DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment CG3339 and Dnah12

DIOPT Version :9

Sequence 1:NP_001036762.2 Gene:CG3339 / 43295 FlyBaseID:FBgn0039510 Length:4842 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:XP_006252733.1 Gene:Dnah12 / 252959 RGDID:619990 Length:3960 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:3888 Identity:1209/3888 - (31%)
Similarity:1901/3888 - (48%) Gaps:528/3888 - (13%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly  1225 KMECTADG----------------LEMLERAIRDALADTVAAASAYAAKFQAYAFLWTQQSSEVL 1273
            |||.|.|.                |.::|| |.:.| .||....::.:...|...|.|:....|:
  Rat   327 KMELTFDDDKMEFYPTFQDLEDVVLGLIER-ISETL-QTVQTVPSWLSGTTAPVNLDTELPEHVM 389

  Fly  1274 AACMQTAREQTHHVSAGGYAIMETFKKEIENYNEVHDAID-------QCENRE------------ 1319
            ...:.|.|...|....|   :...:|..:.|||.:.|...       |.||..            
  Rat   390 YWALSTLRIAVHQNLEG---VRAHYKTYVTNYNWLLDGTATKMIERFQSENHTFDEYTEFIERFF 451

  Fly  1320 -------CINGW-----LALDIKPLKYGLLNLACKWSHMCKKWLLRYVQGTLKELNAFIARGFET 1372
                   .:..|     :.||.:.||.||.|.|..::::    ||..:....::.|..|...|||
  Rat   452 SLASEIMLLPQWAHYPMVRLDCEDLKTGLTNKAKAFANI----LLNDIASKHRKENESICSEFET 512

  Fly  1373 LQLHIARQDFAT--LLRVLAIMSEIREREPYADNVFKPLKEIMGLLKTYNVEFEPQLLRGIEQLP 1435
            ::.|..|....|  ::.::|.:.:.|                               ..||:.|.
  Rat   513 IKEHALRVPETTEEMMELIAFIEKAR-------------------------------TTGIQNLA 546

  Fly  1436 QQWQQLKHSSTVKQEALQDTRFHQQQ--RVTALIGLHTCHLQHYARQFQKMPFFRVPCPQVYDVC 1498
            |:.|:.|.    :.....||....|:  .:.|.:.|....:.                 .|:|..
  Rat   547 QRIQESKR----QMGYFLDTFLLSQEDLNLNASVLLWPSKIN-----------------PVFDEN 590

  Fly  1499 DEVYLRLHRFRRQQRLYTRWARLLDIQPPDPATLQFCE-VELRRVKQL----------------- 1545
            ||:.....|.:..:.:..|...:|:|:.......:|.| .||.|::|.                 
  Rat   591 DELIENSKRTKENELIAKREKLILEIEKESRRMEEFTEFAELDRMQQYVADVRHLQKRIQDSEEA 655

  Fly  1546 ------------WDFVRVIE---------------SCIVAWHATP--W-----LLIDTDDMEHEC 1576
                        |:..:..|               :.::.|..|.  |     |.::.:.||.:.
  Rat   656 VQFINKEEELFKWELTKYPELEKLKVTIEPYQKFFNFVLKWQRTEKRWMDGGFLDLNGESMEADI 720

  Fly  1577 KKFTRDL-RTLD--------------KCIR-------------EWAPYVHIVGVLRELVASLR-- 1611
            .:|:|:: :||.              |..|             :.:|.:.:...:.|.:...:  
  Rat   721 DEFSREVFKTLKFFQTKQKKELQEKRKAARKRSLMEEKPEEEPKESPTITMCATVMEQIKVFKEY 785

  Fly  1612 --AITELQNPAITERHWMELMQLTKLSYKCNKSTRLAQLLTLQLQHHEEDIKNTVDRAIKEMTVT 1674
              .::.|.||.:..|||.::.::.......:..|.|.::|.|.|..:.|..:.....|.||.::.
  Rat   786 IPTVSILCNPGMRARHWKQMSEIVGYDLTPDSGTTLRKVLKLNLTPYLESFEVISAGASKEFSLE 850

  Fly  1675 KVLDEIKATWAHLEFELEQHHTRPHIQLLKVSEELIETLDDNQMQLQNISTSKHIEYLLDKLTHW 1739
            :.::.:.|||..:.|.:..:.. ..:.:|...:|:...|||..::.|.:..|..|:...:::..|
  Rat   851 RAMNAMIATWDDISFHISLYRD-TGVYILSSVDEIQAILDDQIIKTQTMRGSPFIKPFENEIKAW 914

  Fly  1740 QKVLGGIDTLIVNWFEVQRKWIYLECIFIGSADIRAQLPADAANFERIDEDFTALLAKVQEVRVV 1804
            :..|..|...|..|.:||.:|:|||.||. |.||..|:|.:...|:.:|..:          :.:
  Rat   915 EDRLIRIQETIDEWLKVQAQWLYLEPIFC-SEDIMQQMPEEGRQFQTVDRHW----------KDI 968

  Fly  1805 MQVVLRHDDVLA--QLLQLQHRLAVCE-------KALNDYLETKRLAFPRFYFISAADLLDILSN 1860
            |:...:...|||  .|..|..:|..|.       |.||.|||.|||.||||:|:|..::|:|||.
  Rat   969 MKFCAKDPKVLAATSLTGLLEKLQNCNDLLDKIMKGLNAYLEKKRLFFPRFFFLSNDEMLEILSE 1033

  Fly  1861 GNNPQVIDRHLIKLFDSILRLQYETNTPNALGMHSKEND--EYVPFVSFDPDQPAFIVCGGRVEL 1923
            ..:|..:..||.|.|:.|.:|::.||. :...|:|.|.:  |.:..:|..       ...|.||.
  Rat  1034 TKDPLRVQPHLKKCFEGIAKLEFLTNL-DIKAMYSSEGERVELISVISTS-------AARGAVEK 1090

  Fly  1924 WLRAIIQQMRSTLHELFRRALRVFGEKPRELWLYDWPAQVALCCSQISWTADVNRSFGCMEEGYE 1988
            ||..:...|..::|::...:...:.|..|:.|:.:||.||.||.||:.||::.........||.:
  Rat  1091 WLIQVEDLMLRSIHDVIAASRLAYPESARKDWVREWPGQVVLCVSQMFWTSETQEVISGGNEGLK 1155

  Fly  1989 GVMKELHKRQIAQLNALINLLLGELSPGDRQKIMTICTIDVHSRDVVGKIIASKVDNSLAFQWQS 2053
            ...|||.    .|||.::.|:.|:||...|..:..:.|||||:||||..:|...|.:...|||.:
  Rat  1156 KYYKELQ----YQLNDIVELVRGKLSKQTRITLGALVTIDVHARDVVMDMIDMGVSHDTDFQWLA 1216

  Fly  2054 QLRHRWDDDQAGSSSGRASTAISCGGGDEDCFANICDAEFRYAYEYLGNTSRLVITPLTDRCYIT 2118
            |||:.|:.:.|.                    ..|.:...:||||||||:.||||||||||||.|
  Rat  1217 QLRYYWEYENAR--------------------VRIVNCNVKYAYEYLGNSPRLVITPLTDRCYRT 1261

  Fly  2119 LTQSLRLRLAGATAGPAGTGKTETTKDLGRALGVMVYVFNCSEQMDYKSCGNIYKGLAQTGAWGC 2183
            |..:..|.|.||..||||||||||||||.:||.|...|||||:.:||.:.|..:||||.:|||.|
  Rat  1262 LIGAFYLNLGGAPEGPAGTGKTETTKDLAKALAVQCVVFNCSDGLDYLAMGKFFKGLASSGAWAC 1326

  Fly  2184 FDEFNRICVEVLSVVAVQVKTIQEAIKMHKTQFIFMGERISLEPSVGIFITMNPGYAGRTELPEN 2248
            |||||||.:|||||||.|:..||.||:.....|:|.|..:.|.|:..:.||||||||||:|||:|
  Rat  1327 FDEFNRIELEVLSVVAQQILCIQRAIQQKLEVFVFEGTELRLNPNCFVAITMNPGYAGRSELPDN 1391

  Fly  2249 LKTLFRPCAMIVPDFALICEIMLMAEGFQDARLLARKFITLYTLCKELLSKQDHYDWGLRAIKSV 2313
            ||.|||..||:||::|||.||.|.:.||.:|:.|:.|.:..|.||.|.||.|.|||:|:||:|:|
  Rat  1392 LKVLFRTVAMMVPNYALIAEISLYSYGFLNAKPLSVKIVMTYRLCSEQLSSQFHYDYGMRAVKAV 1456

  Fly  2314 LVVAGTLKRDDHSRPEDQVLMRALRDFNIPKIVTEDVPIFMGLIGDLFPALDVPRKRVFEFEKTI 2378
            ||.||.||....:..||.:|:|:::|.|.||.::.|:|:|.|:..||||.:.:|.....||.:..
  Rat  1457 LVAAGNLKLKYPNENEDILLLRSIKDVNEPKFLSHDIPLFNGITSDLFPGIKLPEADYQEFLECA 1521

  Fly  2379 RRAVNEIKLQPEEGFLMKVVQLQELLDVRHSVFIVGNAGTGKTKIWQTLRETYRI-------QKL 2436
            ..|.....|||.:.||.|::|..|::.|||...:||.....||::...|.:|..:       .:.
  Rat  1522 YEACETQNLQPVKFFLEKIIQTYEMMIVRHGFMLVGEPFAAKTEVLHILADTLTLMNERNYGDEE 1586

  Fly  2437 KPVCHVLNPKALSNDELFGIVNPTTREWKDGLFSSIMREQANMPPGNPKWIVLDGDIDPMWIESL 2501
            |.:...:|||:::..:|||..:|.:.||.||:.::..||.|.....:.||:|.||.||.:||||:
  Rat  1587 KVMYRTVNPKSITMGQLFGQFDPVSHEWTDGIVANTFREFALAESPDRKWVVFDGPIDTLWIESM 1651

  Fly  2502 NTLMDDNKILTLASNERISLKREMRLLFEVGHLKAATPATVSRAGILYINPQDLGWSPYVSSWLE 2566
            ||::||||.|.|.|.|.|.:..:|.|:||...|..|:||||||.|::|:.|..|||.|.|:|||.
  Rat  1652 NTVLDDNKKLCLMSGEIIQMSPQMSLIFETMDLSQASPATVSRCGMIYLEPSQLGWEPIVASWLN 1716

  Fly  2567 TRVDMIERGILNALFEKYFPCLMQRQRDFRR-----ITPITDMAMIQMTCHLLECLLDSDEGNAD 2626
            :..:.:.......|.::.|..|:|...:|||     :.|..::..:.....|:|.||.:...|  
  Rat  1717 SLKEPLNELEHQNLLKELFNWLVQPSLEFRRKKCKELIPTGNINAVVALTRLIEILLCTVVEN-- 1779

  Fly  2627 GRGRGSATGGAANPHSLHHGELSHEAMVMALETIFVYATVWSFGSALSQDVIIDWHREFHKWWIG 2691
                        :|.|.|     ....:||   .||::.:||.|::...|..:.:.........|
  Rat  1780 ------------DPSSKH-----IRVWIMA---TFVFSLIWSVGASCDTDGRLAFDNFLRSLVTG 1824

  Fly  2692 EFKDIKLP-----------SQGTVFDYQLNVQTL-KFQPWSELAAHQSLEGQIDSETPLQNVLIS 2744
            :.....:|           .:|.|:||...::.. ::..|::|.....:|   |..|.:|::::.
  Rat  1825 KNDKAPMPVFINKWECPFDEKGLVYDYMYELRNRGRWIHWNDLIKSSDIE---DRRTKIQDIIVP 1886

  Fly  2745 TAETIRLAYFLKLLIDRNLACMLVGNSGCGKGAIFRQLFGQYANDQELLEVAVSAATAGDSSHQQ 2809
            |.:|||..:.:.|.|......:.||.:|.||..        |..|:.:             :|.:
  Rat  1887 TMDTIRYTFLMDLCISHAKPLLFVGPTGTGKSV--------YVKDKLM-------------NHLE 1930

  Fly  2810 QSGNPAGAVVVRRKASSSATPLLTTVQATHFNFY------TSSEIFQKMLDRPLEKKSGRCYAPS 2868
                                      :..:|.||      ||:...|.::...|:|:....:.|.
  Rat  1931 --------------------------KGKYFPFYVNFSARTSANQVQNIIMARLDKRRKGVFGPP 1969

  Fly  2869 GPKRRLIYFVNDLNMPEVDAYGTVQPHTIMRQFMDYRQWYDRQ---RLQLKDIRHCQFAACMNPT 2930
            ..| :.:.|::|:|||.::.||...|..::|||.|...|||.:   ::.|.||   :..|.|.|.
  Rat  1970 MGK-KCVVFIDDMNMPSLEKYGAQPPIELLRQFFDCGHWYDLKDTTKITLVDI---ELIAAMGPP 2030

  Fly  2931 AGS-FTIDPRLQRHFCVFSVAPPGEDTLHHIYGSILSSHLESPSQGFTKEIRSIGSLLVRVGIAL 2994
            .|. ..:.||..|||.:.::....::|:..|:.||:..:|.  :..|:.|...:|..:|...:.:
  Rat  2031 GGGRNAVTPRFIRHFNICTINSFSDETMVRIFSSIMMFYLR--THDFSPEYFVLGHQIVSATMEI 2093

  Fly  2995 HRRVEYAFLPTALKFHYLFNLRDLTGIYQG-LMNSVGAPASAGGGGASGFGGTICSRPSELMRLY 3058
            :::.....|||..|.||.|||||.:.:.:| |:....|..|                ...::||:
  Rat  2094 YKQSMGNLLPTPAKSHYTFNLRDFSRVIRGCLLIDKEAIES----------------KHTMIRLF 2142

  Fly  3059 VHEAFRVYHDRLVDPYD----IKSFKSSIRDIFKKDFEDFDEDFVFAEPLIYSHF---------- 3109
            |||..||::|||::..|    ....|:.|:|.||:..|:           ::||.          
  Rat  2143 VHEVLRVFYDRLINDEDRNWLFLLIKNVIKDHFKESLEN-----------VFSHLRRGNSSINEE 2196

  Fly  3110 -AQSLVDQKYM--PLKSWDSLYQLLIEAQASYNEVVGY------------MNLVLFEDAMIHVCR 3159
             .::|:...||  .|:..|.:|..::... .:||||..            ||||:|...:.|:.|
  Rat  2197 DLRNLMFGDYMNPDLEGDDRVYIEILNIH-QFNEVVDQCLDEYNQTHKRRMNLVVFRYVLEHLSR 2260

  Fly  3160 INRILESPRGNALLIGVGGSGKQTLARLAAFISSLNVSQIQIKRGFGLLDMREEIGNLYMKVGLK 3224
            |.|||:...|||||||:||||:|:|..||..::.:.:.|.:|.:.:|:.:.||:|.:|...||:|
  Rat  2261 ICRILKQSGGNALLIGLGGSGRQSLTSLATSMAKMQIFQPEISKSYGMNEWREDIKSLLRNVGVK 2325

  Fly  3225 NLASVFLISDAQIPDESILMLINDLLASGEIPELFNDDQLDTITNGIRNEVKQSGTLDTKEN--- 3286
            ...:||||:|.||.:|:.|..|:.:|.:||:|.:|..|:...:..|:| .|.|.|....:.:   
  Rat  2326 GQKTVFLITDTQIKEEAFLEDIDSVLNTGEVPNIFAADEKQEVMEGVR-PVAQVGNKHGELSPLA 2389

  Fly  3287 CWRYFVEKVRRLLKVVLCFSPVGQTLRVRARKFPAIISRTAIDWFHEWPKSALESVSQKFLN--E 3349
            .:.:||.:.:..|.||:.|||:|...|.|.|:||::|:...||||..||:.|||.|:..||.  |
  Rat  2390 LFAFFVNRCKDNLHVVVAFSPIGDAFRNRLRQFPSLINCCTIDWFQPWPEDALERVAVSFLETVE 2454

  Fly  3350 INGILEPALVPPIGCFMAYVHGTVNQISRIYLQNEKRYNYTTPKTFLEYIFLYRKLLVDKNGEFA 3414
            :..:....:||    ...:.|.::..:|..:|:...|:||.|..::||.|..:|:||..|.....
  Rat  2455 LTEVERHEIVP----ICKHFHTSIMNLSERFLEELGRHNYVTATSYLELIGSFRQLLTKKRQSVM 2515

  Fly  3415 ERIARLQSGMSKLAECARQVDTLKHQLAIQEVQLAAKNAAADKLIVIVSAESEKVKRERYIAS-E 3478
            |...|..:|:.:||....||..:|.:|...:.:|.|......:::.|:..||.:|:.:|.|.. :
  Rat  2516 EAKQRYVNGLDQLAFAESQVGEMKLELVELQPKLEAAKVENARMMQIIEIESAQVEAKRKIVKLD 2580

  Fly  3479 EEKRVRIIEEDVSIKTKMCEEDLRQAEPALVAAQAALNTLNKNNLTELKSFGSPPKAVVNVCAAV 3543
            ||......||..::|.: ||.||.:|.|||.||.:||:||...::|.:||..:||..|..|.|||
  Rat  2581 EEIASGKAEEAQALKNE-CESDLAEAIPALEAALSALDTLKPADITIVKSMKNPPAGVKLVMAAV 2644

  Fly  3544 MVL-----------LASNGKIPRDRSWKASKLMMVRVDQFLNDLLNYNKDNIHPNIIETLQ-EYL 3596
            .|:           ..:.|||  ...|..||.::..:: ||.||..|:|:||...:::.:: |||
  Rat  2645 CVMKDIKPEKISDPSGTGGKI--FDYWGPSKKLLGDMN-FLRDLREYDKENIPVAVMQKIRSEYL 2706

  Fly  3597 KDPEFNPDKVVQKSVAAAGLCAWVINLHRYHQVFLIVGPKQQALQDSHQELLEARERLQYLKAKI 3661
            .:|||:|.||.:.|.||.|||.|::.:..|.:|..:|.||:..|.::.:.|.|..|.|...:.::
  Rat  2707 TNPEFDPPKVAKASSAAEGLCKWIMAMEVYDRVAKVVAPKKARLAEAQKSLAETMELLNQKRGEL 2771

  Fly  3662 NNLEAKLAEIQAEFENAVGEKQRCQREADKTAFTIDLAHRLVNGLANENVRWKESVQSLLAKIGT 3726
            ..:|..|..:|..|:....||...:.:.:..|..::.|.:|:.||..|..||.::...|.|....
  Rat  2772 AQVEHHLENLQKTFQEKTEEKAALEDQVELCAKKLERATKLIGGLGGEKSRWSQAANDLQATYEN 2836

  Fly  3727 LPGDILLISSFLSYVGCFTRRYREELQHKMWLPNFRKI--DPHIPHTEGVDTLALFSDDAQIAAW 3789
            |.||:|:.:..::|:|.||..:|:|...     ::.|:  :...|.:|.........|..:|.||
  Rat  2837 LTGDVLVSAGVIAYLGAFTSGFRQECTE-----DWSKLCKEKKFPCSEEFSLSKTLGDPVKIRAW 2896

  Fly  3790 NNEGLPMDRMSTENATILQYSTRWPLMIDPQLQGIKWIKN-RFGTDLVVLRLRQKGFLEALEKSI 3853
            |..|||.|..|.:|..|:..|.|||||||||.|..||||| .....|.|::|....::..||..|
  Rat  2897 NIAGLPTDTFSIDNGVIVNNSRRWPLMIDPQGQANKWIKNSEKDNQLSVIKLSDSDYMRTLENCI 2961

  Fly  3854 SQGDTVLIEQIEESMDTVLEPLLSRALIKKGRY--LRIGDKEIEFHASFRLILHTKMANPHYKPE 3916
            ..|..||:|.:.|.:|..|||||.|...|:|..  :|:|:..||:...|:..:.||:.||||.||
  Rat  2962 QLGTPVLLENVGEDLDPSLEPLLLRQTFKQGGIDCIRLGEVIIEYSFDFKFYITTKLRNPHYMPE 3026

  Fly  3917 MQAQTTLINFTVTPDGLEEQLLAEVVKIERPDLEQMKTEVTVQQNKFKISLKALEDELLARLASS 3981
            :..:.:|:||.:||:|||:|||..||..|||:||:.:..:.:|....|..||.:|..:|..|:.|
  Rat  3027 LATKVSLLNFMITPEGLEDQLLGIVVAKERPELEEERNALILQSAANKKQLKDIETRILETLSCS 3091

  Fly  3982 GENVLDDHALVINLENTKRTVDEIEAKVREARVTTLQIDDTRNIYRSAAKRAAILYFVLTDLSRI 4046
            ..|:|:|.:.:..|::.|...:||..|.:.|..|.|:|.::|..||..||.:::|:|.:.||:.|
  Rat  3092 EGNILEDESAIKVLDSAKMMSNEITKKQQVAEKTELKIAESREGYRPIAKHSSVLFFSIADLANI 3156

  Fly  4047 NPIYKFSLKSFMNVFRQAIAMAAESKNYEKRVLHLVESITLQTYRYTLRGLFEADKLTFTSHMTL 4111
            :|:|::||..|:|::..:|..:..||..|||:.:|.:..|...|....|.|||.|||.|:..:..
  Rat  3157 DPMYQYSLTWFVNLYINSIHDSNRSKILEKRLRYLNDHFTYNLYCNICRSLFEKDKLLFSFLLCA 3221

  Fly  4112 RILIAAEQVAKDETDFLL----------RFPHDPTTLSPLDFVGRSAWGGIKSLTLIEHFYGIDK 4166
            .:|:|.:::...|..|||          :.| ||..|..      .:|..|...:.:..|:|:.:
  Rat  3222 NLLLAKKEIEYQELMFLLTGGVSLKSAEKNP-DPNWLQD------KSWEEICRASELPVFHGLRE 3279

  Fly  4167 DMENYTKRWRKFMASDTPEREQFPGEW-KHRTPLQKLCIIRSLRPDRMTYAMRQFVEQTMGRSYA 4230
            ...|:.:.|.....|..|...:.|... |....|||:.|:|.||||::|.|:..:|...:|:.: 
  Rat  3280 HFCNHIREWEDIYNSKEPHNMKLPESMDKTLNELQKIIILRCLRPDKITPAITNYVTDKLGKKF- 3343

  Fly  4231 EIQTPPFGAI--FQELNAATPAFFILSPGVDPIRDVERYGQRQGFHSESDTLVNISLGQGQELLA 4293
             ::.|||...  :.:.|...|..|:||||.||:..:.::...:..  ..:....|||||||..:|
  Rat  3344 -VEPPPFDLTKSYLDSNCTIPLIFVLSPGADPMASLLKFANDKSM--SGNKFQAISLGQGQGPVA 3405

  Fly  4294 EQAIIGALESGQQWVILQNIHLVVNWLPTLEKLIERIVLQSESKGESNFRLFISAEPAPDPQYHV 4358
            .:.|..|:|.| .||.|||.||.|:|:|||||:.|..   |.......|||::::.|:|.     
  Rat  3406 TKMITAAIEEG-TWVCLQNCHLAVSWMPTLEKICEDF---SPEICNPTFRLWLTSYPSPK----- 3461

  Fly  4359 IPQGILESSLKVVNEPPSGMAANLHKAW--DNFSQ-DALETCT-QEAEFKSILFALCYFHAVAGE 4419
            .|..||::.:|:.||||:|:..||.:::  |..|. :....|. :|..::.:||.:|:|||:..|
  Rat  3462 FPVTILQNGVKMTNEPPTGLRLNLLQSYLSDPISDPEFFNGCPGKELAWEKLLFGVCFFHALVQE 3526

  Fly  4420 RRKFGPQGWNKVYPFNIGDLTISSNVLHNYLEGSNRIPWEDLRYLFGEIMYGGHITDDWDRRLCQ 4484
            |:||||.|||..|.||..||.||...|..::...:.||:|.:.||.||..|||.:||||||||..
  Rat  3527 RKKFGPLGWNIPYGFNESDLRISIRQLQLFINEYDTIPFEAISYLTGECNYGGRVTDDWDRRLLL 3591

  Fly  4485 TYLEELLQQDLIDG-DFELCP--GFPAPPNLDFEGYHSYITEMLPEESPLLYGLHPNAEIGFLTT 4546
            |.|.:.....:|:. .::..|  .:.|||...::.|..:|.::...:.|.::|||.|.:|     
  Rat  3592 TMLADFYNSLIIENPHYKFSPSGNYFAPPKGTYDEYIEFIKKLPFTQEPEIFGLHENVDI----- 3651

  Fly  4547 ASEQLLRT--IFE---LQPRESELSSHCGAPREELVKIMIDDFLDKLQDEFNLQALLN----RVE 4602
             |:.|.:|  :||   |.....:.:...|:..:.|::| .:|.|.:|.::|:::|.|.    |.|
  Rat  3652 -SKDLQQTKLLFESLLLTQGGVKQTGSSGSTDQILLEI-TEDILTQLPNDFDIEAALRSYPVRYE 3714

  Fly  4603 RKTPFVVVALQECERMNALIREIKRSLRELMLGLRGELTITQEMERLDHAIFYDHVPAAWARLAY 4667
            .....|:|  ||.||.|.||..|:.:||:|...::|.:.:...:|.|..::....||..||:.:|
  Rat  3715 ESMNTVLV--QEMERFNNLIITIRNTLRDLKKAIKGVVVMDSALEALSGSLLIGKVPEMWAQRSY 3777

  Fly  4668 PSMLGLQSWFADLLHRIKELAGWLNDFKLPCAIWLGGLFNPQSFLTAIMQESARKHDLPLDRMLI 4732
            ||:..|.|:..|.|.|:|.|..|....| |...|:.|.|..|:|||..||..|||:.:|:|  |:
  Rat  3778 PSLKPLGSYITDFLTRLKFLEDWFTMGK-PNVFWISGFFFTQAFLTGAMQNYARKYTIPID--LL 3839

  Fly  4733 SCDVTKKQKDDVTLPPMEGAFVHDLYMDGASWDCQLNSIVALRPKEMLCAMPVIYIKSIVQEKQE 4797
            ..:......|:.|.||.:|.::|.||:|||.|:.....:....||.:...||:|:||..|:.:..
  Rat  3840 GYEFEVIPSDNATNPPEDGVYIHGLYLDGARWNRTSGLLAEQHPKLLFDLMPIIWIKPNVKTEIV 3904

  Fly  4798 LQRVYECPLYKTRSRGNT---------YVWTFNLKTRERPSRWILGGVALLLQ 4841
            ....|.||||||..|..|         :|....|:|......||..|||||.|
  Rat  3905 KTDAYVCPLYKTSERKGTLSTTGHSTNFVIAMLLRTELPAQHWIKRGVALLCQ 3957

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
CG3339NP_001036762.2 DHC_N1 276..903 CDD:285571
DHC_N2 1535..1944 CDD:285579 116/503 (23%)
P-loop_NTPase 2095..2324 CDD:304359 138/228 (61%)
P-loop_NTPase 2409..2544 CDD:304359 53/141 (38%)
P-loop_NTPase 2731..3061 CDD:304359 81/340 (24%)
P-loop_NTPase 3138..3406 CDD:304359 102/284 (36%)
MT 3419..3759 CDD:289543 112/352 (32%)
AAA_9 3789..4001 CDD:289547 89/214 (42%)
Dynein_heavy 4142..4832 CDD:281078 236/717 (33%)
Dnah12XP_006252733.1 DHC_N2 679..1110 CDD:285579 109/450 (24%)
P-loop_NTPase 1238..1468 CDD:304359 138/229 (60%)
P-loop_NTPase 1552..1695 CDD:304359 54/142 (38%)
P-loop_NTPase 1875..2145 CDD:304359 81/338 (24%)
P-loop_NTPase 2246..2507 CDD:304359 98/265 (37%)
MT 2519..2864 CDD:289543 112/348 (32%)
AAA_9 2896..3110 CDD:289547 88/213 (41%)
Dynein_heavy 3251..3948 CDD:281078 240/728 (33%)
Blue background indicates that the domain is not in the aligned region.


Information from Original Tools:


Tool Simple Score Weighted Score Original Tool Information
BLAST Result Score Score Type Cluster ID
Compara 00.000 Not matched by this tool.
Domainoid 00.000 Not matched by this tool.
eggNOG 00.000 Not matched by this tool.
Hieranoid 00.000 Not matched by this tool.
Homologene 00.000 Not matched by this tool.
Inparanoid 00.000 Not matched by this tool.
OMA 00.000 Not matched by this tool.
OrthoDB 00.000 Not matched by this tool.
OrthoFinder 00.000 Not matched by this tool.
OrthoInspector 00.000 Not matched by this tool.
orthoMCL 1 0.900 - - OOG6_100025
Panther 00.000 Not matched by this tool.
Phylome 1 0.910 - -
SonicParanoid 00.000 Not matched by this tool.
SwiftOrtho 1 1.000 - -
TreeFam 00.000 Not matched by this tool.
32.810

Return to query results.
Submit another query.