DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment XNP and xnp-1

DIOPT Version :9

Sequence 1:NP_651398.1 Gene:XNP / 43080 FlyBaseID:FBgn0039338 Length:1311 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_001020958.1 Gene:xnp-1 / 172077 WormBaseID:WBGene00006961 Length:1359 Species:Caenorhabditis elegans


Alignment Length:1370 Identity:485/1370 - (35%)
Similarity:701/1370 - (51%) Gaps:259/1370 - (18%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly     3 KKNPNARHTDAATPLTTDDSNSSS--VSRRESATESKSASESESSPPRSNTKQSRTHKNV----- 60
            ||.| |:...|::....||....|  .|.::|...:||.|||:.|....:.|:|::.|.|     
 Worm    52 KKRP-AKKRKASSSEEDDDDEEESPRKSSKKSRKRAKSESESDESDEEEDRKKSKSKKKVDQKKK 115

  Fly    61 -KASGKATVSSSSDSDQAVANSSANDEEKEPVCKIRIVPLEKLLASPKTKERPSRGSQQKNVTIN 124
             |:..|.|.|||.|.|        :|||:|...|.:         |.|||::.|..|.:      
 Worm   116 EKSKKKRTTSSSEDED--------SDEEREQKSKKK---------SKKTKKQTSSESSE------ 157

  Fly   125 DSSDEEPLKGSKLVLPARKSRNKNASIIELSD-SEEVDEEEESLLVAIPLPKEAQQTKPEKNSSK 188
            :|.:|..:|.||        :||..|:.:.:: |||.||:|                ||    ||
 Worm   158 ESEEERKVKKSK--------KNKEKSVKKRAETSEESDEDE----------------KP----SK 194

  Fly   189 ASKESIEKRQKAQKEATTSSARAIRSVNGTRRGSLSSERSSRASSSRAESPPRPKRCVVRLKRVS 253
            .||:.::|:.|::.|                            |.|..|            |.|.
 Worm   195 KSKKGLKKKAKSESE----------------------------SESEDE------------KEVK 219

  Fly   254 LPKTKPAQKPKKMSSDSEEAATTSKKSRQRRSKSESEADSDYEAPAAEEEEEEE----------- 307
            ..|.|..:..||.|...:||....|..:::|||:.||..|:.|....||||:|.           
 Worm   220 KSKKKSKKVVKKESESEDEAPEKKKTEKRKRSKTSSEESSESEKSDEEEEEKESSPKPKKKKPLA 284

  Fly   308 -RKSSGDEEEAANSSDSEVMPQRKRRR-----KKSESDKG-SSDFEPEEKQKKKGRKRIKKTSSG 365
             :|.|.|||  :..||.||:||:|:|.     ..||.:|. .|:.|..:.::|..:|:.||..|.
 Worm   285 VKKLSSDEE--SEESDVEVLPQKKKRGAVTLISDSEDEKDQKSESEASDVEEKVSKKKAKKQESS 347

  Fly   366 ESDGDGDDD------KQKNKRKHIRK----IIKTKDLDLTTKEAAKEEDDRRKRIEDRQKLYNRI 420
            ||..|..:.      |.|.|.|..:|    |:.:..|...|.:|.:.|.:||||:|.:||.:|.|
 Worm   348 ESGSDSSEGSITVNRKSKKKEKPEKKKKGIIMDSSKLQKETIDAERAEKERRKRLEKKQKEFNGI 412

  Fly   421 FVK------------SESVEINELVLD-----FDEESKKALLQVDKGLLKKLKPHQVAGVKFMWD 468
            .::            |...::..:|||     .||||||. ::|...|::.|||||..|::||:|
 Worm   413 VLEEGEDLTEMLTGTSSQRKLKSVVLDPDSSTVDEESKKP-VEVHNSLVRILKPHQAHGIQFMYD 476

  Fly   469 ACFETLKESQEKPGSGCILAHCMGLGKTLQVVTLSHTLLVNTRRTG--VDRVLIISPLSTVNNWA 531
            ..||:| :..:..|||.||||||||||||||:|..||:|:: .:.|  ..|||::.|.:.:.||.
 Worm   477 CAFESL-DRLDTEGSGGILAHCMGLGKTLQVITFLHTVLMH-EKIGEKCKRVLVVVPKNVIINWF 539

  Fly   532 REFTSWMKFANRND-----IEVYDISRYKDKPTRIFKLNEWFNE--GGVCILGYDMYRILANE-- 587
            :||..|:.   .||     |:|.::..||....|...|..|.:.  ..|.|:|||::|||..|  
 Worm   540 KEFQKWLV---DNDEELDTIDVNELDSYKTIEDRRRALKAWHSSKTPSVMIIGYDLFRILTVEDD 601

  Fly   588 ------KAKGLR-KKQREQLMQALVDPGPDLVVCDEGHLLKNEKTSISKAVTRMRTKRRIVLTGT 645
                  |.:..| :|.:|...:.|.:||||:|||||.|.|||:.:::||.:.::.|||||.||||
 Worm   602 PKKKKPKNRNRRLEKAKEDFRKYLQNPGPDMVVCDEAHKLKNDDSALSKCMVKILTKRRICLTGT 666

  Fly   646 PLQNNLREYYCMIQFVKPNLLGTYKEYMNRFVNPITNGQYTDSTERDLRLMKHRSHILHKLLEGC 710
            ||||||.||:||:.||||.||||..|:.|||||.|..|:..|::..::..||.|.|:|:..|:.|
 Worm   667 PLQNNLMEYHCMVNFVKPGLLGTKTEFANRFVNIINRGRTKDASPLEVSFMKRRCHVLYDHLKKC 731

  Fly   711 IQRRDYSVLAPYLPPKHEYVVYTTLSELQQKLYGYYMTTHREQSGGDVVGKGA---RLFQDFQDL 772
            :.|:||.||...:|||.|||:....:|.|..||..::        .|:||...   ||..|:...
 Worm   732 VDRKDYRVLTEAIPPKQEYVINVRQTERQCALYNAFL--------NDIVGDSGLSKRLLPDYHMF 788

  Fly   773 RRIWTHPMNLRVNSDNVIAKRLLSNDDSDMEGFICDETDEDEAASNSSDSCETFK----SDASMS 833
            .||||||..|.::...:..:|::..|..:...|| |:.|..|:.|..|     ||    ||:..|
 Worm   789 SRIWTHPYQLVLHEQRMERERVMREDAEEEADFI-DDGDGSESESEGS-----FKSGSESDSGKS 847

  Fly   834 GLAASSGKVKKRKTRNGN---------------AGGGDSDSD-------------LEMLGGLGGG 870
            .:.:|..:...:|.:|||               ....|.|.:             :.....|.|.
 Worm   848 VVLSSDDEGSSKKKKNGNKPEIKKTAPQKKRKFLNSDDEDEEDGEDTAMAILQDGIRQSKRLAGE 912

  Fly   871 SSVQK--DDPSEWWKPF-----VEERELNNVHHSPKLLILLRLLQQCEAIGDKLLVFSQSLQSLD 928
            .:..:  |.|.|:...|     |:|.:.::...|.||::|:.::::||.||||||||||||:||.
 Worm   913 EADLRDTDTPPEYTGWFARLGLVKEEDRDDFALSNKLILLVEIIKKCEEIGDKLLVFSQSLESLT 977

  Fly   929 VIEHFLSLVDSNTKNYEFEGD-----VGDFKGCWTSGKDYFRLDGSCSVEQREAMCKQFNNITNL 988
            :|:..|..: :.|..:..:|.     .|:....|..|:||..:|||....:|:|:...||:..||
 Worm   978 LIKRMLEYM-AGTGQWFADGHEALNAEGEETWSWLEGEDYMTIDGSVQSGKRDAVQTSFNDPLNL 1041

  Fly   989 RARLFLISTRAGGLGINLVAANRVVIFDVSWNPSHDTQSIFRVYRFGQIKPCYIYRLIAMGTMEQ 1053
            ||||.|||||||.||.|:||||||:|||..|||||||||:||||||||.||.||||.||.||||:
 Worm  1042 RARLMLISTRAGSLGTNMVAANRVIIFDACWNPSHDTQSLFRVYRFGQTKPVYIYRFIAQGTMEE 1106

  Fly  1054 KVYERQVAKQATAKRVIDEQQISRHYNQTDLMELYSYELKPST-EREMPIL---PKDRLFAEILT 1114
            ::|:|||.|::|:.||:||.||.|||...||.|||.:  .||| :.::.|.   |||||.|:::.
 Worm  1107 RIYKRQVTKESTSMRVVDEAQIQRHYLGNDLTELYQF--TPSTFDPDVEISCAPPKDRLLADVIH 1169

  Fly  1115 EHEKLIFKYHEHDSLLEQEEHENLTEEERKSAWAEYEAEKTRTVQASQYMSYDRNAFGN-QVMGQ 1178
            :::..:..|.|||:|....|.|.|||:|.|.||.:||.:|:.....:||.:.....|.| .::||
 Worm  1170 KNQHAVVDYIEHDTLFANVEDEKLTEQEMKDAWTDYEKDKSGMPVRAQYAAPPMPGFPNGMIVGQ 1234

  Fly  1179 FGNASGSVTSNKIFGFRSD------ILLQLLNMKISKDHQE-----LNQNQVIQLVPTYLQQLYN 1232
              |....:.:....|.|.|      :..:|..|:| ||...     |.:|.:.|::| |:.   :
 Worm  1235 --NVQALLQNRMNQGIRVDQMQHDILFKELQKMRI-KDAGTAVKIVLLRNLLEQILP-YIP---D 1292

  Fly  1233 EMNNG 1237
            ||..|
 Worm  1293 EMRGG 1297

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
XNPNP_651398.1 DTHCT 258..335 CDD:285332 32/93 (34%)
SNF2_N 458..779 CDD:278600 146/341 (43%)
DEXDc 483..646 CDD:238005 76/180 (42%)
Helicase_C 913..1035 CDD:278689 69/126 (55%)
xnp-1NP_001020958.1 SNF2_N 466..796 CDD:278600 147/342 (43%)
DEXDc 490..667 CDD:238005 76/180 (42%)
HELICc 946..1096 CDD:238034 81/150 (54%)


Information from Original Tools:


Tool Simple Score Weighted Score Original Tool Information
BLAST Result Score Score Type Cluster ID
Compara 1 0.930 - - C160160744
Domainoid 1 1.000 233 1.000 Domainoid score I1358
eggNOG 1 0.900 - - E2759_KOG1015
Hieranoid 1 1.000 - -
Homologene 1 1.000 - - H134357
Inparanoid 1 1.050 653 1.000 Inparanoid score I420
Isobase 1 0.950 - 0 Normalized mean entropy S5042
OMA 00.000 Not matched by this tool.
OrthoDB 1 1.010 - - D111318at33208
OrthoFinder 1 1.000 - - FOG0003310
OrthoInspector 1 1.000 - - oto17211
orthoMCL 1 0.900 - - OOG6_104269
Panther 1 1.100 - - LDO PTHR45797
Phylome 1 0.910 - -
RoundUp 1 1.030 - avgDist Average_Evolutionary_Distance R4866
SonicParanoid 1 1.000 - - X2684
SwiftOrtho 1 1.000 - -
TreeFam 1 0.960 - -
1716.740

Return to query results.
Submit another query.