DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment CG3339 and dhc1

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_001036762.2 Gene:CG3339 / 43295 FlyBaseID:FBgn0039510 Length:4842 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_001342921.1 Gene:dhc1 / 3361400 PomBaseID:SPAC1093.06C Length:4196 Species:Schizosaccharomyces pombe


Alignment Length:4777 Identity:982/4777 - (20%)
Similarity:1838/4777 - (38%) Gaps:1066/4777 - (22%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly   142 PLPPASSSF--------TTLDGVPRGKCAY--FVRRNTSDGPLTASNFAESVLY-GDFPV----H 191
            |..|.|.:|        :.|..|..|..|:  |.|...:|.|||..|    :|| ...|:    |
pombe    75 PTSPDSCTFGNMTFQWTSLLQDVFSGTSAFAIFKRFPLTDTPLTLQN----MLYINQLPILKGGH 135

  Fly   192 SKIE---------------TMSLLFDDVLQPLLEQAQSQWPAIVRKDLQARIKEVRNTLTEI--- 238
            ...|               .||..|...|  .:|....:  :.:..:..::.||:..|..:.   
pombe   136 KSNEIPERPINAIFLYTKYVMSCYFTAYL--AMESVDDR--STIDLNSPSKGKELELTCQKFADF 196

  Fly   239 --------KGKTNNRTILSLLVSPTIVEEVFAHVSQGHL---------RPALDPKFRNLLEEMFI 286
                    :...|:.|||.  ..|.|:..: .|..:.:|         :...|.:|...|..:..
pombe   197 ERSFTFFCREYQNSDTILQ--HHPLILSTI-KHAEENNLDLSVRLLPSKVLSDSEFYKSLSNLVN 258

  Fly   287 NW--TTQ-----MHDIVLERSECQPLGSTTQSAGHQPKYITLVSLPAQEIGFWTNRKLNLQNIYE 344
            .|  ||:     .||.:.:.:                         .:|..||.....:|..:.:
pombe   259 VWLKTTRSLIKLFHDQISKTA-------------------------LEEFNFWQFYYRSLSRLND 298

  Fly   345 QLRESTHKTLAQIL------ERIESVYYEPYATAFRKLVAAWLEA--QDVSLWLQPLLRQTAAFN 401
            ||.......:..||      ..|.|...|.....|...|.. ::|  :::||   .:...::...
pombe   299 QLHSRPVLFVLDILAFGKRFHTIASFNSETNIQCFVDKVGK-IDALFKEISL---DIFLSSSTLE 359

  Fly   402 SVQFSNGHDLVAPLVHIVHLVWSNARYYRSTQRMSV-------LLRCICNML------------- 446
            |:|.|     .|.|.......|.|.. |..|:.:..       ||:.|..:|             
pombe   360 SLQLS-----AALLYSTFSKKWRNTG-YPETRVLDFINFITEDLLKLISRLLPALGALSLSNVDF 418

  Fly   447 VHRAAEDLE-LQLLFQGDAD----EGLLK-------INRTIAVLELFKQRMLDYKERYAGSQVLL 499
            .||.|...: |.|.:....|    .|.||       :..:|..::.|:.::...:..:...|.|:
pombe   419 SHRTAVSSDILSLCYIRLKDFLRISGSLKEEQSYYGLKNSIKQIKAFENKLKYIQSFHEKHQQLI 483

  Fly   500 PALSEGAAAVASSPSPDDQQQLWRFCHEDVFGQTLDGFSLQLLE----LRQVFEAAVQFQQLEKL 560
            .||||                        |:|.| ....|::||    ...||.....|:.|:.|
pombe   484 GALSE------------------------VYGLT-HLTELEILEHLNKKEHVFNILTVFKDLQSL 523

  Fly   561 EVGGLRGKILTERVREIFGEFKVLFEQWSNVDIDLTATVASKWKCFRREQTLFFSRMQLLEQKLA 625
            .|                              :|::....:.|...   :|.:::.|.:||.::.
pombe   524 NV------------------------------LDISLKGVNAWNSL---ETSYYNCMTVLEDEVI 555

  Fly   626 TVLLQAFEQCHSWMHLLRLTLMFGSLLQREAVRPELARVLPHILFIYDTEMEQLEDSVGEVLLGY 690
            ..|....:...:...:....:.|..|..|..||..::..|..::.....|::.|:....|.:...
pombe   556 AQLKSLLQYSKTSSQMFTTLMRFQPLFFRTRVRTSISDCLHLLVNRIKQELDLLKTRFTEDVSDT 620

  Fly   691 EIRGLAALPLANNFPPIANAMMWLEQHISRCDEFGAKELSQLVEQLLKEKSELQTLPIQWNSLLS 755
            |   |.|:....|.|..::|::|..|..:|..|: .|.::.:..:             .||:.  
pombe   621 E---LIAMNELRNLPMASSAIIWATQLKNRLHEY-TKNINIIFGE-------------DWNNF-- 666

  Fly   756 RRNILTTKLSNLQMKIWISWHECVDKLIIQGLDESVLSRS--QDLSQLHLN--FSQVLFTLLKET 816
                    ....::|:     ||:  .:.:.||.:::..:  .|:|..:||  |...:|.|.:..
pombe   667 --------PDGFELKV-----ECI--TLQKRLDTNLIFTNWINDVSSRNLNFDFDSKIFYLTQSE 716

  Fly   817 KYLLALQATGSLSGDL--------------FQLPEPLLTLYGHRDAYWERRIRLIKIGEFYNGIR 867
            .....|:.:.|:..|.              :.:|..|:.|     |...:||:||.:. ..:.::
pombe   717 SAESPLRLSVSIDFDPCSFCKEIRTLAHLGYNIPSQLMEL-----ASCLQRIQLIAMC-LIDSVQ 775

  Fly   868 SGECAAAELQLIRNDLASIDEHVEVACQQLTWRNYNDELVAGIFEQSRDLFARLQQSHGNLDAIL 932
            |....:.|:.....:...:.|: |:|.:|        .:|.|:|....|...      |||    
pombe   776 SFNDVSFEISKTEEERFLLQEY-ELAVRQ--------HIVTGLFISWNDFIV------GNL---- 821

  Fly   933 ASMRRWSREPLHQRSLYGRNLLDLRHQQDRVRLRLLQCDE-TKMLLN-RLLIANFCLFFNYESQE 995
                  |..|  :.::..||.|...|  ..|.....|... |.:|:| |..|::  .:...:.|.
pombe   822 ------STPP--KCAIGKRNFLKNIH--PNVENYAYQFSSLTSLLMNKRNAISH--TYMQIQEQL 874

  Fly   996 FQL----YSRD--LSVQEFIREFPEEQRRQYNKYLASVDELICREVREAMRISLEYL--YKEMTA 1052
            |||    ||.|  |::|..:::.                            |.|.|:  |..:  
pombe   875 FQLDICEYSGDIFLTIQRKLQDL----------------------------IDLLYVNGYSNL-- 909

  Fly  1053 TATATTTPTAPPVDPGCSAGMARLVLQQ----ITTPQATSTAGAGASGAPPTANDAPLFE----- 1108
                      ||.....:.....|::.:    ::..:.|.......:....:...:.::|     
pombe   910 ----------PPFVRALNLRFQDLLISRCRKFLSFFKTTILTSGNENNDLKSKFSSDMYEKLRGF 964

  Fly  1109 ---VKLELTETEIRFSPAFDASVENN-------FQQIVEQLLLDIKQTC--DC-----MPRIVAD 1156
               ..|.:....|.|.|......|::       .|.:|...||.||.|.  :|     .|  |.:
pombe   965 LKPTNLTIQRNIIEFDPPVYRKKEDSIYLLDMCLQSVVNIPLLSIKTTAQRNCTLIGFFP--VIN 1027

  Fly  1157 NAPSEDDEDDDTATVDYEQELRWEPREDRAQELQERKKKDLELEQEQGDPKPQAVQFNLLAAAKA 1221
            ...||.....::....::..|.::....:.:........:|.|       |.:..|.:...:...
pombe  1028 RLESEILGIFESLLFHFDSILGYQNYWKKVEPFLNLNSLNLLL-------KSELFQLDQCYSLSL 1085

  Fly  1222 YSQKMECTADGLEMLERAIRDALADTVAAASAYA-------AKFQAYAFLWTQQSSEVLAACMQT 1279
            |...::...|.:..:......::.:|...:..|.       |.|..:.||..::|..:|     .
pombe  1086 YLIHLKSEVDEIGKVTDFKIFSVNNTEFKSQVYLYLREWINALFDRFTFLLGKESEHLL-----N 1145

  Fly  1280 AREQTH-HVSAGGYAIMET---------FKK----------EIENYNEVHDAIDQCENRECINGW 1324
            ..:.|| .:|...:.:..|         |||          :|..|.......:.|:.....|..
pombe  1146 ELDDTHSSLSTVDFTVNNTESLINSLKIFKKAGCYKLNVEHKIITYQNYEMTFNDCDAFSEFNFS 1210

  Fly  1325 LALDIKPLKYGLLNLACKWSHMCKKWLLRYVQGTLKELNAFIARGFETLQLHIARQDFATLL--R 1387
            |..||          ..||..:.:.:..|.::  |:.....|.|.|         .:||..:  .
pombe  1211 LLKDI----------TSKWKDLLESFECRRLK--LENNKDEILRNF---------SEFAKRVNTE 1254

  Fly  1388 VLAIMSEIREREPYADNVFKPLKEIMGLLKTYNVEFEPQLLRGIEQLPQQWQQLKHSSTVKQEAL 1452
            .|:::||.             ....:.|:|....||                    ||||.....
pombe  1255 TLSLISEW-------------CASSLSLIKANYDEF--------------------SSTVDDFLF 1286

  Fly  1453 QDTRFHQQQRVTALIGLHTCHLQHYARQFQKMPFFRVPCPQVYDVCD------EVYLRLHRFRRQ 1511
            :.::..:|           |.:..|.::..::        ::.:.||      |::         
pombe  1287 RFSKATEQ-----------CLMVKYIKKDLEI--------EIEESCDFSIQTEEIH--------- 1323

  Fly  1512 QRLYTRWARLLDIQPPDPATLQFCEVELRRVKQLWDFVRVIESCIVAWHATPWLLIDTDDMEHEC 1576
              ||.::..::.      :.|:|. ||::.                    |.|.|.||..:..:.
pombe  1324 --LYKKFKDVIS------SNLEFI-VEIKN--------------------TRWKLFDTATLSVQT 1359

  Fly  1577 KKFTRDLRTLDKCIREWAPYVHIVGVLRELVASLRAITELQNPAITERHWMELMQLTKLSYKCN- 1640
            ......|.::....:.:..:.:....|.:|......:.:|::..:...||:.|.::||.:.:.: 
pombe  1360 THQINALESVHTSFQHFKLFTNTKQSLNQLKDCTLLLQKLKSCPLKPVHWISLFEITKSTEQLDF 1424

  Fly  1641 KSTRLAQLLTLQLQHHEEDIKNTVDRAIKEMTVTKVLDEIKATWAHLEFELEQHHTRPHIQLLKV 1705
            :...::.:|.:.||.||..|...::.|:.|..:....:|:.:.|.:..|..:....|.:|  :..
pombe  1425 EKLLVSDILGIDLQAHESFITTLLNSAVVEANLENQFNEVHSFWKNSYFSFKSFKGRNYI--VVG 1487

  Fly  1706 SEELIETLDDNQMQLQNISTSKHIEYLLDKLTHWQKVLGGIDTLIVNWFEVQRKWIYLECIFIGS 1770
            .:|||:.::.|...|..|.||:|.:.....:|..|..:..|...:..|.|:|:.|.:|..||..|
pombe  1488 CQELIDAVEKNMDSLNLIKTSRHFKDGDMNITDLQSKMKIIVKFLNIWKEIQQIWTHLSAIFYES 1552

  Fly  1771 ADIRAQLPADAANFERIDEDFTALLAKVQEVRVVMQVVLRHDDVLAQLLQLQHRLAVCEKALNDY 1835
            ..|:..||..||:|....:.:..|:..::| |..:..|.....:|....:|...|...:|:|..|
pombe  1553 TYIQQLLPELAASFFNSSKTYMHLVTLLKE-RSYLYKVSNIPSLLESAAKLSTTLEDSKKSLLKY 1616

  Fly  1836 LETKRLAFPRFYFISAADLLDILSNGNNPQVIDRHLIKLFDSILRLQYETNTPNALGMHSKENDE 1900
            .|.:|....|.||:...||::::||..:|.||::.:|||:..|..|..:|...|..|..:.|.:|
pombe  1617 FELQRHKISRLYFLGDDDLMELISNPCDPFVINKQIIKLYPGIRSLIVDTENTNINGCTTNEGNE 1681

  Fly  1901 YV---PFVSFDPDQPAFIVCGGRVELWLRAIIQQMRSTLHELFRRALR----VFGEKPRELWLYD 1958
            .:   |....|..||..         |:.::...:::||.:||..:.:    .:..|.|.::..:
pombe  1682 LLFDNPICLLDNTQPLH---------WISSLEPFLKATLFQLFSTSFQQIRDFYYNKSRNVFCKE 1737

  Fly  1959 W----PAQVAL----C--CSQI-SWTAD--VNRSFGCMEEGYEGVMKELHKRQIAQLNALINLLL 2010
            |    |:|:.|    |  |.:| :..||  ::..|..:.:|...::....:.::: :...:.|:.
pombe  1738 WFLRYPSQITLLSLRCTLCHEIETGIADCCLDAVFNFINDGISSLVLLADENELS-IKKKVTLMF 1801

  Fly  2011 GELSPGDRQKIMTICTIDVHSRDVVGKIIASKVDNSLAFQWQSQLR--HRWDDDQAGSSSGRAST 2073
            .||               :|.::.||.:..:..:|   :.|..:::  :|.|.|           
pombe  1802 NEL---------------LHFKETVGLLCKNSFNN---YFWSREVKAFYREDHD----------- 1837

  Fly  2074 AISCGGGDEDCFANICDAEFRYAYEYLGNTSRLVITPLTDRCYITLTQSLRLRLAGATAGPAGTG 2138
                   ||.....:...||.||:||......:|.|.||..|:..|..|:...|.|:..||||||
pombe  1838 -------DEAVVIKMFSLEFIYAFEYSELDDPIVYTDLTRNCFSVLLHSIASNLGGSPIGPAGTG 1895

  Fly  2139 KTETTKDLGRALGVMVYVFNCSEQMDYKSCGNIYKGLAQTGAWGCFDEFNRICVEVLSVVAVQVK 2203
            ||||.|.:...||..|:||||....:||:...|..||||.|.:.|||||||:....||.::..::
pombe  1896 KTETVKAVSAYLGKNVFVFNCDNAFNYKTIQRILSGLAQIGTYICFDEFNRLDSGTLSAISYDIQ 1960

  Fly  2204 TIQEAIKMHKTQFIFMGERISLEP----SVGIFITMNPGYAGRTELPENLKTLFRPCAMIVPDFA 2264
            .||..:. |       .:.:...|    :..||:||||||.||.:||.|||.||||..|..||..
pombe  1961 RIQSLVS-H-------SDGLCQSPILLDAPTIFVTMNPGYLGRFKLPSNLKKLFRPIWMGSPDNK 2017

  Fly  2265 LICEIMLMAEGFQDARLLARKFITLYTLCKELLSKQDHYDWGLRAIKSVLVVA----GTLKRDDH 2325
            .||||:.::.||:::.||::...:.:..|...||...|||:||||:|.|:..|    |.||:.:.
pombe  2018 KICEILFLSFGFKESSLLSQVLDSFFLCCSGSLSNCLHYDFGLRAMKVVIKAAKRIKGFLKKKNT 2082

  Fly  2326 SRPEDQVLMRALRDFNIPKIVTEDVPIFMGLIGDL--FPALDVPRKRVF----EFEKTIRRAVNE 2384
            ...|.::|..|:|:...|.::.:|:|:|.......  |||:   :...|    .||..|.:.:::
pombe  2083 ICQELEILWYAIREVLYPSLIYQDIPLFFKAEESYFNFPAV---KANAFIDPDNFEVNIEQTLSK 2144

  Fly  2385 IKLQPEEGFLMKVVQLQELLDVRHSVFIVGNAGTGKTKIWQTLRETYRIQKLKPVCHVLNPKALS 2449
            ......:...:|::||.::.:..:.:.::|..|:||::|::.|:.......:..:.:|::||||:
pombe  2145 NFFGNNQYLKLKIMQLYQMSEAYNGIILLGKTGSGKSQIFRILQSALLNIGIDCIVYVISPKALT 2209

  Fly  2450 NDELFGIVNPTTREWKDGLFSSIMREQANMPPGNPKWIVLDGDIDPMWIESLNTLMDDNKILTLA 2514
            .:.|||.:|..||||.||:|:.::|:..:.........|.|.::.|.|:|::|:|:||||.|||:
pombe  2210 KESLFGSMNMDTREWTDGVFTKLLRKTRDSCYYKRYMFVFDDELSPEWVEAMNSLLDDNKTLTLS 2274

  Fly  2515 SNERISLKREMRLLFEVGHLKAATPATVSRAGILYINPQD---------------------LGWS 2558
            :.|||:|:..:::.||...:.:.|.||:||.|::.|:..|                     ||.|
pombe  2275 NGERIALQPYVKIFFEADSVASLTRATISRCGLICISNIDDNILSSTDKMLSFTSGATNYPLGSS 2339

  Fly  2559 ------------------PYVSSWLETRVDMIERGILNALFEKYFP---CLMQRQRDFRRITPIT 2602
                              ..:||..:..||:  :.|:|...:::|.   .|:.:.:.|.|.:.||
pombe  2340 NDEFSTVFSKVLTDEVMMNLISSCYKFSVDL--QHIMNFTKQRFFTTFYSLLDQTKLFTRSSNIT 2402

  Fly  2603 DMAMIQMTCHLLE----------CLLDSDEGNADGRGRGSATGGAANPHSLHHGELSHEAMVMAL 2657
            :....:..|:.|:          |..|:|   |..|.|                           
pombe  2403 ESLSFKELCNYLKKKICYILAWCCTGDTD---AKSRER--------------------------- 2437

  Fly  2658 ETIFVYATVWSFGSALSQDVIIDWHREFHKWWIGEFKDIKLPSQGTVFDYQLNVQTLKFQPWSEL 2722
                  .|.|     |.|:..:|         :.|.||.:..|   :.|:.::::|   |.|..:
pombe  2438 ------FTHW-----LMQNASVD---------LPEIKDFEHVS---ILDFDVSLET---QSWYPI 2476

  Fly  2723 AAHQSLEGQIDSETPLQ---NVLISTAETIRLAYFLKLLIDRNLACMLVGNSGCGKGAIFRQLFG 2784
            |      |:....:.|:   |.:|.|.:|:|.|.||...:.:|...:..|..|.||..:   :.|
pombe  2477 A------GKTLKSSALKYAGNTVIPTLDTVRYAEFLNFSLTKNRCVIFCGPPGSGKSML---MLG 2532

  Fly  2785 QYANDQELLEVAVSAATAGDSSHQQQSGNPAGAVVVRRKASSSATPLLTTVQATHFNFYTSSEIF 2849
            ...:.|::..:|::.:                               ::|...:..:|...|.::
pombe  2533 TLRSRQDVEVIALNFS-------------------------------ISTSSKSVVSFLEQSTVY 2566

  Fly  2850 QKMLDRPLEKKSGRCYAPSGPKRRLIYFVNDLNMPEVDAYGTVQPHTIMRQFMDYRQ-WY--DRQ 2911
            .:.....:       ..|...::.|:.|.:::|:|.............:|..::::. |:  .::
pombe  2567 YRSTGMTI-------MCPKNHEKVLVLFCDEINLPRSRNCLAEDVICFLRHMLEHQGFWHPLHKE 2624

  Fly  2912 RLQLKDIRHCQFAACMNPTA--GSFTIDPRLQRHFCVFSVAPPGEDTLHHIYGSILSSHLESPSQ 2974
            .:.:|:|..|  .|| ||:.  |......|..|...:..|..|...:|..||.::|.      ..
pombe  2625 WVTIKNIFVC--GAC-NPSTDIGRNDFPERFLRRTVLIFVDYPESYSLVTIYNALLE------KS 2680

  Fly  2975 GFTKEIRSIGSLLVRVGIALHRRVEYAFLPTALKFHYLFNLRDLTGIYQGLMNSVGAPASAGGGG 3039
            ....:.::|...:|:..:..::.:...|..:..  .|::..||||.......|...:.|....  
pombe  2681 ALINQYKTIILNIVKASVKFYQVLRENFKSSTQ--GYVYTPRDLTRWLISFKNYAESYAETNN-- 2741

  Fly  3040 ASGFGGTICSRPSELMRLYVHEAFRVYHDRLVDPYDIKSFKSSIRDIFKKDFEDFDEDFVFAEPL 3104
                        ..|::::.|||.||..||||...:.....:.::.:...||.:|:...:|.:.:
pombe  2742 ------------LSLIKVWYHEACRVLLDRLVSQKECSWGMTELQKVIVTDFGEFEVSVIFEKQI 2794

  Fly  3105 IYSHFAQSLVDQKYMPLKS----WDSLYQLLIEAQASYNEVVGYMNLVLFEDAMIHVCRINRILE 3165
            |::...::.::  ::...|    .:|||:....:..:       ..||..::.:.|:.|.:|||.
pombe  2795 IFTDILKNGLE--FLDFASLRPKLESLYKKFYSSHPN-------NTLVFVDETITHILRFHRILN 2850

  Fly  3166 SPRGNALLIGVGGSGKQTLARLAAFISSLNVSQIQIKRGFGLLDMREEIGNLYMKVGLKNLASVF 3230
            :...:|||.|..|.|::.:.....:::|.::.::|..:.:.:.|..:.:.::.:..|..|..:..
pombe  2851 NSGMHALLQGSVGLGQKAVVEFVCWLNSFSLFELQKNQTYSIEDFEDNLKSILILAGTTNCKACL 2915

  Fly  3231 LISDAQIPDESILMLINDLLASGEIPELFNDDQLDTITNGIR--NEVKQSGTLDTKENCWRYFVE 3293
            .|:::.......|.|:|:||.:.|:...|:.:....|...:.  ||. |....|::|:....|:.
pombe  2916 AINESIAGVPGFLDLLNNLLTNSEVSNFFDQNDWAEIKKNLNKLNEF-QPLKFDSEESVTEIFMN 2979

  Fly  3294 KV-RRLLKVVLCFSPVGQTLRVRARKFPAIISRTAIDWFHEWPKSALESVSQKFLNE---INGI- 3353
            .| :.|..|...::......:..:.. ||:::|..||::|.|...::..::.:.|.|   :|.: 
pombe  2980 NVFQNLCVVFYVYTSADVDFQTNSLS-PALLNRCTIDYYHSWDYHSMLQIANEVLQETISLNALD 3043

  Fly  3354 -LEPAL--VPPIGCFMAYVHGTVNQISRIYLQNEKRYNYTTPKTFLEYI-FLYRKLLV---DKNG 3411
             ..|.|  :.....:.|.....||..:.| :...|....|:..:.|.:| ||....|:   |.| 
pombe  3044 HDNPNLKNIKGSSIYDAVAQAVVNTHTSI-VWEFKHLGKTSYFSCLHFIRFLNTFCLIFGRDAN- 3106

  Fly  3412 EFAERIARLQSGMSKLAECARQVDTLKHQLAIQEVQLAAKNAAA-DKLIVIV----SAESEKVKR 3471
            :.::..:|:::|..|:.|.::.:|..|..|:.|:..|.:|...| |:|..|:    :.|::||..
pombe  3107 KLSKEKSRIENGFKKIKETSQGIDKFKEALSDQQNVLFSKTKTANDRLQCIIQTKQAVEAKKVYS 3171

  Fly  3472 ERYIASEEEKRVRIIEEDVSIKTKMCEEDLRQAEPALVAAQAALNTLNKNNLTELKSFGSPPKAV 3536
            .:..||.::|...:.|:..|:.     :::..|:||::.|:.:::.:.|.:|.||:|...||.|:
pombe  3172 LQAEASLQKKSFLLNEKKNSVM-----KEVSYAKPAVIEARKSVSDIKKAHLIELRSLSRPPMAI 3231

  Fly  3537 VNVCAAVMVLLASNGKIPRDRSWKASKLMMVRVDQFLNDLLNYNKD-----NIHPNIIETLQEYL 3596
            ......|..||..:.     ..||..:.::.| |.|:..:||||.:     |:...|   .|:|.
pombe  3232 RITMEVVCKLLGFSA-----TDWKNVQQLLKR-DDFIPKILNYNLEKELSINLRRKI---EQDYF 3287

  Fly  3597 KDPEFNPDKVVQKSVAAAGLCAWVINLHRYHQVFLIVGPKQQALQDSHQELLEARERLQYLKAKI 3661
            .:|.|..|.|.:.|.|...|..|:.::..|.:|...:.|....:.....|...|.|.:|...|..
pombe  3288 SNPIFTFDSVNRASKACGPLLLWIKSICNYSKVLEKLEPLNSEVDRLKLEQKNAEECIQETIAAC 3352

  Fly  3662 NNLEAKLAEIQAEFENAVGEKQRCQREADKTAFTIDLAHRLVNGLANENVRWKESVQSLLAKIGT 3726
            .:|:.||.::|.|:.:.:.|....:.:.|:....:..:..::..|:.|...|...:.....::..
pombe  3353 KDLDEKLLQLQEEYASMISEIHSMELQMDEVKCKMQRSIEVITDLSIERNEWSGFLNLYPKRMWN 3417

  Fly  3727 LPGDILLISSFLSYVGCFTRRYREELQHKMWLPNFRKIDPHIPHTEGVDTLALFSDDAQIAAWNN 3791
            |.|:.|:.:||:.|.|......|      ::|.|  |.:|.|                     ::
pombe  3418 LVGESLMEASFVVYAGNLDPSMR------IFLRN--KCEPII---------------------SS 3453

  Fly  3792 EGLPMDR-------------------------MSTENATILQYSTRWPLMIDPQLQGIKWIKNRF 3831
            .|.|:.:                         .|.||..|:|.:....|:|||..|.:..:.:.:
pombe  3454 FGFPISKSAVRTNIERCVQTSIESKYYKNLTDYSLENIYIIQENKSPLLIIDPSSQILDILPSLY 3518

  Fly  3832 ---GTDLVVLRLRQKGFLEALEKSISQGDTVLIEQIEESMDTVLEPLLSRALIKKGRYLRIGDKE 3893
               .:||:  ....|.|...::.::..|..::|:. .|..|..:||||.....       .|..|
pombe  3519 KGKASDLI--SFSNKSFQNQIKLALLSGSAIIIKD-AELWDVSIEPLLKPEFF-------TGSGE 3573

  Fly  3894 IEFHASFRLILHTKMANPHYKPEMQAQ---------TTLINFTVTPDGLEEQLLAEVVKIERPDL 3949
            ::...:...|..|...|..:..|:|:.         ..::|||::...||.|:|..|:.::.|.:
pombe  3574 VQTTFAKDTITITLPLNIIFFSEVQSNELENKASKFMNVVNFTLSISLLETQMLKSVISVQEPGV 3638

  Fly  3950 EQMKTEVTVQQNKFKISLKALEDELLARLASSGENVLDDHALVINLENTKRTVDEIEAKVREARV 4014
            .:.|......:...:..:::|:::||..|.||.||::....:|:.|:|.|...:.|.....|::.
pombe  3639 FKQKDNCFTLKLSIERQIRSLQEQLLKTLCSSNENIVGTDEIVVLLKNLKEKHETIRLAYSESQS 3703

  Fly  4015 TTLQIDDTRNIYRSAAKRAAILYFVLTDLSRINPIYKFSLKSFMNVFRQAIAMAAESKN--YEKR 4077
            ...::|:....|:.:.|....:..|......:...|.||.....:.|.|.:.:..|::|  ::..
pombe  3704 INRKVDELIRRYKLSIKSFLSVVVVFQHFISLKKSYSFSFNFIWSTFHQMLNVVLENRNQDFKSL 3768

  Fly  4078 VLHLVESITLQTYRYTLRGLFEADKLTFTSHMTLRILIAAEQVAKDETDFLLR---FPHDPTTLS 4139
            ::..:..:..:.:.|    :|..|::.|.                    |||.   ||.:..:|.
pombe  3769 IMDALRDLIRRCFLY----IFPEDRVLFL--------------------FLLMFFFFPKETESLR 3809

  Fly  4140 PLDFVGRSAWGGIKSLTLIEHFYGIDKDMENYTKRW---RKFMASDTPEREQFPGEWKHRTPLQK 4201
            .|..|..      |:|.|.:.:....:...:..:|.   ..|..:.....:.|..|....|..::
pombe  3810 KLLIVNG------KTLELEQSYLNFFETCSDSNERGGLESLFFKTHASNIQNFCTEVLANTHCEE 3868

  Fly  4202 LCIIRSLRPDRMTYAMRQFVEQTMGRSYAEIQTPPFGAIFQELNAATPAFFILSPGVDPIRDVER 4266
            .|:  .|..|..:.|.:  ||      ::.|:......|..|..:..|....|..          
pombe  3869 DCL--KLLYDLWSSAFK--VE------FSNIKYDFLKIINDESESRMPTIVYLME---------- 3913

  Fly  4267 YGQRQGFHSESDTL------------VNISLGQGQ-ELLAEQAIIGALESGQQ-WVILQNIHLVV 4317
                   :.|.|:|            :.:|||..: |.||:..:  .|.|.:. |:.:.||||..
pombe  3914 -------NCEIDSLLQNAKIPQNIKKLTVSLGSAENESLADSYL--KLASTEPLWLFINNIHLST 3969

  Fly  4318 NWLPTLEKLIERIVLQSESKGESNFRLFISAEPAPDPQYHVIPQGILESSLKVVNEPPSGMAANL 4382
            .|       .|::..:..:....|.|:...:|     .::.:|..:|..|..:|....:....||
pombe  3970 PW-------AEKLPSKMSNHLHKNSRIVCLSE-----IHNQLPHQLLCISRSIVFNKQTSFKNNL 4022

  Fly  4383 HKAWDNFSQDALETCTQ---EAEFKSILFALCYFHAVAGERRKFGPQGWNKVYPFNIGDLTISSN 4444
            ...     .:.|.|.|.   ...|: :.|.|.:.||...|...|....|.:...|:..|....:.
pombe  4023 LNL-----LELLPTMTHTLPHNRFR-LFFFLSWLHATLAEIYCFTCSSWKEPCYFDDSDFYFGTK 4081

  Fly  4445 VLHNYLEGS---NRIPWEDLRYLFGEIMYGGHITDDWD--------RRLCQTYLEELLQQDLIDG 4498
            :|.|.|..:   ....|...:.|...::||..::...|        :||...:..::....|:..
pombe  4082 ILCNILYRNVHLEEFSWGTFKDLLLNVVYGPKVSASSDFIALDKILKRLIAQFKTQISSNILLTD 4146

  Fly  4499 DFELCPGFPAPPNLDFEGYHSYITEMLPEESP 4530
            :|:    |..|..:.|......|.: ||:|.|
pombe  4147 NFK----FILPYEITFSSAKEVIGQ-LPDEIP 4173

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
CG3339NP_001036762.2 DHC_N1 279..903 CDD:462457 122/692 (18%)
DHC_N2 1532..1943 CDD:462462 98/414 (24%)
DYN1 1759..4514 CDD:227570 658/2951 (22%)
AAA_6 2095..2421 CDD:463697 119/339 (35%)
MT 3419..3759 CDD:463699 84/349 (24%)
Dynein_C 4545..4840 CDD:465677
dhc1NP_001342921.1 DHC_N1 252..818 CDD:462457 126/707 (18%)
DHC_N2 1320..1718 CDD:462462 101/447 (23%)
DYN1 <1605..4196 CDD:227570 647/2904 (22%)
Blue background indicates that the domain is not in the aligned region.

Return to query results.
Submit another query.