DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment CG3339 and Dnah10

DIOPT Version :9

Sequence 1:NP_001036762.2 Gene:CG3339 / 43295 FlyBaseID:FBgn0039510 Length:4842 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:XP_008767494.2 Gene:Dnah10 / 117252 RGDID:619988 Length:4592 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:5000 Identity:1500/5000 - (30%)
Similarity:2415/5000 - (48%) Gaps:768/5000 - (15%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly    62 LRRIVVEWQHGHRRVLVMTLSPGGDLVPRSCLSDLYLPYSV----QSARGSIPSA--------ML 114
            ::||:      :|..|.::|:|         ||:.:|..:|    :|::.:||.|        ::
  Rat   137 VKRII------NRLELHVSLTP---------LSEEFLEQNVVFFLRSSKDAIPEASDMKEAMEIM 186

  Fly   115 PAEDEAMATVTAAVSAVVSATPGALLIPL---------------PPASSSFTTLDGVPRGKCAYF 164
            | |......:.:.|...:......:.:|.               ||....|::.|          
  Rat   187 P-ETMEYGIINSQVLQFLKDIICQVFMPALSFNQHKSESGQVASPPEVQEFSSYD---------- 240

  Fly   165 VRRNTSDGPLTASNFAESVLYGDFPVHSKIETMSLLFDDVLQPLLEQAQSQWPAIVRKDLQARIK 229
                .:|.|   |...|::.|     ||    :.|:.|:.|.                :||....
  Rat   241 ----ITDLP---SMLGETMEY-----HS----IQLIRDEFLM----------------NLQKFAN 273

  Fly   230 EVRNTLTEIKGKTNNRTILSLLVSPTI-----VEEVFAHVSQGHLRPALDPKFRNLLEEMFINWT 289
            .::.|:.:::|:..       |..|:|     |.|:.|           ||:....||:..|||.
  Rat   274 NIQRTMQQLEGEIK-------LEMPSISVEGEVSELVA-----------DPELVETLEQCVINWL 320

  Fly   290 TQMHDIVLERSECQPLGSTTQSAGHQPKYITLVSLPAQEIGFWTNRKLNLQNIYEQLRESTHKTL 354
            .|:...|..:.:.:|.|:.                |..||.||..|...|..:|||.:....:.:
  Rat   321 GQISYAVDSQLKKKPQGNG----------------PLAEIEFWRERNATLSALYEQTKLPFVRKV 369

  Fly   355 AQILERIESVY---YEPYATAFRKLVAAWLEAQDVSLWLQPLLRQTAAFNSVQFSNGH---DLVA 413
            .::::..||:.   .:|..|...||   .:||.|...:|..:.|...  |....||.|   |.:.
  Rat   370 LEVIKEAESMLTANVQPVLTELFKL---HMEASDNVRFLSTVERHFK--NITHGSNFHVVLDTIP 429

  Fly   414 PLVHIVHLVWSNARYYRSTQRMSVLLRCICNMLVHRAAEDLELQLLFQGDADEGLLKINRTIAVL 478
            .::..:.:||..:|:|...:||..|:..|...:..|....:.|:.||:.:......|.......|
  Rat   430 SMMSALRMVWIISRHYNRDERMIPLMERIAWEIAERVCRVINLRTLFKENRANAQFKTQEAKNTL 494

  Fly   479 ELFKQRMLDYKERYAGSQVLLPALSEGAAAVASSPSPDDQQQLWRFCHEDVFGQTLDGFSLQLLE 543
            :|:|:...|.:.:...|                     .::..|.|..:.:|.:| |..:....:
  Rat   495 KLWKKSYFDIRAKIEAS---------------------GREARWEFDRKRLFERT-DYMANICQD 537

  Fly   544 LRQVFEAAVQFQQLEKLEVGGLRGKILTERVREIFGEFKVLFEQWSNVDID-LTATVASKWKCFR 607
            |..:.....:|..:...|:..:.|.  .:|:.::......|......::.| .....|..||...
  Rat   538 LSDILRVLEEFYNIFGPELKAVTGD--PKRIDDVLCRVDSLVAPMETLNFDPFNIRSAPYWKYVM 600

  Fly   608 REQTLFFSRMQLLEQKLATVLLQAFEQCHSWMHLLRLTLMFGSLLQREAVRPELARVLPHILFIY 672
            .:   |...:.::|::....:.::|:...|......:.|.|..:..|||:..::......||..|
  Rat   601 ED---FKLEVLVIEKEAKNFIDESFKTLRSAEAAFDMLLKFKHIRSREAINRQMMMKFNDILAQY 662

  Fly   673 DTEMEQLEDSVGEVLLGYEIRGLAALPLANNFPPIANAMMW-------LEQHISR-------CDE 723
            ..|:    |.|.::   :| :.|...||..|.||:|.|:.|       ::..|.|       .|.
  Rat   663 YKEI----DIVNKI---FE-QNLDNPPLYKNHPPVAGAICWERSLFYRIKHTILRFMEVEELLDS 719

  Fly   724 FGAKELSQLVEQLLKEKSELQTLPIQ-WNSLLSRRNILTTK--LSNLQMKIWISWHECVDKLIIQ 785
            ...:|:.|...::.::..|.:.:..: |..        ||:  |.||..|      ..:.|..|.
  Rat   720 ERGQEVKQRYLEVGRKMKEYEDVKYEHWKE--------TTEQSLPNLMKK------SLLTKNTIT 770

  Fly   786 GLDESVLSRSQDLSQLHLNFSQVLFTLLKETKYLLALQATGSLSGDLFQLPEPLLTLYGHRDAYW 850
            ..|.:|:.|.   :...:|||.||..::.|||||..|.         |.:||....:....|.:.
  Rat   771 SEDSAVIDRG---TMFVINFSPVLREIINETKYLEQLG---------FTVPELARNVALQEDKFL 823

  Fly   851 ERRIRLIKIGEFYNGIRSGECAAAELQLIRNDL-----ASIDEHVE-------VACQQLTWRNYN 903
            .....:.::.:.|:             |:.|.|     ..:|:|.:       ...::|.|.:  
  Rat   824 RYTEGIQRMLDHYH-------------LLVNTLNEAESVLLDDHSQELLRVFRSGYKRLNWNS-- 873

  Fly   904 DELVAGIFEQSRDLFARLQQSHGNLDAILASMRRWSREPLHQRSLYGRNLLDLRHQQDRVRLRLL 968
                .||    .|...|.:|:.|..:::           :||          :....:.:..|| 
  Rat   874 ----LGI----ADYITRCKQAIGKFESL-----------VHQ----------IHKNAEDINSRL- 908

  Fly   969 QCDETKMLLNRLLIANFCLFFNYESQEFQLYSRDLSVQEFIREFPEEQRRQYNKYLASVDELICR 1033
                       .||.:..||   .|...:...:...|:||. |:.|.:|.:      .||.:   
  Rat   909 -----------TLIESINLF---RSPVIKTEDKLPGVKEFF-EYIERERSR------DVDHM--- 949

  Fly  1034 EVREAMRISLEYLYKEMTATATATTTPTAPPV-------DPGCSAGMARLVLQQITTPQATSTAG 1091
             ||..|.|.  .|..::......|.|..||.:       :......:.:|:|:.:   ||.::. 
  Rat   950 -VRWYMAIG--PLLTKVEGLVVHTNTGRAPKLASYYEYWEGKIYDVLVKLILKNL---QAFNSL- 1007

  Fly  1092 AGASGAPPTANDAPLFEVKLELTETEIRFSPAFDASVENNFQQIVEQLLLDIKQTCDCMPRIV-- 1154
                    ...:.|||:.:..|:..||...|        |..:|.:..:..|:...:.....|  
  Rat  1008 --------ILRNVPLFQAETILSAPEIILHP--------NANEIDKMCVHCIRGCVEVTKYFVRW 1056

  Fly  1155 ----ADNAPSEDDEDDDTATVDYEQELRWEPREDRAQELQERKKKDLELEQEQGDPKPQAVQFNL 1215
                ....|.:..|:::...:.:..::        :|..|         ..:|....||.:. .|
  Rat  1057 MNGSCIECPPQKGEEEEIVIISFYNDI--------SQNSQ---------IMDQAVMIPQNIH-RL 1103

  Fly  1216 LAAAKAYSQKMECTADGLEMLERAIRDALADTVAAASAYAAKFQAYAFLWTQQSSEVLAACMQTA 1280
            |.....|.|:.:......::.:..:.:..|.......||..|.|.||        ::.|..|:  
  Rat  1104 LVNIMKYLQRWKRYRPLWKLDKSIVMEKFAAKKPPCVAYDEKLQFYA--------KIAADVMR-- 1158

  Fly  1281 REQTHHVSAGGYAIMETFKKEIENYNEVHDAIDQCENRECINGWLALDIKPLKYGLLNLACKWSH 1345
                                        |..:   ::..||.    |.::||...:...|..|..
  Rat  1159 ----------------------------HPLV---KDEHCIR----LQLEPLANTVQENAKSWVT 1188

  Fly  1346 MCKKWLLRYVQGTLKELNAFIARGFETLQLHIAR------QDFATLLRVLAIMSEIREREPYADN 1404
            ...|.|....:..|..|...|.        |:|:      .....|..|||.:||||.:....:.
  Rat  1189 SLGKLLNESAREELYSLRDEIE--------HLAKNLKKSPNTLDDLKFVLATISEIRTKSLIMEL 1245

  Fly  1405 VFKPLKEIMGLLKTYNV---EFEPQLLRGIEQLPQQWQQLKHSSTVKQEALQDTRFHQQQRVTAL 1466
            .:|.::|....:..|::   |.|.:|:..||.:   |:.|...|...:.||...:    :..|.:
  Rat  1246 RYKDVQERYRTMAIYSIFPPEAEQELVDNIENM---WETLFTDSVNVEHALGGIK----RTFTEI 1303

  Fly  1467 IGLHTCHLQHYARQFQKMPFFRVPCPQVYDV--------CDEVYLRLHRFRRQQRLYTRWARLLD 1523
            ......:.:....:|.|..:...|.....|:        ..|..|..|...||:  .....:|.|
  Rat  1304 TRSEIINYRSQVDEFAKRFYSEGPGAVGEDLDKGSELLGSFEKELARHEKNRQE--LANAEKLFD 1366

  Fly  1524 IQPPDPATL--QFCEVE-----LRRVKQLWDFVRVIESCIVAWHATPWLLIDTDDMEHECKKFTR 1581
            :    |.|:  :..:|:     ||.:..|:|.:::.:.   .|..|.|:.::...::...:.|.:
  Rat  1367 L----PITMYPELMKVQKEMAGLRMIYDLYDSLKIAKE---EWSQTLWINLNVQYLQEGIEGFLK 1424

  Fly  1582 DLRTLDKCIREWAPYVHIVGVLRELVASLRAITELQNPAITERHWMELMQLTKLSYKCNKSTRLA 1646
            :||.|.:.:|..:...|:...::....|:..:.:|::.|:.||||.|||:.|.:.::..::..|.
  Rat  1425 NLRKLPRHVRSLSVAFHLETKMKAFKDSIPLLLDLKHEALRERHWKELMEKTGVFFEMTETFTLD 1489

  Fly  1647 QLLTLQLQHHEEDIKNTVDRAIKEMTVTKVLDEIKATWAHLEFELEQHH--TRPHIQLLKVSEEL 1709
            .:..::|..|.|.:...|..|:||:.:.|.:.||..||.:::|.:.:::  |:....:|...:::
  Rat  1490 NMFAMELHKHTEVLNEIVTAAVKEVAIEKAVKEILDTWENMKFTVVKYYKGTQERGYILGSVDDI 1554

  Fly  1710 IETLDDNQMQLQNISTSKHIEYLLDKLTHWQKVLGGIDTLIVNWFEVQRKWIYLECIFIGSADIR 1774
            |:.||||.:.||:||.|:.:...|..:..|:|.|..|..:|..|..|||||:|||.|||| .|||
  Rat  1555 IQCLDDNTVNLQSISGSRFVGPFLQTVHKWEKTLSLIGEVIEIWMLVQRKWMYLESIFIG-GDIR 1618

  Fly  1775 AQLPADAANFERIDEDFTALLAKVQEVRVVMQVVLRHDDVLAQLLQLQHRLAVCEKALNDYLETK 1839
            :|||.:|..|:.||..|..::....:..|:.: .....:.|..|..:...|..|:|:|||||::|
  Rat  1619 SQLPEEAKKFDVIDRIFKRIMGDTLKDPVIKR-CCEAPNRLHDLQTVSEGLEKCQKSLNDYLDSK 1682

  Fly  1840 RLAFPRFYFISAADLLDILSNGNNPQVIDRHLIKLFDSILRLQYETNTPNALGMHSKENDEYV-- 1902
            |.|||||:|||..:||.||.| ::|..:..|:||::|:|..|::          |..::.|.:  
  Rat  1683 RNAFPRFFFISDDELLSILGN-SDPLCVQEHMIKMYDNIAMLRF----------HDGDSGEKLVS 1736

  Fly  1903 PFVSFDPDQPAF---IVCGGRVELWLRAIIQQMRSTLHELFRRAL-RVFGEKPRELWLYDWPAQV 1963
            ..:|.:.:...|   :...||||.|:..::.:||.|...:.:.|: |...::.|..|:..:...|
  Rat  1737 AMISAEGEVMVFRKIVRAEGRVEDWMTTVLNEMRRTNRLITKEAIFRYCEDRSRVDWMMMYQGMV 1801

  Fly  1964 ALCCSQISWTADVNRSFGCMEEGYEGVMKELHKRQIAQLNALINLLLGELSPGDRQKIMTICTID 2028
            .|..||:.||.:|...|..:::|.:..||...|:...|::.|:..:..:||..||:|..|:..||
  Rat  1802 VLAASQVWWTWEVEDVFNKVKQGDKQAMKNYGKKMHRQIDDLVTRITMQLSKNDRKKYNTVLIID 1866

  Fly  2029 VHSRDVVGKIIASKVDNSLAFQWQSQLRHRWDDDQAGSSSGRASTAISCGGGDEDCFANI--CDA 2091
            ||:||:|...|...:..:..|:|:||||..||.:.                 ||   .||  |..
  Rat  1867 VHARDIVDSFIRGSILEAREFEWESQLRFYWDREP-----------------DE---LNIRQCTG 1911

  Fly  2092 EFRYAYEYLGNTSRLVITPLTDRCYITLTQSLRLRLAGATAGPAGTGKTETTKDLGRALGVMVYV 2156
            .|.|.|||:|...||||||||||.|:||||:|.:.|.||.|||||||||||||||.:|||::..|
  Rat  1912 TFGYGYEYMGLNGRLVITPLTDRIYLTLTQALSMYLGGAPAGPAGTGKTETTKDLAKALGLLCVV 1976

  Fly  2157 FNCSEQMDYKSCGNIYKGLAQTGAWGCFDEFNRICVEVLSVVAVQVKTIQEAIKMHKTQFIFMGE 2221
            .||.|.||||:.|.|:.||||.||||||||||||...||||::.|::||:.|:....|.|.|.|:
  Rat  1977 TNCGEGMDYKAVGKIFSGLAQCGAWGCFDEFNRIDASVLSVISSQIQTIRNALIHQLTTFQFEGQ 2041

  Fly  2222 RISLEPSVGIFITMNPGYAGRTELPENLKTLFRPCAMIVPDFALICEIMLMAEGFQDARLLARKF 2286
            .|||:..:||||||||||||||||||::|.||||..:||||...||||||.:|||..|:.||:|.
  Rat  2042 EISLDSRMGIFITMNPGYAGRTELPESVKALFRPVVVIVPDLQQICEIMLFSEGFLGAKTLAKKM 2106

  Fly  2287 ITLYTLCKELLSKQDHYDWGLRAIKSVLVVAGTLKRDDHSRPEDQVLMRALRDFNIPKIVTEDVP 2351
            ..||.|.:|.||||.|||:||||:|||||:||.|||......||.||||||||.|:||.|.||||
  Rat  2107 TVLYKLAREQLSKQHHYDFGLRALKSVLVMAGELKRGSADLQEDVVLMRALRDMNLPKFVFEDVP 2171

  Fly  2352 IFMGLIGDLFPALDVPRKRVFEFEKTIRRAVNEIKLQPEEGFLM------KVVQLQELLDVRHSV 2410
            :|:|||.||||.||.||.|..:|...:...:.      |.|:::      ||||:.|.:..||:.
  Rat  2172 LFLGLISDLFPGLDCPRVRYPDFNDAVEDVLE------ENGYVLLPVQVDKVVQMFETMLTRHTT 2230

  Fly  2411 FIVGNAGTGKTKIWQTLRETYRIQKLKPVCHVLNPKALSNDELFGIVNPTTREWKDGLFSSIMRE 2475
            .:||..|.||:.:..||.:......:....::|||||:|..||:||::||||:|.||:.|:|.||
  Rat  2231 MVVGPTGGGKSVVINTLCQAQTKLGILTKLYILNPKAVSVIELYGILDPTTRDWTDGVLSNIFRE 2295

  Fly  2476 QANMPPGNP--KWIVLDGDIDPMWIESLNTLMDDNKILTLASNERISLKREMRLLFEVGHLKAAT 2538
             .|.|....  |:|:.|||:|.:|:|::|::|||||:||||:.|||.|:....||||||.|:.|:
  Rat  2296 -INKPTDKKERKYILFDGDVDALWVENMNSVMDDNKLLTLANGERIRLQSHCALLFEVGDLQYAS 2359

  Fly  2539 PATVSRAGILYINPQDLGWSPYVSSWLETRVDMIERGILNALFEKYFPCLMQ---------RQRD 2594
            ||||||.|::|::|::|.:.||...||:...:.:|:..||.|||||.|.|:.         ||.:
  Rat  2360 PATVSRCGMVYVDPKNLKYQPYWKKWLQQIQNKVEQKYLNDLFEKYVPILIDLIIEGILDGRQGE 2424

  Fly  2595 -FRRITPITDMAMIQMTCHLLECLLDSDEGNADGRGRGSATGGAANPHSLHHGELSHEAMVMALE 2658
             .:.:.|.||:.|:.....:::.||:.:..:.|                             .||
  Rat  2425 KLKMVVPQTDLNMVTQLTKMMDSLLEGEIEDPD-----------------------------LLE 2460

  Fly  2659 TIFVYATVWSFGSALSQDVII-------------------DWHREFHKWWIGEFKDIKLPSQ-GT 2703
            ..|:.|...|.||:|.::..|                   :|.|.      ||     ||.. .|
  Rat  2461 CFFLEALYCSLGSSLLEEGRIKFDECIKNLSSMPTAETEGNWARP------GE-----LPGHLPT 2514

  Fly  2704 VFDYQLNVQTLKFQPWSELA---AHQSLEGQIDSETPLQNVLISTAETIRLAYFLKLLIDRNLAC 2765
            ::::..:.:...:.||::|.   .|...:..:|       :|:.|.:|.|..:.|:.::......
  Rat  2515 LYEFHFDSKRNYWIPWNKLVPEYVHNHQKRFVD-------ILVHTVDTTRTTWILEQMVKIKHPV 2572

  Fly  2766 MLVGNSGCGKGAIFRQLFGQYANDQELLEVAVSAATAGDSSHQQQSGNPAGAVVVRRKASSSATP 2830
            :.||.||..|.|. .|.|.:..|::..:.:.|                                 
  Rat  2573 LFVGESGTSKTAT-TQNFLKNLNEETNIVLMV--------------------------------- 2603

  Fly  2831 LLTTVQATHFNFYTSSEIFQKMLDRPLEKKSGRCYAPSGPKRRLIYFVNDLNMPEVDAYGTVQPH 2895
                    :|:..|:|...|:.|:..:||::...|.|...| ||:.|::|:|||:||.|||.||.
  Rat  2604 --------NFSSRTTSLDIQRNLEANVEKRTKDTYGPPMGK-RLLVFMDDMNMPKVDEYGTQQPI 2659

  Fly  2896 TIMRQFMDYRQWYDR-QRLQLKDIRHCQFAACMNPTAGSFT-IDPRLQRHFCVFSVAPPGEDTLH 2958
            .:::..::....||| :.|..|.||...|.|.|....|... :|||....|.||:|..|.|::||
  Rat  2660 ALLKLLLEKGYLYDRGKELNCKSIRDLGFIAAMGKAGGGRNEVDPRFLSLFSVFNVPFPSEESLH 2724

  Fly  2959 HIYGSILSSHLESPSQGFTKEIRSIGSLLVRVGIALHRRVEYAFLPTALKFHYLFNLRDLTGIYQ 3023
            .||.|||..|..:    |.:.|..:...|....:.|::.:.....||..||||:||||||:.::.
  Rat  2725 LIYYSILKGHTST----FAESISGVSRKLTFCTLTLYKNIVQDLPPTPSKFHYIFNLRDLSRVFN 2785

  Fly  3024 GLMNSVGAPASAGGGGASGFGGTICSRP------SELMRLYVHEAFRVYHDRLVDPYDIKSFKSS 3082
            ||                     :.:.|      |:::|::.:|..||:||||::..|.:..:..
  Rat  2786 GL---------------------VLTNPDRFQTVSQMVRVWRNECLRVFHDRLINEVDKQLVQDY 2829

  Fly  3083 IRDIFKKDFEDFDEDFVFAEPLIYSHFAQSLVDQK---YMPLKSWDSLYQLLIEAQASYNEVVGY 3144
            |.::.|:.|.| |.:.|..:|:::..|..:|.:::   |..::.:::...|..|....||||...
  Rat  2830 IGNLVKEHFND-DYEMVMRDPILFGDFRTALQEEEPRIYEDIQDYEAAKALFEEILEEYNEVNTK 2893

  Fly  3145 MNLVLFEDAMIHVCRINRILESPRGNALLIGVGGSGKQTLARLAAFISSLNVSQIQIKRGFGLLD 3209
            ||||||:||:.|:.|::||:...||:|||:||||||||:|||||||.:...|.:|.:.||:...:
  Rat  2894 MNLVLFDDALEHLTRVHRIIRMDRGHALLVGVGGSGKQSLARLAAFTAGYEVFEILLSRGYSENN 2958

  Fly  3210 MREEIGNLYMKVGLKNLASVFLISDAQIPDESILMLINDLLASGEIPELFNDDQLDTITNGIRNE 3274
            .|:::.|||||:||:|...:||.:||.:.:|..|.|||::|.||.:|.||.:::.|.|.:.|..|
  Rat  2959 FRDDLKNLYMKLGLENKLMIFLFTDAHVAEEGFLELINNMLTSGMVPALFTEEEKDNILSQIGQE 3023

  Fly  3275 VKQSGTLDTKENCWRYFVEKVRRLLKVVLCFSPVGQTLRVRARKFPAIISRTAIDWFHEWPKSAL 3339
            ..:.|....||:.|::||.|....|.:||..||||.|||.|.|.||.:::.|.||||..||..||
  Rat  3024 ALKHGMGPAKESVWQFFVNKSANNLHIVLGMSPVGDTLRTRCRNFPGLVNNTGIDWFMPWPPQAL 3088

  Fly  3340 ESVSQKFLNEINGILEPALVPPIGCFMAYVHGTVNQISRIYLQNEKRYNYTTPKTFLEYIFLYRK 3404
            .:|::.||.. |.::....:..:...:..||.:|.:.|:.:.|..:|.||.|||.:|::|..|.|
  Rat  3089 HAVAKSFLGN-NSMIPSEKLEDLVEHVVLVHQSVGEFSKQFQQKLRRSNYVTPKNYLDFINTYSK 3152

  Fly  3405 LLVDKNGEFAERIARLQSGMSKLAECARQVDTLKHQLAIQEVQLAAKNAAADKLI------VIVS 3463
            ||.:|......:..||:.|:.||.|...|:|.|..:||.|::.||.|:||.:.|:      ..::
  Rat  3153 LLDEKTQYNIAQCKRLEGGLDKLKEATIQLDELNQKLAEQKIVLAEKSAACETLLEEIATNTAIA 3217

  Fly  3464 AESEKVKRERYIASEEEKRVRIIEEDVSIKTKMCEEDLRQAEPALVAAQAALNTLNKNNLTELKS 3528
            .|.:|:..|:.|..||:.::      ::::....|..|.:..|.|.||:..|..|:|:::||::|
  Rat  3218 EEKKKLAEEKAIEIEEQNKI------IAVEKAEAETALAEVMPILEAAKLELQKLDKSDVTEIRS 3276

  Fly  3529 FGSPPKAVVNVCAAVMVLLASNGKIPRDRSWKASKLMMVRVDQFLNDLLNYNKDNIHPNIIETLQ 3593
            |..|||.|..||..::::     |..::.:||.:|.|| ....||..|:..:.|:|....::.::
  Rat  3277 FAKPPKQVQTVCECILIM-----KGYKELNWKTAKGMM-SDPNFLRSLMELDFDSITQGQVKNIK 3335

  Fly  3594 EYLKDPEFNPDKVVQKSVAAAGLCAWVINLHRYHQVFLIVGPKQQALQDSHQELLEARERLQYLK 3658
            ..||......:::...|.|..|:..:|..:..|..||..:.||:..:....:.....:..|:.::
  Rat  3336 GLLKTLNTTIEEMEAVSKAGLGMLKFVEAVMGYCDVFREIKPKRDKVARLERNFFLTKRELERIQ 3400

  Fly  3659 AKINNLEAKLAEIQAEFENAVGEKQRCQREADKTAFTIDLAHRLVNGLANENVRWKESVQSLLAK 3723
            .::..::.:|..:.|::|.|:.|||:.|.||:.....:..|.:|::||.:|||||...:..|:.:
  Rat  3401 NELAAIQKELEALGAKYEAAILEKQKLQEEAEIMERRLIAADKLISGLGSENVRWLNDLDELMHR 3465

  Fly  3724 IGTLPGDILLISSFLSYVGCFTRRYREELQHKMWLPNFRKIDPHIPHTEGVDTLALFSDDAQIAA 3788
            ...|.||.||.::||||.|.||..:|:.:.::.|..:.  :|..||.::......|.:||.:|:.
  Rat  3466 RVKLLGDCLLCAAFLSYEGAFTWEFRDAMVNQEWRNDI--LDRDIPLSQPFRLENLLTDDVEISR 3528

  Fly  3789 WNNEGLPMDRMSTENATILQYSTRWPLMIDPQLQGIKWIKNR-FGTDLVVLRLRQKGFLEALEKS 3852
            |.::|||.|.:|.:|..:...::|:||.||||.|.:.|||.: ...:|.|.......||:.||.|
  Rat  3529 WGSQGLPPDELSVQNGILTTRASRFPLCIDPQQQALNWIKRKEERNNLRVASFNDPDFLKQLEMS 3593

  Fly  3853 ISQGDTVLIEQIEESMDTVLEPLLSRAL-IKKGR-YLRIGDKEIEFHASFRLILHTKMANPHYKP 3915
            |..|...|...::|.:|.|::.:|.:.: |.:|| ::.:||||:::.::|||.|:||:|||.|.|
  Rat  3594 IKYGTPFLFHDVDEYIDPVIDNVLEKNIKISQGRQFIILGDKEVDYDSNFRLYLNTKLANPRYSP 3658

  Fly  3916 EMQAQTTLINFTVTPDGLEEQLLAEVVKIERPDLEQMKTEVTVQQNKFKISLKALEDELLARLAS 3980
            .:..:..:||:|||..|||:|||:.:|..||.:||:.:..:..:.::.|..||.|||.||..||:
  Rat  3659 SVFGKAMVINYTVTLKGLEDQLLSVLVAYERRELEEQREHLIQETSENKNLLKDLEDSLLRELAT 3723

  Fly  3981 SGENVLDDHALVINLENTKRTVDEIEAKVREARVTTLQIDDTRNIYRSAAKRAAILYFVLTDLSR 4045
            |..|:||:..||..||.||....|:..|::.|..|.|.||..|:.||.||:|.|||:|||::::.
  Rat  3724 STGNMLDNVELVQTLEETKSKATEVSEKLKLAEKTALDIDRLRDGYRPAARRGAILFFVLSEMAL 3788

  Fly  4046 INPIYKFSLKSFMNVFRQAIAMAAESKNYEKRVLHLVESITLQTYRYTLRGLFEADKLTFTSHMT 4110
            :|.:|::||.:|:.||..::..:.......||:.::::::|...|.|...||||..||.|:.:||
  Rat  3789 VNSMYQYSLIAFLEVFGLSLKKSLPDSILLKRLKNIMDTLTFNIYNYGCTGLFEKHKLLFSFNMT 3853

  Fly  4111 LRILIAAEQVAKDETDFLLRFPHDPTTLS--------PLDFVGRSAWGGIKSLTLIEHF---YG- 4163
            ::|..|..:|.:||.||.|:     ..:|        |..::....|..|  :.|.|.|   :| 
  Rat  3854 IKIEQAEGRVPQDELDFFLK-----GNISLEKSKWKKPCTWLSDQGWEDI--ILLSEKFSDIFGN 3911

  Fly  4164 IDKDMENYTKRWRKFMASDTPEREQFPGEW-KHRTPLQKLCIIRSLRPDRMTYAMRQFVEQTMGR 4227
            :..|:|:....|:::...|:.|:..||..: .|.|..|||.|:|..|.||:..|:..:|..|||.
  Rat  3912 LPFDIEHNLPTWQEWYDKDSLEQFPFPLRYDDHITAFQKLLILRCFRVDRVYRAVTDYVTLTMGE 3976

  Fly  4228 SYAEIQTPP---FGAIFQELNAATPAFFILSPGVDPIRDVERYGQRQGFHSESDTLVNISLGQGQ 4289
            .|.:   ||   |.|||::....:|..||||||.||..|:.:..:|.||  ....|..:::||||
  Rat  3977 KYVQ---PPMISFEAIFEQSTPNSPIVFILSPGSDPASDLMKLAERSGF--GGTRLKFLAMGQGQ 4036

  Fly  4290 ELLAEQAIIGALESGQQWVILQNIHLVVNWLPTLEKLIERIVLQSESKGESNFRLFISAEPAPDP 4354
            |.:|.|.:..|:..| ||::|||.||:|.||..|||.:|||     :|...:|||:::.:|... 
  Rat  4037 EKVALQLLETAVARG-QWLMLQNCHLLVKWLKDLEKSLERI-----TKPHPDFRLWLTTDPTKG- 4094

  Fly  4355 QYHVIPQGILESSLKVVNEPPSGMAANLHKAWDNFSQDALETCTQEAEFKSILFALCYFHAVAGE 4419
                .|.|||:.|||||.|||:|:..|:...:...|.|.||.|...| ||.:::.|.:||||..|
  Rat  4095 ----FPIGILQKSLKVVTEPPNGLKLNMRATYFKISHDMLEQCPHTA-FKPLVYVLAFFHAVVQE 4154

  Fly  4420 RRKFGPQGWNKVYPFNIGDLTISSNVLHNYL-----EGSNRIPWEDLRYLFGEIMYGGHITDDWD 4479
            |||||..|||..|.||..|..:...:|:.||     :...||||..|:||.||:||||...|.:|
  Rat  4155 RRKFGKIGWNVYYDFNESDFQVCMEILNTYLTKAFQQHDPRIPWGSLKYLIGEVMYGGRAIDSFD 4219

  Fly  4480 RRLCQTYLEELLQQDLIDG------------DFELCPGFPAPPNLDFEGYHSYITEMLP-EESPL 4531
            ||:..||::|.|...:.|.            |:::..|       |.:.......|.|| ..:|.
  Rat  4220 RRILTTYMDEYLGDFIFDTFQPFHFFRNKDVDYKIPVG-------DVKDKFVEAIEALPLANTPE 4277

  Fly  4532 LYGLHPNAEIGFLTTASEQLLRTIFELQPRESELSSHCGAPREELVKIMIDDFLDKLQDEFNLQA 4596
            ::|||.|||||:.|.|:..:...:.||||:..|.||  |..|::.:..:..|..:|:...|:|..
  Rat  4278 VFGLHSNAEIGYYTQAARDMWGHLLELQPQTGESSS--GVSRDDYIGQVAKDIENKMPKIFDLDQ 4340

  Fly  4597 LLNRVERK------TPFVVVALQECERMNALIREIKRSLRELMLGLRGELTITQEMERLDHAIFY 4655
            :     ||      :|..||.|||..|.|.|:..:.|||.||...|.||:.::.|::.:..::|.
  Rat  4341 V-----RKHLGLNISPTSVVLLQELGRFNKLVIRMTRSLAELQRALAGEVGMSNELDDVARSLFL 4400

  Fly  4656 DHVPAAWARLAYPSMLGLQSWFADLLHRIKELAGWLNDFKLPCAIWLGGLFNPQSFLTAIMQESA 4720
            .|:|..|.:||..::..|.:|....|.|..:...|:.:.: |..:||.||..|:|:|||::|.:.
  Rat  4401 GHIPHIWRKLAPDTLKTLGNWMVYFLRRFNQYTLWVTESE-PSVMWLSGLHIPESYLTALVQATC 4464

  Fly  4721 RKHDLPLDRMLISCDVTKKQ-KDDVTLPPMEGAFVHDLYMDGASWDCQLNSIVALRPKEMLCAMP 4784
            |::..||||..:...|||.| .|:|.....:|.||..||::||.||.:...:|..:||.::..:|
  Rat  4465 RRNGWPLDRSTLFTQVTKFQDADEVNERAGQGCFVSGLYLEGADWDIERGCLVKSKPKVLVVDLP 4529

  Fly  4785 VIYIKSIVQEKQELQRVYECPLYKTRSRGNT----YVWTFNLKTRERPSRWILGGVALLL 4840
            ::.|..|...:.:||..:..|:|.|..|.|.    .|:..:|.|.:..|.|:|.||.|.|
  Rat  4530 ILKIIPIEGHRLKLQNTFRTPVYTTSMRRNAMGVGLVFEADLFTAKHISHWVLQGVCLTL 4589

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
CG3339NP_001036762.2 DHC_N1 276..903 CDD:285571 134/662 (20%)
DHC_N2 1535..1944 CDD:285579 126/420 (30%)
P-loop_NTPase 2095..2324 CDD:304359 148/228 (65%)
P-loop_NTPase 2409..2544 CDD:304359 64/136 (47%)
P-loop_NTPase 2731..3061 CDD:304359 89/337 (26%)
P-loop_NTPase 3138..3406 CDD:304359 117/267 (44%)
MT 3419..3759 CDD:289543 100/345 (29%)
AAA_9 3789..4001 CDD:289547 86/214 (40%)
Dynein_heavy 4142..4832 CDD:281078 253/726 (35%)
Dnah10XP_008767494.2 DHC_N1 309..879 CDD:400611 136/674 (20%)
DHC_N2 1375..1780 CDD:400618 126/420 (30%)
DYN1 <1616..4234 CDD:227570 1019/2811 (36%)
AAA_6 1915..2241 CDD:403853 193/331 (58%)
AAA_8 2894..3153 CDD:403858 112/259 (43%)
Dynein_C 4291..4589 CDD:408026 99/305 (32%)


Information from Original Tools:


Tool Simple Score Weighted Score Original Tool Information
BLAST Result Score Score Type Cluster ID
Compara 00.000 Not matched by this tool.
Domainoid 00.000 Not matched by this tool.
eggNOG 00.000 Not matched by this tool.
Hieranoid 00.000 Not matched by this tool.
Homologene 00.000 Not matched by this tool.
Inparanoid 00.000 Not matched by this tool.
OMA 00.000 Not matched by this tool.
OrthoDB 1 1.010 - - D1492at2759
OrthoFinder 00.000 Not matched by this tool.
OrthoInspector 00.000 Not matched by this tool.
orthoMCL 00.000 Not matched by this tool.
Panther 00.000 Not matched by this tool.
Phylome 00.000 Not matched by this tool.
SonicParanoid 00.000 Not matched by this tool.
SwiftOrtho 00.000 Not matched by this tool.
TreeFam 00.000 Not matched by this tool.
11.010

Return to query results.
Submit another query.