Protein Alignment CG5882 and cfap58

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_651540.1
• Gene: CG5882 / 43269
• FlyBaseID: FBgn0039490
• Length: 866
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: NP_001071024.4
• Gene: cfap58 / 561732
• ZFINID: ZDB-GENE-060929-128
• Length: 885
• Species: Danio rerio
• Alignment Length: 911
• Identity: 221/911 - (24%)
• Similarity: 438/911 - (48%)
• Gaps: 119/911 - (13%)

  Fly     1 MSKASGSEDEPLVPDDFDDDFYKELCDKIPEATKALRQKDTPNNADNVQRLLICGSRYKSDLRLE 65
            :::.||.|..    |.|..::.|        .|||||:     :.:|.:||:
Zfish    29 LNELSGDEKF----DKFRVEYEK--------VTKALRK-----SHENEKRLM------------- 63

  Fly    66 KERSQELRKEIESLEERLENAARVTKLDMATIEELRGVIEGAWKQKDAAQIREQSAQDEVLSLRE 130
             .:.:||..||.|...:|..|.::...|.|:|..|:..|:.|||..:|:..:|..|::.:...:|
Zfish    64 -AKCRELNAEIVSNSVKLSTAMKLVDEDQASINTLKQEIDKAWKMVEASHEKELQAKETIKKYKE 127

  Fly   131 KLDESEQMVAHLN---EKRLAMS-------------KRDDGKERERLNAEIADLNKRLHLQRTYA 179
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Zfish   128 E-------IANLNKLVEKGAGVSGGQEYSVGDLLKIKEELTEQRDKLLSEVVTLRENL----TKA 181

  Fly   180 TELDHTIEGLEAKNKELLKLLDE----TSSDACNLKRKSDALTKELSTMKTEESRYQEQISQMKS 240
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Zfish   182 TGAQQEIEAEKNKAMDMIAQLQQEIQVRQNEVHRETRRKEKLEKEVKQFQTDLESKQSEI----- 241

  Fly   241 ANEHLTKVKVRQNLQILSLKTNLEHLNTQHNAANNKLAKITVDLEY--TVQERDKNKRALN---- 299
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Zfish   242 ------KLLTQQSQRLQDDQQKLEQLLQEHKIINEKSSKEMEQLQHRNTKLQQDNEQNSINLEQL 300

  Fly   300 -----QRINLLKVREDELIKVRQDNGKLAKSQEAIARKYAVLDEAKREVETLNIRLRTQLGTQDK 359
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Zfish   301 SQQNQQRASDLKMKEEEVSQLKQEITKLTRLREGAQRRLRQMEEQKAEVENQRETLKNQITGLER 365

  Fly   360 ELESMRRVVHHFEKNNENLTKERDSLRRELQAEHHQLEQSNA---QHQEA----QHEVRALKDTI 417
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Zfish   366 EMEASKNQIDADKKAIDELVRERDILNKNMIKAANETDKQQTLVKLHEQSKKTLEHEILNYRD-- 428

  Fly   418 TTMDTKLKKLNEDANKLKKEKTKKLDEIQHWIDKLDALQN--EMHLKENYEIELKRTISDLEAKC 480
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Zfish   429 -----EAQKQRKIIYQLEKERDRYINEASELTKKV--LENIEDIKLKEMQIFEYKKRIAEAETKL 486

  Fly   481 SKFQQQHDGLAAERQTLQRSVQLADEERQKLRDQLVNLQAHVEKLKAKIGYRDGEISRLQLQIDR 545
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Zfish   487 KQQQNLYEDVRTERNLFSKNLIEAKDQNAEMRRKVKIVNHMFEQLKDEITAKEVALDKERQEFQR 551

  Fly   546 MEKERRLLRNEIRHAQLGQQHTKAELLDKRKENDRHAKSLQEDEQKLARLRKDVDNLMNEKNAIS 610
            :|:||..|:.|::..:|..|.||..|..::.:.....|.:.|.:.:..|.:|::|.:::|::.:.
Zfish   552 VERERENLKAELQKMKLQAQETKQLLAKQQAQEQELLKIIAEADAERIRQKKELDQVISERDLLG 616

  Fly   611 AALTKRNEEFDRLKHSQENLQTVYDQTQRQCSQYQDDMRLMGVEIKNLRTERDVLRADRESAADL 675
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Zfish   617 TQLVKRNDSLALLYEKVKIQQSILNKGEVHYNERLEDIRVLKIEIKKQRREKSILSKTVINVDDL 681

  Fly   676 RQELLQMHRMLNQERIKARALQDEMVTPMNVHRWRLLSGKDPEKMDLLGRISILRKQLLQQNVAA 740
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Zfish   682 RQEVFHMHRELMKERTRCRALEDELNNPLNVHRWRKLEASDPSSFELIQKIHSLQRRLISKTQEV 746

  Fly   741 SEQERALNEAQQLYAALREFMLKLPSHKVRAELNSVKANLSAKDRKLKVLKAELSAREADEKSKK 805
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Zfish   747 VEKELLLQEKEKLYVELKHILARQPGPEAAEKLQVYQRTLREKTKQLKALTAELNMHESQAEGYK 811

  Fly   806 EKLEEMRVSLALTKTQLLEEKKHKQKLLEERQLLEQMHCYSAPA----------QLPRTLGAGFK 860
            .::|.:...|...|.:...:|:..|:..|:::.|       .||          ..||..|.||.
Zfish   812 YEIERLVHELQEVKKKYFAQKRKDQENREKQRSL-------GPAGQPVIQPQRPDGPRFTGGGFS 869

  Fly   861 M 861
            :
Zfish   870 L 870

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
CG5882	NP_651540.1	SMC_prok_B	<70..391	CDD:274008	84/351 (24%)
		Smc	<324..>841	CDD:440809	133/525 (25%)
cfap58	NP_001071024.4	None