DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment CG5521 and Ralgapa2

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_001163748.1 Gene:CG5521 / 43242 FlyBaseID:FBgn0039466 Length:1964 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:XP_017447727.2 Gene:Ralgapa2 / 296211 RGDID:1308023 Length:1973 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:2128 Identity:710/2128 - (33%)
Similarity:1036/2128 - (48%) Gaps:431/2128 - (20%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly     1 MFTKKSHADVKKSTAKLQDSKKDSASRLRHLRMI----------------LDNVELEESKCLFET 49
            ||:::||.||||||.|:.|.|||..:||:|||.:                ||||:..:.|..|||
  Rat     1 MFSRRSHGDVKKSTQKVLDPKKDVLTRLKHLRALLGTHDPQYRGRVRAGHLDNVDASDLKQFFET 65

  Fly    50 NYSHVYFILYDTFIQAEANLKQKELPFHIVHKAHREELDGSLWLLEKILCLLPELLARRWQCHSL 114
            |||.:|||.|:.||..|.:||.|.     .:|:.|||||..|:|.||||..|||.:..||...|:
  Rat    66 NYSQIYFIFYENFITLENSLKLKG-----NNKSQREELDSILFLFEKILQFLPERIFFRWHYQSI 125

  Fly   115 SRIMAKLLHLGNSPKLRREGVRYFLLWYQTLGENAPGYVHAMYADLIPGL--IVPQKGVVGPDTE 177
            ...:.||||.|||.|:|.||:|.||||.|.|..|.......::|.|:||.  ::..:|....:| 
  Rat   126 GSTLKKLLHTGNSIKIRCEGIRLFLLWLQALQTNCAEEQVLIFACLVPGFPAVLSSRGPCTLET- 189

  Fly   178 FSASDFLTHPNMKADGGMASVFHDNAFSHPVQSSEVVALLPPSSSEKSAPPDPRDGLEVLLNSMV 242
                  |.:|:            .:.....:...|:..|||..|.||.|.......|::||..||
  Rat   190 ------LINPS------------PSVVDAKIYPEEITPLLPAVSGEKIAEDQTCFFLQILLKYMV 236

  Fly   243 HTAACLRWRDNRAQKDHRAFAFLLQRFMDVFLPVFSPNFDVSCSIYNPRLDLPVMR------SIN 301
            ..||.|.|: |:..:| ..|.||...|...:||...|:|....:||.|.|::|.:|      ::.
  Rat   237 IQAASLEWK-NKENQD-TGFKFLFTLFRKYYLPHLFPSFTKLTNIYKPVLEIPHLRPKPLYVTVT 299

  Fly   302 KKEEVMAS-------CVVVLINWVSRFTHERLLSHRLDCTLHIEDV------------------- 340
            :..|.:.|       ..||.|.|:..|..|:........|.:..||                   
  Rat   300 RDNETIYSTKIPYMAARVVFIKWIVTFFLEKKYLTATQNTKNGVDVLPKIIQTVGGGAIQEKVPE 364

  Fly   341 -------DQVRLHGYQQGL----------------------IVRDVLYVNRENINFVHEVYRQAF 376
                   :|.:.|.....|                      :|:.:|...|..:|||:||:||||
  Rat   365 LDGAGATEQDKSHSNSSTLSDRRLSNSSLCSIEEEHRTVYEMVQRILLSTRGYVNFVNEVFRQAF 429

  Fly   377 LLNFTSKPQIEAIRTAIAVYRDWMTGETPPPFLLEPN-----------------DDPPPPSNAGG 424
            ||   ...:|...|..:.|||.|:. :..|.|:.||:                 |.....|.:.|
  Rat   430 LL---PSCEISITRKVVQVYRKWIL-QNKPVFMEEPDKKDVAEEDADKLGLSETDSKEVSSESSG 490

  Fly   425 TPRSQRL-RTPSYVGAIA----GSKDQLVVRAGRQNVLQVFVTNAANVFLVNTANLNICFPTRSR 484
            ..||... ||.|:..|::    ..:|...|:||.|.:||||:||||||||     |..|.     
  Rat   491 HKRSSSWGRTYSFTSAMSRGCVTEEDNTNVKAGAQAMLQVFLTNAANVFL-----LEPCV----- 545

  Fly   485 SYRSTP--LEEQTEICKKVLNVYRTMVMNTEMDTRTWEQLLMVLLQVTSIVLHQNQHTLPSGTNK 547
               ..|  |.||.:.||.||.::|.|:|...|:.:||||:|.:||::|..|:.:.:..|.. .:.
  Rat   546 ---EVPMLLREQVDACKAVLIIFRRMIMELTMNQKTWEQMLQILLRITEAVMQKPKDKLVQ-DSF 606

  Fly   548 SATLGGILGSAIFQTLIVTWIRAHTKVPVNVLLWEKFLNVLQSLTHREELIIEWNKTIQTLTRVF 612
            :.:|.|:|    |:||||.||||:..|.::..||:.||.||.|||..||||.||:..:.:||.|.
  Rat   607 ARSLAGLL----FRTLIVAWIRANLCVYISRELWDDFLRVLSSLTEWEELITEWSNIMDSLTAVL 667

  Fly   613 SRYTYGINLLDLPLDRVAESRAEKRRRIGSV----------------WQG-----------SGSN 650
            :|..||:.:.:||||:::|.:.:|:|..|.|                |:.           |.:.
  Rat   668 ARTVYGVEMTNLPLDKLSEQKEKKQRGKGCVLEPQKGTAVGRSFSLSWRSHPDVTEPMRFRSATT 732

  Fly   651 SAANGGSAASAAISQNRQRESLAESSS-------SRSEETSSQVPLPNH------------PRPH 696
            |.|.|...|...:   ||:.:...|.|       |.:...:..|||..|            |..|
  Rat   733 SGAPGVEKARNTV---RQKATAKRSQSISNCVHLSEALPATKSVPLLLHTVSALLPGLSYSPCSH 794

  Fly   697 H-------QHTQSQGGTG-----HGTRPIPLTPMLS----RSYSEGS-------------LASAA 732
            .       |..:|.....     .|.:|:|.:...|    |.||:.|             :||..
  Rat   795 RLSEVEEFQQAESTAAADCDYLVVGQQPVPRSSSTSDITERLYSDSSQGYSPMLPHPAFYMASGD 859

  Fly   733 RSSRIRRRRAATPKPKAL----QPSQLAENRIN-----PQDLRRAM--------SLDSLARKGDA 780
            .:|   ...|.|..|..|    .|.|..||..|     |:.::.:.        .:..|.|:..:
  Rat   860 LNS---GPHACTTGPLPLSHLPSPGQKVENSQNLSSSEPKSVQESKGHVTHEHEGVTILVRRSSS 921

  Fly   781 -EETDSYQEGDNESG-AGSRSPSPTASSGIEGGSIKDAQLQI----------------DASLD-D 826
             .|.|..:|.....| ...|..|.:..|.:..|...:|:|.:                ||..| |
  Rat   922 PAELDLKEESQQTHGRCRERQKSESTGSDMAVGYSNEAELPVSPWQTCEEDPELSTPTDAVADSD 986

  Fly   827 ANSGSYGSGSNSGSIS-GRRC------IILGGSAEGWHPDSTSIMWKRMLGALGDVNRIPKADLH 884
            |......|.:::.::: .|.|      ||.||:..||||||.:::|:|:||.|||||.|....:|
  Rat   987 ARHWLQLSPTDASNLTESRECLADDCSIIAGGNLTGWHPDSAAVLWRRVLGILGDVNNIQSPKIH 1051

  Fly   885 AQVFMHLLEMTQNLIKIKQNQGISTDNQNTQPMPPLVPPIGIVAPWCYGSLSLDRSFKKGKLWAL 949
            |:||.:|.|:...|.||:.|..||.|||::...|.|:||:.:.|.|.:.:.:|...:|:|||.|.
  Rat  1052 AKVFSYLYELWYKLAKIRDNLAISLDNQSSPSPPLLIPPLRMFASWLFKATTLPNEYKEGKLQAY 1116

  Fly   950 QLLCSLAIQG---AVNMQQLPLFYHALHQLLTGEDRDLIYAILKHLEGPRLLSLLLPGHTLLLLD 1011
            :|:|::..:.   ..|...|..||..:|..||.||:|::..|:|:. .||..||.|||.::|:.|
  Rat  1117 KLICAMMTRRQDVLPNSDFLVHFYLVMHLGLTSEDQDVLNTIIKNC-SPRFFSLGLPGFSMLVGD 1180

  Fly  1012 LVHASA-ILLTSLEVSRSTPRAEVAALLGSLLCYPSSLLTRSVLQPTPQKFELME-CSDLQDHIL 1074
            .:.|:| :|.|.:   .:.||:|...|||||:|:|::.....:||..|:..:::. ..|::.:::
  Rat  1181 FITAAARVLSTDM---LAAPRSEALTLLGSLVCFPNTYQEIPLLQSVPEVSDVVTGAEDVKHYLI 1242

  Fly  1075 NIVLRCARREPSAKARCIALSQLGQWLLMRLSQPLPASNSGRANLFQQAVPHHKDVHPKASSVYN 1139
            ||:|:.|..||:..|||||:..||.|:...|:|                            ...:
  Rat  1243 NILLKNATEEPNECARCIAICSLGVWICEELAQ----------------------------CASH 1279

  Fly  1140 PRIKEVLQVLLQALQFKHHTIAIVAVDSLKLCAERGRQLAAIE-----RVPQLIITAICKAL--- 1196
            |::|:.:.|:...|:|.:..:|.||.|.|:|......:|...|     ::.::::..|...|   
  Rat  1280 PQVKDAINVIGVTLKFPNKIVAQVACDVLQLLVSYWEKLQMFETALPRKMAEILVATIAFLLPSA 1344

  Fly  1197 EIQSVTKPKDSDKVVLTSLMLCLGEFCMAIPAPIMLTPFNEQGDTLVLQ------------VLRV 1249
            |..||    ::||..:.||:|||.::|||:|...:|.|.:    |.|::            :.||
  Rat  1345 EYSSV----ETDKKFIVSLLLCLLDWCMALPVSALLHPVS----TAVIEELHPSRAPLLDYIYRV 1401

  Fly  1250 LLQVASGAPRHERVKLTADDDFDMHIAHDDLQG---DGRLPEATYQTSETIQ------------- 1298
            |.....|:..:     |....:.:.:|  ||..   |..||.|..:.||.:|             
  Rat  1402 LHCCVCGSSTY-----TQQSHYTLTLA--DLSSTDYDPFLPLANVRNSEPVQYHSSADLGNLLTV 1459

  Fly  1299 ------KCITAIKLCAKAVSMHLVTHIGHFPMGIGASRLSSMVEEQDDIGNAAYGGQVETRRDSV 1357
                  :.:..|.|.|:.|..|||.|:||:|:..|.:.|.|:|.|..|  ||...|        .
  Rat  1460 EEEKKRRSVELIPLTARMVMAHLVNHLGHYPLSGGPAVLHSLVSENHD--NAHVEG--------T 1514

  Fly  1358 ELPS-VVSAQNMQLFMLNSGLVASFIELPTLKLPGGGITAGLVTADKQVRVLMRDLNGKACWDAS 1421
            ||.| |..:.|:|||:.|...:.|:::.|. :.|.||.:.|.::   .|||::||::||..||..
  Rat  1515 ELSSEVFRSPNLQLFVFNDSTLISYLQTPA-EGPAGGTSGGSLS---DVRVIVRDISGKYSWDGK 1575

  Fly  1422 ILYSEPRNAEEPPKTTPKIQHSQPLDSMATSMVTHTPSPRHTLRHRPAGVLPLAKDMAPDLDQLD 1486
            :||........|....|..|.|        ....||..|:..|.|...|.           |.||
  Rat  1576 VLYGPLEGRLAPSGRNPSFQIS--------GWHHHTCGPQSNLFHGEEGD-----------DVLD 1621

  Fly  1487 DMLAYIGHTSPECVAPTVSQLN----APTASPLSGNQEAQAISVILNQRLLEQEFVTHSTQAPSP 1547
            .:|..||||||||:.|  ||||    :||.|.::.:||.:.|.|||.|...|.|:|         
  Rat  1622 KLLENIGHTSPECLLP--SQLNLNEPSPTPSAMNCDQEKEIIEVILRQSTQEDEYV--------- 1675

  Fly  1548 ALRHASSNSSLQQPDQRSLHSTTASFDSLPTRTEMPFQYCRLLFSHLGLAGWERRSRTHLLQRSE 1612
              :...|||:::         .|:.....|.....||.:||||...||:..|:||...|||:::.
  Rat  1676 --QRCHSNSAVK---------VTSQGQPSPVEPRGPFYFCRLLLDDLGMNSWDRRKNFHLLKKNS 1729

  Fly  1613 KLMRELRNVDLQKCRETHKMAVIYVAAGQEDKGSILRNTSGSSTYEMFVSALGWEIDLETHNGFL 1677
            ||:|||:|:|.::||||||:||.|:|.|||||.|||.|..||..||.||:.||||:||.||.||:
  Rat  1730 KLLRELKNLDSRQCRETHKIAVFYIAEGQEDKCSILANERGSQAYEDFVAGLGWEVDLSTHCGFM 1794

  Fly  1678 GGLPRQG-CGATAPYYATPFLEVVYHVATRMPSDSSEAMLLKTRHLGNDEVHIVWSEHNRDYRRD 1741
            |||.|.| .|.|||||||..:||::||:|||||||.:::..|.|||||||||||||||:|||||.
  Rat  1795 GGLQRNGSTGQTAPYYATSTVEVIFHVSTRMPSDSDDSLTKKLRHLGNDEVHIVWSEHSRDYRRG 1859

  Fly  1742 ILPTEFCDVLIVVYPLRNGLFRVTVNRKPEVPWFGPLANESVVSGACLATLIRATAINASRTKRA 1806
            |:||.|.||.|::||::|.:|.:|:.:|||||:||||.:.::|||..|.:||.||.|||||..:.
  Rat  1860 IIPTAFGDVSIIIYPMKNHMFFITITKKPEVPFFGPLFDGAIVSGKLLPSLICATCINASRAVKC 1924

  Fly  1807 ALPLYQQFYEERNRSLDSVSSRYKESTTFEDFASRIYNPMPLSTL-GT 1853
            .:||||.|||||...|:::...::|..||||||:::::|.|..:| ||
  Rat  1925 LIPLYQSFYEERALYLEAIIQNHREVMTFEDFAAQVFSPSPSYSLSGT 1972

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
CG5521NP_001163748.1 RALGAPB_N 491..619 CDD:466561 54/127 (43%)
Rap_GAP 1648..1820 CDD:460463 106/172 (62%)
Ralgapa2XP_017447727.2 RALGAPB_N 550..674 CDD:466561 54/128 (42%)
Rap_GAP 1765..1937 CDD:460463 105/171 (61%)

Return to query results.
Submit another query.