DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment Nf1 and Nf1

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_733132.2 Gene:Nf1 / 43149 FlyBaseID:FBgn0015269 Length:2802 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:XP_061503004.1 Gene:Nf1 / 1273814 VectorBaseID:AGAMI1_002638 Length:3049 Species:Anopheles gambiae


Alignment Length:3104 Identity:2312/3104 - (74%)
Similarity:2507/3104 - (80%) Gaps:362/3104 - (11%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly     2 TQKPGEWASALLARFEDQLPNRIGAYGTQARMSQDQLVACLIHISRYRFSLVISGLTKMLQRVNE 66
            ||||||||::||||||:|||.|.|.:|||||:|.|:.:.|||.||||||||||||||||||||||
Mosquito     3 TQKPGEWANSLLARFEEQLPYRTGPHGTQARLSIDETMNCLIQISRYRFSLVISGLTKMLQRVNE 67

  Fly    67 --AALQ------NRHEPERCYFESLVIILTTLERCLTNQTKDTARFEEAMNVKLLLREISQFVDV 123
              ..||      ..||||||.::||:|||.||||||:.|:|||||||||||||||||||.||:|:
Mosquito    68 IFIILQFQPPACRGHEPERCCYDSLIIILETLERCLSGQSKDTARFEEAMNVKLLLREICQFIDI 132

  Fly   124 QSDSNPNAAQLKALASKVLFALSQNHFSAVFNRISARIQELTSCSEENPDYNDIELIQHIDMDMI 188
            |:::|.||..|||||||||||||||||.|||||||||:|||::|:||||||:|||||||||:|:.
Mosquito   133 QNENNQNATSLKALASKVLFALSQNHFGAVFNRISARLQELSTCAEENPDYSDIELIQHIDLDVH 197

  Fly   189 KLTKLLQETITKFRS-KRAPPLILLYSLEKAIWNWIEYHPQEFQDLQRGTNRDISTCWEPLMDFV 252
            :|||||.|||.||:| |::..:|||.|||:|:|||||:||:||:||||..|.::|.|.|...|.:
Mosquito   198 RLTKLLTETIQKFKSLKKSAHMILLSSLERALWNWIEFHPKEFEDLQRNPNDELSKCCETFFDIL 262

  Fly   253 EYFKTENKKSKTLVWPLQMLLLILNPSCLEAVVNELQQSEKEKEKDKEKVASKSAQSTSRDKDFS 317
            :.: :||||::..|||||::||||:|..||.:||                |...|..:.|  ...
Mosquito   263 DSY-SENKKARAAVWPLQIMLLILSPKVLEEIVN----------------ADSGAPCSPR--HLK 308

  Fly   318 AKQFIESIKRGLGQHSPSKQVTESAAIACVKLCKASTYINNTDSNNVVFKLVQFFINDLKALLFN 382
            .|.|:|.||:|||.|:.|||.|||||||||||||||||||..|||||.|:|||..||||||||||
Mosquito   309 KKHFMEGIKKGLGAHASSKQSTESAAIACVKLCKASTYININDSNNVTFQLVQSVINDLKALLFN 373

  Fly   383 PAKPFSRGQGYNFADIELMIDCWVSCFRINPHNIEALKVCLNLSSPQAYHFVIVCSLLRLAHIYV 447
            ||||||||||:||.||:||||||||||||.|||.|||||||:|:||.|||||||.|||       
Mosquito   374 PAKPFSRGQGFNFQDIDLMIDCWVSCFRIKPHNNEALKVCLSLNSPPAYHFVIVSSLL------- 431

  Fly   448 DFRLQNKNPFRIVNQPRLSWWPQTDVVHYRSAELRALFTDTLNKATQGYIAHTPLRYITSLTLKS 512
                      :||.|.||.||||.|:|:.||.|||.||||||||||||||||||||.||||||||
Mosquito   432 ----------KIVTQARLPWWPQIDLVYARSGELRGLFTDTLNKATQGYIAHTPLRMITSLTLKS 486

  Fly   513 KDTQKGLTRAEEGPAHKMLLLLLVRLIHADPTLLLNTQGKVAHEVQSSTLELINGLVSLVHQTTM 577
            ||.|..|||.:||||||.||||:||||||||.||||:.||..||||||||||||||||||||.||
Mosquito   487 KDAQSRLTRPDEGPAHKALLLLMVRLIHADPMLLLNSLGKAGHEVQSSTLELINGLVSLVHQPTM 551

  Fly   578 PDVAQEAMEALLALHAPEKIEVWNPEAPINTFWDVSSQVLFSISQKLIQHQIANYTDVLKWLREI 642
            |||||||||||||||:|:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mosquito   552 PDVAQEAMEALLALHSPDKIEVWNPEAPINTFWDVSSQVLFSISQKLIQHQIANYTDVLKWLREI 616

  Fly   643 LICRNTFLQRHKDYAHVGSQIAICKQAHIKMEVVFFMYLWSVDLDAVLTSLSCFGLLCEEAEICC 707
            |||||||||||||||:||||||||:|||||:||||||||||||||||:.||||||||||||||..
Mosquito   617 LICRNTFLQRHKDYANVGSQIAICRQAHIKLEVVFFMYLWSVDLDAVMVSLSCFGLLCEEAEIRS 681

  Fly   708 SSDELTVGFIMPNYHIYQELAQLSTSAT-----DSRICFFDNTHGNVLSRLTLQKRIMTLLRKIE 767
            .|||||||||:||||:||||:..|.:.|     :||..||::.||    |:|||:.||:||||||
Mosquito   682 GSDELTVGFILPNYHLYQELSHTSATLTSPQNAESRYSFFEHLHG----RVTLQRNIMSLLRKIE 742

  Fly   768 HCVHGVQPAWEETFRNWEVSSKVLQTYPKCKGEDGQAEVFHRGMGKRRASHQSSEHDLEEQINEW 832
            |||:|||||||||||||||:||:||:|||.|.|:||||||||.|||||||||||||||||||.||
Mosquito   743 HCVNGVQPAWEETFRNWEVTSKLLQSYPKGKPEEGQAEVFHRSMGKRRASHQSSEHDLEEQITEW 807

  Fly   833 ANMTWFLLALGGVCLHKRSSSRQMLLQQSQN-NASLG----SLAQNSLYSSSTSSGHGSLHPSTV 892
            |||||||||||||||.|..:.|    |.:|. |..:|    ||.|::...||:|||.||:||...
Mosquito   808 ANMTWFLLALGGVCLQKPRNQR----QATQGYNLPIGTAGPSLMQSTTSLSSSSSGRGSMHPIMG 868

  Fly   893 SL-STLPPAPPQDVSYCPVTQFVGQLLRLLVCSNEKIGLNIQKNVKELVGEEMSTQLYPILFDQV 956
            || |::.|...|:|.|||||||:|||||||||:|||.|..|||:||||||:|||.|||||||||:
Mosquito   869 SLVSSIGPGSSQEVQYCPVTQFIGQLLRLLVCNNEKFGPQIQKHVKELVGQEMSAQLYPILFDQI 933

  Fly   957 RAIVEKFFDQQGQVNVNVTDINTQFIEHTIYIMKSILDPKANKDPNNDQPSPSEHLGVTSIEGMM 1021
            |:|||||||||||  |.||||||||||||||||||:||.:.:|| .||||:.:|||||||||.:|
Mosquito   934 RSIVEKFFDQQGQ--VVVTDINTQFIEHTIYIMKSVLDGRQSKD-QNDQPANAEHLGVTSIENLM 995

  Fly  1022 LGIVRYVRHLDMTVYAIRIKTKLCQLVEVMMKRRDDLAFRQEMKFRNKLVEYLTDWVMGTSHQIA 1086
            |.||||||||||||:||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mosquito   996 LAIVRYVRHLDMTVHAIHIKTKLCQLVEVMMKRRDDLAFRQEMKFRNKLVEYLTDWVMGTSHQIA 1060

  Fly  1087 PPSSADAAILTNTSLIFRDLDQACMEAVAALLRGLPLQPEESDRGDLMDAKSALFLKYFTLFMNL 1151
            ||.|.|..|:|      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mosquito  1061 PPGSGDVTIIT------RDLDQACMEAVAALLRGLPLQPEESDRGDLMDAKSALFLKYFTLFMNL 1119

  Fly  1152 LNDCIDSSEAEKEMNNTPLLPPRPRMAAGKLTALRNATILAMSNLLGANIDSGLMHSIDLGYNPD 1216
            ||||:|.|||:|:.||.||||||||:|||||||||||||.||||||.|||||||||||||.||||
Mosquito  1120 LNDCVDGSEADKDTNNPPLLPPRPRVAAGKLTALRNATIQAMSNLLSANIDSGLMHSIDLSYNPD 1184

  Fly  1217 LQTRAAFMEVLTQILQQGTEFDTLAETVLADRFEQLVQLVTMISDKGELPIAMALANVVTTSQMD 1281
            ||||||||||||||||||||||||||:|:|||||||||||||||||||||||||||:||||||||
Mosquito  1185 LQTRAAFMEVLTQILQQGTEFDTLAESVMADRFEQLVQLVTMISDKGELPIAMALASVVTTSQMD 1249

  Fly  1282 ELARVLVTLFDAKHLLSPLLWNMFYREVEVSDCMQTLFRGNSLGSKIMAFCFKIYGASYLQMLLE 1346
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Mosquito  1250 ELARVLVTLFDAKHLLSPLLWNMFYREVEVSDCMQTLFRGNSLGSKIMAFCFKIYGASYLQGLLE 1314

  Fly  1347 PLIRPLLDEEEETCFEVDPARLDPTEDIEQHRNNLIALTQKVFDAIINSSDRFPPQLRSMCHCLY 1411
            |||||||.:|..:.||||||||:||||||.:|.|||||||||||||:||:|||||||||||||||
Mosquito  1315 PLIRPLLGDEPTSSFEVDPARLEPTEDIEVNRKNLIALTQKVFDAIVNSADRFPPQLRSMCHCLY 1379

  Fly  1412 QVLSKRFPNLLQNNIGAVGTVIFLRFINPAIVSPQELGIVDKQVHSSAKRGLMLMSKILQNIANH 1476
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.:..|||||||||||||||||
Mosquito  1380 QVLSKRFPNLLQNNIGAVGTVIFLRFINPAIVSPQELGIVGKQVPTQIKRGLMLMSKILQNIANH 1444

  Fly  1477 VEFSKEQHMLCFNDFLRDHFEAGRRFFIQIASDCETVDQTSHSMSFISDANVLALHRLLWTHQEK 1541
            |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||:
Mosquito  1445 VEFSKEQHMLCFNDFLRAHFEAGRRFFIQIASDCETVDQTSHSMSFISDANVLALHRLLWSHQER 1509

  Fly  1542 IGDYLSSSRDHKAVGRRPFDKMATLLAYLGPPEHKPVDSHMMFSSYARWSSIDMSSTNFEEIMVK 1606
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||::|||||||||||||||||||||||
Mosquito  1510 IGDYLSSSRDHKAVGRRPFDKMATLLAYLGPPEHKPVDSHLLFSSYARWSSIDMSSTNFEEIMVK 1574

  Fly  1607 HQMHEKEEFKTLKSMNIFYQAGTSKSGYPVFYYIARRYKIGETNGDLLIYHVILTLKPFCHSPFE 1671
            |||||||||||||||||||||||||:|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mosquito  1575 HQMHEKEEFKTLKSMNIFYQAGTSKAGNPVFYYIARRYKIGETNGDLLIYHVILTLKPFCHSPFE 1639

  Fly  1672 VVIDFTHTCSDNRFRTEFLQKWFYVLPTVAYENVHAVYIYNCNSWVREYTKFHDRILAPLKGNRK 1736
            |||||||||||||||||||||||||||.|||||::|.|||||||||||||||||||||||||.||
Mosquito  1640 VVIDFTHTCSDNRFRTEFLQKWFYVLPEVAYENLYAAYIYNCNSWVREYTKFHDRILAPLKGCRK 1704

  Fly  1737 LLFLESPNKLTDFIDAEQQKLPGATLSLDEDLKVFSNALKLSHKDTKVAIKVGPTALQITSAEKT 1801
            |:||:||.||.|.||.|||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||
Mosquito  1705 LIFLDSPAKLNDVIDPEQQKLPGATLSLDEDLKVFNNALKLSHKDTKVAIKVGPTALQITSAEKT 1769

  Fly  1802 KVLAHSVLLNDVYYASEIEEVCLVDDNQFTLSITNESGQLSFIHNDCDNIVQAIIHIRNRWELSQ 1866
            |||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.|||||||||||||||||||||||||||
Mosquito  1770 KVLAHSVLLNDVYYASEIEEVCLVDDNQFTLSIANESSQLSFIHNDCDNIVQAIIHIRNRWELSQ 1834

  Fly  1867 PDSVTVHQKIRPKDVPGTLLNMALLNLGSCDPNLRTAAYNLLCALTATFDLKIEGQLLETQGLCI 1931
            |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||.||||||||||||||||||||||||
Mosquito  1835 PDSVTVHQKIRPKDVPGTLLNMALLNLGSSDPNLRTAAYNQLCALTATFDLKIEGQLLETQGLCI 1899

  Fly  1932 PSNNTIFIKSVSEKLATNEPHLTLEFLEESIQGFQRSTIELKHLCLEYMTPWLKNLVKFCKSNDD 1996
            |||||||||||||.|||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||:|||.:|:
Mosquito  1900 PSNNTIFIKSVSETLATNEPHLTLEFLEECIQGFQRSTIELKHLCLEYMTPWLANLVRFCKPSDE 1964

  Fly  1997 SKKLK-VSQILDKLINLTIDQKEMYPSVQAKIWGSIGQIPELIDMVLDNFLHKSITYGLGSPQVE 2060
            .|:.| |:|||:|||||||:|||||||:||||||||||||||||||||||:|||::.||||||||
Mosquito  1965 GKRQKQVAQILEKLINLTIEQKEMYPSIQAKIWGSIGQIPELIDMVLDNFIHKSVSSGLGSPQVE 2029

  Fly  2061 IMADTAVALASANVQLVSKKVITRICRVMDKSCTNPTQYLEQHMMWDDIAILGRYLLMLSFNNCL 2125
            |||||||||||||||||:||||.|:||||||:|.:|||||||||||||||||.||||||||||||
Mosquito  2030 IMADTAVALASANVQLVAKKVIGRLCRVMDKTCHSPTQYLEQHMMWDDIAILARYLLMLSFNNCL 2094

  Fly  2126 DVATSVPYLFHTITFLVCSGSLSMRASTHGLVINIIHSLCTCTNPSFSEEAQRVLRLSLDEFSLP 2190
            |||..:||||||:|||||:||||||||||||||||||||||||.||||||.||:|||||||||||
Mosquito  2095 DVARHLPYLFHTVTFLVCTGSLSMRASTHGLVINIIHSLCTCTKPSFSEETQRMLRLSLDEFSLP 2159

  Fly  2191 KFYLLFGISKVKSAAVTAFRSSCRHPTDKWLGNERVTQPLPADRERLSLPSLEVITDALLEIMEA 2255
            ||||||||||||||||||||||||||.|:|||||||:|..|||||||:||||||||:||||||||
Mosquito  2160 KFYLLFGISKVKSAAVTAFRSSCRHPNDRWLGNERVSQAPPADRERLALPSLEVITEALLEIMEA 2224

  Fly  2256 CMRDVPDCEWLNTWTSLARSFAFCYNPALQPRALIVYGCISKSVTDHEVKQLLRILVKALESFND 2320
            ||||:|||:||.||||||:|||||:|||||||||||:|||||||||.:|||||||||||||||||
Mosquito  2225 CMRDIPDCDWLQTWTSLAKSFAFCFNPALQPRALIVFGCISKSVTDQDVKQLLRILVKALESFND 2289

  Fly  2321 LILIEALVMCLTRIQPLLRPESPIHRALFWVAISVLQLDEITLYGAGLALLEQNLHTLKSQGCFD 2385
            :||:|||||||||:||||||||||||||||||:|||||||.|||.|||||||||||||.||..||
Mosquito  2290 IILLEALVMCLTRLQPLLRPESPIHRALFWVAVSVLQLDESTLYAAGLALLEQNLHTLNSQQLFD 2354

  Fly  2386 KKETIAEVMMKTREKLEWHFKQLDHAVGLSFRSNFHFALVGHLIKGFRHPTPTTVSRTSRVLTML 2450
             .:.||:|||.|||.||||||||||||||||:|||||||||||:|||||||||||||||||||||
Mosquito  2355 -NQNIADVMMATREPLEWHFKQLDHAVGLSFKSNFHFALVGHLLKGFRHPTPTTVSRTSRVLTML 2418

  Fly  2451 LGIIAKPLHRDKFEVTPDSVAYLTALVAVSEEVRSRCHVKHALPRWPADL-----SSSVENGEAS 2510
            |||:|||..||||||||||||||||||..||||||||||||.:||||.:.     |:|..:.:.|
Mosquito  2419 LGIVAKPHRRDKFEVTPDSVAYLTALVCFSEEVRSRCHVKHTVPRWPVESGGSGDSASGSSSDPS 2483

  Fly  2511 GGVQAIGLPLS----------------RRQKSWDILDQSALQFARQ-HKV--------------- 2543
            ....|.|.||:                |||||||:|||||:|:||| |||               
Mosquito  2484 APNSAGGGPLTGGSGPSGSSGSGGHSVRRQKSWDMLDQSAIQYARQSHKVQQHQEPVVIRGKSWR 2548

  Fly  2544 ---------------------------------------------------PTLQN--------- 2548
                                                               |.|.|         
Mosquito  2549 SLDSAHNPHLGMISHSSFVTHGINTTTNNINNMITMINMNSNTSNSITPGMPNLNNNNNSSILTN 2613

  Fly  2549 ----------------------------------------------------------------- 2548
                                                                             
Mosquito  2614 IISSNNNNNTTNTTSTAGSFASAVATNATTVAGPLGVGAYQSQRNDFRNRRSSSEPVNHGQMVLM 2678

  Fly  2549 ----------------------------------------------------------------- 2548
                                                                             
Mosquito  2679 NPNIAKLIALNQGHTPTYGHGGGGGVGTHQQPSQVAIAAAVTAAAAAAATAGAAAATGTQLPRPT 2743

  Fly  2549 ---------------------------------------------------ARVLFKTQRSFSVP 2562
                                                               ||:||||.||||||
Mosquito  2744 SPLPPAVPTVPVTTDEEGSEQARDATKQGTNKDESENFIVDCLQDISSIKIARMLFKTHRSFSVP 2808

  Fly  2563 TTKDP-NNATGIEERQ-ERGSRSSVSNESNVLLDPEVLPDLSIQALVLTVLATLVKYSSDEGETR 2625
            |||:. ..:|.|:.|| |||||||||||||||||||||||.|.||||||||||||||::||.|||
Mosquito  2809 TTKERLGKSTRIDNRQKERGSRSSVSNESNVLLDPEVLPDSSTQALVLTVLATLVKYTTDEAETR 2873

  Fly  2626 VLYQYLAEGSVVFPKVFPVIHSLLDQKINNILSVSHDQVVLNSVQNIIQNMLASEDPSQQQLHFL 2690
            ||||||||||:||||||||||||||||:||:||||:||:||.|||:||||||||||.|||.||||
Mosquito  2874 VLYQYLAEGSIVFPKVFPVIHSLLDQKVNNVLSVSNDQIVLASVQSIIQNMLASEDASQQPLHFL 2938

  Fly  2691 QSCGFGGLWRFAGPFTKYNMMGESSELFVNCLEAMVETCLPGDESAPVPPSPRPYNLSSSLSSLT 2755
            |||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||.:||.|:|||||||||||||||||
Mosquito  2939 QSCGFGGLWRFAGPFTKYNMMVESSELFVNFLEAMVETCLPVEESTPMPPSPRPYNLSSSLSSLT 3003

  Fly  2756 LGSPTDKAFSSESLDFYDNCPGSVSSLRRASHSKSR--AKHRINDSPSH 2802
            |||||||    |||| :|...||||||||||.||:|  :|||..|||:|
Mosquito  3004 LGSPTDK----ESLD-HDGFSGSVSSLRRASCSKARTGSKHRFIDSPTH 3047

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
Nf1NP_733132.2 RasGAP_Neurofibromin 1242..1575 CDD:213332 308/332 (93%)
CRAL_TRIO_2 1633..1767 CDD:463965 121/133 (91%)
PH_NF1 1759..1868 CDD:270123 105/108 (97%)
MOR2-PAG1_mid <1931..>2086 CDD:433790 134/155 (86%)
Nf1XP_061503004.1 None

Return to query results.
Submit another query.