DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment CG3339 and Dnah1

DIOPT Version :9

Sequence 1:NP_001036762.2 Gene:CG3339 / 43295 FlyBaseID:FBgn0039510 Length:4842 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_001028827.2 Gene:Dnah1 / 171339 RGDID:621795 Length:4250 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:4829 Identity:1397/4829 - (28%)
Similarity:2227/4829 - (46%) Gaps:897/4829 - (18%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly   245 RTILSLLVSPTIVEEV-----FAHVSQGHLRPALDPKFRNLLEEMFINWTTQMHDIVLERSECQP 304
            |...|.::||..::::     ..::||..:|.|...||....|...|....|      ||.|.|.
  Rat    80 RGFYSDILSPGTLDQLGDVCCGPYLSQNLIRQADLDKFTPKAESFVIPEDFQ------ERVEQQS 138

  Fly   305 LGSTTQ--------SAGHQPKYITLVSLPAQEIGFWTNRKLNLQNIYEQ-LRESTHKTLAQILER 360
            :|:||:        ...::||    |.:|.|.:.....||:.::...:| ||....:.||.  |.
  Rat   139 IGTTTRLLTQTDFPLQSYEPK----VQVPFQVLPGRCPRKIEIERRKQQYLRLDIEQLLAN--EG 197

  Fly   361 IESVYYEPYATAFRKLVAAWLEAQDVSLWLQPLLRQTAAFNSVQFSNGHDLVAPLVHIVHLVWSN 425
            |:|          .||:....:.|      ||   ||       ...|.|.:.| :::...|:.|
  Rat   198 IDS----------NKLMPRHPDLQ------QP---QT-------IEQGRDPLFP-IYLPLKVFDN 235

  Fly   426 ARY------------------YRSTQRMSVLLRCICNMLVHRAAEDLELQL------LFQGDADE 466
            ..:                  ||.......||. ..:.|.|...:..||..      :...|.::
  Rat   236 EEFDCRTPTEWLNMGLEPDAQYRKPVPGKALLP-TDDALGHEDPKSQELDYRWCEVGVLDYDEEK 299

  Fly   467 GLLKINRTIAVLELFKQRMLDYKERYAGSQVLLPALSEGAAAVASSPSPDDQQQLWR----FCHE 527
            .|..:.:|             .|......::.:|.::.|.......|..|.|..:.|    ||.|
  Rat   300 KLYLVQKT-------------DKRGLVRDEMGMPIVNGGVTPEGRPPLLDTQYWVPRIQLLFCAE 351

  Fly   528 D--VFGQTLDGFSLQLLELRQVFEAAVQFQQLEKLEVGGLRGKILTERVREIFGEFKVLFEQWSN 590
            |  ||.|.:    :|...||:..||.:.:                                   |
  Rat   352 DPRVFTQRV----VQANALRKNTEALLLY-----------------------------------N 377

  Fly   591 VDIDLTATVASKWKCFRREQTLFFSRMQLLEQKLATVLLQAFEQCHSWMHLLRLTLMFGSLLQRE 655
            :.:|...|...:               .:.||.|:.:        ..|                 
  Rat   378 LYVDCMPTEGQR---------------VINEQSLSKI--------KQW----------------- 402

  Fly   656 AVRPELARVLPHILFIYDTEMEQLEDSVGEVLLGYEIRGLAALPLANNFPPIANAMMWLEQHISR 720
            |:.....|..|.:|       |.|.....||.|.|| |.:..:    ||..|.:         |:
  Rat   403 ALSTPRMRKGPSVL-------EHLSSLAREVNLDYE-RSMNKI----NFDQIVS---------SK 446

  Fly   721 CDEFGAKELSQLVEQLLKEKSELQTLP----------IQWNSLLSRRNILTTKLSNLQMKIWISW 775
            .:.|....|.:..|:.:..:. |.::|          ..:.|||:|..::|. ||.::.      
  Rat   447 PETFSFVTLPEKEEEKVPNQG-LVSVPEYPFREQKEDFTFVSLLTRSEVITA-LSKVRA------ 503

  Fly   776 HECVDKLIIQGLDESVL---SRSQDLSQLH-LNFSQVLFTLLKETKYLLALQATGSLSGDLFQLP 836
             || :|:....|..|.|   ||.::..|:. ..||||.. .||:: ::..|:.  ::...|..:.
  Rat   504 -EC-NKVTSMSLFHSNLSKYSRLEEFEQIQSQTFSQVQM-FLKDS-WISTLKV--AMRSSLRDMS 562

  Fly   837 EPLLTLYGHRDAYWERRI--RLIKIGEFYNGIRSGECAAAELQ-----LIRNDLASIDEHVEVAC 894
            :....||   :..||..:  :|.|:.|....:         ||     |:::.|.|..:.:..||
  Rat   563 KGWYNLY---ETNWEVYLMSKLRKLMELIKYM---------LQDTLRFLVQDSLGSFAQFIGDAC 615

  Fly   895 -------QQLTWRNYNDELVAGIFEQSRD-LFARLQQSHGNLDAILASMRRWSREPLHQRSLYGR 951
                   ..:.|   .::|:...::..:: ||.        :|.:|.:.......||.|..:...
  Rat   616 CSVLECIDDMDW---GEDLINSPYKPRKNPLFI--------VDLVLDNTGVHYSTPLEQFEVILL 669

  Fly   952 NLLD----LRHQQDRVRLRLLQCDETKMLLNRLLIANFCLFFNYES--------QEFQ------L 998
            ||.|    ..|...::.         |:::..:.|:...|.   ||        :|.:      :
  Rat   670 NLFDKGILATHAVPQLE---------KLVMEDIFISGDPLL---ESVGLHEPLVEELRANITNAM 722

  Fly   999 YSRDLSVQEFIREFPEEQRRQYNKYLASVDELICREVREAMRISLEYLYKEMTATATATTTPTAP 1063
            :...:.:|.:.:|        |.|||    ||...::...::     .|:        |..|:|.
  Rat   723 HKAMIPLQAYAKE--------YRKYL----ELNNNDISTFLK-----TYQ--------TQCPSAE 762

  Fly  1064 PVDPGCSAGMARLVLQQITTPQATSTAGAGASGAPPTANDAPLFEVKLELTETEIRFSPAFDASV 1128
            .|        ..:|:..:...:...             |..|          :.|...| |..:|
  Rat   763 EV--------REVVITHLKEKEILD-------------NSLP----------SSIIIGP-FYINV 795

  Fly  1129 ENNFQQIVEQLLLDIKQTCDCMPRIVADNAPSEDDEDDDTATVDYEQELRWEPREDRAQELQERK 1193
            :|    :.:.|....|.....|..|:|.|..:|.|                    ...:|.:...
  Rat   796 DN----VKQSLSKKRKALATSMLDILAKNLHNEVD--------------------SICEEFRSIS 836

  Fly  1194 KKDLELEQEQGDPKPQAVQFNLLAAAKAYSQKMECTADGLEMLERAIRDALADTVAAASAYAAKF 1258
            :|..|        ||.:::  .||..:.:   |:...:.|.:||..|...::|            
  Rat   837 RKIYE--------KPNSIE--ELAELRDW---MKGIPEKLVILEERIVKVMSD------------ 876

  Fly  1259 QAYAFLWTQQSSEVLAACMQTAREQTHHVSAGGYAIMETFKKEIENYNEVHDAIDQCENRECING 1323
                                             |.:|:.|     .||.   ..|...::...|.
  Rat   877 ---------------------------------YEVMDEF-----FYNL---TTDDFNDKWAANN 900

  Fly  1324 WLALDIKPLK-YGLLNLACKWSHMCKKWLLRYVQGTLKELNAFIARGFETLQLHIARQDFAT--- 1384
            |      |.| .|.:::. :..|:..:...|.:|  |.:.|.|..: .|.|||.:|  .|:|   
  Rat   901 W------PTKILGQIDMV-RQQHVEDEEKFRKIQ--LMDQNNFQEK-LEGLQLVVA--GFSTHVE 953

  Fly  1385 LLRVLAIMSEIREREPYADNVFKPLKEIMGLLKTYNVEFEPQLLRGIEQLPQQWQQLKHSSTVKQ 1449
            :.|...|.:|:|       .|.|.||:...|...||                             
  Rat   954 IARAHEIANEVR-------RVKKQLKDCQQLAMLYN----------------------------- 982

  Fly  1450 EALQDTRFHQQQRVTALIGLHTCHLQHYARQFQKMPFFRVPCPQVYDVCDEVYLRLHRFRRQQRL 1514
                     .::|:                       |.:|... ||       :|.|..::.:.
  Rat   983 ---------NRERI-----------------------FGLPITN-YD-------KLSRMVKEFQP 1007

  Fly  1515 YTRWARLLDIQPPDPATLQFCEVELRRVKQLW----DFVRVIESCIVAWHATPWLLIDTDDMEHE 1575
            |      ||                     ||    |::|..||    |...|...||.:.:|  
  Rat  1008 Y------LD---------------------LWTTASDWLRWSES----WMNDPLSAIDAEQLE-- 1039

  Fly  1576 CKKFTRDLRTLDKCIREWAPYVHIVGVLRELVASLRA-----------ITELQNPAITERHWMEL 1629
             |......:|:.||::::..    :...:::...:||           |..|:||.:..|||..|
  Rat  1040 -KNVIESFKTMHKCVKQFKD----IPACQDVALDIRARIDEFKPYIPLIQGLRNPGMRNRHWEVL 1099

  Fly  1630 MQLTKLSYKCNKSTRLAQLLTLQLQHHEEDIKNTVDRAIKEMTVTKVLDEIKATWAHLEFE-LEQ 1693
            .....::.:...:...|:.|.:.||.:.|.|....:.|.||..:.:.||:::..||.:.|. |..
  Rat  1100 SNEININVRPKANLTFARCLEMNLQDYIESISKVAEVAGKEYAIEQALDKMEKEWASILFNVLPY 1164

  Fly  1694 HHTRPHIQLLKVSEELIETLDDNQMQLQNISTSKHIEYLLDKLTHWQKVLGGIDTLIVNWFEVQR 1758
            ..|..:|  ||..:|..:.|||:.:..|::|.|.:.:....::..|:..|.....::..|...||
  Rat  1165 KETDTYI--LKSPDEASQLLDDHIVMTQSMSFSPYKKPFEQRINSWETKLKLTQEVLEEWLNCQR 1227

  Fly  1759 KWIYLECIFIGSADIRAQLPADAANFERIDEDFTALLAKVQEVRVVMQVVLRHDDVLAQLLQLQH 1823
            .|:|||.|| .|.||..|||.::..::.::..:..::....|.|.|:. |.....:|..|.....
  Rat  1228 SWLYLEPIF-SSEDITRQLPVESKRYQTMERIWRKIMKNAYENREVIN-VCSDQRLLDSLRDCNK 1290

  Fly  1824 RLAVCEKALNDYLETKRLAFPRFYFISAADLLDILSNGNNPQVIDRHLIKLFDSILRLQYETNTP 1888
            .|.:.:|.|::||||||.|||||||:|..:||:|||...:|..:..||.|.|::|.||.::.:. 
  Rat  1291 LLDLVQKGLSEYLETKRTAFPRFYFLSDDELLEILSQTKDPTAVQPHLRKCFENIARLLFQEDL- 1354

  Fly  1889 NALGMHSKENDEYVPFVSFDPDQPAFIVCGGRVELWLRAIIQQMRSTLHELFRRALRVFGEKPRE 1953
            ....|:|.|.:|.....|..|        ...||.||..:.:.|::::|::...|::.:....|.
  Rat  1355 EITHMYSAEGEEVKLSFSIYP--------SSNVEDWLLEVERSMKASVHDIIEMAIKAYPTMLRT 1411

  Fly  1954 LWLYDWPAQVALCCSQISWTADVNRSFGCMEEGYEGVMKELHKRQIAQLNALINLLLGELSPGDR 2018
            .|:..||.||.:...|..||.:|.::...     ..:...|..:...||:.|:.|:.|:||...|
  Rat  1412 EWVLSWPGQVTIAGCQTYWTLEVAQALEA-----SSISSSLFPQLSKQLSDLVALVRGKLSRMQR 1471

  Fly  2019 QKIMTICTIDVHSRDVVGKIIASKVDNSLAFQWQSQLRHRWDDDQAGSSSGRASTAISCGGGDED 2083
            ..:..:..|:||::|||.|:|...|.:...|:|.||||:.|.::                    |
  Rat  1472 MVLSALIVIEVHAKDVVSKLIDENVVSVHDFEWISQLRYYWTNN--------------------D 1516

  Fly  2084 CFANICDAEFRYAYEYLGNTSRLVITPLTDRCYITLTQSLRLRLAGATAGPAGTGKTETTKDLGR 2148
            .:....:|||.|.||||||:.||||||||||||:|||.:|.|:..||.||||||||||||||||:
  Rat  1517 LYIRAVNAEFIYGYEYLGNSGRLVITPLTDRCYLTLTGALHLKFGGAPAGPAGTGKTETTKDLGK 1581

  Fly  2149 ALGVMVYVFNCSEQMDYKSCGNIYKGLAQTGAWGCFDEFNRICVEVLSVVAVQVKTIQEAIKMHK 2213
            ||.:...|||||:|:|:.:.|..:||||..|||.||||||||.:|||||||.|:.|||:|.:...
  Rat  1582 ALAIQTVVFNCSDQLDFMAMGKFFKGLASAGAWACFDEFNRIDIEVLSVVAQQITTIQKAQQQRV 1646

  Fly  2214 TQFIFMGERISLEPSVGIFITMNPGYAGRTELPENLKTLFRPCAMIVPDFALICEIMLMAEGFQD 2278
            .:|:|.|..|.|.||..:|||||||||||||||:|||.||||.||:|||:|:|.||.|.:.||.:
  Rat  1647 ERFMFEGVEIPLVPSCAVFITMNPGYAGRTELPDNLKALFRPVAMMVPDYAMIAEISLYSFGFNE 1711

  Fly  2279 ARLLARKFITLYTLCKELLSKQDHYDWGLRAIKSVLVVAGTLKRDDHSRPEDQVLMRALRDFNIP 2343
            |.:||:|..|.:.|..|.||.|||||:|:||:|:|:..||.|||::.:..|:.:.:||:||.|:|
  Rat  1712 ANVLAKKITTTFKLSSEQLSSQDHYDFGMRAVKTVISAAGNLKRENPTMNEELICLRAIRDVNVP 1776

  Fly  2344 KIVTEDVPIFMGLIGDLFPALDVPRKRVFEFEKTIRRAVNEIKLQPEEGFLMKVVQLQELLDVRH 2408
            |.:.||:.:|.|::.||||............::.||:|..:..|:..||||:|.:||.|...|||
  Rat  1777 KFLQEDLKLFSGIVSDLFPTTKEEETDYGILDQAIRKACEKNNLKDVEGFLIKCIQLYETTVVRH 1841

  Fly  2409 SVFIVGNAGTGKTKIWQTLRETYRIQKLKPVC----------HVLNPKALSNDELFGIVNPTTRE 2463
            .:.:||..|:||:..::.|.......|.||..          :|||||:::..:|:|..:..|.|
  Rat  1842 GLMLVGPTGSGKSNCYRILAAAMTSLKGKPSISGGVYEAVNYYVLNPKSITMGQLYGEFDLLTHE 1906

  Fly  2464 WKDGLFSSIMREQANMPPGNPKWIVLDGDIDPMWIESLNTLMDDNKILTLASNERISLKREMRLL 2528
            |.||:|.|::|..|.....|.||.:.||.:|.:|||::||::||||.|.|:|.|.|.|...|.::
  Rat  1907 WTDGIFPSLIRAGAIASDTNKKWYMFDGPVDAVWIENMNTVLDDNKKLCLSSGEIIKLTEAMTMM 1971

  Fly  2529 FEVGHLKAATPATVSRAGILYINPQDLGWSPYVSSWLETRVDMIERGILNALFEKYFPCLMQR-- 2591
            |||..|..|:||||||.|::|:.|..||..|:|..||:....:|:.      :|:.|..|..:  
  Rat  1972 FEVQDLAVASPATVSRCGMVYLEPSILGLMPFVECWLKHLPSIIKP------YEEQFKTLFVKFL 2030

  Fly  2592 -------QRDFRRITPITDMAMIQMTCHLLECLLDSDEGNADGRGRGSATGGAANPHSLHHG--- 2646
                   :...:.:...|:..:......||:|..                    .|.....|   
  Rat  2031 ESSIAFVRTTVKEVVASTNSNLTMSLLKLLDCFF--------------------KPFLPREGLKK 2075

  Fly  2647 ----ELSHEAMVMALETIFVYATVWSFGSALSQDVIIDWHREFHKWWIG---EFKDIKL--PSQG 2702
                :|||  :...:|..|:::.|||.|:.......:::.:     |:.   .|:.|||  |.:|
  Rat  2076 IPSEKLSH--IPELIEPWFIFSLVWSVGATGDHSSRLNFSQ-----WLKIKMVFEQIKLAFPEEG 2133

  Fly  2703 TVFDYQLN----------------VQTLKFQPWSELAAHQSLEGQIDSETPLQNVLISTAETIRL 2751
            .|:||:|:                .:.:.:..|.:    .|:...:..:|...|:::.|.:|:::
  Rat  2134 LVYDYRLDDAGISSTEDDDEDDEESKQVAWVKWMD----YSVPFTMMPDTNYCNIIVPTMDTMQM 2194

  Fly  2752 AYFLKLLIDRNLACMLVGNSGCGKGAIFRQLFGQYANDQELLEVAVSAATAGDSSHQQQSGNPAG 2816
            :|.|.:||..:...:.:|.:|.||                                         
  Rat  2195 SYLLGMLITNHKPVLCIGPTGTGK----------------------------------------- 2218

  Fly  2817 AVVVRRKASSSATPLLTTVQATHFNFYTSSEIFQKMLDRPLEKKSGRCYAPSGP-KRRLIYFVND 2880
            .:.|..|...: .||........|:..||:...|.::|..|:|:....:.|  | .|..|:|::|
  Rat  2219 TLTVSNKLLKN-LPLEYISHFLTFSARTSANQTQDLIDSKLDKRRKGVFGP--PLGRNFIFFIDD 2280

  Fly  2881 LNMPEVDAYGTVQPHTIMRQFMDYRQWYDRQRL-QLKDIRHCQFAACMNPTAGS-FTIDPRLQRH 2943
            ||||.::.||...|..::||:||:..||||:.: ..|::....|...|.|..|. ..|.|||.||
  Rat  2281 LNMPALETYGAQPPIELLRQWMDHGGWYDRKIIGAFKNLVDINFVCAMGPPGGGRNAITPRLTRH 2345

  Fly  2944 FCVFSVAPPGEDTLHHIYGSILSSHLE---------SPSQGFTKEIRSIGSLLVRVGIALHRRVE 2999
            |...|.....|.:...|:..||...::         .|..| ...|..:...||...|:::..:.
  Rat  2346 FNYLSFIEMDEVSKKRIFSIILGCWMDGLLGEKSYREPVPG-APNIVHMTEPLVNATISIYAIIT 2409

  Fly  3000 YAFLPTALKFHYLFNLRDLTGIYQGLMNSVGAPASAGGGGASGFGGTICSRPSELMRLYVHEAFR 3064
            ...|||..|.||.||||||:.::||::  :..||..             ....:|:||:.||..|
  Rat  2410 SQLLPTPAKSHYTFNLRDLSKVFQGIL--MAEPAKV-------------EDKVQLLRLWYHENCR 2459

  Fly  3065 VYHDRLVDPYDIKSFKSSIRDIFKKDFED----FDEDFVFAEPLIYSHFAQSLVDQK-YMPLKSW 3124
            |:.||||:..|...|..    :.:...||    |::...| :|::|..|.....|.| |..:.|.
  Rat  2460 VFRDRLVNEEDRGWFDG----LLEMKMEDLGVAFNKVCPF-QPILYGDFMSPGSDVKSYELITSE 2519

  Fly  3125 DSLYQLLIEAQASYNEV-VGYMNLVLFEDAMIHVCRINRILESPRGNALLIGVGGSGKQTLARLA 3188
            :.:.|::.|....||:: ...:.||||.|||.|:|||:|.|....|||||:||||||:.:|.|||
  Rat  2520 NKMMQVIEEYMEDYNQINTAKLKLVLFVDAMSHICRISRTLRQALGNALLLGVGGSGRSSLTRLA 2584

  Fly  3189 AFISSLNVSQIQIKRGFGLLDMREEIGNLYMKVGLKNLASVFLISDAQIPDESILMLINDLLASG 3253
            :.::.....|:::.:.:|:.:.||::..:.:|.|::||...||.||.||.:||.|..||::|.||
  Rat  2585 SHMAEYECFQVELSKNYGMSEWREDVKKILLKAGMQNLPITFLFSDTQIKNESFLEDINNILNSG 2649

  Fly  3254 EIPELFNDDQLDTITNGIRNEVKQSGTLDTKENCWRYFVEKVRRLLKVVLCFSPVGQTLRVRARK 3318
            :||.|::.|:.|.|.|.:|..:::.|...||.|....:..:||..:.:|||.||:|:..|.|.|:
  Rat  2650 DIPNLYSADEQDQIVNTMRPYIQEQGLQPTKANLMAAYTGRVRNNIHMVLCMSPIGEVFRARLRQ 2714

  Fly  3319 FPAIISRTAIDWFHEWPKSALESVSQKFLNEINGILEPALVPPIGC----------FMAYVHGTV 3373
            ||::::...||||:|||..||:||:.:||:||         |.:.|          ...|:|.:|
  Rat  2715 FPSLVNCCTIDWFNEWPAEALQSVATRFLHEI---------PELECSSEVIEGLIHVCVYIHQSV 2770

  Fly  3374 NQISRIYLQNEKRYNYTTPKTFLEYIFLYRKLLVDKNGEFAERIARLQSGMSKLAECARQVDTLK 3438
            .:....||....|:||.|||::||.:.::..|:..|..|......|::||:.||...:..|..::
  Rat  2771 AKKCVEYLAELARHNYVTPKSYLELLNIFSILIGQKKMELKTAKHRMKSGLDKLLRTSEDVAKMQ 2835

  Fly  3439 HQLAIQEVQLAAKNAAADKLIVI--------VSAESEK-VKRERYIASEEEKRVRIIEEDVSIKT 3494
            .:|.|....|  :.||.|.|:.:        ::.|:.| |:.|...|:|:..:.:.|.:|     
  Rat  2836 EELEIMRPLL--EEAAKDTLLTMDQIKVDTAIAEETRKSVQAEEIKANEKASKAQAIADD----- 2893

  Fly  3495 KMCEEDLRQAEPALVAAQAALNTLNKNNLTELKSFGSPPKAVVNVCAAVMVLLA-SNGKIPRDRS 3558
              .::||.:|.|||.||.|:|..||||::||:::...||..|..|..||.::.. ...|:|.::.
  Rat  2894 --AQKDLDEALPALDAALASLRNLNKNDVTEVRAMQRPPPGVKLVIEAVCIMKGIKPKKVPGEKP 2956

  Fly  3559 -------WKASKLMMVRVDQFLNDLLNYNKDNIHPNIIETLQEYLKDPEFNPDKVVQKSVAAAGL 3616
                   |:..|.::....:||..|..::||||...:|:.:|.|:.:.||.|..:.:.|.|...:
  Rat  2957 GSKVDDYWEPGKGLLQDPGRFLESLFKFDKDNIGEAVIKAIQPYIDNEEFQPAAIAKVSKACTSI 3021

  Fly  3617 CAWVINLHRYHQVFLIVGPKQQALQDSHQELLEARERLQYLKAKINNLEAKLAEIQAEFENAVGE 3681
            |.||..:|:||.|...|.||:|||:::..:|...:..|:..|..:..:|..::.:||::...|.:
  Rat  3022 CQWVRAMHKYHFVAKAVEPKRQALREAQDDLEVTQRILEEAKHHLREVEDGISTLQAKYRECVTK 3086

  Fly  3682 KQRCQREADKTAFTIDLAHRLVNGLANENVRWKESVQSLLAKIGTLPGDILLISSFLSYVGCFTR 3746
            |:..:.:.::....:..|.:|:||||:|.|||:::|::|...:..:.||:|:.:.|::|:|.||.
  Rat  3087 KEELEMKCEQCEQRLGRADKLINGLADEKVRWQDTVENLENMLDNIFGDVLVAAGFVAYLGPFTG 3151

  Fly  3747 RYREELQHKMWLPNFRKIDPHIPHTEGVDTLALFSDDAQIAAWNNEGLPMDRMSTENATILQYST 3811
            :||..| ::.|:.......  :|||.....::...:..:|.:|...|||.|.:|.||..|.|:|.
  Rat  3152 QYRAAL-YEYWVNQLTVYG--VPHTSKPTLISTLGNPVKIRSWQIAGLPNDTLSVENGVINQFSQ 3213

  Fly  3812 RWPLMIDPQLQGIKWIKN---RFGTDLVVLRLRQKGFLEALEKSISQGDTVLIEQIEESMDTVLE 3873
            ||...||||.|..|||||   ..|.|  |.:|..:.||.::|.:|..|...|:|.:.|.:|..||
  Rat  3214 RWTHFIDPQGQANKWIKNMEKESGLD--VFKLSDRDFLRSMENAIRFGKPCLLENVGEELDPALE 3276

  Fly  3874 PLLSRALIKK--GRYLRIGDKEIEFHASFRLILHTKMANPHYKPEMQAQTTLINFTVTPDGLEEQ 3936
            |:|.:...|:  ...|::||..|.:|..||:.:.||:.||||.||:..:.||||||::|.|||:|
  Rat  3277 PVLLKQTYKQQGNTVLKLGDTVIPYHEDFRMYITTKLPNPHYSPEVSTKLTLINFTLSPSGLEDQ 3341

  Fly  3937 LLAEVVKIERPDLEQMKTEVTVQQNKFKISLKALEDELLARLASSGENVLDDHALVINLENTKRT 4001
            ||.:||..||||||:.|.::.:...|.:..||.:||::|.||:||..|.:||..|:..||.:|..
  Rat  3342 LLGQVVAEERPDLEEAKNQLIISNAKMRQELKDIEDQILYRLSSSEGNPVDDVELIKVLEASKMK 3406

  Fly  4002 VDEIEAKVREARVTTLQIDDTRNIYRSAAKRAAILYFVLTDLSRINPIYKFSLKSFMNVFRQAIA 4066
            ..||:||||.|..|...||.||..|...|.|..||:|.::||:.::|:|::||:.|:|:|...||
  Rat  3407 AAEIQAKVRIAEQTEKDIDLTRMEYIPVAVRTQILFFCVSDLANVDPMYQYSLEWFLNIFLSGIA 3471

  Fly  4067 MAAESKNYEKRVLHLVESITLQTYRYTLRGLFEADKLTFTSHMTLRILIAAEQVAKDETDFLLR- 4130
            .:..:.|.:||::::...:|...|....|.|||..||.|...:.:||::...::.:.|..:||. 
  Rat  3472 NSERADNLKKRIVNINRYLTFSLYSNVCRSLFEKHKLMFAFLLCVRIMMNEGKINQGEWRYLLSG 3536

  Fly  4131 ----------FPHDPTTLSPLDFVGRSAWGGIKSLTLIEHFYGIDKDMENYTKRWRKFMASDTPE 4185
                      .||         ::...||..|.:|:.:..|.....|...:..:::....|..|.
  Rat  3537 GSIQTMSENPAPH---------WLSDRAWRDILALSNLPAFSTFSTDFVQHLPKFQAIFDSAEPH 3592

  Fly  4186 REQFPGEWK-HRTPLQKLCIIRSLRPDRMTYAMRQFVEQTMGRSYAEIQTPPFGAIFQELNAATP 4249
            ||..||.|. :....|||.|:|.||.|::|.||:.||...:...:.|.||....|:|:|.|:.||
  Rat  3593 REPLPGIWNTYLDEFQKLLILRCLRGDKVTNAMQDFVANHLEPRFIEPQTANLSAVFKESNSTTP 3657

  Fly  4250 AFFILSPGVDPIRDVERYGQRQGFHSESDTLVNISLGQGQELLAEQAIIGALESGQQWVILQNIH 4314
            ..|:||||.||..|:.::.:...|   |..|..|||||||...||..:..::|.| :||..||.|
  Rat  3658 LIFVLSPGTDPAADLYKFAEEMKF---SKKLSAISLGQGQGPRAEAMMRNSIERG-KWVFFQNCH 3718

  Fly  4315 LVVNWLPTLEKLIERIVLQSESKGESNFRLFISAEPAPDPQYHVIPQGILESSLKVVNEPPSGMA 4379
            |..:|:|.||:|||.|   :..|...:|||::::.|:     :..|..||::..|:..|||.|:.
  Rat  3719 LAPSWMPALERLIEHI---NPDKVHRDFRLWLTSLPS-----NKFPVSILQNGSKMTIEPPRGVK 3775

  Fly  4380 ANLHKAWDNFSQDALETCTQEAEFKSILFALCYFHAVAGERRKFGPQGWNKVYPFNIGDLTISSN 4444
            |||.|::::.|.|.|.:|.:..||||:|.:||.||..|.|||||||.|:|..|.|..|||.|..:
  Rat  3776 ANLLKSYNSLSDDFLHSCQKVVEFKSLLLSLCLFHGNALERRKFGPLGFNIPYEFTDGDLRICIS 3840

  Fly  4445 VLHNYLEGSNRIPWEDLRYLFGEIMYGGHITDDWDRRLCQTYLEELLQQDLIDGDFELCPG---F 4506
            .|..:|:....||::.|:|..|||.|||.:|||||||.....||:.....::..:......   .
  Rat  3841 QLKMFLDEYEDIPYKVLKYTAGEINYGGRVTDDWDRRCVMNILEDFYNPAVLSPEHRYSKSGIYH 3905

  Fly  4507 PAPPNLDFEGYHSYITEMLPEESPLLYGLHPNAEIGFLTTASEQLLRTIFELQPRESELSSHCGA 4571
            ..||..|..||.|||..:...:.|.::|||.||.|.|....:..|...|.:|||:.|.:.   |.
  Rat  3906 QIPPTYDLNGYLSYIKSLPLNDMPEIFGLHDNANITFAQNETFALFGAILQLQPKSSSMG---GQ 3967

  Fly  4572 PREELVKIMIDDFLDKLQDEFNLQALLNR--VERKTPFVVVALQECERMNALIREIKRSLRELML 4634
            .|||||:.:.:|.|.::....:|:.::|:  |..:.....|.:||..|.|.|:..|.::|.:::.
  Rat  3968 SREELVEDVAEDILVQVPKPVDLEEVVNKYPVLYEESMNTVLVQEVIRYNKLLMVITQTLSDMLK 4032

  Fly  4635 GLRGELTITQEMERLDHAIFYDHVPAAWARLAYPSMLGLQSWFADLLHRIKELAGWLNDFKLPCA 4699
            .::|.:.::.|:|.:..:::.:.||..|...||||:..|.||..|||.|:..|..|:.: .:|..
  Rat  4033 AIKGLVVMSLELELMSTSLYNNAVPELWKSKAYPSLKPLASWIMDLLQRLNFLHSWIKN-GIPSV 4096

  Fly  4700 IWLGGLFNPQSFLTAIMQESARKHDLPLDRMLISCDVTKKQKDDVTLPPMEGAFVHDLYMDGASW 4764
            .|:.|.|.||:|||..:|..|||..:.:|.:.....|......::...|..|.:::.|:::||.|
  Rat  4097 FWISGFFFPQAFLTGTLQNFARKFVISIDTITFDFKVLSYASSEIAERPSTGCYIYGLFLEGARW 4161

  Fly  4765 DCQLNSIVALRPKEMLCAMPVIYIKSIVQEKQELQRVYECPLYKTRSRGNT---------YVWTF 4820
            |.....:...||||:...|.||::..:...|.:.|..|.||:|||.:|..|         ||...
  Rat  4162 DPFDFQLAESRPKELYTEMAVIWLLPVANRKVQNQDFYLCPIYKTLTRAGTLSTTGHSTNYVIAV 4226

  Fly  4821 NLKTRERPSRWILGGVALL 4839
            .:.:.:....||..||||:
  Rat  4227 EIPSNQPQRHWIKRGVALI 4245

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
CG3339NP_001036762.2 DHC_N1 276..903 CDD:285571 136/693 (20%)
DHC_N2 1535..1944 CDD:285579 116/424 (27%)
P-loop_NTPase 2095..2324 CDD:304359 144/228 (63%)
P-loop_NTPase 2409..2544 CDD:304359 56/144 (39%)
P-loop_NTPase 2731..3061 CDD:304359 86/341 (25%)
P-loop_NTPase 3138..3406 CDD:304359 107/278 (38%)
MT 3419..3759 CDD:289543 107/356 (30%)
AAA_9 3789..4001 CDD:289547 95/216 (44%)
Dynein_heavy 4142..4832 CDD:281078 239/704 (34%)
Dnah1NP_001028827.2 DHC_N2 998..1401 CDD:400618 121/453 (27%)
DYN1 <1237..3883 CDD:227570 977/2826 (35%)
AAA_6 1528..1854 CDD:403853 179/325 (55%)
Dynein_C 3944..4246 CDD:408026 91/306 (30%)


Information from Original Tools:


Tool Simple Score Weighted Score Original Tool Information
BLAST Result Score Score Type Cluster ID
Compara 00.000 Not matched by this tool.
Domainoid 00.000 Not matched by this tool.
eggNOG 1 0.900 - - E1_COG5245
Hieranoid 00.000 Not matched by this tool.
Homologene 00.000 Not matched by this tool.
Inparanoid 00.000 Not matched by this tool.
OMA 00.000 Not matched by this tool.
OrthoDB 00.000 Not matched by this tool.
OrthoFinder 00.000 Not matched by this tool.
OrthoInspector 00.000 Not matched by this tool.
orthoMCL 1 0.900 - - OOG6_100025
Panther 00.000 Not matched by this tool.
Phylome 1 0.910 - -
SonicParanoid 00.000 Not matched by this tool.
SwiftOrtho 1 1.000 - -
TreeFam 00.000 Not matched by this tool.
43.710

Return to query results.
Submit another query.