DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment CG3339 and Dnah8

DIOPT Version :9

Sequence 1:NP_001036762.2 Gene:CG3339 / 43295 FlyBaseID:FBgn0039510 Length:4842 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:XP_038955254.1 Gene:Dnah8 / 207117 RGDID:619986 Length:4727 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:5171 Identity:1412/5171 - (27%)
Similarity:2374/5171 - (45%) Gaps:857/5171 - (16%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly     1 MSDAAAMASSDEEGL--PAGSTSGRQRVQRDYSDARLERVAAYTTTTMRLKPDKWTK-MMACDDL 62
            |:|..::..||||..  |....||:.||:...:...::.|.:...:....:..|:.: |....:|
  Rat    78 MTDYRSLIPSDEEITMPPEDDESGQGRVRARLAPRPVQSVLSDGLSQSSRRSSKFRRSMTGIPNL 142

  Fly    63 RRIVVEWQ-------HGHRRVLVMTLSP-------------GGDLVP-----RSCLS-DLYLPYS 101
            :..:.|.|       .|.|    |.:.|             |.|||.     ..|.| |.:..:.
  Rat   143 QETLKEKQARFREAREGRR----MKIDPSYKYIFEILGEKLGLDLVSVEELILDCPSLDAFSSFF 203

  Fly   102 VQSARGSIPSAMLPAEDEAMATVTAAVSAVVSATPGALLIPLPPASSSFTTLDGVPRG------- 159
            .:.  ||.....|..|.:.                        |......|:.|||:|       
  Rat   204 EKG--GSKTLKFLYQEGDV------------------------PGLECGRTITGVPKGGKMMRLY 242

  Fly   160 -----------KCAYFVR-RNTSDGPLTASNFAESVLYGDFPVHSKIETMSLLFDDVLQPLLEQA 212
                       .|.:||| ||                  |..::||     .:::|||..:|:.:
  Rat   243 IDNAAPEKLKELCLFFVRCRN------------------DVAINSK-----TIYEDVLFTVLDAS 284

  Fly   213 QSQ------------WPAIVRKDLQARIKEVRNTLTE--IKGKTNNRTIL-----SLLVSPTIV- 257
            :..            .|||:.......:.:.:...:|  |..:|.||.:|     ::.:..|:: 
  Rat   285 KGLLKGIKNMLKNIFLPAILATGNWGALNQSKQGESEKHIFTETINRYLLFLDGATISIEGTVML 349

  Fly   258 --------------EEVFAHVSQGHLRPALDPKFRNLLEEMFINWTTQMHDIVLE----RSECQP 304
                          |||.|..|...:        .:.||::.:.|..|:..:::|    |.|...
  Rat   350 KKVDNIDFSKLHTFEEVTAAASSSEM--------VHQLEDVLMMWYKQIEQVLIESEQMRKEADD 406

  Fly   305 LGSTTQSAGHQPKYITLVSLPAQEIGFWTNRKLNLQNIYEQLRESTHKTLAQILERIESVYYEPY 369
            .|                  |..|:..|.........|.||::..:.|.:..:|.          
  Rat   407 SG------------------PLTELEHWKRMSAKFNYIIEQIKGPSCKAVINVLN---------- 443

  Fly   370 ATAFRKLVAAWL-----------EAQDVSLWL-------QPLLRQTAAFNSVQFSNGHDLVAPLV 416
             .|..||:..|.           |::|...:|       |||..    ::.|..::|   :..|:
  Rat   444 -VAHSKLLKNWRDLDARITDTANESKDNVRYLYTLEKVCQPLYN----YDLVSMAHG---IQNLI 500

  Fly   417 HIVHLVWSNARYYRSTQRMSVLLRCICNMLVHRAAEDLELQLLFQGDADEGLLKI--NRTIAVLE 479
            :.:.::.|.:|||.:::||:.|...:.|.:|......:         .|.|...:  ..|.|||:
  Rat   501 NAIRMIHSVSRYYNTSERMTSLFIKVTNQMVTACKAYI---------TDGGTNHVWDQETPAVLK 556

  Fly   480 LFKQRMLDYKERYAGSQVLLPALSEGAAAVASSPSPDDQQQLWRFCHEDVFGQTLDGFSLQLLEL 544
            ..:..:..:||..|........:.|     :|.....:..:::.|...:.|.:.|:..: :::.:
  Rat   557 KIQDCIFLFKEYQASFHKTRKQILE-----SSGEKSFEVSEMYIFGKFEAFCKRLEKIT-EMITI 615

  Fly   545 RQVFEAAVQFQQLEKLEVGGLRGKILTERVREIFGEFKVLFEQWSNVDIDLTATVASKWKCFRRE 609
            .|.: :|:....:|.:::.|::.|.:.:.:::  .::.:|..:.:..|.|.:.            
  Rat   616 VQTY-SALSNSTIEGIDILGIKFKNIYQGIKK--NQYDILDPRRTEFDTDFSD------------ 665

  Fly   610 QTLFFSRMQLLEQKLATVLLQAFEQCHSWMHLLRLTLMFG---------SLLQR------EAVRP 659
               |..::..||     :.:|||           :.:.||         .||||      ..::.
  Rat   666 ---FMGKINTLE-----IQIQAF-----------MNITFGKILSSQQALQLLQRFQKLNMPCLQL 711

  Fly   660 ELARVLPHILFIYDTEME--------QLEDSVGEVLLGYEIRGLAALPLANNFPPIANAMMWLEQ 716
            |:...:..||..|..|:|        |.:|.                |||.|.||||..::|:.|
  Rat   712 EINHTIERILQCYVAELEATKKLYHSQKDDP----------------PLARNMPPIAGKILWVRQ 760

  Fly   717 HISRCDEFGAKELSQLVEQLLKEKSELQTLPIQWNSLLSRRNILTTKLSNLQMKIWISWHECVDK 781
            ...|        :::.:....|....|.:  |:..:::.:.|    |:|.:.::..:.:|....|
  Rat   761 LYRR--------INEPINYFFKNSDILSS--IEGKAVIRQYN----KISYVLVEFEVVYHTAWVK 811

  Fly   782 LIIQ---GLDESVLSRSQDLSQLHLNFSQVLFTLLKETKYLLALQATGSLSGDLFQLPEPLLTLY 843
            .|.|   .|..::..|..:..:|.:||...:..:::|||.::.::.      |:.:..:.||.| 
  Rat   812 EISQLQYALQATLFVRHPETGKLLVNFDPKILEVVRETKCMIKMKL------DVPEQAKKLLKL- 869

  Fly   844 GHRDAYWERRIRLIKIG-----EFYNGIRSGECAAAELQLIRNDLASIDEHVEVACQQLTWRNYN 903
                   |.:::..|:.     ::|:.: ..|..:..:.|:...:..::..:......|||.:..
  Rat   870 -------ESKLKADKLYLQGLLQYYDDL-CQEVPSVFVNLMTPKMKKVESVLRQGLTVLTWSSLM 926

  Fly   904 DELVAGIFEQSRDLFARLQQSHGNL-----DAILASMRRW------------SREPLHQRSLYGR 951
            .|......|...|:|.:|.:...:|     |.:|..:.:.            ..:.|.....|.:
  Rat   927 LESFFKEVESVLDMFNQLLKKVNDLCEMHIDTVLKEIAKTLLISLSDSGATRVEDMLTLNETYTK 991

  Fly   952 NLLDL-----RHQQDRVRLRLLQCDETKMLLNRLLIANFC-------------LFFNYESQEFQL 998
            ...|:     ||.::.|:       |..::..::....:.             :.|..|:.|.:.
  Rat   992 EWADILNHKSRHVEEAVK-------ELILIFEQIYEVKYTGKPAKPVPEQRKHVVFGSEADEGES 1049

  Fly   999 Y-------SRDLSVQEFIREFPEEQRRQYNKYLASVDELICREVREAMRISLEYLYKEMTATATA 1056
            .       :||:...:...||.:|.:..|    |.....:...:::|.|:||:.:.|.:.     
  Rat  1050 LEYDPDSTARDVDNNDKEDEFKKECKEVY----AFFSHQLLDSLQKATRLSLDTMKKRIF----- 1105

  Fly  1057 TTTPTAPPVDPGCSAGMARLVLQQITTPQATSTAGAGASGAPPTANDAPLFEVKLELTETEIRFS 1121
                                               .|..|...:.:.....:.::.|....:...
  Rat  1106 -----------------------------------VGNQGRKRSEDVVSFIKTEVHLAIPNVVMV 1135

  Fly  1122 PAFDASVENNFQQIVE---QLLLDIKQTCDCMPRIVA---------DNAPSEDDEDDDTATVDYE 1174
            |:.|     :.||.:.   ||.|::.       |.||         ..:|.......|..:: ..
  Rat  1136 PSLD-----DIQQAINRMIQLTLEVS-------RGVAHWGQQQVRRTKSPQTSSRGSDQPSI-MG 1187

  Fly  1175 QELRWEPREDRA--QELQERKKKDLELEQEQGDPKPQAVQFNLLAAAKAYSQKMECTADGLEMLE 1237
            :.|:   :|:|:  :.:..||.|:.               :..:|..|..|:.:...:..:..|.
  Rat  1188 KALK---KEERSFEESIPARKLKNF---------------YPGVAEHKDISKLVLLLSSSVNSLR 1234

  Fly  1238 RAIRDALADTVAAASAYAAKFQAYAFLWTQ----QSSEVLA--ACMQTAREQTHHVSAGGYAIME 1296
            :|..:||.|           ||.|..|||:    :..|.||  ..:...|.:..|     ||   
  Rat  1235 KAATEALQD-----------FQKYKTLWTEDRDVKVKEFLANNPSLTEIRSEILH-----YA--- 1280

  Fly  1297 TFKKEIENYNEVHDAIDQCENRECINGWLALDIKPLKYGLLNLACKWSHMCKKWLLRYVQGTLKE 1361
            ||::|||....:.|.           |.|.|..:|:|..|...|..|..:..::|....:..:.:
  Rat  1281 TFEQEIEELKPIIDV-----------GALELHTEPMKLALSIEAKAWKMLLCRYLNEEYKKKMSD 1334

  Fly  1362 LNAFIARGFETLQLHIARQDFATLLRVLAIMSEIREREPYADNVFKPLKEIMGLLKTYNVEFEPQ 1426
            :..||....:.|...|  :|...:...:..:|.||:.|...|....|::|..|:|..:.||...:
  Rat  1335 MIVFINEYLKKLSRPI--RDLDDVRFAMEALSCIRDNEIQMDMTLGPIEEAYGILNRFEVEVTKE 1397

  Fly  1427 LLRGIEQLPQQWQQLKHSSTVKQEALQDTRFHQQQRVTALIGLHTCHL---------QHYARQFQ 1482
            ...|::.|...:.:|:.    |..::||.....|.:..:.: |.:..:         :.|..:..
  Rat  1398 ESEGVDTLRYSFNKLQS----KAVSVQDELVQVQPKFKSSL-LESVDVFREDVINFTEAYETEGP 1457

  Fly  1483 KMPFFRVPCPQVYDVCDEVYLRLHRFR-------RQQRLYTRWARLLDIQPPDPATLQFCEVELR 1540
            .:|  .:| ||      |...||..|:       |:...|:...:|..:...|...|.....||.
  Rat  1458 MVP--NIP-PQ------EASNRLQIFQANFDDLWRKFVTYSAGEQLFGLPVTDYEVLHKTRKELN 1513

  Fly  1541 RVKQLWDFVRVIESCIVAWHATPWLLIDTDDMEHECKKFTRDLRTLDKCIREWAPYVHIVGVLRE 1605
            .:::|:.....:...|..::...|..:|.:.:..|..:|....|.|.|.:::|..|:.:...:.:
  Rat  1514 LLQKLYGLYDTVMGSISGYYEILWGDVDIEKINAELLEFQNRCRKLPKGLKDWQAYLDLKKRIDD 1578

  Fly  1606 LVASLRAITELQNPAITERHWMELMQLTKLSYKCNKST-RLAQLLTLQLQHHEEDIKNTVDRAIK 1669
            ...|...:..:.|.|:.:|||..:.:||...:.....| .|..::...|..:::||::....|||
  Rat  1579 FSESCPLLEMMTNKAMKQRHWDRISELTGTPFDVESDTFCLRNIMEAPLLKNKDDIEDICISAIK 1643

  Fly  1670 EMTVTKVLDEIKATWAHLEFELEQHHTRPHIQLLKVSE--ELIETLDDNQMQLQNISTSKHIEYL 1732
            |..:...:.::...|.:..........:..: |||.:|  |:|..::|:.|.|.::.::::....
  Rat  1644 EKDIEAKMTQVIENWTNQNLSFSAFKGKGEL-LLKGTESGEIITLMEDSLMVLGSLLSNRYNTPF 1707

  Fly  1733 LDKLTHWQKVLGGIDTLIVNWFEVQRKWIYLECIFIGSADIRAQLPADAANFERIDEDFTALLAK 1797
            ...:.:|...|.....:|..|..||..|:|||.:|:| .||..|||.:|..|:.||:.:..::.:
  Rat  1708 KKTIQNWVYKLSTSSDIIEEWLVVQNLWVYLEAVFVG-GDIAKQLPQEAKRFQNIDKSWVKIMQR 1771

  Fly  1798 VQEVRVVMQVVLRHDDVLAQLL-QLQHRLAVCEKALNDYLETKRLAFPRFYFISAADLLDILSNG 1861
            ..|...|:...: .|:.:.||| .|..:|.||:|:|..|||.|||.||||:|:|...||:||...
  Rat  1772 AHENPNVISCCV-GDETMGQLLPHLHEQLEVCQKSLTGYLEKKRLLFPRFFFVSDPVLLEILGQA 1835

  Fly  1862 NNPQVIDRHLIKLFDSILRLQYETNTPNALGMHSKENDEYVPFVSFDP-----DQPAFIVCGGRV 1921
            ::...|..||..:.|:|          |.:..|.|:.|.....:|.:.     |.|  ::..|.|
  Rat  1836 SDSHTIQPHLPAVSDNI----------NEVTFHPKDYDRMTAVISREGEKIMLDTP--VMAKGPV 1888

  Fly  1922 ELWLRAIIQQMRSTLHELFRRALRVFGEKPREL--WLYDWPAQVALCCSQISWTADVNRSFGCME 1984
            |:||..:::...|:||.:.|.|.....:....|  :|..:||||.|...|:.||.|...:....:
  Rat  1889 EIWLLDLLKVQMSSLHNIIRSAFYQISDSGFLLLPFLNHFPAQVGLLGIQMLWTHDSEEALNSAK 1953

  Fly  1985 EGYEGVMKELHKRQIAQLNALINLLLGELSPGDRQKIMTICTIDVHSRDVVGKIIASKVDNSLAF 2049
            :..: :|...:::.:..||.||:....:|:..||.|..|:.||.||.||:...::...:.:...|
  Rat  1954 DDRK-IMHITNQKFLDILNTLISQTTHDLTKFDRVKFETLITIHVHQRDIFDDLVKMHIKSVTDF 2017

  Fly  2050 QWQSQLRHRWDDDQAGSSSGRASTAISCGGGDEDCFANICDAEFRYAYEYLGNTSRLVITPLTDR 2114
            :|..|.|..:.:|.                  :....:|.|.:|.|..|:||.|.||||||||||
  Rat  2018 EWLKQSRFYFKEDL------------------DQTVVSITDVDFNYQNEFLGCTDRLVITPLTDR 2064

  Fly  2115 CYITLTQSLRLRLAGATAGPAGTGKTETTKDLGRALGVMVYVFNCSEQMDYKSCGNIYKGLAQTG 2179
            |||||.|:|.:.:.||.||||||||||||||:||.||..|.|||||:|||::..|.|:|||||:|
  Rat  2065 CYITLAQALGMNMGGAPAGPAGTGKTETTKDMGRCLGKYVVVFNCSDQMDFRGLGRIFKGLAQSG 2129

  Fly  2180 AWGCFDEFNRICVEVLSVVAVQVKTIQEAIKMHKTQFIFM-GERISLEPSVGIFITMNPGYAGRT 2243
            :||||||||||.:.||||.|.|:..:..|.|..|.||||. |:.:.|.|..|||:|||||||||.
  Rat  2130 SWGCFDEFNRIELPVLSVAAQQIYIVLTARKERKKQFIFSDGDCVDLNPEFGIFLTMNPGYAGRQ 2194

  Fly  2244 ELPENLKTLFRPCAMIVPDFALICEIMLMAEGFQDARLLARKFITLYTLCKELLSKQDHYDWGLR 2308
            |||||||..||..||:|||..:|..:.|.:.||.:..:||:||..||.||:|.|:||.|||:|||
  Rat  2195 ELPENLKIQFRTVAMMVPDRQIIMRVKLASCGFLENVILAQKFYVLYKLCEEQLTKQVHYDFGLR 2259

  Fly  2309 AIKSVLVVAGTLKRDDHSRPEDQVL---MRALRDFNIPKIVTEDVPIFMGLIGDLFPALDVPRKR 2370
            .|.|||...|:.||   :||||..|   ||.|||.|:.|:|.||.|:|:.||.||||.|.:....
  Rat  2260 NILSVLRTLGSQKR---ARPEDSELSTVMRGLRDMNLSKLVDEDEPLFLSLINDLFPGLQLDSNT 2321

  Fly  2371 VFEFEKTIRRAVNEIKLQPEEGFLMKVVQLQELLDVRHSVFIVGNAGTGKTKI----WQTLRETY 2431
            ..|.:..:...||...|.....:.:|:|||.|...|||.:..:|.:|:|||.:    .::|.|..
  Rat  2322 YAELQAAVDNQVNLEGLINHPPWNLKLVQLYETSLVRHGLMTLGPSGSGKTTVITILMKSLTECG 2386

  Fly  2432 RIQKLKPVCHVLNPKALSNDELFGIVNPTTREWKDGLFSSIMREQANMPPGNPKWIVLDGDIDPM 2496
            |..:...    :||||::..::||.::..|.:|.||:||::.|:......|...:::|||.:|.:
  Rat  2387 RPHREMR----MNPKAITAPQMFGRLDTATNDWTDGIFSTLWRKTLKAKKGENIFLILDGPVDAI 2447

  Fly  2497 WIESLNTLMDDNKILTLASNERISLKREMRLLFEVGHLKAATPATVSRAGILYINPQDLGWSPYV 2561
            |||:||:::||||.||||:.:||.:....:|||||.:::.|:||||||.|::||:...|.|.|.:
  Rat  2448 WIENLNSVLDDNKTLTLANGDRIPMAPTCKLLFEVHNIENASPATVSRMGMVYISSSALSWRPIL 2512

  Fly  2562 SSWLETRVDMIERGILNALFEKYFPCLMQRQRDFRRITPITDMAMIQ-----MTCHLLECLLDSD 2621
            .:||:.|........| :|::|.|    :....:.::..|..|.:::     .:.:|||.|:.|.
  Rat  2513 QAWLKRRTQQEATAFL-SLYDKVF----EDAYTYMKLNLIPKMQLLECNYITQSLNLLEGLIPSK 2572

  Fly  2622 EGNADGRGRGSATGGAANPHSLHHGELSHEAMVMALETIFVYATVWSFGSALSQDVIIDWHREFH 2686
            |           .||.::...||              .:||:..:||.|:.|.    ::...:..
  Rat  2573 E-----------EGGVSSVDHLH--------------KLFVFGLMWSLGALLE----LESREKLE 2608

  Fly  2687 KWWIGEFKDIKLP-----SQGTVFDYQLNVQTLKFQPWSELAAHQSLEGQ-----IDSETPLQNV 2741
            .:..|....:.||     |..|::::.:.    .:..|.    |.:...|     .||.....::
  Rat  2609 VFLRGHESKLNLPEIAKDSHHTMYEFYVT----DYGDWE----HWNKRLQPYFYPTDSIPEYSSI 2665

  Fly  2742 LISTAETIRLAYFLKLLIDRNLACMLVGNSGCGKGAIFRQLFGQYANDQELLEVAVSAATAGDSS 2806
            |:...:.||..:.:..:..::.|.:|.|..|..|..:.:....:|..:.:|              
  Rat  2666 LVPNVDNIRTNFLIDTIAKQHKAVLLTGEQGTAKTVMVKAYLKKYDPEVQL-------------- 2716

  Fly  2807 HQQQSGNPAGAVVVRRKASSSATPLLTTVQATHFNFYTSSE--IFQKMLDRPLEKKSGRCYAPSG 2869
                                          :...||.:::|  :||:.::..::|:.|..|.|.|
  Rat  2717 ------------------------------SKSLNFSSATEPMMFQRTIESYVDKRMGSTYGPPG 2751

  Fly  2870 PKRRLIYFVNDLNMPEVDAYGTVQPHTIMRQFMDYRQWYDRQR----LQLKDIRHCQFAACMNPT 2930
             .|::..|::|:|||.::.:|....:.|:||.|:....|...:    ..:.|::  ..||.::|.
  Rat  2752 -GRKMTVFIDDINMPVINEWGDQITNEIVRQMMEMEGMYSLDKPGDFTTIVDVQ--LIAAMIHPG 2813

  Fly  2931 AGSFTIDPRLQRHFCVFSVAPPGEDTLHHIYGSILSSHLESPSQGFTKEIRSIGSLLVRVGIALH 2995
            .|...|..||:|.|.||:...|...::..|:|.|...:.: |.:.|..||..:...||.||..|.
  Rat  2814 GGRNDIPQRLKRQFTVFNCTLPSNTSIDKIFGIIGCGYFD-PCRKFRPEICDMIGNLVSVGRVLW 2877

  Fly  2996 RRVEYAFLPTALKFHYLFNLRDLTGIYQGLMNSVGAPASAGGGGASGFGGTI----CSRPSELMR 3056
            :..:...|||..||||:||||||:.|:||::                   ||    |.....||.
  Rat  2878 QWTKVKMLPTPSKFHYIFNLRDLSRIWQGML-------------------TIKAEECKTIPILMA 2923

  Fly  3057 LYVHEAFRVYHDRLVDPYDIKSFKSS-IRDI--------------------FKKDFE----DFDE 3096
            |:.||..||..||.:.|.|.:.|.:. ||.:                    |.:|..    |..|
  Rat  2924 LFKHECNRVIADRFITPDDEQWFNTQLIRAVEENISPEVAASINPEPYFVDFLRDMPEPTGDEPE 2988

  Fly  3097 DFVFAEPLIYSHFAQSLVDQKYMPLKSWDSLYQLLIEAQASYNEVV--GYMNLVLFEDAMIHVCR 3159
            |.:|..|.||          :.:|  |::.|.:.|...|..:||::  ..::||.|:|||.|:.:
  Rat  2989 DTMFEVPKIY----------ELVP--SFEFLCEKLQFYQKQFNEIIRGTSLDLVFFKDAMTHLIK 3041

  Fly  3160 INRILESPRGNALLIGVGGSGKQTLARLAAFISSLNVSQIQIKRGFGLLDMREEIGNLYMKVGLK 3224
            |:||:.:..|||||:||||||||:|:|||:||:...:.||.:.|.:.:.::.:::.|||...|..
  Rat  3042 ISRIIRTSCGNALLVGVGGSGKQSLSRLASFIAGYQIFQITLTRSYNVSNLIDDLKNLYKVAGAD 3106

  Fly  3225 NLASVFLISDAQIPDESILMLINDLLASGEIPELFNDDQLDTITNGIRNEVKQS-----GTLDTK 3284
            .....|:.:|.:|.||:.|..:|:||:||||..||..|:||.||.|:.:.:|:.     .|.|  
  Rat  3107 GKGITFIFTDNEIKDEAFLEYLNNLLSSGEISNLFARDELDEITQGLISVMKRELPRHPPTFD-- 3169

  Fly  3285 ENCWRYFVEKVRRLLKVVLCFSPVGQTLRVRARKFPAIISRTAIDWFHEWPKSALESVSQKFLNE 3349
             |.:.||:.:.||.|.|||||||||:..|.|:.|||.:||...:|||..|||.||.:|:..||::
  Rat  3170 -NLYEYFISRSRRNLHVVLCFSPVGEKFRARSLKFPGLISGCTMDWFSRWPKEALIAVASYFLSD 3233

  Fly  3350 INGI----LEPALVPPIGCFMAYVHGTVNQISRIYLQNEKRYNYTTPKTFLEYIFLYRKLLVDKN 3410
            .|.:    ::..:|..:|.|    |..|::....|.|..:|..:.|||::|.:|..|:.:..:|.
  Rat  3234 YNIVCSMEIKRHVVEAMGLF----HDMVSESCENYFQRYRRRAHVTPKSYLSFINGYKNIYTEKV 3294

  Fly  3411 GEFAERIARLQSGMSKLAECARQVDTLKHQLAIQEVQLAAKNAAADKLI--VIVSAE-SEKVKRE 3472
            ....|:..|:..|:.||.|.:..|..|...||::|.:||..:..||:::  |.|||: |.|||.|
  Rat  3295 KYINEQAERMNIGLDKLMEASESVAKLSQDLAVKEKELAVASVKADEVLAEVTVSAQASAKVKNE 3359

  Fly  3473 RYIASEEEKRVRIIEEDVSIKTKMCEEDLRQAEPALVAAQAALNTLNKNNLTELKSFGSPPKAVV 3537
              :...::|..:|::|..|.|.| .|..|..|:|||..|:|||||:..|::..::....||..::
  Rat  3360 --VQEVKDKAQKIVDEIDSEKVK-AESKLEAAKPALEEAEAALNTIKPNDIATVRKLAKPPHLIM 3421

  Fly  3538 NVCAAVMVLLASN-GKIPRD-------RSWKASKLMMVRVDQFLNDLLNYNKDNIHPNIIETLQE 3594
            .:...|::|.... ..:..|       .||..| |.::....||..|..:.||.|:...:|.||.
  Rat  3422 RIMDCVLLLFQKKIDPVTMDPEKPCCKPSWGES-LKLMSATGFLFSLQQFPKDTINEETVELLQP 3485

  Fly  3595 YLKDPEFNPDKVVQKSVA-----AAGLCAWVINLHRYHQVFLIVGPKQQALQDSHQELLEARERL 3654
            |     ||.|....:|..     .|||.:|.:.:..::.:...|.|.:..|......|..|...|
  Rat  3486 Y-----FNMDDYTYESAKKVCGNVAGLLSWTLAMAIFYGINREVLPLKANLAKQEGRLAVANAEL 3545

  Fly  3655 QYLKAKINNLEAKLAEIQAEFENAVGEKQRCQREADKTAFTIDLAHRLVNGLANENVRWKESVQS 3719
            ...:|.::..:|:|.::||:|:.|:.||.....:||.....:..|..|::||:.|.|||.:..:.
  Rat  3546 GKAQALLDEKQAELDKVQAKFDAAMNEKMDLLNDADMCRKKMQAASTLIDGLSGEKVRWTQQSKE 3610

  Fly  3720 LLAKIGTLPGDILLISSFLSYVGCFTRRYREELQHKMWLPNF--RKIDPHIPHTEGVDTLALFSD 3782
            ..|:|..|.||:||.:.||||:|.|.:.:|..|....|....  ||    ||.||.::.:|:..|
  Rat  3611 FKAQINRLVGDVLLCTGFLSYLGPFNQIFRNYLLKDQWELEMKARK----IPFTENLNLIAMLVD 3671

  Fly  3783 DAQIAAWNNEGLPMDRMSTENATILQYSTRWPLMIDPQLQGIKWIKNR-FGTDLVVLRLRQKGFL 3846
            ...|..|..:|||.|.:|.:|..|:..:||:||:||||.||..|||:: ...||.|..|..|.|.
  Rat  3672 PPTIGEWGLQGLPGDDLSIQNGIIVTKATRYPLLIDPQTQGKTWIKSKEKENDLQVTSLNHKYFR 3736

  Fly  3847 EALEKSISQGDTVLIEQIEESMDTVLEPLLSRALIKKGR--YLRIGDKEIEFHASFRLILHTKMA 3909
            ..||.|:|.|..:|||.|.|.:|..|:.:|.:..||.|.  .:::||||.:...:|:|.:.||:.
  Rat  3737 THLEDSLSLGRPLLIEDIREELDPALDNVLEKNFIKSGTAFKVKVGDKECDIMDTFKLYITTKLP 3801

  Fly  3910 NPHYKPEMQAQTTLINFTVTPDGLEEQLLAEVVKIERPDLEQMKTEVTVQQNKFKISLKALEDEL 3974
            ||.:.||:.|:|::|:||||..|||.|||..|:..|:.:||..:.::.......|..:|.|||.|
  Rat  3802 NPAFTPEINAKTSVIDFTVTMKGLENQLLRRVILTEKQELESERVKLLEDVTFNKRKMKELEDNL 3866

  Fly  3975 LARLASSGENVLDDHALVINLENTKRTVDEIEAKVREARVTTLQIDDTRNIYRSAAKRAAILYFV 4039
            |.:|:::..:::||.:|:..|..||:|..|:..|:..|..|.::|:..:..:|.||.|.:||||:
  Rat  3867 LYKLSTTQGSLVDDESLIGVLRITKQTAAEVSEKLHVAAETEIKINTAQEEFRPAATRGSILYFL 3931

  Fly  4040 LTDLSRINPIYKFSLKSFMNVFRQAIAMAAESKNYEKRVLHLVESITLQTYRYTLRGLFEADKLT 4104
            :|::|.:|.:|:.||..|:.:|.|::|.:.:|...:||:.:::|.:|.:.:.|::|||:|..|..
  Rat  3932 ITEMSMVNIMYQTSLAQFLKLFDQSMARSEKSPLPQKRITNIIEYLTYEVFTYSVRGLYENHKFL 3996

  Fly  4105 FTSHMTLRILIAAEQVAKDETDFLLR----FPHDPTTLSPLDFVGRSAWGGIKSLTLIEHFYGID 4165
            |...|||:|.:....|...|...|::    .........|..::....|..:..|:.:..|..|.
  Rat  3997 FALLMTLKIDLQRGTVKHKEFQALIKGGAALDLKACPPKPFRWILDMTWLNLVELSKLPQFAEIM 4061

  Fly  4166 KDMENYTKRWRKFMASDTPEREQFPGEWKHR-TPLQKLCIIRSLRPDRMTYAMRQFVEQTMGRSY 4229
            ..:....|.|:.:...|.||.|..|..:... ...:||.:|||..|||..:..|:::..::...|
  Rat  4062 NQISRNEKGWKNWFDKDAPEEEIIPDGYNDSLDTCRKLLLIRSWCPDRTVFQARKYIADSLEEKY 4126

  Fly  4230 AEIQTPPFGAIFQELNAATPAFFILSPGVDPIRDVERYGQRQGFHSESDTLVNISLGQGQELLAE 4294
            .|.........::|.:..||....||.|.||...::...::......:     ||:|||||:.|.
  Rat  4127 TEPVILNLEKTWEESDTHTPLICFLSMGSDPTIQIDALAKKLKLECRT-----ISMGQGQEVHAR 4186

  Fly  4295 QAIIGALESGQQWVILQNIHLVVNWLPTLEKLIERIVLQSESKGESNFRLFISAEPAPDPQYHVI 4359
            :.:..:::.| .||:|||.||   .|..:|:|:|.:::...:  |.:||::|:.||     :...
  Rat  4187 KLVQLSMQQG-GWVLLQNCHL---GLEFMEELLETLMVTETT--EDSFRVWITTEP-----HDRF 4240

  Fly  4360 PQGILESSLKVVNEPPSGMAANLHKAWDNFSQDALETCTQEAEFKSILFALCYFHAVAGERRKFG 4424
            |..:|::|||..||||.|:.|.|.:.:...:||.|: .:....:|.:|:.:.:.|:...||||||
  Rat  4241 PITLLQTSLKFTNEPPQGVRAGLKRTFAGINQDLLD-ISNLPMWKPMLYTVAFLHSTVQERRKFG 4304

  Fly  4425 PQGWNKVYPFNIGDLTISSNVLHNYLEG---SNRIPWEDLRYLFGEIMYGGHITDDWDRRLCQTY 4486
            |.|||..|.||..|.:.|...:.|:|:.   ...:.|..:||:.||:.|||.:|||:|:||...:
  Rat  4305 PLGWNIPYEFNSADFSASVQFIQNHLDECDIKKGVSWSTVRYMIGEVQYGGRVTDDFDKRLLNCF 4369

  Fly  4487 LEELLQQDLIDGDFELCPGFPAPPNLDFEGYHSYITEMLPEESPLLYGLHPNAEIGFLTTASEQL 4551
            ......:.:.:..|....|:..|.....:.|..||..:...::|.::||||||:|.:.:..:..:
  Rat  4370 ARVWFSEKMFEPSFCFYTGYKIPVCKTLDQYFEYIQSLPSLDNPEVFGLHPNADITYQSNTASDV 4434

  Fly  4552 LRTIFELQPRESELSSHCGAPREELVKIMIDDFLDKLQDEF---NLQALLNRVERKTPFVVVALQ 4613
            |.||..:||:||  ....|..||.:|..:.:|.|.||...:   .::|.|.::.......:...|
  Rat  4435 LETITNIQPKES--GGGMGETREAIVYRLSEDMLSKLPPNYVAHEVKARLMKMGHLNSMNIFLRQ 4497

  Fly  4614 ECERMNALIREIKRSLRELMLGLRGELTITQEM-ERLDHAIFYD-HVPAAWARLAY-PSMLGLQS 4675
            |.:||..:|..::.||.:|.|.:.|.:.:::.: :.||:  .|| .:|..|.|::: .|.||.  
  Rat  4498 EIDRMQRVISLLRNSLNDLKLAIEGTIIMSENLRDALDN--MYDARIPQLWKRVSWDSSTLGF-- 4558

  Fly  4676 WFADLLHRIKELAGWLNDFKLPCAIWLGGLFNPQSFLTAIMQESARKH-DLPLDRMLISCDVTKK 4739
            ||.:||.|..:.:.|:.:.: |...|:.|.||||.||||:.||..|.| ...||.:.|..:|.::
  Rat  4559 WFTELLERNAQFSTWIFEGR-PNVFWMTGFFNPQGFLTAMRQEVTRAHKGWALDSVTIHNEVLRQ 4622

  Fly  4740 QKDDVTLPPMEGAFVHDLYMDGASWDCQLNSIVALRPKEMLCAMPVIYIKSIVQEKQELQRVYEC 4804
            .|:::..||:||.:::.|||||||||.:...:....||.:...:||::|.:|.....:..::|.|
  Rat  4623 TKEEIITPPVEGVYIYGLYMDGASWDRRNGKLTESTPKVLFMQLPVLHIYAINSTAPKDPKLYVC 4687

  Fly  4805 PLYKTRSRGN-TYVWTFNLKTRERPSRWILGGVALL 4839
            |:||...|.: |::....|:|...|..|||.|||||
  Rat  4688 PIYKKPRRTDLTFITVVYLRTVLSPDHWILRGVALL 4723

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
CG3339NP_001036762.2 DHC_N1 276..903 CDD:285571 121/681 (18%)
DHC_N2 1535..1944 CDD:285579 110/417 (26%)
P-loop_NTPase 2095..2324 CDD:304359 140/229 (61%)
P-loop_NTPase 2409..2544 CDD:304359 51/138 (37%)
P-loop_NTPase 2731..3061 CDD:304359 82/344 (24%)
P-loop_NTPase 3138..3406 CDD:304359 110/278 (40%)
MT 3419..3759 CDD:289543 110/355 (31%)
AAA_9 3789..4001 CDD:289547 86/214 (40%)
Dynein_heavy 4142..4832 CDD:281078 211/701 (30%)
Dnah8XP_038955254.1 DHC_N1 376..930 CDD:400611 122/683 (18%)
DYN1 1328..4375 CDD:227570 1024/3261 (31%)
AAA_6 2045..2372 CDD:403853 179/329 (54%)
Dynein_C 4429..4724 CDD:408026 100/302 (33%)


Information from Original Tools:


Tool Simple Score Weighted Score Original Tool Information
BLAST Result Score Score Type Cluster ID
Compara 00.000 Not matched by this tool.
Domainoid 00.000 Not matched by this tool.
eggNOG 00.000 Not matched by this tool.
Hieranoid 00.000 Not matched by this tool.
Homologene 00.000 Not matched by this tool.
Inparanoid 00.000 Not matched by this tool.
OMA 00.000 Not matched by this tool.
OrthoDB 00.000 Not matched by this tool.
OrthoFinder 00.000 Not matched by this tool.
OrthoInspector 00.000 Not matched by this tool.
orthoMCL 1 0.900 - - OOG6_100025
Panther 00.000 Not matched by this tool.
Phylome 1 0.910 - -
SonicParanoid 00.000 Not matched by this tool.
SwiftOrtho 1 1.000 - -
TreeFam 00.000 Not matched by this tool.
32.810

Return to query results.
Submit another query.