DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment Nf1 and Nf1

DIOPT Version :9

Sequence 1:NP_733132.2 Gene:Nf1 / 43149 FlyBaseID:FBgn0015269 Length:2802 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:XP_006532499.1 Gene:Nf1 / 18015 MGIID:97306 Length:2852 Species:Mus musculus


Alignment Length:2974 Identity:1600/2974 - (53%)
Similarity:2030/2974 - (68%) Gaps:337/2974 - (11%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly     4 KPGEWASALLARFEDQLPNRIGAYGTQARMSQDQLVACLIHISRYRFSLVISGLTKMLQRVNEAA 68
            :|.||..|:::||::|||.:.|...|..::|.:....|||:||:|:|||||||||.:|:.||...
Mouse     5 RPVEWVQAVVSRFDEQLPIKTGQQNTHTKVSTEHNKECLINISKYKFSLVISGLTTILKNVNNMR 69

  Fly    69 LQNRHEPERCYFESLVIILTTLERCLTNQTKDTARFEEAMNVKLLLREISQFVDVQSDSNPNAAQ 133
            :......:..|...| |||.|||:||..|.|||.|.:|.|.||.||.||..|:....:.|.:||:
Mouse    70 IFGEAAEKNLYLSQL-IILDTLEKCLAGQPKDTMRLDETMLVKQLLPEICHFLHTCREGNQHAAE 133

  Fly   134 LKALASKVLFALSQNHFSAVFNRISARIQELTSCSEENPDYNDIELIQHIDMDMIKLTKLLQETI 198
            |:..||.|||:||.|:|:|||:|||.|:||||.|||:|.|.:||||:|:|::|..||.:||:||.
Mouse   134 LRNSASGVLFSLSCNNFNAVFSRISTRLQELTVCSEDNVDVHDIELLQYINVDCAKLKRLLKETA 198

  Fly   199 TKFRS-KRAPPLILLYSLEKAIWNWIEYHPQEFQDLQRGTNRDISTCWEPLMDFVEYFKTENKKS 262
            .||:: |:...|.::.|||||.|||:|.:|.||..|.:....|::.|.|.|.|.|:.| .|:.|.
Mouse   199 FKFKALKKVAQLAVINSLEKAFWNWVENYPDEFTKLYQIPQTDMAECAEKLFDLVDGF-AESTKR 262

  Fly   263 KTLVWPLQMLLLILNPSCLEAVVNELQQSEKEKEKDKEKVASKSAQSTSRDKDFSAKQFIESIKR 327
            |..|||||::||||.|..::.:..::..                      :.:.:.|.|::|:::
Mouse   263 KAAVWPLQIILLILCPEIIQDISKDVVD----------------------ESNINKKLFLDSLRK 305

  Fly   328 GLGQHSPSKQVTESAAIACVKLCKASTYINNTDSNNVVFKLVQFFINDLKALLFNPAKPFSRGQG 392
            .|..|..|:|:|||||||||||||||||||..| |:|:|.|||..:.|||.|||||:||||||. 
Mouse   306 ALAGHGGSRQLTESAAIACVKLCKASTYINWED-NSVIFLLVQSMVVDLKNLLFNPSKPFSRGS- 368

  Fly   393 YNFADIELMIDCWVSCFRINPHNIEALKVCLNLSSPQAYHFVIVCSLLRLAHIYVDFRLQNKNPF 457
             ..||::|||||.||||||:|||.:..|:||..:||..:|:|:|.||         .|:...:.|
Mouse   369 -QPADVDLMIDCLVSCFRISPHNNQHFKICLAQNSPSTFHYVLVNSL---------HRIITNSTF 423

  Fly   458 R--IVNQPRLSWWPQTDVVHYRSAELRALFTDTLNKATQGYIAHTPLRYITSLTLKSKDTQKGLT 520
            :  :.....|.|||:.|.|:..|.|||.:|.:||:||.||..||..:|...|||.|.|.|.   .
Mouse   424 KHGLGTASALDWWPKIDAVYCHSVELRNMFGETLHKAVQGCGAHPAIRMAPSLTFKEKVTS---L 485

  Fly   521 RAEEGP------AHKMLLLLLVRLIHADPTLLLNTQGKVAHEVQSSTLELINGLVSLVHQTTMPD 579
            :.:|.|      ::|.|||.:|:||||||.|||....|...|.||||.|||.|||.||.|:.||:
Mouse   486 KFKEKPTDLETRSYKCLLLSMVKLIHADPKLLLCNPRKQGPETQSSTAELITGLVQLVPQSHMPE 550

  Fly   580 VAQEAMEALLALHAPEKIEVWNPEAPINTFWDVSSQVLFSISQKLIQHQIANYTDVLKWLREILI 644
            ||||||||||.||..:.|::|||:||:.|||::|||:||.|.:||..||:.:.|::|||||||||
Mouse   551 VAQEAMEALLVLHQLDSIDLWNPDAPVETFWEISSQMLFYICKKLTSHQMLSSTEILKWLREILI 615

  Fly   645 CRNTFLQRHKD---------YAH-VGSQIA----------------------------------- 664
            |||.||.::|.         |.: ||.:::                                   
Mouse   616 CRNKFLLKNKQADRSSCHSLYLYGVGCEMSATGNTTQMSVDHDEFLRACTPGASLRKGRGNSSMD 680

  Fly   665 ----------ICKQAHIKMEVVFFMYLWSVDLDAVLTSLSCFGLLCEEAEICCSSDELTVGFIMP 719
                      ||:||..|:||..:|:||:.|.:|||.::|||..|||||:|.|..||::|...:|
Mouse   681 STAGCSGTPPICRQAQTKLEVALYMFLWNPDTEAVLVAMSCFRHLCEEADIRCGVDEVSVHNFLP 745

  Fly   720 NYHIYQELAQLSTSATDSRICFFDNTHGNVLS--RLTLQKRIMTLLRKIEHCVHGVQPAWEETFR 782
            ||:.:.|.|.:|                |::|  |..||||:|.|||:|||...|...|||:|..
Mouse   746 NYNTFMEFASVS----------------NMMSTGRAALQKRVMALLRRIEHPTAGNIEAWEDTHA 794

  Fly   783 NWEVSSKVLQTYPKCKGEDGQ-AEVFHRGMGKRRASHQSSEHDLE----EQINEWANMTWFLLAL 842
            .||.::|::..|||.|.|||| ||..|:.:.|||.||.|....::    :.:.||.|||.||.||
Mouse   795 KWEQATKLILNYPKAKMEDGQAAESLHKTIVKRRMSHVSGGGSIDLSDTDSLQEWINMTGFLCAL 859

  Fly   843 GGVCLHKRSSSRQMLLQQSQNNASLGSLAQNSLYSSSTSSGHGSLHPSTVSLSTLPPAPPQDVSY 907
            |||||.:||||     ..:..:..:|::::......|..|..|::.                   
Mouse   860 GGVCLQQRSSS-----GLATYSPPMGAVSERKGSMISVMSSEGNID------------------- 900

  Fly   908 CPVTQFVGQLLRLLVCSNEKIGLNIQKNVKELVGEEMSTQLYPILFDQVRAIVEKFFDQQGQVNV 972
            .||::|:.:||.|:||::||:||.|:.|||:|||.|:|..|||:||::::..:.||||.|||  |
Mouse   901 SPVSRFMDRLLSLMVCNHEKVGLQIRTNVKDLVGLELSPALYPMLFNKLKNTISKFFDSQGQ--V 963

  Fly   973 NVTDINTQFIEHTIYIMKSILDPKANKDPNNDQPSPSEHLGVTSIEGMMLGIVRYVRHLDMTVYA 1037
            .::|.||||:|.||.|||::||        |.....|||||..|||.|||.:|||||.|...|:|
Mouse   964 LLSDSNTQFVEQTIAIMKNLLD--------NHTEGSSEHLGQASIETMMLNLVRYVRVLGNMVHA 1020

  Fly  1038 IRIKTKLCQLVEVMMKRRDDLAFRQEMKFRNKLVEYLTDWVMGTSHQIAPPSSADAAILTNTSLI 1102
            |:|||||||||||||.|||||:|.||||||||:||||||||||||:|.|   ..|...||     
Mouse  1021 IQIKTKLCQLVEVMMARRDDLSFCQEMKFRNKMVEYLTDWVMGTSNQAA---DDDIKCLT----- 1077

  Fly  1103 FRDLDQACMEAVAALLRGLPLQPEESDRGDLMDAKSALFLKYFTLFMNLLNDCIDSSEAEKEMNN 1167
             ||||||.||||.:||.||||||||.|..:||:|||.||||||||||||||||   ||.|.|...
Mouse  1078 -RDLDQASMEAVVSLLAGLPLQPEEGDGVELMEAKSQLFLKYFTLFMNLLNDC---SEVEDENAQ 1138

  Fly  1168 TPLLPPRPRMAAGKLTALRNATILAMSNLLGANIDSGLMHSIDLGYNPDLQTRAAFMEVLTQILQ 1232
            |   ..|.|..:.:|.:||:.|:|||||||.||:||||||||.|||:.||||||.||||||:|||
Mouse  1139 T---GGRKRGMSRRLASLRHCTVLAMSNLLNANVDSGLMHSIGLGYHKDLQTRATFMEVLTKILQ 1200

  Fly  1233 QGTEFDTLAETVLADRFEQLVQLVTMISDKGELPIAMALANVVTTSQMDELARVLVTLFDAKHLL 1297
            ||||||||||||||||||:||:||||:.|:|||||||||||||..||.||||||||||||::|||
Mouse  1201 QGTEFDTLAETVLADRFERLVELVTMMGDQGELPIAMALANVVPCSQWDELARVLVTLFDSRHLL 1265

  Fly  1298 SPLLWNMFYREVEVSDCMQTLFRGNSLGSKIMAFCFKIYGASYLQMLLEPLIRPLL--DEEEETC 1360
            ..||||||.:|||::|.||||||||||.||||.||||:|||:|||.||:||:|.::  .:.:...
Mouse  1266 YQLLWNMFSKEVELADSMQTLFRGNSLASKIMTFCFKVYGATYLQKLLDPLLRVIITSSDWQHVS 1330

  Fly  1361 FEVDPARLDPTEDIEQHRNNLIALTQKVFDAIINSSDRFPPQLRSMCHCLYQ------------- 1412
            |||||.||:|:|.:|:::.||:.:|:|.|.|||:||..||.||||:||||||             
Mouse  1331 FEVDPTRLEPSESLEENQRNLLQMTEKFFHAIISSSSEFPSQLRSVCHCLYQATCHSLLNKATVK 1395

  Fly  1413 --------VLSKRFPNLLQNNIGAVGTVIFLRFINPAIVSPQELGIVDKQVHSSAKRGLMLMSKI 1469
                    |:|:|||   ||:|||||:.:||||||||||||.|.||:||:.....:|||.||||:
Mouse  1396 ERKENKKSVVSQRFP---QNSIGAVGSAMFLRFINPAIVSPYEAGILDKKPPPRIERGLKLMSKV 1457

  Fly  1470 LQNIANHVEFSKEQHMLCFNDFLRDHFEAGRRFFIQIASDCETVDQTSHSMSFISDANVLALHRL 1534
            ||:|||||.|:||:||..||||::.:|:..||||:.|||||.|.|..:||:|||||.||||||||
Mouse  1458 LQSIANHVLFTKEEHMRPFNDFVKSNFDLARRFFLDIASDCPTSDAVNHSLSFISDGNVLALHRL 1522

  Fly  1535 LWTHQEKIGDYLSSSRDHKAVGRRPFDKMATLLAYLGPPEHKPV-DSHMMFSSYARWSSIDMSST 1598
            ||.:|||||.||||:||||||||||||||||||||||||||||| |:|        |||::::|:
Mouse  1523 LWNNQEKIGQYLSSNRDHKAVGRRPFDKMATLLAYLGPPEHKPVADTH--------WSSLNLTSS 1579

  Fly  1599 NFEEIMVKHQMHEKEEFKTLKSMNIFYQAGTSKSGYPVFYYIARRYKIGETNGDLLIYHVILTLK 1663
            .|||.|.:||:|||||||.||:::|||||||||:|.|:|||:|||:|.|:.|||||||||:||||
Mouse  1580 KFEEFMTRHQVHEKEEFKALKTLSIFYQAGTSKAGNPIFYYVARRFKTGQINGDLLIYHVLLTLK 1644

  Fly  1664 PFCHSPFEVVIDFTHTCSDNRFRTEFLQKWFYVLPTVAYENVHAVYIYNCNSWVREYTKFHDRIL 1728
            |:...|:|:|:|.|||...|||:|:||.|||.|.|..||:||.||||||||||||||||:|:|:|
Mouse  1645 PYYAKPYEIVVDLTHTGPSNRFKTDFLSKWFVVFPGFAYDNVSAVYIYNCNSWVREYTKYHERLL 1709

  Fly  1729 APLKGNRKLLFLESPNKLTDFIDAEQQKLPGATLSLDEDLKVFSNALKLSHKDTKVAIKVGPTAL 1793
            ..|||:::|:|::.|.||.:.|:.||||||.|||:|:||||||.|||||:||||||:||||.||:
Mouse  1710 TGLKGSKRLIFIDCPGKLAEHIEHEQQKLPAATLALEEDLKVFHNALKLAHKDTKVSIKVGSTAV 1774

  Fly  1794 QITSAEKTKVLAHSVLLNDVYYASEIEEVCLVDDNQFTLSITNESGQLSFIHNDCDNIVQAIIHI 1858
            |:||||:||||..||.|||:||||||||:||||:|||||:|.|:...|:|:|.:|:.|||:||||
Mouse  1775 QVTSAERTKVLGQSVFLNDIYYASEIEEICLVDENQFTLTIANQGTPLTFMHQECEAIVQSIIHI 1839

  Fly  1859 RNRWELSQPDSVTVHQKIRPKDVPGTLLNMALLNLGSCDPNLRTAAYNLLCALTATFDLKIEGQL 1923
            |.|||||||||:..|.|||||||||||||:|||||||.||:||:||||||||||.||:|||||||
Mouse  1840 RTRWELSQPDSIPQHTKIRPKDVPGTLLNIALLNLGSSDPSLRSAAYNLLCALTCTFNLKIEGQL 1904

  Fly  1924 LETQGLCIPSNNTIFIKSVSEKLATNEPHLTLEFLEESIQGFQRSTIELKHLCLEYMTPWLKNLV 1988
            |||.|||||:|||:||.|:|:.||.||||||||||||.|.||.:|:|||||||||||||||.|||
Mouse  1905 LETSGLCIPANNTLFIVSISKTLAANEPHLTLEFLEECISGFSKSSIELKHLCLEYMTPWLSNLV 1969

  Fly  1989 KFCKSNDDSKKLKVSQILDKLINLTIDQKEMYPSVQAKIWGSIGQIPELIDMVLDNFLHKSITYG 2053
            :|||.|||:|:.:|:.||||||.:||::|:||||:|||||||:|||.:|:|:|||:|:..|.|.|
Mouse  1970 RFCKHNDDAKRQRVTAILDKLITMTINEKQMYPSIQAKIWGSLGQITDLLDVVLDSFIKTSATGG 2034

  Fly  2054 LGSPQVEIMADTAVALASANVQLVSKKVITRICRVMDKSCTNPTQYLEQHMMWDDIAILGRYLLM 2118
            |||.:.|:||||||||||.||:|||.|||.|:|:::||:|.:||..||||:||||||||.||:||
Mouse  2035 LGSIKAEVMADTAVALASGNVKLVSSKVIGRMCKIIDKTCLSPTPTLEQHLMWDDIAILARYMLM 2099

  Fly  2119 LSFNNCLDVATSVPYLFHTITFLVCSGSLSMRASTHGLVINIIHSLCTCTNPSFSEEAQRVLRLS 2183
            |||||.||||..:|||||.:||||.:|.||:|||||||:||||||||||:...||||.::|||||
Mouse  2100 LSFNNSLDVAAHLPYLFHVVTFLVATGPLSLRASTHGLLINIIHSLCTCSQLHFSEETKQVLRLS 2164

  Fly  2184 LDEFSLPKFYLLFGISKVKSAAVTAFRSSCRHPTDKWLGNERVTQPLPADRERLSLPSLEVITDA 2248
            |.|||||||||||||||||||||.|||||.|         :|...|...:||..:|.|||.:|:|
Mouse  2165 LTEFSLPKFYLLFGISKVKSAAVIAFRSSYR---------DRSFSPGSYERETFALTSLETVTEA 2220

  Fly  2249 LLEIMEACMRDVPDCEWLNTWTSLARSFAFCYNPALQPRALIVYGCISKSVTDHEVKQLLRILVK 2313
            |||||||||||:|.|:||:.||.||:.|||.|||:||||||:|:|||||.|:..::||::|||.|
Mouse  2221 LLEIMEACMRDIPTCKWLDQWTELAQRFAFQYNPSLQPRALVVFGCISKRVSHGQIKQIIRILSK 2285

  Fly  2314 ALES-------FNDLILIEALVMCLTRIQPLLRPESPIHRALFWVAISVLQLDEITLYGAGLALL 2371
            ||||       :|..:|||:.|:.||::||||..:||:|:||||||::||||||:.||.||.|||
Mouse  2286 ALESCLKGPDTYNSQVLIESTVIALTKLQPLLNKDSPLHKALFWVAVAVLQLDEVNLYSAGTALL 2350

  Fly  2372 EQNLHTLKSQGCFDKKETIAEVMMKTREKLEWHFKQLDHAVGLSFRSNFHFALVGHLIKGFRHPT 2436
            |||||||.|...|:.|.. .||.|..|..||||.||:||.|||:|.|||:|||||||:||:|||:
Mouse  2351 EQNLHTLDSLRIFNDKSP-EEVFMAIRNPLEWHCKQMDHFVGLNFNSNFNFALVGHLLKGYRHPS 2414

  Fly  2437 PTTVSRTSRVLTMLLGIIAKPLHRDKFEVTPDSVAYLTALVAVSEEVRSRCHVKHALPRWPADLS 2501
            |..|:||.|:|..||.::.|..:.|||||...|||||.||:.|||||||||.:||.......|: 
Mouse  2415 PAIVARTVRILHTLLTLVNKHRNCDKFEVNTQSVAYLAALLTVSEEVRSRCSLKHRKSLLLTDI- 2478

  Fly  2502 SSVEN-------------------------------GEASGGVQAIGLPLSRRQKSWDILDQSAL 2535
             |:||                               |..:....|:|....|.:||.. ||... 
Mouse  2479 -SMENVPMDTYPIHHGDPSYRTLKETQPWSSPKGSEGYLAATYPAVGQTSPRARKSMS-LDMGQ- 2540

  Fly  2536 QFARQHKVPTLQNARVLFKTQRSFS--VPTTKDPNNATGIEERQERGS----------------- 2581
                    |:..|.:.|..|::||.  :..||.|       :|||..|                 
Mouse  2541 --------PSQANTKKLLGTRKSFDHLISDTKAP-------KRQEMESGITTPPKMRRVAETDYE 2590

  Fly  2582 -----------------RSSVSNESNVLLDPEVLPDLSIQALVLTVLATLVKYSSDEGETRVLYQ 2629
                             :.||| |||||||.|||.|..||||:||||||||||::||.:.|:||:
Mouse  2591 MAETQRIPSSQQHPHLRKVSVS-ESNVLLDEEVLTDPKIQALLLTVLATLVKYTTDEFDQRILYE 2654

  Fly  2630 YLAEGSVVFPKVFPVIHSLLDQKINNILSVSHDQVVLNSVQNIIQNMLASED-PSQQQLHFLQSC 2693
            ||||.||||||||||:|:|||.|||.:||:..|..:||.:..|:|:::..|: |.|.|..:|||.
Mouse  2655 YLAEASVVFPKVFPVVHNLLDSKINTLLSLCQDPNLLNPIHGIVQSVVYHEESPPQYQTSYLQSF 2719

  Fly  2694 GFGGLWRFAGPFTKYNMMGESSELFVNCLEAMVETCLPG------DESAPVPPSPRPYNLSSSLS 2752
            ||.|||||||||:|...:.:.:||.|..|:|:::|.|||      :||...|.||.|..|.|.| 
Mouse  2720 GFNGLWRFAGPFSKQTQIPDYAELIVKFLDALIDTYLPGIDEETSEESLLTPTSPYPPALQSQL- 2783

  Fly  2753 SLTLGSPTDKAFSSESLDFYDNCPGSVSSLRRASHSKSRAKHRINDSPS 2801
            |:|...               |...|::||..:.||....|..:..||:
Mouse  2784 SITANL---------------NLSNSMTSLATSQHSPGLDKENVELSPT 2817

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
Nf1NP_733132.2 RasGAP_Neurofibromin 1242..1575 CDD:213332 231/355 (65%)
CRAL_TRIO_2 1633..1767 CDD:404584 84/133 (63%)
PH_NF1 1759..1868 CDD:270123 78/108 (72%)
MOR2-PAG1_mid <1931..>2109 CDD:372971 121/177 (68%)
Nf1XP_006532499.1 RasGAP_Neurofibromin 1210..1563 CDD:213332 246/375 (66%)
CRAL_TRIO_2 1614..1748 CDD:372686 87/133 (65%)
PH_NF1 1740..1849 CDD:270123 74/108 (69%)


Information from Original Tools:


Tool Simple Score Weighted Score Original Tool Information
BLAST Result Score Score Type Cluster ID
Compara 1 0.930 - - C167842146
Domainoid 1 1.000 1233 1.000 Domainoid score I11
eggNOG 1 0.900 - - E1_KOG1826
Hieranoid 1 1.000 - -
Homologene 1 1.000 - - H226
Inparanoid 1 1.050 2904 1.000 Inparanoid score I19
Isobase 00.000 Not matched by this tool.
OMA 1 1.010 - - QHG52953
OrthoDB 00.000 Not matched by this tool.
OrthoFinder 1 1.000 - - FOG0005399
OrthoInspector 1 1.000 - - oto94593
orthoMCL 1 0.900 - - OOG6_103500
Panther 1 1.100 - - LDO PTHR10194
Phylome 1 0.910 - -
RoundUp 1 1.030 - avgDist Average_Evolutionary_Distance R472
SonicParanoid 1 1.000 - - X4961
SwiftOrtho 00.000 Not matched by this tool.
TreeFam 1 0.960 - -
1514.790

Return to query results.
Submit another query.