DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment CG3339 and Dnah6

DIOPT Version :9

Sequence 1:NP_001036762.2 Gene:CG3339 / 43295 FlyBaseID:FBgn0039510 Length:4842 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:XP_038964640.1 Gene:Dnah6 / 117250 RGDID:621797 Length:4156 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:4378 Identity:1317/4378 - (30%)
Similarity:2137/4378 - (48%) Gaps:641/4378 - (14%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly   791 VLSRSQDLSQ----LHLNFSQVLFT-LLKETKYLLALQATGSL--------------SGDLFQLP 836
            ||...||..|    ...|..|::.| :||.:..::...:.|||              |.|:|.|.
  Rat    90 VLKLYQDHKQPEYIYEQNRQQLMSTGILKPSPSMIERSSIGSLEAQEALKRKQVLRPSADVFSLS 154

  Fly   837 EPLLT--------LYGHRDAYWER-----RIRLIKIGEFYNGIRSGECAAAELQLIRNDLASIDE 888
            ...|.        |:|.|.:.:.:     |..::|.     .||.      .||:|:  :...:|
  Rat   155 PSKLPRTSIGRRGLFGMRSSTYPKYTFNDREEVVKA-----NIRD------PLQIIK--IVHENE 206

  Fly   889 HV-------EVACQQLTWRNYNDELVA-------GIFEQSRDLFARLQQSHGNLDAILASMRRWS 939
            |:       .|....:.:..||.::|:       ..:..|:|....:    .|.|.......||.
  Rat   207 HLGFLYMIPAVPKSSIEYDTYNLKVVSYENINKNDYYTISKDAVTHV----FNDDIEYIETERWE 267

  Fly   940 REPLHQRSLYGRNLLDLRHQ-------QDRVR-LRLLQCDETKMLLNRLLIAN------------ 984
            :|.|:.|.|....:..|..:       :..|| .::..|  .|.|...|.|.|            
  Rat   268 QEYLYHRELTKIPIFSLFRKWKAFSVWRKNVRSKKITGC--RKALRKNLFIVNPYLRPALLKIND 330

  Fly   985 ---------FCL---FFNYESQEFQLYSRDLSVQEFIREFPEEQRRQYNKYLA-SVDELICR--- 1033
                     .|.   |..|..|||:. ::.:.|||.      .:|.:|.::.| .|....||   
  Rat   331 MCYQLSFMGLCYIEKFHTYTLQEFKA-AQVVRVQEV------TERLEYFRFEAKDVVRKSCRFAL 388

  Fly  1034 ------------EVRE-------------------------------------AMRISL-----E 1044
                        |..|                                     .||::.     :
  Rat   389 RAAGFIPDDCEVETHEDYFKINIASFIDAPSDLPTYGESEKMTYTEQASKRHHCMRLTCFIRLND 453

  Fly  1045 YLYKEMTATATATT--------------TPTAPPVDPGCSAGMARLVLQQITT---PQATSTAGA 1092
            ||.:......|..|              ||:|.             |:|:..|   |:...    
  Rat   454 YLIQNTLHVLTVNTASSLLNYLSDKLKRTPSAD-------------VIQKWITEDKPEVIE---- 501

  Fly  1093 GASGAPPTAND------APLFEVKLELTETEIRFSPAFDASVENNFQQIVEQLLLDIKQTCDCMP 1151
             ..|||.....      .|:|..:|.||...:.|.|:.:     :|...:..::...:.|...:|
  Rat   502 -KKGAPMMEKQEEDESLIPMFLTELILTVQSLLFEPSLE-----DFLDGISGIINHFENTVLSVP 560

  Fly  1152 RIVAD---NAPSEDDEDDDTATVDYEQELRWEPREDRAQELQERKKKDLELEQEQGDPKPQAVQF 1213
            .:|.|   ||.:                   .|..::            ::|::...|.|     
  Rat   561 NLVPDSYFNAFT-------------------SPFINK------------KVEEKTCGPGP----- 589

  Fly  1214 NLLAAAKAYSQKMECTADGLEMLERAIRDALADTVAAASAYAAKFQAYAFLWTQQSSEVLAACMQ 1278
                   :.|...|...:.|.:::: |::.:.....:|..|||.|:.:...:.:..|..|.|..:
  Rat   590 -------SLSAVFEDDRNFLTIIQQ-IKETIHSAFDSARLYAATFEKFQIFFKENESLDLEALKE 646

  Fly  1279 TAREQTHHVSAGGYAIMETFKKEIENYNEVH-DAIDQCENRECINGWLALDIKPLKYGLLNLACK 1342
            ...:            :|.|..::|.|::.| |::.....|..  |.|.:|.|.||..|:....:
  Rat   647 EEPD------------VEFFSSQLEKYHKQHKDSVALKPTRNV--GLLLIDTKQLKEKLIPSPLR 697

  Fly  1343 WSHMCKKWLLRYVQGTLKELNAFIARGFET-LQLHIARQDFATLLRVLAIMSEIREREPYADNVF 1406
            ...:....|.|.   :.|:::|.|:...:. .:|..........:..|..:.||:||....:...
  Rat   698 CLEVLNLMLPRL---SKKKVDAIISEAQDAEYKLEFVPTTTIEYVNSLVFLDEIQERIETLEEEG 759

  Fly  1407 KPLKEIMGLLKTYNVEFEPQLLRGIEQLPQQWQQLKHSSTVKQEALQDTRFHQQQRVTAL---IG 1468
            ..:.::..|::.|.|...|:..       ..:..:|.|.|..:.|:..:...::..:...   :|
  Rat   760 NTVVQMYKLIEQYQVLTPPEDF-------AVFATMKPSITAVRNAIDKSVGDRESSIKQFCLHLG 817

  Fly  1469 LHTCHLQHYARQFQKMPFFRVPCPQVYD-----------------VCDEVYLRLHRFRRQQRLYT 1516
            .....|.:...:.:.:    ...||:.|                 |.|::..|..:::..|:.:.
  Rat   818 RDLEDLNNEVNEVKLL----AQDPQILDISADPEKIKTMLSDLQSVLDDLQKRAFQYKSYQKNFK 878

  Fly  1517 RWARLLDIQPPDPATLQFCEVELRRVKQLWDFVRVIESCIVAWHATPWLLIDTDDMEHECKKFTR 1581
                 :::...| |..:.| .|||..:.|||.:...:.....|..:.:..:|.:.:..:..|:.:
  Rat   879 -----VEVSKFD-ALEEVC-AELRLKQLLWDSLSEWDKLQQEWLKSKFDCLDPEVLNGQVTKYAK 936

  Fly  1582 DLRTLDKCIREWAPYVHIVGVLRELVASLR----AITELQNPAITERHWMELMQ-LTKLSYKCNK 1641
            .:..|:|.:    |...:|..|::.|..::    .|.:|:||.:..|||..:.| :..|......
  Rat   937 FVTQLEKGL----PPNSVVPQLKQKVERMKEKLPVINDLRNPTLKPRHWSAIEQTVDALLVDIEI 997

  Fly  1642 STRLAQLLTLQLQHHEEDIKNTVDRAIKEMTVTKVLDEIKATWAHLEFELEQHHTRPHIQLLKVS 1706
            ...|.:|..|.:....::|::...:|..|..:..:|.:::.:|...||.:..|.....:.:|..:
  Rat   998 PLTLERLSELHVFDFAQEIQDISGQASGEAALEIILKKVEDSWKTTEFVILPHRDSKDVFILGGT 1062

  Fly  1707 EELIETLDDNQMQLQNISTSKHIEYLLDKLTHWQKVLGGIDTLIVNWFEVQRKWIYLECIFIGSA 1771
            :::...|||:.:.:..|::|:::..|..::..|||.|...:..:..|...||.|:|||.|| .:.
  Rat  1063 DDIQVLLDDSTINVATIASSRYVGPLKTRVDDWQKQLSLFNQTLEEWLNCQRNWLYLESIF-NAP 1126

  Fly  1772 DIRAQLPADAANFERIDEDFTALLAKVQE----VRVVMQVVL----RHDDVLAQLLQLQHRLAVC 1828
            ||:.||||:|..|.::|:.:..::.||..    :|...|..|    ::::.|...:|        
  Rat  1127 DIQRQLPAEAKMFLQVDKSWKEIMRKVNRLPNALRAATQPGLLETFQNNNALLDQIQ-------- 1183

  Fly  1829 EKALNDYLETKRLAFPRFYFISAADLLDILSNGNNPQVIDRHLIKLFDSILRLQYETNTPNALGM 1893
             |.|..|||:||:.||||||:|..:||:||:...|||.:..||.|.||||.:|::....|     
  Rat  1184 -KCLEAYLESKRVIFPRFYFLSNDELLEILAQTRNPQAVQPHLRKCFDSISKLEFALMPP----- 1242

  Fly  1894 HSKENDEYVPFVSFDPDQPAF--------------------IVCGGRVELWLRAIIQQMRSTLHE 1938
                .:..:|.:..:|:: .|                    :...|.||.||..:.:.|.|:|..
  Rat  1243 ----TEGKIPGIDTEPEK-VFTNDILAMLSPEGERVGLGKGLKARGNVEEWLGKVEEAMFSSLRR 1302

  Fly  1939 LFRRALRVFGEKPRELW-LYDWPAQVALCCSQISWTADVNRSFGCMEEGYEGVMKELHKRQIAQL 2002
            |.:.|:..:..|.|..| :...|:||.|..|||.|..|:..|..| |:.:...:::..:....:|
  Rat  1303 LCKAAIADYQGKLRTEWVIAGHPSQVILTISQIMWCRDLTESLEC-EDNHLEALEKFEQVNFERL 1366

  Fly  2003 NALINLLLGELSPGDRQKIMTICTIDVHSRDVVGKIIASKVDNSLAFQWQSQLRHRWDDDQAGSS 2067
            |||..::.|.|....|..|..:.|||||:||:|.:::.||||::.:|.||.|||:.||.|.    
  Rat  1367 NALAAIVRGSLPKLHRNIITALITIDVHARDIVSELVQSKVDSAESFDWQRQLRYYWDVDL---- 1427

  Fly  2068 SGRASTAISCGGGDEDCFANICDAEFRYAYEYLGNTSRLVITPLTDRCYITLTQSLRLRLAGATA 2132
                          ::|.|.:..:::.|||||||...||||||||||||:.|..:|:|.|.||.|
  Rat  1428 --------------DNCVARMALSQYTYAYEYLGACPRLVITPLTDRCYLCLMGALQLDLGGAPA 1478

  Fly  2133 GPAGTGKTETTKDLGRALGVMVYVFNCSEQMDYKSCGNIYKGLAQTGAWGCFDEFNRICVEVLSV 2197
            ||||||||||||||.:||.:...|||||:.:|||..|..:.||||:|||.||||||||.:|||||
  Rat  1479 GPAGTGKTETTKDLAKALAIQCVVFNCSDGLDYKMMGRFFSGLAQSGAWCCFDEFNRIDIEVLSV 1543

  Fly  2198 VAVQVKTIQEAIKMHKTQFIFMGERISLEPSVGIFITMNPGYAGRTELPENLKTLFRPCAMIVPD 2262
            :|.|:.||:.|.....::|:|.|..|.|..:...|||||||||||||||:|||.||||.||:||:
  Rat  1544 IAQQLITIRNAKAAKLSRFMFEGREIKLVMTCAAFITMNPGYAGRTELPDNLKALFRPMAMMVPN 1608

  Fly  2263 FALICEIMLMAEGFQDARLLARKFITLYTLCKELLSKQDHYDWGLRAIKSVLVVAGTLKRDDHSR 2327
            :|||.|::|.:|||:.:::||||...:|.||.|.||:|||||:|:||:|||||:||:|||::...
  Rat  1609 YALIAEVILYSEGFESSKILARKMTQMYKLCSEQLSQQDHYDFGMRAVKSVLVMAGSLKRENPDL 1673

  Fly  2328 PEDQVLMRALRDFNIPKIVTEDVPIFMGLIGDLFPALDVPRKRVFEFEKTIRRAVNEIKLQPEEG 2392
            .||.||:|||||.|:||.:|:|..:|.|:|.||||.:.:|.........||...:....||||..
  Rat  1674 SEDVVLIRALRDSNLPKFLTDDALLFSGIISDLFPGVQIPEHDYGILHSTIVDVMISQNLQPEIC 1738

  Fly  2393 FLMKVVQLQELLDVRHSVFIVGNAGTGKTKIWQTLRETY-RIQKL-------KPV-CHVLNPKAL 2448
            .:.||:||.|.:.|||.|.:||..|.|||.::|.|.||. .::||       :|| ..|||||::
  Rat  1739 MVKKVIQLYETMLVRHGVMLVGPTGGGKTTVYQVLAETLGNLEKLNTGNPFYQPVKTFVLNPKSI 1803

  Fly  2449 SNDELFGIVNPTTREWKDGLFSSIMREQANMPPGNPKWIVLDGDIDPMWIESLNTLMDDNKILTL 2513
            :..||:|.||..|.||||||.:..:|...|....:.|||:.||.:|.:|||::||::||||:|.|
  Rat  1804 TMGELYGEVNNVTLEWKDGLMALSVRAAVNDTSEDHKWIISDGPVDALWIENMNTVLDDNKMLCL 1868

  Fly  2514 ASNERISLKREMRLLFEVGHLKAATPATVSRAGILYINPQDLGWSPYVSSWLET----RVDMIER 2574
            |::|||.|..::.:||||..||.|:||||||.|:::::|::|.|.|||.:|:.|    ..:.|..
  Rat  1869 ANSERIKLTPQVHMLFEVQDLKVASPATVSRCGMVFVDPEELKWMPYVKTWMSTLSKKLSEEIRE 1933

  Fly  2575 GILNALFEKYF-PCLMQRQRDFRRITPITDMAMIQMTCHLLECLLDSDEGNADGRGRGSATGGAA 2638
            .:|| ||.:|. ..|....:...:..|..|::.:...|.|||.||.|.:||.             
  Rat  1934 YLLN-LFNRYVDDGLRFVNKKCTQAIPQVDISKVTTLCCLLESLLLSKDGNI------------- 1984

  Fly  2639 NPHSLHHGELSHEAMVMALETI----FVYATVWSFGSALSQDVIIDWHR--EFHKWWIGEFKDIK 2697
                     ||.|.  |.|.|:    ||:..:||.|..|:::   .|..  .|.:....:..|.:
  Rat  1985 ---------LSLEQ--MKLNTVVCQTFVFCYLWSLGGNLTEN---HWDSFDTFIRTQFDDNPDAR 2035

  Fly  2698 LPSQGTVFDYQLNVQTLKFQPWSELAAHQSLEGQIDSETPLQNVLISTAETIRLAYFLKLLIDRN 2762
            |||.|.::...::..|.:..||..:..    ..:...|.|...:|:.||:|:|..|.::.|:...
  Rat  2036 LPSSGDLWSIHVDFDTKRLDPWERIIP----TFKYSREVPFFEMLVPTADTVRYGYLMEKLLAVR 2096

  Fly  2763 LACMLVGNSGCGKGAIFRQLFGQYANDQELLEVAVSAATAGDSSHQQQSGNPAGAVVVRRKASSS 2827
            .:.:..|.:|.||..|.:.|..:.                      |:|   ||.|.|       
  Rat  2097 HSVLFTGTTGVGKSVIAKGLLNRI----------------------QES---AGYVPV------- 2129

  Fly  2828 ATPLLTTVQATHFNFYTSSEIFQKMLDRPLEKKSGRCYAPSGPKRRLIYFVNDLNMPEVDAYGTV 2892
                     ..:|:..|||...|::::..||:|........|.| :::.||:|||||.:|.||:.
  Rat  2130 ---------YLNFSAQTSSARTQEIIESKLERKRKNILGAPGNK-QVVIFVDDLNMPRLDRYGSQ 2184

  Fly  2893 QPHTIMRQFMDYRQWYDRQRLQLKDIRHCQF-AACMNPTAGSFTIDPRLQRHFCVFSVAPPGEDT 2956
            .|..::||:.|:..:|||.:|..|:|:.... :||..|..|...:.||..|||.:..:..|.|.:
  Rat  2185 PPIELLRQYQDFGGFYDRNKLFWKEIQDVTIVSACAPPGGGRNPVTPRFIRHFSMLCLPMPSEHS 2249

  Fly  2957 LHHIYGSILSSHLESPSQGFTKEIRSIGSLLVRVGIALHRRVEYAFLPTALKFHYLFNLRDLTGI 3021
            |..|:.:||:..|..    ||:.::...|.:|...:.::.|:....|||..|.||:||||||:..
  Rat  2250 LKQIFQAILNGFLAD----FTEAVKQTSSNIVEAAVEIYNRMSVDLLPTPAKSHYVFNLRDLSKC 2310

  Fly  3022 YQGLMNSVGAPASAGGGGASGFGGTICSRPSELMRLYVHEAFRVYHDRLVDPYDIKSFKSSIRDI 3086
            .||::..  .|            ||| ....::.||:.||..||:||||::..|...|...:.::
  Rat  2311 VQGILQC--DP------------GTI-REEMQIFRLFCHECQRVFHDRLINNEDKHYFHVILTEM 2360

  Fly  3087 FKKDFE-DFDEDFVFAEPLIYSHFAQSLVDQKYMPLKSWDSLYQLLIEAQASYNEVVGYMN---- 3146
            ..|.|. ..|.::..::|:|:..|.:...|:.       |.:|..|.:.:...|.:..|::    
  Rat  2361 ANKHFGIAIDLEYFLSKPIIFGDFIKFGADKA-------DRIYDDLPDIEKIENVLQDYLDDYNL 2418

  Fly  3147 -------LVLFEDAMIHVCRINRILESPRGNALLIGVGGSGKQTLARLAAFISSLNVSQIQIKRG 3204
                   ||.|:||:.||.||.|::...||||||:||||:|||:|.||||.|......||::.||
  Rat  2419 TNPKEVKLVFFQDAIEHVSRIARMIRQERGNALLVGVGGTGKQSLTRLAAHICGYKCLQIELSRG 2483

  Fly  3205 FGLLDMREEIGNLYMKVGLKNLASVFLISDAQIPDESILMLINDLLASGEIPELFNDDQLDTITN 3269
            :......|::..||...|:::...|||.:|.||..|..|..||::|.|||:|.||..|:|:.:..
  Rat  2484 YNYDSFHEDLRKLYKMAGVEDKNMVFLFTDTQIVVEEFLEDINNILNSGEVPNLFEKDELEQVLA 2548

  Fly  3270 GIRNEVKQSGTLD-TKENCWRYFVEKVRRLLKVVLCFSPVGQTLRVRARKFPAIISRTAIDWFHE 3333
            ..|.:.|:.|..: .::..::||:.:||:.|.:|||.||||:..|.|.|.||::::...||||.:
  Rat  2549 ATRPKAKEVGISEGNRDEVFQYFISRVRQKLHIVLCMSPVGEAFRSRCRMFPSLVNCCTIDWFVQ 2613

  Fly  3334 WPKSALESVSQKFLNEINGILEPALVPPIGCFMAYVHGTVNQIS-RIYLQNEKRYNYTTPKTFLE 3397
            ||:.||.|||:.|.:.::...| .|...:......||.:|:.:: |.|.:..:|| ||||.::||
  Rat  2614 WPREALLSVSKSFFSVVDTGNE-ELKEKLSLMCVNVHLSVSHMADRYYSELRRRY-YTTPTSYLE 2676

  Fly  3398 YIFLYRKLLVDKNGEFAERIARLQSGMSKLAECARQVDTLKHQLAIQEVQLAAKNAAADKLIVIV 3462
            .|.||..:|.:|..:......|:.:|::||.|....||.:|..|:..|..|..|:...:.|:..:
  Rat  2677 LINLYLTMLTEKRKQLVSARDRVTNGLTKLLETNILVDKMKLDLSALEPVLFQKSQDVEALMEKL 2741

  Fly  3463 SAESEKVKRERYIASEEEKRVRIIEEDVSIKTKMCEEDLRQAEPALVAAQAALNTLNKNNLTELK 3527
            ..:.|...:.|.:..|:|...::..|:........:.||.:|.|||.||..||::|:|.:::|::
  Rat  2742 VVDQESADQVRNVVQEDEAIAKVKAEETQAIADDAQRDLEEALPALEAANKALDSLDKADISEIR 2806

  Fly  3528 SFGSPPKAVVNVCAAVMVLLASNGKIPRDRSWKASKLMMVRVDQFLNDLLNYNKDNIHPNIIETL 3592
            .|..||..|:.|..|:.:||  |.|    ..|..:| .::....||..||.|:|:||.|.|:..|
  Rat  2807 VFTKPPDLVMTVMEAISILL--NAK----PDWPTAK-QLLGDSNFLRRLLEYDKENIKPQILSKL 2864

  Fly  3593 QEYLKDPEFNPDKVVQKSVAAAGLCAWVINLHRYHQVFLIVGPKQQALQDSHQELLEARERLQYL 3657
            |.|:.:|:|.|:||.:.|.|...:|.||..:..|.:|...|.||:|.|:.:..||......|:..
  Rat  2865 QRYINNPDFVPEKVEKVSKACKSMCMWVRAMDLYSRVVKEVEPKRQKLRAAQAELDATITTLKEK 2929

  Fly  3658 KAKINNLEAKLAEIQAEFENAVGEKQRCQREADKTAFTIDLAHRLVNGLANENVRWKESVQSLLA 3722
            :|.:..:|.::..:|.|::..|.||:...:....|...:..|.:|...|.:|.|||:||::....
  Rat  2930 QALLKQVEEQIRALQEEYDKGVNEKESLAKTMALTKARLVRAGKLTAALGDEQVRWEESIEKFQE 2994

  Fly  3723 KIGTLPGDILLISSFLSYVGCFTRRYREELQHKMWLPNFRKID-PHIPHTEGVDTLALFSDDAQI 3786
            :|..:.|::.:.::.::|.|.||.:|| :|..:.|:.:...:| |..|....::||   .|..:|
  Rat  2995 EIANIVGNVFIAAACVAYYGAFTAQYR-QLLIECWIDSCLALDIPIDPSFSLINTL---GDPYEI 3055

  Fly  3787 AAWNNEGLPMDRMSTENATILQYSTRWPLMIDPQLQGIKWIKNRFG-TDLVVLRLRQKGFLEALE 3850
            ..||.:|||.|.:||||..::....|||||||||.|..:||:|:.. :.|.|::|....||..||
  Rat  3056 RQWNADGLPRDLISTENGILVTQGRRWPLMIDPQDQANRWIRNKESKSGLKVIKLTDTNFLRILE 3120

  Fly  3851 KSISQGDTVLIEQIEESMDTVLEP-LLSRALIKKGRYL-RIGDKEIEFHASFRLILHTKMANPHY 3913
            .||..|..||:|::.|.:|..||| ||.:..:..||.| |:||.:|::..|||..:.|||.||||
  Rat  3121 NSIRLGLPVLLEELREVLDPALEPILLKQTFMSGGRLLIRLGDSDIDYDKSFRFYMTTKMPNPHY 3185

  Fly  3914 KPEMQAQTTLINFTVTPDGLEEQLLAEVVKIERPDLEQMKTEVTVQQNKFKISLKALEDELLARL 3978
            .||:..:.|:||||||..|||:|||::||::|:|:||..:.::.|:.|..|..||::||::|..|
  Rat  3186 LPEVCIKVTIINFTVTKSGLEDQLLSDVVRLEKPELEGQRVQLIVRINSDKNQLKSIEDKILKLL 3250

  Fly  3979 ASSGENVLDDHALVINLENTKRTVDEIEAKVREARVTTLQIDDTRNIYRSAAKRAAILYFVLTDL 4043
            .:|..|:||:..|:..|:::|.|...|:.:::||..|.|.|:..|..||..|.:.:::|||:..|
  Rat  3251 FTSEGNILDNEELIDTLQDSKITSGAIKTRLKEAESTELMINIARERYRPVATQGSVMYFVIASL 3315

  Fly  4044 SRINPIYKFSLKSFMNVFRQAIAMAAESKNYEKRVLHLVESITLQTYRYTLRGLFEADKLTFTSH 4108
            |.|:|:|::|||.|..:|...|..:.:|.:.::|:..|::...|..|....|||||..||.::..
  Rat  3316 SEIDPMYQYSLKYFKQLFNTTIETSEKSDSLQERLAILLQQTLLTAYTNVSRGLFEQHKLIYSFM 3380

  Fly  4109 MTLRILIAAEQVAKDETDFLLR--------FPHDPTTLSPLDFVGRSAWGGIK---SLTLIEHFY 4162
            :.:.|:...||:.:.|.:|.||        .|..|          .:.|..|:   |...:|.::
  Rat  3381 LCVDIMRQQEQLTEAEWNFFLRGSAGMEKERPPKP----------EAPWLPIQMWFSCCDLEEWF 3435

  Fly  4163 GIDKDM----------------ENY--TKRWRKFMASDTPEREQFPGEW-KHRTPLQKLCIIRSL 4208
            .|.:.:                |.|  .:.|..:......|.::.  .| .:.:...||.:::..
  Rat  3436 PIFEGLTRHILLHPISISLGSFETYINPQSWEGYPKQRHEEEKEH--VWGSNFSSFHKLILVKCC 3498

  Fly  4209 RPDRMTYAMRQFVEQTMGRSYAEIQTPP--FGAIFQELNAATPAFFILSPGVDPIRDVERYGQRQ 4271
            :.:::.:|:..||.:.:|:.:  |:|||  ...::|:::::||..||||.|.||:...:|:.:..
  Rat  3499 KEEKVVFALTDFVIENLGKQF--IETPPVDLATLYQDMSSSTPLVFILSTGSDPMGAFQRFARES 3561

  Fly  4272 GFHSESDTLVNISLGQGQELLAEQAIIGALESGQQWVILQNIHLVVNWLPTLEKLIERIVLQSES 4336
            |:   ::.:.:|||||||..:||:.|..|.:|| .||.|||.||.|:|:..:|:||:.....::|
  Rat  3562 GY---AERVQSISLGQGQGPIAEKMIKDATKSG-NWVFLQNCHLAVSWMLAMEELIKTFTDPNQS 3622

  Fly  4337 KGESNFRLFISAEPAPDPQYHVIPQGILESSLKVVNEPPSGMAANLHKAWDNFSQDALETCTQEA 4401
            . :..||||:|:.|.     ...|..:|::|:||.||||.|:.||:.:|:...:....|......
  Rat  3623 I-KDTFRLFLSSMPC-----STFPVTVLQNSVKVTNEPPKGLRANIRRAFTEMTPSFFEENILGM 3681

  Fly  4402 EFKSILFALCYFHAVAGERRKFGPQGWNKVYPFNIGDLTISSNVLHNYL-EGSNRIPWEDLRYLF 4465
            :::.::|.:|:|||:..||:||||.|||..|.||..|...:...|:.|. ||  :|||:.|.|:.
  Rat  3682 KWRKLIFGICFFHAIIQERKKFGPLGWNICYEFNDSDRECALLNLNLYCHEG--KIPWDALIYIT 3744

  Fly  4466 GEIMYGGHITDDWDRRLCQTYLEELLQQDLIDGDFELCPG--FPAPPNLDFEGYHSYITEMLPEE 4528
            |||.|||.:||.||:|..:|.|:.....:.::.::.....  :.||.....:.:..||.::...:
  Rat  3745 GEITYGGRVTDTWDQRCLRTVLKRFFSPETLEDEYTYSESGIYFAPLADSLQEFKDYIEDLPLID 3809

  Fly  4529 SPLLYGLHPNAEIGFLTTASEQLLRTIFELQPRESELSSHCGAPREELVKIMIDDFLDKLQDEFN 4593
            .|.::|:|.||.:.|....:..|:.||.|:|||.|  |...|...:|:|:.::.....::.:...
  Rat  3810 DPEIFGMHENANLVFQYKETNTLITTILEVQPRSS--SGGEGKSNDEIVQELVASIRTRVPESLQ 3872

  Fly  4594 LQALLNRVERKTP------FVVVALQECERMNALIREIKRSLRELMLGLRGELTITQEMERLDHA 4652
            ::.....:..|.|      ...|..||.:|.|.|::.|..||..|...:.|.:.:::|||::..:
  Rat  3873 MEGASETLFVKDPQGRLNSLTTVLGQEVDRFNNLLKLIHISLETLNKAIAGLVVMSEEMEKVYQS 3937

  Fly  4653 IFYDHVPAAWARLAYPSMLGLQSWFADLLHRIKELAGWLNDFKLPCAIWLGGLFNPQSFLTAIMQ 4717
            ...:.||:.|:..||||:..|.||..||:.|...:..||...: |.:.|:.|.|.||.|||..:|
  Rat  3938 FLNNQVPSLWSNTAYPSLKPLGSWVKDLILRTAFVDLWLKRGQ-PKSFWISGFFFPQGFLTGTLQ 4001

  Fly  4718 ESARKHDLPLDRMLISCDVTKKQKD-------------------DVTLP-PMEGAFVHDLYMDGA 4762
            ..|||::||:|.:....::....:|                   |..|| |.:|..||.::||.:
  Rat  4002 NHARKYNLPIDELSFKYNMIPVYRDQALVIEAAKDIQFGTELPMDKELPTPEDGVLVHGMFMDAS 4066

  Fly  4763 SWDCQLNSIVALRPKEMLCAMPVIYIKSIVQEKQELQRVYECPLYKTRSRGNT---------YVW 4818
            .||.:...|....|.:|...:||::.:. .|..:.:|.:|..|||||.:|..|         :|.
  Rat  4067 RWDDKDMIIEDALPGQMNPMLPVVHFEP-QQNYEPIQTLYHSPLYKTGARAGTLSTTGHSTNFVV 4130

  Fly  4819 TFNLKTRERPSRWILGGVALLLQ 4841
            |..|.::.....||..|.|||.|
  Rat  4131 TVLLPSKRPSDYWIAKGSALLCQ 4153

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
CG3339NP_001036762.2 DHC_N1 276..903 CDD:285571 31/150 (21%)
DHC_N2 1535..1944 CDD:285579 114/441 (26%)
P-loop_NTPase 2095..2324 CDD:304359 143/228 (63%)
P-loop_NTPase 2409..2544 CDD:304359 67/143 (47%)
P-loop_NTPase 2731..3061 CDD:304359 92/330 (28%)
P-loop_NTPase 3138..3406 CDD:304359 108/280 (39%)
MT 3419..3759 CDD:289543 103/339 (30%)
AAA_9 3789..4001 CDD:289547 97/214 (45%)
Dynein_heavy 4142..4832 CDD:281078 217/751 (29%)
Dnah6XP_038964640.1 DHC_N2 887..1307 CDD:400618 114/444 (26%)
DYN1 <1127..3774 CDD:227570 995/2823 (35%)
AAA_6 1441..1767 CDD:403853 184/325 (57%)
Dynein_C 3827..4152 CDD:408026 94/328 (29%)


Information from Original Tools:


Tool Simple Score Weighted Score Original Tool Information
BLAST Result Score Score Type Cluster ID
Compara 00.000 Not matched by this tool.
Domainoid 00.000 Not matched by this tool.
eggNOG 00.000 Not matched by this tool.
Hieranoid 00.000 Not matched by this tool.
Homologene 00.000 Not matched by this tool.
Inparanoid 00.000 Not matched by this tool.
OMA 00.000 Not matched by this tool.
OrthoDB 1 1.010 - - D1492at2759
OrthoFinder 00.000 Not matched by this tool.
OrthoInspector 00.000 Not matched by this tool.
orthoMCL 1 0.900 - - OOG6_100025
Panther 00.000 Not matched by this tool.
Phylome 1 0.910 - -
SonicParanoid 00.000 Not matched by this tool.
SwiftOrtho 1 1.000 - -
TreeFam 00.000 Not matched by this tool.
43.820

Return to query results.
Submit another query.