DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment CG3339 and Dnah11

DIOPT Version :9

Sequence 1:NP_001036762.2 Gene:CG3339 / 43295 FlyBaseID:FBgn0039510 Length:4842 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:XP_038934019.1 Gene:Dnah11 / 117253 RGDID:621088 Length:4514 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:4929 Identity:2093/4929 - (42%)
Similarity:2923/4929 - (59%) Gaps:521/4929 - (10%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly     7 MASSDEEGLPAGSTSGRQRVQRDYSDARLERVAAYTTTTMRLKPDKWTKMMACDDLRRIVVEWQH 71
            ::.|::|..........:|.||...|.|:..:.......:....:.|.:.:..:|          
  Rat    12 LSPSEQEDEEDEEAEAARRAQRFAVDPRVRFLGGRLQQALGFPEETWGEYLESED---------- 66

  Fly    72 GHRRVLVMTLSPGGDLVPRSCLSDLYLPYSVQSARGSIPSAMLPAEDEAMATVTAAVSAVVSATP 136
             ||:||       ||.:..|                                  ...|.|.|..|
  Rat    67 -HRQVL-------GDFLESS----------------------------------GPASLVFSVAP 89

  Fly   137 GALLIPLPPASSSFTTLDGVPRG---KCAYFVRRNTSDGPLTASNFAESVLYGDFPVHSKIETMS 198
            |.|       |:|    ..:||.   |..||.::.|  |....|:|:::||:|:.| .|....::
  Rat    90 GLL-------SAS----PEIPRDVKHKLVYFAKKMT--GSTGESDFSQTVLFGEIP-RSLFTHVT 140

  Fly   199 LLFDDVLQPLLEQAQS--QWPAIVRKDLQARIKEVRNTLTEIKGKTNNRTILSLLVSPTIVEEVF 261
            ...|::|.|:|....:  .|...:.:|::...:.::|.:...:||.:.||.|.:   |||.|.:.
  Rat   141 AFLDEILVPILSNKNNHESWSCFISQDVEHHTEIMKNKMHIFRGKMSRRTHLPI---PTIAENID 202

  Fly   262 AHVSQGHLRPALDP-KFRNLLEEMFINWTTQMHDIVLERSECQPLGSTTQSAGHQPKYITLVSLP 325
            ........||..|. :..:.:|.:.|.|:.|:.:|: |:...|||.|     |..|       .|
  Rat   203 LDQHYSVTRPQSDERRILHAIESVVIKWSHQIQEII-EKDSAQPLLS-----GLHP-------TP 254

  Fly   326 AQEIGFWTNRKLNLQNIYEQLRESTHKTLAQILERIESVYYEPYATAFRKLVAAWLEAQDVSLWL 390
            ..|:.|||.|..||:.||.||:......:.:||...:|.|.......|..:..|.|||:||.|.|
  Rat   255 ETELDFWTMRHDNLKCIYHQLQAPIVLKMVKILRTRQSSYLPALKGIFTTVENALLEARDVELHL 319

  Fly   391 QPLLRQTAAFNSVQFSNGHDLVAPLVHIVHLVWSNARYYRSTQRMSVLLRCICNMLVHRAAEDLE 455
            :||.:.........|.....|:|||:|.:.|:||::::|.|..|:.|||:..||:.:.:|...|.
  Rat   320 RPLRKHIQGLQEADFPQTGILIAPLIHTICLIWSHSKFYNSPARVIVLLQEFCNLFIDQARAYLS 384

  Fly   456 LQLLFQGDADEGLLKINRTIAVLELFKQRMLDYKERYAGSQVLLPALSEGAAAVASSPSPDDQQQ 520
            .:.|.:|:.::.|.|:...|.||.:|:.....|:.                 .:.|..:.|.:|:
  Rat   385 PEDLLKGEIEDALEKVQVAIGVLRMFQNSFFKYRR-----------------GLTSYFTGDTEQR 432

  Fly   521 LWRFCHEDVFGQTLDGFSLQLLELRQVFEAAVQFQQLEKLEVGGLRGKILTERV---REIFGEFK 582
            .|.|....||.: .:.|..:|:::..:|...::|::||:||.||.:|.:|..::   :|.|.|..
  Rat   433 PWDFQSHLVFSR-FNKFLDRLVKIEDMFVTILEFEKLERLEFGGSKGAVLNAQIHSMKEEFIECC 496

  Fly   583 VLFEQ--WSNVDIDLTATVASKWKCFRREQTLFFSRMQLLEQKLATVLLQAFEQCHSWMHLLRLT 645
            .:|.|  :...|.|...        |..:...|.|:....:::|.|:|.:....|.......:|.
  Rat   497 NVFRQSIYDPSDCDSME--------FESDYFQFKSKTLDFDRRLGTLLCEGLSNCSGLESAFKLL 553

  Fly   646 LMFGSLLQREAVRPELARVLPHI-----LF---------IYDTEMEQLEDSVGEVLLGYEIRGLA 696
            .:||:.|::..|....:   ||.     :|         :||..|:|:|.       |:||    
  Rat   554 TIFGNFLEKPVVMEIFS---PHYSTLLNMFNAELDMCKRLYDEHMKQIEH-------GHEI---- 604

  Fly   697 ALPLANNFPPIANAMMWLEQHISRCDEFGAKELSQLVEQLLKEKSELQTLPIQWNSLLSRRNI-- 759
               |..|.|..:..:.|....:.|...|                         |::..|...:  
  Rat   605 ---LNKNMPFTSGNIKWARMLLERLQMF-------------------------WSNFTSLHYLFP 641

  Fly   760 --------------LTTKLSNLQMKIWISWHECVDKLIIQGLDESVLSRSQDLSQLHLNFSQVLF 810
                          :||.|...:.:|:..|...|||.....|::.::..|.....|.:||...|.
  Rat   642 DSPDEAAVCQKYAEMTTLLDQFESRIYSEWRRNVDKTCEFNLNQPLVKFSPINGLLSVNFDPKLV 706

  Fly   811 TLLKETKYLLALQATGSLSGDLFQLPEPLLTLYGHRDAYWERRIRLIKIGEFYNGIRSGECAAAE 875
            .:|:|.||||.|:.:        .:|:..|.::..::...:....|..:.:.||.::. .....|
  Rat   707 AVLREVKYLLMLKKS--------NIPDSALGIFQKKNIILKHIGNLELLVQGYNKLKQ-TLLEVE 762

  Fly   876 LQLIRNDLASIDEHVEVACQQLTWRN----YNDELVAGIFEQSRDLFARLQQSHGNLDAILASMR 936
            ..||..:|.:|||.:.||...|||::    |.:::.....|..|    |:.|:..|:..|..:|:
  Rat   763 YPLIEKELGAIDEQLRVAATWLTWQDDFWVYMEKVQVATAELER----RVSQTQSNVQTIQQTMQ 823

  Fly   937 RWSREPLHQRSLYGRN---LLDLRHQQDRVRLRLLQCDETKMLLNRLLIANFCLFFNYESQEFQL 998
            .|:..||..|....|.   .||.:......:.:|::.|..|:             .|...:..:|
  Rat   824 AWAEWPLLPRRETRREAALTLDDKGDLFAKKYKLIREDGYKI-------------HNLVEENRKL 875

  Fly   999 YSRDLSVQEFIREFPEEQRRQYNKYLASVDELICREVREAMRISLEYLYKEMTATATATTTPTAP 1063
            :..|.|:.            .:..|:..:|:::.....:.:...|::..:.           |..
  Rat   876 FRADPSLD------------SWKIYVEFIDDIVVEGFFQTILHDLDFFLRN-----------TEK 917

  Fly  1064 PVDPGCSAGMARLVLQQITTPQATSTAGAGASGAPPTANDAPLFEVKLELTETEIRFSPAFDASV 1128
            .:.|                                    ||.|:.::.|...||.|.|..:...
  Rat   918 QLKP------------------------------------APFFQAQMLLMPPEIVFKPPLEREA 946

  Fly  1129 ENNFQQIVEQLLLDIKQTCDCMPRIVAD-NAPSEDDEDDDTATVDYEQELRWEPREDRAQELQER 1192
            .:.|..:||.:|....:....|.|:.|. :.|            ||:.::.              
  Rat   947 GDGFYNLVEAMLCGSFKVSAQMGRVAAHLDIP------------DYQNDMD-------------- 985

  Fly  1193 KKKDLELEQEQGDPKPQAVQFNLLAAAKAYSQKMECTADGLEMLERAIRDALADTVAAASAYAAK 1257
                                 |:|               ||..:.:.|.:.:||.:.....:.:.
  Rat   986 ---------------------NML---------------GLAEVRQEIMNRVADVIDKVLEFRSS 1014

  Fly  1258 FQAYAFLWTQQSSEVLAACM---QTAREQTHHVSAGGYAI----METFKKEIENYNEVHDAIDQC 1315
            .:.|::||.....|:|...:   .....:.....||...:    :|.||::|:.|..::..:.:.
  Rat  1015 LETYSYLWVDDRVEILRQFLLYGHAVPSEEIDAPAGEDILQSPTLEQFKEQIDIYEALYVQMSKF 1079

  Fly  1316 ENRECINGWLALDIKPLKYGLLNLACKWSHMCKKWLLRYVQGTLKELNAFIARGFETLQLHIARQ 1380
            ::....|.|..:|::|.|..:||:..|||.|.::.|||:|..:|.||..||.:....||......
  Rat  1080 DDFRVFNSWFKIDMRPFKLSMLNVIKKWSWMFQEHLLRFVVDSLSELQGFIKQTNAGLQRQPHEG 1144

  Fly  1381 DFATLLRVLAIMSEIREREPYADNVFKPLKEIMGLLKTYNVEFEPQLLRGIEQLPQQWQQLKH-S 1444
            |...|:.::..:..:|.|:...|.:|:||||.:.||::|..:...|:...:|:||::|:..|. :
  Rat  1145 DHDGLVDIMGHLLAVRSRQRATDELFEPLKETIMLLESYGQKMPEQVYAQLEELPERWETTKKIA 1209

  Fly  1445 STVKQEA--LQDTRFHQQQRVTALIGLHTCHLQHYARQFQKMPFFRVPCPQVYDVCDEVYLRLHR 1507
            :.|:.|.  ||:......::...|........:...|.:..:.|   .....|.|.|:....|..
  Rat  1210 AVVRHEVSPLQNAEVTLLRKKCILFDEKQAEFRERFRSYAPLGF---KAENPYSVLDKANQELEA 1271

  Fly  1508 FRRQQRLYTRWARLLDIQPPDPATLQFCEVELRRVKQLWDFVRVIESCIVAWHATPWLLIDTDDM 1572
            ...:.......|||.::..|:...::.|..|:|.:|:|||.:..:...|..|..|.|..::.:.|
  Rat  1272 LEEEVVQMQNCARLFEVVLPEYKQMKQCRREVRLLKELWDIIVYVRRSIDNWTETRWRQVNMEQM 1336

  Fly  1573 EHECKKFTRDLRTLDKCIREWAPYVHIVGVLRELVASLRAITELQNPAITERHWMELMQLTKLSY 1637
            :.|.::|.:::.:|||.:|.|..|..:.|.::::..||||:.||||||:.:|||.:|.....:.:
  Rat  1337 DLELRRFAKEIWSLDKAVRVWDAYSGLEGTVKDMTTSLRAVAELQNPALRDRHWQQLTNAIGVRF 1401

  Fly  1638 KCNKSTRLAQLLTLQLQHHEEDIKNTVDRAIKEMTVTKVLDEIKATWAHLEFELEQHHTRPHIQL 1702
            ..|.||.||.||.:||...|||:::.||:|:||:...||:.::..||..|||..|.|| |....|
  Rat  1402 SINDSTTLADLLAVQLHQVEEDVRDIVDKAVKELGTEKVITDVSHTWEALEFSYEVHH-RTGTPL 1465

  Fly  1703 LKVSEELIETLDDN---------------------------QMQLQNISTSKHIEYLLDKLTHWQ 1740
            ||..|:|.|||:.|                           |:|||.:..||::||.:|::..||
  Rat  1466 LKSDEQLFETLEHNQSFLLGLGTSWLATEPLGSAYSHAGILQVQLQTLLQSKYVEYFIDQVLSWQ 1530

  Fly  1741 KVLGGIDTLIVNWFEVQRKWIYLECIFIGSADIRAQLPADAANFERIDEDFTALLAKVQEVRVVM 1805
            ..|...|.:|..|.:|||.|.:||.||:.|.|||.||..||..|:.:|.:|..|:.|..:::.|:
  Rat  1531 NKLNVADAVIFTWMQVQRTWSHLESIFVCSEDIRIQLVEDAQRFDEVDAEFKELMFKTAKIKNVL 1595

  Fly  1806 QVVLRHDDVLAQLLQLQHRLAVCEKALNDYLETKRLAFPRFYFISAADLLDILSNGNNPQVIDRH 1870
            :...| ..:..:|...||||::|||||.:||||||:.|.||||||:|||||:||.|..|:.:.||
  Rat  1596 EATCR-PHLYEKLKDFQHRLSLCEKALAEYLETKRVTFSRFYFISSADLLDLLSKGAQPKQVTRH 1659

  Fly  1871 LIKLFDSILRLQYETN----TPNALGMHSKENDEYVPFVSFDPDQPAFIVCGGRVELWLRAIIQQ 1931
            |:||||||..||:|.|    |..|:||.|||. |||.|       .|...|.|.||.||..:.|.
  Rat  1660 LVKLFDSISDLQFEDNPEVSTCKAVGMFSKEK-EYVSF-------QAGCECIGHVESWLLQLEQT 1716

  Fly  1932 MRSTLHELFRRALRVFGEKPRELWLYDWPAQVALCCSQISWTADVNRSFGCMEEGYEGVMKELHK 1996
            |:.|:......|:..:.|||||||::|:||||||..|||.||.||..:|..:|||||..:|:.||
  Rat  1717 MKETVRLAIAEAIAAYEEKPRELWIFDFPAQVALTGSQIWWTTDVGIAFSRLEEGYETALKDFHK 1781

  Fly  1997 RQIAQLNALINLLLGELSPGDRQKIMTICTIDVHSRDVVGKIIASKVDNSLAFQWQSQLRHRWDD 2061
            :||:|||.||.|||||||||||||:|||||||||:||||.|:|:.||.:..||.|.|||||.|::
  Rat  1782 KQISQLNTLITLLLGELSPGDRQKVMTICTIDVHARDVVAKLISQKVVSPRAFTWLSQLRHEWEE 1846

  Fly  2062 DQAGSSSGRASTAISCGGGDEDCFANICDAEFRYAYEYLGNTSRLVITPLTDRCYITLTQSLRLR 2126
            .:                  :.|..|||||.|:|.||||||:.|||||||||||||||||||.|.
  Rat  1847 SR------------------KHCIVNICDAHFQYCYEYLGNSPRLVITPLTDRCYITLTQSLHLT 1893

  Fly  2127 LAGATAGPAGTGKTETTKDLGRALGVMVYVFNCSEQMDYKSCGNIYKGLAQTGAWGCFDEFNRIC 2191
            ::||.||||||||||||||||||||:|||||||||||||:|.|||||||.||||||||||||||.
  Rat  1894 MSGAPAGPAGTGKTETTKDLGRALGMMVYVFNCSEQMDYRSIGNIYKGLVQTGAWGCFDEFNRIA 1958

  Fly  2192 VEVLSVVAVQVKTIQEAIKMHKTQFIFMGERISLEPSVGIFITMNPGYAGRTELPENLKTLFRPC 2256
            ||||||||||||.|.:||:..:.:|:|:||.|.|:||||||||:|||||||||||||||.|||||
  Rat  1959 VEVLSVVAVQVKMIHDAIRSRRRRFVFLGETIPLKPSVGIFITLNPGYAGRTELPENLKALFRPC 2023

  Fly  2257 AMIVPDFALICEIMLMAEGFQDARLLARKFITLYTLCKELLSKQDHYDWGLRAIKSVLVVAGTLK 2321
            ||:.||..|||||||:||||.|||.||||||:|||||.||||||||||||||||||||||||:||
  Rat  2024 AMVAPDTELICEIMLVAEGFVDARSLARKFISLYTLCDELLSKQDHYDWGLRAIKSVLVVAGSLK 2088

  Fly  2322 RDDHSRPEDQVLMRALRDFNIPKIVTEDVPIFMGLIGDLFPALDVPRKRVFEFEKTIRRAVNEIK 2386
            |.|.:|||||||||||||||:|||||:|||:|:||:.||||||||||:|...||:.::::..|::
  Rat  2089 RGDKNRPEDQVLMRALRDFNMPKIVTDDVPVFLGLVSDLFPALDVPRQRKPHFEQMVKQSTLELR 2153

  Fly  2387 LQPEEGFLMKVVQLQELLDVRHSVFIVGNAGTGKTKIWQTLRETYRIQKLKPVCHVLNPKALSND 2451
            |||||.|::|||||:|||.||||:|:||||||||:||.:||..||...|.|||.:.|||||::.|
  Rat  2154 LQPEESFILKVVQLEELLAVRHSIFVVGNAGTGKSKILRTLNRTYVNMKQKPVWNDLNPKAVTTD 2218

  Fly  2452 ELFGIVNPTTREWKDGLFSSIMREQANMPPGNPKWIVLDGDIDPMWIESLNTLMDDNKILTLASN 2516
            ||||.::..||||||||.|||:|||||:....|.||||||||||:|||||||:|||||:||||||
  Rat  2219 ELFGFIHHATREWKDGLLSSILREQANLTHDGPTWIVLDGDIDPLWIESLNTVMDDNKVLTLASN 2283

  Fly  2517 ERISLKREMRLLFEVGHLKAATPATVSRAGILYINPQDLGWSPYVSSWLETRVDMIERGILNALF 2581
            ||::|...||||||..||:.|||||||||||||:|||||||:|||:||::.|....|:..|..||
  Rat  2284 ERVALTPSMRLLFETHHLQTATPATVSRAGILYVNPQDLGWNPYVASWIDRRRHQSEKANLTILF 2348

  Fly  2582 EKYFP-CLMQRQRDFRRITPITDMAMIQMTCHLLECLLDSDEGNADGRGRGSATGGAANPHSLHH 2645
            :||.| ||.:.:..|:.||.:.:.:::|..|.||||||..:...:|            :|...: 
  Rat  2349 DKYIPVCLEKLRTSFKAITSVPESSLVQTICTLLECLLTPENIPSD------------SPKETY- 2400

  Fly  2646 GELSHEAMVMALETIFVYATVWSFGSALSQDVIIDWHREFHKWWIGEFKDIKLPSQGTVFDYQLN 2710
                        |..||:|.||:||..|.:|.:.|:..:|.:||..|.|.:|.|||||:|||.|:
  Rat  2401 ------------EVYFVFACVWTFGGTLLRDQLSDYQADFSRWWHKEMKAVKFPSQGTIFDYYLD 2453

  Fly  2711 VQTLKFQPWSELAAHQSLEGQIDSETPLQNVLISTAETIRLAYFLKLLIDRNLACMLVGNSGCGK 2775
            .:|.||.||::.....::    |::.||:.||:.|.||.||.||.:||:::....|||||:|.||
  Rat  2454 HKTKKFLPWTDKVPQFTM----DADAPLKTVLVHTPETTRLRYFTELLLNKGKPLMLVGNAGVGK 2514

  Fly  2776 GAIFRQLFGQYANDQELLEVAVSAATAGDSSHQQQSGNPAGAVVVRRKASSSATPLLTTVQATHF 2840
            ...........:.|.                                           .|....|
  Rat  2515 TVFLSDTLASISEDY-------------------------------------------IVSRVPF 2536

  Fly  2841 NFYTSSEIFQKMLDRPLEKKSGRCYAPSGPKRRLIYFVNDLNMPEVDAYGTVQPHTIMRQFMDYR 2905
            |:||:|...|::|::|||||:||.|.|.|.| :|:||::||||||||.|||||||.::||.:||.
  Rat  2537 NYYTTSADLQRILEKPLEKKAGRNYGPRGNK-KLVYFIDDLNMPEVDLYGTVQPHALLRQHIDYG 2600

  Fly  2906 QWYDRQRLQLKDIRHCQFAACMNPTAGSFTIDPRLQRHFCVFSVAPPGEDTLHHIYGSILSSHLE 2970
            .||||.::.||:||:||:.|||||.|||||:||||:|||.|.:...|..|||..|||.|.|.:|:
  Rat  2601 HWYDRHKVMLKEIRNCQYVACMNPMAGSFTVDPRLKRHFTVLAFNFPSLDTLTTIYGQIFSFYLQ 2665

  Fly  2971 SPSQGFTKEIRSIGSLLVRVGIALHRRVEYAFLPTALKFHYLFNLRDLTGIYQGLMNSVGAPASA 3035
              .|.|...:...|..|::..||.|:.:...|:|||:||||.||||||:.|:||::         
  Rat  2666 --QQAFCPSVLRTGPSLIQATIAFHQTMAENFVPTAIKFHYNFNLRDLSNIFQGIL--------- 2719

  Fly  3036 GGGGASGFGGTICSR-PSELMRLYVHEAFRVYHDRLVDPYDIKSFKSSIRDIFKKDFEDFDEDFV 3099
                   |....|.: |.:|.||::||..|||.|||||..|...|:..:.:...|.|:..|.:.:
  Rat  2720 -------FASPECLKCPEDLARLWLHETSRVYGDRLVDANDSDLFQRKMLEAAHKYFKGADANTL 2777

  Fly  3100 FAEPLIYSHFAQSLVDQKYMPLKSWDSLYQLLIEAQASYNEVVGYMNLVLFEDAMIHVCRINRIL 3164
            ..:||:|.|||....|..|.|:|.|:.|..:|.|...:|||:...|:||||||||.|||||:|||
  Rat  2778 QQQPLVYCHFASGREDPCYEPVKDWEGLKAVLTEMMGNYNELHSEMHLVLFEDAMQHVCRISRIL 2842

  Fly  3165 ESPRGNALLIGVGGSGKQTLARLAAFISSLNVSQIQIKRGFGLLDMREEIGNLYMKVGLKNLASV 3229
            .:|:|:|||:||||||||:|:||||:|.||.|.||.:..|:|..|:|.::.|||::.|.||:.:|
  Rat  2843 RTPQGHALLVGVGGSGKQSLSRLAAYICSLEVFQITLTEGYGTQDLRVDLANLYVRTGAKNMPTV 2907

  Fly  3230 FLISDAQIPDESILMLINDLLASGEIPELFNDDQLDTITNGIRNEVKQSGTLDTKENCWRYFVEK 3294
            ||::||.:.|||.|:|||||||||:||.||:|:..|.|.:||||||:..|..|::||||.:|:.:
  Rat  2908 FLLTDAHVLDESFLVLINDLLASGDIPGLFSDEDTDKIISGIRNEVRGLGITDSRENCWAFFLAR 2972

  Fly  3295 VRRLLKVVLCFSPVGQTLRVRARKFPAIISRTAIDWFHEWPKSALESVSQKFLNEINGILEPALV 3359
            ||..||:|.||||||.|||||||||||:::.|||||||.||:.||.|||::|:.||.|| ||...
  Rat  2973 VRLQLKMVFCFSPVGHTLRVRARKFPALVNCTAIDWFHAWPQEALVSVSRRFIEEIEGI-EPQHK 3036

  Fly  3360 PPIGCFMAYVHGTVNQISRIYLQNEKRYNYTTPKTFLEYIFLYRKLLVDKNGEFAERIARLQSGM 3424
            ..|..||||||.:|.::|..|.|||:|||||||::|||.|.|::.||..|.||...:...|.:|:
  Rat  3037 DSISLFMAYVHTSVKEVSAWYYQNERRYNYTTPRSFLEQISLFKSLLKKKRGEVQRKKEHLGNGI 3101

  Fly  3425 SKLAECARQVDTLKHQLAIQEVQLAAKNAAADKLIVIVSAESEKVKRERYIASEEEKRVRIIEED 3489
            .||...|.||..||.:||.||.:|..:|..|:.||..:..::|||.||:.||..||::|..|:.:
  Rat  3102 QKLQTTASQVGNLKARLASQEAELQLRNQDAEALITKIGLQTEKVSREKAIADAEERKVAAIQTE 3166

  Fly  3490 VSIKTKMCEEDLRQAEPALVAAQAALNTLNKNNLTELKSFGSPPKAVVNVCAAVMVLLASNGKIP 3554
            .|.|.:.||.||.:||||||||.|||||||:.||||||:|.:||.||.||.||||||||..|::|
  Rat  3167 ASQKQRECEADLLKAEPALVAATAALNTLNRVNLTELKTFPNPPNAVTNVTAAVMVLLAPRGRVP 3231

  Fly  3555 RDRSWKASKLMMVRVDQFLNDLLNYNKDNIHPNIIETLQE-YLKDPEFNPDKVVQKSVAAAGLCA 3618
            :||||||:::.|.:||.||..|:||:|::|..|.::.:.| |||||||||:.:..||.|||||||
  Rat  3232 KDRSWKAARIFMGKVDDFLQALINYDKEHIPENCLKVVNEQYLKDPEFNPNLIRTKSFAAAGLCA 3296

  Fly  3619 WVINLHRYHQVFLIVGPKQQALQDSHQELLEARERLQYLKAKINNLEAKLAEIQAEFENAVGEKQ 3683
            ||||:.::::|:..|.||:|||..::.:|..|.|:|:.::.|:.:|:..|..:.|.||.|..||.
  Rat  3297 WVINIIKFYEVYCDVEPKRQALAQTNLDLAAATEKLEAVRRKLVDLDHNLRRLTASFEKATAEKV 3361

  Fly  3684 RCQREADKTAFTIDLAHRLVNGLANENVRWKESVQSLLAKIGTLPGDILLISSFLSYVGCFTRRY 3748
            |||.|.::|..|||||:|||:.|.:|.:||.:|::|...:..||.||:||.::|:||:|.|||:|
  Rat  3362 RCQEEVNQTNKTIDLANRLVSELESEKIRWGQSIKSFETQEKTLCGDVLLTAAFVSYIGSFTRQY 3426

  Fly  3749 REELQHKMWLPNFRKIDPHIPHTEGVDTLALFSDDAQIAAWNNEGLPMDRMSTENATILQYSTRW 3813
            |:||....|:| |.:....||..||:|.:|..:|||.||.|||:|||.|||||||||||.:..||
  Rat  3427 RQELVDCKWIP-FLQQKVSIPIAEGLDMIATLTDDATIATWNNQGLPSDRMSTENATILTHCKRW 3490

  Fly  3814 PLMIDPQLQGIKWIKNRFGTDLVVLRLRQKGFLEALEKSISQGDTVLIEQIEESMDTVLEPLLSR 3878
            |||||||.||||||||::|.||.|..|.|||||.|:|.:::.||.:|||.::|::|.||.|||.|
  Rat  3491 PLMIDPQQQGIKWIKNKYGPDLKVTHLGQKGFLNAIEMALAFGDVILIENLKETVDPVLGPLLGR 3555

  Fly  3879 ALIKKGRYLRIGDKEIEFHASFRLILHTKMANPHYKPEMQAQTTLINFTVTPDGLEEQLLAEVVK 3943
            ..||||:|:||||||.||:.:||||||||:||||||||:||||||:|||||.||||.|||||||.
  Rat  3556 NTIKKGKYIRIGDKECEFNKNFRLILHTKLANPHYKPELQAQTTLLNFTVTEDGLEGQLLAEVVS 3620

  Fly  3944 IERPDLEQMKTEVTVQQNKFKISLKALEDELLARLASSGENVLDDHALVINLENTKRTVDEIEAK 4008
            :||||||::|..:|..||.|||.|:.||::||.||:::..:.|||..||..||.||.|..|||.|
  Rat  3621 VERPDLERLKLVLTKHQNDFKIELRHLEEDLLLRLSAAEGSFLDDTDLVERLETTKATAAEIEHK 3685

  Fly  4009 VREARVTTLQIDDTRNIYRSAAKRAAILYFVLTDLSRINPIYKFSLKSFMNVFRQAIAMAAESKN 4073
            |.|||....:|::||..||..|.||:::|||::||.:|||:|:||||:|..:|.:||..|.:.::
  Rat  3686 VIEARENERKINETRECYRPVAARASLMYFVISDLRKINPVYQFSLKAFKTLFHRAIEQADKVED 3750

  Fly  4074 YEKRVLHLVESITLQTYRYTLRGLFEADKLTFTSHMTLRILIAAEQVAKDETDFLLRFPHDPTTL 4138
            .::|:..|:||:|..|:.:..:.|||.|||||.|.|..:||:...::...|.||||||..:.|..
  Rat  3751 TQERICALMESVTYATFLHASQALFEKDKLTFLSQMAFQILLRRNEIHPLELDFLLRFTVEHTYS 3815

  Fly  4139 SPLDFVGRSAWGGIKSLTLIEHFYGIDKDMENYTKRWRKFMASDTPEREQFPGEWKHRTPLQKLC 4203
            ||:||:...:|..:|::.|:|.|.|:|:|:|...|:|||::.|:.||:|:.|.|||.::.:|||.
  Rat  3816 SPVDFLTAQSWSAVKAVALMEEFRGLDRDVEGSAKQWRKWVESECPEKEKLPQEWKKKSLIQKLI 3880

  Fly  4204 IIRSLRPDRMTYAMRQFVEQTMGRSYAEIQTPPFGAIFQELNAATPAFFILSPGVDPIRDVERYG 4268
            |:|::||||||||:|.|||:.:|..|.|......|..|.|.:..||.|||||||||.::|:|..|
  Rat  3881 ILRAVRPDRMTYALRNFVEEKLGTKYVERTRLDLGKAFGESSPGTPVFFILSPGVDALKDLEVLG 3945

  Fly  4269 QRQGFHSESDTLVNISLGQGQELLAEQAIIGALESGQQWVILQNIHLVVNWLPTLEKLIERIVLQ 4333
            :|.||..:|....|:||||||||:||.|:..|...| .||.|||:|||..||.|||||:|:.   
  Rat  3946 KRLGFTIDSGKFHNVSLGQGQELVAEMALEKAAIGG-HWVFLQNVHLVAKWLGTLEKLLEKF--- 4006

  Fly  4334 SESKG-ESNFRLFISAEPAPDPQYHVIPQGILESSLKVVNEPPSGMAANLHKAWDNFSQDALETC 4397
              |:| ..::|:|:|||.||.....|||||:||:|:|:.||||:||.||||.|..||.||.||.|
  Rat  4007 --SQGSHRDYRVFLSAEAAPSQHEPVIPQGLLENSIKITNEPPTGMLANLHAALYNFDQDTLEMC 4069

  Fly  4398 TQEAEFKSILFALCYFHAVAGERRKFGPQGWNKVYPFNIGDLTISSNVLHNYLEGSNRIPWEDLR 4462
            :::.|||||||:|||||.....|.:||||||::.|||:.|||||.:|:|:|:||.:..:||||||
  Rat  4070 SKDQEFKSILFSLCYFHGCVAGRLRFGPQGWSRSYPFSPGDLTICTNILYNHLEANPHVPWEDLR 4134

  Fly  4463 YLFGEIMYGGHITDDWDRRLCQTYLEELLQQDLIDGDFELCPGFPAPPNLDFEGYHSYITEMLPE 4527
            ||||||:|||||||.|||:||:.||||.:...||:.:..|.|||.|||..|:.|||.||.:|||.
  Rat  4135 YLFGEIIYGGHITDAWDRKLCRVYLEEFMNPSLIEDELMLAPGFAAPPYSDYSGYHQYIEDMLPP 4199

  Fly  4528 ESPLLYGLHPNAEIGFLTTASEQLLRTIFELQPRESELSSHCGAPREELVKIMIDDFLDKLQDEF 4592
            |||.||||||||||..||..|..|.||:.|:|||.:..:...|...|:.||.::||.|::|.:||
  Rat  4200 ESPALYGLHPNAEIELLTVTSNMLFRTLLEMQPRNAVSNEEQGQSTEDKVKNILDDILERLPEEF 4264

  Fly  4593 NLQALLNRVERKTPFVVVALQECERMNALIREIKRSLRELMLGLRGELTITQEMERLDHAIFYDH 4657
            |:..::.:...::|:::|..|||||||.|:|||:.||:.|.|||:||||::.::|....|:.||.
  Rat  4265 NMAEIMQKNPNRSPYILVCFQECERMNVLLREIRVSLQHLDLGLKGELTLSPDVETQLSALSYDR 4329

  Fly  4658 VPAAWARLAYPSMLGLQSWFADLLHRIKELAGWLNDFKLPCAIWLGGLFNPQSFLTAIMQESARK 4722
            ||..|.:|||||..||..||.|||.|.:||..|..|..||..:||.||||||||||||||..|||
  Rat  4330 VPDTWNKLAYPSTYGLAQWFNDLLLRCRELDTWTQDLTLPAVVWLSGLFNPQSFLTAIMQTMARK 4394

  Fly  4723 HDLPLDRMLISCDVTKKQKDDVTLPPMEGAFVHDLYMDGASWDCQLNSIVALRPKEMLCAMPVIY 4787
            ::.|||||.::.|||||.|:|...||.|||::|.|:::||.||.|..::|..|.||:...||||:
  Rat  4395 NEWPLDRMCLTIDVTKKTKEDYGHPPREGAYLHGLHLEGARWDIQSGALVDARLKELTSTMPVIF 4459

  Fly  4788 IKSIVQEKQELQRVYECPLYKTRSRGNTYVWTFNLKTRERPSRWILGGVALLLQ 4841
            .|:|..::||::..||||:|||::||.||||||.|::::|.::|:|.||||||:
  Rat  4460 AKAIPADRQEVKHAYECPVYKTKARGLTYVWTFRLRSKDRIAKWVLAGVALLLE 4513

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
CG3339NP_001036762.2 DHC_N1 276..903 CDD:285571 162/665 (24%)
DHC_N2 1535..1944 CDD:285579 176/439 (40%)
P-loop_NTPase 2095..2324 CDD:304359 189/228 (83%)
P-loop_NTPase 2409..2544 CDD:304359 92/134 (69%)
P-loop_NTPase 2731..3061 CDD:304359 132/330 (40%)
P-loop_NTPase 3138..3406 CDD:304359 160/267 (60%)
MT 3419..3759 CDD:289543 170/340 (50%)
AAA_9 3789..4001 CDD:289547 139/211 (66%)
Dynein_heavy 4142..4832 CDD:281078 363/690 (53%)
Dnah11XP_038934019.1 DHC_N1 220..789 CDD:400611 162/658 (25%)
DHC_N2 1296..1722 CDD:400618 176/435 (40%)
DYN1 1550..4164 CDD:227570 1483/2739 (54%)
AAA_6 1862..2188 CDD:403853 256/325 (79%)
MT 3095..3439 CDD:289543 171/344 (50%)
Dynein_C 4217..4512 CDD:408026 147/294 (50%)


Information from Original Tools:


Tool Simple Score Weighted Score Original Tool Information
BLAST Result Score Score Type Cluster ID
Compara 00.000 Not matched by this tool.
Domainoid 00.000 Not matched by this tool.
eggNOG 00.000 Not matched by this tool.
Hieranoid 1 1.000 - -
Homologene 00.000 Not matched by this tool.
Inparanoid 00.000 Not matched by this tool.
OMA 1 1.010 - - QHG56441
OrthoDB 1 1.010 - - D1463at33208
OrthoFinder 1 1.000 - - FOG0000396
OrthoInspector 00.000 Not matched by this tool.
orthoMCL 1 0.900 - - OOG6_100025
Panther 1 1.100 - - O PTHR10676
Phylome 1 0.910 - -
SonicParanoid 00.000 Not matched by this tool.
SwiftOrtho 00.000 Not matched by this tool.
TreeFam 00.000 Not matched by this tool.
76.930

Return to query results.
Submit another query.