DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment CG3339 and Dnah2

DIOPT Version :9

Sequence 1:NP_001036762.2 Gene:CG3339 / 43295 FlyBaseID:FBgn0039510 Length:4842 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:XP_008766120.1 Gene:Dnah2 / 303242 RGDID:1565087 Length:4508 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:4889 Identity:1446/4889 - (29%)
Similarity:2356/4889 - (48%) Gaps:653/4889 - (13%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly   116 AEDEAMATVTAAVSAVVSATPGALLIPLPPASSSFTTLDGVP---RGKCAYFVRRNTSDGPLTAS 177
            |:|.::..:|..|..|.     .|.:.|           |:|   :.:..||:|:  :..|:|..
  Rat   105 AQDPSVPVLTIFVDPVF-----GLKLEL-----------GMPVQTQNQIVYFIRQ--APVPITPE 151

  Fly   178 NFAESVLYGDFPVHSKIETMSLLFDDVLQPLLEQAQSQWPAIVRKDLQARIKEVRNTLTEIKGKT 242
            ||.|:|.||... .:.|..:..|...|..|.:...:| ||..:|....:.:.....:||:.:.|.
  Rat   152 NFEETVQYGTVR-GAYIPALLRLLSGVYVPQIFMNKS-WPESIRNHFVSHLHRFLASLTDTRYKL 214

  Fly   243 NNRTIL-----SLLVSPTIVEEVFAHVSQGHLRPALDPKFRNLLEEMFINWTTQMHDIVLERSEC 302
            ...|:|     ::.:.|.:|.:              |.:....||...|:||.|:.:::    ..
  Rat   215 EGHTVLYIPAEAITMDPAVVIK--------------DKELVQRLETSMIHWTRQIKEVL----SA 261

  Fly   303 QPLGSTTQSAGHQPKYITLVSLPAQEIGFWTNRKLNLQNIYEQLRESTHKTLAQILERIESVYYE 367
            |....|.::.|           |.:||.||.||.::|..|.:||.:...|.:..||...:|.|..
  Rat   262 QESVDTGENLG-----------PLEEIEFWNNRCMDLSGISKQLVKQGVKHIESILLLAKSSYLA 315

  Fly   368 PYATAFRKLVAAWLEAQDVS------LWLQPLLRQTAAFNSVQFSNGHDL---VAPLVHIVHLVW 423
            |    ||||..   :.||.|      |....:||:  .:..:.|....|:   :..|:.::.::|
  Rat   316 P----FRKLAQ---QIQDGSRQAQSNLTFLSILRE--PYQELAFMKPKDISDKLPKLISLIRIIW 371

  Fly   424 SNARYYRSTQRMSVLLRCICNMLVHRAAEDLELQLLFQGDADEGLLKINRTIAVLELFKQRMLDY 488
            .|:.:|.:.:|::.|.|.:.|.::......:.|..:|:|........:...|:....       :
  Rat   372 VNSPHYNTRERLTGLFRKMSNEIIRLCCHSVSLDRIFEGYVSSSKEDLQGCISCCHA-------W 429

  Fly   489 KERYAGSQVLLPALSEGAAAVASSPSPDDQQQLWRFCHEDVFGQTLDGFSLQLLELRQVFEAAVQ 553
            ||.|..:..:....|...               |......:|.| :|.|..:..:|.:|.:....
  Rat   430 KEHYLRAVQMHTQFSNRG---------------WVLDQTSIFAQ-VDAFVQRCKDLIEVCDCQYH 478

  Fly   554 FQQLEKLEVG------GLRGKILTERVREIFGEFKVLFEQWSNVDIDLTATVASKWKCFRREQTL 612
            |.:......|      |.:|..:|..:.||...|....:....|...:.....:.|   ..:...
  Rat   479 FARWLDGTQGPLPCFFGAQGPQITRNLLEIEDIFHKNLQTLRAVRGGILDVKNTSW---HEDYNK 540

  Fly   613 FFSRMQLLEQKLATVLLQAFEQCHSWMHLLRLTLMFGSLLQREAVRPELARVLPHILFIYDTEME 677
            |.:.::.||.....::..|||......|.:.|...|..|..|||:.....:....:..::::|: 
  Rat   541 FRAGIKDLEVMTQNLITSAFELVRDVEHGVLLLDTFHRLANREAIMRTYEKKAVDLYMLFNSEL- 604

  Fly   678 QLEDSVGEVLLGYEIRGLAALPLANNFPPIANAMMWLEQHISRC--DEFGAKELSQLVEQLLKEK 740
                            .|....|...:|       :||.::::.  .....:.|.:.:::::...
  Rat   605 ----------------ALVNRELNKKWP-------YLEPYMAQYSGQAHWVRILRRRIDRVMNCL 646

  Fly   741 SELQTLPI--QWNSLLSRRNILTTKLSNLQMKIWISWHECVDKLIIQGLDESVLSRSQD-LSQLH 802
            |....||.  .....:.....:...:..|..|.:..|...:||..|:.||..:|..||: ...|.
  Rat   647 SGAHFLPHIGTGEETVHTYQQMVQAIDELVRKTFQEWTATLDKDCIRRLDMPLLRISQEKAGMLD 711

  Fly   803 LNFSQVLFTLLKETKYLLALQATGSLSGDLFQLPEPLLTLYGHRDAYWERRIRLIKIGEFYNGIR 867
            :||.:.|..|..|..|...|         ||:.|..::.:....:.....|..|:.:...||.| 
  Rat   712 VNFDKTLLILFVEIDYWERL---------LFETPHYVMNVADRAEDLRILRENLLLVARDYNRI- 766

  Fly   868 SGECAAAELQLIRNDLASIDEHVEVACQQLTWRNYNDELVAGIFEQSRDLFARLQQSHGNLDAIL 932
            ....:..|..|.:..:..:|:.:....::|.|......  |....:.|...:::|....:..|..
  Rat   767 IAMLSPDEQALFKERIRFLDKKIHPGLKKLNWALKGAS--AFFITECRIHASKVQMIVNDFKAST 829

  Fly   933 ASMRRWSREPLHQRSLYGRNLLDLRHQQDRVRLRLLQCDET----KMLLNRLLIANFCLFFNYES 993
            .:: .|..:.:.:        |.|.|...:...|.|:.:|.    :|.:.:.|:.......|..:
  Rat   830 LTI-GWKAQEMSE--------LLLVHITGKQVYRDLEFEEAQREHRMAVQQKLVNLHQDVINILT 885

  Fly   994 QEFQLYSRDLSVQEFIREFPEEQRRQYNKYLASVDELICREVREAMRISLEYLYKEMTATATATT 1058
            ..|:::..|         .||.| :|:..|...:|.:    :.:|:|:::::...|::.......
  Rat   886 NSFEVFKND---------GPEIQ-QQWLLYTIRLDHM----MEDALRLNVKWSLLELSKAINGDG 936

  Fly  1059 TPTAPPVDPGCSAGMARLVLQQITTPQATSTAGAGASGAPPTANDAPLFEVKLELTETEIRFSPA 1123
            ..:..|:       ...||:.|      :...|.||                      ::.|||.
  Rat   937 KTSPNPL-------FRVLVILQ------SDVQGGGA----------------------QVEFSPT 966

  Fly  1124 FD--ASVENN-----FQQI-----VEQLLLDIKQTCDCMPRIVADNAPSEDDEDDDTATVDYEQE 1176
            ..  |||.|:     |..|     :..:|...|.|.:.:..:|      |.|||           
  Rat   967 LQTLASVVNDIGSHLFSTISVFRHLPDILTKRKMTREPIHVVV------ERDED----------- 1014

  Fly  1177 LRWEPREDRAQELQERKKKDLELEQEQGDPKPQAVQFNLLAAAKAYSQKMECTADGLEMLERAIR 1241
                                                                    :..::..|.
  Rat  1015 --------------------------------------------------------IRKIQAQIS 1023

  Fly  1242 DALADTVAAASAYAAKFQAYAFLWTQQSSEVLAACMQTAREQTHHVSAGGYAIMETFKKEIENYN 1306
            ..:.:..:....|...:..|..:|.......:      .|.|..:..      :.:|..:|..|.
  Rat  1024 SGMTNNASLLQNYLKTWDMYREIWEINKDSFI------RRYQRLNPP------VSSFDADIARYT 1076

  Fly  1307 EVHDAIDQCENRECINGWLALDIKPLKYGLLNLACKWSHMCKKWLLRYVQGTLKELNAFIARGFE 1371
            ||.:.:.:.|....|. ::.||...||:.|:....:|.:.....|.....|.|.:|:.::....|
  Rat  1077 EVANNVQKEETVLNIQ-FVMLDCSHLKFSLVQHCNEWQNKFTTLLKEMAAGRLMDLHTYLKDNAE 1140

  Fly  1372 TLQLHIAR--QDFATLLRVLAIMSEIREREPYADNVFKPLKEIMGLLKTYNVEFEPQLLRGIEQL 1434
                .|:|  |....|...|.:|..::...|..:....|:.|...:|:.|.|.....:|..:|.|
  Rat  1141 ----KISRPPQTLEELGVSLQLMDTLQHDLPNLETQIPPIHEQFTILEKYEVPVPDTVLEMLESL 1201

  Fly  1435 PQQW---QQLKHSSTVKQEALQDTRFHQQQRVTALIGLHTCHLQHYARQFQKM------------ 1484
            ..:|   ||:...|.      |..:.|:::..|.||        |.|..|:|.            
  Rat  1202 NGEWLTFQQILLDSE------QMLKKHKEKFKTGLI--------HAADDFKKKAHNLLEDFELKG 1252

  Fly  1485 PF-FRVPCPQVYDVCDEVYLRLHRFRRQQRLYTRWARLLDIQPPDPATLQFCEVELRRVKQLWDF 1548
            || ..|......|...:|...|...|.::........:..|:.|....||..|.||..::|:|:.
  Rat  1253 PFTSNVGHTAALDQIAQVRAMLMAMREEESNLRSNLGIFKIEQPISKDLQNLEKELDALQQVWEI 1317

  Fly  1549 VRVIESCIVAWHATPWLLIDTDDMEHECKKFTRDLRTLDKCI--REWAPYVHIVGVLRELVASLR 1611
            .|..|.....|....:|.:.|:.||.......|.|..|.|..  |.|.........:.:...::.
  Rat  1318 TRDWEESWNQWKTGCFLTLQTEAMESMAHGLFRRLTRLAKEYKDRNWEVIETTRAKIEQFKRTMP 1382

  Fly  1612 AITELQNPAITERHWMELMQLTKLSY-KCNKSTRLAQLLTLQLQHHEEDIKNTVDRAIKEMTVTK 1675
            .|::|:|||:.||||.::.:..:..: :.::|..|.|::.|.:..|.|.|......|.||:.:..
  Rat  1383 LISDLRNPALRERHWDQVKEEIQREFDQESESFTLEQIVKLGMDQHVEKIAEISASATKELAIEV 1447

  Fly  1676 VLDEIKATWAHLEFELEQHHTRPHIQLLKVSEELIETLDDNQMQLQNISTSKHIEYLLDKLTHWQ 1740
            .|..|..||...:.::..:..:.| ..|:.:||:.:.|:|||:.|..:..|:.::.....:.||:
  Rat  1448 GLQNIAKTWDSTQLDIVPYKDKGH-HRLRGTEEVFQALEDNQVALSTMKASRFVKAFEKDVDHWE 1511

  Fly  1741 KVLGGIDTLIVNWFEVQRKWIYLECIFIGSADIRAQLPADAANFERIDEDFTALLAKVQEVRVVM 1805
            :.|..|..:|.....|||:|:|||.||:|. |||.|||.::|.|::::.::..::.::.:....:
  Rat  1512 RCLSLILEVIEMVLTVQRQWMYLENIFLGE-DIRKQLPNESALFDQVNNNWKGIMDRMNKDNNAL 1575

  Fly  1806 QVVLRHDDVLAQLLQLQHRLAVCEKALNDYLETKRLAFPRFYFISAADLLDILSNGNNPQVIDRH 1870
            :.. .:..:|..|:::...|...:|:|:.||||||..||||||:|..|||:||....||:.:..|
  Rat  1576 RST-HYPGLLETLIEMNTILEDIQKSLDMYLETKRHMFPRFYFLSNDDLLEILGQSRNPEAVQPH 1639

  Fly  1871 LIKLFDSILRLQYE-----TNTPNALGMHSKENDEYVPFVSFDPDQPAFIVCGGRVELWLRAIIQ 1930
            |.|.||:|..|:.:     ::...|:||.|.:. ||:.|:     .|  ::..|.||.||..:.:
  Rat  1640 LKKCFDNIKLLKIQKVGGSSSKWEAVGMFSGDG-EYIDFL-----HP--VLLEGAVESWLGDVER 1696

  Fly  1931 QMRSTLHELFRR---ALRVFGEKPRELWLYDWPAQVALCCSQISWTADVNRSFGCM----EEGYE 1988
            .||.||.:|.|.   ||:.|..| |:.|:.||..|:.:..|||.|||||.:   |:    |...:
  Rat  1697 AMRMTLRDLLRNCRMALKKFLNK-RDKWVKDWAGQMVITASQIQWTADVTK---CLMTAKERSDK 1757

  Fly  1989 GVMKELHKRQIAQLNALINLLLGELSPGDRQKIMTICTIDVHSRDVVGKIIASKVDNSLAFQWQS 2053
            .::|.:.|:|::.||.....:.|.|:...|.||:.:.||::|:|||:.|:....:.:..||.|.|
  Rat  1758 KILKVMKKKQVSILNKYSEAIRGNLTKIMRLKIVALVTIEIHARDVLEKLYKGGLMDVNAFDWLS 1822

  Fly  2054 QLRHRWDDDQAGSSSGRASTAISCGGGDEDCFANICDAEFRYAYEYLGNTSRLVITPLTDRCYIT 2118
            |||..|:.|.                  :||.....:.:|:|.||||||:.||||||||||||:|
  Rat  1823 QLRFYWEKDV------------------DDCIIRQTNTQFQYGYEYLGNSGRLVITPLTDRCYMT 1869

  Fly  2119 LTQSLRLRLAGATAGPAGTGKTETTKDLGRALGVMVYVFNCSEQMDYKSCGNIYKGLAQTGAWGC 2183
            ||.:|.|...|:..||||||||||.||||:|||..|.|.||||.:||||.|.:|.||||||||||
  Rat  1870 LTTALHLHRGGSPKGPAGTGKTETVKDLGKALGTYVIVVNCSEGLDYKSMGRMYSGLAQTGAWGC 1934

  Fly  2184 FDEFNRICVEVLSVVAVQVKTIQEAIKMHKTQFIFMGERISLEPSVGIFITMNPGYAGRTELPEN 2248
            |||||||.:|||||||.|:.:|..|:..:.|:|.|.|..|:|..|.|||||||||||||||||||
  Rat  1935 FDEFNRINIEVLSVVAQQILSILSALTANLTRFYFEGFEINLVWSCGIFITMNPGYAGRTELPEN 1999

  Fly  2249 LKTLFRPCAMIVPDFALICEIMLMAEGFQDARLLARKFITLYTLCKELLSKQDHYDWGLRAIKSV 2313
            ||::|||.||:|||..||.||:|..|||.:.::||:|..|||:|..:.||:|||||:||||:.|:
  Rat  2000 LKSMFRPIAMVVPDSTLIAEIILFGEGFGNCKILAKKVYTLYSLAVQQLSRQDHYDFGLRALTSL 2064

  Fly  2314 LVVAGTLKRDDHSRPEDQVLMRALRDFNIPKIVTEDVPIFMGLIGDLFPALDVPRKRVFEFEK-- 2376
            |..||..:|......:::||:.::||.||.|:.:.|||:|..::.||||.:::|   |.::.|  
  Rat  2065 LRYAGKKRRLQPDLTDEEVLLLSMRDMNIAKLTSVDVPLFNAIVQDLFPNIELP---VIDYGKLR 2126

  Fly  2377 -TIRRAVNEIKLQPEEGFLMKVVQLQELLDVRHSVFIVGNAGTGKTKIWQTLRET---------- 2430
             ||.:.:.|:.||.....|.||:||.|..:.|||..|||..|:.||..|:.|:.:          
  Rat  2127 DTIEQEIREMGLQITPFTLTKVLQLYETKNSRHSTMIVGGTGSSKTTSWRILQASLTSLCRAGEP 2191

  Fly  2431 -YRIQKLKPVCHVLNPKALSNDELFGIVNPTTREWKDGLFSSIMREQANMPPGNPKWIVLDGDID 2494
             :.|.|..|    |||||||..||:|..:..|.||.||:.||:||........:.|||:.||.:|
  Rat  2192 NFNIVKEFP----LNPKALSLGELYGEYDLNTNEWTDGILSSVMRAACADEKPDEKWILFDGPVD 2252

  Fly  2495 PMWIESLNTLMDDNKILTLASNERISLKREMRLLFEVGHLKAATPATVSRAGILYINPQDLGWSP 2559
            .:||||:|::|||||:|||.:.|||::..::.|||||.:|..|:||||||.|::|.:..||||:|
  Rat  2253 TLWIESMNSVMDDNKVLTLINGERIAMPEQVSLLFEVENLAVASPATVSRCGMVYTDYVDLGWTP 2317

  Fly  2560 YVSSWLETR----VDMIERGILNALFEKYFPCLMQRQRD-FRRITPITDMAMIQMTCHLLECLLD 2619
            ||.||||.|    ::.::|     :|||:...::..::| ...:.|:|:.:.|...|.|...|..
  Rat  2318 YVQSWLEKRPKAEIEPLQR-----MFEKFINKILTFKKDNCNELVPVTEYSGIISLCKLYTVLAT 2377

  Fly  2620 SDEGNADGRGRGSATGGAANPHSLHHGELSHEAMVMALETIFVYATVWSFGSALSQD---VIIDW 2681
            .:.|              .||....    :|..||   |..||::.:||..:::.:|   .|..:
  Rat  2378 PENG--------------VNPADTE----NHAFMV---EMTFVFSMIWSVCASVDEDGRKKIDSY 2421

  Fly  2682 HREFHKWWIGEFKDIKLPSQGTVFDYQLNVQTLKFQPWSELAAHQSLEGQIDSETPLQNVLISTA 2746
            .||..    |.|     |::.||::|.:|.   |.:.||..........:.....|...:::.|.
  Rat  2422 LREIE----GSF-----PNKDTVYEYYVNP---KMRTWSSFEEQLPKSWRYPPNAPFYKIMVPTV 2474

  Fly  2747 ETIRLAYFLKLLIDRNLACMLVGNSGCGKGAIFRQLFGQYANDQ-ELLEVAVSAATAGDSSHQQQ 2810
            :|:|..|.:..|:......:|||..|.||.:|.:.:.....:.| .:|.|.:||.|         
  Rat  2475 DTVRYNYLVSTLVANQNPVLLVGPVGTGKTSIAQSVLQSLPSSQWSVLVVNMSAQT--------- 2530

  Fly  2811 SGNPAGAVVVRRKASSSATPLLTTVQATHFNFYTSSEIFQKMLDRPLEKKSGRCYAPSGPKRRLI 2875
                                             ||:.: |.:::..:||::...|.|.|.| .:|
  Rat  2531 ---------------------------------TSNNV-QSIIESRVEKRTKGVYVPFGGK-SMI 2560

  Fly  2876 YFVNDLNMPEVDAYGTVQPHTIMRQFMDYRQWYDRQRLQLKDIRHCQFAACMNPTAGSFT-IDPR 2939
            .|::|||||..|.:|:..|..::|.::||..||||.:..:|.||.....|.|.|..|..| |.||
  Rat  2561 TFMDDLNMPAKDMFGSQPPLELIRLWIDYGFWYDRVKQTIKHIRDMFLMAAMGPPGGGRTVISPR 2625

  Fly  2940 LQRHFCVFSVAPPGEDTLHHIYGSILSSHLESPSQGFTKEIRSIGSLLVRVGIALHRRVEYAFLP 3004
            ||..|.:.::..|.|..:..|:|::::..|    |.|.:|::.||:::....:.::..|...|||
  Rat  2626 LQSRFNIINMTFPTESQIIRIFGTMINQKL----QDFEEEVKPIGNVVTEATLDVYNTVVQRFLP 2686

  Fly  3005 TALKFHYLFNLRDLTGIYQGLMNSVGAPASAGGGGASGFGGTICSRPSELMRLYVHEAFRVYHDR 3069
            |..|.||||||||::.::||::.:           ...|..|..|    :.||::||.|||:.||
  Rat  2687 TPAKIHYLFNLRDISKVFQGMLRA-----------NKDFHDTKAS----ITRLWIHECFRVFSDR 2736

  Fly  3070 LVDPYDIKSFKSSIRDIFKKDFE----------------DFDEDFVFAEPLIYSHFAQSLVDQKY 3118
            |||..|:::|...:.|.....|:                ||     ..||.:|    :.|||   
  Rat  2737 LVDTTDMEAFIGILSDKLGTFFDLTFHHLCPNKRPPIFGDF-----LKEPKVY----EDLVD--- 2789

  Fly  3119 MPLKSWDSLYQLLIEAQASYNEV-----VGYMNLVLFEDAMIHVCRINRILESPRGNALLIGVGG 3178
                    |..|....:.:.||.     |..|.||||.:|:.|:.||.|::..||||.||:|:||
  Rat  2790 --------LSVLKTAMETALNEYNLSPSVVQMQLVLFREAIEHITRIVRVIGQPRGNMLLVGIGG 2846

  Fly  3179 SGKQTLARLAAFISSLNVSQIQIKRGFGLLDMREEIGNLYMKVGLKNLASVFLISDAQIPDESIL 3243
            ||:|:|||||:.|...|..||::.:.:...:.|::|..||.:.|::..|:.||..|.||.|||.|
  Rat  2847 SGRQSLARLASSICEYNTFQIEVTKHYRKQEFRDDIKRLYRQAGVELQATSFLFVDTQIADESFL 2911

  Fly  3244 MLINDLLASGEIPELFNDDQLDTITNGIRNEVKQSGTLDTKENCWRYFVEKVRRLLKVVLCFSPV 3308
            ..||::|:|||:|.|:..|:.:.|.|.|.::.:.....::.::.:.|.:|:||..|.:|||.|||
  Rat  2912 EDINNILSSGEVPNLYKADEFEEIQNQIIDQARAEQISESSDSLFAYLIERVRNNLHIVLCLSPV 2976

  Fly  3309 GQTLRVRARKFPAIISRTAIDWFHEWPKSALESVSQKFLNEINGILEPALVPPIGCFMAYVHGTV 3373
            |...|...|::||:::.|.|:||.|||:.||..|::|:|..::...:..:...:......:|.:|
  Rat  2977 GDPFRNWIRQYPALVNCTTINWFSEWPREALLEVAEKYLVGVDLGTQENIHRKVAQIFVTMHWSV 3041

  Fly  3374 NQISRIYLQNEKRYNYTTPKTFLEYIFLYRKLLVDKNGEFAERIARLQSGMSKLAECARQVDTLK 3438
            .|.|:..|...:|:||.||..:||.:..|:|||.:|..|..::..:|::|:.|:.|...:|:.:.
  Rat  3042 AQYSQKMLLELRRHNYVTPTNYLELVSGYKKLLGEKRQELLDQANKLRTGLFKIDETREKVEVMS 3106

  Fly  3439 HQLAIQEVQLAAKNAAADKLIVIVSAESEKVKRERYIASEEEKRVRIIEEDVSIKTKMC------ 3497
            .:|...:.::|......::.:||:..:    |||   |.|::|.|....|.::|:...|      
  Rat  3107 LELEDAKKKVAEFQKQCEEYLVIIVQQ----KRE---ADEQQKAVTANSEKIAIEEVKCQALADN 3164

  Fly  3498 -EEDLRQAEPALVAAQAALNTLNKNNLTELKSFGSPPKAVVNVCAAVMVLLASNGKIPRDRSWKA 3561
             ::||.:|.|||..|..||.:|||.::.|:||:|.||..|..|..|||:|   .|..|   :|..
  Rat  3165 AQKDLEEALPALEEAMRALESLNKKDIGEIKSYGRPPAQVEIVMQAVMIL---RGNEP---TWAE 3223

  Fly  3562 SKLMMVRVDQFLNDLLNYNKDNIHPNIIETLQEYLKDPEFNPDKVVQKSVAAAGLCAWVINLHRY 3626
            :|..:.. ..|:..|:.::||||...:::.:..|...|:|.||.:.:.|:||..||.||..:..|
  Rat  3224 AKRQLGE-QNFIKSLIYFDKDNISDKVLKKIGAYCAQPDFQPDIIGRVSLAAKSLCMWVRAMELY 3287

  Fly  3627 HQVFLIVGPKQQALQDSHQELLEARERLQYLKAKINNLEAKLAEIQAEFENAVGEKQRCQREADK 3691
            .:::.:|.||:..:..:..:|.|.:..|...:.|:..:..||..::.:::..:.:|:..::::::
  Rat  3288 GRLYRVVEPKRIRMNAAIAQLQEKQAALAEAQEKLREVAEKLEMLKKQYDEKLAQKEELRKKSEE 3352

  Fly  3692 TAFTIDLAHRLVNGLANENVRWKESVQSLLAKIGTLPGDILLISSFLSYVGCFTRRYREELQHKM 3756
            ....::.|..||:|||.|..||:|:||.|...:|.|.||.|:.::||||:|.|...||:|:.:::
  Rat  3353 MELKLERAGMLVSGLAGEKARWEETVQGLEEDLGYLVGDCLIAAAFLSYMGPFLTNYRDEIVNQI 3417

  Fly  3757 WLPNFRKIDPHIPHTEGVDTLALFSDDAQIAAWNNEGLPMDRMSTENATILQYSTRWPLMIDPQL 3821
            |:....::.........:|.  ..::..::..||.:|||.|..||||..|:....||.||||||.
  Rat  3418 WIKKIWELQVPCSPRFAIDN--FLTNPTKVRDWNIQGLPSDSFSTENGIIVTRGNRWALMIDPQA 3480

  Fly  3822 QGIKWIKNRFGTD-LVVLRLRQKGFLEALEKSISQGDTVLIEQIEESMDTVLEPLLSRALIKKG- 3884
            |.:|||||..|.. |.::.|:...:|..||.:|..|..||::.::|.:|..|.|:|::::.:.| 
  Rat  3481 QALKWIKNMEGNQGLKIIDLQMHDYLRVLEHAIQFGFPVLLQNVQEYLDPSLNPVLNKSVARIGG 3545

  Fly  3885 -RYLRIGDKEIEFHASFRLILHTKMANPHYKPEMQAQTTLINFTVTPDGLEEQLLAEVVKIERPD 3948
             ..:||.|||:|::.:||..|.||::||||.||..|:||::||.|...|||.|||..||:.|||:
  Rat  3546 RMLMRIADKEVEYNPNFRFYLTTKLSNPHYSPETSAKTTIVNFAVKEQGLEAQLLGIVVRKERPE 3610

  Fly  3949 LEQMKTEVTVQQNKFKISLKALEDELLARLASSGENVLDDHALVINLENTKRTVDEIEAKVREAR 4013
            ||:.|..:.:.....|..||.||||:|..|..:..::|||..||..|:.:|.|..|:..::..:.
  Rat  3611 LEEQKDSLVINIAAGKRKLKELEDEILRLLNEATGSLLDDVQLVNTLQTSKITATEVTEQLETSE 3675

  Fly  4014 VTTLQIDDTRNIYRSAAKRAAILYFVLTDLSRINPIYKFSLKSFMNVFRQAIAMAAESKNYEKRV 4078
            .|.:.||..|..||..|:||::|:|||.|:.||:|:|:|||.:::::|..:|..:..|...|.|:
  Rat  3676 TTEINIDLAREAYRPCAQRASVLFFVLNDMGRIDPMYQFSLDAYISLFILSIDKSHRSNKLEDRI 3740

  Fly  4079 LHLVESITLQTYRYTLRGLFEADKLTFTSHMTLRILIAAEQVAKDETDFLLR---------FPHD 4134
            .:|.:..|...||||.|.|||..||.|:.||..:||..:.::..||.:|.||         ...:
  Rat  3741 EYLNDYHTYAVYRYTCRTLFERHKLLFSFHMCAKILETSGKLNMDEYNFFLRGGVVLDREGQMDN 3805

  Fly  4135 PTTLSPLDFVGRSAWGGIKSLTLIEHFYGIDKDMENYTKRWRKFMASDTPEREQFPGEWKHR-TP 4198
            |.|    .::..:.|..|..|..:.:|:|:....|.|.:.|..:..:..||:...||||::. ..
  Rat  3806 PCT----SWLADAYWDNITELDKLTNFHGLMNSFEQYPRDWHLWYTNSNPEKAMLPGEWENACNE 3866

  Fly  4199 LQKLCIIRSLRPDRMTYAMRQFVEQTMGRSYAEIQTPP---FGAIFQELNAATPAFFILSPGVDP 4260
            :|::.|:||||.||:.:.:..|:...:|..:.|   ||   ...:.::....:|..|||||||||
  Rat  3867 MQRMLIVRSLRQDRVAFCVTSFIVSNLGSRFIE---PPVLNMKLVMEDSTPRSPLVFILSPGVDP 3928

  Fly  4261 ----IRDVERYGQRQGFHSESDTLVNISLGQGQELLAEQAIIGALESGQQWVILQNIHLVVNWLP 4321
                ::..|..|....||:       :||||||..:|.:.:...:..| .||.|.|.||.::|:|
  Rat  3929 TSALLQLAEHTGMAHRFHA-------LSLGQGQAPIAARLLREGVNQG-HWVFLANCHLSLSWMP 3985

  Fly  4322 TLEKLIERIVLQSESKGESNFRLFISAEPAPDPQYHVIPQGILESSLKVVNEPPSGMAANLHKAW 4386
            .|:||:|:  ||.|....| |||::|:.|.||     .|..||::|:|:..|||.|:.||:.:.:
  Rat  3986 NLDKLVEQ--LQVEDPHPS-FRLWLSSSPHPD-----FPISILQASIKMTTEPPKGLKANMTRLY 4042

  Fly  4387 DNFSQDALETCTQEAEFKSILFALCYFHAVAGERRKFGPQGWNKVYPFNIGDLTISSNVLHNYLE 4451
            ...::.....|::..::|.:|||||:||::..||:||...|||.:|.||..|..:|.|:|..||:
  Rat  4043 QLMTEAQFTHCSKPTKYKKLLFALCFFHSILLERKKFLQLGWNIIYGFNDSDFEVSENLLSLYLD 4107

  Fly  4452 GSNRIPWEDLRYLFGEIMYGGHITDDWDRRLCQTYLEE-LLQQDLIDGDFEL--CPGFPAPPNLD 4513
            .....||:.|:||...:.||||:||||||||..||:.: .....|....:.|  ...:..|.:..
  Rat  4108 EYEETPWDALKYLIAGVNYGGHVTDDWDRRLLTTYINDYFCDLSLTTPSYRLSVLDTYYIPKDGS 4172

  Fly  4514 FEGYHSYITEMLPEESPLLYGLHPNAEIGFLTTASEQLLRTIFELQPRESELSSHCGAPREELVK 4578
            ...|..||:.:...:.|..:|.||||::....|.:..|..|:..|||:.:. :...|..|||.|.
  Rat  4173 LASYKEYISLLPSMDPPEAFGQHPNADVASQITEARTLFETLLSLQPQITP-TRIGGQSREEKVL 4236

  Fly  4579 IMIDDFLDKLQDEFNLQALLNRVERK------TPFVVVALQECERMNALIREIKRSLRELMLGLR 4637
            .:..|...|:.:..:.:.     .||      :|..||.|||.:|.|.|::.|..||.:|..|::
  Rat  4237 ELAADVKQKIPEMIDYEG-----TRKLLALDPSPLNVVLLQEIQRYNKLMKTILFSLTDLEKGIQ 4296

  Fly  4638 GELTITQEMERLDHAIFYDHVPAAWARLAYPSMLGLQSWFADLLHRIKELAGWLNDFKLPCAIWL 4702
            |.:.::..:|.:.:.||..|||..|.:: |||...|.||..||..|:::...|.|....|...||
  Rat  4297 GLIVMSTSLEEIFNCIFDAHVPPLWGKV-YPSQKPLASWTRDLAVRVEQFETWANRAHPPVLFWL 4360

  Fly  4703 GGLFNPQSFLTAIMQESARKHDLPLDRMLISCDVTKKQKDDVTLPPMEGAFVHDLYMDGASWDCQ 4767
            .|...|..||||::|.:||::::.:|.:.....|:.....::..||.:|.:|..||::||.||.:
  Rat  4361 SGFTFPTGFLTAVLQSAARQNNISVDSLSWEFIVSTVDDSNLVYPPKDGVWVRGLYLEGAGWDRK 4425

  Fly  4768 LNSIVALRPKEMLCAMPVIYIKSIVQEKQELQRVYECPLYKTRSRGN-----TYVWTFNLKTRER 4827
            .:.:|...|.:::|.||.|:.:.....|:..:.:|.||.|...:|..     ::|...:|::...
  Rat  4426 NSCLVEAEPMQLVCLMPTIHFRPAESRKKSAKGMYSCPCYYYPNRAGSADRASFVIGIDLRSGAM 4490

  Fly  4828 PS-RWILGGVALLL 4840
            .| .||..|.|||:
  Rat  4491 TSDHWIKRGTALLM 4504

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
CG3339NP_001036762.2 DHC_N1 276..903 CDD:285571 126/646 (20%)
DHC_N2 1535..1944 CDD:285579 125/419 (30%)
P-loop_NTPase 2095..2324 CDD:304359 148/228 (65%)
P-loop_NTPase 2409..2544 CDD:304359 64/145 (44%)
P-loop_NTPase 2731..3061 CDD:304359 90/331 (27%)
P-loop_NTPase 3138..3406 CDD:304359 103/272 (38%)
MT 3419..3759 CDD:289543 104/346 (30%)
AAA_9 3789..4001 CDD:289547 94/214 (44%)
Dynein_heavy 4142..4832 CDD:281078 226/712 (32%)
Dnah2XP_008766120.1 DHC_N1 239..806 CDD:285571 126/652 (19%)
DHC_N2 1304..1709 CDD:285579 125/415 (30%)
P-loop_NTPase 1846..2076 CDD:304359 148/229 (65%)
P-loop_NTPase 2162..2303 CDD:304359 64/144 (44%)
P-loop_NTPase 2462..2728 CDD:304359 90/328 (27%)
P-loop_NTPase 2813..3074 CDD:304359 100/260 (38%)
MT 3087..3419 CDD:289543 103/345 (30%)
AAA_9 3447..3663 CDD:289547 94/215 (44%)
Dynein_heavy 3805..4496 CDD:281078 228/720 (32%)


Information from Original Tools:


Tool Simple Score Weighted Score Original Tool Information
BLAST Result Score Score Type Cluster ID
Compara 00.000 Not matched by this tool.
Domainoid 00.000 Not matched by this tool.
eggNOG 00.000 Not matched by this tool.
Hieranoid 00.000 Not matched by this tool.
Homologene 00.000 Not matched by this tool.
Inparanoid 00.000 Not matched by this tool.
OMA 00.000 Not matched by this tool.
OrthoDB 1 1.010 - - D1492at2759
OrthoFinder 1 1.000 - - FOG0000396
OrthoInspector 00.000 Not matched by this tool.
orthoMCL 1 0.900 - - OOG6_100025
Panther 00.000 Not matched by this tool.
Phylome 1 0.910 - -
SonicParanoid 00.000 Not matched by this tool.
SwiftOrtho 00.000 Not matched by this tool.
TreeFam 00.000 Not matched by this tool.
43.820

Return to query results.
Submit another query.