DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment CG3339 and Dnah12

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_001036762.2 Gene:CG3339 / 43295 FlyBaseID:FBgn0039510 Length:4842 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:XP_063131137.1 Gene:Dnah12 / 252959 RGDID:619990 Length:3962 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:3890 Identity:1209/3890 - (31%)
Similarity:1903/3890 - (48%) Gaps:530/3890 - (13%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly  1225 KMECTADG----------------LEMLERAIRDALADTVAAASAYAAKFQAYAFLWTQQSSEVL 1273
            |||.|.|.                |.::|| |.:.| .||....::.:...|...|.|:....|:
  Rat   327 KMELTFDDDKMEFYPTFQDLEDVVLGLIER-ISETL-QTVQTVPSWLSGTTAPVNLDTELPEHVM 389

  Fly  1274 AACMQTAREQTHHVSAGGYAIMETFKKEIENYNEVHDAID-------QCENRE------------ 1319
            ...:.|.|...|....|   :...:|..:.|||.:.|...       |.||..            
  Rat   390 YWALSTLRIAVHQNLEG---VRAHYKTYVTNYNWLLDGTATKMIERFQSENHTFDEYTEFIERFF 451

  Fly  1320 -------CINGW-----LALDIKPLKYGLLNLACKWSHMCKKWLLRYVQGTLKELNAFIARGFET 1372
                   .:..|     :.||.:.||.||.|.|..::::    ||..:....::.|..|...|||
  Rat   452 SLASEIMLLPQWAHYPMVRLDCEDLKTGLTNKAKAFANI----LLNDIASKHRKENESICSEFET 512

  Fly  1373 LQLHIARQDFAT--LLRVLAIMSEIREREPYADNVFKPLKEIMGLLKTYNVEFEPQLLRGIEQLP 1435
            ::.|..|....|  ::.::|.:.:.|                               ..||:.|.
  Rat   513 IKEHALRVPETTEEMMELIAFIEKAR-------------------------------TTGIQNLA 546

  Fly  1436 QQWQQLKHSSTVKQEALQDTRFHQQQ--RVTALIGLHTCHLQHYARQFQKMPFFRVPCPQVYDVC 1498
            |:.|:.|.    :.....||....|:  .:.|.:.|....:.                 .|:|..
  Rat   547 QRIQESKR----QMGYFLDTFLLSQEDLNLNASVLLWPSKIN-----------------PVFDEN 590

  Fly  1499 DEVYLRLHRFRRQQRLYTRWARLLDIQPPDPATLQFCE-VELRRVKQL----------------- 1545
            ||:.....|.:..:.:..|...:|:|:.......:|.| .||.|::|.                 
  Rat   591 DELIENSKRTKENELIAKREKLILEIEKESRRMEEFTEFAELDRMQQYVADVRHLQKRIQDSEEA 655

  Fly  1546 ------------WDFVRVIE---------------SCIVAWHATP--W-----LLIDTDDMEHEC 1576
                        |:..:..|               :.::.|..|.  |     |.::.:.||.:.
  Rat   656 VQFINKEEELFKWELTKYPELEKLKVTIEPYQKFFNFVLKWQRTEKRWMDGGFLDLNGESMEADI 720

  Fly  1577 KKFTRDL-RTLD--------------KCIR-------------EWAPYVHIVGVLRELVASLR-- 1611
            .:|:|:: :||.              |..|             :.:|.:.:...:.|.:...:  
  Rat   721 DEFSREVFKTLKFFQTKQKKELQEKRKAARKRSLMEEKPEEEPKESPTITMCATVMEQIKVFKEY 785

  Fly  1612 --AITELQNPAITERHWMELMQLTKLSYKCNKSTRLAQLLTLQLQHHEEDIKNTVDRAIKEMTVT 1674
              .::.|.||.:..|||.::.::.......:..|.|.::|.|.|..:.|..:.....|.||.::.
  Rat   786 IPTVSILCNPGMRARHWKQMSEIVGYDLTPDSGTTLRKVLKLNLTPYLESFEVISAGASKEFSLE 850

  Fly  1675 KVLDEIKATWAHLEFELEQHHTRPHIQLLKVSEELIETLDDNQMQLQNISTSKHIEYLLDKLTHW 1739
            :.::.:.|||..:.|.:..:.. ..:.:|...:|:...|||..::.|.:..|..|:...:::..|
  Rat   851 RAMNAMIATWDDISFHISLYRD-TGVYILSSVDEIQAILDDQIIKTQTMRGSPFIKPFENEIKAW 914

  Fly  1740 QKVLGGIDTLIVNWFEVQRKWIYLECIFIGSADIRAQLPADAANFERIDEDFTALLAKVQEVRVV 1804
            :..|..|...|..|.:||.:|:|||.||. |.||..|:|.:...|:.:|..:          :.:
  Rat   915 EDRLIRIQETIDEWLKVQAQWLYLEPIFC-SEDIMQQMPEEGRQFQTVDRHW----------KDI 968

  Fly  1805 MQVVLRHDDVLA--QLLQLQHRLAVCE-------KALNDYLETKRLAFPRFYFISAADLLDILSN 1860
            |:...:...|||  .|..|..:|..|.       |.||.|||.|||.||||:|:|..::|:|||.
  Rat   969 MKFCAKDPKVLAATSLTGLLEKLQNCNDLLDKIMKGLNAYLEKKRLFFPRFFFLSNDEMLEILSE 1033

  Fly  1861 GNNPQVIDRHLIKLFDSILRLQYETNTPNALGMHSKEND--EYVPFVSFDPDQPAFIVCGGRVEL 1923
            ..:|..:..||.|.|:.|.:|::.||. :...|:|.|.:  |.:..:|..       ...|.||.
  Rat  1034 TKDPLRVQPHLKKCFEGIAKLEFLTNL-DIKAMYSSEGERVELISVISTS-------AARGAVEK 1090

  Fly  1924 WLRAIIQQMRSTLHELFRRALRVFGEKPRELWLYDWPAQVALCCSQISWTADVNRSFGCMEEGYE 1988
            ||..:...|..::|::...:...:.|..|:.|:.:||.||.||.||:.||::.........||.:
  Rat  1091 WLIQVEDLMLRSIHDVIAASRLAYPESARKDWVREWPGQVVLCVSQMFWTSETQEVISGGNEGLK 1155

  Fly  1989 GVMKELHKRQIAQLNALINLLLGELSPGDRQKIMTICTIDVHSRDVVGKIIASKVDNSLAFQWQS 2053
            ...|||.    .|||.::.|:.|:||...|..:..:.|||||:||||..:|...|.:...|||.:
  Rat  1156 KYYKELQ----YQLNDIVELVRGKLSKQTRITLGALVTIDVHARDVVMDMIDMGVSHDTDFQWLA 1216

  Fly  2054 QLRHRWDDDQAGSSSGRASTAISCGGGDEDCFANICDAEFRYAYEYLGNTSRLVITPLTDRCYIT 2118
            |||:.|:.:.|.                    ..|.:...:||||||||:.||||||||||||.|
  Rat  1217 QLRYYWEYENAR--------------------VRIVNCNVKYAYEYLGNSPRLVITPLTDRCYRT 1261

  Fly  2119 LTQSLRLRLAGATAGPAGTGKTETTKDLGRALGVMVYVFNCSEQMDYKSCGNIYKGLAQTGAWGC 2183
            |..:..|.|.||..||||||||||||||.:||.|...|||||:.:||.:.|..:||||.:|||.|
  Rat  1262 LIGAFYLNLGGAPEGPAGTGKTETTKDLAKALAVQCVVFNCSDGLDYLAMGKFFKGLASSGAWAC 1326

  Fly  2184 FDEFNRICVEVLSVVAVQVKTIQEAIKMHKTQFIFMGERISLEPSVGIFITMNPGYAGRTELPEN 2248
            |||||||.:|||||||.|:..||.||:.....|:|.|..:.|.|:..:.||||||||||:|||:|
  Rat  1327 FDEFNRIELEVLSVVAQQILCIQRAIQQKLEVFVFEGTELRLNPNCFVAITMNPGYAGRSELPDN 1391

  Fly  2249 LKTLFRPCAMIVPDFALICEIMLMAEGFQDARLLARKFITLYTLCKELLSKQDHYDWGLRAIKSV 2313
            ||.|||..||:||::|||.||.|.:.||.:|:.|:.|.:..|.||.|.||.|.|||:|:||:|:|
  Rat  1392 LKVLFRTVAMMVPNYALIAEISLYSYGFLNAKPLSVKIVMTYRLCSEQLSSQFHYDYGMRAVKAV 1456

  Fly  2314 LVVAGTLKRDDHSRPEDQVLMRALRDFNIPKIVTEDVPIFMGLIGDLFPALDVPRKRVFEFEKTI 2378
            ||.||.||....:..||.:|:|:::|.|.||.::.|:|:|.|:..||||.:.:|.....||.:..
  Rat  1457 LVAAGNLKLKYPNENEDILLLRSIKDVNEPKFLSHDIPLFNGITSDLFPGIKLPEADYQEFLECA 1521

  Fly  2379 RRAVNEIKLQPEEGFLMKVVQLQELLDVRHSVFIVGNAGTGKTKIWQTLRETYRI-------QKL 2436
            ..|.....|||.:.||.|::|..|::.|||...:||.....||::...|.:|..:       .:.
  Rat  1522 YEACETQNLQPVKFFLEKIIQTYEMMIVRHGFMLVGEPFAAKTEVLHILADTLTLMNERNYGDEE 1586

  Fly  2437 KPVCHVLNPKALSNDELFGIVNPTTREWKDGLFSSIMREQANMPPGNPKWIVLDGDIDPMWIESL 2501
            |.:...:|||:::..:|||..:|.:.||.||:.::..||.|.....:.||:|.||.||.:||||:
  Rat  1587 KVMYRTVNPKSITMGQLFGQFDPVSHEWTDGIVANTFREFALAESPDRKWVVFDGPIDTLWIESM 1651

  Fly  2502 NTLMDDNKILTLASNERISLKREMRLLFEVGHLKAATPATVSRAGILYINPQDLGWSPYVSSWLE 2566
            ||::||||.|.|.|.|.|.:..:|.|:||...|..|:||||||.|::|:.|..|||.|.|:|||.
  Rat  1652 NTVLDDNKKLCLMSGEIIQMSPQMSLIFETMDLSQASPATVSRCGMIYLEPSQLGWEPIVASWLN 1716

  Fly  2567 TRVDMIERGILNALFEKYFPCLMQRQRDFRR-----ITPITDMAMIQMTCHLLECLLDSDEGNAD 2626
            :..:.:.......|.::.|..|:|...:|||     :.|..::..:.....|:|.||.:...|  
  Rat  1717 SLKEPLNELEHQNLLKELFNWLVQPSLEFRRKKCKELIPTGNINAVVALTRLIEILLCTVVEN-- 1779

  Fly  2627 GRGRGSATGGAANPHSLHHGELSHEAMVMALETIFVYATVWSFGSALSQDVIIDWHREFHKWWIG 2691
                        :|.|.|     ....:||   .||::.:||.|::...|..:.:.........|
  Rat  1780 ------------DPSSKH-----IRVWIMA---TFVFSLIWSVGASCDTDGRLAFDNFLRSLVTG 1824

  Fly  2692 EFKDIKLP-----------SQGTVFDYQLNVQTL-KFQPWSELAAHQSLEGQIDSETPLQNVLIS 2744
            :.....:|           .:|.|:||...::.. ::..|::|.....:|   |..|.:|::::.
  Rat  1825 KNDKAPMPVFINKWECPFDEKGLVYDYMYELRNRGRWIHWNDLIKSSDIE---DRRTKIQDIIVP 1886

  Fly  2745 TAETIRLAYFLKLLIDRNLACMLVGNSGCGKGAIFRQLFGQYANDQELLEVAVSAATAGDSSHQQ 2809
            |.:|||..:.:.|.|......:.||.:|.||..        |..|:.:             :|.:
  Rat  1887 TMDTIRYTFLMDLCISHAKPLLFVGPTGTGKSV--------YVKDKLM-------------NHLE 1930

  Fly  2810 QSGNPAGAVVVRRKASSSATPLLTTVQATHFNFY------TSSEIFQKMLDRPLEKKSGRCYAPS 2868
                                      :..:|.||      ||:...|.::...|:|:....:.|.
  Rat  1931 --------------------------KGKYFPFYVNFSARTSANQVQNIIMARLDKRRKGVFGPP 1969

  Fly  2869 GPKRRLIYFVNDLNMPEVDAYGTVQPHTIMRQFMDYRQWYDRQ---RLQLKDIRHCQFAACMNPT 2930
            ..| :.:.|::|:|||.::.||...|..::|||.|...|||.:   ::.|.||   :..|.|.|.
  Rat  1970 MGK-KCVVFIDDMNMPSLEKYGAQPPIELLRQFFDCGHWYDLKDTTKITLVDI---ELIAAMGPP 2030

  Fly  2931 AGS-FTIDPRLQRHFCVFSVAPPGEDTLHHIYGSILSSHLESPSQGFTKEIRSIGSLLVRVGIAL 2994
            .|. ..:.||..|||.:.::....::|:..|:.||:..:|.  :..|:.|...:|..:|...:.:
  Rat  2031 GGGRNAVTPRFIRHFNICTINSFSDETMVRIFSSIMMFYLR--THDFSPEYFVLGHQIVSATMEI 2093

  Fly  2995 HRRVEYAFLPTALKFHYLFNLRDLTGIYQG-LMNSVGAPASAGGGGASGFGGTICSRPSELMRLY 3058
            :::.....|||..|.||.|||||.:.:.:| |:....|..|                ...::||:
  Rat  2094 YKQSMGNLLPTPAKSHYTFNLRDFSRVIRGCLLIDKEAIES----------------KHTMIRLF 2142

  Fly  3059 VHEAFRVYHDRLVDPYD----IKSFKSSIRDIFKKDFEDFDEDFVFAEPLIYSHF---------- 3109
            |||..||::|||::..|    ....|:.|:|.||:..|:           ::||.          
  Rat  2143 VHEVLRVFYDRLINDEDRNWLFLLIKNVIKDHFKESLEN-----------VFSHLRRGNSSINEE 2196

  Fly  3110 -AQSLVDQKYM--PLKSWDSLYQLLIEAQASYNEVVGY------------MNLVLFEDAMIHVCR 3159
             .::|:...||  .|:..|.:|..::... .:||||..            ||||:|...:.|:.|
  Rat  2197 DLRNLMFGDYMNPDLEGDDRVYIEILNIH-QFNEVVDQCLDEYNQTHKRRMNLVVFRYVLEHLSR 2260

  Fly  3160 INRILESPRGNALLIGVGGSGKQTLARLAAFISSLNVSQIQIKRGFGLLDMREEIGNLYMKVGLK 3224
            |.|||:...|||||||:||||:|:|..||..::.:.:.|.:|.:.:|:.:.||:|.:|...||:|
  Rat  2261 ICRILKQSGGNALLIGLGGSGRQSLTSLATSMAKMQIFQPEISKSYGMNEWREDIKSLLRNVGVK 2325

  Fly  3225 NLASVFLISDAQIPDESILMLINDLLASGEIPELFNDDQLDTITNGIRNEVKQSGTLDTKEN--- 3286
            ...:||||:|.||.:|:.|..|:.:|.:||:|.:|..|:...:..|:| .|.|.|....:.:   
  Rat  2326 GQKTVFLITDTQIKEEAFLEDIDSVLNTGEVPNIFAADEKQEVMEGVR-PVAQVGNKHGELSPLA 2389

  Fly  3287 CWRYFVEKVRRLLKVVLCFSPVGQTLRVRARKFPAIISRTAIDWFHEWPKSALESVSQKFLN--E 3349
            .:.:||.:.:..|.||:.|||:|...|.|.|:||::|:...||||..||:.|||.|:..||.  |
  Rat  2390 LFAFFVNRCKDNLHVVVAFSPIGDAFRNRLRQFPSLINCCTIDWFQPWPEDALERVAVSFLETVE 2454

  Fly  3350 INGILEPALVPPIGCFMAYVHGTVNQISRIYLQNEKRYNYTTPKTFLEYIFLYRKLLVDKNGEFA 3414
            :..:....:||    ...:.|.::..:|..:|:...|:||.|..::||.|..:|:||..|.....
  Rat  2455 LTEVERHEIVP----ICKHFHTSIMNLSERFLEELGRHNYVTATSYLELIGSFRQLLTKKRQSVM 2515

  Fly  3415 ERIARLQSGMSKLAECARQVDTLKHQLAIQEVQLAAKNAAADKLIVIVSAESEKVKRERYIAS-E 3478
            |...|..:|:.:||....||..:|.:|...:.:|.|......:::.|:..||.:|:.:|.|.. :
  Rat  2516 EAKQRYVNGLDQLAFAESQVGEMKLELVELQPKLEAAKVENARMMQIIEIESAQVEAKRKIVKLD 2580

  Fly  3479 EEKRVRIIEEDVSIKTKMCEEDLRQAEPALVAAQAALNTLNKN--NLTELKSFGSPPKAVVNVCA 3541
            ||......||..::|.: ||.||.:|.|||.||.:||:||.::  ::|.:||..:||..|..|.|
  Rat  2581 EEIASGKAEEAQALKNE-CESDLAEAIPALEAALSALDTLKESPADITIVKSMKNPPAGVKLVMA 2644

  Fly  3542 AVMVL-----------LASNGKIPRDRSWKASKLMMVRVDQFLNDLLNYNKDNIHPNIIETLQ-E 3594
            ||.|:           ..:.|||  ...|..||.::..:: ||.||..|:|:||...:::.:: |
  Rat  2645 AVCVMKDIKPEKISDPSGTGGKI--FDYWGPSKKLLGDMN-FLRDLREYDKENIPVAVMQKIRSE 2706

  Fly  3595 YLKDPEFNPDKVVQKSVAAAGLCAWVINLHRYHQVFLIVGPKQQALQDSHQELLEARERLQYLKA 3659
            ||.:|||:|.||.:.|.||.|||.|::.:..|.:|..:|.||:..|.::.:.|.|..|.|...:.
  Rat  2707 YLTNPEFDPPKVAKASSAAEGLCKWIMAMEVYDRVAKVVAPKKARLAEAQKSLAETMELLNQKRG 2771

  Fly  3660 KINNLEAKLAEIQAEFENAVGEKQRCQREADKTAFTIDLAHRLVNGLANENVRWKESVQSLLAKI 3724
            ::..:|..|..:|..|:....||...:.:.:..|..::.|.:|:.||..|..||.::...|.|..
  Rat  2772 ELAQVEHHLENLQKTFQEKTEEKAALEDQVELCAKKLERATKLIGGLGGEKSRWSQAANDLQATY 2836

  Fly  3725 GTLPGDILLISSFLSYVGCFTRRYREELQHKMWLPNFRKI--DPHIPHTEGVDTLALFSDDAQIA 3787
            ..|.||:|:.:..::|:|.||..:|:|...     ::.|:  :...|.:|.........|..:|.
  Rat  2837 ENLTGDVLVSAGVIAYLGAFTSGFRQECTE-----DWSKLCKEKKFPCSEEFSLSKTLGDPVKIR 2896

  Fly  3788 AWNNEGLPMDRMSTENATILQYSTRWPLMIDPQLQGIKWIKN-RFGTDLVVLRLRQKGFLEALEK 3851
            |||..|||.|..|.:|..|:..|.|||||||||.|..||||| .....|.|::|....::..||.
  Rat  2897 AWNIAGLPTDTFSIDNGVIVNNSRRWPLMIDPQGQANKWIKNSEKDNQLSVIKLSDSDYMRTLEN 2961

  Fly  3852 SISQGDTVLIEQIEESMDTVLEPLLSRALIKKGRY--LRIGDKEIEFHASFRLILHTKMANPHYK 3914
            .|..|..||:|.:.|.:|..|||||.|...|:|..  :|:|:..||:...|:..:.||:.||||.
  Rat  2962 CIQLGTPVLLENVGEDLDPSLEPLLLRQTFKQGGIDCIRLGEVIIEYSFDFKFYITTKLRNPHYM 3026

  Fly  3915 PEMQAQTTLINFTVTPDGLEEQLLAEVVKIERPDLEQMKTEVTVQQNKFKISLKALEDELLARLA 3979
            ||:..:.:|:||.:||:|||:|||..||..|||:||:.:..:.:|....|..||.:|..:|..|:
  Rat  3027 PELATKVSLLNFMITPEGLEDQLLGIVVAKERPELEEERNALILQSAANKKQLKDIETRILETLS 3091

  Fly  3980 SSGENVLDDHALVINLENTKRTVDEIEAKVREARVTTLQIDDTRNIYRSAAKRAAILYFVLTDLS 4044
            .|..|:|:|.:.:..|::.|...:||..|.:.|..|.|:|.::|..||..||.:::|:|.:.||:
  Rat  3092 CSEGNILEDESAIKVLDSAKMMSNEITKKQQVAEKTELKIAESREGYRPIAKHSSVLFFSIADLA 3156

  Fly  4045 RINPIYKFSLKSFMNVFRQAIAMAAESKNYEKRVLHLVESITLQTYRYTLRGLFEADKLTFTSHM 4109
            .|:|:|::||..|:|::..:|..:..||..|||:.:|.:..|...|....|.|||.|||.|:..:
  Rat  3157 NIDPMYQYSLTWFVNLYINSIHDSNRSKILEKRLRYLNDHFTYNLYCNICRSLFEKDKLLFSFLL 3221

  Fly  4110 TLRILIAAEQVAKDETDFLL----------RFPHDPTTLSPLDFVGRSAWGGIKSLTLIEHFYGI 4164
            ...:|:|.:::...|..|||          :.| ||..|..      .:|..|...:.:..|:|:
  Rat  3222 CANLLLAKKEIEYQELMFLLTGGVSLKSAEKNP-DPNWLQD------KSWEEICRASELPVFHGL 3279

  Fly  4165 DKDMENYTKRWRKFMASDTPEREQFPGEW-KHRTPLQKLCIIRSLRPDRMTYAMRQFVEQTMGRS 4228
            .:...|:.:.|.....|..|...:.|... |....|||:.|:|.||||::|.|:..:|...:|:.
  Rat  3280 REHFCNHIREWEDIYNSKEPHNMKLPESMDKTLNELQKIIILRCLRPDKITPAITNYVTDKLGKK 3344

  Fly  4229 YAEIQTPPFGAI--FQELNAATPAFFILSPGVDPIRDVERYGQRQGFHSESDTLVNISLGQGQEL 4291
            :  ::.|||...  :.:.|...|..|:||||.||:..:.::...:..  ..:....|||||||..
  Rat  3345 F--VEPPPFDLTKSYLDSNCTIPLIFVLSPGADPMASLLKFANDKSM--SGNKFQAISLGQGQGP 3405

  Fly  4292 LAEQAIIGALESGQQWVILQNIHLVVNWLPTLEKLIERIVLQSESKGESNFRLFISAEPAPDPQY 4356
            :|.:.|..|:|.| .||.|||.||.|:|:|||||:.|..   |.......|||::::.|:|.   
  Rat  3406 VATKMITAAIEEG-TWVCLQNCHLAVSWMPTLEKICEDF---SPEICNPTFRLWLTSYPSPK--- 3463

  Fly  4357 HVIPQGILESSLKVVNEPPSGMAANLHKAW--DNFSQ-DALETCT-QEAEFKSILFALCYFHAVA 4417
              .|..||::.:|:.||||:|:..||.:::  |..|. :....|. :|..::.:||.:|:|||:.
  Rat  3464 --FPVTILQNGVKMTNEPPTGLRLNLLQSYLSDPISDPEFFNGCPGKELAWEKLLFGVCFFHALV 3526

  Fly  4418 GERRKFGPQGWNKVYPFNIGDLTISSNVLHNYLEGSNRIPWEDLRYLFGEIMYGGHITDDWDRRL 4482
            .||:||||.|||..|.||..||.||...|..::...:.||:|.:.||.||..|||.:||||||||
  Rat  3527 QERKKFGPLGWNIPYGFNESDLRISIRQLQLFINEYDTIPFEAISYLTGECNYGGRVTDDWDRRL 3591

  Fly  4483 CQTYLEELLQQDLIDG-DFELCP--GFPAPPNLDFEGYHSYITEMLPEESPLLYGLHPNAEIGFL 4544
            ..|.|.:.....:|:. .::..|  .:.|||...::.|..:|.::...:.|.::|||.|.:|   
  Rat  3592 LLTMLADFYNSLIIENPHYKFSPSGNYFAPPKGTYDEYIEFIKKLPFTQEPEIFGLHENVDI--- 3653

  Fly  4545 TTASEQLLRT--IFE---LQPRESELSSHCGAPREELVKIMIDDFLDKLQDEFNLQALLN----R 4600
               |:.|.:|  :||   |.....:.:...|:..:.|::| .:|.|.:|.::|:::|.|.    |
  Rat  3654 ---SKDLQQTKLLFESLLLTQGGVKQTGSSGSTDQILLEI-TEDILTQLPNDFDIEAALRSYPVR 3714

  Fly  4601 VERKTPFVVVALQECERMNALIREIKRSLRELMLGLRGELTITQEMERLDHAIFYDHVPAAWARL 4665
            .|.....|:|  ||.||.|.||..|:.:||:|...::|.:.:...:|.|..::....||..||:.
  Rat  3715 YEESMNTVLV--QEMERFNNLIITIRNTLRDLKKAIKGVVVMDSALEALSGSLLIGKVPEMWAQR 3777

  Fly  4666 AYPSMLGLQSWFADLLHRIKELAGWLNDFKLPCAIWLGGLFNPQSFLTAIMQESARKHDLPLDRM 4730
            :|||:..|.|:..|.|.|:|.|..|....| |...|:.|.|..|:|||..||..|||:.:|:|  
  Rat  3778 SYPSLKPLGSYITDFLTRLKFLEDWFTMGK-PNVFWISGFFFTQAFLTGAMQNYARKYTIPID-- 3839

  Fly  4731 LISCDVTKKQKDDVTLPPMEGAFVHDLYMDGASWDCQLNSIVALRPKEMLCAMPVIYIKSIVQEK 4795
            |:..:......|:.|.||.:|.::|.||:|||.|:.....:....||.:...||:|:||..|:.:
  Rat  3840 LLGYEFEVIPSDNATNPPEDGVYIHGLYLDGARWNRTSGLLAEQHPKLLFDLMPIIWIKPNVKTE 3904

  Fly  4796 QELQRVYECPLYKTRSRGNT---------YVWTFNLKTRERPSRWILGGVALLLQ 4841
            ......|.||||||..|..|         :|....|:|......||..|||||.|
  Rat  3905 IVKTDAYVCPLYKTSERKGTLSTTGHSTNFVIAMLLRTELPAQHWIKRGVALLCQ 3959

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
CG3339NP_001036762.2 DHC_N1 279..903 CDD:462457
DHC_N2 1532..1943 CDD:462462 117/505 (23%)
DYN1 1759..4514 CDD:227570 972/2874 (34%)
AAA_6 2095..2421 CDD:463697 171/325 (53%)
MT 3419..3759 CDD:463699 112/354 (32%)
Dynein_C 4545..4840 CDD:465677 103/312 (33%)
Dnah12XP_063131137.1 None
Blue background indicates that the domain is not in the aligned region.

Return to query results.
Submit another query.