DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment CG3339 and Dnah9

DIOPT Version :9

Sequence 1:NP_001036762.2 Gene:CG3339 / 43295 FlyBaseID:FBgn0039510 Length:4842 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:XP_002727768.2 Gene:Dnah9 / 117251 RGDID:621799 Length:4484 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:4816 Identity:2216/4816 - (46%)
Similarity:3070/4816 - (63%) Gaps:410/4816 - (8%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly    85 GDLVPRSCLSDLYLPYSVQSARGSIPSAMLPAED----EAMATVTAAVS----AVVSATPGALLI 141
            ||  ||..|...::..|::.|.|:.......||.    :|.....||..    .||.:.||.|::
  Rat    19 GD--PRLRLLGTFVARSLRPAAGTWERCAGTAEAGRLLQAFLDHNAAAGPCPLLVVQSGPGGLVV 81

  Fly   142 PLPPASSSFTTLDGVP-----RGKCAYFVRRNTSDGPLTASNFAESVLYGDFPVHSKIETMSLLF 201
              .|.      ||..|     |.|..:|:|  |...|....:...:||.||.|. ..:|.::.|.
  Rat    82 --RPG------LDAGPEPNQARAKGLFFLR--TRSEPPGNHSLRGTVLCGDLPA-VPLEHLAPLL 135

  Fly   202 DDVLQPLLEQAQS--QWPAIVRKDLQARIKEVRNTLTEIKGKTNNRTILSLLVSPTIVEEVFAHV 264
            .:|:.|:|:..::  .||.:|.:|::.....:::.|..|......||:|.|.|....||.|    
  Rat   136 SEVIIPVLDNEKNHLDWPHMVCQDIRHHAHSLQSDLLVILEHMKGRTLLPLPVGSEKVEFV---- 196

  Fly   265 SQGHLRPALDPKFRN---LLEEMFINWTTQMHDIVLERSECQPLGSTTQSAGHQPKYITLVSLPA 326
             .|...|.||...::   .:|...|.|:.|: .:||:|...|||     ..|.:|       .|.
  Rat   197 -DGQSEPVLDSIDKSTVYAMESAVIKWSHQV-QVVLKRESSQPL-----IQGEKP-------TPK 247

  Fly   327 QEIGFWTNRKLNLQNIYEQLRESTHKTLAQILERIESVYYEPYATAFRKLVAAWLEAQDVSLWLQ 391
            .|:.||.:|..:|::||.||.....:.:|.:|::::|.|...:...|:.:.||..||||:.:.|.
  Rat   248 VELEFWKSRCEDLEHIYNQLMTIKVRGMAGLLDKLQSSYLPAFKAMFQDVEAALTEAQDIRVHLL 312

  Fly   392 PLLRQTAAFNSVQFSNGHDLVAPLVHIVHLVWSNARYYRSTQRMSVLLRCICNMLVHRAAEDLEL 456
            ||.:......:::|......:.||:|:|.|:|:|.::|||..|::|||:.|||:|:.:|:..|..
  Rat   313 PLQQHLDILENMEFPEVKGRLRPLLHVVCLIWANCKWYRSPGRLTVLLQEICNLLIQQASNYLSP 377

  Fly   457 QLLFQGDADEGLLKINRTIAVLELFKQRMLDYKERYAGSQVLLPALSEGAAAVASSPSPDDQQQL 521
            :.|.:.:.:|...|:......|..|||...|.:|.      |.....|           |.:.:.
  Rat   378 EDLLRSEVEESQRKLQIVSDTLSFFKQAFQDRREH------LHTYFKE-----------DSEVRA 425

  Fly   522 WRFCHEDVFGQTLDGFSLQLLELRQVFEAAVQFQQLEKLEVGGLRGKILTERVREIFGEFKVLFE 586
            |.|....||.: ||||..:|..:..:.:.|:.|.:|||||..||||..|:::|:::..||:.:::
  Rat   426 WDFQASLVFVR-LDGFLGRLRMVEDLLKTALDFNKLEKLEFSGLRGNSLSQKVQQMHEEFEEMYK 489

  Fly   587 QWSNVDIDLTATVASKWKCFRREQTLFFSRMQLLEQKLATVLLQAFEQCHSWMHLLRLTLMFGSL 651
            .:.:...|.....:.:   |..:...|..|::.|:::|.|:|:|||:......|..:|..:.|:|
  Rat   490 VFLDCSYDCLNPESME---FENDVCGFNKRVEDLDRRLGTILIQAFDDVPEVEHAFKLLDITGTL 551

  Fly   652 LQREAVRPELARVLPHILFIYDTEMEQLEDSVGEVLLGYEIR-----GLAALPLANNFPPIANAM 711
            ::|..|..:::.....::.:::||::.:     .::....||     |.:  |:..|.|.:|..:
  Rat   552 VERPLVAQDVSHKYLALIRMFNTELDAV-----RIIYSQHIREEVEHGFS--PVHKNMPTMAGGI 609

  Fly   712 MWLEQHISRCDEFGAKELSQLVEQLLKEKSELQTLPIQW-------NSLLSRRNILTTKLSNLQM 769
            .|            |:||.|.::...   |..:.:| .|       ..::.:...|.|.|...:.
  Rat   610 RW------------AQELRQRIKGPF---SNFKNIP-HWCLQSAEGKRMIQKYEDLLTLLEEYER 658

  Fly   770 KIWISWHECVDKLIIQGLDESVLSRSQDLSQLHLNFSQVLFTLLKETKYLLALQATGSLSGDLFQ 834
            :::..|.:.|.:...:.|...:|.|.....||.:||:..|.::|||..|   ||.|     ::..
  Rat   659 RLYEDWCQTVSEKSQRNLSLPLLHRDPITKQLSVNFNSQLISVLKEMNY---LQPT-----EVKP 715

  Fly   835 LPEPLLTLYGHRDAYWERRIRLIKIGEFYNGIRSGECAAAELQLIRNDLASIDEHVEVACQQLTW 899
            :||....::..|:.|.:....|..:..:||.:.: .....|..|:..:|.:||..:..|.:.|:|
  Rat   716 IPETAAAMFSSREFYRQLVANLELMANWYNKVIT-TLLEVEFPLVEEELQNIDLRLRAAEETLSW 779

  Fly   900 RNYNDELVAGIFEQS-------RDLFARLQQSHGNLDAILASMRRWSREPLHQRSLYGRNL-LDL 956
            :      ..||::.:       .||..|:|::..|::.|...|:.|. .|:.:|....:.. |.|
  Rat   780 K------TEGIWDYAMQITNSIHDLERRIQKTKDNVEEIQTIMKTWV-SPIFKRKDGKKECPLSL 837

  Fly   957 RHQQDRVRLRLLQCDETKMLLNRLLIANFCLFFNYESQEFQLYSRDLSVQEFIREFPEEQRRQYN 1021
            ..|||.:........|:.:.::.|:..|..||                       ..:.....:.
  Rat   838 DDQQDLLEKYYSLIRESGLKIHALVQENLVLF-----------------------AADPASSTWK 879

  Fly  1022 KYLASVDELICREVREAMRISLEYLYKEMTATATATTTPTAPPVDPGCSAGMARLVLQQITTPQA 1086
            .|:..:|.::......|:..||:||.:                 :..|..|:             
  Rat   880 SYVGHIDSMLLDGFFLAIECSLKYLLE-----------------NTECKPGL------------- 914

  Fly  1087 TSTAGAGASGAPPTANDAPLFEVKLELTETEIRFSPAFDASVENNFQQIVEQLLLDIKQTCDCMP 1151
                             .|:||.:|.|...|:.|.|:.|:.|:.....||:.|:..|......:|
  Rat   915 -----------------TPIFEAQLNLVTPELVFYPSLDSGVKGGLYDIVQSLVTSIFAVPSLVP 962

  Fly  1152 RIVADNAPSEDDEDDDTATVDYEQELRWEPREDRAQELQERKKKDLELEQEQGDPKPQAVQFNLL 1216
            |                                              |....|.|.         
  Rat   963 R----------------------------------------------LSPHSGSPH--------- 972

  Fly  1217 AAAKAYSQKMECTADGLEMLERAIRDALADTVAAASAYAAKFQAYAFLWTQQSSEVLAACM---- 1277
                 |...:|..|| |..|...:.:.:...:....:|......|::|:.:...|.|...:    
  Rat   973 -----YQGDLEEMAD-LASLRSLLLERVQTMMTLCCSYRNTLSQYSYLYVEDRKEALGQFLLYGH 1031

  Fly  1278 -QTAREQTHHVSAG---GYAIMETFKKEIENYNEVHDAIDQCENRECINGWLALDIKPLKYGLLN 1338
             .|..|...||..|   ...::..||.:|::|.::::.:...|..:..:||:.:|::|.|..|||
  Rat  1032 VLTPEEIEAHVEDGIPESPPLLHHFKDQIDSYEKLYEDVVSLEPSKVFDGWMRVDVRPFKASLLN 1096

  Fly  1339 LACKWSHMCKKWLLRYVQGTLKELNAFIARGFETLQLHIARQDFATLLRVLAIMSEIREREPYAD 1403
            ...|||.|.|:.|:.:|..:|.:|::||......|...:.:.||..|:.::..:..::||:...|
  Rat  1097 TIKKWSLMFKQHLVDFVTNSLADLDSFIKSTECGLLKRVEKGDFQGLVEIMGHLVTLKERQSSTD 1161

  Fly  1404 NVFKPLKEIMGLLKTYNVEFEPQLLRGIEQLPQQWQQLKHSS-TVKQEA--LQDTRFH-QQQRVT 1464
            ::|:|||:.:.|||:|..|....:.:.:|:||::|:.:|..: ||:|:.  ||..... .:||.:
  Rat  1162 DMFEPLKQTIELLKSYEQELPETVFKQLEELPEKWKNVKKMAITVRQQVAPLQANEVALLRQRCS 1226

  Fly  1465 ALIGLHTCHLQHYARQFQKMPFFRVPCPQVYDVCDEVYLRLHRFRRQQRLYTRWARLLDIQPPDP 1529
            |.    ....|.:..:|.|...||......:.:.|..::.:..........::.|.|.::..||.
  Rat  1227 AF----DDEQQQFQERFHKEAPFRFDSINPHQMLDVWHMEIQHMESTMATISKSADLFEVNVPDY 1287

  Fly  1530 ATLQFCEVELRRVKQLWDFVRVIESCIVAWHATPWLLIDTDDMEHECKKFTRDLRTLDKCIREWA 1594
            ..|:.|..|..::|:|||.:.::.|.|.||.||.|..|..:.|:.|||:|.|.:|.|||..|.|.
  Rat  1288 KQLRQCRKEACQLKELWDTIGMVTSSIQAWEATSWRNISVEAMDSECKQFARQIRNLDKEFRTWD 1352

  Fly  1595 PYVHIVGVLRELVASLRAITELQNPAITERHWMELMQLTKLSYKCNKSTRLAQLLTLQLQHHEED 1659
            .:..:...:...:.||||:.|||||||.||||.:|||.|.:::..::.|.||.||.|||.|.|::
  Rat  1353 AFTGLESTVLNTLTSLRAVAELQNPAIRERHWRQLMQATGVNFTMDRDTTLAHLLQLQLHHFEDE 1417

  Fly  1660 IKNTVDRAIKEMTVTKVLDEIKATWAHLEFELEQHHTRPHIQLLKVSEELIETLDDNQMQLQNIS 1724
            :::.||||:|||::.|.|.|::.|||.:||:.|. |.|.||.||:..|:|||.|:|||:||||:.
  Rat  1418 VRDIVDRAVKEMSMEKTLKELQTTWASMEFQYET-HARTHIPLLQSDEDLIEVLEDNQVQLQNLM 1481

  Fly  1725 TSKHIEYLLDKLTHWQKVLGGIDTLIVNWFEVQRKWIYLECIFIGSADIRAQLPADAANFERIDE 1789
            .||::.:.|::::.|||.|...|::|..||||||.|.:||.|||||.|||||||.||..||.||.
  Rat  1482 MSKYVAFFLEEVSSWQKKLSTADSVISIWFEVQRTWSHLESIFIGSEDIRAQLPQDAKRFESIDS 1546

  Fly  1790 DFTALLAKVQEVRVVMQVVLRHDDVLAQLLQLQHRLAVCEKALNDYLETKRLAFPRFYFISAADL 1854
            ||..|:...|:...|::.. ....:..:|..:|.||.:|||||.:||:|||||||||||:|::||
  Rat  1547 DFRELVYDAQKTPNVVEAT-NKSGLYEKLEDIQSRLCLCEKALAEYLDTKRLAFPRFYFLSSSDL 1610

  Fly  1855 LDILSNGNNPQVIDRHLIKLFDSILRLQYETN-----TPNALGMHSKENDEYVPFVSFDPDQPAF 1914
            |||||||..||.:.|||.||||::.::|::.:     |..:|||:||| :|||.|     .:|. 
  Rat  1611 LDILSNGTAPQQVQRHLSKLFDNMAKMQFQLDASQNPTKTSLGMYSKE-EEYVAF-----SEPC- 1668

  Fly  1915 IVCGGRVELWLRAIIQQMRSTLHELFRRALRVFGEKPRELWLYDWPAQVALCCSQISWTADVNRS 1979
             .|.|:||:||..:::.|::|:......|:..:.||||:.||:|:||||||.|:||.||.:|..:
  Rat  1669 -DCSGQVEIWLNRVLRHMKATVRHEMTEAVTAYEEKPRDQWLFDYPAQVALTCTQIWWTTEVGIA 1732

  Fly  1980 FGCMEEGYEGVMKELHKRQIAQLNALINLLLGELSPGDRQKIMTICTIDVHSRDVVGKIIASKVD 2044
            |..:|||||..||:.:|:|:|||..||.:|:|:||.|||||||||||||||:||||.|:||.|||
  Rat  1733 FARLEEGYENAMKDYYKKQVAQLKTLITMLIGQLSKGDRQKIMTICTIDVHARDVVAKMIAQKVD 1797

  Fly  2045 NSLAFQWQSQLRHRWDDDQAGSSSGRASTAISCGGGDEDCFANICDAEFRYAYEYLGNTSRLVIT 2109
            |:.||.|.|||||||||:.                  :.||||||||:|.|:|||||||.|||||
  Rat  1798 NAQAFLWLSQLRHRWDDEA------------------KHCFANICDAQFLYSYEYLGNTPRLVIT 1844

  Fly  2110 PLTDRCYITLTQSLRLRLAGATAGPAGTGKTETTKDLGRALGVMVYVFNCSEQMDYKSCGNIYKG 2174
            ||||||||||||||.|.::||.||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||
  Rat  1845 PLTDRCYITLTQSLHLTMSGAPAGPAGTGKTETTKDLGRALGIMVYVFNCSEQMDYKSCGNIYKG 1909

  Fly  2175 LAQTGAWGCFDEFNRICVEVLSVVAVQVKTIQEAIKMHKTQFIFMGERISLEPSVGIFITMNPGY 2239
            ||||||||||||||||.||||||||||||:||:||:..|.:|.|:||.|||:|||||||||||||
  Rat  1910 LAQTGAWGCFDEFNRISVEVLSVVAVQVKSIQDAIRDKKQRFSFLGEEISLDPSVGIFITMNPGY 1974

  Fly  2240 AGRTELPENLKTLFRPCAMIVPDFALICEIMLMAEGFQDARLLARKFITLYTLCKELLSKQDHYD 2304
            |||||||||||.|||||||:||||.|||||||:||||.:||||||||||||.|||||||||||||
  Rat  1975 AGRTELPENLKALFRPCAMVVPDFELICEIMLVAEGFIEARLLARKFITLYRLCKELLSKQDHYD 2039

  Fly  2305 WGLRAIKSVLVVAGTLKRDDHSRPEDQVLMRALRDFNIPKIVTEDVPIFMGLIGDLFPALDVPRK 2369
            ||||||||||||||:|||.|..|||||||||:|||||||||||:|:|:|||||.|||||||||||
  Rat  2040 WGLRAIKSVLVVAGSLKRGDPDRPEDQVLMRSLRDFNIPKIVTDDMPVFMGLISDLFPALDVPRK 2104

  Fly  2370 RVFEFEKTIRRAVNEIKLQPEEGFLMKVVQLQELLDVRHSVFIVGNAGTGKTKIWQTLRETYRIQ 2434
            |..:||..:|:|:.::|||.|:.|::|||||:|||.|||||||||.|||||:::.::|.:||:|.
  Rat  2105 RDLDFEAVVRKAIVDLKLQAEDNFVLKVVQLEELLAVRHSVFIVGGAGTGKSQVLKSLHKTYQIM 2169

  Fly  2435 KLKPVCHVLNPKALSNDELFGIVNPTTREWKDGLFSSIMREQANMPPGNPKWIVLDGDIDPMWIE 2499
            :.:||...|||||::|||||||:||.|||||||||||||||.||:....||||:|||||||||||
  Rat  2170 RCRPVWTDLNPKAVTNDELFGIINPATREWKDGLFSSIMRELANISHDGPKWILLDGDIDPMWIE 2234

  Fly  2500 SLNTLMDDNKILTLASNERISLKREMRLLFEVGHLKAATPATVSRAGILYINPQDLGWSPYVSSW 2564
            ||||:|||||:|||||||||.|...||||||:.||:.||||||||||||||||.||||:|.|:||
  Rat  2235 SLNTVMDDNKVLTLASNERIPLNPTMRLLFEISHLRTATPATVSRAGILYINPADLGWNPPVNSW 2299

  Fly  2565 LETRVDMIERGILNALFEKYFP-CLMQRQRDFRRITPITDMAMIQMTCHLLECLLDSDEGNADGR 2628
            ::.|....||..|..||:||.| ||...:..|::|.|:.:.:||||.|:||||||..:...||  
  Rat  2300 IDQREVQTERANLTILFDKYLPTCLDTLRTRFKKIIPVPEQSMIQMLCYLLECLLTKEAVPAD-- 2362

  Fly  2629 GRGSATGGAANPHSLHHGELSHEAMVMALETIFVYATVWSFGSALSQDVIIDWHREFHKWWIGEF 2693
                      .|..::             |..||:|.:|:|||::.||.::|:..||.|||:.||
  Rat  2363 ----------CPKEIY-------------ELYFVFAAIWAFGSSMVQDQLVDYRAEFSKWWLTEF 2404

  Fly  2694 KDIKLPSQGTVFDYQLNVQTLKFQPWSELAAHQSLEGQIDSETPLQNVLISTAETIRLAYFLKLL 2758
            |.:|.|||||||||.::.:|.||:||.:|..    :.:.|.|.|||..|:.|:||||:.||::.|
  Rat  2405 KTVKFPSQGTVFDYYIDQETKKFEPWGKLIP----QFEFDPEMPLQACLVHTSETIRVCYFMERL 2465

  Fly  2759 IDRNLACMLVGNSGCGKGAIFRQLFGQYANDQELLEVAVSAATAGDSSHQQQSGNPAGAVVVRRK 2823
            ::|....||||::|.||                                         :|:|..|
  Rat  2466 MERRRPVMLVGSAGSGK-----------------------------------------SVLVGAK 2489

  Fly  2824 ASSSATPLLTTVQATHFNFYTSSEIFQKMLDRPLEKKSGRCYAPSGPKRRLIYFVNDLNMPEVDA 2888
            . ||..|....|:...||:||:|.:.|.:|::|||||:||.|.|.| .|:||||::|:|||||||
  Rat  2490 L-SSLNPEEYMVKNVPFNYYTTSAMLQAVLEKPLEKKAGRNYGPPG-NRKLIYFIDDMNMPEVDA 2552

  Fly  2889 YGTVQPHTIMRQFMDYRQWYDRQRLQLKDIRHCQFAACMNPTAGSFTIDPRLQRHFCVFSVAPPG 2953
            ||||||||::||.:||..||||.:|.||:|.:.|:.:|||||||||||:|||||||.||::..||
  Rat  2553 YGTVQPHTVIRQHLDYGHWYDRNKLSLKEIMNVQYISCMNPTAGSFTINPRLQRHFSVFALCFPG 2617

  Fly  2954 EDTLHHIYGSILSSHLESPSQGFTKEIRSIGSLLVRVGIALHRRVEYAFLPTALKFHYLFNLRDL 3018
            .|.|..||.:||:.||:..:...|.: :||.| |:.:.:..|:::...|||||:||||:|||||.
  Rat  2618 ADALSSIYSTILTHHLKLGNFPTTLQ-KSIPS-LINLAVTFHQKIATTFLPTAIKFHYIFNLRDF 2680

  Fly  3019 TGIYQGLMNSVGAPASAGGGGASGFGGTICSRPS-ELMRLYVHEAFRVYHDRLVDPYDIKSFKSS 3082
            ..|:||::                |..|.|.:.: :|::||:||:.|||.|::|:..|...|...
  Rat  2681 ANIFQGIL----------------FSSTECVKSTQDLVKLYLHESDRVYRDKMVEEKDFNLFDKL 2729

  Fly  3083 IRDIFKKDFEDFDEDFVFAEPL-IYSHFAQSLVDQKYMPLKSWDSLYQLLIEAQASYNEVVGYMN 3146
            ..:..||:|:|........:.| :|.|||..:.:.||||::|||.|.|.|:||..|:|||...|:
  Rat  2730 QTEFLKKNFDDSKGMLEQTQNLNMYCHFANGIGEPKYMPVQSWDLLSQTLVEALESHNEVNAVMD 2794

  Fly  3147 LVLFEDAMIHVCRINRILESPRGNALLIGVGGSGKQTLARLAAFISSLNVSQIQIKRGFGLLDMR 3211
            |||||||:.|:|.||||||||||||||:||||||||:|.||||||||::|.||.:::|:.:.|.:
  Rat  2795 LVLFEDAIHHICHINRILESPRGNALLVGVGGSGKQSLTRLAAFISSMDVFQITLRKGYQIPDFK 2859

  Fly  3212 EEIGNLYMKVGLKNLASVFLISDAQIPDESILMLINDLLASGEIPELFNDDQLDTITNGIRNEVK 3276
            .::.:|.:|.|:|||::|||::||.:.||..|:||||||||||||:|:::::.:.|.|.:|||||
  Rat  2860 VDLASLCLKAGVKNLSTVFLMTDAHVADERFLVLINDLLASGEIPDLYSEEEEENIINNVRNEVK 2924

  Fly  3277 QSGTLDTKENCWRYFVEKVRRLLKVVLCFSPVGQTLRVRARKFPAIISRTAIDWFHEWPKSALES 3341
            ..|.:|::||||::|:|:|||.|||.|||||||..||:|:||||||::.|||:||||||:.||||
  Rat  2925 SQGLIDSRENCWKFFIERVRRQLKVTLCFSPVGNKLRIRSRKFPAIVNCTAINWFHEWPQEALES 2989

  Fly  3342 VSQKFLNEINGILEPALVPPIGCFMAYVHGTVNQISRIYLQNEKRYNYTTPKTFLEYIFLYRKLL 3406
            ||.:||.....| |||:...|..|||:||.:||:||:.||.||:||||||||:|||:|.||:.||
  Rat  2990 VSLRFLQNTKNI-EPAVKQSISKFMAFVHISVNKISQSYLINEQRYNYTTPKSFLEFIRLYQSLL 3053

  Fly  3407 VDKNG-EFAERIARLQSGMSKLAECARQVDTLKHQLAIQEVQLAAKNAAADKLIVIVSAESEKVK 3470
             ::|| |...::.||::|:.||...:.|||.||.:||.|||:|..||...||||.:|..|:.||.
  Rat  3054 -ERNGKELQSKVERLENGLLKLHSTSAQVDDLKAKLATQEVELRQKNEDTDKLIQVVGVETSKVS 3117

  Fly  3471 RERYIASEEEKRVRIIEEDVSIKTKMCEEDLRQAEPALVAAQAALNTLNKNNLTELKSFGSPPKA 3535
            ||:.||.|||::|.:|..:|..|.|.|||||.:|||||.|||||||||||.||||||||||||.|
  Rat  3118 REKAIADEEEQKVALIMLEVQQKQKDCEEDLAKAEPALTAAQAALNTLNKTNLTELKSFGSPPLA 3182

  Fly  3536 VVNVCAAVMVLLASNGKIPRDRSWKASKLMMVRVDQFLNDLLNYNKDNIHPNIIETLQEYLKDPE 3600
            |.||.||||||:|..||:|:||||||:|:.|.:||.||:.|::::|:|||.|.::.::.||:||.
  Rat  3183 VSNVSAAVMVLMAPGGKVPKDRSWKAAKITMTKVDSFLDSLIHFDKENIHENCLKAIRPYLQDPA 3247

  Fly  3601 FNPDKVVQKSVAAAGLCAWVINLHRYHQVFLIVGPKQQALQDSHQELLEARERLQYLKAKINNLE 3665
            |||:.|..||.||||||:||||:.|:::||..|.||:|||..:..:|..|:|:|..:||||.:|.
  Rat  3248 FNPEFVATKSYAAAGLCSWVINIVRFYEVFCDVEPKRQALNKATSDLTAAQEKLAAIKAKITHLN 3312

  Fly  3666 AKLAEIQAEFENAVGEKQRCQREADKTAFTIDLAHRLVNGLANENVRWKESVQSLLAKIGTLPGD 3730
            ..||::..:||.|..||.:||:||:.||.||.||:|||.|||:|||||.|:||:...:..||.||
  Rat  3313 ENLAKLTTKFEKATAEKLKCQQEAEVTAGTISLANRLVGGLASENVRWAEAVQNFRQQERTLCGD 3377

  Fly  3731 ILLISSFLSYVGCFTRRYREELQHKMWLPNFRKIDPHIPHTEGVDTLALFSDDAQIAAWNNEGLP 3795
            |||.::|:||:|.||::||:.|....|.|...::...||.|..:|.|.:.:|||.:|.|.|||||
  Rat  3378 ILLTTAFISYLGFFTKKYRKSLMDGTWKPYLSQLKVPIPTTPTLDPLKMLTDDADVATWQNEGLP 3442

  Fly  3796 MDRMSTENATILQYSTRWPLMIDPQLQGIKWIKNRFGTDLVVLRLRQKGFLEALEKSISQGDTVL 3860
            .||||.||||||....|||||:||||||||||||::|.:|.|.::.|||.|:.:|:::..||.||
  Rat  3443 ADRMSMENATILINCERWPLMVDPQLQGIKWIKNKYGEELRVTQIGQKGCLQTIERALEAGDVVL 3507

  Fly  3861 IEQIEESMDTVLEPLLSRALIKKGRYLRIGDKEIEFHASFRLILHTKMANPHYKPEMQAQTTLIN 3925
            ||.:|||:|.||.|||.|.:|||||:::|||||.||:..||||||||:|||||:||:|||.||||
  Rat  3508 IENLEESIDPVLGPLLGREVIKKGRFIKIGDKECEFNPKFRLILHTKLANPHYQPELQAQATLIN 3572

  Fly  3926 FTVTPDGLEEQLLAEVVKIERPDLEQMKTEVTVQQNKFKISLKALEDELLARLASSGENVLDDHA 3990
            ||||.||||:||||.||.:|.||||.:|:::|.|||.|||:||.|||.||:||:|:..|.|.:.|
  Rat  3573 FTVTRDGLEDQLLAAVVSMEIPDLEHLKSDLTKQQNGFKITLKTLEDNLLSRLSSASGNFLGETA 3637

  Fly  3991 LVINLENTKRTVDEIEAKVREARVTTLQIDDTRNIYRSAAKRAAILYFVLTDLSRINPIYKFSLK 4055
            ||.|||.||:|..|::.||:||::|.::|::.|..||.||.||::|||::.|||:|:|:|:||||
  Rat  3638 LVENLEVTKQTAAEVQEKVQEAKLTEVKINEAREHYRPAAARASLLYFIMNDLSKIHPMYQFSLK 3702

  Fly  4056 SFMNVFRQAIAMAAESKNYEKRVLHLVESITLQTYRYTLRGLFEADKLTFTSHMTLRILIAAEQV 4120
            :|..||::|:..||.|::.::||.:|::|||...|:||.|||||.||||:.:.:|.:||:..::|
  Rat  3703 AFSIVFQKAVEKAAPSEDVKERVTNLIDSITFSVYQYTTRGLFECDKLTYLAQLTFQILLVNQEV 3767

  Fly  4121 AKDETDFLLRFPHDPTTLSPLDFVGRSAWGGIKSLTLIEHFYGIDKDMENYTKRWRKFMASDTPE 4185
            ...|.|||||.|....|.||::|:...|||.||:|:.:|.|..:|:|:|...|.|:||:.|:.||
  Rat  3768 NAAELDFLLRAPVQAGTPSPMEFLSHQAWGSIKALSSMEEFCNLDRDIEGSAKSWKKFVESECPE 3832

  Fly  4186 REQFPGEWKHRTPLQKLCIIRSLRPDRMTYAMRQFVEQTMGRSYAEIQTPPFGAIFQELNAATPA 4250
            :|:||.:||::|.||:||::|::||||||||||.|||:.:|..|...:...|.:.|:|...|||.
  Rat  3833 KEKFPQDWKNKTGLQRLCMMRAMRPDRMTYAMRDFVEEKLGSKYVMGRPLDFVSSFEESGPATPM 3897

  Fly  4251 FFILSPGVDPIRDVERYGQRQGFHSESDTLVNISLGQGQELLAEQAIIGALESGQQWVILQNIHL 4315
            ||||||||||::|||..|::.|:...:....|:|||||||::||.|:..|.:.| .|||||||||
  Rat  3898 FFILSPGVDPLKDVENQGKKLGYTFNNRNFHNVSLGQGQEVVAEAALDLAAKKG-HWVILQNIHL 3961

  Fly  4316 VVNWLPTLEKLIERIVLQSESKGESNFRLFISAEPAPDPQYHVIPQGILESSLKVVNEPPSGMAA 4380
            |..||.||||.:|.  |..||  ..:||:||||||||.|:.|:|||||||:|:|:.||||:||.|
  Rat  3962 VAKWLSTLEKKLEE--LSEES--HPDFRVFISAEPAPSPEGHIIPQGILENSIKITNEPPTGMHA 4022

  Fly  4381 NLHKAWDNFSQDALETCTQEAEFKSILFALCYFHAVAGERRKFGPQGWNKVYPFNIGDLTISSNV 4445
            |||||.|||:||.||.|::|.|||:|||||||||||..|||||||||||:.||||.||||||.||
  Rat  4023 NLHKALDNFTQDTLEMCSRETEFKTILFALCYFHAVVAERRKFGPQGWNRSYPFNTGDLTISVNV 4087

  Fly  4446 LHNYLEGSNRIPWEDLRYLFGEIMYGGHITDDWDRRLCQTYLEELLQQDLIDGDFELCPGFPAPP 4510
            |:|:||.:.::|::||||||||||||||||||||||||:|||||.::.::::|:..|.||||.|.
  Rat  4088 LYNFLEANTKVPYDDLRYLFGEIMYGGHITDDWDRRLCRTYLEEFIRPEMLEGELSLAPGFPLPG 4152

  Fly  4511 NLDFEGYHSYITEMLPEESPLLYGLHPNAEIGFLTTASEQLLRTIFELQPRESELSSHCGAPREE 4575
            |:|:.|||.||...||.|||.||||||||||||||..||:|.||:.|:|||:|:.....|:.|||
  Rat  4153 NMDYSGYHQYIDAELPPESPYLYGLHPNAEIGFLTQTSEKLFRTVLEMQPRDSQAGDGAGSTREE 4217

  Fly  4576 LVKIMIDDFLDKLQDEFNLQALLNRVERKTPFVVVALQECERMNALIREIKRSLRELMLGLRGEL 4640
            .||..:::.||::.||||:..|:.:||.:||::|||||||||||.|.|||:||||||.|||:|||
  Rat  4218 KVKAFLEEILDRVTDEFNIPELMAKVEERTPYIVVALQECERMNILTREIQRSLRELHLGLQGEL 4282

  Fly  4641 TITQEMERLDHAIFYDHVPAAWARLAYPSMLGLQSWFADLLHRIKELAGWLNDFKLPCAIWLGGL 4705
            |:|.|||.|.:|::.|.||..|||.||||..||.:||.|||:|||||..|..||.:|..:||.|.
  Rat  4283 TMTSEMENLQNALYLDVVPEPWARRAYPSTAGLAAWFLDLLNRIKELETWTGDFVMPSTVWLTGF 4347

  Fly  4706 FNPQSFLTAIMQESARKHDLPLDRMLISCDVTKKQKDDVTLPPMEGAFVHDLYMDGASWDCQLNS 4770
            ||||||||||||..|||::.|||:|.:.||||||.:::...||.|||:::.|:|:||.||.|...
  Rat  4348 FNPQSFLTAIMQSMARKNEWPLDQMALQCDVTKKNREEFRSPPREGAYIYGLFMEGACWDTQAGI 4412

  Fly  4771 IVALRPKEMLCAMPVIYIKSIVQEKQELQRVYECPLYKTRSRGNTYVWTFNLKTRERPSRWILGG 4835
            |...:.|::...|||:::|:|..|||:.:.:|.||:|||..||.||||||||||:|.||:|:|.|
  Rat  4413 IAEAKLKDLTPPMPVMFLKAIPAEKQDCRSIYACPVYKTCQRGPTYVWTFNLKTKENPSKWVLAG 4477

  Fly  4836 VALLLQ 4841
            ||||||
  Rat  4478 VALLLQ 4483

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
CG3339NP_001036762.2 DHC_N1 276..903 CDD:285571 162/641 (25%)
DHC_N2 1535..1944 CDD:285579 192/413 (46%)
P-loop_NTPase 2095..2324 CDD:304359 200/228 (88%)
P-loop_NTPase 2409..2544 CDD:304359 96/134 (72%)
P-loop_NTPase 2731..3061 CDD:304359 139/330 (42%)
P-loop_NTPase 3138..3406 CDD:304359 162/267 (61%)
MT 3419..3759 CDD:289543 189/339 (56%)
AAA_9 3789..4001 CDD:289547 138/211 (65%)
Dynein_heavy 4142..4832 CDD:281078 403/689 (58%)
Dnah9XP_002727768.2 DHC_N1 210..787 CDD:285571 164/648 (25%)
DHC_N2 1293..1697 CDD:285579 192/413 (46%)
P-loop_NTPase 1830..2060 CDD:304359 200/229 (87%)
P-loop_NTPase 2144..2279 CDD:304359 96/134 (72%)
P-loop_NTPase 2437..2708 CDD:304359 139/331 (42%)
P-loop_NTPase 2786..3053 CDD:304359 162/267 (61%)
MT 3065..3408 CDD:289543 190/342 (56%)
AAA_9 3435..3648 CDD:289547 138/212 (65%)
Dynein_heavy 3785..4474 CDD:281078 405/693 (58%)


Information from Original Tools:


Tool Simple Score Weighted Score Original Tool Information
BLAST Result Score Score Type Cluster ID
Compara 00.000 Not matched by this tool.
Domainoid 00.000 Not matched by this tool.
eggNOG 1 0.900 - - E1_COG5245
Hieranoid 1 1.000 - -
Homologene 00.000 Not matched by this tool.
Inparanoid 00.000 Not matched by this tool.
OMA 1 1.010 - - QHG56441
OrthoDB 1 1.010 - - D1463at33208
OrthoFinder 1 1.000 - - FOG0000396
OrthoInspector 00.000 Not matched by this tool.
orthoMCL 1 0.900 - - OOG6_100025
Panther 1 1.100 - - O PTHR10676
Phylome 1 0.910 - -
SonicParanoid 00.000 Not matched by this tool.
SwiftOrtho 1 1.000 - -
TreeFam 1 0.960 - -
109.790

Return to query results.
Submit another query.