DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment CG3339 and Dnah5

DIOPT Version :9

Sequence 1:NP_001036762.2 Gene:CG3339 / 43295 FlyBaseID:FBgn0039510 Length:4842 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:XP_008759046.2 Gene:Dnah5 / 294854 RGDID:1560828 Length:4621 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:5106 Identity:1424/5106 - (27%)
Similarity:2363/5106 - (46%) Gaps:818/5106 - (16%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly    45 TMRLKPDKWTKMMACDDLRRIVVEWQHGHRRVLVMTLSPGGDLVPRSCLSDLYLPYSVQSARGSI 109
            |.|||.:|        :.:|..::.:|.:...:|           .||| ||..|        .:
  Rat    19 TQRLKEEK--------EAKRARLDGRHDYLFAIV-----------ASCL-DLNKP--------EV 55

  Fly   110 PSAMLPAE-----DEAMAT------------VTAAVSAVVSATPGALLIPLPPASSS------FT 151
            ..|:|...     |:..|.            |..|.:....::.|     :.|||..      |.
  Rat    56 EDALLEGNQIERIDQLFAVGGLRHLMFYYQDVEGAEAGQFGSSGG-----VNPASGKMKKPKVFV 115

  Fly   152 T--LDGVPRGKCAYFVRRNTSDGPLTASNFAESVLYG--DFPVHSKIETMSLLFDDVLQPLLEQA 212
            |  .|....|.|.:|.|.:.|.. :||.|....|.:.  |......:.::..|..|:..|.|..:
  Rat   116 TEGKDVALMGACVFFTRADPSKA-ITAENIHREVSFNTLDTADGGLLNSVRRLLSDIFIPALRAS 179

  Fly   213 QSQWPAI----------------------VRKDLQARIKEVRN----TLTEIKGKTNNRTILSLL 251
            ...|..:                      :....|..:||..|    .:.|:|........|:|.
  Rat   180 SHGWGELEGLQDASSIQQEFLSSLEGFVGILSGAQNSLKEKVNLQKCDIVELKSLKEPMDYLALA 244

  Fly   252 VSPTIVEEVFAHVSQGHLRPALDPKFRNLLEEMFINWTTQMHDIVLE----RSECQPLGSTTQSA 312
            .:|..||:|                     |.....|..||..|:.|    |.|...:|      
  Rat   245 SNPETVEKV---------------------ECCMRVWIKQMEQILAENNQLRKEADDVG------ 282

  Fly   313 GHQPKYITLVSLPAQEIGFWTNRKLNLQNIYEQLRESTHKTLAQILERIESVYYEPYATAFRKLV 377
                        |..|:..|..|......:.:||:....|.:..:|           |.|..||:
  Rat   283 ------------PRAELEHWKKRLSKFNYLLDQLKSPDVKAVLAML-----------AAAKSKLL 324

  Fly   378 AAWLEAQDVSLWLQPLLRQTAAFNSVQ----------------FSNGH----DLVAPLVHIVHLV 422
            ..|.:|.         :|.|.|.|..:                :|:..    |.:..|::.:.::
  Rat   325 KVWRDAD---------IRVTDAANEAKDNVKYLYTLEKCCDPLYSSDPVTMVDAIPTLINAIKMI 380

  Fly   423 WSNARYYRSTQRMSVLLRCICNMLVHRAAEDLE---LQLLFQGDADEGLLKINRTIAVLELFKQR 484
            :|.:.||.:::|::.|...:.|.::......:.   ...::....|..:.||...|.:.:.::..
  Rat   381 YSISHYYNTSERITSLFVKVTNQMISACKAHITNNGTATIWSQPQDIVMQKIAAAIKLKQGYQCC 445

  Fly   485 MLDYKERYAGSQVLLPALSEGAAAVASSPSPDDQQQLWRFCHEDVFGQTLDGFSLQLLELRQVFE 549
            ..:.|::.                   ..:|.::|  :.|....:||: .:.|..:|.::..:|.
  Rat   446 FQETKQKL-------------------KQNPSEKQ--FDFSEMYIFGK-FETFHQRLAKIMDIFT 488

  Fly   550 -----AAVQFQQLEKLE---------VGGLRGK---ILTERVREIFGEFKVLFEQWSNVDIDLTA 597
                 :.:|..::|.||         |.|::.|   .|.:|..:...::....:|.:.:..:|  
  Rat   489 TFKTYSVLQDSKIEGLEDMVTKYQDVVAGIKKKEYNFLDQRKMDFDQDYDEFCKQTNELHSEL-- 551

  Fly   598 TVASKWKCFRREQTLFFSRMQLLEQKLATVLLQAFEQCHSWMHLLRLTLMFGSLLQREAVRPELA 662
                     :|.....|.::|...|.|:|  |:.||         ||.:            |.|.
  Rat   552 ---------QRFMDTTFEKIQSTRQALST--LKKFE---------RLNI------------PNLG 584

  Fly   663 RVLPHILFIYDTEMEQLEDSVGEVLLGYEIRGLAAL--------PLANNFPPIANAMMWLEQHIS 719
            ....:.:...:              .|.:|..::.|        |||.:.||||..::|..|...
  Rat   585 IEAKYQIVFQN--------------FGTDIDMISKLYTKQKYDPPLARDQPPIAGKILWARQLFH 635

  Fly   720 RCDEFGAKELSQLVEQLLKEKSELQTLPIQWNSLLSRRNILTTKLSNLQMKIWISWHECVDKLII 784
            |        |.|.::...:....|:|  ::...::...|.:...|...::....:|.:.::::.:
  Rat   636 R--------LEQPMQLFQQHPFVLRT--VEAKPVIRSYNRIAKVLLEFEVLYHRAWLQQIEEIHV 690

  Fly   785 QGLDESVLSRSQDLSQLHLNFSQVLFTLLKETKYLLALQATGSLSGDLFQLP-EPL-LTLYGHRD 847
             ||:.|:|.::....||.:||...:..|.:||:.:       |..|    || .|. ..|:..||
  Rat   691 -GLEASLLVKAPGTGQLFVNFDPQILILFRETQCM-------SQMG----LPVSPFAAALFEKRD 743

  Fly   848 AYWERRIRLIKIGEFYNGIRSGECAAAELQLIRNDLASIDEHVEVACQQLTWRNYN-DELVAGIF 911
            .|.:....:..:...|..::.....|.| ||:...||.:||.::.....|||.:.| ...:...|
  Rat   744 MYKKNFSDMKMMLSEYQRVKLKMPPAIE-QLMLPHLARVDEALQPGLAVLTWTSLNIGTYLENAF 807

  Fly   912 EQSRDLFARLQQSHG----NLDAILASMRRWSREPLHQRSLYGRNLLDLRHQQDRVRLRLLQCDE 972
            |:.:||...|.:.:.    .:.|||..|                         ..|.|..|..|:
  Rat   808 EKIKDLELLLDRINDLIEFRIHAILEEM-------------------------SSVALCQLPQDD 847

  Fly   973 TKMLLNRLLIANFCLFFNYESQEFQLYSRDLSVQ-----EFIREFPEEQRRQYNKYLASVDELIC 1032
            .                 ...:||...::||.|.     .|.....||...:....|..|| ::.
  Rat   848 P-----------------LTCEEFLQMTKDLCVNGAQKLHFKSSLVEEAVNELINMLLDVD-VLP 894

  Fly  1033 REVREAMRISLEYLYKEMTATATATTTPTAPPVDPGCSAGMARLVLQQITTPQATSTAGAGASGA 1097
            .|..|.:|        ...|:....|:...    .||:..:|             |:..||.|..
  Rat   895 EEASEKVR--------HENASPNGDTSGGG----EGCAEALA-------------SSFNAGTSSL 934

  Fly  1098 PPTA------------------------NDAPLFEV---KLELTETEIRFS-------------- 1121
            |.|.                        |...|.:|   .||.....|.||              
  Rat   935 PLTTIARKKKEMEVLEEARELLSYFNHQNTDALLKVTRNTLEAIRRRIHFSHMINFRDSKGASKV 999

  Fly  1122 -----PAFDASVENNFQQI-VEQLLLDIKQT----CDC---MPRIVAD----------------- 1156
                 |.|.|||......| :...|.||:||    .:|   :|:.|..                 
  Rat  1000 KQNHLPIFRASVTLAIPNISMTPALEDIQQTLNKAVECIISVPKGVRQWSSELLSKRKMRERKMA 1064

  Fly  1157 NAPSEDDEDDDTATVDYEQELRWEPREDRAQELQERKKKDLELEQEQGDPKPQAVQFNLLAAAKA 1221
            ...|.:|.|.||              |....||||    .|||         .:|...:....:.
  Rat  1065 AVQSNEDSDSDT--------------EVEESELQE----TLEL---------ASVNLPIPVQTQN 1102

  Fly  1222 YSQKMECTADGLEM--LERAIRDALADTVAAASAYAAKFQAYAFLWTQQSSEVLAACMQTAREQT 1284
            |.:.:   :|..|:  |...:...::.|.........:|:.|..:|            |..:|.|
  Rat  1103 YYKNI---SDNKEIVKLVSVLSTVISSTKKEVITSMDRFKCYNHIW------------QKEKEDT 1152

  Fly  1285 HHVSAGGYAIMETFKKEIENYNEVHDAIDQCENRECINGWLALDIKPLKYGLLNLACKW-----S 1344
            .........::..|:..|..:..:...|:......|: |.:||....||:.|......|     .
  Rat  1153 IMTFIAQNPLLSEFESRILYFQSLEQEINAEPEYICV-GSIALYTADLKFSLTAETKAWMMVLGR 1216

  Fly  1345 HMCKKW------LLRYVQGTLKELNAFIARGFETLQLHIARQDFATLLRVLAIMSEIREREPYAD 1403
            |..:|:      :...|:...|:||..|             :|...:...:|.:.||||::...|
  Rat  1217 HCNRKYRSEMENIFTVVEEFQKKLNRPI-------------KDLDDIRIAMAALKEIREQQISTD 1268

  Fly  1404 NVFKPLKEIMGLLKTYNVEFEPQLLRGIEQLPQQWQQ-LKHSSTVKQE--ALQDTRFHQQQRVTA 1465
            ....|::|...||..|.:....:.:..::.|...|:: |..:|.|:.|  |||.: |.::...|.
  Rat  1269 FQVGPIEESYALLNKYGLLVAKEEMDKVDTLRYAWEKLLARASDVQNELGALQPS-FRKELISTV 1332

  Fly  1466 LIGLHTCHLQHYARQFQKMPFFRVPCPQVYDVCDEVYLRLHRFRRQQRLY--------------T 1516
            .:.|..|. |.|.......|......||  :..|.:.:..::|....|.|              |
  Rat  1333 EVFLQDCQ-QFYLDYDLNGPMVSGLKPQ--EASDRLIIFQNQFDNIYRKYITYTGGEELFGLPVT 1394

  Fly  1517 RWARLLDIQPPDPATLQFCEVELRRVKQLWDFVRVIESCIVAWHATPWLLIDTDDMEHECKKFTR 1581
            ::.:||:|:.           :|..:::::.....:...:.::..|.|..::.:.:..|..:|..
  Rat  1395 QYPQLLEIKK-----------QLNLLQKIYSLYNNVIETVNSYQDTLWSEVNIEKINSELLEFQN 1448

  Fly  1582 DLRTLDKCIREWAPYVHIVGVLRELVASLRAITELQNPAITERHWMELMQLTKLSYKC-NKSTRL 1645
            ..|.|.:.:::|..::.:...:.:.......:..:.:.|:.||||..:..||..|... |::.:|
  Rat  1449 RCRKLPRALKDWQAFLDMKKTIDDFSECCPLLEYMASNAMVERHWQRITTLTGHSLDVGNETFKL 1513

  Fly  1646 AQLLTLQLQHHEEDIKNTVDRAIKEMTVTKVLDEIKATWAHLEFELEQHHTRPHIQLLKVS-EEL 1709
            ..::.:.|..::|:|::....|:||..:.:.|.::...|.:.........||..:.|...| .|:
  Rat  1514 RNIMEVPLLKYKEEIEDICISAVKERDIEQKLKQVINEWDNKTLTFSSFKTRGELLLRGDSTSEV 1578

  Fly  1710 IETLDDNQMQLQNISTSKHIEYLLDKLTHWQKVLGGIDTLIVNWFEVQRKWIYLECIFIGSADIR 1774
            |.:::|:.|.|.::.::::......::.:|.:.|.....:|.||..||..|||||.:|:| .||.
  Rat  1579 IASMEDSLMLLGSLLSNRYNMPFKAQIQNWVQCLSNSTDIIENWMTVQNLWIYLEAVFVG-GDIA 1642

  Fly  1775 AQLPADAANFERIDEDFTALLAKVQEVRVVMQVVLRHDDVLAQLL-QLQHRLAVCEKALNDYLET 1838
            .|||.:|..|..||:.:..::.:..|:..|:|..: .|:.:.||| .|..:|.:|:|:|..|||.
  Rat  1643 KQLPKEAKRFSNIDKSWVKIMTRAHEIPNVVQCCV-GDETMGQLLPHLLDQLEICQKSLTGYLEK 1706

  Fly  1839 KRLAFPRFYFISAADLLDILSNGNNPQVIDRHLIKLFDSILRLQYETNT-PNALGMHSKENDEYV 1902
            |||.||||:|:|...||:||...::...|..||:.:||:|..:::.... ...|.:.|:|.:   
  Rat  1707 KRLCFPRFFFVSDPALLEILGQASDSHTIQAHLLNVFDNIKTVKFHDKIYDRILSISSREGE--- 1768

  Fly  1903 PFVSFDPDQPAFIVCGGRVELWLRAIIQQMRSTLHELFRRALRVFGEKPREL--WLYDWPAQVAL 1965
               :.:.|:|  ::..|.||:||.:::::.:|:||.:.|:|.....|...:|  :|..:||||.|
  Rat  1769 ---TIELDKP--VMAEGNVEVWLNSLLEESQSSLHLVIRQAAANIQESGFQLIEFLSSFPAQVGL 1828

  Fly  1966 CCSQISWTADVNRSFGCMEEGYEG------VMKELHKRQIAQLNALINLLLGELSPGDRQKIMTI 2024
            ...|:.||.|       .||..:.      :|::.::..:..||.||.:...:||..:|.|..|:
  Rat  1829 LGIQMLWTRD-------SEEALQNAKFDKKIMQKTNQSFLELLNMLIEMTTKDLSSMERVKYETL 1886

  Fly  2025 CTIDVHSRDVVGKIIASKVDNSLAFQWQSQLRHRWDDDQAGSSSGRASTAISCGGGDEDCFANIC 2089
            .||.||.||:...:....|.:...|:|..|.|..:.:|                  .:....:|.
  Rat  1887 ITIHVHQRDIFDDLCHMHVKSPTDFEWLKQCRFYFKED------------------SDKTMIHIT 1933

  Fly  2090 DAEFRYAYEYLGNTSRLVITPLTDRCYITLTQSLRLRLAGATAGPAGTGKTETTKDLGRALGVMV 2154
            |..|.|..|:||.|.|||||||||||||||.|:|.:.:.||.||||||||||||||:||.||..|
  Rat  1934 DVAFTYQNEFLGCTDRLVITPLTDRCYITLAQALGMSMGGAPAGPAGTGKTETTKDMGRCLGKYV 1998

  Fly  2155 YVFNCSEQMDYKSCGNIYKGLAQTGAWGCFDEFNRICVEVLSVVAVQVKTIQEAIKMHKTQFIFM 2219
            .|||||:|||::..|.|:|||||:|:||||||||||.:.||||.|.|:..|....|.||..|||.
  Rat  1999 VVFNCSDQMDFRGLGRIFKGLAQSGSWGCFDEFNRIDLPVLSVAAQQISIILTCKKEHKKSFIFT 2063

  Fly  2220 -GERISLEPSVGIFITMNPGYAGRTELPENLKTLFRPCAMIVPDFALICEIMLMAEGFQDARLLA 2283
             |:.:::.|..|:|:|||||||||.|||||||..||..||:|||..:|..:.|.:.||.|..:||
  Rat  2064 DGDNVTMNPEFGLFLTMNPGYAGRQELPENLKINFRSVAMMVPDRQIIIRVKLASCGFIDNVVLA 2128

  Fly  2284 RKFITLYTLCKELLSKQDHYDWGLRAIKSVLVVAGTLKRDDHSRPEDQVLMRALRDFNIPKIVTE 2348
            |||.|||.||:|.||||.|||:|||.|.|||...|..||..|:..|..::||.|||.|:.|::.|
  Rat  2129 RKFFTLYQLCEEQLSKQVHYDFGLRNILSVLRTLGAAKRASHTDTESTIVMRVLRDMNLSKLIDE 2193

  Fly  2349 DVPIFMGLIGDLFPALDVPRKRVFEFEKTIRRAVNEIKLQPEEGFLMKVVQLQELLDVRHSVFIV 2413
            |.|:|:.||.||||.:.:.:....|.|..|.:.|.|..|.....:.:||:||.|...|||.:..:
  Rat  2194 DEPLFLSLIEDLFPNILLDKAGYPELETAISKQVEEAGLINHPPWKLKVIQLFETQRVRHGMMTL 2258

  Fly  2414 GNAGTGKTKIWQTLRET-------YRIQKLKPVCHVLNPKALSNDELFGIVNPTTREWKDGLFSS 2471
            |.:|:|||....||.:.       :|..:       :||||::..::||.::..|.:|.||:||:
  Rat  2259 GPSGSGKTSCIHTLMKAMTDCGKPHREMR-------MNPKAITAPQMFGRLDVATNDWTDGIFST 2316

  Fly  2472 IMREQANMPPGNPKWIVLDGDIDPMWIESLNTLMDDNKILTLASNERISLKREMRLLFEVGHLKA 2536
            :.|:......|...||||||.:|.:|||:||:::||||.||||:.:||.:....:::||..::..
  Rat  2317 LWRKTLKAKKGEHIWIVLDGPVDAIWIENLNSVLDDNKTLTLANGDRIPMAPNCKIVFEPHNIDN 2381

  Fly  2537 ATPATVSRAGILYINPQDLGWSPYVSSWLETRVDMIERGILNALFEKYFPCLMQ---RQRDFRRI 2598
            |:||||||.|:::::...|.|||.:..:|:.|... |..||..|:.:.||.|.:   :..:|:  
  Rat  2382 ASPATVSRNGMVFMSSSVLDWSPILEGFLKRRSPQ-EAEILRQLYAETFPDLYRFSIQNLEFK-- 2443

  Fly  2599 TPITDMAMIQMTCHLLECLLDSDEGNADGRGRGSATGGAANPHSLHHGELSHEAMVMALETIFVY 2663
            ..|.:..:|..:.|:|:.|:.:.|           ..|..:|.  |.|.|            ||:
  Rat  2444 MEILEAFVITQSTHMLQGLIPTKE-----------QAGDVDPE--HLGRL------------FVF 2483

  Fly  2664 ATVWSFGSALSQDVIIDWHREFHKWWIG-EFKDIKLPS----QGTVFDYQLNVQTLKFQPWSELA 2723
            |.:||.|:.|.    ::..|....|... |...:.||.    ..|:|||.: .....::.||...
  Rat  2484 AMMWSVGAVLE----LEGRRRMELWLRSREGPTLHLPQLTDPGDTMFDYYV-APDGTWRHWSMCI 2543

  Fly  2724 AHQSLEGQIDSETPLQNVLISTAETIRLAYFLKLLIDRNLACMLVGNSGCGKGAIFRQLFGQYAN 2788
            .......  |:.....::|:...:.:|..:.:|.:..:..|.:|:|..|..|..|.:....::  
  Rat  2544 PEYVYPP--DTTPEYGSILVPNVDNVRTDFLIKTIAKQGKAVLLIGEQGTAKTVIIKGFMSKF-- 2604

  Fly  2789 DQELLEVAVSAATAGDSSHQQQSGNPAGAVVVRRKASSSATPLLTTVQATHFNFYTSSEIFQKML 2853
                                    :|....|.....||:.|||:                ||:.:
  Rat  2605 ------------------------DPESHTVKNLNFSSATTPLM----------------FQRTI 2629

  Fly  2854 DRPLEKKSGRCYAPSGPKRRLIYFVNDLNMPEVDAYGTVQPHTIMRQFMDYRQWYDRQRL-QLKD 2917
            :..::|:.|..|.|...|:..: |::|||||.::.:|....:.|:||.|:...:|:.::. :...
  Rat  2630 ESYVDKRMGTTYGPPAGKKMAV-FIDDLNMPVINEWGDQVTNEIVRQLMEQNGFYNLEKPGEFTS 2693

  Fly  2918 IRHCQF-AACMNPTAGSFTIDPRLQRHFCVFSVAPPGEDTLHHIYGSILSSHLESPSQGFTKEIR 2981
            |...|| ||.::|..|...|..||:|.|.:|:...|.:.::..|:| ::........:||:||::
  Rat  2694 IVDIQFLAAMIHPGGGRNDIPQRLKRQFSIFNCTLPSDASMDKIFG-VIGEGYYCAQRGFSKEVQ 2757

  Fly  2982 SIGSLLVRVGIALHRRVEYAFLPTALKFHYLFNLRDLTGIYQGLMNSVGAPASAGGGGASGFGGT 3046
            .....||.:...|.:..:...|||..||||:||||||:.|:||::|               ....
  Rat  2758 DAVIKLVPLTRRLWQMTKLKMLPTPAKFHYVFNLRDLSRIWQGMLN---------------ITSE 2807

  Fly  3047 ICSRPSELMRLYVHEAFRVYHDRLVDPYDIKSFKSSIRDIFKKDFEDFDEDFVFAEPLIYSHFAQ 3111
            :.....||:||:.||..||..||.....|:..|..::..:.:::|.  :|.....:..:.::|..
  Rat  2808 VIKDTDELLRLWKHECKRVIADRFSMSSDVTWFDKAVVSLVEEEFG--EEKTPVVDCGVDAYFVD 2870

  Fly  3112 SLVD-----------------QKYMPLKSWDSLYQLLIEAQASYNEVV---GYMNLVLFEDAMIH 3156
            .|.|                 :.|.|:.|.:.|.:.|......|||.:   | |::|.|.|||:|
  Rat  2871 FLRDAPEATGETPEETDAEMPKLYEPIASLNHLQERLSVFLQLYNESIRGTG-MDMVFFRDAMVH 2934

  Fly  3157 VCRINRILESPRGNALLIGVGGSGKQTLARLAAFISSLNVSQIQIKRGFGLLDMREEIGNLYMKV 3221
            :.:|:|::.:|||||||:||||||||:|.|||:||:.....||.:.|.:...::.|::..||...
  Rat  2935 LVKISRVIRTPRGNALLVGVGGSGKQSLTRLASFIAGYTSFQITLTRSYNTSNLMEDLKVLYRTA 2999

  Fly  3222 GLKNLASVFLISDAQIPDESILMLINDLLASGEIPELFNDDQLDTITNGIRNEVKQSGTL--DTK 3284
            |.:.....|:.:|.:|.:||.|..:|::|:|||:..||..|::|.|.:.:.:.:|:....  .|.
  Rat  3000 GQQGKGITFIFTDNEIKEESFLEYMNNVLSSGEVSNLFARDEIDEINSDLTSIMKKEHPKRPPTN 3064

  Fly  3285 ENCWRYFVEKVRRLLKVVLCFSPVGQTLRVRARKFPAIISRTAIDWFHEWPKSALESVSQKFLNE 3349
            :|.:.||:.:||..|.:||||||||:..|.||.||||:||...||||..|||.||.:||:.||:.
  Rat  3065 DNLYEYFMSRVRGNLHIVLCFSPVGEKFRNRALKFPALISGCTIDWFSRWPKDALVAVSEHFLSS 3129

  Fly  3350 IN----GILEPALVPPIGCFMAYVHGTVNQISRIYLQNEKRYNYTTPKTFLEYIFLYRKLLVDKN 3410
            .|    ..::..||..:|.|.   .|...:.:. |.|..:|..:.|||::|.:|..|:.:..:|:
  Rat  3130 YNIDCTAEIKKELVQCMGSFQ---DGVAEKCAD-YFQRFRRSTHVTPKSYLSFIQGYKFIYEEKH 3190

  Fly  3411 GEFAERIARLQSGMSKLAECARQVDTLKHQLAIQEVQLAAKNAAAD---KLIVIVSAESEKVKRE 3472
            .|......|:.:|:.||.|.:..|..|..:||::|.:|...|..||   |.:.:.:..:||||.|
  Rat  3191 VEVQSLANRMNTGLEKLKEASESVAALSQELAVKEKELQVANEKADMVLKEVTMKAQAAEKVKAE 3255

  Fly  3473 RYIASEEEKRVRIIEEDVSIKTKMCEEDLRQAEPALVAAQAALNTLNKNNLTELKSFGSPPKAVV 3537
               ..:.:.:.:.|.:.:|....:.||.|..|:|||..|:|||.|:..:::..:::.|.||..::
  Rat  3256 ---VQKVKDKAQAIVDSISKDKAIAEEKLEAAKPALEEAEAALQTIKPSDIATVRTLGRPPHLIM 3317

  Fly  3538 NVCAAVMVLL---ASNGKIPRDR-----SWKASKLMMVRVDQFLNDLLNYNKDNIHPNIIETLQE 3594
            .:...|::|.   .:..||..|:     ||:.| |.::....||.:|..:.||.|:..:||.|..
  Rat  3318 RIMDCVLLLFHRRVNAVKIDLDKSCTVPSWQES-LKLMTAGNFLQNLQQFPKDTINEEVIEFLSP 3381

  Fly  3595 YLKDPEFNPDKVVQKSVAAAGLCAWVINLHRYHQVFLIVGPKQQAL--QDSHQELLEARERLQYL 3657
            |.:..::|.:...:.....||||:|...:..:..:...|.|.:..|  |::...|  |.:.||..
  Rat  3382 YFEMSDYNIETAKRVCGNVAGLCSWTKAMASFFSINKEVLPLKANLIVQENRHAL--AMQDLQKA 3444

  Fly  3658 KAKINNLEAKLAEIQAEFENAVGEKQRCQREADKTAFTIDLAHRLVNGLANENVRWKESVQSLLA 3722
            :|::::.:|:|..:|||:|.|:.|||....:||:....:..|..|::|||.|..||.|..:...|
  Rat  3445 QAELDDKQAELDVVQAEYEQAMTEKQTLLEDADRCRHKMQTASTLISGLAGEKERWTEQSKEFAA 3509

  Fly  3723 KIGTLPGDILLISSFLSYVGCFTRRYREELQHKMWLPNF--RKIDPHIPHTEGVDTLALFSDDAQ 3785
            :|..|.||:||.::||||.|.|.:.:|:.|.:. |....  ||    ||....::...:..|...
  Rat  3510 QIKRLVGDVLLATAFLSYSGPFNQEFRDLLLND-WKKEMKARK----IPFGNDLNLNEMLIDAPT 3569

  Fly  3786 IAAWNNEGLPMDRMSTENATILQYSTRWPLMIDPQLQGIKWIKNRFG-TDLVVLRLRQKGFLEAL 3849
            |:.||.:|||.|.:|.:|..|:..::|.||:||||.||..||:|:.. .:|.:..|..|.|...|
  Rat  3570 ISEWNLQGLPNDDLSIQNGIIVTKASRSPLLIDPQTQGKIWIRNKESQNELQITSLNHKYFRNHL 3634

  Fly  3850 EKSISQGDTVLIEQIEESMDTVLEPLLSRALIKKGR--YLRIGDKEIEFHASFRLILHTKMANPH 3912
            |.|:|.|..:|||.:.|.:|..|:.:|.:..||.|.  .:::||||::....|:|.:.||:.||.
  Rat  3635 EDSLSLGRPLLIEDVGEELDPALDNVLEKNFIKTGSTFKVKVGDKEVDVMDGFKLYITTKLPNPA 3699

  Fly  3913 YKPEMQAQTTLINFTVTPDGLEEQLLAEVVKIERPDLEQMKTEVTVQQNKFKISLKALEDELLAR 3977
            |.||:.|:|.:|:||||..|||:|||..|:..|:.:||:.:|.:..:....|...|.|||.||.|
  Rat  3700 YTPEISARTAIIDFTVTVKGLEDQLLGRVILTEKQELEKERTHLLEEVTANKRRTKELEDNLLYR 3764

  Fly  3978 LASSGENVLDDHALVINLENTKRTVDEIEAKVREARVTTLQIDDTRNIYRSAAKRAAILYFVLTD 4042
            |.|:..::::|.:|::.|.|||:|.:|:..|:..:..|.:||:..|..||..|.|.:||||::|:
  Rat  3765 LTSTQGSLVEDESLIVVLSNTKKTAEEVTQKLEISGETEIQINSAREEYRPVATRGSILYFLITE 3829

  Fly  4043 LSRINPIYKFSLKSFMNVFRQAIAMAAESKNYEKRVLHLVESITLQTYRYTLRGLFEADKLTFTS 4107
            :..:|.:|:.||:.|:.:|..::|.:.:|....||:.:::|.:|.:.::|.::||:|..|..||.
  Rat  3830 MRLVNEMYQTSLRQFLGLFDLSLARSVKSPITSKRIGNIIEHMTYEVFKYAVQGLYEEHKFLFTL 3894

  Fly  4108 HMTLRILIAAEQVAKDETDFLLR---------FPHDPTTLSPLDFVGRSAWGGIKSLTLIEHFYG 4163
            .:||:|.|....|..:|...|::         .||.|:     .::....|..:..|:.::.|..
  Rat  3895 LLTLKIDIQRNLVKHEEFLTLIKGGASLDLKACPHKPS-----KWILDMTWLNLVELSKLKQFSD 3954

  Fly  4164 IDKDMENYTKRWRKFMASDTPEREQFPGEW-KHRTPLQKLCIIRSLRPDRMTYAMRQFVEQTMGR 4227
            |...:....|.||.:...:.||.|..|..: |.....::|.:|||..|||.....|:::..:||.
  Rat  3955 ILDQISRNEKLWRIWFDKENPEEEPLPNAYDKSLDCFRRLLLIRSWCPDRTIAQARKYIMDSMGE 4019

  Fly  4228 SYAEIQTPPFGAIFQELNAATPAFFILSPGVDPIRDVERYGQRQGFHSESDTLVNISLGQGQELL 4292
            :|||.........::|.:..||...:||.|.||...:...|:|....:.     .:|:|||||:.
  Rat  4020 NYAEGVILDLEKTWEESDPRTPLICLLSMGSDPTDSIIALGKRLKIETR-----YVSMGQGQEVH 4079

  Fly  4293 AEQAIIGALESGQQWVILQNIHLVVNWLPTLEKLIERIVLQSESKGESNFRLFISAEPAPDPQYH 4357
            |.:.:...:.:| .||:|||.||.:::   |::|:: :|.::|:..:: |||:|:.|     .:.
  Rat  4080 ARKLLHQTMANG-GWVLLQNCHLGLDF---LDELMD-VVTETETVHDT-FRLWITTE-----VHK 4133

  Fly  4358 VIPQGILESSLKVVNEPPSGMAANLHKAWDNFSQDALETCTQEAEFKSILFALCYFHAVAGERRK 4422
            ..|..:|:.|:|..||||.|:.|.|.:.:...|||.|:. :..|::|.:|:|:.:.|:...||||
  Rat  4134 QFPITLLQMSIKFANEPPQGLRAGLRRTYGGVSQDLLDV-SVGAQWKPMLYAVAFLHSTVQERRK 4197

  Fly  4423 FGPQGWNKVYPFNIGDLTISSNVLHNYLEG---SNRIPWEDLRYLFGEIMYGGHITDDWDRRLCQ 4484
            |||.|||..|.||..|...:...:.|:|:.   ...:.|..:||:.|||.|||.:|||:|:||..
  Rat  4198 FGPLGWNIPYEFNQADFNATVQFIQNHLDDMDIKKGVSWTTVRYMIGEIQYGGRVTDDYDKRLLN 4262

  Fly  4485 TYLEELLQQDLIDGDFELCPGFPAPPNLDFEGYHSYITEMLPEESPLLYGLHPNAEIGFLTTASE 4549
            |:.:....:::...||....|:..|.....:||..||..:...:||.::||||||:|.:.:..::
  Rat  4263 TFAKVWFSENMFGPDFTFYQGYNIPKCSTVDGYLQYIQSLPAYDSPEVFGLHPNADITYQSKLAK 4327

  Fly  4550 QLLRTIFELQPRESELSSHCGAPREELVKIMIDDFLDKLQDEFNLQALLNRVERKTPFV---VVA 4611
            .:|.||..:||::|  |......||.:|..:.||.|:||.::::...:..|:::..||.   :..
  Rat  4328 DVLDTILGIQPKDS--SGGGDETREAVVARLADDMLEKLPEDYSPFEVKERLQKMGPFQPMNIFL 4390

  Fly  4612 LQECERMNALIREIKRSLRELMLGLRGELTITQEMERLDHAIFYDHVPAAWARLAY-PSMLGLQS 4675
            .||.:||..::..::.:|.||.|.:.|.:.::..:......:|...:||.|.:.:: .|.||.  
  Rat  4391 RQEIDRMQRVLSLVRSTLTELKLAVDGTIIMSDNLRDALDCMFDARIPARWKKASWVSSTLGF-- 4453

  Fly  4676 WFADLLHRIKELAGWLNDFKLPCAIWLGGLFNPQSFLTAIMQESARKH-DLPLDRMLISCDVTKK 4739
            ||.:||.|..:...|:::.: |...|:.|.||||.||||:.||..|.: ...||.|::..:|||.
  Rat  4454 WFTELLERNCQFTSWVSNGR-PHCFWMTGFFNPQGFLTAMRQEITRANKGWALDNMVLCNEVTKF 4517

  Fly  4740 QKDDVTLPPMEGAFVHDLYMDGASWDCQLNSIVALRPKEMLCAMPVIYIKSIVQEKQELQRVYEC 4804
            .|||::.||.||.:|:.||::||.||.:...::..:||.:...||||.|.:.....:: .|:|.|
  Rat  4518 MKDDISAPPTEGVYVYGLYLEGAGWDKRNMKLIESKPKVLFELMPVIRIFAENNTARD-PRLYCC 4581

  Fly  4805 PLYKTRSRGN-TYVWTFNLKTRERPSRWILGGVALL 4839
            |:||...|.: .|:...:|||.:.|..|||.|||||
  Rat  4582 PIYKKPVRTDLNYIAAVDLKTAQAPEHWILRGVALL 4617

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
CG3339NP_001036762.2 DHC_N1 276..903 CDD:285571 125/680 (18%)
DHC_N2 1535..1944 CDD:285579 106/412 (26%)
P-loop_NTPase 2095..2324 CDD:304359 142/229 (62%)
P-loop_NTPase 2409..2544 CDD:304359 51/141 (36%)
P-loop_NTPase 2731..3061 CDD:304359 80/331 (24%)
P-loop_NTPase 3138..3406 CDD:304359 110/276 (40%)
MT 3419..3759 CDD:289543 108/352 (31%)
AAA_9 3789..4001 CDD:289547 87/214 (41%)
Dynein_heavy 4142..4832 CDD:281078 221/699 (32%)
Dnah5XP_008759046.2 DHC_N1 250..802 CDD:400611 129/703 (18%)
DHC_N2 1399..1804 CDD:400618 109/425 (26%)
DYN1 <1640..4282 CDD:227570 938/2816 (33%)
AAA_6 1939..2266 CDD:403853 178/326 (55%)
Dynein_C 4326..4618 CDD:408026 101/298 (34%)


Information from Original Tools:


Tool Simple Score Weighted Score Original Tool Information
BLAST Result Score Score Type Cluster ID
Compara 00.000 Not matched by this tool.
Domainoid 00.000 Not matched by this tool.
eggNOG 00.000 Not matched by this tool.
Hieranoid 00.000 Not matched by this tool.
Homologene 00.000 Not matched by this tool.
Inparanoid 00.000 Not matched by this tool.
OMA 00.000 Not matched by this tool.
OrthoDB 00.000 Not matched by this tool.
OrthoFinder 00.000 Not matched by this tool.
OrthoInspector 00.000 Not matched by this tool.
orthoMCL 1 0.900 - - OOG6_100025
Panther 00.000 Not matched by this tool.
Phylome 1 0.910 - -
SonicParanoid 00.000 Not matched by this tool.
SwiftOrtho 1 1.000 - -
TreeFam 00.000 Not matched by this tool.
32.810

Return to query results.
Submit another query.