
eggNOG	1	0.900	-	-		E1_COG5245
Homologene	0	0.000	Not matched by this tool.
Inparanoid	0	0.000	Not matched by this tool.
Isobase	0	0.000	Not matched by this tool.
OMA	0	0.000	Not matched by this tool.
OrthoDB	0	0.000	Not matched by this tool.
OrthoFinder	0	0.000	Not matched by this tool.
OrthoInspector	1	1.000	-	-		otm47047
orthoMCL	1	0.900	-	-		OOG6_100025
Panther	1	1.100	-	-	P	PTHR10676
Phylome	1	0.910	-	-
RoundUp	0	0.000	Not matched by this tool.
SonicParanoid	0	0.000	Not matched by this tool.
	7	6.740