DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment CG3339 and Dnah17

DIOPT Version :9

Sequence 1:NP_001036762.2 Gene:CG3339 / 43295 FlyBaseID:FBgn0039510 Length:4842 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:XP_038943439.1 Gene:Dnah17 / 287845 RGDID:1563805 Length:4459 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:4864 Identity:2193/4864 - (45%)
Similarity:3035/4864 - (62%) Gaps:462/4864 - (9%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly    32 DARLERVAAYTTTTMRLKPDKWTKMMACDDLRRIVVE-WQHGHRRVLVMTLSPGGDLVPRSCLSD 95
            |.|::.:...::..::.|||||:|::..::...:..| :......||||||:|.|.::|  ||. 
  Rat     3 DPRIDYLETVSSALLKFKPDKWSKLVGAEENMALFTEFFDKTENPVLVMTLNPAGIIIP--CLG- 64

  Fly    96 LYLPYSVQSARGSIPSAMLPAEDEAMATVTAAVSAVVSATPGALLIPLPPASSSFTTLDGVPRGK 160
              .|.|:::                                                       |
  Rat    65 --FPESLKT-------------------------------------------------------K 72

  Fly   161 CAYFVRRNTSDGPLTASNFAESVLYGDFPVHSKIETMSLLFDDVLQPLLEQAQSQ--WPAIVRKD 223
            ..||:|  |....:|..|:...::|||.. .:.::.:..:.::||..||.|.::.  ||.:|.:|
  Rat    73 GVYFIR--TKPENITKDNYKTRLIYGDIS-PTPVDQLIAVVEEVLYSLLNQNENMDGWPRVVSED 134

  Fly   224 LQARIKEVRNTLTEIKGKTNNRTILSLLVSPTIVEEVFAHV-SQGHLRPALDPKFRNLLEEMFIN 287
            :..::..::|.:..:.||...:|:|.:   |..:..:...: |...:..:||....:.:|.:.|:
  Rat   135 IVKQVHRLKNEMFVMGGKIKGKTLLPI---PEHLGSLDGTLESMERIPSSLDNSLLHSIETIIID 196

  Fly   288 WTTQMHDIVLERSECQPLGSTTQSAGHQPKYITLVSLPAQEIGFWTNRKLNLQNIYEQLRESTHK 352
            |:.|:.| ||.:...|.|     ..|..|       ||..|..||..|.:|||.|:|||......
  Rat   197 WSHQIRD-VLSKDSAQAL-----LDGLHP-------LPRVEFEFWDARLMNLQCIHEQLNRPKVN 248

  Fly   353 TLAQILERIESVYYEPYATAFRKLVAAWLEAQDVSLWLQPLLRQTAAFNSVQFSNGHDLVAPLVH 417
            .:.:|||:.:|.|:......:..:.....||.|:.|:|:||...........|:.....:..::.
  Rat   249 KIVEILEKAKSCYWPALQNVYMNVTQGLKEANDIVLYLKPLRILLEEMEQADFTVLPSFIVKVLS 313

  Fly   418 IVHLVWSNARYYRSTQRMSVLLRCICNMLVHRAAEDL---ELQLLFQGDADEGLLKINRTIAVL- 478
            .:..:|:.:.:|.:..|:.|:||...|.::......|   |:....||:.:|.|..|::::.|| 
  Rat   314 TICFIWATSEHYNTPSRVIVILREFSNQIIEMTRTYLSPEEVLKGLQGEIEEVLGGISQSVGVLK 378

  Fly   479 ELF-------KQRMLDYKERYAGSQVLLPALSEGAAAVASSPSPDDQQQLWRFCHEDVFGQTLDG 536
            |||       ....|.:|:|                    .|.|      |.|.....|.: ::.
  Rat   379 ELFHAYDFCCANMKLFFKDR--------------------PPVP------WEFPSSLAFSR-MNA 416

  Fly   537 FSLQLLELRQVFEAAVQFQQLEKLEVGGLRGKILTERVREIFGEFKVLFEQWSNVDIDLTATVAS 601
            |..::..:..:::.|::|.:|||:|:||:||.||...|.:|:.|...|.:.::....|......|
  Rat   417 FFHRVQTIEDLYKTAIEFLKLEKIELGGVRGNILGNLVTQIYDEVFELVKVFAECKYDPLDPGDS 481

  Fly   602 KWKCFRREQTLFFSRMQLLEQKLATVLLQAFEQCHSWMHLLRLTLMFGSLLQREAVRPELARVLP 666
            .   |..:...|.:::|.|:::|||:..|||:.|:......:|..|.|.||:|..:   |..|:|
  Rat   482 S---FDDDYNDFETKIQDLDRRLATIFCQAFDDCNCIESSAKLLYMCGGLLERPLI---LVEVVP 540

  Fly   667 HILFIYDTEMEQLEDSVGEVLLGYEIRGLAA-----LPLANNFPPIANAMMW---LEQHISRCDE 723
            .    |...:|.....:....|.|:.:..|:     .|:..|.||:|..:.|   |::.:    |
  Rat   541 R----YSVMLEMFNTELDNAKLMYDAQMAASEDGQIPPIHKNMPPVAGQLKWSLELQERL----E 597

  Fly   724 FGAKELSQLVEQLLKEKSELQTLPIQWNSLLSRRNILTTKLSNLQMKIWISWHECVDKLIIQGLD 788
            ...|.|..:...::..        ::...:..:.:.:...|...:.|.:..|.|.||:.....|.
  Rat   598 VSMKYLKHIDHPVMSS--------VEAKLVYDKYDEMIGLLKGYREKKYQQWVEGVDQDCHFNLG 654

  Fly   789 ESVLSRSQDLSQLHLNFSQVLFTLLKETKYLLALQATGSLSGDLFQLPEPLLTLYGHRDAYWERR 853
            :.::.|....|.:.:|||:.|..:|:|.|||...|..        ::|.....|:...:.:.:..
  Rat   655 QPLIQRDPFSSLIQVNFSKALVAVLREVKYLNFQQQK--------EIPSSAEKLFSENEIFRKFV 711

  Fly   854 IRLIKIGEFYNGIRSGECAAAELQLIRNDLASIDEHVEVACQQLTWRNYNDELVAGIFEQSRDLF 918
            ..|..|..:||.|:: .....|..||:::|..||..:..|...|.|   |.|.|....::.|::.
  Rat   712 GNLELIVGWYNEIKT-TVMEVEFPLIKSELEEIDVKLMSAETTLFW---NGENVMEYIQEMREIL 772

  Fly   919 ----ARLQQSHGNLDAILASMRRWSREPLHQRSLYGRN-LLDLRHQQDRVRLRLLQCDETKMLLN 978
                .|:|::..|::.|..:|:.||..||.:|....:. ||||..:...:..|.....:..:.:.
  Rat   773 HNLQNRIQKTKQNIEGITQAMQEWSANPLFERKDNKKEALLDLDGRVANLNKRYAAVKDAGVRIQ 837

  Fly   979 RLLIANFCLFFNYESQEFQLYSRDLSVQEFIREFPEEQRRQYNKYLASVDELICREVREAMRISL 1043
            .::..|           .:|:..|.:.|            .:..|:..:|.::..|....:|.||
  Rat   838 AMVTEN-----------AELFKADTTSQ------------PWKDYVNYIDAMVLDEFDRFIRKSL 879

  Fly  1044 EYLYKEMTATATATTTPTAPPVDPGCSAGMARLVLQQITTPQATSTAGAGASGAPPTANDAPLFE 1108
            .||...||.                                               ..|.|||||
  Rat   880 NYLMDNMTM-----------------------------------------------DENIAPLFE 897

  Fly  1109 VKLELTETEIRFSPAFDASVENNFQQIVEQLLLDIKQTCDCMPRIVADNAPSEDDEDDDTATVDY 1173
            :::||.|..:.|:|..:...|::|..::|.|:.|:......:||:.......:.|.:|.|..::.
  Rat   898 IRMELDEDGLTFNPTLEMGDEDSFLSLIEGLINDLYNVARLIPRLAKGRINYKSDLEDITDLIEM 962

  Fly  1174 EQELRWEPREDRAQELQERKKKDLELEQEQGDPKPQAVQFNLLAAAKAYSQKMECTADGLEMLER 1238
            .:||.                                   :|:..|                   
  Rat   963 REELS-----------------------------------SLVIGA------------------- 973

  Fly  1239 AIRDALADTVAAASAYAAKFQAYAFLWTQQSSEVLAACM-----QTAREQTHHVSAGGYAIMET- 1297
                     :..|..|...|:.|::||.....|.:...:     .|..|....:..   .|.:| 
  Rat   974 ---------MKVAEEYQDSFERYSYLWVDDLQEFMKNFLIFGHAPTPEELDTKIDD---TIPKTQ 1026

  Fly  1298 -----FKKEIENYNEVHDAIDQCENRECINGWLALDIKPLKYGLLNLACKWSHMCKKWLLRYVQG 1357
                 |:::|::|.::::.:.:|||.:..:|||..|.:|.|..|||...:||.:.|::|..:|..
  Rat  1027 PTLAQFQQQIDSYEKLYEEVSRCENTKVFHGWLQCDCRPFKQALLNTIKRWSLLFKRYLSDHVIN 1091

  Fly  1358 TLKELNAFIARGFETLQLHIARQDFATLLRVLAIMSEIREREPYADNVFKPLKEIMGLLKTYNVE 1422
            :|.:|.:|:......|:..:...|:..|:.|:..:.:::||:...|::|:|||:.:.|||:|..|
  Rat  1092 SLADLESFMGVTRTGLKKPLKEGDYDGLVEVMGHLMKVKERQVATDSMFEPLKQTIELLKSYGEE 1156

  Fly  1423 FEPQLLRGIEQLPQQWQQLKH-SSTVKQEA--LQDTRFHQQQRVTALIGLHTCHLQH-YARQFQK 1483
            ...:....:::||:||...|. :..|||..  ||....:..:|......|.    || :..:|::
  Rat  1157 MPEETYLKLQELPEQWTNTKKLAIQVKQNVAPLQANEVNILRRKCQQFELK----QHEFREKFRR 1217

  Fly  1484 MPFFRVPCPQVYDVCDEVYLRLHRFRRQQRLYTRWARLLDIQPPDPATLQFCEVELRRVKQLWDF 1548
            ...|....|..|...::....:...........:...|.::..||...|:.|..|:|.:|:|||.
  Rat  1218 DAPFTFSDPDPYKSLNKQQKSISAMEGVMEALCKSGSLFEVTVPDYKQLKACHKEVRLLKELWDM 1282

  Fly  1549 VRVIESCIVAWHATPWLLIDTDDMEHECKKFTRDLRTLDKCIREWAPYVHIVGVLRELVASLRAI 1613
            :.::.:.|..|..|.|..|:.:.|:.:||||.:|:|:|||.::.|..:|.:...::.::.||||:
  Rat  1283 IVMVNTSIDDWKTTKWKDINVEQMDIDCKKFAKDVRSLDKEMKAWDAFVGLDNTVKNMITSLRAV 1347

  Fly  1614 TELQNPAITERHWMELMQLTKLSYKCNKSTRLAQLLTLQLQHHEEDIKNTVDRAIKEMTVTKVLD 1678
            :|||||||.||||.:|||.|::.::.::.|.||.||.|.|..:|::::|.||:|:||..:.|||.
  Rat  1348 SELQNPAIRERHWQQLMQATQVKFEMSEETTLADLLQLNLHKYEDEVRNIVDKAVKESGMEKVLK 1412

  Fly  1679 EIKATWAHLEFELEQHHTRPHIQLLKVSEELIETLDDNQMQLQNISTSKHIEYLLDKLTHWQKVL 1743
            .:.:||:.:|||.|. |.|....|||..|.|:|||:|||:||||:..||::.:.|.::|.||:.|
  Rat  1413 TLDSTWSTMEFEHEL-HPRTGTMLLKSDELLVETLEDNQVQLQNLMMSKYLSHFLKEVTSWQQKL 1476

  Fly  1744 GGIDTLIVNWFEVQRKWIYLECIFIGSADIRAQLPADAANFERIDEDFTALLAKVQEVRVVMQVV 1808
            ...|::|..||||||.|.:||.|||||.|||||||.|:..|:.||::|.||:....:...|::..
  Rat  1477 STADSVISIWFEVQRTWSHLESIFIGSEDIRAQLPEDSRRFDSIDQEFKALMEDAVKTPNVVEAT 1541

  Fly  1809 LRHDDVLAQLLQLQHRLAVCEKALNDYLETKRLAFPRFYFISAADLLDILSNGNNPQVIDRHLIK 1873
             ....:..:|.:|:..||||||||.:||||||||||||||:|:|||||||||||:|..:.|||.|
  Rat  1542 -NKPGLYDKLERLKKSLAVCEKALAEYLETKRLAFPRFYFVSSADLLDILSNGNDPVEVSRHLSK 1605

  Fly  1874 LFDSILRLQYETNTPN-----ALGMHSKENDEYVPFVSFDPDQPAFIVC--GGRVELWLRAIIQQ 1931
            ||||:.:|::..:...     .|||:||| |||   :.||.:      |  .|:||:||..::.:
  Rat  1606 LFDSLCKLKFRLDASGNPIKVGLGMYSKE-DEY---MDFDKE------CDLSGQVEVWLNRVLDR 1660

  Fly  1932 MRSTLHELFRRALRVFGEKPRELWLYDWPAQVALCCSQISWTADVNRSFGCMEEGYEGVMKELHK 1996
            |.:||......|:..:.|||||.|::|:||||||.|:||.||.:|..:|..:|||||..:|:.:|
  Rat  1661 MCATLRHEIPEAVVTYEEKPREQWIFDYPAQVALTCTQIWWTTEVGLAFARLEEGYENAIKDYNK 1725

  Fly  1997 RQIAQLNALINLLLGELSPGDRQKIMTICTIDVHSRDVVGKIIASKVDNSLAFQWQSQLRHRWDD 2061
            :||:||||||.||:|.||.|||.|||||||||||:||||.|:|.:||::|.||.||||||||||:
  Rat  1726 KQISQLNALITLLIGNLSAGDRMKIMTICTIDVHARDVVAKMITAKVESSQAFTWQSQLRHRWDE 1790

  Fly  2062 DQAGSSSGRASTAISCGGGDEDCFANICDAEFRYAYEYLGNTSRLVITPLTDRCYITLTQSLRLR 2126
            ::                  :.||||||||:.:|:|||||||.|||||||||||||||||||.|.
  Rat  1791 EK------------------KHCFANICDAQIQYSYEYLGNTPRLVITPLTDRCYITLTQSLHLI 1837

  Fly  2127 LAGATAGPAGTGKTETTKDLGRALGVMVYVFNCSEQMDYKSCGNIYKGLAQTGAWGCFDEFNRIC 2191
            :.||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
  Rat  1838 MGGAPAGPAGTGKTETTKDLGRALGTMVYVFNCSEQMDYKSCGNIYKGLAQTGAWGCFDEFNRIS 1902

  Fly  2192 VEVLSVVAVQVKTIQEAIKMHKTQFIFMGERISLEPSVGIFITMNPGYAGRTELPENLKTLFRPC 2256
            ||||||:|||||.:|:||:..|.:|.|:||.|||.|:||||||||||||||||||||||.|||||
  Rat  1903 VEVLSVIAVQVKCVQDAIRAKKKKFNFLGEMISLIPTVGIFITMNPGYAGRTELPENLKALFRPC 1967

  Fly  2257 AMIVPDFALICEIMLMAEGFQDARLLARKFITLYTLCKELLSKQDHYDWGLRAIKSVLVVAGTLK 2321
            ||:||||.|||||||:||||.:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||
  Rat  1968 AMVVPDFELICEIMLVAEGFLEARLLARKFITLYTLCKELLSKQDHYDWGLRAIKSVLVVAGSLK 2032

  Fly  2322 RDDHSRPEDQVLMRALRDFNIPKIVTEDVPIFMGLIGDLFPALDVPRKRVFEFEKTIRRAVNEIK 2386
            |.|.:|.|||||||||||||||||||:|:|:||||||||||||||||||...|||.|::::.|:|
  Rat  2033 RGDPTRAEDQVLMRALRDFNIPKIVTDDLPVFMGLIGDLFPALDVPRKRDLNFEKIIKQSIVELK 2097

  Fly  2387 LQPEEGFLMKVVQLQELLDVRHSVFIVGNAGTGKTKIWQTLRETYRIQKLKPVCHVLNPKALSND 2451
            ||.|:.|::|||||:|||.||||||::||||:||:::.::|.:||:..|.|||...|:|||::.|
  Rat  2098 LQAEDSFVLKVVQLEELLQVRHSVFVIGNAGSGKSQVLKSLNKTYQNMKRKPVAVDLDPKAVTCD 2162

  Fly  2452 ELFGIVNPTTREWKDGLFSSIMREQANMPPGNPKWIVLDGDIDPMWIESLNTLMDDNKILTLASN 2516
            |||||:||.||||||||||:|||:.||:....||||||||||||||||||||:|||||:||||||
  Rat  2163 ELFGIINPATREWKDGLFSTIMRDLANITHDGPKWIVLDGDIDPMWIESLNTVMDDNKVLTLASN 2227

  Fly  2517 ERISLKREMRLLFEVGHLKAATPATVSRAGILYINPQDLGWSPYVSSWLETRVDMIERGILNALF 2581
            |||.|.|.|||:||:.||:.||||||||||||||||.||||:|.||||:|.|....|:..|..||
  Rat  2228 ERIPLNRTMRLVFEISHLRTATPATVSRAGILYINPADLGWNPVVSSWIERRKVQSEKANLIILF 2292

  Fly  2582 EKYFP-CLMQRQRDFRRITPITDMAMIQMTCHLLECLLDSDEGNADGRGRGSATGGAANPHSLHH 2645
            :||.| ||.:.:..|:||||:.::.:||...:||||||.......|            :|..|: 
  Rat  2293 DKYLPTCLDKLRFGFKRITPVPEITVIQTILYLLECLLTEKNAPPD------------SPKELY- 2344

  Fly  2646 GELSHEAMVMALETIFVYATVWSFGSALSQDVIIDWHREFHKWWIGEFKDIKLPSQGTVFDYQLN 2710
                        |..||:|..|:||.|:.||.:||:..||.||||.|||.||||||||:|||.::
  Rat  2345 ------------ELYFVFACFWAFGGAMFQDQLIDYRVEFSKWWINEFKTIKLPSQGTIFDYYID 2397

  Fly  2711 VQTLKFQPWSELAAHQSLEGQIDSETPLQNVLISTAETIRLAYFLKLLIDRNLACMLVGNSGCGK 2775
            .:|.||.||::...:    .::|.:.|||..|:.|.||||:.||:.||:.:....|||||:|.||
  Rat  2398 PETKKFLPWTDKVPN----FELDPDIPLQASLVHTTETIRIRYFMDLLMAKAWPVMLVGNAGTGK 2458

  Fly  2776 GAIFRQLFGQYANDQELLEVAVSAATAGDSSHQQQSGNPAGAVVVRRKASSSATPLLTTVQATHF 2840
            ..:........:.|..|                                          |||..|
  Rat  2459 SVLMGDKLENLSTDDYL------------------------------------------VQAVPF 2481

  Fly  2841 NFYTSSEIFQKMLDRPLEKKSGRCYAPSGPKRRLIYFVNDLNMPEVDAYGTVQPHTIMRQFMDYR 2905
            ||||:|.:.|.:|::||||||||.|.|.|.| :||||::|:||||||.||||.|||::||.||:|
  Rat  2482 NFYTTSAMLQGVLEKPLEKKSGRNYGPPGTK-KLIYFIDDMNMPEVDKYGTVAPHTLIRQHMDHR 2545

  Fly  2906 QWYDRQRLQLKDIRHCQFAACMNPTAGSFTIDPRLQRHFCVFSVAPPGEDTLHHIYGSILSSHL- 2969
            .|||||:|.|||:.:||:.||||||:||||||||||||||||:|:.||.:.|..||.:||:.|| 
  Rat  2546 HWYDRQKLTLKDVHNCQYVACMNPTSGSFTIDPRLQRHFCVFAVSFPGHEALITIYNTILAQHLS 2610

  Fly  2970 --ESPSQGFTKEIRSIGSLLVRVGIALHRRVEYAFLPTALKFHYLFNLRDLTGIYQGLMNSVGAP 3032
              .:||     .|:.:.|.||...:|||::|...|||||:||||:||||||:.|:||::.|.   
  Rat  2611 YRSAPS-----VIQRLCSHLVTAALALHQKVAATFLPTAIKFHYIFNLRDLSNIFQGILFST--- 2667

  Fly  3033 ASAGGGGASGFGGTICSRPSELMRLYVHEAFRVYHDRLVDPYDIKSFKSSIRDIFKKDFEDFDED 3097
                        ..|...|.:::||::|||.|||.|::||..|.::.:.......||.|:|..|:
  Rat  2668 ------------LEILRTPLDIVRLWLHEAERVYGDKMVDEKDQETLRRVTMASTKKFFDDLGEE 2720

  Fly  3098 FVFAEPLIYSHFAQSLVDQKYMPLKSWDSLYQLLIEAQASYNEVVGYMNLVLFEDAMIHVCRINR 3162
            .:||:|.|:.||.|.:.|.||.|:.....|.:||.:...|||||...|||||||||:.|:|||||
  Rat  2721 HLFAKPNIFCHFTQGIGDPKYFPVTDVAHLNKLLKDVLDSYNEVNAVMNLVLFEDAVAHICRINR 2785

  Fly  3163 ILESPRGNALLIGVGGSGKQTLARLAAFISSLNVSQIQIKRGFGLLDMREEIGNLYMKVGLKNLA 3227
            |||||||||||:||||||||:|:||||:||:|:|.||.:|:|:.:.|::.::...|:|..:||:.
  Rat  2786 ILESPRGNALLVGVGGSGKQSLSRLAAYISALDVFQITLKKGYAIPDLKMDLAAQYIKSAVKNVP 2850

  Fly  3228 SVFLISDAQIPDESILMLINDLLASGEIPELFNDDQLDTITNGIRNEVKQSGTLDTKENCWRYFV 3292
            ||||::|:|:.:|..|:||||||||||||.||.||.|:.|.:.:|.:||..|..||:|.||::|:
  Rat  2851 SVFLMTDSQVAEEQFLVLINDLLASGEIPGLFGDDDLENIISSMRPQVKSLGMTDTREACWKFFI 2915

  Fly  3293 EKVRRLLKVVLCFSPVGQTLRVRARKFPAIISRTAIDWFHEWPKSALESVSQKFLNEINGILEPA 3357
            ||||:.|||:|||||||..||||||||||:::.||||||||||:.||.|||.:||.|..|| :|.
  Rat  2916 EKVRKQLKVILCFSPVGSVLRVRARKFPAVVNCTAIDWFHEWPEDALVSVSARFLQETQGI-QPE 2979

  Fly  3358 LVPPIGCFMAYVHGTVNQISRIYLQNEKRYNYTTPKTFLEYIFLYRKLLVDKNGEFAERIARLQS 3422
            :...|..||:|||.|||::|:.||..|:||||||||||||.|.||:.||..|..|...:|.||::
  Rat  2980 VKTSISLFMSYVHTTVNEMSKTYLATERRYNYTTPKTFLEQIKLYQNLLAKKRMELVAKIERLEN 3044

  Fly  3423 GMSKLAECARQVDTLKHQLAIQEVQLAAKNAAADKLIVIVSAESEKVKRERYIASEEEKRVRIIE 3487
            |:.||...|.|||.||.:||:||.:|..||..|||||.:|..|:|||.:|:.||.|||.:|.:|.
  Rat  3045 GLMKLQSTASQVDDLKAKLAVQEAELKQKNENADKLIQVVGVETEKVSKEKAIADEEEIKVEVIN 3109

  Fly  3488 EDVSIKTKMCEEDLRQAEPALVAAQAALNTLNKNNLTELKSFGSPPKAVVNVCAAVMVLLASNGK 3552
            ::|:.|.|.||.||.:|||||:|||.||:|||||||||||||||||.|||||.||||:|.|..||
  Rat  3110 KNVTEKQKACETDLAKAEPALLAAQEALDTLNKNNLTELKSFGSPPDAVVNVTAAVMILTAPGGK 3174

  Fly  3553 IPRDRSWKASKLMMVRVDQFLNDLLNYNKDNIHPNIIETLQEYLKDPEFNPDKVVQKSVAAAGLC 3617
            ||:|:||||:|:||.:||.||:.|..::|::|....::..:.|..:|.|:|:.:..||.||||||
  Rat  3175 IPKDKSWKAAKIMMGKVDTFLDSLKRFDKEHIPEACLKAFKPYQGNPTFDPEFIRSKSTAAAGLC 3239

  Fly  3618 AWVINLHRYHQVFLIVGPKQQALQDSHQELLEARERLQYLKAKINNLEAKLAEIQAEFENAVGEK 3682
            :|.||:.|:::|:..|.||:|||::::.||.||:::|..:|.||..|.|.|..:.:.||.|..||
  Rat  3240 SWCINIVRFYEVYCDVAPKRQALEEANAELAEAQDKLSRIKNKIAELNANLNNLTSAFEKATAEK 3304

  Fly  3683 QRCQREADKTAFTIDLAHRLVNGLANENVRWKESVQSLLAKIGTLPGDILLISSFLSYVGCFTRR 3747
            .:||:|||.|...|.||:|||.|||:|||||.|||::..::..||.||:||||:|:||||.||::
  Rat  3305 IKCQQEADATNRVISLANRLVGGLASENVRWAESVENFRSQGVTLCGDVLLISAFVSYVGYFTKK 3369

  Fly  3748 YREELQHKMWLPNFRKIDPHIPHTEGVDTLALFSDDAQIAAWNNEGLPMDRMSTENATILQYSTR 3812
            ||.||..|.|:|....:...||.|||:|.|.|.:|||.:|.|||:|||.|||||||||||..:.|
  Rat  3370 YRNELMEKFWIPYVNNLKVPIPITEGLDPLTLLTDDADVATWNNQGLPSDRMSTENATILCNTER 3434

  Fly  3813 WPLMIDPQLQGIKWIKNRFGTDLVVLRLRQKGFLEALEKSISQGDTVLIEQIEESMDTVLEPLLS 3877
            |||::|.||||||||||::|::|..:||.||.:|:.:|::||:|||:|||.|.|::|.||:|||.
  Rat  3435 WPLIVDAQLQGIKWIKNKYGSELKAIRLGQKSYLDIIEQAISEGDTLLIENIGETVDPVLDPLLG 3499

  Fly  3878 RALIKKGRYLRIGDKEIEFHASFRLILHTKMANPHYKPEMQAQTTLINFTVTPDGLEEQLLAEVV 3942
            |..|||||:::|||||:|:|.|||||||||..|||||||||||.|||||.||.||||:||||.||
  Rat  3500 RNTIKKGRFIKIGDKEVEYHPSFRLILHTKYFNPHYKPEMQAQCTLINFLVTRDGLEDQLLAAVV 3564

  Fly  3943 KIERPDLEQMKTEVTVQQNKFKISLKALEDELLARLASSGENVLDDHALVINLENTKRTVDEIEA 4007
            ..|||||||:|..:|..||:|||.||.|||.|||||:::..|.|.|.|||.|||.||.|.:|||.
  Rat  3565 AKERPDLEQLKANLTKSQNEFKIVLKELEDSLLARLSAASGNFLGDTALVENLETTKHTANEIEE 3629

  Fly  4008 KVREARVTTLQIDDTRNIYRSAAKRAAILYFVLTDLSRINPIYKFSLKSFMNVFRQAIAMAAESK 4072
            ||:||::|..:|::.|..||.||.||::|||:|.||::|||||:||||:|..||.:||.....::
  Rat  3630 KVQEAKITETKINEARENYRPAAARASLLYFILNDLNKINPIYQFSLKAFNVVFEKAIQKTPPAE 3694

  Fly  4073 NYEKRVLHLVESITLQTYRYTLRGLFEADKLTFTSHMTLRILIAAEQVAKDETDFLLRFPHDPTT 4137
            ...:||::|.:.||...|.||.|||||.|||.|.:.:|.::|...:::...|.|||||||.....
  Rat  3695 EVRQRVINLTDEITYSVYMYTARGLFERDKLIFLAQVTFQVLSMKKELNPVELDFLLRFPFKAGV 3759

  Fly  4138 LSPLDFVGRSAWGGIKSLTLIEHFYGIDKDMENYTKRWRKFMASDTPEREQFPGEWKHRTPLQKL 4202
            :||:||:...:|||||:|:.::.|..:|.|:|...|||:|.:.|:.||:|.||.|||::|.||||
  Rat  3760 VSPVDFLQHQSWGGIKALSEMDEFKNLDSDIEGSAKRWKKLVESEAPEKEIFPKEWKNKTALQKL 3824

  Fly  4203 CIIRSLRPDRMTYAMRQFVEQTMGRSYAEIQTPPFGAIFQELNAATPAFFILSPGVDPIRDVERY 4267
            |::|.:||||||||::.|||:.||..:.|.::..|...::|.:.:||.||||||||||::|||..
  Rat  3825 CMVRCMRPDRMTYAVKNFVEEKMGSKFVEGRSVEFSKSYEESSPSTPIFFILSPGVDPLKDVEAL 3889

  Fly  4268 GQRQGFHSESDTLVNISLGQGQELLAEQAIIGALESGQQWVILQNIHLVVNWLPTLEKLIERIVL 4332
            |::.||..::..|.|:|||||||::||.|:..|.|.| .||||||||||..||..|:|.:||.  
  Rat  3890 GKKLGFTIDNGKLHNVSLGQGQEVVAEDALDVAAEKG-HWVILQNIHLVARWLSILDKKVERY-- 3951

  Fly  4333 QSESKGESNFRLFISAEPAPDPQYHVIPQGILESSLKVVNEPPSGMAANLHKAWDNFSQDALETC 4397
              .|....::|:||||||||..:.|:|||||||:::|:.||||:||.||||||.|.|:||.||.|
  Rat  3952 --SSGSHEDYRVFISAEPAPSVETHIIPQGILENAIKITNEPPTGMYANLHKALDLFTQDTLEMC 4014

  Fly  4398 TQEAEFKSILFALCYFHAVAGERRKFGPQGWNKVYPFNIGDLTISSNVLHNYLEGSNRIPWEDLR 4462
            |:|.|||.|||||||||||..||||||.||||:.||||.||||||.|||:||||.:.::||:|||
  Rat  4015 TKEIEFKCILFALCYFHAVVAERRKFGAQGWNRSYPFNNGDLTISINVLYNYLEANPKVPWDDLR 4079

  Fly  4463 YLFGEIMYGGHITDDWDRRLCQTYLEELLQQDLIDGDFELCPGFPAPPNLDFEGYHSYITEMLPE 4527
            |||||||||||||||||||||:|||.|.::.::::|:..|.|||..|||||::|||.||.|.||.
  Rat  4080 YLFGEIMYGGHITDDWDRRLCRTYLIEFIRVEMLEGEVLLAPGFQIPPNLDYKGYHEYIDENLPP 4144

  Fly  4528 ESPLLYGLHPNAEIGFLTTASEQLLRTIFELQPRESELSSHCGAPREELVKIMIDDFLDKLQDEF 4592
            |||.||||||||||||||..||:|.||:.|:||:|::..:..|..|||.||.::||.|:|:.:.|
  Rat  4145 ESPYLYGLHPNAEIGFLTVTSEKLFRTVLEMQPKETDSGAGTGVSREEKVKAVLDDILEKIPETF 4209

  Fly  4593 NLQALLNRVERKTPFVVVALQECERMNALIREIKRSLRELMLGLRGELTITQEMERLDHAIFYDH 4657
            |:..::.:...|||:||||.|||||||.|..|::|||:||.|||:||||||.:||.|..|:|||.
  Rat  4210 NMAEIMAKAAEKTPYVVVAFQECERMNILTNEMRRSLKELNLGLKGELTITTDMEDLSTALFYDT 4274

  Fly  4658 VPAAWARLAYPSMLGLQSWFADLLHRIKELAGWLNDFKLPCAIWLGGLFNPQSFLTAIMQESARK 4722
            ||..|...|||||:||.:|::|||.||:||..|..||.||..:||.|.||||||||||||..|||
  Rat  4275 VPETWVARAYPSMMGLAAWYSDLLQRIRELESWTTDFALPTTVWLAGFFNPQSFLTAIMQSMARK 4339

  Fly  4723 HDLPLDRMLISCDVTKKQKDDVTLPPMEGAFVHDLYMDGASWDCQLNSIVALRPKEMLCAMPVIY 4787
            ::.|||:|.:|.:||||.::|:|.||.||::|:.|:|:||.||.|...|...:.|::...||||:
  Rat  4340 NEWPLDKMCLSVEVTKKTREDMTAPPREGSYVYGLFMEGARWDTQTGVIAEAKLKDLTPVMPVIF 4404

  Fly  4788 IKSIVQEKQELQRVYECPLYKTRSRGNTYVWTFNLKTRERPSRWILGGVALLLQ 4841
            ||:|..::.|.:.:||||:||||.||.||||||||||:|:.::|||..||||||
  Rat  4405 IKAIPVDRMETKNIYECPVYKTRIRGPTYVWTFNLKTKEKAAKWILAAVALLLQ 4458

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
CG3339NP_001036762.2 DHC_N1 276..903 CDD:285571 153/645 (24%)
DHC_N2 1535..1944 CDD:285579 187/415 (45%)
P-loop_NTPase 2095..2324 CDD:304359 198/228 (87%)
P-loop_NTPase 2409..2544 CDD:304359 92/134 (69%)
P-loop_NTPase 2731..3061 CDD:304359 146/332 (44%)
P-loop_NTPase 3138..3406 CDD:304359 165/267 (62%)
MT 3419..3759 CDD:289543 183/339 (54%)
AAA_9 3789..4001 CDD:289547 141/211 (67%)
Dynein_heavy 4142..4832 CDD:281078 396/689 (57%)
Dnah17XP_038943439.1 DHC_N1 187..764 CDD:400611 156/650 (24%)
DHC_N2 1266..1672 CDD:400618 188/417 (45%)
DYN1 1493..4124 CDD:227570 1569/2757 (57%)
AAA_6 1806..2132 CDD:403853 268/325 (82%)
MT 3040..3383 CDD:289543 184/342 (54%)
Dynein_C 4162..4457 CDD:408026 160/294 (54%)


Information from Original Tools:


Tool Simple Score Weighted Score Original Tool Information
BLAST Result Score Score Type Cluster ID
Compara 00.000 Not matched by this tool.
Domainoid 00.000 Not matched by this tool.
eggNOG 00.000 Not matched by this tool.
Hieranoid 1 1.000 - -
Homologene 00.000 Not matched by this tool.
Inparanoid 00.000 Not matched by this tool.
OMA 1 1.010 - - QHG56441
OrthoDB 1 1.010 - - D1463at33208
OrthoFinder 1 1.000 - - FOG0000396
OrthoInspector 00.000 Not matched by this tool.
orthoMCL 1 0.900 - - OOG6_100025
Panther 1 1.100 - - O PTHR10676
Phylome 1 0.910 - -
SonicParanoid 00.000 Not matched by this tool.
SwiftOrtho 1 1.000 - -
TreeFam 00.000 Not matched by this tool.
87.930

Return to query results.
Submit another query.