Protein Alignment CG6059 and ORY

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_651541.2
• Gene: CG6059 / 43270
• FlyBaseID: FBgn0039491
• Length: 884
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: NP_001015498.5
• Gene: ORY / 3355174
• FlyBaseID: FBgn0046323
• Length: 914
• Species: Drosophila melanogaster
• Alignment Length: 911
• Identity: 304/911 - (33%)
• Similarity: 516/911 - (56%)
• Gaps: 78/911 - (8%)

  Fly     1 MKSSK-RKMSRLFKTASVNSKSLSMMNLEERFRESVEPAQINLLRDLNDKFFSSSYQLVQSLSE- 63
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  Fly     1 MASNKDRKKAK--KANNVDENSEPQLLFQEVIDET-DVLDLNLYSDINDEFFNEANRVVQFLMEA 62

  Fly    64 RFPFLAGKVKLYVDILSRLHAHYVNEVEQGRAMHEKVRTADEKLQLALRTTAISEAMMEHLRESL 128
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  Fly    63 KRHFEASRIKRYSDIIFNLHRRYVDEVNDNEVLRPQILSSEKKLRLALELTSTSEEAMQKLKDLL 127

  Fly   129 EDAWRNEDATKNREETMQLQLMS-LVRSD-QSNMTKGTTDHVPISNKDLQLHRLVLRERDRLAAE 191
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  Fly   128 GDAWKESDASALREQLVQEKLQEVLIKCEGLADRNSGTTDDTAEFGHLAKYKNIILRERDRLAGE 192

  Fly   192 LKDHQKRLQTNRLYSESVEVMIEVYKEIISKLNARAKKAELDNFRLEHRCNVEQDKYEDRLLHLN 256
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  Fly   193 VVDLEKRLATNRYYSENLEYIIRNNEDAMSKMASRAKFAEGERLNVESKLRALMKTMEEQKEAHG 257

  Fly   257 KELVAVVQQNEELQAA------------------EKDFMELAATNEALKQRSDRLS------REN 297
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  Fly   258 KTMMKLDIANRELSETTRKLSQKISDYDRQRVHLDKYRSEVNALNKAMHKNEDDISDLTKNQKNN 322

  Fly   298 HTLTKSLRIMEDEKNKLQTSLKVSEGLNDAQRRDKLDLELARRSAERDAKKKADDSMILERRFHL 362
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  Fly   323 EEMIKQLRLIEKEKSNAVS-------------------QLTSR-----LKKSIEDQNNATTRMYK 363

  Fly   363 LAKKNTELNDQVLVNQNELKVQEKKMLMATAKLNEAIRQKEEIARSRDKLRAEISRLNDIVAGVR 427
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  Fly   364 LNRKVMMLNSEILRLKNNINSLEKDVLNANGRTDDIRRIKETLQRERDSLRSDIIKLNNTMADLK 428

  Fly   428 HEIASIRHQMQDLLTDLLRANKQLDEKDLQVQKIAREKREQSLELNDAYKKIDGIEETLALKSER 492
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  Fly   429 HDMMLKANMISSLNLDMNKLNVKLDEAYILKSKAEKERDEMAQEMETLHERIENYQDQISLKTSQ 493

  Fly   493 LEVLQVELQQKQQEFANVKKQMEVIQSEKVMLMKTMDMCSRDRSTLQNTMTKLTHQINQMTSSLA 557
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  Fly   494 VNDLTEKLHEKQREVHSYKKQLESVHSEKMMLQRNLENTTQERDNFRILQAKSGHQIQQLTTEIS 558

  Fly   558 INEKEISSLKNQIEQLNRTVKQKQNEIHAKSRLLASTKTDLREMKIRLEQAAHTIDTDEKRFKNM 622
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  Fly   559 ANEVKINSLNLKIEHLNNYIKELQSDLKNKENLVAALRKDMREMKAKNEMLAKTISNDELKFMKM 623

  Fly   623 ACALDEVTKEKSLVGLQMVRRNDEVRLLREKLDMMQKAIDRGTMQYNQRVEDIRLLKLEVVNLRT 687
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  Fly   624 GHELEEMRKERNLVGLQMVRRNDEIVVIKEKLQIAQNALDNGTTQYNQRVEDIRLLKKEISNLHT 688

  Fly   688 SHECMQREVGNKAAMRHDVIRLERQLNQERLKVSAYSEELSRPCRIHRWRVLLGKDPRRFELIRK 752
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  Fly   689 ESECLKHAIKSTADMRKEIVRLQRALNQEHIRIRALTEDARTPTGVHRWRILKGEDPKKFELLEK 753

  Fly   753 IQQLLKRNIRLSVERENKAKELAELEHVHEEFKRQMTNLPDPSVRQKLCIQQRINRRQTRQLKAM 817
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  Fly   754 LQLLQKRSLKQSIENSNLKNKLCEAQKTNETLKRMLSHMPTVEIKHKLVVQQRINRQMAKKLKTL 818

  Fly   818 KAELRINEIDLKTREHLIEGFQEQLRLHHLENKENFIGK----GDFSIRS-GKATEDEFTEQVFD 877
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  Fly   819 AAERSLDMVELKSRQCII---------------NSFAGKISEIGELSILSDGK---NEIKSAILD 865

  Fly   878 M 878
            :
  Fly   866 V 866

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
CG6059	NP_651541.2	Smc	<251..>524	CDD:440809	72/296 (24%)
		SMC_prok_B	<425..715	CDD:274008	112/289 (39%)
ORY	NP_001015498.5	SMC_N	<111..435	CDD:481474	97/347 (28%)
		DR0291	290..>417	CDD:441187	38/150 (25%)
		SMC_prok_B	<363..686	CDD:274008	122/322 (38%)