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Protein Alignment CG3339 and dnah5l

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_001036762.2 Gene:CG3339 / 43295 FlyBaseID:FBgn0039510 Length:4842 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:XP_002666734.3 Gene:dnah5l / 335340 ZFINID:ZDB-GENE-091204-287 Length:4667 Species:Danio rerio


Alignment Length:5092 Identity:1399/5092 - (27%)
Similarity:2382/5092 - (46%) Gaps:785/5092 - (15%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly    12 EEGLPAG-------STSGRQRVQRDYSDARLERVAAYTTTTMRLKPDKWTKMMACDDLRRIVVEW 69
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Zfish    93 EHALPTAVPAPVQTAISGKRSVILS-NEAQQERVKL---------------VRAFKDERRAALDS 141

  Fly    70 QHGHRRVLVMTLSPGGDL----VPRSCLSD--LYLPYSVQSARGSIPSAML---PAEDEAMATVT 125
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Zfish   142 RH---RYLISVIAEAISLADMEVEEAIIADDKFYMIEEFFSANGS-KSLMLFYQATESSNSGNDT 202

  Fly   126 AAVSA------VVSATPGALLIPLPPASSSFTTLDGVPRGKCAYFVRRNTSDGPLTASNFAESVL 184
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Zfish   203 SNVAKGQKKLFITSGDHEAL------------------TGQCLFFLR--ITDKAITTTNISQEVN 247

  Fly   185 YG--DFPVHSKIETMSLLFDDVLQPLLEQAQSQWPAIVRKDLQARIKEVRNTLTEIKGKTNNRTI 247
            :|  |....|.:..:..|...|:...| ::|..|.||  ||.|.. .:|:|.|..:...|  .|:
Zfish   248 FGMLDCSESSILHNLEFLLTQVMNQAL-KSQEDWGAI--KDGQMN-PDVQNFLRSVDKFT--FTL 306

  Fly   248 LSLLVSPTIVEEVFA--HVSQ----GHLRPALDPKFR-------NLLEEMFINWTTQMHDIVLE- 298
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Zfish   307 SSVMRN---MEEKFKLHHIPSAPDLSHIQKPEDYSYAANNSELVEDLEAVLVYWAKQIEQVLTES 368

  Fly   299 ---RSECQPLGSTTQSAGHQPKYITLVSLPAQEIGFWTNRKLNLQNIYEQLRESTHKTLAQILER 360
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Zfish   369 ERIRRESDDIG------------------PSAELAHWKRRMITFCSLMDEIKDPYVKKIIGILHA 415

  Fly   361 IESVYYEPYATAFRKLVAAWLEAQDVSLWLQPLLRQTAAFNSVQFSNGHDL---VAPLVHIVHLV 422
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Zfish   416 AKSKTMSKWKELDASITIVANEAKDNVKYLSTL---DKFFELLEKSTPTSMLKHIPKLMNSIHMI 477

  Fly   423 WSNARYYRSTQRMSVLLRCICNMLVHRAAEDLELQLLFQG-------DADEGLLKINRTIAVLEL 480
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Zfish   478 HRVSQFYNTSEHMTSLFVKVTNQMVTTSK-----AYLCQGVTKVWELDRKELLKRMKECIELNQE 537

  Fly   481 FKQRMLDYKERYAGSQVLLPALSEGAAAVASSPSPDDQQQLWRFCHEDVFGQTLDGFSLQLLELR 545
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Zfish   538 YQQCFRQMKEK-----------------IQQNP---HERQL-ELSENYIFGK-FDTFCKRLEKIT 580

  Fly   546 QVFEAAVQFQQLEKLEVGGLRGKILTERVREIFGEFKVLFEQWSNVDIDLTATVASKWKC----- 605
            .:......|..|:.::..|         |.:|:..::           ::.:|:.||...     
Zfish   581 DMATTLEDFSVLQFMKFEG---------VEKIYMRYQ-----------NIVSTIKSKTYNVLDHR 625

  Fly   606 ---FRREQTLFFSRMQLLEQKLATVLLQAFEQCHSWMHLLRLTLMFGSLLQREAVRPELARVLPH 667
               |..:...|.:::|:|.|.:..::       .:|             |||.....::..:|  
Zfish   626 KLEFDNDYIEFRNQIQVLYQSVDALI-------DTW-------------LQRPLTTEQVLELL-- 668

  Fly   668 ILFIYDTEMEQLEDSVGE----------VLLGYE-----IRGLAALPLAN---NFPPIANAMMWL 714
                     .:.|:.||.          ||..||     :|........|   ...|:|..:.| 
Zfish   669 ---------SRFENGVGRQMDLNQKYMVVLQRYECDLEFVRKCYQKEKDNPVSQLTPLAGKIEW- 723

  Fly   715 EQHISRCDEFGAKELSQLVE---QLLKEKSELQTLPIQWNSLLSRRNILTTKLSNLQMKIWISWH 776
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Zfish   724 -----------SKHLFKKIELPMQILKDKLDILQMPDR-RKIIRSYNRLAAVLLEYEMIHQKAWV 776

  Fly   777 ECVDKLIIQGLDESVLSRSQDLSQLHLNFSQVLFTLLKETKYLLALQATGSLSGDLFQLPEPLLT 841
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Zfish   777 EGVE-LGLSGLNASLLTRHPTTKEFYVNLDPLVLEVLQEANNMYKL---GAL------VPDGIHD 831

  Fly   842 LYGHRDAYWERRIRL-IKIGEFYNGIRS--GECAAAELQLIRNDLASIDEHVEVACQQLTWRNYN 903
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Zfish   832 MAAKEPQLKEYRYKLQMMLKEFHAVVKKIPGVLKSPMKPFIR----SVETALSPGLTILSWTSLN 892

  Fly   904 DELVAGIFEQSRDLFARLQQSHGNLDAILASMRRWSREPLHQRSLYGRNLLDLR--HQ-QDRVRL 965
            .:...|.      ::..||:    |:.:|..:               .::||.|  |. :.....
Zfish   893 IDYFIGC------VYKALQE----LEQVLKVV---------------TDILDCRINHTLESMCST 932

  Fly   966 RLLQCDETKMLLNRLLIANFCLFFNYESQEFQLYSRDLSVQEFIREFPEEQRRQYNKYLASVDEL 1030
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Zfish   933 TLLTLPENEPVTPEMFLTHTAATISTERETLKVASQ--QVERSMLEIAEELNRM----------- 984

  Fly  1031 ICREVREAMRISLEYL------YKEMT-----------------------ATATATTTPTAPPVD 1066
                ::.:.|::|:..      .|:||                       |..|||.:..     
Zfish   985 ----LKPSERVNLKKCSCLHPDAKQMTRCLQCLPCAFYIMMGQLCQRNTEALVTATKSSL----- 1040

  Fly  1067 PGCSAGMARLVLQQITTPQATSTAGAGASGAPPTANDAPLFEVKLELTETEIRFSPAFD--ASVE 1129
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Zfish  1041 ----NALHRRLLAASSSYRSSSPSGA--------TIQVPLFRVSVELAIPNIVFRPSFEHIQGIL 1093

  Fly  1130 NNFQQIVEQLLLDI--------KQTCDCMPRIVADNAPSEDDEDDDTATVDYEQELRWEPREDRA 1186
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Zfish  1094 NKGVNMVLSMAKDIPLWNYFHLQQ-----DQLQAEQVAAREHGDETVVS---------KPILLRS 1144

  Fly  1187 QELQERKKKDLELEQEQGDPKPQAVQFNLLAAAKAYSQKMECTADGLEMLERAIRDALADTVAAA 1251
            .:....:.||:.....|..|        |:::.|         ||..::||              
Zfish  1145 LDRHVTEHKDVNKSLSQLVP--------LVSSLK---------ADAGDILE-------------- 1178

  Fly  1252 SAYAAKFQAYAFLWTQQSSEVLAACMQTAREQTHHVSAGGYAIMETFKKEIENYNEVHDAIDQCE 1316
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Zfish  1179 -----DLSQFSALWNQDPAEQVKAFLQT------------NPILADFSTQLSLYSAYETQIHELP 1226

  Fly  1317 NRECINGWLALDIKPLKYGLLNLACKWSHMCKKWLLRYVQGTLKELNAFIARGFETLQLHIARQD 1381
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Zfish  1227 -QTCTVGPILFETESLKMSLIQECHTWKREFGAALNQQASAGMTEISSFVDGVNRQLQRPIS--D 1288

  Fly  1382 FATLLRVLAIMSEIREREPYADNVFKPLKEIMGLLKTYNVEFEPQLLRGIEQLPQQWQQLKHSST 1446
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Zfish  1289 LDDVRESMGALRELREEEIRIETIMGPVEESFALLNRHDLFFNDGNAERIDGVVYAWKELKVMAK 1353

  Fly  1447 VKQEALQDTRFHQQQRVTA----------------------LIGL----HTCHLQHYARQFQKM- 1484
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Zfish  1354 ETQKKLSDVEPHMKAELIAGVEVFQKSVESFYGDYDNSGPGVTGLPPREASDRLQVYQAKFDELW 1418

  Fly  1485 ----------PFFRVPCPQVYDVCDEVYLRLHRFRRQQRLYTRWARLLDIQPPDPATLQFCEVEL 1539
                      ..|.:|..:        |..|||.:|                           ||
Zfish  1419 RKYVTFSSGEELFGLPVGE--------YPDLHRIKR---------------------------EL 1448

  Fly  1540 RRVKQLWDFVRVIESCIVAWHATPWLLIDTDDMEHECKKFTRDLRTLDKCIREWAPYVHIVGVLR 1604
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Zfish  1449 NLLSKLYSLYNSVIDSVSGYYDILWADLNIEKINNELLDFQNRIRKLPAALKEWQAFNDLKKTID 1513

  Fly  1605 ELVASLRAITELQNPAITERHWMELMQLTKLSYKCN-KSTRLAQLLTLQLQHHEEDIKNTVDRAI 1668
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Zfish  1514 DFNETCPLLYMMANKAMMARHWERITDLTKHKFEVEAPNFSLRNVMEAPLLKCKEDIEDVCISAV 1578

  Fly  1669 KEMTVTKVLDEIKATWAHLEFELEQHHTRPHIQLLKVSE--ELIETLDDNQMQLQNISTSKHIEY 1731
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Zfish  1579 KERDIEAKLKDVVTEWSGHQFTFATFRNRGEL-LLKGSDTSEKVALMEDSLMVLGSLMSNRYNAP 1642

  Fly  1732 LLDKLTHWQKVLGGIDTLIVNWFEVQRKWIYLECIFIGSADIRAQLPADAANFERIDEDFTALLA 1796
            ....:..|.:.|.....:|..|..||..|:|||.:|:| .||..|||.:|..|:.||:.:..::.
Zfish  1643 FKPTIQQWVQKLSNSSEVIEKWLTVQNLWLYLEAVFVG-GDIAKQLPQEAKRFQNIDKSWQRIMQ 1706

  Fly  1797 KVQEVRVVMQVVLRHDDVLAQLL-QLQHRLAVCEKALNDYLETKRLAFPRFYFISAADLLDILSN 1860
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Zfish  1707 RAHEIPGVVQCCV-GDETLQQLLPHLLEQLEVCQKSLSGYLEKKRLVFPRFFFVSDPVLLEILGQ 1770

  Fly  1861 GNNPQVIDRHLIKLFDSILRLQY-ETNTPNALGMHSKENDEYVPFVSFDPDQPAFIVCGGRVELW 1924
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Zfish  1771 ASDSHTIQAHLLNLFDNVNRVVFHEKNYDQILSFQSQEGE------TVNMSEP--INAQGNVEAW 1827

  Fly  1925 LRAIIQQMRSTLHELFRRALRVFGEKPRELWLYD--WPAQVALCCSQISWTADVNRSFGCMEEGY 1987
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Zfish  1828 LGMLLDGVKKTLHSIIRQAAMVIGDQGFKLVEFQSMFPAQVGLLGIQFIWTRDAEEALQ-QSKAD 1891

  Fly  1988 EGVMKELHKRQIAQLNALINLLLGELSPGDRQKIMTICTIDVHSRDVVGKIIASKVDNSLAFQWQ 2052
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Zfish  1892 KKIMQTTNQKFLDLLNELIDMTTHDLTKMERTKYETLITIHVHQKDIFDDLVQMNIRSPLDFEWQ 1956

  Fly  2053 SQLRHRWDDDQAGSSSGRASTAISCGGGDEDCFANICDAEFRYAYEYLGNTSRLVITPLTDRCYI 2117
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Zfish  1957 KQSRFYFIDD------------------TDRCIIQITDVEFDYCNEYLGCTDRLVITPLTDRCYI 2003

  Fly  2118 TLTQSLRLRLAGATAGPAGTGKTETTKDLGRALGVMVYVFNCSEQMDYKSCGNIYKGLAQTGAWG 2182
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Zfish  2004 TLAQALGMSMGGAPAGPAGTGKTETTKDMGRCLGKYVVVFNCSDQMDFRGLGRIYKGLAQSGAWG 2068

  Fly  2183 CFDEFNRICVEVLSVVAVQVKTIQEAIKMHKTQFIFM-GERISLEPSVGIFITMNPGYAGRTELP 2246
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Zfish  2069 CFDEFNRIELPVLSVAAQQIYIVLQCKKNKKSQFIFTDGDVVDMDKEFGIFLTMNPGYAGRQELP 2133

  Fly  2247 ENLKTLFRPCAMIVPDFALICEIMLMAEGFQDARLLARKFITLYTLCKELLSKQDHYDWGLRAIK 2311
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Zfish  2134 ENLKIQFRTVAMMVPDRAIIMRVKLASAGFRENQVLSRKFYTLYKLCEEQLSKQVHYDFGLRNIL 2198

  Fly  2312 SVLVVAGTLKRDDHSRPEDQVLMRALRDFNIPKIVTEDVPIFMGLIGDLFPALDVPRKRVFEFEK 2376
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Zfish  2199 SVLRTLGAVKRSNPTEPEKTVVMRVLRDMNLSKLVDEDEPLFMSLINDLFPGIMLDKAGYPDLEA 2263

  Fly  2377 TIRRAVNEIKLQPEEGFLMKVVQLQELLDVRHSVFIVGNAGTGKTKIWQTLRETYRIQKLKPVC- 2440
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Zfish  2264 AITKQAEEAGLIAHPPWILKLVQLYETQRVRHGMMTLGPSGTGKTTCIHTL------MKAMTDCG 2322

  Fly  2441 --HV---LNPKALSNDELFGIVNPTTREWKDGLFSSIMREQANMPPGNPKWIVLDGDIDPMWIES 2500
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Zfish  2323 NPHKEMRMNPKAITASQMFGTLDVATNDWTDGIFSTLWRKTLKSKKGEHIWIVLDGPVDAIWIEN 2387

  Fly  2501 LNTLMDDNKILTLASNERISLKREMRLLFEVGHLKAATPATVSRAGILYINPQDLGWSPYVSSWL 2565
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Zfish  2388 LNSVLDDNKTLTLANGDRIPMAPNCKVVFEPHNIDNASPATVSRNGMVFMSSSVLDWQPILQAWL 2452

  Fly  2566 ETRVDMIERGILNALFEKYFPCLMQRQRDFRRITP---ITDMAMIQMTCHLLECLLDSDEGNADG 2627
            : ::..::..:|.|.|...:..||...  |..::|   :.:...|:.|..||:.||.:.|     
Zfish  2453 K-KIPPMQADVLLAAFNSIYQDLMNFV--FTAVSPKMQLLECMYIKQTIDLLQGLLPAVE----- 2509

  Fly  2628 RGRGSATGGAANPHSLHHGELSHEAMVMALETIFVYATVWSFGSAL------SQDVIIDWHREFH 2686
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Zfish  2510 ---------EKNLNAAH------------INRLFIFAVMWSAGALMELEDRAKMEVFLKKHN--- 2550

  Fly  2687 KWWIGEFKDIKLPS-QG--TVFDYQLNVQTLKFQPWSELAAHQSLEGQIDSETPLQNVLISTAET 2748
                   ..:.||| ||  |:|::.:: .|.::..|:..........  ||.....::|:...:.
Zfish  2551 -------ARLDLPSTQGEQTIFEFLVS-STGEWDLWATRVPEYIYPK--DSVPDYASILVPNVDN 2605

  Fly  2749 IRLAYFLKLLIDRNLACMLVGNSGCGKGAIFRQLFGQYANDQELLEVAVSAATAGDSSHQQQSGN 2813
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Zfish  2606 IRTDFLMQTIMKQGKAVLLIGEQGTAKTVMIKGYTSKY--------------------------- 2643

  Fly  2814 PAGAVVVRRKASSSATPLLTTVQATHFNFYTSSEIFQKMLDRPLEKKSGRCYAPSGPKRRLIYFV 2878
                           .|.....::.:|:..|...:||:.::..::|:.|..|.|.|.|:..: ||
Zfish  2644 ---------------DPETNLSKSLNFSSATQPGMFQQTIESYIDKRMGTTYGPPGGKKMTV-FV 2692

  Fly  2879 NDLNMPEVDAYGTVQPHTIMRQFMDYRQWYDRQR---------LQLKDIRHCQFAACMNPTAGSF 2934
            :|:|||.::.:|....:.|:||.|....:|..:|         |||       .||.::|..|..
Zfish  2693 DDINMPVINEWGDQITNEIVRQLMVQGGFYSLERPGEFTTVVDLQL-------VAAMIHPGGGRN 2750

  Fly  2935 TIDPRLQRHFCVFSVAPPGEDTLHHIYGSILSSHLESPSQGFTKEIRSIGSLLVRVGIALHRRVE 2999
            .|..||:|.||||:...|...::..|:.::.|.:. ...:||.:|:.|:.:.||.....:.:.|:
Zfish  2751 DIPQRLKRQFCVFNCTLPSNSSIDKIFHTLASGYF-CVERGFPEEVCSLAAALVPTTRKVWQAVK 2814

  Fly  3000 YAFLPTALKFHYLFNLRDLTGIYQGLMNSVGAPASAGGGGASGFGGTICSRPSELMRLYVHEAFR 3064
            ...||:..||||:||||||:.|:||::.               .|..:|..|..|..|:.||..|
Zfish  2815 AKMLPSPAKFHYIFNLRDLSRIWQGILT---------------VGSEVCQTPQLLASLFRHECSR 2864

  Fly  3065 VYHDRLVDPYDIKSFKSSIRDIFKKD--------------FEDFDED---FVFAEPLIYSHFAQS 3112
            |..||.:|..|.::|...:..|..:|              |.||..|   ....||    ..|:.
Zfish  2865 VIADRFIDEKDRETFDGILERITAQDHGPSLLEQGPWQGYFVDFLRDAPEMTGEEP----EDAEE 2925

  Fly  3113 LVDQKYMPLKSWDSLYQLLIEAQASYNEVV--GYMNLVLFEDAMIHVCRINRILESPRGNALLIG 3175
            ...:.|.|:.::.:|.:.|...|..|||.|  ..|:||.|||||||:.:|:||:.:.||||||:|
Zfish  2926 ETPKVYEPIPTFKALSERLSMFQEQYNEAVRGAAMDLVFFEDAMIHLMKISRIIRTARGNALLVG 2990

  Fly  3176 VGGSGKQTLARLAAFISSLNVSQIQIKRGFGLLDMREEIGNLYMKVGLKNLASVFLISDAQIPDE 3240
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Zfish  2991 VGGSGKQSLTRLASFIAGYQSFQITLTRTYNVSNLIEDLKALYRIAGLEGKGVTFIFTDNDIKDE 3055

  Fly  3241 SILMLINDLLASGEIPELFNDDQLDTITNGIRNEVKQS-----GTLDTKENCWRYFVEKVRRLLK 3300
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Zfish  3056 AFLEYMNNVLASGEVSNLFARDEVDEITQSLIPAMKKDLPRCPPTID---NLYNYFLSRVRSNLH 3117

  Fly  3301 VVLCFSPVGQTLRVRARKFPAIISRTAIDWFHEWPKSALESVSQKFLN----EINGILEPALVPP 3361
            |.|||||||:.||.||.|||.:||...:|||..||:.||.:|:|.||:    ..:..::.::|..
Zfish  3118 VALCFSPVGEKLRSRALKFPGLISGCTVDWFQRWPRDALVAVAQHFLSNYSLRCSDEVKRSVVQT 3182

  Fly  3362 IGCFMAYVHGTVNQISRIYLQNEKRYNYTTPKTFLEYIFLYRKLLVDKNGEFAERIARLQSGMSK 3426
            :|.|    ...|.:|...|.|..:|..|.|||::|.:|..|:.:..:|.........|:.:|:.:
Zfish  3183 MGTF----QDMVAEICTEYFQRFRRQTYVTPKSYLTFIKGYQMIYTEKIENVGVLAERMNTGLER 3243

  Fly  3427 LAECARQVDTLKHQLAIQEVQLAAKNAAADKLIVIVSAE---SEKVKRERYIASEEEKRVRIIEE 3488
            |.|....|:.|:.:|..:|..|......|.::::.|:|:   :||||.:  :...::|...|::|
Zfish  3244 LMEAELSVNELRVELREKEKVLEVAKQKAGEVLLEVTAKAQAAEKVKAQ--VQKVKDKAQAIVDE 3306

  Fly  3489 DVSIKTKMCEEDLRQAEPALVAAQAALNTLNKNNLTELKSFGSPPKAVVNVCAAVMVLL---ASN 3550
             :....|:.|..|..|:|||.|::|||.|:...::..::..|.||..::.:...|::|.   ...
Zfish  3307 -IEGDKKVAESKLEAAKPALEASEAALKTIKPADIATVRKLGKPPHLIMRIMDCVLLLFQRRVDG 3370

  Fly  3551 GKIPRDR-----SW-KASKLMMVRVDQFLNDLLNYNKDNIHPNIIETLQEYLKDPEFNPDKVVQK 3609
            ..:..:|     || :|.|||  ....||:.|||:|||.|...::|.|..||...::|.:...:.
Zfish  3371 VTMDPERPCVKPSWGEALKLM--NNSGFLSMLLNFNKDTITEEVVELLSPYLAMEDYNLETAKRT 3433

  Fly  3610 SVAAAGLCAWVINLHRYHQVFLIVGPKQQALQDSHQELLEARERLQYLKAKINNLEAKLAEIQAE 3674
            ....||||:|...:..:..:...|.|.:..|:.....|..|::.|...:.:::..:.:|.:.||.
Zfish  3434 CGNVAGLCSWTEAMVEFFGINKEVLPLKANLKLQEARLTVAQDELSRAQEQLDAKQKELDDAQAM 3498

  Fly  3675 FENAVGEKQRCQREADKTAFTIDLAHRLVNGLANENVRWKESVQSLLAKIGTLPGDILLISSFLS 3739
            ::.|:.|||....:|:.....:..|..|::||..|.:||.||......:|..:.||:||.:.|||
Zfish  3499 YDAAMKEKQDLLDDAEACKKKMSNAVALIDGLGGEKIRWTESSAQFERQIKDMVGDVLLATGFLS 3563

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Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

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